UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO

FACULTAD DE INGENIERÍA

Generación de modelos 3D
de muestras de roca con
Structure from Motion

MATERIAL DIDÁCTICO
Que para obtener el título de
Ingeniero Geólogo

PRESENTA
Mario Michel Montoya Ramírez

ASESOR DE MATERIAL DIDÁCTICO

Lic. Sergio Enrique Macías Medrano

Ciudad Universitaria, Cd. Mx., 2021

 MATERIAL DIDÁCTICO PARTE DEL PROYECTO
DGAPA/UNAM/PAPIME: “Geología desde los ojos de un Dron: una
poderosa herramienta educativa para los actuales ingenieros de la Tierra”

Este documento que forma parte de las Guías de Aprendizaje Autónoma, Videotutoriales y
Modelos 3D de muestras de roca del proyecto DGAPA/UNAM/PAPIME: PE101020
“Geología desde los ojos de un Dron: una poderosa herramienta educativa para los actuales
ingenieros de la Tierra” a cargo del Dr. José Antonio Hernández Espriú.

~1~
 AGRADECIMIENTOS

Investigación realizada gracias al Programa de Apoyo a Proyectos para Innovar y Mejorar la

Educación (PAPIME) de la UNAM PE101020, “Geología desde los ojos de un Dron: una
poderosa herramienta educativa para los actuales ingenieros de la Tierra” a cargo del Dr. José
Antonio Hernández Espriú. Particularmente agradezco a la DGAPA-UNAM la beca recibida
que me permitió culminar la realización de este material didáctico.

~2~
 AGRADECIMIENTOS

Agradezco principalmente al Lic. Sergio Macías Medrano por compartir su conocimiento, su

confianza y por la oportunidad de ser parte del proyecto.

Al Dr. José Antonio Hernández Espriú encargado del proyecto por aceptar mi participación
en el.

Al grupo de trabajo del proyecto, al Dr. José Antonio Hernández Espriú, Ing. Javier Mancera
Alejándrez, Lic. Sergio Macías Medrano, Eduardo, Dr. Darío Emmanuel Solano Rojas y al
Dr. Enrique Alejandro González Torres.

~3~
 AGRADECIMIENTOS

Agradezco a la Universidad Nacional Autónoma de México y a la Facultad de Ingeniería, por

brindarme la mejor educación y la oportunidad de desarrollarme como persona.

Agradezco al Lic. Sergio Macías Medrano por estar siempre al pendiente de que aprendiera,
contagiarme su gusto por la fotogrametría y por todo su apoyo desde el servicio social.

Agradezco a mi familia y a mis padres por creer en mí y bríndame su apoyo incondicional a

lo largo de mi carrera. Gracias por haberme dado las fuerzas, así como los medios suficientes
para poder desarrollarme intelectual y moralmente.

A mis compañeros y amigos, Brenda, Nancy, Bianca, Isa, Alana, Gigi, Adri, etc por tantas
experiencias y prácticas juntos.

~4~
 ÍNDICE

Lista de figuras y tablas ................................................................................................................6

1. Introducción............................................................................................................................7
2. Marco teórico .........................................................................................................................8
2.1 Fotogrametría ..................................................................................................................8
2.1.1 Fundamentos básicos de la fotogrametría tradicional ...........................................9
2.1.2 Fotogrametría digital: Structure from Motion ..................................................... 11
2.2 Agisoft Metashape Professional (Aspectos generales y ventajas)......................... 14
3. Aplicación en las geociencias ............................................................................................ 16
4. Ejemplo de aplicación ......................................................................................................... 17
4.1 Resultados y posible aplicación.................................................................................. 22
5. Conclusiones y recomendaciones ...................................................................................... 25
6. Referencias citadas ............................................................................................................. 27

~5~
 LISTA DE FIGURAS Y TABLAS

Figura 1. Clasificación de la fotogrametría digital. ............................................................................... 9

Figura 2. Visión estereoscópica natural. Tomado de (Rosas et. al., 2007). ................................... 10
Figura 3. Visión estereoscópica artificial. Tomado de (Rosas et. al., 2007). ................................. 10
Figura 4. Representación del paralaje. Tomado de (Quirós Rosado, 2014). ................................. 11
Figura 5. Geometría epipolar. ................................................................................................................. 12
Figura 6. Reconstrucción de una nube de puntos a partir de la superposición de varias
fotografías. .................................................................................................................................................. 13
Figura 7. A. "Cubo" de Peña de Bernal. B. Núcleo. ............................................................................ 17
Figura 8. Pasos durante la adquisición de fotografías. ...................................................................... 18
Figura 9. Resultado del primer bloque de pasos para el procesamiento de imágenes en Agisoft
Metashape Proffessional. ......................................................................................................................... 19
Figura 10. Pasos para la generación de dos perspectivas.................................................................. 20
Figura 11. Alineación y combinación de dos modelos 3D. ............................................................... 21
Figura 12. Pasos para la generación de un solo modelo. ................................................................... 21
Figura 13. Colocación de puntos de control para escalar modelo 3D. ........................................... 22
Figura 14. Pasos para escalar y exportar productos. ......................................................................... 22
Figura 15. A. Modelo 3D de muestra de Peña de Bernal. B. Modelo 3D de un núcleo. ............. 23
Figura 16. Medición en nube de puntos densa de muestra de roca de Peña de Bernal............... 24

Tabla 1. Comparación de diferentes softwares fotogramétrico con precios del 2020. ................ 15

~6~
 1. INTRODUCCIÓN

En Ingeniería Geológica, la observación, descripción y clasificación de muestras de roca es de

suma importancia para poder determinar los procesos que les dieron origen, e interpretar los
ambientes geológicos y su historia geológica. Sin embargo, debido a la reciente pandemia del
COVID-19 se le imposibilita al docente proporcionar dichas muestras de roca a sus alumnos de
manera física; por lo que se presenta el siguiente documento que describe los pasos a seguir para
la realización de modelos 3D de muestras de roca con dispositivos móviles, incluso fotográficos,
al alcance de los alumnos.
En la actualidad existen varios investigadores que han desarrollado varios materiales digitales
para la creación y visualización de modelos, uno de ellos es Adrián Riquelme que cuenta con una
colección de modelos 3D de muestras de roca para impartir asignaturas como Petrología
(Riquelme et. al., 2016), además ha desarrollado las herramientas Structure from Motion para la
caracterización de macizos rocosos (Riquelme et. al., 2016). Por otro lado, Ryan Hollister
presenta visitas geológicas virtuales con diversas actividades y recursos, modelos 3D de
muestras de roca y minerales, para que el alumno pueda complementar su trabajo de campo con
material virtual. Una investigadora fundamental es Samantha Thi Porter debido a que en su
artículo Porter et. al. (2016) propuso una metodología para realización de modelos 3D de
artefactos con interés arqueológico, este artículo se tomó como base para la creación de los
materiales didácticos generados en esta investigación. Sin embargo, aunque estos autores
cuentan con modelos con excelente calidad y escritos con parte de su metodología no existe
algún documento(s) que explique(n) de manera detallada los pasos a seguir para generar modelos
3D de muestras de roca.
Esta problemática se resuelve con el material generado como parte del proyecto
DGAPA/UNAM/PAPIME: PE101020 “Geología desde los ojos de un Dron: una poderosa
herramienta educativa para los actuales ingenieros de la Tierra”, que son los siguientes:

1. Guía de Aprendizaje Autónoma: “Generación de modelos 3D de muestras de roca con SfM”

(https://drones.unam.mx/guias-aprendizaje ). Esta describe los pasos a seguir para
generar su propio modelo desde la adquisición de fotografías hasta el procesamiento de
ellas.
2. Plantillas fotogramétricas (3) a diferentes escalas.
3. Serie de 4 videotutoriales (https://www.youtube.com/playlist?list=PL4b-
3GKJaF7wmW7tKAEb0Bo10Iducycj_ ). 1 videotutorial por cada etapa de la metodología
planteada en la Guía de Aprendizaje Autónoma.
4. Modelos 3D de muestras de rocas en Sketchfab
(https://sketchfab.com/IngenieriaGeologicaAsistida ).
~7~
 5. Este documento. Como parte de la opción X. de Titulación por actividad de apoyo a la
docencia se presenta este documento el cual presenta los fundamentos para la realización
del material didáctico generado en el proyecto DGAPA/UNAM/PAPIME: PE101020
“Geología desde los ojos de un Dron: una poderosa herramienta educativa para los actuales
ingenieros de la Tierra”, así como los resultados, conclusiones y recomendaciones.
Por último, estos materiales tienen como finalidad proporcionar a los docentes y alumnos una
herramienta adicional que complementa al trabajo de campo y laboratorio al considerar la
situación actual que se está viviendo en el mundo.

2. MARCO TEÓRICO
2.1 FOTOGRAMETRÍA
La fotogrametría, según la Sociedad Americana de Fotogrametría y Teledetección (ASPRS,
2014), es el arte, ciencia y tecnología para la obtención de medidas fiables de objetos físicos y su
entorno, a través de grabación, medida e interpretación de imágenes y patrones de energía
electromagnética radiante y otros fenómenos. La fotogrametría es, en esencia la ciencia que
utiliza fotografías para hacer medidas, generar planos y mapas de gran exactitud. Aunado a esto,
permite conocer las características geométricas (formas y dimensiones) y su posición en el
espacio.
La evolución de la fotogrametría se da principalmente en cuatro etapas:

1. Inicios de la fotogrametría o fotogrametría plana (1839-1870).

Empieza en 1839 con la invención de la fotografía en Francia por Joseph Nicéphore
Niepce y Daguerre. Más adelante, el coronel Aimé Laussedat, considerado el padre de
la fotogrametría en 1851, comienza la fotogrametría terrestre al obtener planos
exactos de edificios y pequeñas extensiones a partir de una fotografía. Albrecht
Meydenbauer se conoce como el autor del término “fotogrametría” utilizándolo por
primera vez en un artículo de una revista de arquitectura publicada en 1867. (Cheli,
2012).
2. Fotogrametría analógica (1900-1970).
Invención del aeroplano y de la estereoscopia dando origen a la estereofotogrametría.
Se considera al padre de la estereofotogrametría analítica al Dr. Carl Pulfrich (1901)
al realizar medidas estereoscópicas con un estereocomparador a partir del cual todos
los instrumentos se basaron. La medición dentro de la fotogrametría analógica se
realiza con fotografías analógicas de restitución óptica o mecánica, donde el operador
realiza la alineación de las imágenes para crear un modelo estereoscópico debidamente
nivelado y escalado. (Cheli, 2012).
3. Fotogrametría analítica (1970-1990).
~8~
 Inicia con la invención de las computadoras. Se crea el restituidor analítico por Uki
Helava, agilizando tiempos y mejorando los niveles de detalle a diferentes escalas
mediante técnicas computacionales. Se posibilita el vuelco de la información a
programas de tipo CAD. (Lerma García, 2002).
4. Fotogrametría digital (1990-Actualidad).
Iniciado con el lanzamiento del primer satélite artificial y el uso del satélite Landsat.
Los restituidores analíticos son reemplazados por computadoras personales
repotencializadas, las que resuelven la relación entre las coordenadas de puntos
medidas sobre la imagen digital y sus correspondientes en el terreno (mediante la
ecuación de colinealidad), proyectando el uso de la fotogrametría en el campo satelital
(Linder, 2006). A través de diversos artículos (Fawcett et al.,2019; Jaud et al., 2019; y
Pearse et al., 2018) se ha observado que la fotogrametría es una disciplina flexible al
converger en ella diversas herramientas para la adquisición de imágenes como son
satélites, celulares, cámaras convencionales o drone, que cuenten con la capacidad de
recontruir de modo tridimensional prácticamente cualquier objeto a través de los
algoritmos SfM. De esta manera, propongo la siguiente figura (FIGURA 1) en donde
se organizan las herramientas de acuerdo al tipo de fotogrametría.
Teléfono
celular
Terrestre
Cámara
fotográfica
Fotogrametría
Digital Satélital Satélites

Aérea Drone

FIGURA 1. Clasificación de la fotogrametría digital. (Elaboración propia con información de Fawcett et al.
(2019), Jaud et al. (2019) y Pearse et al. (2018))

2.1.1 FUNDAMENTOS BÁSICOS DE LA FOTOGRAMETRÍA TRADICIONAL

La fotogrametría tradicional se apoya fundamentalmente en las relaciones matemáticas de la

geometría proyectiva y de visión estereoscópica.
La visión estereoscópica se puede dar principalmente de dos maneras:

• Visión estereoscópica natural.

~9~
 La visión estereoscópica natural (FIGURA 2) es la capacidad
que tiene el ser humano de integrar una sola imagen
tridimensional, en relieve y con suficiente profundidad. Es
decir, cada ojo captura imagen de un mismo objeto y en el
cerebro, se unen por un proceso mental generando una única
imagen en tres dimensiones.

FIGURA 2. Visión estereoscópica natural. Tomado de

(Rosas et. al., 2007).

• Visión estereoscópica artificial

En la visión estereoscópica artificial (FIGURA 3)

se utilizan un par de imágenes estéreo de una
misma escena donde las cámaras están situadas en
diferentes posiciones y se encuentran separadas,
pero cuentan con una sobreposición determinada.
Se puede hacer uso de un estereoscopio (FIGURA
3).

FIGURA 3. Visión estereoscópica artificial. Tomado

de (Rosas et. al., 2007).

~ 10 ~
Otro concepto importante dentro de fotogrametría es el paralaje (FIGURA 4) que se define
como el desplazamiento de la posición de un objeto en dos fotografías consecutivas causado por
un cambio en la posición de la cámara al realizar los disparos. Esos desplazamientos permiten
calcular las distancias entre los objetos del terreno.

FIGURA 4. Representación del paralaje. Tomado de (Quirós Rosado, 2014).

En la FIGURA 4 se representa el paralaje estereoscópico donde O’ y O’’ son las diferentes

posiciones de la cámara y A y B son los puntos del terreno que se van a fotografiar, se le va a
llamar paralaje a la siguiente cantidad:

𝑃𝑎 = 𝑥𝑎’ − 𝑥𝑎’’ 𝑃𝑏 = 𝑥𝑏’ − 𝑥𝑏’’

2.1.2 Fotogrametría digital: Structure from Motion

Un método fotogramétrico muy utilizado dentro de la fotogrametría digital es Structure from

Motion (SfM) el cual es considerado de bajo costo y de alta resolución. El término “Structure” se
refiere a todos los parámetros de la escena como la posición de cámara, orientaciones, longitudes
focales y posiciones relativas; y “Motion” se refiere al movimiento de la cámara.
Tiene sus orígenes en el campo de la visión artificial y el desarrollo de los algoritmos
automáticos de correlación automática de imágenes (CAI) (Riquelme et. al., 2016; Westoby et.
al., 2012). Sin embargo, este método se basa en los principios básicos de fotogrametría
tradicional como lo es el paralaje y la estereoscopia, ésta última busca un efecto de relieve y otro

~ 11 ~
de apreciación de distancias, de forma que a partir de dos fotografías sea posible reconstruir un
modelo donde se puedan realizar mediciones en altimetría y planimetría.
SfM implica la determinación de la geometría epipolar (FIGURA 5) entre dos cámaras, esta
condición se cumple cuando los dos ejes de la cámara de un sistema estereoscópico son paralelos
entre sí y perpendiculares a la base (caso ideal).

FIGURA 5. Geometría epipolar.

La Geometría Proyectiva es la que se encarga de estudiar la geometría epipolar, se toman dos

fotografías de un objeto, conociendo la matriz del movimiento (R, T) rotación y traslación que
lleva una cámara en la otra podríamos determinar las verdaderas proporciones del objeto.

La Figura 5 muestra la geometría epipolar donde los puntos O1 y O2 son los centros de las
cámaras, X’1 y X’2 son las proyecciones del punto p (se trata de un punto del objeto a restituir)
sobre los planos imágenes, e1 y e2 son los epipolos (intersecciones de los planos imagen con la
línea base), el plano conformado por O1 , O2 y p se llama plano epipolar y por último las rectas
𝑙1 y 𝑙2 son las rectas epipolares que se definen como la intersección del plano epipolar con los
planos imágenes que pasan por los epipolos.
Para ubicar la posición 3D de un punto a partir de un conjunto de ubicaciones de imágenes y las
posiciones de la cámara se utiliza la triangulación, este proceso SfM lo resuelve utilizando sus
algoritmos.
Por lo tanto, SfM identifica de manera automática la posición de cámara, la orientación y la
geometría de la escena incluso si no se cuenta con coordenadas 3D conocidas basándose en la
correlación de un conjunto de imágenes no necesariamente estructuradas para así generar una

~ 12 ~
nube de puntos 3D en un sistema coordenado arbitrario (FIGURA 6). Para poder otorgarle un
sistema de coordenadas a la nube de puntos es necesario hacer uso de la Georectificación.
La Georectificación significa convertir la nube de puntos de un sistema de coordenadas
arbitrario interno en un sistema de coordenadas. Esto se puede lograr de dos formas:

• Directo. Se realiza cuando se conocen las coordenadas de la posición de la cámara, en

conjunto con la distancia focal, por lo que el sistema de referencia del modelo resultante
adopta el mismo en el que se encuentran las coordenadas de la cámara.
• Indirecto. Para que el método cuente con un sistema coordenado definido es necesario
hacer uso de los marcadores o puntos de control terrestre (GCP por sus siglas en inglés)
con coordenadas conocidas, estos puntos permiten escalar y georreferenciar la nube de
puntos 3D. Si lo que se pretende es referir el modelo a un sistema coordenado proyectado
como puede ser UTM, entonces se deberá emplear un receptor GPS. En contraste, si lo
que se pretende es colocar puntos de control sobre un modelo como las muestras de roca,
entonces basta con colocar marcadores.

FIGURA 6. Reconstrucción de una nube de puntos a partir de la superposición de varias fotografías.

Si nos remitimos a la documentación que proporciona Agisoft LLC (2020), el concepto GCP está
referido principalmente a los datos que se recaban a partir de un receptor GPS en los puntos de
control definidos previamente sobre el área de estudio, por lo que es posible referenciar el modelo
a la ubicación correcta en el espacio geográfico. Sin embargo, existen aplicaciones dentro de la
fotogrametría a corto alcance como es la reconstrucción de muestras de roca, entre otras, en
donde estrictamente no se realizan mediciones de este tipo y, por el contrario, como se muestra
~ 13 ~
en este trabajo, las coordenadas que se emplean como puntos de control se definen mejor como
marcadores.
En el caso de los marcadores, son de suma de importancia a escala de muestras de roca debido a
que estos permiten georreferenciar y mejoran la precisión relativa y absoluta del proyecto.
Los softwares que utilizan este método para la reconstrucción fotogramétrica se dividen en dos
categorías:
1. Software comercial o de paga. Este tipo de software normalmente tiene un flujo de trabajo
más ágil e intuitivo. Sin embargo, se tiene que pagar una cuota mensual o anual para hacer
uso de este. Los más utilizados en la fotogrametría son Pix4D (2021) y Agisoft Metashape
Professional (2020).
2. Software open-source. Son software de código abierto donde el flujo de trabajo es más
complejo donde puede ser necesario utilizar varios programas en secuencia para obtener
los resultados deseados. Algunos de estos softwares son COLMAP (2018) y
OpenDroneMap (2018).

2.2 AGISOFT METASHAPE PROFESSIONAL (ASPECTOS GENERALES Y

VENTAJAS )

Agisoft Metashape Professional es un software fotogramétrico de licencia de paga que procesa

de manera automática imágenes digitales y genera datos espaciales en 3D para su uso en
Sistemas de Información Geográfica, documentación de patrimonio cultural y para realizar
mediciones indirectas de objetos a diferentes escalas.
En la actualidad, Agisoft Metashape Professional (Agisoft LLC, 2020) es uno de los softwares
más utilizados en el campo de la fotogrametría porque puede ser utilizado dentro de muchas
ramas de las geociencias. Sin embargo, existen otros softwares fotogramétricos como lo son
Pix4D (2021), COLMAP (2018), OpenDroneMap (2018), DroneDeploy (2021), entre otros que
son de gran utilidad para el procesamiento de imágenes digitales y generación de productos a
partir de estas. En la TABLA 1 se presenta una comparación de los diferentes softwares
fotogramétricos.

Software Licencia (USD) Sistema operativo

Agisoft Metashape Prueba de 30 días, después Windows, Mac OS, Linux
$3 499
Pix4D Prueba de 15 días, después Windows, Mac OS, Online
desde $291.67 al mes

~ 14 ~
 COLMAP Libre Windows, Mac OS, Linux/Unix/BSD
OpenDroneMap Libre Windows, Mac OS, Linux,
Ubuntu/Debian, Fedora,
CentOS/RHEL, Arch
DroneDeploy $99 al mes Online

TABLA 1. Comparación de diferentes softwares fotogramétrico con precios del 2020.

Agisoft Metashape Professional permite procesar imágenes digitales provenientes de cámaras

RGB o multiespectrales, incluidos los sistemas multicámara, estas imágenes pueden ser
corregidas de manera automática, permite calcular nubes de puntos densas, modelos
texturizados, ortomosaicos georreferenciados de alta resolución, Modelos Digitales de
Elevación/Superficie con alto nivel de detalle, curvas de nivel y modelos 3D texturizados.
Asimismo, es posible eliminar sombras y objetos con textura de los modelos mediante la
herramienta de máscaras, así como también permite clasificar de manera automática nubes de
puntos densas dependiendo del color y forma, entre otras herramientas útiles e importantes para
los estudiosos de las Ciencias de la Tierra. Agisoft Metashape Professional puede ser utilidad de
la siguiente manera:

• Minas y canteras – DEM precisas para el cálculo del volumen de material. (Benevenuti &
De Lemos Peroni, 2021)
• Agricultura de precisión – Cálculo del índice de vegetación de diferencia normalizada,
soporte de imágenes pancromáticas, multiespectrales y térmicas. (González et al., 2017).
• Topografía y cartografía – Triangulación aérea, nube de puntos densa y generación de
ortomosaicos u ortofotos. Mediciones indirectas dentro de estos productos. (James &
Robson, 2012; Verma & Bourke, 2019)
• Arqueología y documentación – Soporte para cámaras profesionales y de consumo para la
generación de modelos 3D de objetos históricos. (Porter et. al., 2016)
• Preservación del patrimonio cultural – Soporte de imágenes aéreas y oblicuas. (Jaladoni
et. al., 2018; Porter et. al., 2016)

Una de las ventajas de este software es que cuenta con un flujo de trabajo lineal (Workflow) muy
intuitivo y automatizado que incluso puede ser utilizado por alguien que no cuente con
conocimientos amplios en fotogrametría.
Se eligió este software para el procesamiento de estas imágenes ya que cuenta con una
herramienta fundamental (puntos de control o marcadores) para realizar la reconstrucción
fotogramétrica de los modelos 3D de muestras de rocas. Los puntos de control son de gran
importancia debido a que disminuyen el error cuadrático, permite escalar el modelo y

~ 15 ~
georreferenciarlo, pero mucho más importante se utiliza para la unión de dos modelos con
diferentes perspectivas de las muestras de roca.

3. APLICACIÓN EN LAS GEOCIENCIAS

La fotogrametría ha sido utilizada en varios ámbitos de las geociencias (Westoby et. al., 2012)
como lo son en la arqueología (Jaladoni et. al., 2018; Porter et. al., 2016)) y en la paleontología
para la preservación de fósiles. Dentro de la geología ha sido aplicado en la mecánica de rocas
para la caracterización de macizos rocosos (Riquelme et. al., 2016; Riquelme et. al., 2019),
identificación de texturas y rugosidad (Baker et. al., 2008), caracterización geotécnica y
evaluación de estabilidad en taludes (Tannant, 2015), mapas de erosión y movimiento de las
masas rocosas en la geomorfología (James & Robson, 2012; Verma & Bourke, 2019).
En las geociencias no solo se han utilizado modelos 3D digitales sino también estos han sido
impresos. Hasiuk (2014) indica la importancia de la impresión 3D debido a que se pueden hacer
pruebas destructivas, exageración de la escala en modelos digitales de elevación para conceptos
como la morfología, modelos cristalográficos y modelos de fósiles. Un claro ejemplo de esto es
como Ishutov (2017) imprimió medios porosos para identificar el comportamiento del flujo en
estos medios en hidrogeología y geología del petróleo.
De manera más específica, Harvey et. al. (2017) menciona la importancia de la generación de
modelos 3D de muestras de rocas georreferenciadas que sean representativas de una unidad
estratigráfica o región para crear una colección digital de acceso mundial. Esta aplicación puede
ser de gran ayuda para el geólogo debido a que puede contar con un contexto más regional y
puede realizar correlaciones estratigráficas y así proporcionar una mejor interpretación
geológica.
En la actualidad, a causa de la pandemia del COVID-19 Andrews et. al. (2020) menciona que
debido a la dificultad de hacer accesibles minerales y muestras de rocas a los estudiantes de las
geociencias se ha tenido que recurrir a realizar una colección de muestras de roca y minerales
en 3D de manera digital para que puedan acceder a estos materiales de manera rápida y sin
necesidad de salir de sus hogares.
Todas estas aplicaciones dentro de las geociencias han sido bien documentadas como ya se
mencionó, no sólo para la visualización en 3D de objetos importantes dentro de esta rama sino
para la impresión. Estos recursos pueden ser una herramienta fundamental para hacer más
rápida y eficiente ciertas interpretaciones para los estudiosos de las geociencias.

~ 16 ~
 4. EJEMPLO DE APLICACIÓN

Para poder verificar la efectividad del método planteado para la generación de modelos 3D de
muestras de rocas se realizaron dos modelos 3D de muestras ideales: un “cubo” y un núcleo
(FIGURA 7). Se les llama “ideales” porque su forma permite un mejor manejo de ellas.

A. B.

FIGURA 7. A. "Cubo" de Peña de Bernal. B. Núcleo.

Las dos muestras pasaron por los mismos pasos para generar sus propios modelos 3D
texturizados, estos pasos se divideron en las siguientes 4 etapas:

Etapa 2: Etapa 3:
Etapa 1: Etapa 4:
Generación de Generación de
Adquisición de Escalado y
dos un solo
fotografías exportanción
perspectivas modelo

• Etapa 1: Adquisición de fotografías

Antes de empezar con la adquisición de fotografías se sugiere realizar una caracterización
detallada de la muestra de roca para identificar sus principales características y sobretodo
definir si es necesario generar el modelo 3D de la muestra completa o simplemente será
necesario hacerlo de una parte de la muestra.

Con la ayuda de una caja de luz fotográfica, luces LED, una base giratoria y una plantilla
fotogramétrica que cuenta con marcas cada 10° se van a adquirir de manera sistemática

~ 17 ~
 las fotografías, es decir, se tomará una fotografía en cada marca de la plantilla
fotogramétrica para obtener la sobreposición debida para su reconstrucción
fotogramétrica (ver FIGURA 7). Para lograr un mayor detalle en el modelo el ángulo de
la cámara va a ser cambiado durante la adquisición de las fotografías.

Como en este caso se va a requerir generar el modelo 3D de la muestra de roca completa

se tomaron 80 fotografías, dividiso en dos bloques o “Chunks” de 40 fotografías con dos
perspectivas diferentes que pueden ser unidas posteriormente utilizando un software
fotogramétrico.
Para terminar este primer bloque de pasos para crear un modelo 3D las fotografías
adquiridas tienen que ser transferidas al equipo de cómputo con el que van a ser
procesadas.

El proceso para esta primera etapa se muestra en el videotutorial de nombre: “Modelos

3D de Roca SfM Parte 1| Adquisición de fotografías” subido a la plataforma de Youtube
con el siguiente link: https://www.youtube.com/watch?v=5ZjFgF6RNHM

FIGURA 8. Pasos durante la adquisición de fotografías.

• Etapa 2: Generación de dos perspectivas

El primer bloque para el procesamiento de las fotografías consiste en generar dos
perspectivas de manera separada utilizando el software fotogramétrico Agisoft Metashape
Professional versión 1.5.1. Este software cuenta con un Flujo de trabajo ya establecido
para realizar reconstrucciones fotogramétricas exitosas.

Inicialmente se tienen que agregar las fotografías. Se sugiere calibrarlas para tener datos
más confiables, el software permite calibrar las fotografías de manera automática para
eliminar y/o reducir la distorsión radial y tangencial provocada por la cámara.

~ 18 ~
 Con el fin de excluir elementos no necesarios como el fondo se recurre a la importación
de máscaras de todas las fotografías del espacio para que el programa únicamente
reconstruya la muestra de roca. Luego, estas fotografías ya con el fondo excluido tienen
que ser separadas en dos bloques o “Chunks” que van a ser definidos por las diferentes
perspectivas de la muestra de roca.

El segundo paso dentro del Flujo de trabajo es la alineación de fotografías la cual identifica
puntos en común en diferentes fotografías para establecer sus relaciones espaciales y
ubicaciones en un sistema de coordenadas arbitrario (en caso de no contar con
coordenadas específicas), ordenando los puntos en forma de una nube de puntos dispersa.
Posteriormente, el software basándose en la nube de puntos dispersa generada durante la
alineación calcula la profundidad y la intensifica creando una nube de puntos densa. Por
último, para tener una mayor precisión en nuestro modelo se realizó una limpieza de la
nube de puntos densa eliminando todos esos puntos que no son parte de la muestra de
roca.

FIGURA 9. Resultado del primer bloque de pasos para el procesamiento de imágenes en Agisoft Metashape
Proffessional.

El proceso para esta etapa se muestra en el videotutorial de nombre: “Modelos 3D de Roca

SfM Parte 2 | Generación de nubes de puntos de perspectivas diferentes” subido a la
plataforma de Youtube con el link: https://www.youtube.com/watch?v=V1D-
Gy3DUkw

~ 19 ~
 FIGURA 10. Pasos para la generación de dos perspectivas.

• Etapa 3: Generación de un solo modelo

El segundo bloque de pasos para el procesamiento de las fotografías tiene como objetivo
generar un solo modelo 3D mediante la unión de los dos modelos generados en la etapa
anterior.

Agisoft Metashape Professional permite la unión de dos o más “Chunks” o bloques

utilizando los siguientes métodos:
❖ Puntos de control o marcadores
❖ Nube de puntos
❖ Posición de las cámaras
En este caso se colocaron 3 puntos de control o marcadores sin embargo es posible
agregar más para tener una mayor precisión. Estos puntos de control tienen que ser
encontrados fácilmente en los dos “Chunks” y a su vez, pueden ser colocados en
características muy particulares de la muestra de roca. Después de colocar los marcadores
pertinentes se van a alinear y combinar los dos modelos 3D para generar un modelo
completo de la muestra de roca (FIGURA 11). Metashape basándose en la nube de puntos
densa del modelo completo de la roca hace una triangulación para la construcción de una
malla o un modelo poligonal. Para terminar, se va a generar un modelo texturizado de la
muestra de roca basándose en las fotografías.

~ 20 ~
 FIGURA 11. Alineación y combinación de dos modelos 3D.

En el modelo resultante se observa la plantilla (puntos en color blanco) en las dos bases
de la muestra, misma que se puede eliminar.
El proceso para esta etapa se muestra en el videotutorial de nombre: “Modelos 3D de Roca
SfM Parte 3 | Alineación de dos chunks para generar un modelo de nube de puntos”
subido a la plataforma de Youtube con el link:
https://www.youtube.com/watch?v=g2DOkq1y704

FIGURA 12. Pasos para la generación de un solo modelo.

• Etapa 4: Escalado y exportación de productos

Finalmente, para obtener un modelo 3D de una muestra de roca útil es necesario escalarlo
y exportar los principales productos como lo son la nube de puntos densa y el modelo
texturizado. Cada plantilla fotogramétrica cuenta con medidas conocidas para realizar
este bloque de pasos. Se colocan dos puntos de control dentro de la plantilla
fotogramétrica (FIGURA 13) para crear una barra de escala con las medidas conocidas y
así corregir el modelo 3D de la muestra de roca.

~ 21 ~
 FIGURA 13. Colocación de puntos de control para escalar modelo 3D.

El proceso para esta etapa se muestra en el videotutorial de nombre: “Modelos 3D de Roca

SfM Parte 3 | Escalado de la muestra de roca” subido a la plataforma de Youtube con el
link: https://www.youtube.com/watch?v=rZcvruWAlZQ

FIGURA 14. Pasos para escalar y exportar productos.

4.1 RESULTADOS Y POSIBLE APLICACIÓN

Al finalizar las 4 etapas se obtuvieron dos principales productos que pueden ser utilizados y
analizados con otro tipo de software como:

❖ Visor 3D (corporación Microsoft) – Permite la visualización de modelos 3D en el formato

OBJ.

~ 22 ~
 ❖ MeshLab (software libre) – Permite el procesamiento y edición de mallas triangulares no
estructuradas en 3D. También permite la medición de los modelos 3D. Admite nube de
puntos densa y modelos texturizados.
❖ CloudCompare (software libre) – Permite comparar y realizar estudios sobre nubes de
puntos en varios formatos.
En la FIGURA 15 se pueden observar los modelos texturizados obtenidos:

A. B. FIGURA 15. A.
Modelo 3D de
muestra recolectada a
6 km de la Peña de
Bernal. B. Modelo 3D
de un núcleo.

Estos modelos 3D texturizados fueron subidos a Sketchfab para su visualización. Sketchfab es

un sitio web utilizado para visualizar y compartir contenido 3D en línea. Los links de las
muestras de rocas son los siguientes:

• Núcleo https://sketchfab.com/3d-models/nucleo-con-geometria-ideal-para-sfm-
fc82f3e24321451d94b65e1e8fae6eb3
• Muestra de Peña de Bernal https://sketchfab.com/3d-models/roca-con-geometria-ideal-
para-sfm-e0436b009cbd439db659a1def4f959ba

Adicionalmente se realizaron los modelos 3D de dos muestras de roca volcánica de la Primera

Visita Geológica de la estación La Cima, los links son los siguientes:

• Muestra https://sketchfab.com/3d-models/modelo-2-cima-ii-
05e1bb5d80ff47299fae72400cd997ea
• Bomba https://sketchfab.com/3d-models/bomba-cima-ii-
470e924af9e44f54a1f0dafb14a7ca91
También fue posible exportar la nube de puntos densa para realizar mediciones en Meshlab
(FIGURA 16) y así comprobar que el modelo se encontrara debidamente escalado.

~ 23 ~
 FIGURA 16. Medición en nube de puntos densa de muestra de roca de Peña de Bernal.

De manera más específica estos dos productos pueden ser utilizados de la siguiente forma:

❖ Nube de puntos densa:

▪ Definir, clasificar y delimitar diferentes clases de nubes puntos de acuerdo con su
color para identificar cierta litología.
▪ Con base en el punto anterior, entrenar un programa para que de manera
automática realice la clasificación de futuras litologías.
▪ Identificación de rugosidad.
▪ Definir dirección de planos de discontinuidad a escala de muestras de roca.

❖ Modelo 3D texturizado:
▪ Realizar mediciones indirectas sin necesidad de contar con la muestra de roca física
como el tamaño de los estratos y el tamaño de los clastos.
▪ Visualizar con mayor detalle las características más importantes de las muestras de
roca.
▪ Identificación de texturas.
▪ Fácil visualización del modelo en diferentes softwares de libre acceso.
▪ También los modelos 3D pueden ser georreferenciados dentro de un mapa digital
con datos geológicos, sísmicos, estratigráficos, entre otros para realizar
interpretaciones geológicas más precisas.

~ 24 ~
 ▪ Sumado a esto, contar con un modelo digital 3D de una muestra de roca resulta ser
de importancia cuando dicha muestra fue sometida a pruebas físicas destructivas
para conocer sus propiedades mecánicas como la resistencia a la compresión,
resistencia al esfuerzo cortante, entre otros.
▪ Debido a la pandemia de COVID-19 un modelo de este tipo puede ayudar al
estudiante a visualizar diferentes tipos de rocas sin necesidad de tenerlas de manera
física para entrenar el ojo y realizar clasificaciones preliminares.

5. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES

Un modelo en 3D de una muestra de roca se realiza utilizando fotogrametría digital, se pueden

adquirir las fotografías con un dispositivo móvil o una cámara profesional y se utiliza un software
que hace de manera automática la reconstrucción fotogramétrica utilizando algoritmos de SfM.
Con base en la investigación realizada se concluyó:
1. Se generó material escrito (Guía de Aprendizaje Autónomo) y audiovisual
(Videotutoriales y modelos 3D en Sketchfab) que contienen la información necesaria
conjunta y puntual para que el alumnado pueda elaborar su propio modelo 3D sin la
necesidad de contar con equipo especializado.
2. Alumnos que formaron parte del proyecto PAPIME fueron capaces de replicar de manera
exitosa el material realizado.
3. Se tiene que tomar en cuenta que, para hacer uso de cierto tipo de softwares
fotogramétricos, en este caso Agisoft Metashape Professional, se requiere un equipo de
cómputo con características mínimas para que este pueda funcionar de manera óptima
como lo es el sistema operativo (Windows XP o posterior), la memoria RAM (4 GB o
mayor) y el procesador (Intel Core 2 Duo o equivalente).
4. Una de las ventajas de Agisoft Metashape Professional es que permite procesar las
imágenes en diferentes “Calidades” las cuales pueden estar en función de lo que se quiere
obtener.
Algunas de las recomendaciones son:
1. Utilizar el software Agisoft Metashape Professional para realizar reconstrucciones
fotogramétricas.
2. Crear una colección digital de modelos 3D de muestras de roca representativas de
unidades estratigráficas vistas en las prácticas de campo de las asignaturas.
3. Crear un mapa digital de los principales estados de la República Mexicana que los alumnos
visitan durante sus prácticas campo y georreferenciar la colección de muestras de roca.

~ 25 ~
4. Conjuntar el modelo 3D de muestras de roca con mapas geológicos, modelos digitales de
elevación, secciones geológicas, información sísmica, columnas estratigráficas hasta
secciones delgadas para una mejor interpretación.
5. Con base en los puntos anteriores, se recomienda a los profesores de materias con
prácticas de campo mostrarle al estudiante en una sola plataforma una visualización desde
lo más general (geología regional) hasta lo más particular (muestras de roca) de una zona
geológicamente importante. Estos materiales ayudarán al alumno a realizar una
interpretación más completa y contar con una relación espacial de todos los recursos.
Es importante recalcar que un modelo 3D de una muestra de roca no pretende sustituir el
trabajo de campo, sino puede complementarlo. Principalmente cuando la reciente pandemia
del COVID-19 y el distanciamiento social ha provocado la digitalización de los recursos para
la educación.

~ 26 ~
 6. REFERENCIAS CITADAS

Agisoft LLC. (2020). Agisoft Metashape. St. Petersburg. Retrieved from

https://www.agisoft.com/
Andrews, G. D., Labishak, G., Brown, S., Isom, S., Pettus, H., & Byers, T. (2020). Teaching with
Digital 3D Models of Minerals and Rocks. The Geological Society of America. Groundwork.
Volume 30 Issue 9. Pp. 42-43. https://doi.org/10.1130/GSATG464GW.1
ASPRS Positional Accuracy Standards for Digital Geospatial Data (2014)
Baker, B., Gessner, K., Holden, E.-J., & Squelch, A. (2008). Automatic detection of anisotropic
features on rock surfaces. Geosphere, 418-428. https://doi.org/10.1130/GES00145.1

Benevenuti, F., & De Lemos Peroni, R. (2021). Detección de problemas de drenaje en minas a cielo
abierto y caminos de acarreo utilizando fotogrametría UAV. Revista DYNA, 88 (216), pp 190-
195 Universidad Nacional de Colombia Sede Medellín Facultad de Minas.
https://doi.org/10.15446/dyna.v88n216.90801.

Caire Lomeli, J. (1977). Fotogrametría-I, Fotogrametría terrestres. México, D.F: Editorial

Rodriguez.

Cheli, A. (2012). Introducción a la Fotogrametría y su evolución. Argentina: Ediciones Hespérides.

DroneDeploy, I. (2021). DroneDeploy. San Francisco. Retrieved from

https://www.dronedeploy.com/
ETH Zurich, & UNC Chapel Hill. (2018). Colmap. Retrieved from https://colmap.github.io/

Fawcett, D., Blanco-Sacristán, J., & Benaud, P. (2019). Two decades of digital photogrammetry:
Revisiting Chandler´s 1999 paper on "Effective application of automated digital photogrammetry
for geomorphological research" - synthesis. UK: Progress in Physical Geography 43(2).
https://doi.org/10.1177/0309133319832863.

González, A., Amarillo, G., Amarillo, M., & Sarmiento, F. (2017). Drones Applied to Precision
Agriculture. Bogotá, Colombia: Publicaciones e Investigación ISSN: 1900-6608 Volumen
10-2017. https://doi.org/10.22490/25394088.1585
Harvey, A., Fotopoulos, G., Hall, B., & Amolins, K. (2017). Augmenting comprehesion of
geological relationships by integrating 3D laser scanned hand samples within a GIS
enviroment. Computers & Geosciences. Volume 103, 152-153.
https://dx.doi.org/10.1002/2016GL069334

~ 27 ~
Hasiuk, F. (2014). Making things geological: 3-D printing in the geosciences. GSA Today, v.24,
no.8, 28-29. https://doi.org/10.1130/GSATG211GW.1

Ishutov, S. (2017). 3D printing porous proxies as a new tool for laboratory and numerical
analyses of sedimentary rocks. Iowa Satate University Capstones, Theses and Dissertations ,
224.
Jalandoni, A., Domingo, I., & Taçon, P. (2018). Testing the value of low-cost Structute-from-
Motion (SfM) photogrammetry for metric and visual analysis of rock art. Journal of
Archaeological Science: Reports , 605-616. https://doi.org/10.1016/j.jasrep.2017.12.020
James, M., & Robson, S. (2012). Straightforward reconstruction of 3D surfaces and topography
with a camera: Accuracy and geoscience application. Journal of Geophysical Research, Vol.
117, F03017,, 17. https://doi.org/10.1029/2011JF002289

Jaud, M., Kervot, M., Delacourt, C., & Bertin, S. (2019). Potential of Smartphone SfM
Photogrammetry to Measure Coastal Morphodynamics. Journal MDPI.
https://doi.org/10.3390/rs11192242

Lerma García, J. (2002). Fotogrametría Moderna: Analítica y Digital. Universidad Politécnica de

Valencia.

Linder, W. (2006). Digital Photogrammetry. A practical Course. Germany: Springer. ISBN -10 3-
540-29152-0.
OpenDroneMap contributors. (2018). OpenDroneMap. Retrieved from
https://www.opendronemap.org/
Pearse, G., Dash, J., Persson, H., & Watt, M. (2018). Comparison of high-density LiDAR and
satellite photogrammetry for forest inventory. ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote
Sensing 142. https://doi.org/10.1016/j.isprsjprs.2018.06.006
Pix4D SA. (2021). Pix4D. Retrieved from https://www.pix4d.com/
Porter, S. T., Roussel, M., & Soressi, M. (2016). A Simple Photogrammetry Rig for the Reliable
Creation of 3D Artifact Models in the Field. Advances in Archeological Practice 4(1). A
Journal of the Society for American Archaeology, 71-86. https://doi.org/10.7183/2326-
3768.4.1.71
Quirós Rosado, E. (2014). Introducción a la Fotogrametría y Cartografía aplicadas a la Ingeniería
Civil. Cáceres: Universidad de Extremadura .

~ 28 ~
Riquelme, A., Cano González, M., Tomás Jover, R., Jordá Bordehore, L., & Santamarta Cerezal
, J. (2016). Petrología 3D. Alicante, España: Confenecia: XIV Jornadas de Redes de
Investigación en Docencia Universitaria.
Riquelme, A., Cano, M., Tomás, R., & Jordá, L. (2016). Structure from Motion (SfM): una técnica
fotogramétrica de bajo coste para la caracterización y monitoreo de macizos rocosos.
Conference Paper, 10 Simposio Nacional de Ingeniería Geotécnica, At A Coruña, Spain, Volume:
1, 209-215.

Riquelme, A., Cano, M., Tomás, R., & Jorda, L. (2019). Digital 3D Rocks: A Collaborative
Benchmark for Learning Rocks Recognition. Rock Mechanics and Rock Engineering, 16.
https://doi.org/10.1007/s00603-019-01843-3
Rosas, H., Vargas, W., Cerón, A., & Dominguez, D. (2007). Psychophysical approach to the
measurement of depth perception in stereo vision. Conference Paper.
https://doi.org/10.1007/978-3-540-73335-5_39
Tannant, D. (2015). Review of Photogrammetry-Based Techniques for Characterization and
Hazard Assesssment of Rock Faces . International Journal of Geohazards and Enviroment.
Vol.1. No.2, 76-87. https://doi.org/10.15273/ijge.2015.02.009
Verma, A. K., & Bourke, M. C. (2019). A method based on structure-from-motion
photogrammetry to generate sub-milimetre-resolution digital elevation model for
investigating rock breckdown features. Earth Surface Dynamics; Gottingen Tomo 7, N°1,
45-66. https://doi.org/10.5194/esurf-7-45-2019
Westoby, M., Brasington, J., Glasse, N., Hambrey, M., & Reynolds, J. (2012). "Structure-from-
Motion" photogrammetry: A low-cost, effective tool for geoscience application.
Geomorphology. Volumen 179, 300-314. https://doi.org/10.1016/j.geomorph.2012.08.021

~ 29 ~