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Replicación del DNA: Proceso y Enzimas

Este documento describe el proceso de replicación del ADN en procariotas. Explica que la replicación es semiconservativa y ocurre en tres etapas: iniciación, elongación y terminación. En la iniciación, se desenrolla y separa la doble hélice de ADN en el punto de origen, se sintetiza un cebador de ARN y se une el primer desoxirribonucleótido. En la elongación, las ADN polimerasas sintetizan las nuevas cadenas de ADN de forma bidireccional. En la terminación, las
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Replicación del DNA: Proceso y Enzimas

Este documento describe el proceso de replicación del ADN en procariotas. Explica que la replicación es semiconservativa y ocurre en tres etapas: iniciación, elongación y terminación. En la iniciación, se desenrolla y separa la doble hélice de ADN en el punto de origen, se sintetiza un cebador de ARN y se une el primer desoxirribonucleótido. En la elongación, las ADN polimerasas sintetizan las nuevas cadenas de ADN de forma bidireccional. En la terminación, las
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Replicación

Licda. Nerkys Lorena Doñe


DNA  RNAm  PROTEÍNAS
“Es la síntesis del DNA formándose 2
moléculas hijas idénticas a la molécula
madre”
 ¿CUÁNDO OCURRE?
JUSTO ANTES DE LA DIVISIÓN CELULAR.
 ¿DÓNDE SE LOCALIZA?
EN EL NÚCLEO.
REGLAS FUNDAMENTALES
 Es semi conservativa.
 Empieza en un punto de origen.
 Ocurre bidireccionalmente.
 La dirección de lectura es 3’  5’
 La dirección de síntesis es 5’  3’ y es
semi discontinua.
 La polimerización es termodinámicamente
favorable
REPLICACIÓN EN
PROCARIOTAS
MODELOS O
TEORÍAS

 DISPERSIVA
 CONSERVATIVA
 SEMICONSERVATIVA
Las cadenas de DNA
progenitoras se
rompen a intervalos,
y las dos moléculas
de DNA de doble
cadena resultantes
(moléculas hijas)
presentan
fragmentos del DNA
progenitor
combinados con
fragmentos nuevos.


Cada una de las
hebras del DNA
progenitor se duplica
produciendo dos
moléculas hijas una de
las cuáles es la
molécula de DNA
progenitora intacta y
la otra una molécula
de DNA cuyas dos
hebras son nuevas.
• Se originan dos
moléculas de DNA,
cada una de ellas
compuesta de una
hebra del DNA
original y de una
hebra complementaria
nueva. Propuesta por
el modelo de Watson y
Crick.
REQUERIMIENTOS DE LA
REPLICACIÓN
 MOLDE  Cadena de
DNA dúplex.
 SUSTRATOS:
4 Ribonucleósidos
Trifosfatados  Mg2++
(ATP, GTP, UTP, CTP)  ATP
4 Desoxiribonucleósidos
 Proteínas
Trifosfatados
(dATP, dGTP, dTTP, dCTP) Estabilizadoras de la
Hebra Simple del
DNA (SSB).
ENZIMAS
 PROTEÍNA DNA a
 HELICASAS
 TOPOISOMERASAS I Y II (DNA GIRASA)
 PRIMASA O RNA POLIMERASA

 DNA POLIMERASAS:
• DNA POLIMERASA III
• DNA POLIMERASA I
 PIROFOSFATASAS
 DNA LIGASA
ENZIMAS DE LA REPLICACIÓN
Proteína DNA a  Separa las cadenas del DNA
dúplex.
DNA Helicasas  Desenrollan la doble hélice.
Proteínas Estabilizadoras del
DNA Monocatenario (SSB) Mantienen abierta
la hélice.
Topoisomerasas I y II  Estabilizan el
desenrrollamiento.
ENZIMAS DE LA REPLICACIÓN
RNA Primasa  Genera el RNA cebador.

RNA Cebador  Permite que empiece a actuar


la DNA Pol III.
DNA Polimerasas III  Sintetiza las cadenas de
DNA.
DNA Polimerasa III y I  Corrección de errores.

Pirofosfatasas  Aportan la energía necesaria.

DNA Ligasa  Une los fragmentos de Okazaki.


ETAPAS
1. INICIACION

2. ELONGACION

3. TERMINACION
PRE-INICIACIÓN
“Desenrrollamiento y apertura de la doble
hélice en el punto ori-c”
 LOCALIZAR ORIGEN DE REPLICACIÓN Ori C.
 SEPARARLAS CADENAS.
 FORMACIÓN DEL TOPOISÓMERO (-).
 FORMACIÓN DE LA HORQUILLA DE REPLICACIÓN.

Enzimas Que Participan:


Proteína dnaA
DNA Helicasas
Proteínas Estabilizadoras del DNA
Monocatenario (SSB)
DNA Topoisomerasas I y II
Primosoma
PRE-INICIACIÓN
“Desenrrollamiento y apertura de la
doble hélice en el punto ori-c”
1- Proteína dnaA separa la molécula doble del
DNA formando regiones de cadena simple.
2- DNA Helicasas facilitan el desenrrollamiento
de la cadena dúplex.
3- Proteínas SSB se unen a las hebras molde
para que no vuelvan a enrollarse.
4- DNA girasa y Topoisomerasas I y II eliminan
la tensión generada por la torsión en el
desenrrollamiento.
PROTEÍNA dnaA  20 – 50 monómeros.
 Se unen a secuencias especificas de
nucleótidos en el origen de la replicación (rico
en pares de bases de AT)  Ori C (245 pb).
 Requiere ATP.
 Separa la molécula doble del DNA formando
regiones de cadena simple.
 La proteína dnaA se une al ori C y a ellos se
unen las proteínas dnaB y dnaC, formando un
complejo proteico.
PUNTO DE ORIGEN

PROCARIOTAS  UNO

EUCARIOTAS  MÚLTIPLES
PROTEÍNAS ESTABILIZADORAS DE LA HEBRA
SIMPLE DEL DNA (SSB)  Se unen a la cadena
simple cooperativamente, una favorece la
unión de las demás.
 Mantienen el equilibrio entre la cadena simple
y la doble del DNA.
 Mantienen separadas las cadenas y las
protegen de las Nucleasas de DNA de cadena
simple.
DNA HELICASAS 
 Se unen al DNA de
cadena simple cerca de
la horquilla y se mueve a
la región de cadena doble
forzando la separación y
el desenrrollamiento del
DNA.
 Requieren ATP.
 Cuando las cadenas se
separan las SSB se unen
evitando que se forme de
nuevo la hélice.
 TOPOISOMERASAS  Al separarse las
cadenas del DNA doble se forman
superenrollamientos positivos/ negativos en
la región de la horquilla de replicación.
 Las Topoisomerasas se encargan de remover
esos superenrollamientos.
 I  Corta
reversiblemente una
sola cadena de la doble
hélice, pasa la cadena
intacta a través de la
rotura y resella.
 Así, relaja los
superenrollamientos
acumulados.
 No requieren ATP.
Tienen actividades de
Nucleasa y de Ligasa.
 Negativos  E. coli
 Negativos y Positivos
 Eucariotas
II  DNA GIRASA
 Corta ambas cadenas
de la doble hélice, pasa
la cadena intacta a
través de las roturas y
resella. Así, introduce
superenrollamientos
negativos en el DNA.
 Requiere ATP.
 Tiene actividades de
Nucleasa y de Ligasa.

27/08/2008 23
AgentesAnti cáncer: Etopósido Diana
 Topoisomerasa II humana.

 Agentes Antimicrobianos:
Quinolonas Ciprofloxacina 
Diana  DNA girasa bacteriana
INICIACIÓN
“Síntesis del RNA iniciador”
 FORMACIÓN DEL COMPLEJO INICIADOR.
 FORMACIÓN DEL RNA INICIADOR.
 UNIÓN DEL PRIMER DESOXIRRIBONUCLEÓTIDO.

ENZIMAS QUE PARTICIPAN:


Primosoma  Primasa (RNA Pol) + Complejo
Proteínas dnaA, dnaB y dnaC.
DNA Pol III
INICIACIÓN
“Síntesis del RNA iniciador”

 Primasa sintetiza la molécula de RNA cebador


o Primer.
 DNA Pol III une el 1er. desoxirribonucleótido
al extremo 3’ -OH del cebador.
PRIMASA O RNA POLIMERASA 
•Sintetiza de novo secuencias cortas de RNA (5
a 10 nucleótidos) de manera complementaria y
antiparalela al molde de DNA.
•Secuencia de RNA cebador, necesaria para que
actúe la DNA Pol III.
•No tiene actividad correctora.

PRIMOSOMA  Es la unión de la Primasa


con el complejo de proteínas (dnaA, dnaB y
dnaC) que se unen al DNA simple.
ELONGACIÓN
“Síntesis del DNA”
 ALARGAMIENTO DE LAS CADENAS DE DNA.
 HEBRA CONDUCTORA Y HEBRA RETRASADA.
 PARTICIPAN DNA POL III , DNA POL I, PIROFOSFATASAS Y

DNA LIGASA.

DNA Polimerasa III


sintetiza las
nuevas
hebras en sentido
5’3’.
DNA POLIMERASA III (Mg2++)
• Actividad de Polimerasa 5’  3’  Polimeriza

nucleótidos en sentido 5’  3’ (1,000


n/seg.).
•La cadena matriz 5’  3’ del DNA para que
sea copiada debe dar una vuelta “De
trombón” para que la DNA Polimerasa pueda
desplazarse por ella.
 Actividad de Exonucleasa 3’  5’  Hidroliza
los nucleótidos, que no estén correctamente
colocados, en sentido 3’  5’ y rellena.
 Esto asegura la fidelidad de la replicación.
ELONGACIÓN
UNIÓN DE LOS NUCLEÓTIDOS

 Losnucleótidos se unen entre sí mediante por


enlaces fosfodiester acción de las enzimas
Primasa (RNA Pol), DNA Pol I y III.

 Se
unen enlazando el grupo P5’ de un
nucleótido con la posición 3’ del siguiente.

 Cadanucleótido debe tener tres grupos P para


poder ser incorporado a la cadena
polinucleotídica.
 El nucleótido
pierde dos P como
pirofosfato (PPi) y
se une al azúcar
del nucleótido
siguiente a través
del P restante.
 Las Pirofosfatasas
rompen el enlace
del pirofosfato
para proporcionar
energía a la
reacción.
ELONGACIÓN

La cadena 3’5’es leída por la DNA polimerasa


III de manera continua precedida por RNA
cebador (cadena conductora, va en dirección a
la apertura de la horquilla).

La cadena 5’3’ no puede ser leída


directamente, esto se soluciona invirtiendo la
cadena y leyéndola en pequeños fragmentos de
DNA (Okazaki -1,000 n), precedidos por RNA
cebador, que crecen en sentido 5’3’ y que más
tarde se unen (cadena retrasada, va en
dirección contraria a la apertura de la
horquilla).
DNA POLIMERASA I
1- Actividad de Exonucleasa 5’  3’
PARA ELIMINAR AL RNA INICIADOR.
Separación de los ribonucleótidos del
RNA Cebador y sustitución por los
desoxirribonucleótidos correspondientes.
2- Actividad de Polimerasa 5’  3’
PARA SINTETIZAR DNA EN DIRECCIÓN 5’  3’
Rellena los huecos con DNA (10 n/seg.).
3- Actividad de Exonucleasa 3’  5’
PARA EFECTUAR LAS CORRECCIONES.
Separación de desoxirribonucleótidos
incorrectos y sustitución por los correctos.
DNA LIGASA Sella en forma
covalente las brechas del DNA
sintetizado por la DNA Pol III y el
sintetizado por la DNA Pol I, o sea, une
los fragmentos de OKAZAKI.

Estos nucleótidos deben estar situados


en una estructura de doble cadena y
apareados de manera correcta.
Requiere ATP  AMP + PPI o
NAD+  AMP + NMP
AMBAS CADENAS
TERMINACIÓN
“Corrección de Errores”
 SE REALIZA LA LECTURA DE PRUEBA PARA CORREGIR
POSIBLES ERRORES.
 SE CULMINA LA REPLICACIÓN Y LAS MOLÉCULAS HIJAS
DEL DNA SE SEPARAN.
 REPLICACIÓN SEMICONSERVATIVA.

• Las enzimas correctoras son la DNA Pol III y


la DNA Pol I que corrigen todos los errores
cometidos en la replicación o duplicación.
DNA POL III Y DNA POL I
PARA EFECTUAR LAS CORRECCIONES.
 Actividad de Exonucleasa 3’  5’  Hidroliza
los nucleótidos, que no estén correctamente
colocados, en sentido 3’  5’ y rellena.

 Esto asegura la fidelidad de la replicación.


INHIBIDORES DE
LA REPLICACIÓN
INHIBIDORES DE LA
REPLICACIÓN

1- Bloquean la replicación del DNA al detener


la elongación de la cadena, enlenteciendo
así la división de células de rápido
crecimiento y de los virus.
ACRIDÍNA,
ACTINOMICINA D Y
ETIDIO
BLEOMICINA,
◦ Se intercalan entre las NEOCARZINOSTATINA
bases y dificultan la
separación de las cadenas.
 Producen rotura de los
NETROPSINA Y enlaces entre los carbonos
DISTAMICINA A 3 y 4 de la ribosa.

• Se unen a zonas ricas en


A-T.
EJEMPLOS
NUCLEÓSIDOS ANÁLOGOS DESOXIADENOSINA 
DIDANOSINA (ddI) + OH
◦ Se producen al modificar
la porción de azúcar del TIMIDINA + N3 
nucleósido. ZIDOVUDINA (AZT)

◦AZIDO-3’-DESOXITIMIDINA
(AZT)  VIH

◦ARABINÓSIDO CITOSINA
(ara C – Cytarabina)  QUIMIOTERAPIA
◦ARABINÓSIDO ADENINA
(ara A - Viradabina)  ANTIVIRAL

EJEMPLOS
INHIBIDORES DE LA
REPLICACIÓN
2- Actúan sobre las enzimas de replicación
(inhibidores específicos)  Forman
complejos con el DNA impidiendo
su desenrrollamiento y la separación
de sus cadenas.
•NOVOBIOCINA Y
•ACIDO NALIDÍXICO  DNA GIRASA

•AFIDICOLINA  DNA POLIMERASA

EJEMPLOS

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