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Estructura y función de ADN polimerasa alfa

El documento describe la polimerasa alfa humana, que consta de 4 subunidades incluyendo la subunidad catalítica POLA1. Se compara con otras polimerasas humanas encontrando similitudes en los posibles centros activos. La estructura forma una L donde el ADN a replicar se introduce.

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Estructura y función de ADN polimerasa alfa

El documento describe la polimerasa alfa humana, que consta de 4 subunidades incluyendo la subunidad catalítica POLA1. Se compara con otras polimerasas humanas encontrando similitudes en los posibles centros activos. La estructura forma una L donde el ADN a replicar se introduce.

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DNA

POLIMERASA
ALFA
HUMANA
SUBUNIDAD CATALÍTICA.

Lucía Cavero Carmona


NIUB: 18107106
COMPOSICIÓN DE
SUBUNIDADES
El complejo de la polimerasa alfa consta de 4 subunidades:
 POLA1/p180, con función catalítica, y que consta de 1462
aminoácidos.
 POLA2/p70, que es la subunidad reguladora.
 Dos subunidades primasas:
 PRIM1/p49
 PRIM2/p58
ESTUDIO COMPARATIVO CON OTRAS
POLIMERASAS HUMANAS

Las 2 polimerasas humanas más similares son:


 DNA polimerasa zeta subunidad catalítica:
 Identities: 153/683 (22%)
 Query: 43%
 DNA polimerasa delta subunidad catalítica:
 Identities: 213/792 (27%)
 Query: 51%
POSIBLES CENTROS ACTIVOS

En ambas tres polimerasas humanas encontramos grupos de aminoácidos


repetidos en el mismo lugar, conservados, por lo que pueden ser los
posibles centros activos.
 Del 863 al 869
 Del 1000 al 1006
COMPARACIÓN TAXONÓMICA
EVOLUTIVA
Para la comparación he usado diferentes especies con distinto nivel de
Identities y Query, pero en todos los organismos se han mantenido los aa´s
del centro activo sin variación alguna.
Identities Query

Canis lupus familiaris 91% 99%

Orcina orca 91% 100%

Fragaria vesca 39% 83%

Mycobacterium tuberculosis 24% 40%


ESTRUCTURA

Estructura en forma de L, el
ADN a replicar se introduce
entre las dos partes
horizontales de la L.
Normalmente encontramos
dos subunidades catalíticas
juntas replicando a la vez.
DOMINIOS DE LA
SUBUNIDAD
Encontramos 4
dominios más o menos
diferenciados dentro de
la subunidad catalítica.
CADENA MOLDE Y CADENA
CEBADORA

Podemos suponer cuál


es la cadena molde y
cuál el cebador porque la
cadena molde siempre
será más larga que el
cebador, ya que tiene la
información que tiene
que duplicarse en el
cebador. En este caso, la
cadena verde será el
molde y la amarilla el
cebador.
CADENA MOLDE Y CADENA CEBADORA.
EXTREMOS 5’ Y 3’.

Otra manera de identificar al


cebador es comprobando qué
cadena de nucleótidos está
más cerca del centro activo,
marcado con halos amarillos
en la imagen, del 1000-1006
(YGDTDS), en este caso la
azul, además de verse que es
la más corta en la imagen.

Extremo 3’, pues se va


añadiendo de 5’ a 3’ y por
tanto, el que esté al lado
del centro activo será el
sitio donde se haya
añadido el último y donde
se pondrá el siguiente
Extremo 5’ nucleótido.

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