Transcripción
ARN
Transcripción : DEFINICION
La síntesis de ARN incluye la separación de las cadenas del ADN y
la síntesis de una molécula de ARNm, dirección 5' a 3'
ES el 1er. proceso de la expresión génica, se transfiere la
información contenida en la secuencia del ADN hacia la secuencia
de proteína utilizando diversos ARN como intermediarios.
Las secuencias de ADN son copiadas a ARN mediante la ARN
polimerasa, se sintetiza un ARN mensajero.
La transcripción del ADN se la conoce como síntesis del ARN
mensajero
Mediante esta ruta se sintetizan todos los tipos de
ARN que existen en la célula.
En la transcripción cada ARN formado corresponde
a la copia de una porción o segmento de ADN.
Características de la transcripción
Presenta una serie de
características que la
diferencian de la replicación,
las cuales son:
Reiterativo,
Selectivo una región Conservador,
concreta de Monocatenario
puesto que se El proceso no ,
ADN puede afecta a la
limita a una ser copiada estructura del afecta a una sola de
porción del multitud de las cadenas del ADN,
ADN, es un
ADN, se veces dando proceso y la copia resultante,
reconoce un lugar a la conservador de o ARN es una
punto de inicio y formación de la molécula de molécula de una
múltiples ADN, el gen o única cadena o
uno de moléculas de genes copiados monocatenaria
terminación en la ARN permanecen
molécula de iguales.
ADN
a. Complementaria b. Dirección c. Asimetría
Dirección: las ARN polimerasas sintetizan ARN, siempre 5'P→3'OH, el ARN producto
de la transcripción crece solo en esta dirección. Recuerde que la dirección en la que las
ADN polimerasas sintetizan ADN es también la misma 5'P→3'OH.
Asimetría de la transcripción: significa que solamente se transcribe para cada gen una
de las dos hélices de ADN, la hélice que se toma como molde para producir el ADN se
la denomina hélice codificadora o hélice con sentido y la otra hélice de ADN, la que no
se transcribe, se la denomina hélice estabilizadora o hélice sin sentido.
La transcripción es un mecanismo básico de complementariedad
de bases, añadidas en forma gradual, unidireccional y
antiparalela, sin necesidad de un iniciador y acoplada a
la hidrólisis del pirofosfato.
La cadena de ARN crece en dirección 5'-3' mientras que se va
copiando la cadena de ADN en dirección 3'-5' por lo que la
síntesis es antiparalela y unidireccional
Hebra molde y hebra no molde
Orientación y numeración
La posición de un nucleótido en cualquier gen o
región de DNA, siempre se refiere a la hebra
codificante.
Su orientación es la del sentido de transcripción.
Los nucleótidos de esta hebra se numeran a partir
del punto de inicio de la transcripción, al que se
asigna el valor +1
Los elementos -10 y -35 reciben sus nombres, del
hecho de estar 35 y 10 nucleótidos antes del sitio
de iniciación (+1 en el ADN).
El signo de menos solo significa que están antes, no
después, de este sitio.
Tipos de ARN Mensajero
ARNm monocistrónico: ARNm policistrónico:
1. Solo tiene
un codón de inicio AUG, 1. Tiene varios codones
de inicio AUG, por lo
reconocido por los que da lugar a varias
ribosomas para iniciar proteínas.
la traducción, lo que
2. LLeva información de
solo da lugar a una
varios genes.
proteína.
3. PROCARIOTAS
2. LLeva la información
de un único gen.
3. EUCA
Los ARNm de eucariotas tienen una vida media de hasta 10 horas.
El ARNm bacteriano no tiene Poli A y tiene una vida media de menos de
una hora.
REQUERIMIENTOS PARA LA
TRANSCRIPCIÓN
Para LLEVARSE a cabo la
requiere los
transcripción de las células se
siguientes
elementos :
1. DNA original que servirá de
molde para ser copiado.
2. ENZIMA: RNA-POLIMERASA,
sintetiza el RNA a partir del
molde de ADN.
3. Tiene por precursores a los 4
ribonucleósidos trifosfatados:
ATP, GTP, UTP, yCTP.
En la reacción de polimerización estos
son añadidos de un extremo al otro de
la hebra.
REACCION DE POLIMERIZACION TRANSCRIPCIÓN
La polimerización consiste
en la adición de un el
ribonucleósido trifosfatado ,
al extremo 3’ OH, del
nucleótido precedente y con
la liberación de pirofosfato
formar : enlace fosfodiéster.
EL enlace fosfodiéster se
corresponde a la cadena de
ARN en crecimiento y el
precursor.
El ribonucleótido con sus 3
grupos fosfato se adhiere
con la cadena molde
(cadena de ADN)
ELEMENTOS QUE PARTICIPAN EN LA
TRANSCRIPCION PROCARIOTAS FACTOR
SIGMA
Reconocimiento
del promotor
α Unión al
promotor
ARN
β Sitio catalítico
POLIMERASA:
Β’ Unión al
ADN
PROCARIOTA: Encontramos una sola
polimerasa, es decir que con una sola se
realizarian los distintos tipos de ARN.
ARN Polimerasa, formada por 5
subunidades, cuya Función es la unión
de ribonucleósidos trifosfato.
FACTOR SIGMA
1
8
ARN POLIMERASA EN EUCARIOTAS
La ARN polimerasa se puede unir al promotor, solo con la
ayuda de proteínas llamadas factores de transcripción basales.
Para cada tipo de ARN hay una polimerasa especifica.
Tipo IV y la V
Parece que funcionan solo para la reparación de las hebras de
ARN, en estrés o en reparaciones por rotura mecánica de la
célula.
Estructura del gen
Se define como la unidad elemental de la herencia, la región física y
funcional que controla una característica hereditaria concreta, la portadora de
la información genética, la que gobierna.
En la estructura básica de
cualquier gen encontramos El ADN no se traduce
cuatro elementos: directamente en proteínas sino
a. Promotor que antes debe transcribirse a
b. Secuencia codificadora ARN, que la maquinaria celular
c. Terminador puede traducir en proteínas.
d. Secuencias reguladoras
Estructura del gen
1. Los genes eucariotas están
constituidos por secuencias
regulatorias codificantes. (exones)
2. El inicio del sitio de
transcripción se denomina +1, y la
numeración aumenta conforme se
dirige al extremo 3’, se conoce
como corriente abajo, donde se
encuentran las secuencias
codificantes del gen.
3. Hacia el extremo 5’, en la
dirección opuesta, llamada
corriente arriba, la numeración se
indica como —1, y allí se
encuentra la mayoría de regiones
regulatorias del gen.
Intrones y exones
1. La región codificadora del gen, contiene regiones
que no serán traducidas, llamadas intrones, y que
son retirados posteriormente. (corte y empalme)
2. Las regiones que codifican para el producto génico
se conocen como exones.
3. Un solo gen puede sintetizar diferentes proteínas
mediante el arreglo de los exones por el proceso de
corte y empalme alternativo.
4. El tránscrito primario o ARN-hn es el producto
inmediato de la transcripción y consiste en un ARN
que contiene secuencias intrónicas y exónicas, cuyos
extremos 5’ y 3’ no han sufrido ninguna modificación.
El promotor
Para comenzar la transcripción de un gen, la ARN polimerasa
se une al ADN del gen en una región llamada el promotor.
Básicamente, el promotor le dice a la ARN polimerasa donde
"sentarse" sobre el ADN y comenzar a transcribir.
El promotor es la secuencia de DNA necesaria para que la
RNA polimerasa se una al molde y lleve a cabo la reacción de
iniciación.
PROMOTORES PROMOTORES
PROCARIOTAS EUCARIOTAS
1. El promotor mínimo es la región PromotoresEucariotico
regulatoria indispensable para la
transcripción del gen. Las secuencias
adyacentes, forman parte de él, y
pueden modificar la tasa de
transcripción del gen.
2. El promotor basal es la
secuencia mínima requerida para la
unión de la maquinaria basal de
transcripción y para la ARNp II
(incluye el Inr y la caja TATA o el
DPE.)
Una secuencia consenso es la
región conocida como iniciador
(Inr) localizada entre –3 y +5.
3. A los promotores se unen
proteínas reguladoras los factores
transcripcionales (TF), cuya función
es (aumentar o disminuir) la tasa de
transcripción.
1. Algunos promotores basales son fuertes, ubicados en los
genes procariotas y virales, se les denomina así, ya que la
maquinaria de transcripción basal se une de forma eficaz y
la tasa de transcripción es elevada.
2. Otros promotores son débiles, como los de genes
eucariotas, con un inicio de la transcripción menos
frecuente, y que requieren secuencias accesorias contenidas en
promotores proximales, localizadas a menos de 200 pb
corriente arriba del sitio de inicio de la transcripción.
3. Otras regiones regulatorias que ayudan a los promotores
débiles, son los promotores distales, que se encuentran a mas
de 200 pb río arriba (región 5’) del sitio de inicio de la
transcripción, aunque también se han localizado hacia el
extremo 3’ (corriente abajo.
A. Región promotora
Secuencia de nucleótidos conocidos como la caja
Pribnow en procariotas y caja TATA en eucariotas
LOS PROMOTORES EN LOS SERES HUMANOS
En Eucariontes, la ARN polimerasa en las células no
se une directamente a los promotores, como la ARN
polimerasa de bacterias, sino que proteínas auxiliares
llamadas factores basales (generales) de la
transcripción, se unen primero al promotor y ayudan a
la ARN polimerasa de las células a sujetarse del ADN.
La enzima ARN polimerasa, que fabrica ARN
nuevo, a partir de un molde de ADN, debe
unirse al ADN de un gen llamado el
PROMOTOR .
En las PROCARIOTAS, la ARN polimerasa se une
directamente al promotor, por medio del factor sigma.
En los EUCARIONTES, hay un paso adicional,
La ARN polimerasa se puede unir al promotor solo con
la ayuda de proteínas llamadas factores de
transcripción basales (generales).
Son parte de las herramientas centrales de transcripción
de la célula y se necesitan para transcribir cualquier
gen.
Factores transcripcionales
1. Los TF son proteínas que se unen al ADN en el promotor, potenciador o
silenciador para el control de la expresión de los genes.
Factores de transcripción generales o basales
2. Son los requeridos para el inicio de la transcripción en todos los promotores
basales. Se unen a la ARN pol para formar un complejo que rodea el sitio de
inicio, determinando la iniciación.
Factores de transcripción inducibles
1. El conjunto de TF requerido para la expresión de un gen es particular para cada
promotor.
2. Los TF inducibles, o TF de tejido específico, interactúan con el ADN de la misma
manera que los TF generales, pero su función es más bien reguladora y se unen
preferentemente a los promotores distales.
3. Se sintetizan o activan bajo un estímulo y controlan la transcripción en tiempo y
espacio.
Enhancers o POTENCIADORES o SECUENCIAS
AMPLIFICADORAS, son secuencias cortas que
potencian o aumentan la transcripción del gen de
manera cooperativa con otras secuencias reguladoras y
alteran la estructura del ADN, que favorece el inicio
de la transcripción.
CAJA TATA
Considerada como la principal secuencia del promotor, es el
sitio de unión tanto de los factores de transcripción como de
las histonas y está implicada en el proceso de transcripción
por la ARN polimerasa.
Se trata de un promotor focalizado.
Es específica de genes regulados, y sobre ella se establece el
PIC (Complejo de Preinicio), formado por la ARN polimerasa
II y sus GTFs (Factores Generales de la Transcripción).
Preiniciación
En el preinicio de la transcripción se necesitan una
serie de factores de transcripción que ejercen de
factores de iniciación, que se unen a secuencias
específicas de ADN para reconocer el sitio donde
la transcripción ha de comenzar,
El promotor de un gen es la region de ADN que
controla el inicio de la transcripción, compuesto por
una secuencia específica de ADN localizado antes del
punto de inicio de la transcripción, presente en
procariotas como eucariotas.
Un factor de transcripción es una proteína que participa
en la regulación de la transcripción, pero no forma parte
de la ARN polimerasa.
Los factores de transcripción pueden actuar
reconociendo y uniéndose a secuencias concretas de
ADN, uniéndose a otros factores, o uniéndose
directamente a la ARN polimerasa.
Preiniciacion EUCARIOTAS
Al inicio de la transcripción no se requiere de un cebador para
sintetizar la nueva cadena de ARN.
Los promotores tienen secuencias reguladoras definidas, donde
las más conocidas son la caja TATA, o caja Pribnow en
procariotas
La burbuja de transcripción se llama «complejo abierto».
La ARN polimerasa es una enzima formada por 5 subunidades: 2
subunidades α, 1 subunidadad β' y 1 subunidad ω que tiene
como función la unión de ribonucleótidos trifosfato.
Cuando se forma el complejo abierto, la ARN polimerasa
comienza a unir ribonucleótidos mediante enlaces fosfodiéster, y
una vez que se forma el primer enlace fosfodiéster, acaba la etapa
de iniciación.
Transcripción en procariotas
INICIACION
FACTOR
SIGMA
TFIIB Sirve como puente entre TFIID, el factor
que reconoce inicialmente la secuencia
promotora, y la ARN polimerasa II.
TFIID Reconocimiento del promotor.
TFIIA Interactúa con la subunidad TBP
(proteína de unión a TATA) de TFIID, y
ayuda en la unión de TBP a la caja TATA
que contiene el ADN del promotor.
TFIIE Recluta TFIIH al complejo de iniciación.
Tanto TFIIH como TFIIE son necesarios
para la eliminación del promotor por la
ARN polimerasa.
TFIIF Se une a la ARN Pol II cuando la
enzima ya está liberada de cualquier
otro factor de transcripción, lo que
evita que entre en contacto con el ADN
fuera del promotor.
TFIIH Recluta ARN Pol II a los promotores
de genes. Funciona como una
helicasa que desenrolla el ADN.
INICIACION
1ero, la Helicasa separa las hebras de ADN en LAS cajas TATA
2DO. se unen los factores y las proteínas de transcripción que permiten el
acceso de la ARN polimerasa al molde de ADN de cadena simple.
La búsqueda del promotor por la ARN polimerasa es muy rápida, se
produce la formación de la «burbuja de transcripción» o apertura del ADN
La ARN polimerasa es una enzima que tiene como función la unión
de ribonucleósidos trifosfato
3ERO. Cuando se forma el complejo abierto, la ARN polimerasa
comienza a unir ribonucleósidos mediante enlaces fosfodiéster, y
una vez que se forma el 1er enlace fosfodiéster, acaba la etapa de
iniciación y comienza así la siguiente etapa.
Disgregación del Promotor
Cuando el complejo está completo, la ARN polimerasa II se
desprende de los factores de transcripción y abre la doble hélice
en el sector del gen contiguo al promotor, se forma la burbuja de
transcripción.
Una vez sintetizado el 1er. enlace fosfodiéster, se deshace el complejo del
promotor, para que quede limpio para volver a funcionar de nuevo.
Cuando la cadena transcrita alcanza una longitud de 23 nucleótidos, el
complejo ya no se desliza y da lugar a la sgte. fase, la elongación.
ELONGACION
Mediador
TERMINACION
Hay 2 tipos de terminación:
directa o mediada por
proteínas.
Cuando el ARN se
transcribe se enrollan en
forma de horquilla y pierde
estabilidad, con lo que la
cadena se disocia,
LUEGO de la horquilla
viene una región de poli(U)
que actúa como señal para
que se suelte la ARN POL
y termine la transcripción.
2. La terminación mediada por proteínas
necesita de la PRESENCIA de proteína rho
que reconoce la señal de terminación.
No tienen cadena poli(U) en este mecanismo.
1ero. rho se une a un sitio específico del ARN
llamado rut,
2do. tras unirse, rho viaja en dirección 5′-3′
hasta que encuentra a la ARN pol y desenrolla
el segmento bicatenario hibrido de RNA-DNA
formado,
Finalmente, se libera el RNA y la RNA pol
cesando la transcripción.
Terminación en BACTERIAS LA RHO-DEPENDIENTE
El ARN contiene un sitio de
unión para una proteína
llamada factor rho, QUE se
une a esta secuencia y
comienza a "desplazarse"
por el transcrito hacia la
ARN polimerasa.
RHO-INDEPENDIENTE.
Conforme la ARN
polimerasa se acerca al final
del gen que se está
transcribiendo, llega a una
región rica en nucleótidos C
y G, que se dobla sobre sí
mismo y los nucleótidos G y
C complementarios se unen
entre sí.
Esto da como resultado una
horquilla estable que causa
que la polimerasa se
detenga.
En el caso de los ARNm de Eucariotas que llevan la información
de un gen, las secuencias con información para el polipéptido,
(EXONES), no están contiguas, están separadas por segmentos
de ARN sin función codificante (INTRONES).
El mecanismo de eliminación se llama SPLICING.
INHIBIDORES
Antibiótico
Cloranfenicol Inhibe la acción peptidil transferasa en procariontes
Estreptomicina
Inhibe la iniciación de la cadena peptídica de
procariontes y también provoca errores de lectura en
el ARNm
Inhibe la unión del aminoacil-ARNt a la subunidad
Tetraciclina
menor del ribosoma de procariontes
Inhibe la iniciación de la cadena peptídica de
Neomicina procariontes y también provoca errores de lectura en
el ARNm
Entromicina Inhibe la translocación en procariontes
Similar a la eritromicina por impedir que un factor de
Acido Fusidico elongación se disocie de la subunidad mayor del
ribosoma
Presenta una similitud muy grande a los aminoacil-
Puromicina ARNt provocando terminación prematura de la
