Catálisis covalente o nucleofílica
El término nucleofílico o necrófilo se refiere a cualquier compuesto que contenga un átomo con un par de
electrones no compartidos. Un buen nucleófilo es el que coparte con facilidad este par de electrones con un
átomo de otra molécula deficiente en electrones para formar un enlace covalente. Un ejemplo es la
descarboxilación del acetocetato, en ausencia del catalizador, la reacción pasa por un estado de transición
muy alta de energía, por lo que la velocidad es baja. Además se sabe que las aminas primarias actúan como
catalizadores en esta reacción. En el primer paso, el grupo amino ataca de manera nucleofílica el grupo
carbonilo del acetoacetato para formar una base de Schiff.
El nitrógeno protonado del intermediario covalente actúa como un pozo de electrones, de tal manera que
estabiliza el estado de transición y se reduce la energía libre de activación. En los pasos subsecuentes se
pierde el bióxido de carbono, se forma la acetona y se regenera la amina primaria
Catálisis por iones
metálicos
Los iones metálicos, presentes en muchas enzimas, tienen un cometido importante en el proceso catalítico. Algunos de los
mecanismos por medio de los cuales un ion metálico puede ayudar a la enzima en la transformación del sustrato son: a) al
unirse a los sustratos, los orienta para que se lleve a cabo la reacción; b) estabiliza las cargas negativas que se generan
durante el estado de transición por medio de interacciones electrostáticas; c) por su capacidad de oxidarse y reducirse en
forma reversible, es un componente importante en las reacciones de oxidorreducción; d) enmascara a un nucleófilo o activa a
un electrófilo, y e) puede aumentar la velocidad de la reacción de manera indirecta al estabilizar la estructura nativa de la
enzima.
Catálisis electrostática
Al estabilizarse el estado de transición por grupos cargados que forman parte del sitio activo, la reacción se
acelera. Como se menciona en el apartado anterior, los iones metálicos a menudo interactúan de manera
electrostática con las cargas que se generan en el estado de transición. Además, la distribución de cargas en el
sitio activo de la enzima sirve para guiar los sustratos polares hacia este sitio, de tal manera que se facilita la
interacción entre la enzima y el sustrato.
Catálisis por efecto de proximidad
y orientación
Considérese el caso de una reacción en solución en la que participan dos sustratos. Para que se formen los productos los
sustratos que tengan la suficiente energía de activación deben aproximarse y chocar en la orientación correcta. En ausencia
de una enzima, la probabilidad de que ocurra este choque productivo es baja. Las moléculas de sustrato colisionan con
frecuencia con las moléculas del solvente, y muchos de los choques entre los mismos sustratos ocurren entre regiones de la
molécula que no participan en la reacción. Por lo tanto, estos choques son improductivos. Si además se considera que, en
promedio, los sustratos en la solución están muy alejados unos de otros, el resultado es que la velocidad de la reacción es
baja. Este panorama cambia con la presencia de la enzima en el medio de reacción, ya que, cuando los sustratos entran al
sitio activo de la enzima, se inmovilizan y quedan en estrecho contacto (efecto de proximidad) y con la orientación correcta
para que ocurra la reacción (efecto de orientación), en donde se detallan las velocidades relativas de la formación del
anhídrido para ésteres que tienen diferentes grados de movimiento. La pura aproximación de los reactantes incrementa la
constante de velocidad entre 10 3 y 10 5. Sin embargo, cuando éstos se inmovilizan en la orientación correcta, el aumento es
mucho mayor, 10 7
