Nucleótidos
Los nucleótidos, son las unidades monomeras del
DNA y del RNA
DNA desoxirribonucleótidos
RNA ribonucleótidos
Tres componentes característicos
POLINUCLEÓTIDOS
Los polinucleótidos son cadenas lineales de
nucleótidos en los que los grupos fosfato están
esterificados a los hidroxilos 5' y 3' de dos
nucleótidos consecutivos
Como consecuencia, cada polinucleótido contiene
únicamente un OH libre en el grupo fosfato en
posición 5' (extremo 5' fosfato) y un OH libre en
posición 3' (extremo 3').
Por convención, la secuencia de los polinucleótidos se
representa en el sentido 5' 3'. Los dos
polinucleótidos presentes en los seres vivos son el
ácido ribonucleico (RNA) y el ácido
desoxirribonucleico (DNA).
DIFERENCIAS ENTRE EL DNA Y EL RNA
Peso molecular pentosa bases nitrogenadas estructura
DNA alto
2-desoxirribosa
timina
RNA bajo
D-ribosa
uracilo
Bases nitrogenadas compartidas: adenina, guanina
y citosina.
LAS PENTOSAS
La -D-ribofuranosa es uno de los constituyentes del RNA, mientras
que la -D-2-desoxirribofuranosa forma parte del DNA. La única
diferencia consiste en que en la posición 2 de la pentosa, un grupo
OH ha sido sustituído por un H. Esta pequeña alteración supone que
la molécula del DNA sea más resistente a la hidrólisis que el RNA.
desoxirribosa ribosa
Las bases pirimidínicas derivan del anillo de pirimidina. Las
bases pirimidínicas que aparecen en el RNA son uracilo y
citosina, mientras que en el DNA encontramos timina y
citosina
Timina (característico del DNA)
Pirimidina
Citosina
Uracilo (característico del RNA)
LAS BASES NITROGENADAS
Las bases púricas tienen la estructura fundamental del heterociclo purina.
Las bases púricas que se encuentran en los ácidos nucleicos (tanto DNA
como RNA) son la adenina y la guanina. Adenina
(Pirimidina con anillo
Purina imidazol
condensado)
Guanina
La pentosa está unida a la base por un enlace -N-glucosilo
establecido entre el átomo de carbono 1 de la pentosa y el átomo
de nitrógeno 9 de las bases purínicas o el átomo de nitrógeno 1 de
las bases pirimidínicas. El grupo fosfato de los nucleótidos se halla
unido mediante enlace éster al átomo de carbono 5 de la pentosa.
También existen bases raras o menores:
5-hidroximetilcitosina
Pirimidinas
5-metilcitosina
6-metiladenina
Purinas
2-metilguanina
Cuando el grupo fosfato de un nucleótido se separa por
hidrólisis, la estructura residual recibe el nombre de
nucleósido.
Por tanto, los nucleótidos son los 5’-fosfatos de los
nucleósidos correspondientes.
Sólo se encuentran en cantidades mínimas en la
mayoría de las células, como productos de la
hidrólisis química enzimática de los nucleótidos
Por otro lado, las células también contienen los 5’-difosfatos y los 5’-
trifosfatos de los nucleósidos corrientes; de aquí que se incluya la letra M
de mono, D de di y T de tri-fosfato en las abreviaturas de los nucleótidos.
Abreviaturas de los desoxirribonucleósido 5'-fosfatos
Base Mono Di Tri
Adenina
Guanina
Citosina
Timina
Por otro lado, las células también contienen los 5’-difosfatos y los 5’-
trifosfatos de los nucleósidos corrientes; de aquí que se incluya la letra M
de mono, D de di y T de tri-fosfato en las abreviaturas de los nucleótidos.
Abreviaturas de los desoxirribonucleósido 5'-fosfatos
Base Mono Di Tri
Adenina dAMP dADP dATP
Guanina dGMP dGDP dGTP
Citosina dCMP dCDP dCTP
Timina dTMP dTDP dTTP
Entre los nucleósidos 5’-difosfato y 5’-trifosfato podemos mencionar los
siguientes por su importancia metabólica:
De hecho se trata de
ribonucleósidos 5’-fosfatos
Restos
g a
fosfòricos
5’-monofosfato de adenosina
5’-difosfato de adenosina
5’-trifosfato de adenosina
También conocidos como NDPs y NTPs
Los grupos fosfóricos condensados de los NDPs y NTPs forman complejos con
cationes divalentes tale como el Mg2+ y el Ca+2
Debido a la relativamente elevada concentración de Mg del citoplasma, los
nucleósidos-5’-difosfatos y 5’-trifosfatos se dan fundamentalmente en forma
de complejos con el magnesio en la cèlula intacta
El grupo fosfato terminal puede separarse
selectivamente por la acción de enzimas específicos
sin que se escindan los demás enlaces.
RNA
Existen diferentes tipos de RNA de acuerdo a su peso molecular
RNA MENSAJERO (RNAm)
Su peso molecular es alto y contiene únicamente
los nucléotidos mayoritarios: Adenina, Guanina,
Citosina y Uracilo.
RNA de transferencia (RNAt)
Las moléculas de RNA
transferente (RNAt) tienen
entre 75 y 90 nucleótidos, y
su peso molecular es de unos
25000 dalton. Se conocen
unos 60 RNAt distintos, y se
encuentran en todas las
células.
Su estructura secundaria presenta un plegamiento complejo
en donde alternan zonas apareadas y zonas no apareadas, y
en donde se pueden distinguir zonas críticas.
RNA RIBOSÓMICO (RNAr)
Se conocen 3 ó 4 tipos distintos de RNAr.
Su estructura secundaria y terciaria
presenta un plegamiento complejo
RNA HETEROGÉNEO NUCLEAR (RNAhn)
El RNA pequeño nuclear (RNAsn)
El RNA vírico
DNA
Los ácidos nucleicos fueron descubiertos por
Freidrich Miescher en 1869.
En los años 20, el bioquímico Phoebus Levene
determinó que el DNA estaba formado por 4
tipos distintos de nucleótidos.
En 1949, el bioquímico Erwin Chargaff
analizó el contenido molar de las bases de
DNA procedente de diversos organismos y
descubrió que en todos los casos [A]=[T] y
que [G]=[C], o lo que es lo mismo, [A+G]=[T+C]
([purinas]=[pirimidinas]). Esta es la llamada
ley de Chargaff.
A principios de los años 50 Maurice Wilkins y Rosalind
Franklin realizaron los primeros estudios físicos con
el DNA mediante la técnica de difracción de rayos
X y observaron que
1. La molécula de DNA es una cadena extendida con
una estructura altamente ordenada
2. La molécula de DNA es helicoidal y tiene 20 Å de
diámetro
3. La hélice del DNA está compuesta por dos hebras
helicoidales y
4. Las bases de los nucleótidos están apiladas con
los planos separados por una distancia de 3,4 Å.
Patrón de
difracción
de rayos X
del DNA
En 1953, James Watson y Francis Crick combinaron los
datos químicos y físicos del DNA, y propusieron un modelo
estructural del DNA.
Las dos hebras están enrolladas
una alrededor de la otra formando
una doble hebra helicoidal
Las dos cadenas de
polinucleótidos se
mantienen equidistantes,
al tiempo que se enrollan
en torno a un eje
imaginario.
El esqueleto azúcar-fosfato
(formado por una secuencia
alternante de desoxirribosa y
fosfato, unidos por enlaces
fosfodiéster 5'-3') sigue una
trayectoria helicoidal en la parte
exterior de la molécula.
Las bases se dirigen desde cada
cadena al eje central imaginario.
Las bases de una hebra están
enfrentadas con las de la otra,
formando los llamados pares de
bases (PB).
Las dos bases que forman
un Par de Bases están en el
mismo plano y dicho plano
es perpendicular al eje de
la hélice.
Las bases interaccionan entre sí
mediante puentes de hidrógeno.
Los pares de bases están
formados siempre por una
purina y una pirimidina, de
forma que ambas cadenas
están siempre equidistantes,
a unos 11 Å una de la otra.
Los Pares de Bases adoptan
una disposición helicoidal en
el núcleo central de la
molécula, ya que presentan
una rotación de 36º con
respecto al par adyacente,
de forma que hay 10 Pares
de Bases por cada vuelta de
la hélice.
La A se empareja siempre
con la T mediante dos
puentes de hidrógeno,
mientras que la C se
empareja siempre con la G
por medio de 3 puentes de
hidrógeno
Las dos hebras son
antiparalelas.
Por convención, la
secuencia de bases de
una hebra sencilla se
escribe con el extremo
5'-P a la izquierda.
Puentes de hidrógeno:
•Grupos amino
•Grupos –NH-
•Los átomos de oxígeno
fuertemente negativos
La doble hélice es dextrógira.
La hélice presenta dos tipos de surcos
helicoidales externos, unos son anchos y
profundos (surcos mayores) y otros son
estrechos y poco profundos (surcos
menores).
Los dos tipos de surcos son lo
suficientemente amplios como para
permitir que las moléculas proteicas
entren en contacto con las bases
