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Genética y Genómica: Nuestro Futuro

Este documento trata sobre genética y genómica. Explica conceptos como genética, genómica, el proyecto genoma humano y medicina genómica. También describe cómo se organiza el genoma y algunas enfermedades genéticas como la fibrosis quística.
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Genética y Genómica: Nuestro Futuro

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G.

Antiñolo
mar2k6
Genética y Genómica:
Nuestra herencia, Nuestro futuro
Guillermo Antiñolo
Unidad Clínica de Genética y Reproducción
Hospitales Universitarios Virgen del Rocío
Sevilla
Nuestra herencia
G. Antiñolo
mar2k6

Nuestro futuro

 Genética ¿el pasado?

 Genómica

 El Proyecto Genoma Humano

 Medicina Genómica

 Medicina Genómica, genética e


investigación

 Genómica y Sociedad
¿Por qué es importante el genoma?

 El genoma contiene toda la información


necesaria para todos los aspectos
relacionados con:

 Embriogénesis
 Desarrollo
 Crecimiento
 Metabolismo
 Reproducción
¿Cómo se organiza el genoma?
 Los genes, ADN, gracias a diversas
proteínas (estructurales y reguladoras)
están empaquetados formando los
cromosomas.
 Excepto durante la división celular, la
cromatina está homogéneamente
distribuida en el núcleo.
Genética vs Genómica

 Genética: estudio de los


genes y sus efectos (por
ejemplo CFTR y la Fibrosis
Quística)

 Genómica: estudio de
TODOS los genes del
genoma, incluyendo sus
interacciones con los
factores medio
ambientales.
Genética, ¿el pasado?

 Enfermedades causadas por la presencia o


ausencia de un cromosoma o región
cromosómica

 Enfermedades causadas por mutaciones de


un único gen
Carga Genética
El 8% de las personas es diagnosticado antes de los 25 años de
una enfermedad que tiene un componente genético

 Enfermedades Monogénicas 3,6/1000


Autosómicas dominantes 1,4/1000
Autosómicas recesivas 1,7/1000
Ligadas al X 0,5/1000
 Anomalias cromosómicas 1,8/1000
 Enfermedades Multifactoriales 46,4/1000
 Anomalías congénitas 26,6/1000
 Otras 1,6/1000
Enfermedad rara

 Es aquella enfermedad con una prevalencia de:


 1/1350 (National Institute of Health)
 1/2000 (Unión Europea)
 Entre las enfermedades denominadas raras, más del 80%
presenta una base genética.
EFECTO DE LAS ENFERMEDADES DE
BASE GENÉTICA
 Prevalencia en R.N. vivos de EBG > 2%
 30-50% de los ingresos pediátricos
 Primera causa de mortalidad en Andalucía hasta los 14 años
 Afectan a la seguridad reproductiva
 5% de la carga de enfermedad en nuestra población
 Morbimortalidad perinatal, infantil y adulta
 Dificultad diagnóstica y retraso en el diagnóstico
 suponen una gran carga social y familiar

 Esperanza de Vida.
 Calidad de Vida.
 Reproducción.
 Adaptación Individual, Familiar y Social.
Enfermedad con
Componente Genético

Localización del gen


Tiempo

Proyecto
Identificación del gen Genoma
Humano

Diagnóstico Función
G. Antiñolo
mar2k6

Diagnóstico Genético
y
Medicina Molecular

Consejo
Genético
Tiempo

Diagnóstico
Prenatal

Diagnóstico
Presintomático
Síndrome de Wolf-Hirschhorn

Región 4p16.3

Tel cen
Exon 25a
Exon 12b
Exon
1

165 Kb
WHSCR

90 Kb
Síndrome de DiGeorge/VCFS

22q11.2
N25 D22S75
cen CLATHRI Tel

3’ TUPLE 1
D22S553
D22S609
D22S942
N
CTP

LSI TUPLE 1
110 Kb
Fibrosis Quística

 Desequilibrio iónico por alteración del transporte del ion cloro lo cual
provoca la formación de moco obstructivo en pulmones y páncreas y
elevadas concentraciones de cloro en las secreciones sudoríparas.
 Enfermedad de herencia autosómica recesiva.
 Gen responsable: CFTR (Cystic Fibrosis transmembrane regulator)
 Localización molecular: 7q31
 Alteración molecular: mutaciones en el gen CFTR
Análisis de las mutaciones mas
frecuentes en Fibrosis Quística

F508 G542X G551D


R553X 1717-1G>A N1303K
R117H 621+1G>T W1282X

1078 del T R334W R1162X


A455E 3659 del C 3849+10kbC>
T
D1507 S1251N R347P
D1152H E60X 2183AA>G
711+1G> 1898+1G> 3120+1G>A
T A
2184delA G85E 2789+5G>A
I148T R560T
Amniocentesis
DIAGNÓSTICO GENÉTICO
G. Antiñolo
mar2k6

PREIMPLANTATORIO

Biopsia d +3
Verde –- Cromosoma
Cromosoma 13
X
Acqua– -Cromosoma
Rojo Cromosoma21
18
Fijación
citoplasma
núcleo
FISH
núcleo

Día +4

Blastocisto
Análisis de la expansión en Corea de
Huntington

Nº de Edad de aparición de
repeticiones síntomas

39 72-59

40 61-56

41 56-52

42 50-48

43 45-42

44 43-40

45 39-36

46 37-35

47 35-31

48 34-30

49 32-25

50 30-24
Cáncer hereditario

¿Cual es mi riesgo de
desarrollar cáncer?
G. Antiñolo
mar2k6

Genetic Susceptibility is NOT Health Destiny

Genetics is
just one
piece of the
“puzzle”
Factores que afectan a la penetrancia

Genes
modificadores Carcinógenos

Otros
Respuesta al daño
factores
del ADN

No todo el que tiene un gen alterado desarrolla cáncer


G. Antiñolo
mar2k6
PROVISIÓN DE SERVICIOS DE SALUD

 Prevención primaria y secundaria en enfermedades de base genética

 Resultados e impacto de los servicios de genética en pacientes y familias

 Validez y utilidad clinica de los análisis genéticos

 Bases de datos de pacientes

 Integración de la genética médica en la práctica clínica


QA IN GENETIC TESTING

Life Science and Biotechnology - A strategy for Europe


Second Progress report and future orientations
(07/04/2004)

Priorities for future actions by Commission and Member States

• to engage in EU-wide co-ordination of efforts to ensure the


highest quality of genetic testing in the EU and beyond EU-25,

• to establish EU-wide networking of national centres for


exchanges of information regarding quality assurance of genetic
testing, including training activities, and EU-wide networking for
genetic testing of rare diseases.
Enfermedad con
Componente Genético

Localización del gen


Tiempo

Identificación del gen

Proyecto
Diagnóstico Función Genoma
Humano
Medicina
Terapia
Predictiva
Farmacológica
Farmacogenética

Terapia Génica
G. Antiñolo
mar2k6

Investigación en
Genética

Entender la Entender la respuesta al


enfermedad tratamiento

Individualizar el
Nuevas Terapias tratamiento
Enfermedades complejas o
multifactoriales
De la genética médica a la
medicina genómica
Identificación de
Bases moleculares de Identificación y caracterización
factores genéticos
la neoplasia endocrina molecular de nuevos loci de involucrados en el
múltiple y el cáncer susceptibilidad para la enfermedad de desarrollo y progresión
medular de tiroides Hirschsprung y el cáncer medular de de enfermedades
familiar tiroides complejas
Genética y genómica: herramientas
disponibles
Técnicas
Técnicas de
de detección
detección de
de
mutaciones:
mutaciones: SSCP,
SSCP, análisis
análisis de
de
heterodúplex,
heterodúplex, dHPLC
dHPLC yy
secuenciación
secuenciación

Genotipación
Genotipación de
de marcadores
marcadores
microsatélites
microsatélites

Banco
Banco DNA
DNA

Databases
Análisis
Análisisde
deSNPs
SNPsmediante
mediante
genotipación
genotipaciónespectral
espectralyy Herramientas
Herramientas
minisecuenciación
minisecuenciación
bioinformáticas
bioinformáticas
G. Antiñolo
mar2k6

“Family history is very genomic”


--Sharon Kardia, Univ of Michigan

• Shared genes,
environments,
behaviors,and
their interactions

The Family History Public Health Initiative


[Link]
Perfil genético: preparados, listos, YA!!!

Abra la boca y diga: ACGT


ENFERMEDAD

METABOLOMA

PROTEOMA

TRANSCRIPTOMA

GENOMA
G. Antiñolo
mar2k6 medicina genómica?

Historia Bioinformática
Genoma Transcriptoma Proteoma Metaboloma clínica

Datos del paciente seguros y confidenciales


Análisis y cruce de datos en tiempo real

• Diagnóstico individualizado
• Prescripción mas eficaz
• Mejores resultados en salud
• Reducción de costes sanitarios

Medicina
Personalizada

Consulta Médica
G. Antiñolo
mar2k6 medicina genómica?

(2020?) - Alzheimer Disease, for example

 5 or 6 genetic variations identified that strongly predispose for


Alzheimer disease; another 10 or 12 with weaker association
 Chip-based genetic test gives personal likelihood of developing the
condition
 Chip-based genetic test identifies the drug most likely to be
effective for given individual
 Chip-based genetic test determines individual likelihood of drug
side effects
G. Antiñolo
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How Do Health Professionals Prepare for Genomic Medicine?

 Need to learn to “think genetically” - to:


 realize when genetic factors play a role
 effectively use family hx & genetic tests
 be able to explain genetics concepts
 deal with “risk” & genetic predisposition
 realize personal and societal impact of genetic
information
 protect genetic privacy
 use genetics to individualize patient care
 use genetics to preserve health
Misperceptions

 “Genomics isn’t relevant to me or the area of public health in


which I work”

Did you know that …

9 of the top 10 causes of death in the


U.S. have a genetic component?
Top 10 Causes of Death in the U.S. (2000)

 HEART DISEASE
 CANCER
 CEREBROVASCULAR DISEASE
 CHRONIC LOWER RESPIRATORY DISEASE
? ACCIDENTS/UNINTENTIONAL INJURIES
 DIABETES
 PNEUMONIA/INFLUENZA
 ALZHEIMER’S DISEASE
 KIDNEY DISEASE
 SEPTICEMIA
G. Antiñolo
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Misperceptions

 “There are no interventions based on


genomics”

It’s true, we can’t change our genes.


BUT we can use this knowledge to …
G. Antiñolo
mar2k6

Potential Interventions

 Modify screening and medical


recommendations
 More Frequent Screenings
 Genetic Testing/Evaluation
 Interventions or Prevention
G. Antiñolo
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Potential Interventions

 Target messages and


interventions aimed at changing
behaviors of high-risk groups
 Diet
 Physical Activity
 Smoking Cessation
 Alcohol Avoidance
 Others?
Aspectos éticos

 Equidad
 Confidencialidad
 Uso adecuado de la información genética
 Investigación biomédica
¿Cómo preparar a la sociedad en la
era de la genómica?

 Educación e información accesible con los objetivos de entender:


 La base científica de la genética
 La utilización de la genética en la práctica clínica
 Riesgo y predisposición
 Como afecta la información genética individualmente
 El impacto de la genética en la sociedad
G. Antiñolo
mar2k6

La desinformación genética

Elija el sexo de su hijo,


de forma natural.

Al menos el 50% de las


veces acertamos.
“To wrest from nature the secrets
which have perplexed philosophers
in all ages, to track to their sources
the causes of diseases, to correlate
the vast stores of knowledge, that
they may be quicly avalaible for the
prevention and cure of disease -
these are our ambitions.”

(William Osler, Montreal Medical


Journal, 1902).

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