Estructura y
función del
ácido nucleico
Dra. Leslie Godinez.
El descubrimiento de que la información genética está codificada a lo
largo de una molécula polimérica compuesta de sólo cuatro tipos de
unidades monoméricas fue uno de los principales logros científicos del
siglo xx. Esta molécula polimérica, el ácido desoxirribonucleico (DNA),
es la base química de la herencia, y está organizada en genes, las
unidades fundamentales de la información genética.
El conocimiento de la estructura y función de los ácidos nucleicos es
esencial para entender los aspectos genéticos y muchos aspectos de
la fisiopatología, así como la base ge_x0002_nética de la enfermedad.
Los ácidos nucleicos, llamados así originalmente por su reacción ácida y por
su localización nuclear, son macromoléculas. Hoy se sabe que la localización
de estas moléculas es amplia. El ácido desoxirribonucleico (DNA) reside en el
núcleo, en las mitocondrias y en los cloroplastos de organismos eucarióticos,
mientras que el ácido ribonucleico (RNA) se le encuentra también en el
citoplasma y asociado al retículo endoplásmico. La lógica de esta distribución
celular estriba en las funciones celulares de los ácidos nucleicos. El DNA, el
portador permanente de la información genotípica celular, puede determinar
el fenotipo de la célula desde el interior del núcleo gracias a la transcripción
de su información en RNA, moléculas efímeras que viajan a otros
compartimientos celulares para ejecutar las instrucciones genotípicas
transcritas en ellas.
Introduccion •
El ácido desoxirribonucleico
(DNA), es la base química de
la herencia, y está organizada
en genes, las unidades
fundamentales de la
información genética.
Los ácidos nucleicos son polímeros construidos por monómeros llamados
nucleótidos. A su vez, un nucleótido está compuesto por una pentosa, una
base nitrogenada y un fosfato. En los nucleótidos que constituyen el RNA, la
pentosa es la ribosa y, en el caso del DNA, es la 2’-desoxirribosa, es decir,
una ribosa que carece del grupo OH en la posición 2’. De esta distinción a
nivel del carbono 2’ surgen las diferencias químicas fundamentales entre el
DNA y el RNA.
• EL DNA CONTIENE LA
INFORMACIÓN
GENÉTICA •
En 1944, en una serie de experimentos efectuados por Avery, MacLeod y McCarty, se
demostró por vez primera que el DNA contiene la información genética.
La naturaleza química de las unidades de desoxinucleótido monoméricas del DNA —
desoxiadenilato, desoxiguanilato, desoxicitidilato y timidilato— se describe en el capítulo
32. Estas unidades monoméricas del DNA se mantienen en forma polimérica por medio
de enlaces 3ʹ,5ʹ-fosfodiéster que constituyen una cadena único.
El polímero como se describe posee una polaridad; un extremo tiene un 5ʹ-hidroxilo o
fosfato terminal, mientras que el otro tiene un grupo 3ʹ-fosfato o
hidroxilo terminal. La importancia de esta polaridad es evidente.
Junto con datos de difracción con rayos X de la molécula de DNA, y la observación de
Chargaff de que en las moléculas de DNA la concentración de nucleótidos
desoxiadenosina (A) es igual a la de nucleótidos timidina (T) (A = T), mientras que la de
nucleótidos desoxiguanosina (G) es igual a la de nucleótidos desoxicitidina (C) (G = C),
condujeron a Watson, Crick y Wilkins a proponer a principios del decenio de 1950 un
modelo de una molécula de DNA bicatenario.
Las dos cadenas de esta hélice bicatenaria se mantienen en registro por medio tanto
de enlaces de hidrógeno entre las bases purina y pirimidina de las moléculas lineales
respectivas, como de interacciones de van der Waals e hidrofóbicas entre los pares de
bases adyacentes api_x0002_ladas. La formación de pares entre los nucleótidos purina
y pirimidina en las cadenas opuestas es muy específica, y depende de enlaces de
hidrógeno de A con T y de G con C.
Las dos cadenas
de esta hélice bicatenaria se como de interacciones La formación de pares
mantienen en registro por de van der Waals e entre los nucleótidos
medio tanto de enlaces de hidrofóbicas entre los purina y pirimidina en
hidrógeno entre las bases pares de bases las cadenas opuestas es
purina y pirimidina adyacentes apiladas. muy específica, y
de las moléculas lineales depende de enlaces de
respectivas, hidrógeno de A con T y
de G con C.
• Las dos cadenas del DNA forman una hélice doble
Debido a los ángulos que adoptan
El DNA está formado por dos entre sí los átomos que conforman
cadenas o hebras sus armazones, los polinucleótidos
polinucleotídicas que se aparean del DNA tienden a enrollarse en
entre sí formando lo que se ha una estructura helicoidal cuando se
llamado la doble hélice del DNA parean.
En esta doble hélice, los El pareamiento de las bases
armazones de desoxirribosafosfato nitrogenadas por medio de
de cada cadena, con sus cargas puentes de hidrógeno se ilustra
aniónicas, quedan situadas al en la figura 27-6. Este
exterior, y las bases nitrogenadas pareamiento ocurre tan sólo
en medio de las dos cadenas entre una purina y una pirimidina.
Los pareamientos que se observan en la doble hélice del DNA son entre adenina y timina, y entre citosina y
guanina.
Las cantidades molares de adenina son iguales a las de timina y las de guanina igual a las de citosina (la
llamada regla de equivalencia de Chargaff).
Nótese que el par guanina-citosina establece tres puentes de hidrógeno (G ≡ C), mientras que el par adenina-
timina sólo forma dos puentes (A = T). Esto se traduce en una mayor cohesión o estabilidad para el par G ≡ C
que para el par A= T.
Si las bases pareadas en el interior de la hélice son diferentes de los pares A = T o C ≡ G, el grosor de la
hélice puede sufrir una distorsión. Por ejemplo, el pareamiento entre dos purinas ocasionaría que las
distancias entre las armazones aumentasen, causando un “abultamiento” en la hélice. Estas distorsiones
permiten que ciertas proteínas reconozcan un pareamiento anómalo y procedan a “repararlo”.
Las dos cadenas del DNA son
complementarias y antiparalelas
El pareamiento y enrollamiento de
A las dos cadenas de la doble hélice
del DNA son complementarios de
secuencias y ocurren en forma
antiparelela.
B
La primera característica es fácil de
intuir, pues depende del pareamiento
entre los pares de bases: G ≡ C y A = T.
Cada posición A de una cadena se
pareará con su base complementaria T.
C La segunda característica, la
antiparalelidad, indica que la
dirección en que corren dos
cadenas del DNA es opuesta.
Sólo cadenas que tengan complementariedad de bases cuando se alinean en forma
antiparalela pueden formar una doble hélice, ya que sólo de esta manera los átomos que
forman los puentes de hidrógeno están lo suficiente cerca para que los puentes se
puedan formar.
Esta propiedad de la hélice doble del DNA es fundamental para su función biológica, pues
determina que una cadena tenga una contraparte única e inequívoca. La secuencia
nucleotídica de una cadena queda de forma implícita determinada por la secuencia de su
cadena complementaria.
Gracias a esto, cada una de las cadenas del DNA sirve de molde para dirigir la
duplicación fidedigna de su cadena complementaria. También, gracias a esta
complementariedad y antiparalelidad, una cadena sencilla de DNA identifica en forma
específica a su complementaria.
• Estructura
tridimensional de
la hélice doble del
DNA •
El tipo principal de hélice que el DNA forma
en la naturaleza se denomina conformación
B (figura 27-7). Otras conformaciones que
puede adoptar el DNA son la conformación
cruciforme, la cuádruplex-G y la Z. Estas
conformaciones del DNA diferentes a la
canónica conformación B, han mostrado ser
sitios con altas tasas de mutaciones, que se
asocian con varias patologías.
El armazón, constituido por las pentosas y los fosfatos, con sus cargas
negativas, queda por fuera de la hélice y va girando a lo largo del
eje de ésta en forma diestra. Los anillos purínicos y pirimidínicos de
cada par de bases se sitúan en el interior de la hélice, alineándose
en un solo plano. Este plano, que incluye el par de bases y sus
puentes de hidrógeno, se sitúa en forma casi perpendicular al eje de
rotación de la hélice. El apilamiento de los pares de bases permite
una interacción electrónica del tipo de las fuerzas de van der Waals
entrelos anillos, la cual contribuye a la estabilidad de la hélice.
En la conformación B, la hélice del DNA
tiene la forma de un largo cilindro con
diámetro de 2 nm. Cada par de bases
contribuye a la longitud de la hélice en
0.34 nm y la hace girar 36° hacia la
derecha. Este giro hace que, al irse
apilando, los pares de bases se
desplacen en un factor de 36° con
respecto al par vecino y que cada 10
pares de bases haya una revolución
completa (360°) del enrollamiento de la
hélice.
No importa que las bases nitrogenadas estén alojadas en el
interior de la hélice doble, los surcos son el sitio de
acceso a ellas; son sitios de crucial importancia para que
la maquinaria enzimática y otras proteínas reguladoras
“lean”, a través de ellos, las secuencias nucleotídicas del
DNA responsables de la especificidad de la interacción.
Estructura secundaria del RNA: dobles
cadenas complementarias y antiparalelas
1. Aunque el RNA difiere de forma estructural del DNA por tener un OH en la
posición 2’ y por emplear la base uracilo en vez de la base timina, existen
entre ellos semejanzas importantes. El DNA y el RNA son polímeros muy
parecidos, ambos poseen el mismo armazón de pentosa fosfato y tienen bases
nitrogenadas que funcionan como cadenas laterales variables, unidas a la
posición 1’ del armazón. Esta semejanza se extiende a la capacidad del RNA de
formar, como el DNA, estructuras de dos cadenas poliméricas.
2. En el caso del RNA, las purinas y pirimidinas que forman los pares de bases son
C ≡ G y A = U, con 3 y 2 puentes de hidrógeno, respectivamente.
La molécula de DNA
tiene surcos
1. El examen cuidadoso del modelo descrito en la
figura 34-2 revela un surco mayor y un surco
menor que dan vueltas a lo largo de la
mo_x0002_lécula paralelos a los esqueletos
fosfodiéster. En estos surcos, las proteínas
pueden interactuar de modo específico con
átomos ex_x0002_puestos de los nucleótidos
(por medio de interacciones hidrofóbicas y
iónicas específicas) y por ello reconocen, y se
unen a, secuencias de nucleótido específicas,
regularmente sin alterar la formación de pares
de bases de la molécula de DNA de doble hélice.
El DNA existe en formas relajada
y superenrollada
Los círculos cerrados Las enzimas que catalizan
Este proceso que
existen en formas cambios topológicos del
necesita energía
relajada y DNA se llaman
coloca a la molécula
superenrollada. Las topoisomerasas, las
bajo tensión de
superhélices se cuales pueden relajar o
torsión, y mientras
introducen cuando un insertar superhélices,
mayor es el número
círculo cerrado se gira usando ATP como una
de superhélices,
alrededor de su propio fuente de energía. Hay
mayor es la tensión o
eje o cuando un homólogos de esta
torsión (como ocurre
fragmento lineal del DNA enzima en todos los
al torcer una bandera
dúplex, cuyos extremos organismos, y son blancos
de caucho).
están fijos, se tuerce. importantes de la
quimioterapia de cáncer.
•EL DNA PROPORCIONA UN MOLDE PARA
REPLICACIÓN Y TRANSCRIPCIÓN
Cada célula hija
contiene moléculas
de DNA con
La molécula de información idéntica
DNA sirva como un molde, en el a la que poseía la
La información genética
primer caso para la transcripción célula madre.
almacenada en la
de la información hacia el RNA, y
secuencia de nucleótido
en el segundo para la replicación
del DNA tiene dos
de la información hacia
propósitos. moléculas de DNA hijas
• Casi todas las especies de rNA participan en
algún aspecto de la síntesis de proteína
Muchas otras moléculas de
RNA citoplásmicas muy
Las moléculas de RNA abundantes (RNA ribosómicos;
citoplásmico que sirven como rRNA) tienen funciones
moldes para la síntesis de estructurales en donde
contribuyen a la formación y
proteína (es decir, que función de ribosomas (la
transfieren información genética maquinaria en el ámbito de
desde el DNA hacia la maquinaria organelo para
sintetizadora de proteína) se la síntesis de proteína) o
designan RNA mensajeros, o sirven como moléculas
mRNA adaptadoras (RNA
de transferencia; tRNA) para la
traducción de información del
RNA hacia secuencias
específicas de aminoácidos
polimerizados
Hay varias clases
de rNA
En todos los organismos procarióticos y eucarióticos hay cuatro clases
principales de moléculas de RNA: mensajero (mRNA), de
transferencia (tRNA), ribosómico (rRNA) y RNA pequeños. Cada
uno difiere de los otros en su abundancia, tamaño, función y
estabilidad general.
• rNA mensajero (mrNA)
Esta clase es la de abundancia, tamaño y estabilidad más heterogéneos; por ejemplo, en la
levadura de cerveza mRNA específicos están presentes en cientos/célula hasta, en promedio,
≤0.1 mRNA/ de la celula.
rNA de transferencia (trNA)
La longitud de las moléculas de tRNA varía desde 74 hasta 95 nucleótidos. También se
generan por procesamiento nuclear de una molécula precursora (cap. 36). Las moléculas de
tRNA sirven como adaptadoras para la traducción de la información en la secuencia de
nucleótidos del mRNA hacia aminoácidos específicos. Hay al menos 20 especies de
moléculas de tRNA en cada célula, y por lo menos una (y a menudo varias) corresponde a
cada uno de los 20 aminoácidos requeridos para la síntesis de proteína.
rNA ribosómico (rrNA)
Un ribosoma es una estructura nucleoproteínica citoplásmica que actúa como
la maquinaria para la síntesis de proteínas a partir de los moldes de
mRNA. En los ribosomas, las moléculas de mRNA y tRNA interactúan para
traducirse hacia una información acerca de molécula de proteína
específica transcrita desde el gen. Durante periodos de síntesis activa de
proteína, muchos ribosomas pueden asociarse con cualquier molécula de
mRNA para formar un montaje llamado el polisoma (fig. 37-7).
GENOMA Y
CROMOSOMAS
El genoma es el conjunto de genes y secuencias
que regulan su expresión
1. Con su lenguaje de cuatro letras, el ADN contiene la información necesaria
para construir el cuerpo humano completo. Un gen se refiere
tradicionalmente a la unidad de ADN que lleva las instrucciones para
elaborar una proteína específica o un grupo específico de proteínas. Cada
uno de los estimados 20,000 a 25,000 genes en el genoma humano
codifica un promedio de tres proteínas.
2. Encontrados en 23 pares de cromosomas empacados en el núcleo de una
célula humana, los genes dirigen la producción de proteínas con la ayuda
de enzimas y moléculas mensajeras. Específicamente, una enzima copia
la información del ADN de un gen a una molécula llamada ácido
ribonucleico mensajero (ARNm). El ARNm sale del núcleo al citoplasma de
la célula, donde el ARNm es leído por una diminuta máquina molecular
denominada ribosoma, y la información se utiliza para unir pequeñas
moléculas llamadas aminoácidos en el orden correcto para formar una
proteína específica.
1. Las proteínas forman estructuras corporales, tales como órganos y tejidos,
y también controlan reacciones químicas y transportan señales entre una
célula y otra. Si se muta el ADN de una célula, podría producirse una
proteína anómala, que puede alterar los procesos habituales del cuerpo y
dar lugar a una enfermedad como el cáncer.
• La información genética en el DNA de un cromosoma puede transmitirse por
medio de replicación precisa, o se puede intercambiar mediante diversos
procesos, entre ellos entrecruzamiento, recombinación, transposición y
conversión.
• Éstos proporcionan un medio para asegurar la adaptabilidad y diversidad para el
organismo pero, cuando estos procesos tienen errores, también pueden dar por
resultado enfermedad.
• Varios sistemas enzimáticos participan en la replicación, alteración y reparación
del DNA. Las mutaciones se deben a un cambio de la secuencia de bases de
DNA, y en ocasiones dependen de defectos de la replicación, el movimiento o la
reparación del DNA, y ocurren con una frecuencia de alrededor de una en cada
106 divisiones celulares
1. Una mutación en una célula germinal se transmite hacia la descendencia
(la denominada transmisión vertical de enfermedad hereditaria). Diversos
factores, entre ellos virus, sustancias quími_x0002_cas, luz ultravioleta y
radiación ionizante, aumentan el índice de mutación.
2. Las mutaciones suelen afectar células somáticas y, así, se transmiten
hacia generaciones sucesivas de células, pero sólo dentro de un
organismo (es decir, de modo horizontal).
La cromatina consta de
moléculas de DNA de La hélice de
doble cadena muy DNA bicatenario en
largas, y una masa casi cada cromosoma tiene
igual de proteínas una longitud que es
básicas más bien mi_x0002_les de veces
pequeñas el diámetro del núcleo
llamadas histonas, de la célula.
En estudios de microscopia electrónica de cromatina se han demostrado partículas esféricas densas
denominadas nucleosomas, que tienen alrededor de 10 nm de diámetro y están conectadas por
medio de filamentos de DNA (fig. 351). Los nucleosomas están compuestos de DNA enrollado
alrededor de un conjunto de moléculas de histona.
• Our team
El complejo de ADN más histonas y otras proteínas estructurales se llama cromatina.
Durante la mayor parte de la vida de la célula, la cromatina está descondensada, lo que significa
que existe en cadenas largas y delgadas que parecen garabatos bajo el microscopio. En este
estado, la maquinaria celular (como las proteínas que leen y copian el ADN) puede acceder de
forma relativamente fácil al ADN, lo cual es importante para permitir que la célula crezca y
funcione.
1. Las proteínas protegen, empaquetan y regulan la actividad biológica del
ADN. Los humanos tenemos 46 cromosomas en cada una de nuestras
células, organizados en 23 pares. Recibimos 23 cromosomas de nuestra
madre y 23 de nuestro padre. Durante la formación de las células
especializadas de la reproducción, los gametos, es decir, los cromosomas
de esas células, sufren un proceso llamado meiosis, que tiene por
resultado la reducción de la cantidad de cromosomas. Ya maduros, los
gametos sólo contienen la mitad de la cantidad normal de cromosomas;
es decir, para nuestra especie, 23 cromosomas. Al unirse los dos gametos,
el femenino y el masculino, se reconstituye el número normal de
cromosomas, 23 pares o 46 cromosomas.
1. Cada célula de nuestro cuerpo tiene dos copias de cada cromosoma, o dos juegos
completos de todos nuestros genes, o genoma: uno que heredamos de nuestro padre y
otro que heredamos de nuestra madre. El orden en el que se han enlazado los
nucleótidos que conforman las hebras del ADN constituye la información genética.
2. Ahora sabemos que el genoma humano tiene aproximadamente 3 mil millones de
nucleótidos, que llenarían aproximadamente 500 directorios telefónicos de 500 páginas
cada uno, o un solo DVD (video disco digital), repartidos en 23 cromosomas.
1. Los dos cromosomas en un par homólogo son muy similares entre ellos y
tienen el mismo tamaño y forma. Sobre todo, portan el mismo tipo de
información genética: es decir, tienen los mismos genes en los mismos
lugares. Sin embargo, no tienen necesariamente las mismas versiones de
los genes. Eso es porque puedes haber heredado dos versiones diferentes
de genes de tu mamá y de tu papá.
2. Como un ejemplo real, vamos a considerar un gen en el cromosoma 9 que
determina el tipo de sangre (A, B, AB u O).
3. Es posible que una persona tenga dos copias idénticas de este gen, uno
en cada cromosoma homólogo; por ejemplo, puedes tener una dosis doble
de la versión del gen para el tipo A. Por otra parte, puedes tener dos
versiones diferentes del gen en tus dos cromosomas homólogos, como
uno para el tipo A y uno para el tipo B (que da sangre tipo AB).
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Los cromosomas sexuales, X y Y, determinan el sexo
biológico de una persona: XX especifica femenino y XY
especifica masculino. Estos cromosomas no son homólogos
verdaderos y son una excepción a la regla de los mismos
genes en los mismos lugares. Aparte de regiones pequeñas
de similitud necesarias durante la meiosis, o producción de
células sexuales, los cromosomas X y Y son distintos y portan
genes diferentes. Los 44 cromosomas no sexuales en
humanos se llaman autosomas
1. A medida que una célula se prepara para dividirse, debe hacer una copia
de cada uno de sus cromosomas. Las dos copias de un cromosoma se
llaman cromátidas hermanas. Las cromátidas hermanas son idénticas y
están unidas una con la otra por proteínas llamadas cohesinas. La unión
entre las cromátidas hermanas es más fuerte en el centrómero, una
región del ADN que es importante para su separación durante fases
posteriores de la división celular.
2. Mientras las cromátidas hermanas están conectadas en el centrómero, se
consideran como un cromosoma. Sin embargo, tan pronto como se
separan durante la división celular, cada una se considera un cromosoma
diferente.
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