Clase de ácidos
nucléicos
BIO141C-2016
Bruno Tesser
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Los ácidos nucleicos son biomoléculas de
gran tamaño.
El peso molecular de estos polímeros es muy
elevado: en el caso del hombre, es de 3,6 X 1012, que
equivale a 5,6 X 109 pares de nucleótidos.
Fueron aisladas por primera vez por Miescher en
1870, a partir del núcleo de las células del pus; su
nombre se origina del hecho de que la primera vez
que se identificaron se observó que eran ácidos,
además de que fueron identificados por primera vez
en el núcleo celular.
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Historia
Friedrich Miescher
Descubre la nucleina
Esperma de salmón 3
Experimentos de Griffith
Frederick Griffith
Agente transformante
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Características generales de los ácidos nucleicos
• En las células se encuentran dos variedades de ácidos
nucleicos:
– el ácido desoxirribonucleico (ADN).
– el ácido ribonucleico (ARN)
• El ADN forma genes, el material hereditario de las células, y
contiene instrucciones para la producción de todas las
proteínas que el organismo necesita.
• El ARN está asociado a la transmisión de la información
genética desde el núcleo hacia el citoplasma, donde tiene lugar
la síntesis de proteínas, proceso al cual está estrechamente
relacionado. Hay varios tipos de ARN, los tres más importantes:
– ARN mensajero (ARNm),
– ARN de transferencia (ARNt)
– ARN ribosómico (ARNr),
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En las células eucariotas, el ADN se encuentra principalmente
en el núcleo, pero también en las mitocondrias y en los
cloroplastos.
El ADN de las mitocondrias y de los cloroplastos es similar al
de las células procariotas.
El ADN nuclear está asociado a proteínas, las llamadas
nucleoproteínas. Estas, básicamente, son histonas. También
hay una pequeña cantidad de un grupo heterogéneo de
proteínas, llamadas proteínas no histónicas.
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• El ADN de las mitocondrias y de los cloroplastos
es similar al de las células procariotas.
• Durante mucho tiempo se creyó que el ADN
procariota no estaba asociado a proteínas (ADN
desnudo) y que estaba disperso en el citoplasma.
• En la actualidad, se ha observado que está
asociado a proteínas no histónicas, formando una
condensación llamada nucleoide, que, a
diferencia del núcleo, carece de envoltura.
• También en los virus se han observado proteínas
básicas asociadas al ADN.
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DNA de Escherichia coli
Una sola molécula circular
cuya circunferencia mide
1 mm
Tiene un peso molecular de
aproximadamente 109 Da
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Nucleótidos: subunidades de los ácidos nucleicos
Los ácidos nucleicos son biopolímeros donde los monómeros son los
nucleótidos, unidades moleculares que constan de:
a. un azúcar de cinco carbonos, -D-ribosa en el ARN o -D-
desoxirribosa en el ADN
b. un grupo fosfato (ácido fosfórico).
c. una base nitrogenada, o una purina de doble anillo o una
pirimidina de anillo simple.
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• El ADN contiene las bases púricas Adenina (A) y Guanina (G) y las
bases pirimidínicas. Citosina (C) y Timina (T), junto con el azúcar
desoxirribosa y el fosfato.
• El ARN contiene las mismas bases púricas (A y G), pero en cuanto a
las bases pirimidínicas, el Uracilo (U) reemplaza a la timina.
Purinas
Pirimidinas
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• La unión de la base nitrogenada con la
pentosa se realiza mediante un enlace N-
glucosídico entre en C1 de la pentosa y el
nitrógeno que ocupa la posición 1 en las
bases pirimidínicas y el nitrógeno de la
posición 9 en las bases púricas.
• Esta molécula recibe el nombre de
nucleósido y pueden ser ribonucleósidos o
desoxirribonucleósidos.
Nucleósido
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• Cuando al nucleósido se le une el fosfato
mediante un enlace éster (éster fosfórico
entre el carbono 5’ de la pentosa y el
grupo fosfato) tenemos los nucleótidos.
•
• Los nucleótidos se pueden separar en
sus componentes por hidrólisis.
• Si es hidrólisis alcalina se separa en
el nucleósido y el fosfato.
• Si es hidrólisis ácida en la base
nitrogenada por un lado y la pentosa
con el fósforo por otro.
Nucleótido
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NH2
NH2
N
N
N
adenina N
N N
O O
H enlace N-glucosídico N
N
HO P OH HO OH HO P O CH2
O O
OH desoxirribosa OH
fosfato
enlace OH OH
ester
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Los ácidos nucleicos están
formados por cadenas de
nucleótidos, unidos por enlaces
covalentes entre la molécula de
azúcar de un nucleótido (el
carbono 3´ de la ribosa o de la
desoxirribosa) y la molécula de
fosfato del siguiente nucleótido
que a su vez está unido al
carbono 5´ de la pentosa.
Estos enlaces son llamados uniones o puentes fosfodiéster,
porque el fosfato está unido por una unión éster fosfato al azúcar del
nucleótido y por otra unión equivalente al azúcar del nucleótido que
lo precede.
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• Las moléculas de ADN son considerablemente más grandes que las
de ARN, pero además poseen una estructura doble, ya que están
constituidas por dos cadenas que son complementarias entre sí.
• Las dos cadenas se enfrentan por las bases, que se mantienen
unidas por la existencia de puentes de hidrógeno.
• La complementariedad proviene de que siempre una base púrica (de
mayor dimensión) se enfrenta con una base pirimídinica y que el
acoplamiento siempre enfrenta a A con T y a G con C.
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Nucleótidos no nucleicos
• Son nucleótidos que no forman parte de los ácidos
nucleicos.
• Se encuentran libres en las células.
• Pueden actuar como:
• Reguladores metabólicos (aportando energía)
• Activadores de enzimas
• Coenzimas
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Nucleótidos de adenina
ADP - ATP
• Son moléculas transportadoras de energía
• Los fosfatos se unen mediante enlaces ricos en energía.
• En las reacciones que se libera energía (exergónicas) se forma ATP
a partir de ADP.
• En las reacciones que se necesita energía (endergónicas) se
hidroliza el ATP y da ADP y ácido fosfórico
• También pueden actuar en estos procesos nucleótidos de guanina
(GTP – GDP)
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ATP como
donador de energía
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Estructura primaria del ADN (secuencia de
nucleótidos)
•Es la secuencia de nucleótidos de una sola cadena.
•Se pueden distinguir en ella un esqueleto de
pentosas y fosfatos y una secuencia de bases
nitrogenadas.
•El número de hebras diferentes de ADN que se
puede formar combinando las cuatro bases
nitrogenadas -adenina, guanina, citosina y timina-, es
muy elevado.
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Estructura secundaria del ADN (doble hélice)
•La estructura secundaria del ADN es la disposición
espacial en doble hélice de dos cadenas de
polinucleótidos, con las bases nitrogenadas
enfrentadas y unidas mediante puentes de hidrógeno.
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Las cadenas del ADN son complementarias, no
iguales, Por lo tanto, la secuencia de cada cadena
es diferente.
El enrollamiento plectonímico implica que, para
separar las dos hebras, hay que girar una respecto
a la otra.
En la estructura secundaria del ADN, los grupos
hidrófobos de las bases se disponen hacia el
interior de la molécula, estableciendo interacciones
hidrófobas entre grupos lipófilos, que colaboran con
los puentes de hidrógeno en dar estabilidad a la
macromolécula.
Las pentosas y los fosfato (carga negativa) quedan
en el exterior. Debido a la ionización, los ácidos
nucleicos tienen carácter ácido. Las bases de
ambas hebras están en el interior y unidas por los
puentes de hidrógeno.
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Características de la doble hélice
• Dos cadenas polinucleótidas unidas entre sí
• Antiparalelas
• Complementarias
• Estabilizadas por puentes de hidrógeno entre
bases nitrogenadas
• Enrolladas en espiral alrededor de un eje
imaginario
• Esqueleto azúcar fosfato hacia fuera –
• Planos de las bases perpendiculares al eje y
paralelos entre sí
• Enrollamiento plectonémico
• Gira en sentido dextrógiro (reloj)
• 10 pares de nucleótidos por vuelta (3,4 nm)
• Diámetro .- 2 nm
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Desnaturalización – renaturalización del ADN
La doble hélice de ADN en estado natural es muy estable; pero, si se calienta,
cuando la temperatura llega aproximadamente a 100°C, las dos hebras de la
doble hélice se separan, se produce la desnaturalización del ADN.
Si posteriormente se mantiene el ADN desnaturalizado a 65°C, las dos hebras
vuelven a unirse.
Esta restauración de la doble hélice es lo que se llama renaturalización y es lo
que permite la hibridación si se parte de hebras de distintos ADN
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Para conseguir que el ADN quepa dentro del núcleo, se encuentra muy
empaquetado, y aún más cuando se condensa para formar un cromosoma.
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El ADN superenrollado. El empaquetamiento del ADN circular
Las moléculas de ADN circular, como el ADN bacteriano o el ADN
mitocondrial, presentan una estructura terciaria, que consiste en que la fibra
de 20 Å se halla retorcida sobre sí misma formando una especie de
superhélice. Esta disposición se denomina ADN sobreenrrollado.
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Tipos de ADN según su estructura, su forma y su empaquetamiento
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FUNCIÓN BIOLÓGICA DEL ADN
El ADN es la molécula almacén de la información genética y contiene todas
las instrucciones necesarias para construir todas las moléculas del cuerpo
de un ser vivo. Para ello tiene que ser capaz de realizar copias de si mismo
(replicarse) mediante un proceso basado en la complementariedad de las
bases.
En cuanto a su longitud, el ADN mide 1,7 µ en el virus del polioma; 1,36
mm en Escherichia coli; 11,2 cm en cada célula de Drosophila; 0,57 m en el
erizo de mar; 0,93 m en el gallo; 1,89 m en el perro, 2,36 m en el hombre
(sumando el ADN de los 46 cromosomas), etc.
La longitud del ADN no siempre guarda relación con la complejidad del
organismo. Muchas especies tienen mucho más ADN que el necesario para
codificar su estructura y fisiología. Esto ha dado lugar a numerosas hipótesis
sobre las funciones de ese ADN supernumerario.
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EL ÁCIDO RIBONUCLEICO - ARN
El ácido ribonucleico o ARN está
constituido por nucleótidos de ribosa, con
las bases adenina, guanina, citosina y
uracilo. No tiene timina como el ADN.
Estos ribonucleótidos se unen entre ellos
mediante enlaces fosfodiéster en sentido
5 '3', al igual que en el ADN.
El ARN es casi siempre monocatenario,
excepto en los reovirus que es
bicatenario.
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Se ha observado la existencia de ARN
con función biocatalizadora (ribozimas),
por lo que se ha sugerido que, en el origen
de la vida, los ARN pudieron ser las
primeras moléculas capaces de auto
duplicarse. Después, sería el ADN el
encargado de guardar la información
genética, ya que su cadena es más
estable.
Ribozima
hammerhead
Participan en el procesado del RNA transcrito primario y en la
formación de enlace peptídico en la síntesis de proteínas.
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El ARN se encuentra en muchos tipos de virus y en las células procariotas
y eucariotas. En éstas hay de cinco a diez veces más ARN que ADN.
Los ARN se clasifican en:
1.ARN bicatenario (en los reovirus)
2.ARN monocatenario:
a. ARN de transferencia (ARNt)
b. ARN mensajero (ARNm)
c. ARN ribosómico (ARNr)
d. ARN nucleolar (ARNn)
El hecho de que las células que fabrican grandes cantidades de proteínas
sean ricas en ARN fue una de las pistas para desvelar la transmisión de la
información genética.
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ARNm ARNr ARNt
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EL ARN DE TRANSFERENCIA (ARNt).
•Tiene entre 70 y 90 nucleótidos y se encuentra disperso en el
citoplasma.
•Hay unos cincuenta tipos de ARNt.
•Constituye el 15% del ARN de la célula.
•Su función es transportar aminoácidos específicos hasta los
ribosomas, donde, según la secuencia especificada en un ARN
mensajero (transcrita, a su vez, del ADN), se sintetizan las
proteínas.
•Las diferencias entre los ARNt son debidas fundamentalmente a
una secuencia de tres bases nitrogenadas, denominada
anticodón.
•Entre los nucleótidos que forman los ARNT, además de A, G, C y
U, aparecen otros que llevan bases metiladas, como la
dihidrouridina (UH2 ), la ribotimidina (T), la inosina (I), la
metilguanosina (GMe), etcétera, que constituyen el 10 % de los
ribonucleótidos totales del ARNt.
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• El ARNt es monocatenario, pero
presenta zonas con estructura
secundaria en doble hélice, y
zonas con estructura primaria o
lineal, que forman asas o
bucles, lo que confiere a la
molécula una forma de hoja de
trébol.
• En ella se distingue:
Brazo D: Unión con el enzima
que cataliza la unión a los
aminoácidos.
Brazo T: Lleva timina
Brazo A (del anticodón).
Extermo 3’: aceptor de
aminoácidos
Extremo 5’: Siempre lleva
guanina y un grupo fosfórico
libre. 38
• En realidad la molécula está mucho
más replegada, adoptando una
estructura terciaria en forma de L.
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EL ARN MENSAJERO (ARNm)
•Es monocatenario, básicamente lineal, y
con un peso molecular que oscila entre
200.000 y 1.000.000 Da.
•Su función es transmitir la información
contenida en el ADN y llevarla hasta los
ribosomas, para que en ellos se sinteticen
las proteínas a partir de los aminoácidos
que aportan los ARNt.
•El ARNm tiene una estructura diferente en
procariotas y en eucariotas.
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El ARNm eucariótico
• Presenta algunas zonas (pocas) en doble
hélice, por complementariedad de bases
entre distintos segmentos, y zonas lineales
que dan lugar a los llamados lazos en
herradura.
• El ARNm eucariótico se forma a partir del
transcrito primario (pre-ARNm), también
llamado ARN heterogéneo nuclear
(ARNhn), nombre que hace referencia a la
variabilidad de su tamaño.
• Posee una serie de segmentos con
información, denominados exones,
alternados con otros sin información
denominados intrones, que luego son
suprimidos y no aparecen en el ARNm.
• Este proceso se denomina maduración y
se produce en el núcleo.
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El filamento de ARN se puede
enrollar sobre sí mismo mediante la
formación de pares de bases en
algunas secciones de la molécula,
formando las denominadas
estructura secundarias del ARN
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Estructura del ARNm eucariótico
• El ARNm eucariótico posee en su extremo 5'
una guanosina trifosfato invertida y metilada en
el nitrógeno 7 (m7 Gppp).
• Esta molécula, que recibe el nombre de
caperuza (cap), bloquea la acción de enzimas
exonucleasas que pueden destruir el ARNm, y
constituye la señal de inicio en la síntesis de
proteínas.
• A continuación, hay un segmento sin
información, seguido de otro segmento con
información que suele empezar con la
secuencia AUG.
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• En el extremo 3' o extremo final posee de 150 a
200 nucleótidos de adenina, lo que se denomina
«cola» de poli-A. Es un estabilizador frente a
las exonucleasas.
• Entre la síntesis y la degradación del ARNm no
transcurren más que unos cuantos minutos,
para evitar una superproducción de proteínas.
• El ARNm eucariótico es monocistrónico, es
decir, sólo contiene información para una
cadena polipeptídica.
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Estructura del ARNm de procariontes
El ARNm procariótico no adopta la estructura del ARN eucariótico.
No presenta exones e intrones
Carece de caperuza (empieza con un nucleótido trifosfato no invertido, por
ejemplo: pppG-...) y de cola de poli-A,
Es policistrónico, es decir, contiene informaciones separadas para distintas
proteínas.
5’ LIDER CISTRÓN CISTRÓN TRAILER 3’
Secuencia
espaciadora
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Estructura del ARNm de procariotas
5’ LIDER CISTRÓN CISTRÓN TRAILER 3’
Secuencia
espaciadora
• El sector comprendido entre el extremo 5’ y el codón de inicio se denomina
Líder (no lleva información).
• La secuencia comprendida entre el codón sin sentido y el extremo 3’ del
ARNm se denomina extremo Trailer y tampoco lleva información.
• Los ARNm Policistrónicos presentan secuencias de longitud variable que
separan las regiones codificantes o Cistrones, estas se denominan
regiones espaciadoras, usualmente de 10 pb. de longitud.
• Cada Cistrón posee un codón de inicio y uno sin sentido (finalización).
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EL ARN RIBOSÓMICO (ARNr)
•Es el ARN que constituye, en parte, los ribosomas. Este tipo de ARN
representa el 60% del peso de dichos orgánulos.
•El ARNr presenta segmentos lineales y segmentos en doble hélice.
•El ARNr está asociado con las proteínas ribosómicas (más de 70),
formando una estructura relacionada con la síntesis de proteínas (da
alojamiento al ARNm y a los ARNt, portadores de los aminoácidos que
formarán las proteínas durante dicho proceso).
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EL ARN NUCLEOLAR (ARNn).
• Es un ARN que se encuentra constituyendo, en parte, el nucléolo.
• Se origina a partir de diferentes segmentos de ADN, uno de los cuales se
denomina región organizadora nucleolar (NOR).
• A partir de este ADN, se forma en el nucléolo un ARN de 45 S. Este ARN
nucleolar se asocia a proteínas, procedentes del citoplasma, muchas de
las cuales son las que conformarán los ribosomas.
• Posteriormente, la partícula de ribonucleoproteína se escinde en tres
ARN.
• A continuación se añade un ARN de 5 S, también asociado a proteínas,
sintetizado fuera del nucléolo, es decir, en el nucleoplasma, a partir de
otro segmento de ADN.
• A partir de todos ellos se forman las dos subunidades ribosómicas, una de
40 S y otra de 60 S, que atraviesan la envoltura nuclear y se unen en el
citoplasma, dando lugar a un ribosoma de 80 S.
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EL ARN PEQUEÑO NUCLEAR (ARNpn)
• Existe un quinto tipo de ARN, el ARN pequeño nuclear (ARNpn),
denominación que hace referencia a su pequeño tamaño y a su
presencia en el núcleo de las células eucariotas.
• También se le denomina ARN-U por su elevado contenido en uridina.
• El ARNpn se une a ciertas proteínas del núcleo formando las
ribonucleoproteínas nucleares (RNPpn), y así actúa realizando el
proceso de eliminación de intrones (maduración del ARNm), gracias a
que posee secuencias complementarias a las de los extremos de los
intrones (secuencias de nucleótidos no codificantes).
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FUNCIONES DE LOS ÁCIDOS RIBONUCLEICOS
Las funciones de los ARN pueden resumirse en tres:
1. Transmisión de la información genética desde el ADN a los
ribosomas. Las enzimas ARN-polimerasas a partir de un gen de ADN, es
decir, una secuencia de nucleótidos de ADN con información sobre una
proteína, sintetizan, mediante la complementariedad de las bases, un ARN
mensajero, proceso denominado transcripción. Luego, este ARNm llegará
hasta los ribosomas. El ADN es utilizado únicamente como almacén de
información genética.
2. Conversión de la secuencia de ribonucleótidos de ARNm en una
secuencia de aminoácidos. Este proceso se denomina traducción y se
realiza en los ribosomas. En él intervienen, además del ARNm, el ARNr de
los ribosomas y el ARNt que transportan los aminoácidos.
3. Almacenamiento de la información genética. Algunos virus carecen de
ADN y, por ello, contienen su información biológica en forma de ARN. Por
ejemplo, el virus de la gripe, el de la polio, el de la inmunodeficiencia
humana, los reovirus (que poseen ARN bicatenario), etc
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Diferencias entre DNA y RNA
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