DOMINIO ARCHAEA
Maestría en Educación en Ciencias Naturales con orientación en
Biología
Modulo: Biodiversidad
Catedrática: PhD Mirna Marín
Presentado por: Dania Raquel Gómez
Historia
El grupo de arqueas que se ha estudiado desde más antiguo es el de las metanógenas.
La metanogénesis fue descubierta en el lago Mayor de Italia en 1776, al observar en él el
burbujeo de "aire combustible". En 1882 se observó que la producción de metano en el
intestino de animales se debía a la presencia de microorganismos.
En 1936, año que marcó el principio de la era moderna en el estudio de la metanogénesis,
H.A Barker brindó las bases científicas para el estudio de su fisiología y logró desarrollar
un medio de cultivo apropiado para el crecimiento de los metanógenos. En ese mismo año
se identificaron los géneros Methanococcus y Methanosarcina.
Las primeras arqueas extremófilas se encontraron en ambientes calientes. En 1970,
Thomas D. Brock de la Universidad de Wisconsin descubrió a Thermoplasma, un arquea
termoacidófila y en 1972 a Sulfolobus, una hipertermófila.17 Brock se inició en 1969 en el
campo de la biología de los hipertermófilos con el descubrimiento de la bacteria Thermus.
En 1977 se identifica a las arqueas como el grupo procariota más distante al descubrir que
los metanógenos presentan una profunda divergencia con todas las bacterias estudiadas.
Origen evolutivo y relaciones filogenéticas
Existen tres teorías acerca del posible origen de los tres dominios de la vida propuestos por
Woese y colaboradores:
1. Las bacterias divergieron primero, formando un linaje que produjo a las arqueas y a los
eucariotas
2. Un linaje “proto-eucariótico” divergió a partir de un linaje completamente procariótico (el
de las bacterias y las arqueas)
3. Las arqueas divergieron de un linaje que posteriormente dio lugar a los eucariotas y a las
bacterias
En 1989, dos investigadores, Gogarten e Iwabe, propusieron independientemente una forma
de analizar filogenéticamente a todos los organismos vivos (cosa imposible de hacer a partir
de estudios de secuencias de genes únicos).
Iwabe se valió del análisis de las secuencias de genes producidos en eventos “tempranos” de
duplicación génica, “enraizando” el árbol de la vida a partir de la comparación de la
secuencia de los genes parálogos que codifican factores de elongación.
Origen evolutivo y relaciones filogenéticas
Los factores de elongación son
proteínas de unión a GTP que participan
en la traducción, específicamente en la
unión de moléculas de ARN de
transferencia amioacilados a los
ribosomas y en la translocación del
peptidil ARN de transferencia.
De acuerdo con los resultados de las
comparaciones entre las secuencias de
los tres grupos, los genes que codifican
para los factores de elongación en las
arqueas son más parecidos a los de los
organismos eucariotas que a los de las
bacterias.
Origen evolutivo y relaciones filogenéticas
Gogarten, por otra parte, comparó las secuencias de otros genes producidos por
eventos de duplicación, concretamente de aquellos que codifican para las
subunidades tipo V y tipo F de la enzima ATPasa que se encuentran en
arqueas/eucariotas y en bacterias, respectivamente.
Los resultados obtenidos por Gogarten, al igual que los señalados anteriormente,
demuestran que estos genes en las arqueas (que presuntamente surgieron por
eventos de duplicación genética) están más estrechamente emparentados con los
eucariotas que con sus homólogos bacterianos.
Clasificación
Robert Harding Whittaker en 1969 creó un sistema de cinco reinos basándose en
sus características estructurales: Monera (que incluye a los procariotas), Protista
(organismos eucariotas unicelulares), Plantae (eucariotas pluricelulares
fotosintéticos), Fungi (eucariotas pluricelulares que obtienen su alimento por
absorción) y Animalia (organismos invertebrados, excepto protozoos, y los
vertebrados) (Hickman et al., 2006). Sin embargo, aún seguían sin resolverse las
relaciones evolutivas entre la mayoría de los microorganismos.
Clasificacíon
Carl Woese y colaboradores dieron un giro conceptual en la década de 1970, tras
el descubrimiento de la estructura del ADN, llegando a la conclusión de que la
historia evolutiva está registrada en el ADN. Propusieron la clasificación de los
seres vivos en tres dominios: Archaea, Bacteria y Eukarya, basándose en la
utilización de la subunidad menor del ARN ribosómico (ARNr 16S) como marcador
filogenético (Woese et al., 1990). Archaea y Bacteria contienen a los
microorganismos procariotas y Eukarya a los eucariotas
Filogenia
Con base en tres estudios recientes, uno
basado en 38 genes marcadores (2013),
otro basado en proteínas ribosomales
(2015)7y un tercero multigen (2017).
Las arqueas se subdividen en cuatro
superfilos:
1. Diapherotrites , Parvarchaeota ,
Aenigmarchaeota , Nanoarchaeota y
Nanohaloarchaeota (DPANN).
2. Thaumarchaeota , Aigarchaeota ,
Crenarchaeota y Korarchaeota (TACK);
3. Euryarchaeota
4. El recién descubierto Asgardarchaeota
Filogenie
La posición de DPANN en los árboles
filogenéticos es menos clara, ya que se
ha sugerido que pertenecen a
Euryarchaeota y que su colocación
basal en los árboles es debida a la
atracción de ramas largas, por tanto
una filogenia alternativa con una nueva
actualización es la siguiente.
Las características de los filos son:
Euryarchaeota: Es el grupo más variado, cuatro clases son metanógenas, tres son termoacidófilas
y dos hiperhalófilas. También abundan en ambientes marinos.
Grupo TACK:
Thaumarchaeota: Son quimiolitoautótrofos nitrificantes de ambientes marinos y terrestres.
Korarchaeota: Son escasas y se encuentran en fuentes termales.
Crenarchaeota o Eocyta: Tienen varias características comunes y generalmente son hipertermófilos, acidófilos,
reductores y/u oxidantes del azufre y quimiolitoheterótrofos.
Filos candidatos: Aigarchaeota (propuesto en 2011, de características intermedias entre mesófilos e hipertermófilos36
),
Bathyarchaeota y Geoarchaeota.
Asgardarchaeota: Contiene las arqueas más próximas a los eucariotas.
Filos candidatos: Lokiarchaeota, Odinarchaeota, Thorarchaeota y Heimdallarchaeota.
Grupo DPANN:
Nanoarchaeota: Hipertermófilos o acidófilos muy pequeños. Se considera que las nanoarqueas con 300 nm de
diámetro, son los procariontes más pequeños.
Filos candidatos: Diapherotrites, Parvarchaeota, Micrarchaeota (los dos filos anteriores, que contienen arqueas muy
pequeñas, se conocían previamente como ARMAN), Woesearchaeota, Pacearchaeota, Aenigmarchaeota y
Nanohaloarchaeota.
Características generales de las arqueas
Morfología
Las arqueas tienen una morfología celular
similar a la de las bacterias, pero se han
descrito morfologías cuadradas planas o
células de tipo ameboide que son
exclusivas de las arqueas.
Aunque no tienen núcleo y tienen una
organización celular de tipo procariota
como las bacterias, las propiedades
moleculares son más parecidas a las de
las células eucarióticas
Características generales de las arqueas
Pared Celular
En cuanto a la pared celular, la mayoría de las
células de Archaea tienen una pared para poder
soportar altas resiones, impedir la lisis celular y
dotar a la célula de forma y rigidez.
La estructura más común de la pared celular
dentro de las arqueas es la constituida por una
capa superficial paracristalina o capa S, formada
por un entrelazamiento de glicoproteínas y
proteínas. Las capas S son muy resistentes por
lo que pueden ser el único componente de la
pared celular. No obstante, en muchos casos se
encuentra acompañada de otros componentes,
pero la capa S siempre será la que está en
contacto directo con el medio externo.
Características generales de las arqueas
Membrana celular
La estructura principal de la membrana celular es
una doble capa de estos fosfolípidos, que recibe el
nombre de bicapa lipídica. Los fosfolípidos de las
membranas arqueanas son inusuales en cuatro
cosas.
Primeramente, las bacterias tienen membranas
compuestas principalmente de lípidos unidos con
glicerol mediante enlaces éster, mientras que en las
arqueas los lípidos se unen al glicerol mediante
enlaces éter. La diferencia entre estos dos tipos de
fosfolípidos es el tipo de enlace que los une al
glicerol. Los enlaces éter tienen una resistencia
química superior a la de los enlaces éster, lo que
podría contribuir a la capacidad de algunas
arqueas de sobrevivir a temperaturas extremas o en
ambientes muy ácidos o alcalinos. Las bacterias y
eucariotas también contienen algunos lípidos con
enlaces éter, pero a diferencia de las
Arqueobacterias, estos lípidos no forman una parte
importante de sus membranas.
Características generales de las arqueas
Membrana celular
En segundo lugar, los lípidos arqueanos son
únicos porque la estereoquímica del grupo
glicerol es la inversa de la que se observa en
otros organismos. El grupo glicerol puede existir
en dos formas que son la imagen especular la
una de la otra, y que se pueden denominar
formas "diestra" y "siniestra"; en lenguaje químico
se les denomina enantiómeros. Del mismo modo
que una mano derecha no entra fácilmente en un
guante para la mano izquierda, una molécula de
glicerol diestra generalmente no puede ser
utilizada o creada por enzimas adaptados por la
forma siniestra. Esto sugiere que las arqueas
utilizan enzimas completamente diferentes para
sintetizar sus fosfolípidos de los que utilizan las
bacterias y eucariotas; como estas enzimas se
desarrollaron muy al principio de la historia de la
vida, esto sugiere a su vez que las arqueas se
separaron muy pronto de los otros dos dominios.
Características generales de las arqueas
Membrana Celular
En tercer lugar, las colas lipídicas de los
fosfolípidos de las arqueanos tienen una
composición química diferente a las de otros
organismos. Los lípidos arqueanos se basan
en una cadena isoprenoide y son largas
cadenas con múltiples ramas laterales y, a
veces, incluso anillos de ciclopropano o
ciclohexano. Esto contrasta con los ácidos
grasos que hay en las membranas de otros
organismos, que tienen cadenas rectas sin
ramificaciones ni anillos. Aunque los
isoprenoides desempeñan un papel
importante en la bioquímica de muchos
organismos, solo las arqueas los utilizan
para producir fosfolípidos. Estas cadenas
ramificadas podrían ayudar a evitar que las
membranas arqueobacterianas tengan fugas
a altas temperaturas.
Características generales de las arqueas
Membrana Celular
Finalmente, en algunas arqueas la bicapa
lipídica es sustituida por una única
monocapa. De hecho, las arqueas
fusionan las colas de dos moléculas
fosfolipídicas independientes en una única
molécula con dos cabezas polares, esta
fusión podría hacer su membrana más
rígida y más apta para resistir ambientes
severos.
Por ejemplo, todos los lípidos de
Ferroplasma son de este tipo, lo que se
cree que ayuda a este organismo a
sobrevivir en los medios
extraordinariamente ácidos en que habita.
Características generales de las arqueas
Genética
Al igual que las bacterias, las arqueas son organismos procariotas, es decir, que en
su interior el material genético no está encerrado por una membrana (no tienen
núcleo) y no existen orgánulos membranosos citoplasmáticos.
Su ADN se encuentra en la forma de un cromosoma circular y algunos fragmentos
circulares de menor tamaño conocidos como plásmidos.
Comparten con las bacterias la presencia de enzimas topoisomerasas y girasas
similares, lo que representa una evidencia “indirecta” de la “cercanía” en cuanto a
la estructura cromosómica de ambos grupos de organismos.
Genetica
Los genes de las arqueas muestran una gran homología con muchos genes
eucariotas, especialmente con aquellos cuyo descubrimiento deriva de estudios
con antibióticos.
La maquinaria de replicación, transcripción y traducción de eucariotas y arqueas es
muy parecida, sobre todo respecto a la enzima ADN polimerasa.
Sus genes codificantes para proteínas no tienen intrones (pero otros sí), caso
contrario a los genes eucariotas. Además, las arqueas tienen proteínas similares a
las histonas asociadas con su ADN, presentes en eucariotas y ausentes en
bacterias.
Una de las subunidades de su enzima ARN polimerasa está dividida y sus ARN
mensajeros, así como en las bacterias, no poseen “capuchas” (del inglés cap) en
sus extremos 5´.
Características generales de las arqueas
Metabolismo
Tipos nutricionales del metabolismo de las arqueobacterias.
Tipo nutricional Fuente de energía Fuente del carbono Ejemplos
Compuestos
Fotótrofos Luz solar Haloarchaea
orgánicos
Compuestos Ferroglobus,
Compuestos
Litótrofos inorgánicos o Methanobacteria o
inorgánicos
fijación del carbono Pyrolobus
Compuestos Pyrococcus,
Compuestos
Organótrofos orgánicos o Sulfolobus o
orgánicos
fijación del carbono Methanosarcinales
Características generales de las arqueas
Metabolismo: Metano
Metanogenesis
Las arqueas metanogénicas del filo
Euryarchaeota producen hasta el 60%
de esta emisión de metano. La
metilcoenzima M reductasa ( Mcr ) se
expresa comúnmente en arqueas
metanogénicas; esta enzima cataliza el
último paso en la metanogénesis (CH
4síntesis) y el primer paso en la
metanotrofia ( oxidación de CH 4 ). La
metanogénesis y la oxidación del
metano son pasos importantes en el
ciclo C, y ambos son realizados
exclusivamente por metanógenos
anaeróbicos.
Metabolismo
Sustratos para la metanogenesis
1. Sustratos de tipo CO2. 2. Sustratos metilados.
Aquí se incluye el propio dióxido de Comprenden el metanol (CH3OH) y
carbono (CO2), el formiato (HCOO-) y el muchos otros, como la metilamina
monóxido de carbono (CO). En el caso (CH3NH3 + ), la dimetilamina ([CH3]2NH2
del CO2, se reduce a metano usando H2 + ), la trimetilamina ([CH3]3NH+ ), el
como donador de electrones. metilmercaptano (CH3SH) y el
dimetilsulfuro ([CH3]2S). El metanol puede
CO2 + 4H2 CH4 + 2 H2O reducirse empleando un donador de
electrones externo como por ejemplo el
H2.
CH3OH + H2 CH4 + 2 H2O
Metabolismo
Sustratos para la metanogenesis
3. Sustratos acetótrofos.
Aquí encontramos el acetato (CH3COO- ) y el piruvato (CH3COCOO- ). El proceso
se denomina reacción acetotrófica y consiste en la rotura del acetato hasta CO2 +
CH4. El acetato es una fuente muy importante de metano en la naturaleza, sin
embargo, son pocas las especies que realizan este proceso.
CH3COOH CH4 + CO2
Características generales de las arqueas
Metabolismo: Azufre
Algunas bacterias y arqueas están Las arqueas reducen estos sulfatos y
involucradas en el ciclo del azufre (S), sulfitos a sulfuros a través de enzimas
que es un elemento importante en los codificadas por el grupo de genes
organismos. El azufre en el suelo existe disimilatorios sulfito reductasas ( dsr ).
principalmente en forma de sulfato- Euryarchaeota , Crenarchaeota y
ésteres (-O-SO 3 H) y sulfonatos (C-SO Aigarchaeotaaislados de hábitats
3 H), que necesitan ser metabolizados marinos o humedales expresan la
por microbios del suelo antes de que el capacidad genética de reducir el sulfito
S se vuelva biodisponible para las a sulfuro mediante dsr. Los estudios
plantas. combinados sugieren un papel potencial
de las arqueas en el ciclo de S
rizosférico, aunque se necesita más
trabajo para verificar la participación
directa de las arqueas en los ciclos de
S.
Características generales de las arqueas
Metabolismo: Fotótrofos
Ciertas especies de haloarqueas pueden llevar a cabo la síntesis de ATP mediada
por la luz, proceso que no se considera fotosíntesis por la ausencia de pigmentos
clorofílicos. Los pigmentos que intervienen son carotenoides rojos y naranjas, que
son sensibles a la luz (bacteriorruberinas, nombrados anteriormente) y otros
pigmentos inducibles conservadores de la energía.
Características generales de las arqueas
Habitats
Las arqueas se han relacionado principalmente con ambientes “extremos”, es decir,
aquellos lugares naturales que imponen serias restricciones para el desarrollo
normal de los seres vivos, especialmente en términos de temperatura, pH, salinidad,
anaerobiosis (ausencia de oxígeno), etc.; razón por la cual su estudio resulta
sumamente interesante, pues poseen adaptaciones únicas.
Sin embargo, las técnicas más recientes de análisis molecular para la identificación
de especies de microorganismos no cultivados (aislados y mantenidos in vitro en un
laboratorio) han permitido detectar la presencia de arqueas en ambientes tan
cotidianos como el suelo, el rumen de algunos animales, aguas oceánicas y de
lagos, entre otros.
Habitats
Sin embargo, la mayor parte de las arqueas que han sido identificadas en la
naturaleza son clasificadas de acuerdo con el hábitat que ocupan, siendo familiares
en la literatura los términos “hipertermófilos”, “acidófilos” y “termoacidófilos
extremos”, “halófilos extremos” y “metanógenos”.
Los ambientes ocupados por las arqueas hipertermófilas son aquellos que se
caracterizan por temperaturas constantes muy elevadas (muy por encima de las
temperaturas “normales” a las cuales está sometida la mayoría de los seres vivos).
Lago Lonar en el distrito Buldhana El campo de géiseres del
de Maharashtra, India. Tatio, en Atacama
Habitats
Los ambientes donde habitan los acidófilos extremos, por otra parte, son aquellos
donde el pH es muy bajo y estos también pueden distinguirse por altas
temperaturas (termoacidófilos extremos), entretanto los ambientes de los halófilos
extremos son aquellos donde la concentración de sales es muy elevada.
Las arqueas metanógenas viven en ausencia de oxígeno o anaerobiosis, en
ambientes donde pueden emplear otras moléculas como aceptores de electrones
en su metabolismo y son capaces de producir metano como producto de
“desecho” metabólico.
Sistema hidrotermal de
Dallol, en Etiopía.
Características generales de las arqueas
Reproducción
Las arqueas se reproducen asexualmente por fisión binaria o múltiple, fragmentación o
gemación. No se produce meiosis, de manera que si una especie de arquea existe en más de
una forma, todas tienen el mismo número de cromosomas (tienen el mismo cariotipo).
La división celular está controlada como parte de un complejo ciclo celular, donde el
cromosoma se replica, las copias se separan y luego la célula se divide.Los detalles del ciclo
celular solo han sido investigados en el género Sulfolobus, siendo similares a los de bacterias
y eucariontes: los cromosomas se replican desde múltiples puntos de partida (origen de
replicación) usando ADN polimerasas que son similares a las enzimas equivalentes
eucarióticas. Sin embargo, las proteínas que dirigen la división celular, como la proteína FtsZ
que forma un anillo contráctil alrededor de la célula, parecen estar más relacionadas con sus
equivalentes bacterianos.
No se forman endosporas en ninguna especie de arquea, aunque algunas especies de
haloarqueas pueden alternar entre fenotipos y crecer como diferentes tipos de células,
incluidas estructuras de paredes gruesas que son resistentes al choque osmótico y que les
permiten sobrevivir a bajas concentraciones de sal. No se trata de estructuras reproductivas,
pero es posible que ayuden a estas especies a dispersarse en nuevos hábitats.
Comparacion
Característica Archaea Bacteria Eukarya
Monodérmica (
bacterias grampositiv
Envoltura celular Monodérmica as Monodérmica
) o didérmica (
bacterias gramnegativ
as
Seudopeptidoglicano )
, glucoproteínas, Peptidoglicano o Si existe, quitina,
Pared celular
polisacáridos o ausente celulosa, etc.
ausente
Lípidos con enlaces
Lípidos con enlaces Lípidos con enlaces
Membrana plasmática éter, a veces
éster éster
monocapa
Múltiples
Cromosoma circular, cromosomas
Cromosoma circular,
traducción y lineales, histonas,
Genoma traducción y
transcripción traducción y
transcripción únicas
similares a Eukarya transcripción
similares a Archaea
Sin orgánulos Sin orgánulos Con orgánulos
rodeados de rodeados de rodeados de
Estructuras celulares
membranas y sin membranas y sin membranas y con
núcleo núcleo núcleo
Ribosomas92 70 S 70 S 80 S
Muy variado: Muy variado:
Fotosintéticos
fotosintéticos, fotosintéticos,
(plantas) o
Metabolismo quimiosintéticos, quimiosintéticos,
quimiorganotrofos
organotrofos, organotrofos,
(animales y hongos)
litotrofos, etc. litotrofos, etc
Aplicaciones biotecnológicas de las arqueas
Las propiedades inusuales de las arqueas y la gran estabilidad de sus componentes
celulares, las convierten en un gran recurso para el desarrollo de nuevos procesos
biotecnológicos y aplicaciones industriales. Algunas de ellas son las siguientes:
1. Los lípidos de membrana de las arqueas tienen una mayor resistencia a la
oxidación, hidrolisis química y ataque de esterasas en comparación con los
lípidos de membrana de otros microorganismos de diferente dominio. Por ello, se
utilizan para elaborar unos liposomas especiales denominados arqueosomas, que
tienen útiles aplicaciones en biotecnología. Estos arqueosomas tienen mayor
eficiencia de encapsulación que los liposomas convencionales y poseen una
potencial actividad transportadora de diversas sustancias y principios activos,
mejorando incluso la eficacia de los mismos. Se ha ensayado el uso de los
arqueosomas como transportadores de antígenos y vacunas, obteniendo
resultados muy favorables, y en la industria cosmética como sistemas de
vectorización por vía tópica.
Aplicaciones biotecnológicas de las arqueas
2. Una aplicación interesante de las haloarqueas es su capacidad de producir proteínas
antimicrobianas, denominadas halocinas. Estas moléculas han demostrado ser
activas frente a células tanto procariotas como eucariotas, por lo que pueden llegar a
ser muy efectivas. Hay estudios que confirman que algunas halocinas son capaces
de disminuir el crecimiento de la línea celular de cáncer de colon SW620.
3. Sirven para la elaboración de ciertos alimentos fermentados o para la producción de
proteínas recombinantes, debido a los mínimos riesgos de contaminaciones en el
laboratorio.
4. Las haloarqueas producen bacteriorrodopsina, una proteína que interviene en la
síntesis de ATP (mediante fotosíntesis). Se trata de una molécula muy estable
termodinámicamente por lo que tiene aplicaciones tecnológicas interesantes, sobre
todo en el campo de la bioelectrónica. Se destaca su uso en la construcción de
celdas fotovoltaicas, en la elaboración de discos de almacenamiento de datos de
alta capacidad o en sistemas convertidores de energía luminosa en química
Aplicaciones biotecnológicas de las arqueas
6. Las enzimas producidas por organismos extremófilos se denominan
extremoenzimas. Son capaces de permanecer activas catalíticamente bajo
condiciones extremas de temperatura, pH, salinidad y presión. Hay muchos
metabolitos de este tipo que han sido aislados y tienen aplicaciones industriales
importantes. Sin embargo, existen problemas técnicos que dificultan el uso de
estos compuestos en las grandes empresas, sobre todo por su disponibilidad.
7. Las capas S de la envoltura celular de las arqueas han demostrado ser excelentes
estructuras con aplicación en nanotecnología molecular y biomineralización, ya
que tienen una alta capacidad de unión y una gran habilidad para recristalizar de
forma uniforme en superficies sólidas.
8. Las arqueas metanógenas tienen interés industrial porque pueden ser usadas
para producir energía, ya que el metano es un combustible poco contaminante, y
para obtener biogás a través de biodigestores.
Aplicaciones biotecnológicas de las arqueas
9. Las enzimas de arqueas hipertermófilas pueden ser utilizadas en:
a) Industria azucarera, textil y papelera: hay varias enzimas de arqueas que
intervienen en el metabolismo de los hidratos de carbono, con las que se pueden
obtener jarabes de glucosa, frutosa, elaboración de bebidas, etc
b) Industria farmacéutica: se puede determinar la glucosa en sangre y realizar otros
procesos analíticos con ciertas enzimas de arqueas, como por ejemplo con la
enzima glucosa DSH de Sulfolobus solfataricus.
c) Biología molecular: Para la realización de la reacción en cadena de la polimerasa
(PCR) son necesarias ADN polimerasas termoestables, ya que hay etapas del
proceso en las que la temperatura es muy elevada. Hay ciertas especies de
arqueas de las que se extraen este tipo de enzimas, por ejemplo, de la especie
Pyrococcus furiosus obtenemos la enzima polimerasa Pfu (Pfu-pol)
Aplicaciones biotecnológicas de las arqueas
10. Hay arqueas acidófilas y/o termófilas que son útiles en la industria minera. Esta
aplicación es de las más importantes y está en auge actualmente. La
biolixiviación es el proceso de solubilización de metales asociados a sulfuros,
utilizando la acción de ciertos microorganismos. Se han propuesto dos
mecanismos que describen la biolixiviación:
a) Mecanismo directo: es el mediado por la acción de microorganismos y las
reacciones químicas son catalizadas por enzimas. Requiere el contacto físico de
los organismos con el mineral.
Aplicaciones biotecnológicas de las arqueas
b) Mecanismo indirecto: en este caso no hay contacto físico entre los
microorganismos y el mineral, aunque estos son importantes porque pueden
formar reactivos químicos que intervienen en el proceso. En este caso las
reacciones químicas pueden no ser enzimáticas. Este procedimiento es el más
aceptado y su mecanismo químico consiste en el ataque oxidativo de iones
férrico y protones sobre el mineral. Hay dos vías que describen la disolución de
sulfuros metálicos: mecanismo del tiosulfato y mecanismo del polisulfuro. Estos
nombres provienen del compuesto principal de azufre intermediario que
interviene.
Aplicaciones biotecnológicas de las arqueas
Algunas de las especies de arqueas más representativas que participan en
biolixiviación son las pertenecientes al género Acidianus, como Acidianus
copahuensis, al género Ferroplasma, como Ferroplasma thermophilum, al género
Sulfolobus, como Sulfolubus metallicus o al género Metallosphaera, como
Metallosphaera sedula. En concreto Sulfolobus metallicus es una arquea acidófila y
quimiolitotrofa cuyas enzimas son capaces de solubilizar películas de calcopirita
(CuFeS2) que se forman sobre explotaciones mineras.
Interacciones con otros organismos
Mutualismo
Un ejemplo bien comprendido de mutualismo es la interacción entre los protozoos y
arqueas metanógenas del sistema digestivo de animales que digieren celulosa, como
los rumiantes y las termitas. En estos ambientes anaeróbicos, los protozoos
descomponen la celulosa del material vegetal para obtener energía. Este proceso
libera hidrógeno como producto residual, pero los niveles altos de hidrógeno reducen
la energía generada por esta reacción. Cuando los metanógenos convierten el
hidrógeno en metano, los protozoos se benefician, ya que podrán obtener más
energía de la descomposición de la celulosa.
Estas asociaciones entre metanógenos y protozoos van un paso más allá en diversas
especies de protozoos anaeróbicos, como Plagiopyla frontata, en cuyo caso, las
arqueas viven en el protozoo y consumen el hidrógeno producido en sus
hidrogenosomas. Se están descubriendo asociaciones similares con organismos más
grandes, con el descubrimiento de que la arquea marina Cenarchaeum symbiosum
que vive dentro de la esponja Axinella mexicana.
Interacciones con otros organismos
Comensalismo
Las arqueas también pueden ser comensales, beneficiándose de una asociación sin
ayudar o dañar al otro organismo. Por ejemplo, el metanógeno Methanobrevibacter
smithii es de largo la arquea más común de la flora humana, representando
aproximadamente un 10% de todos los procariotas del intestino humano. Como en
el caso de las termitas, es posible que estos metanógenos sean en realidad
mutualistas en los humanos, interactuando con otros microbios del intestino para
facilitar la digestión de los alimentos. También hay comunidades
arqueobacterianas asociadas con una variedad de otros organismos, como en la
superficie de corales, y en la parte del suelo que rodea las raíces de las plantas (la
rizosfera).
BIBLIOGRAFIA
Eme L, Doolittle WF. Archaea. Curr Biol. 2015 Oct 5;25(19):R851-5. doi:
10.1016/[Link].2015.05.025. PMID: 26439345.
Jihye Jung, Jun-Seob Kim, Julian Taffner, Gabriele Berg, Choong-Min Ryu, Archaea,
tiny helpers of land plants, Computational and Structural Biotechnology Journal,
Volume 18, 2020, Pages 2494-2500, ISSN 2001-0370, https
://[Link]/10.1016/[Link].2020.09.005. (
[Link]
Parks DH, Chuvochina M, Chaumeil PA, Rinke C, Mussig AJ, Hugenholtz P. A
complete domain-to-species taxonomy for Bacteria and Archaea. Nat Biotechnol.
2020 Sep;38(9):1079-1086. doi: 10.1038/s41587-020-0501-8. Epub 2020 Apr 27.
Erratum in: Nat Biotechnol. 2020 Sep;38(9):1098. PMID: 32341564.
Bernander R. Archaea and the cell cycle. Mol Microbiol. 1998 Aug;29(4):955-61.
doi: 10.1046/j.1365-2958.1998.00956.x. PMID: 9767564.
Kelman LM, Kelman Z. Multiple origins of replication in archaea. Trends Microbiol.
2004 Sep;12(9):399-401. doi: 10.1016/[Link].2004.07.001. PMID: 15337158
Bonnie Chaban , Sandy YM Ng y Ken F Jarrell . Hábitats de arqueas: desde lo
extremo hasta lo ordinario. Revista Canadiense de Microbiología . 52 (2): 73-116.
[Link]
Schink B. Energetics of syntrophic cooperation in methanogenic degradation.
Microbiol Mol Biol Rev. 1997 Jun;61(2):262-80. PMID: 9184013; PMCID: PMC232610.
Eckburg PB, Bik EM, Bernstein CN, et al (Junio de 2005). «Diversity of the human
intestinal microbial flora». Science (journal) 308 (5728): 1635-8. PMC 1395357.
PMID 15831718. doi:10.1126/science.1110591.
Chelius, M., Triplett, E. La diversidad de arqueas y bacterias en asociación con las
raíces de Zea mays L .. Microb Ecol 41, 252-263 (2001).
[Link]
Eloe-Fadrosh EA. Genome gazing in ammonia-oxidizing archaea. Nat Rev Microbiol.
2019 Sep;17(9):531. doi: 10.1038/s41579-019-0248-8. PMID: 31320751.
Garzón N., FILOGENIA DE LOS SERES VIVOS: DOMINIO ARCHAEA (Septiembre de
2017). Revisión bibliográfica, trabajo fin de grado. Universidad de Sevilla. http:
[Link]
%[Link]?sequence=1&isAllowed=y
