Enzimas

• Las enzimas son los catalizadores de las reacciones biológicas.

• Actúan rebajando la energía de activación
• Acelerando la velocidad de la reacción, ( mas producto formado por unidad de
tiempo).
• Exceptuando las ribozimas (*), son proteínas globulares, solubles en agua, que
se difunden bien en los líquidos orgánicos.

• Las ribozimas son unos ARN capaces de catalizar a otros ARN, quitándoles o añadiéndoles nucleótidos, sin consumirse ellos
mismos. (Se considera que en la primera materia viva la función catalítica la realizaba el ARN).
 Las enzimas cumplen las dos características de todos los catalizadores:
• Actúan en cantidades muy pequeñas.
• No se obtiene más producto, sino la misma cantidad en menos tiempo.
• No se consumen durante la reacción biológica.

Además, a diferencia de los catalizadores no biológicos, las enziimas:

• Son muy específicas.
• Actúan siempre a temperatura ambiente, la temperatura del ser vivo.
• Son muy activas. Algunas consiguen aumentar la velocidad de reacción
mas de un millón de veces, muy superior a los catalizadores no biológicos.
• Presentan un peso molecular muy elevado.
• Dada su naturaleza proteica, su síntesis implica una codificación genética.
Diferencias entre catalizadores biológicos y químicos

BIOLÓGICOS QUÍMICOS
Son específicos para una determinada reacción química o para un grupo de Aceleran cualquier reacción inespecíficamente.
reacciones químicas a para un sustrato o grupo de sustratos.
Son proteínas (aunque hay ARN –Ribozimas- con función enzimática). Son sustancias simples finamente divididas.
Son saturables No son saturables.
Son altamente eficaces (son eficaces en bajas concentraciones). Son medianamente eficaces.
Puede ser regulada su actividad catalítica. No pueden ser regulados.
Son termolábiles y su actividad puede variar también de acuerdo al pH del No son termolábiles ni se alteran con cambios de
medio. pH.
Cofactores enzimáticos
 La reacción enzimática
1. La enzima (E) actúa fijando al sustrato en su superficie (adsorción) mediante
enlaces débiles
2. Se forma el complejo enzíma-sustrato (ES). Se generan tensiones que
debilitan los enlaces del sustrato, por lo que para llegar al estado de transición
del complejo enzima-sustrato, (complejo activado) se requiere mucha menos
energía que para llegar al estado de transición del sustrato solo.
3. Se liberan la enzima intacta (E) y el producto (P)
El centro activo de los enzimas
• La formación del complejo ES se realiza gracias a
los radicales de algunos pocos aminoácidos que
establecen enlaces con el sustrato (y con el grupo
prostético si lo hay), fijándolo y luego rompiendo
alguno de sus enlaces.

• La región de la enzima que se une al sustrato recibe

el nombre de centro activo.

Características:
• Es una parte muy pequeña con una estructura tridimensional en forma
de hueco que facilita encajar al sustrato.
• Están formados por aminoácidos lejanos en la secuencia polipeptídica,
que debido a los repliegues de ésta, quedan próximos.
• Los radicales de estos aminoácidos presentan afinidad por el sustrato, lo
atraen y establecen enlaces débiles con él.
• Esto facilita que, una vez roto alguno de sus enlaces, los productos
resultantes se puedan separar con facilidad del centro activo.
En una enzima se pueden distinguir tres tipos de aminoácidos

Aminoácidos estructurales.
• Son los que no establecen enlaces químicos
con el sustrato Son los más abundantes y los
responsables de la forma de la enzima.
• Por ejemplo, en la lisozima de 129 aminoácidos,
124 son estructurales y sólo 5 no lo son.

Aminoácidos de fijación.
• Son los que establecen enlaces débiles con el
sustrato y lo fijan.
• Se encuentran en el centro activo de la enzima

Aminoácidos catalizadores.
• Son los que al establecer enlaces, débiles o
fuertes (covalentes), con el sustrato, provocan
la rotura de alguno de sus enlaces. Centro activo
• Son los responsables de su transformación.
• También están en el centro activo
 La especificidad de los enzimas
Fischer (1890) Modelo «llave (sustrato) - cerradura (enzima)»

En la actualidad se ha visto que algunas enzimas, al establecer los enlaces

con el sustrato, modifican la forma de sus centros activos para adaptarse
mejor al sustrato, es decir, solamente son complementarias después de
haberse unido a él, es el llamado acoplamiento inducido (como el guante
(enzima) se adapta a la mano (sustrato)).
 Factores que afectan la actividad enzimática

Influencia de la temperatura.

• Si a una reacción enzimática se le suministra energía calorífica, las

moléculas aumentan su movilidad y el número de encuentros
moleculares, por lo que aumenta la velocidad en que se forma el
producto.
• Existe una temperatura óptima para la cual la actividad enzimática es
máxima.

• Si la temperatura aumenta, se
dificulta la unión enzima-sustrato y
a partir de cierta temperatura la
enzima se desnaturaliza, pierde su
estructura terciaria y cuaternaria si
la tiene y, por tanto, pierde su
actividad enzimática.
 Factores que afectan la actividad enzimática

Influencia del pH.

• Las enzimas presentan dos valores límite de pH entre los cuales son
eficaces; traspasados estos valores, las enzimas se desnaturalizan y
dejan de actuar.

• Entre los dos límites existe un pH óptimo en el que la enzima presenta

su máxima eficacia.

• El pH óptimo está condicionado por el tipo

de enzima y de sustrato, debido a que el
pH influye en el grado de ionización de los
radicales del centro activo de la enzima y
también de los radicales del sustrato.

• Las variaciones de pH provocan cambios

en las cargas eléctricas, alterando la
estructura terciaria del enzima y por tanto,
su actividad.
 Factores que afectan la actividad enzimática

Inhibidores.

• Los inhibidores son sustancias que disminuyen la actividad de una

enzima o bien impiden completamente la actuación de la misma.

• Pueden ser perjudiciales o beneficiosos como, por ejemplo, la

penicilina, que es un inhibidor de las enzimas que regulan la síntesis de
la pared bacteriana, por lo que es útil contra las infecciones
bacterianas, y el AZT, que es un inhibidor de la transcriptasa inversa,
por lo que retrasa el desarrollo del SIDA.
 Factores que afectan la actividad enzimática

Concentración del sustrato

A mayor concentración del sustrato, a una concentración fija de la enzima se
obtiene la velocidad máxima.
Concentración de la enzima
Siempre y cuando haya sustrato disponible, un aumento en la concentración de la
enzima aumenta la velocidad enzimática hacia cierto límite.

Después de que se alcanza esta velocidad, un

aumento en la concentración del sustrato no tiene
efecto en la velocidad de la reacción. (todos los
enzimas están ocupados)
Velocidad de la
reacción

A medida que aumenta la concentración de

sustrato, aumenta la velocidad de reacción
(mientras queden enzimas libres).

Concentración de sustrato (concentración de enzima fija)

 Cinética de la actividad enzimática

En una reacción enzimática con una concentración de enzima constante,

al incrementar la concentración del sustrato se produce un aumento de
la velocidad de reacción. Este incremento en la velocidad de reacción se
debe a que, al haber más moléculas de sustrato por unidad de volumen,
se aumenta la probabilidad de encuentro entre sustrato y enzima.

Llega un momento en que la velocidad

Velocid ad de
reacción
de reacción deja de crecer, es decir, se
llega a una velocidad máxima (Vmax).

Esto se debe a que todas las moléculas

Vmax de la enzima ya están ocupadas por
moléculas de sustrato, formando el
complejo enzima-sustrato, lo que se
Vsemimax denomina saturación de la enzima.

KM [S
Constante de Michaelis-Menten (KM).

Es la concentración del sustrato a la cual la velocidad de reacción es la

mitad de la velocidad máxima. KM depende de la afinidad que hay entre la
enzima y su sustrato.
Un valor de KM pequeño indica mucha afinidad (la mitad de la velocidad
máxima se alcanza a concentraciones de sustrato pequeñas)
 REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

ACTIVACIÓN ENZIMÁTICA
 Inhibición enzimática
La inhibición puede ser de dos tipos: irreversible y reversible.

1. La inhibición irreversible. Los inhibidores irreversibles son

los que se combinan o destruyen un sitio esencial para la
actividad de la enzima.
2. La inhibición reversible tiene lugar cuando no se inutiliza el
centro activo, sino que sólo se impide temporalmente su
normal funcionamiento. Existen tres modalidades:

a) Competitiva
b) No competitiva
 INHIBICIÓN ENZIMÁTICA

Inhibidor competitivo

Inhibidor no competitivo
• La inhibición reversible competitiva se debe a la
presencia de un inhibidor cuya molécula es
similar al sustrato por lo que compite con este en
la fijación al centro activo del enzima.
• Si se fija el inhibidor, la enzima queda
bloqueada.
• La velocidad de la reacción disminuye en función
de la concentración del inhibidor.
• La inhibición reversible no competitiva es cuando un determinado
producto se une a un lugar del enzima distinto del centro activo,
cambiando la forma del enzima e impidiendo la unión del sustrato
Enzimas alostéricas

Las enzimas alostéricas son aquellas que pueden adoptar dos formas
estables diferentes (activa e inactiva).

Estas enzimas, además del centro activo, tienen al menos otro lugar,
denominado centro regulador, al que se puede unir una determinada
sustancia, denominada ligando.

Los ligandos pueden ser activadores o inhibidores.

 Inhibición alostérica.
sustrato

Enzima activa

Sin inhibidor

Los inhibidores alostéricos

se unen a una zona de la
enzima y cambian la Enzima inactiva
configuración del centro
activo de tal manera que
impiden que el sustrato
se pueda unir a él. con inhibidor

inhibidor
 Cooperativismo

Las enzimas alostéricas suelen estar formadas por varias subunidades

moleculares denominadas protómeros.

Cada protómero posee un centro activo y al menos un centro regulador. En

muchas enzimas, cuando al centro regulador se une una molécula
denominada activador o ligando, la conformación del protómero varía,
haciendo funcional al centro activo.

La variación en la conformación de este protómero se transmite

instantáneamente a los otros protómeros asociados haciéndolos a su vez
activos, efecto que se denomina transmisión alostérica.

De esta forma la enzima pasa de estado inhibido a un estado activo o

catalítico.
Para que una enzima alostérica actué es precisa la unión de uno o más
ligandos y luego la del sustrato, por tanto la velocidad de reacción en función
de la concentración de sustrato no aumenta tan rápidamente como en las
enzimas no alostéricas. Pero una vez transformada al estado activo una
subunidad, todas las demás subunidades subitamente empiezan a actuar,
(cooperativismo,) y se produce un cambio de velocidad de reacción muy
grande, la llamada «ley del todo o nada».
La representación gráfica de la relación
entre la velocidad de reacción y la
concentración del sustrato no es una
hipérbola, sino una curva sigmoidal o curva
en «S»
El alosterismo permite la autorregulación de la actividad enzimática.
Hay dos casos:

[Link]ón por retroinhibición o inhibición feed-back. Se da en

enzimas cuya conformación inicial es la activa. Se produce cuando el
producto final es el que al fijarse al centro regulador actúa como
inhibidor, provocando la transición alostérica a la forma inactiva de la
enzima.

2. Regulación por inducción

enzimática. Se da en enzimas
cuya conformación inicial es la
inactiva. Se produce cuando
alguna sustancia inicial es la que
al fijarse sobre el centro regulador
provoca la transición alostérica a
la forma activa de la enzima, por lo
que ésta empieza a actuar sobre
el sustrato
 Sustratos

Si el ligando no se une al
centro regulador el enzima no
puede unirse al sustrato

Ligandos

Si el ligando se une al centro

regulador , el centro activo se
modifica y el enzima se une al
sustrato
 Enzimainhibidor sustrato

El centro
activo está
Enzima sustrato Inhibición competitiva ocupado. El
sustrato no
puede entrar

sustrato
Inhibición alostérica Enzima
El centro
activo se
modifica por
la acción del
regulador regulador. El
sustrato El sustrato
sustrato no
Inhibición esta
puede entrar
acompetitiva modificado,
no puede
entrar en el
centro activo
Inhibición enzimática
 Representación de los distintos
cambios conformacionales que
padece la hemoglobina al unirse
con una molécula de oxígeno

Un molécula de oxígeno se puede unir con el hierro (II) del grupo hemo en cada una de
las cuatro cadenas de la molécula de hemoglobina.

La desoxihemoglobina tiene una relativa baja afinidad para el oxígeno, pero cuando una
molécula se une a un único hemo, crece la afinidad por el oxígeno, permitiendo que la
segunda molécula se una más fácilmente, y la tercera y cuarta aun más fácilmente.
 La cooperatividad es un fenómeno común y puede
llegar a ser crucial en la regulación de la respuesta
enzimática a cambios en la concentración de sustrato.

La cooperatividad positiva hace que la enzima sea

mucho más sensible a la concentración de sustrato,
con lo que su actividad puede llegar a variar en gran
medida aunque se mueva en rangos muy estrechos
de concentración de sustrato.
Representación de los distintos
cambios conformacionales que
padece la hemoglobina al unirse La cooperatividad negativa hace que la enzima sea
con una molécula de oxígeno insensible a pequeños cambios en la concentración de
sustrato.
Nomenclatura de los Enzimas
1. NOMENCLATURA ANTIGUA: SUFIJO -asa
• Nombre de la fuente u origen del enzima: Pancreasa
• Nombre del sustrato: Proteasa
• Tipo de reacción catalizada: Hidrolasa

2. NOMENCLATURA ACTUAL:
Enzyme Commission [E.C.] de la IUBMB
• Clasificación de enzimas (6 clases)
• Asignación de código E.C.: [Link]
• Nombre sistemático:
Sustrato:Cosustrato Tipo de Reacción -asa
Etanol:NAD+ Oxidorreductasa
 Clasificación de los Enzimas
CLASE TIPO DE REACCION CATALIZADA

1. OXIDO-REDUCTASAS Transferencia de electrones

20 subclases Sred + S’ox  Sox + S’red

2. TRANSFERASAS Transferencia de grupos

9 subclases S-grupo + S’  S’-grupo + S

3. HIDROLASAS Rotura hidrolítica de enlaces

11 subclases A-B + H2O  A-H + B-OH

4. LIASAS Rotura de enlaces A-B  A+B

7 subclases Salida de grupos CX-CY  C=C + X-Y
Adición a dobles enlaces C=C + XY  CX-CY

5. ISOMERASAS Cambios internos

6 subclases Transferencias internas de grupos

6. LIGASAS Formación de enlaces mediante reacciones de

5 subclases condensación con gasto de energía (ATP)

International Union of Biochemistry and Molecular Biology [IUBMB]

 Eficacia de las vías metabólicas

En las vías metabólicas el producto generado por una enzima es el

sustrato de la siguiente enzima, por ello, para aumentar la eficiencia del
sistema hay distintos mecanismos:

[Link] compartimentación. Consiste en separar mediante membranas los

lugares donde se realizan aquellas vías metabólicas que no se desea que
se relacionen
[Link] multienzimático. Es la asociación de varias enzimas que
actúan sucesivamente en una vía. El complejo supramolecular resultante
es más eficaz que si las enzimas estuvieran dispersas en el medio.
[Link]ón en membranas. Algunas enzimas y algunos complejos
multienzimáticos se encuentran englobados de forma ordenada en las
membranas, de forma que esto facilita la unión entre los sucesivos
productos y las sucesivas enzimas.
Vitaminas
Son moléculas muy variadas que pueden pertenecer a distintos grupos de
principios inmediatos.
Algunas son indispensables en la dieta, ya que no pueden ser sintetizadas por
el organismo (excepto la B5).
Otras vitaminas son necesarias para la actuación de determinados enzimas, ya
que funcionan como coenzimas que intervienen en distintas rutas
metabólicas y , por ello, una deficiencia en una vitamina puede originar
importantes defectos metabólicos.
Las cantidades necesarias son mínimas (una dieta variada garantiza las
necesidades del organismo)
Las vitaminas se clasifican según su solubilidad en agua:

[Link] hidrosolubles.
• Actúan como coenzimas o precursores de coenzimas.
• Son las del complejo B o la vitamina C

[Link] liposolubles.
• No son solubles en agua y si en disolventes no polares.
• Son lípidos insaponificables.
• No suelen ser cofactores o precursores.
• Son las vitaminas A,D,E y K
 Enfermedades
FUNCIONES
VITAMINAS carenciales
C (ácido Coenzima de algunas peptidasas. Interviene
Escorbuto
ascórbico) en la síntesis de colágeno
Coenzima de las descarboxilasas y de las
B1 (tiamina) Beriberi
enzima que transfieren grupos aldehidos
Constituyente de los coenzimas FAD y Dermatitis y lesiones
B2 (riboflavina)
FMN en las mucosas
B3 (ácido Fatiga y trastornos del
Constituyente de la CoA
pantoténico) sueño
Constituyente de las coenzimas NAD y
B5 (niacina) Pelagra
NADP
Interviene en las reacciones de transferencia
B6 ( piridoxina) Depresión, anemia
de grupos aminos.
Coenzima en la transferencia de grupos
B12 (cobalamina) Anemia perniciosa
metilo.
Coenzima de las enzimas que transfieren
Biotina grupos carboxilo, en metabolismo de Fatiga, dermatitis...
aminoácidos.
Ceguera nocturna,
Ciclo visual, crecimiento, protección y
A (retinol) xeroftalmia,
mantenimiento del tejido epitelial
desecación epitelial
Metabolismo del Ca2+, esencial en el Raquitismo,
D
crecimiento y mantenimiento de los huesos deformidades oseas