Scribd
Cargar
60 vistas33 páginas

MATLAB Uso

Este documento describe el uso de MATLAB para preprocesar espectros espectrales mediante funciones para la lectura de datos, normalización, transformación logarítmica y reducción de dimensionalidad a través de análisis de componentes principales (PCA). El documento guía al usuario a través del procesamiento de espectros, generación de gráficos y almacenamiento de los resultados preprocesados.

Cargado por

lizlesc
Derechos de autor
© © All Rights Reserved
Nos tomamos en serio los derechos de los contenidos. Si sospechas que se trata de tu contenido, reclámalo aquí.
Formatos disponibles
Descarga como PPTX, PDF, TXT o lee en línea desde Scribd
60 vistas33 páginas

MATLAB Uso

Este documento describe el uso de MATLAB para preprocesar espectros espectrales mediante funciones para la lectura de datos, normalización, transformación logarítmica y reducción de dimensionalidad a través de análisis de componentes principales (PCA). El documento guía al usuario a través del procesamiento de espectros, generación de gráficos y almacenamiento de los resultados preprocesados.

Cargado por

lizlesc
Derechos de autor
© © All Rights Reserved
Nos tomamos en serio los derechos de los contenidos. Si sospechas que se trata de tu contenido, reclámalo aquí.
Formatos disponibles
Descarga como PPTX, PDF, TXT o lee en línea desde Scribd

MATLAB

• Pre-procesamiento espectral.

• Análisis estadístico multivariado


Matlab 7.0
• Pre-procesamiento espectral.

1. PM_read_1Ddata.m funciones para leer datos


espectroscópicos de
Bruker
2. PM_read_procs.m funciones para leer parámetros
de procesamiento de
Bruker

3. PM_input_parameters.m contiene parámetros


ProMetab_v1_1

4. ProMetab_v1_1.m texto principal para el


Dr. Mark Viantde
procesamiento School
datosof Biosciences, University of Birmingham, Birmingham.
Formato de los datos de RMN
• Espectros contenidos en una carpeta.
• Estar enumerados secuencialmente.
• Los espectros deber ser copiados al directorio de trabajo de
MATLAB reteniendo los mismos archivos y estructura de
directorio creada por Bruker.
Se carga ProMetab_v1_1
¿1-D o 2-D?
¿Nombre de la carpeta en donde están los espectros?
¿Cuántos espectros vamos a procesar?
¿Número del primer espectro a procesar?
¿A partir de cuál  empezamos a binnear?
¿Hasta cuál ?
¿Ancho de cada bin?
Los espectros se comienzan a leer por el programa
Los espectros se comienzan a leer por el programa
Los espectros se comienzan a leer por el programa
¿Gráfico de los espectros no normalizados?
¿Qué tipo de normalización deseamos?
¿Gráfico de los espectros normalizados?
¿Gráfico de los espectros normalizados binneados?
¿Con o sin transformación logarítmica?
¿Gráfico transformado logarítmicamente?
-3
x 10 Plot of RawNormalized 1D NMR Spectra -3
x 10 Plot of RawNormalized 1D NMR Spectra
12 12

10 10

8 8

6 6

4 4

2 2

0 0

-2 -2
12 10 8 6Plot of Glog-transformed
4 2 0 -2 Binned
Normalized 12 1D NMR
10 Spectra
8 6 4 2 0 -2
6

2 FINAL
1

0
¿Cómo salvar la matriz de los espectros pre-procesados?

Nombre?
MATLAB
• Pre-procesamiento espectral.

• Análisis estadístico multivariado

PCA
TOMCAT
Toolbox for Multivariate Calibration Techniques

Michal Daszykowski, et al. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems 2003, 310, 943.
Varianza total acumulada
100

90
cumulative percent of explained data variance

80

70

60

50

40

30

20

10

0
0 2 4 6 8 10 12 14 16
Consecutive PCs
Varianza total acumulada
100

90
cumulative percent of explained data variance

80

70

60

50

40

30

20

10

0
0 2 4 6 8 10 12 14 16
100
Consecutive PCs
99

98

97

96

95

94

93

92

91

90
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5
Consecutive PCs
15
13
14

10
PC 2 - 1.57 %

-5

16
15
Grupo 2
Grupo 1

También podría gustarte