BIOENERGETICA

BIOENERGÉTICA

Las células requieren energía para realizar todos los procesos de la vida. No se produce
energía nueva, ni se recicla la energía utilizada. Se requiere un aporte contínuo de
energía. La energía fluye en una dirección a través de cada célula y organismo, y a través
de la ecoesfera. Los organismos productores atrapan energía luminosa desde el sol
durante la fotosíntesis, parte de esa energía se incorpora en los enlaces de los
carbohidratos y otros compuestos orgánicos. Luego, parte de esa energía química puede
transferirse a los organismos consumidores, que se alimentan de los productores, y a
los descomponedores, que se alimentan de todos ellos, tarde o temprano.
La energía es un tema central en bioquímica: las células y los organismos
dependen de un aporte constante de energía que les permite oponerse a la
tendencia inevitable que tiene un sistema en la naturaleza a decaer a un
estado de menor energía.

Las células vivas y los organismos son sistemas abiertos, que

intercambian materia y energía con el medio.
Los sistemas vivos no están nunca en equilibrio con su medio, y la
interacción constante entre el sistema y el medio explica cómo los
organismos pueden crear orden dentro de ellos a la vez que operan
dentro de la segunda ley de la termodinámica.

Los sistemas abiertos pueden permanecer en un estado de no

equilibrio mientras puedan adquirir energía libre desde el medio, en la
forma de reactantes, calor o trabajo.
 C D
A A B E excreción
C´ D´
inmovilización

Estado estable o equilibrio dinámico

La mayoría de las reacciones bioquímicas son reversibles.

La velocidad de cambio en una dirección es igual a la velocidad de cambio

en la dirección opuesta, y el cambio neto es cero.
Fuerza:

Todo aquello capaz de modificar el estado de

resposo o de movimiento de un cuerpo.

Trabajo/Energía:
Fuerza X Espacio
Potencia:
Trabajo/ Tiempo
Energía:
- Atómica
La energía no se gasta,
- Química Se transforma
Leña
Carbón
Calor Vapor a presión
Gasolina
Diesel
Gas

Turbina,
Energía mecánica
Motor
- E. mecánica

Generador,
Energía eléctrica

Lámpara Radiador Motor Sirena

- E. luminosa - Calor - E. mecánica - Energía mecánica,
Sonido
 Energía luminosa
+ CO2 + H2O + NH4
CO2 + H2O + NH4
+ CALOR

Carne

Leche
Vaca,
cerdo,
etc.
El “ciclo” de la energía no es un ciclo
Es un flujo y una serie de conversiones Humano (a)
que termina en calor
La energía y los seres vivos
- Para qué?
Movimiento:
- Animales y sus órganos
- Las células también se mueven

Renovación constante de todas las moléculas:

- Síntesis
- Degradación

Transporte:
- Todos los materiales que entran y salen de los organismos,
órganos, células; las membranas son impermeables a casi
todo.
- Organos especializados (intestino, riñón)
- Organos cuya base funcional es el transporte, principalmente de iones
EL SISTEMA NERVIOSO
Otros requerimientos:
Anton Enselig (Alemania):
- Radio despertador
- Baño de agua caliente
- Desayuno: Huevos fritos con tocino, café
(estufa eléctrica)
-Viaje al trabajo en coche, 48 kms

Total: 53,900 Kcal antes de llegar

Abdul Mulaich (Marruecos)

- Despierta solito
- Se lava con agua fría, si quiere
- Desayuna pan frío y té, calentado con estiércol
- Va a su parcela a pie

Total: 1,676 Kcal.

 Además:
- Construcción y mantenimiento de una casa
- Operación de los sistemas de comunicación
(radio, televisión, teléfono)
- Otros servicios públicos
(alumbrado, transporte, etc.)
- Vestido
- Mobiliario

En resumen, la energía para mantener la vida es

casi nada.

Aún así, hay países (y grandes regiones en México),

en que ni ésto se tiene.
 Termodinámica
 La Termodinámica se enfoca al estudio de la Energía; la
que se requiere para que una reacción suceda, o la que
se emite cuando la reacción procede.

 Y en función del Principio de Conservación.

 Conceptos
 Universo:
Conjunto de materia con todo a su
alrededor.

• Sistema:
Parte específica del Universo que se
está estudiando

• Alrededores;
lo que rodea al Sistema
 Variables de estado:

• Indican el estado del sistema en un punto dado

 P (presión),
 T (temperatura),
 V (volumen),
 [ ] Concentración Molar
 The First Law
The total energy of an isolated system is
conserved.
 E (or U) is the internal energy - a function that
keeps track of heat transfer and work
expenditure in the system
 E is heat exchanged at constant volume
 E is independent of path
 E2 - E1 = E = q + w
 q is heat absorbed BY the system
 w is work done ON the system
 Energía
 La energía no se crea ni se destruye,
se transforma.

 La energía total es la suma de todas

las contribuciones de energía al
sistema (cinética, potencial, de enlace,
de rotación, de vibración, etc.)

 La energía de un sistema se
manifiesta solo cuando es transferida.
 Unidades
 En el sistema CGS:
erg (g cm2/ seg2)

 En el sistema MKS:
Joules (Kg m2/ seg2)
1 Joule = 107 erg
1Kcal = 4,187 J
1 cal = 4.187 J
R = 0.08206 atm L/ K mol = 1.9872 cal/ K mol
 Funciones de Estado:
• Indican la diferencia entre dos estados del sistema,
sin importar el camino seguido:

P = Pf – Pi
T = Tf – Ti
H = Contenido de Calor = Hf –Hi
 E
Si el sistema se mantiene a volumen constante:

E = q – w
.w = PV
E = q – PV = q – P (V2 – V1)
V2 = V1
E = q

E = qV
 Enthalpy
A better function for constant pressure
 H = E + PV
 If P is constant, H = q
 H is the heat absorbed at constant P
 Volume is approx. constant for biochemical reactions (in
solution)
 So H is approx. same as E
 Entalpía

 A presión constante, E no sirve para

caracterizar los procesos químicos.
 Se define otra función de estado llamada
Entalpía (Contenido de calor a presión
constante)
H = qP

Si H > 0 el sistema gana calor

Si H < 0 el sistema pierde calor
 Calor
• Si la reacción lleva consigo un
desprendimiento de calor del sistema al
medio, se denomina exotérmica.

• Por el contrario, si el proceso químico

implica la absorción de una cierta cantidad
de calor del medio por parte del sistema, se
denomina endotérmica.

• Todas las reacciones de combustión son

exotérmicas;
• por ejemplo: la reacción de combustión del
hidrógeno libera gran cantidad de calor.
 Calor

• Por el contrario, la reacción de

descomposición del carbonato de calcio es
endotérmica pues requiere la aportación al
sistema de una cierta cantidad de energía
calorífica del medio.

• La cantidad de calor desprendido o

absorbido en una reacción química, se
denomina calor de reacción.
 •Se expresa en kilocalorías (kcal) o en kilojouls
(kJ).

•En una reacción endotérmica irá precedido de un

signo menos.

•Los calores de reacción dependen de la presión,

temperatura y estado físico (sólido, líquido o
gaseoso) del sistema.

•En los cálculos de energía, deben especificarse

las condiciones de la reacción química.
 •(H) Entalpía

•Propiedad extensiva, su magnitud depende de la

cantidad de materia presente. Se mide sólo el cambio.

•La entalpía sirve para medir el calor liberado o absorbido

en una reacción.

•Entalpía de reacción: es la diferencia entre entalpías de

los productos y las entalpías de los reactivos.

H = SnH (productos) – SnH (reactivos)

 The Second Law
 Systems tend to proceed from ordered to
disordered states
 The entropy change for (system +
surroundings) is unchanged in reversible
processes and positive for irreversible
processes
 All processes proceed toward equilibrium
- i.e., minimum potential energy
 Entropy
 A measure of disorder
 An ordered state is low entropy
 A disordered state is high entropy
 dSreversible = dq/T
 Criterio de espontaneidad

ΔStotal>0

Δssistema+ ΔSalrededores >0

Criterio de espontaneidad
basado exclusivamente
en las propiedades del sistema

Definición de una nueva función de estado

G
 Energía libre
 La dirección y cantidad a la cual procede una reacción está
determinada por el grado energía libre que dos factores cambian
durante la reacción. Estos factores son la entalpía (DH, una
medida del cambio de calor entre los reactivos y productos de la
reacción) y la entropía (DS, una medida del cambio en el
desorden de los reactivos y productos)
 Ninguna de estas cantidades termodinámicas por si mismas es
suficiente para determinar si una reacción podrá suceder
espontáneamente en el orden en el que está escrita. Pero,
cuando se combinan matemáticamente, es posible conocer la
tercera, a partir del conocimiento de dos de ellas. La entropía no
se puede determinar experimentalmente, se debe calcular a partir
de G y H.
 El valor de G para un proceso nos da una idea
cuantitativa de la máxima cantidad de trabajo,
diferente del trabajo de expansión, que se puede
obtener de un sistema a P y T constantes

dG  dH  TdS dH  dU  PdV dU  dq  dw

dG  dq  dw  PdV  TdS  dq  dwotro  Pexterna dV  PdV  TdS

P  Pexterna dq  TdS proceso reversible

dG  dwotro ,reversible wreversible  wirreversible

dG  dwmax, otro

G  wmax,otro
 G  wmax,otro

G nos indica cuánto trabajo se puede

obtener a partir de una transformación
espontánea en un sistema dado
Criterio de espontaneidad:
“la dirección de cambio espontáneo
es aquella que no requiere la realización
de trabajo sobre el sistema”
 G versus Go’
 How can we calculate the free energy change for rxns not
at standard state?
 Consider a reaction: A + B  C + D
 Then:
G = Go’ + RT ln ([C][D]/[A][B])
 El cambio en la energía libre se puede presentar
en dos formas DG y DG°. El primero (sin el
subíndice °) es la forma mas general porque
predice el cambio en la energía libre y por tanto
la dirección de la reacción a cualquier
concentración de reactivos y productos. Este
valor contrasta con el cambio en la energía libre
estándar DG°, que es el cambio en energía libre
cuando la concentración de reactivos y
productos es de 1 mol L-1, aunque esta
representación es de un estado no fisiológico,
es útil para comparar cambios de energía en
diferentes reacciones, de hecho puede ser
determinada a partir de la cuantificación de la
constante de equilibrio (k).
 Energy Transfer
A Crucial Biological Need
 Energy acquired from sunlight or food
must be used to drive endergonic
(energy-requiring) processes in the
organism
 Two classes of biomolecules do this:
 Reduced coenzymes (NADH, FADH2)
 High-energy phosphate compounds - free
energy of hydrolysis larger than -25 kJ/mol)
 ATP

An Intermediate Energy Shuttle Device

 PEP and 1,3-BPG are created in the
course of glucose breakdown
 Their energy (and phosphates) are
transferred to ADP to form ATP
 But ATP is only a transient energy
carrier - it quickly passes its energy to a
host of energy-requiring processes
 Phosphoric Acid Anhydrides
Why ATP does what it does!
 ADP and ATP are examples of phosphoric
acid anhydrides
 Note the similarity to acyl anhydrides
 Large negative free energy change on
hydrolysis is due to:
 electrostatic repulsion
 stabilization of products by ionization and
resonance
 entropy factors
Fig. 14-1 L
Tabla 13-6 L
Fig. 14-1 L
 Enol Phosphates
 Phosphoenolpyruvate (PEP) has the largest free energy
of hydrolysis of any biomolecule
 Formed by dehydration of 2-phospho-glycerate
 Hydrolysis of PEP yields the enol form of pyruvate - and
tautomerization to the keto form is very favorable
Fig. 14-5 L
Fig. 14-6 L
 Activación de reacciones por ATP mediante
adenilación

1.- Biosíntesis de ácidos grasos

R-COO- + ATP R-COO-AMP + PPi

2.- Biosíntesis de proteínas

aa + ATP aa-AMP + Ppi
aa-AMP + tRNA aatRNA + AMP
 glucosa + Pi glucosa-6-P + H2O G´º = 13.8 kJ/mol

ATP + H2O ADP + Pi G´º = -30.5 kJ/mol

Se pueden expresar como reacciones secuenciales:

1) Glucosa + Pi glucosa-6-P + H2O

2) ATP + H2O ADP + Pi

Sumando: ATP + Glucosa ADP + Glucosa-6-P

G´º = 13.8 kJ/mol + (-30.5 kJ/mol) = -16.7 kJ/mol