Reparacin del DNA
La reparacin del DNA es la capacidad de una clula para detectar y reparar daos en el DNA. Es esencial para el mantenimiento de la integridad estructural del genoma en general y de los genes en particular
Reparacin del DNA
TIPO DE REPARACIN
Eliminacin de mutgenos (destoxificacin) Reversin Directa
EJEMPLO
TIPO DE LESIN REPARADA
Superxido dismutasa Se evita la formacin de lesin Oxidativa Fotoliasa Alquiltransferasas Fotodmeros de Pirimidina Derivados alquilo de las bases
Escisin de nucletidos (general) Escisin de bases (especfica)
Las que causa distorsin de la Sistema de la Doble hebra de DNA escinucleasa XPA, XPC
N-glicolasas del DNA Bases desaminadas, modificadas, oxidadas, sitios absicos etc.. y endonucleasa AP
Nucletidos mal aperadas por Errores en la replicacin de bases Modificadas Reparacin de roturas bicatenarias
Reparacin de apareamientos MSH, MLH y PMS incorrectos pos-replicacin Recombinacin homloga RecA , Rad51 Unin de extremos no homlogos Ku
Eliminacin de Agentes mutgenos
Superoxido Dismutasa y su centro Activo
2O
. + 2H 2
O2 + H2O2
Catalasa
1/2O2
Superoxido Dismutasa
+ H 2O
Reversin Directa de la Lesin
Reconocimiento del fotodimero Transferencia electrnica iniciada por la absorcin de luz visible Escinde el anillo de ciclobutano Regeneracin de las bases originales Tambin conocida como enzima FOTOREACTIVADORA Se encuentra en bacterias, hongos, algunas levaduras pero no en mamferos placentarios.
Rayos UV
FOTOLIASA
FADH2 + Cromoforo
2 Reversin Directa de la Lesin
Alquiltransferasas Guanina
O
Cys-S CH3 Inactiva
N
N N
H2N
N Azcar
ALQUILTRANSFERASA Cys-S Activa Centro Activo Cys-S CH3
N N N
O N H2N
grupo alquilo eliminado por medio de la transferencia a un residuo de cistena. La catlisis inactiva la enzima ya que no puede regenerarse. El sistema es saturable y la clula debe de sintetizar nuevas alquiltransferasas
Alquilantes
Azcar
O6-metil-guanina
Reparacin por Escisin
Cromosoma Gen
DNA mutacin Protenas de Escisin y sntesis
Proceso complejo que consiste en la eliminacin de la base nitrogenada, nucletido o segmento de ADN defectuoso y su reemplazo por otro nuevo, de secuencia correcta
Cromosoma
Gen
Complejo proteico de enzimas reparadoras que lleva a la sntesis de DNA fuera del programa (ciclo celular)
DNA mutacin
Protenas de escisin y de sntesis de DNA
Reparacin por Escisin Mecanismo general de reparacin por escisin de nucletidos. NER (nucleotide excision repair)
Mecanismos especficos de reparacin por escisin de bases. BER (base excision repair)
Reparacin por Escisin FASES 1. Escisin: distinta en NER y BER
2. Sntesis: comn en ambas
3. Sellado: comn en ambas
3 Reparacin por Escisin -NER
Mecanismo de reparacin por escisin de nucletidos (NER) Reparacin GENERAL
Es el sistema ms importante en humanos y esta ligado a la transcripcin preferentemente los genes se reparan. Repara las lesiones que distorsionan la doble helice: dimeros de Timina, agentes intercalantes, y dao al DNA causado por el tabaquismo
Reparacin por Escisin -NER
XPA
Complejo de Reconocimiento
XPA
Reconocimiento
ESCINUCLEASA
Complejo de protenas que identifican la lesin con gasto de ATP
Escisin
Complejo de endonucleasas hidroliza enlances fosfodiester a ambos lados de la mutacin (-22 +6 nt) .El corte de una sola hebra es de las escinucleasas Helicasa separa el oligonucleotido (Proca riotes 12-13nt y eucariotes 28 nt)
TFHII Helicasa
3`
DNA pol y DNA ligasa
DNA pol d y e rellenan el hueco, participan PCNA y RFC La mella del extremo 3` se cierra con DNA ligasa
Sntesis
Reparacin por Escisin -NER
SUBUNIDAD
XPA
RPA
FUNCIN
Reconoce la lesin y se une a l Es la protena de unin de hebra sencilla que interviene en la replicacin. Es el mismo Factor de Transcripcin para los genes de clase II, tiene actividad de Helicasa. XPB, XPD.
TFHII
XPC+HHR23B XPG XPF+ERCC1
Ayuda e estabilizar el complejo de la escinucleasa
Endonucleasa que corta el extremo 3`de la regin a escindir. Endonucleasa que corta el extremo 5` de la regin a escindir
Reparacin por Escisin -BER
O
CH3
N
N
H2N N
Mecanismo de reparacin por escisin de bases (BER) Reparacin ESPECFICA
Repara daos ocasionados al DNA que involucran una sola base Desaminacion, Oxidacin, Sitios AP, Alquilacin etc.
N Azcar
O6-metil-guanina
sitio AP
3`
Reparacin por Escisin -BER
Escisin
Base Mutada
Se elimina solo la base alterada y no el nucletido completo por una N- glicosilasa de DNA.
N glicosilasa de DNA es especfica para cada tipo de lesin.
Uracilo DNA glicosilasa :desaminacin de C 3-metiladenina DAN glicosilsa: metilacin A, G, C o T,desaminacin de A, hipoxantina Formamidopirimidina DNA glicosilasa : 8 hidroxiguanidina, formamidopirimidinas Hidrato de pirimidina DNA glicosilasa : Timidina Glicol, pirimidinas oxidadas
Endonucleasa AP
DNA glicosilasa
5`
3`
sitio AP
Se genera un sitio absico (AP) y la endonucleasa AP hidroliza el enlace fosfodiester dejando un extremo 3 OH libre
Reparacin por Escisin -BER
DNA pol b
Sntesis
DNA pol d
Reparacin de un solo nucletido por la DNA pol b Desoxirribofosfodiesterasa (elimina el sitio AP) y Polimerasa
Reparacin de un tramo largo por la DNA pol d y e Requiere de PCNA y RFC y la endonucleasa FEN1 DNA ligasa une los extremos y cierre mellas
Ligasa
Reparacin de Aparamientos incorrectos
Reparacin post replicacin
Errores por apareamientos incorrectos cometidos durante la replicacin y que escapan a las exonucleasas de las DNA polimerasas Corrige inserciones y deleciones de 1 a 4 nucletidos en una de las hebras Como sabe el sistema de reparacin cual corregir Si se repara la cadena correcta Si se repara la cadena incorrecta BIEN Mutacin
La maquinaria de reparacin reconoce la recin cadena de DNA sintetizada porque la cadena molde ya tiene sitios de metilacin
INSERCIONES DELECIONES
Apareamientos incorrectos
Reparacin de Apareamientos incorrectos
Sistema de Reparacin de los Apareamientos Incorrectos
Identifica las mutaciones y Repara cuando son mutaciones de la cadena recin sintetizada MSH-MutS Detecta los apareamientos incorrectos por la distorsin que causan en el DNA MLH, PMS-MutL Activa a MutH y recluta el complejo entero MutH Enzima que produce una incisin o corte en una cadena cerca del sitio de mal apareamiento. En eucariotes no es necesaria este paso por que revisa el DNA de nueva sntesis, los fragmentos de Okazaki y cadena lider sin unir
UvrD Helicasa desenrolla y habr el DNA en procariotes
Enfermedades humanas asociadas a la reparacin
Xerodermia pigmentosa
Sndrome de Cokayne
Cncer colorectal hereditario sin poliposis Tricodistrofa
Ataxia-telangiectasia
Xerodermia pigmentosa
Cncer de piel causada por la deficiencia en algunos de los genes responsables de la reparacin por escisin de nucletidos, lo que conduce a una acumulacin de dmeros de timina
XPA, XPB, XPC, XPD, XPF, ERCC1 y XPG
Sndrome de Cokayne
Enanismo, retraso mental, y sntomas Neurolgicos progresivos causados por la desmielinizacin ,y hay una sensibilidad moderada a los rayos UV, se origina por mutaciones a los genes CSA y CSB relacionados con la reparacin. Algunas mutaciones de XPB, XPD y XPD dan lugar a sndromes solapantes XP/CS
Cncer colorectal hereditario sin poliposis Los genes defectuosos son del sistema de reparacin por apareamientos incorrectos hMSH2 o hMLH1