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Química Biológica
1º Medicina
Facultad de Medicina
Universidad de Buenos Aires
Reservados todos los derechos.
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
aminoácidos y proteínas
_aminoácidos y proteínas
No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Aminoácidos
Son sustancias orgánicas que poseen un grupo amino (en el carbono alfa), un grupo
carboxilo (acido) y un grupo radical unidos al
carbono 1.
El carbono alfa es un carbono asimétrico
está formado por:
− Arriba: carboxilo
− Derecha: hidrogeno
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− Izquierda: amino
− Abajo: depende del aminoácido (el radical)
− Unidades estructurales de proteínas, ya que las van a formar
− Neurotransmisores, como el glutamato
− Transporte de ácidos grasos activados
− Participación metabólica de la síntesis de:
• Glucosa
• Urea
• Purinas
• Pirimidinas
• Hemo
• Etc.
Son los que no pueden ser sintetizados por el organismo y que deben ser aportados a
través de la dieta. Son
− Valina
− Leucina
− Isoleucina
− Triptófano
− Metionina
− Treonina
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− Lisina
− Fenilalanina
Los aminoácidos esenciales tienen proteínas con alto valor biológico en la dieta.
Los otros aminoácidos esenciales son: valina, leucina, isoleucina, triptófano, metionina,
treonina y lisina. Existen varias reglas mnemotécnicas para recordar estos ocho
aminoácidos y te sugerimos que elijas una y la memorices:
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“Leo hizolio, metió un trio de tres aminoácidos esenciales en una valija fea.”
Las proteínas de origen animal son ricas en estos aminoácidos. Estos son los aminoácidos
que determinan que las proteínas contengan ALTO valor biológico. Metionina y
cisteína contienen azufre
− Isómeros ópticos (series D y L): la presencia de C asimétricos determina:
• Si el grupo amino está a la derecha es SERIE D
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• Si el grupo amino está a la izquierda es SERIE L
− Ionización a pH fisiológico
− Comportamiento anfoterico
− Formación de enlaces peptídicos
Ionizacion a pH fisiologico
Los aminoácidos tienen un alto punto de fusión y ebullición y forman redes cristalinas.
Esto significa que los aminoácidos se IONIZAN.
− Si están ionizados se les agrega ATO
− Si no están ionizados se les agrega ICO
El punto isoeléctrico es el valor de pH, en el cual una molécula ionizable no se desplaza,
ni hacia el ánodo ni hacia el cátodo, cuando es sometida a una corrida electroforética.
Para todos los aminoácidos se cumple que no se desplazarán cuando la sumatoria de
“todas” las cargas de la molécula sean cero, formándose una especie neutra llamada
“zwitterión”.
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Para los aminoácidos de cadenas laterales neutras, esto se da cuando el grupo N tiene
carga positiva NH3+ y el grupo C tiene carga negativa COO-.
Por lo tanto, el punto isoeléctrico se da cuando la especie que se encuentra en mayor
proporción es la eléctricamente neutra.
Es importante no confundir el punto isoeléctrico con el valor del pK.
− El pK es la inversa de la constante de equilibrio de disociación. Es decir, el valor de
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pH en el cual un determinado grupo ionizable se encuentra 50% ionizado y 50%
neutro (llamamos grupo funcional a un sector específico de la molécula).
− Existe un pK para cada grupo capaz de ceder o aceptar protones.
Cuando este se encuentra desionizado su terminación es “ico” (glutámico) y cuando está
ionizado su terminación es “ato” (glutamato)
Comportamiento anfoterico
El comportamiento anfoterico es el comportamiento de un aminoácido que tienen en
un campo eléctrico según variaciones del pH. Se encuentran cargados eléctricamente.
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Según el medio en el que este se encuentra (sea ácido/básico) genera que el aminoácido
se comporte diferente. Por ejemplo, al L-alanina se ioniza y se comporta como una base,
captando protones y adquiriendo forma catiónica (+1)
Según el medio en el que este se encuentra (sea ácido/básico) genera que el aminoácido
se comporte diferente:
− Medio ácido: el aminoácido dipolar se comportará como una base adquiriendo
protones del medio y optará por tener una forma catiónica de configuración
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más uno. El pH en el cual un aminoácido se encuentra 50% como ion dipolar y un
50% en forma catiónica forma es el pK1 corresponde a 2,34.
− Medio básico (pH alcalino): se va a comportar en un ácido y va a ceder
protones al medio quedan con una carga negativa por lo que se le confiere el
nombre de forma aniónica. El pH en el cual un aminoácido se encuentra 50% como
ion dipolar y un 50% en forma aniónica es el pK2 corresponde a 9,69.
El pH donde toda la molécula tiene carga neutra. PK: El pK es la inversa de la constante
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de equilibrio de disociación. Es decir, el valor de pH en el cual un determinado grupo
ionizable se encuentra 50% ionizado y 50% neutro (llamamos grupo funcional a un sector
específico de la molécula). Existe un pK para cada grupo capaz de ceder o aceptar
protones.
Punto isoelectrico
El punto isoeléctrico es el valor de pH, en el cual una molécula ionizable no se
desplaza, ni hacia el ánodo ni hacia el cátodo, cuando es sometida a una corrida
electroforética. Para todos los aminoácidos (Aa.) se cumple que no se desplazarán
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cuando la sumatoria de “todas” las cargas de la molécula sean cero, formándose una
especie neutra llamada “zwitterión”.
Union peptidica
Es un tipo de unión AMIDA, en la cual se produce la condensación de un carboxilo de uno
de los aminoácidos con el grupo amino del otro aminoácido y perdida de una molécula
de agua.
− Tiene coplanaridad atómica (que los cuatro átomos intervienen
en la formación del enlace peptídico están en un mismo plano)
− Hibridación de resonancia
La hibridación de resonancia es cuando el enlace peptídico por momentos se comporta
como enlace simple y por otros como
ligadura doble. Esto le da características de
rigidez, asi impide la rotación alrededor de
los enlaces carbono-nitrógeno
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La condensación de un ácido carboxílico y un grupo amino con pérdida de una molécula
de agua
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Al ser uniones tipo AMIDA, permite establecer un enlace
entre dos aminoácidos para formar un DIPEPTIDO
El glutatión es un tripéptido de alta importancia biológica
y está formados por tres aminoácidos:
1) Glicina
2) Cisteína
3) Glutamato.
Es importante para la eliminación de radicales libres en la célula
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Para que un ácido o una base débil tengan capacidad de amortiguación de los cambios
en la concentración de H + (pH), deben tener una constante de disociación (pKa)
cercana al pH del medio en el que se encuentran.
Por ejemplo, el aminoácido histidina cuenta con un núcleo imidazol en su cadena lateral
que tiene un pKa cercano a 6,5 y por lo tanto puede contener cambios en la
concentración de H +, aceptando o cediéndolos.
− Unión amida: se forma entre un carboxilo (OH) con el grupo amino (HN),
perdiendo una molécula de agua.
− Coplanaridad atómica: los 4 átomos que intervienen en la formación de un
enlace peptídico (C, O, N, H) se encuentran en un mismo plano.
− Hibridación de resonancia: el enlace peptídico por momentos se comporta como
un enlace simple y por momentos como doble ligadura lo cual le da una
característica de rigidez a molécula proteica, impidiendo la rotación alrededor de
los enlaces de carbono y nitrógeno. Permite que a proteína no adopte cualquier
configuración en el espacio, sino solamente la configuración que le permite la
rigidez de esta doble ligadura.
LA CONFIGURACIÓN TRANS ES LA MAS FAVORECIDA
Se clasifican según polaridad de los grupos R a pH=7
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− No polares:
• Alanina
• Valina
• Leucina
• Isoleucina
• Fenilalanina
• Prolina
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• Triptófano
• Metionina
− Polares sin carga:
• Serina
• Treonina
• Cisteína
• Glicina
• Tirosina
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• Asparagina
• Glutamina
− Polares con carga negativa:
• Aspartato
• Glutamato
− Polares con carga positiva:
• Histidina (es la única capaz de amortiguar el pH en condiciones fisiológicas)
• Arginina
• Lisina
− DIPEPTIDOS, dos aminoácidos. El nombre de dipéptido va en función del cual es el
nombre del aminoácido que tiene el extremo amino terminal que es el primero
de la cadena y cuál es el aminoácido que tiene el extremo carboxilo terminal
que va a ser el 2 de la cadena.
− OLIGOPEPTIDOS (PEPTIDOS), tres a diez aminoácidos
− POLIPEPTIDOS, de 11 a 49 aminoácidos
− PROTEÍNAS, de 50 o más aminoácidos, con un peso molecular de más de 6mil Da
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Peptidos de importancia biologica
− Glutatión
− Angiotensina II
− Vasopresina
− Bradiquinina
− Encefalinas
− Factores liberadores de hormonas
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Propiedades acido-base
Las propiedades ácido-base de cualquier molécula están dadas por la cantidad de
grupos ionizables y por los pK de éstos. En un péptido o una proteína existirá un solo
grupo C terminal y un solo grupo N terminal que estarán libres y por tanto serán
capaces de aceptar o ceder protones. El resto de las interacciones ácido-base serán
determinadas por sus cadenas laterales (R). Es importante destacar que mientras mayor
sea la extensión de la cadena peptídica, menor será la influencia relativa de los grupos
C (carboxilo) y N (amino) terminales.
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Proteínas
Son moléculas versátiles, se clasifican en niveles de organización creciente. Las proteínas
son de alto valor biológico cuando su incorporación a la dieta nos garantiza el aporte
de aminoácidos esenciales y semiesenciales.
Las proteínas de origen animal (carnes, clara de huevo, leche) aportan todos las
aminoácidos esenciales.
− Nutricionales (como la albumina)
− Enzimáticas (catalizadores biológicos)
− Estructurales (proteínas de membrana)
− Metabólicas (como la insulina)
− Contracción muscular (actina/miosina)
− Defensa física e inmunológica (alfa queratina y las inmunoglobulinas)
− Coagulación
− Transporte (transportadoras de hormonas esteroideas)
− Ciclo visual (opsina)
− Protección (alfa queratina)
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− Almacenamiento (ferratina)
Cuando hablamos de la estructura primaria de una proteína, nos referimos a nombre,
número y orden de los aminoácidos que la conforman.
− Está determinada genéticamente
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− Determina el resto de las estructuras
− Los puentes que estabilizan las estructuras son las uniones peptídicas y disulfuro
− El cambio de un solo aminoácido puede alterar la función de la proteína
Por ejemplo, la anemia de las células falciformes:
Una mutación genética hereditaria a nivel de
las cadenas beta que determina el cambio de
aminoácido en cadena beta de hemoglobina
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normal, formando hemoglobina S, esta cuando
se desoxigena tiende a formar precipitados
dentro de los vasos sanguíneos y forman
trombos.
Las proteínas se forman por cadenas lineales
de aminoácidos sin ningún tipo de ramificaciones y que esa secuencia lineal no es al
azar, sino que está determinada en el código genético. Justamente a esa secuencia
lineal de aminoácidos propia de cada proteína es lo que llamamos estructura primaria.
Se refiere al enrollamiento de la cadena polipeptídica alrededor de un eje imaginario
longitudinal. Hay 3 tipos más comunes:
− Alfa-hélice
− Hoja plegada
− Triple hélice del colágeno
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Alfa-helice
Una vuelta completa de alfa-hélice contiene 3.6 residuos de aminoácidos. Los grupos R
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de cada residuo de aminoácido se orientan hacia afuera. La alfa-hélice dextrorrotatoria
es mas estable. Es estabilizada por puentes hidrogeno, entre el oxígeno carbonílico del
enlace peptídico de un residuo aminoacilo y el átomo de hidrogeno del nitrógeno del
enlace situado a 4 residuos de el a lo
largo de la cadena peptídica.
Muchas alfa-hélices tienen grupos
predominantemente hidrofóbicos en un
lado del eje de la hélice y otros
hidrofílicos del lado opuesto. Estas
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hélices anfipáticas están adaptadas
para la formación de interfases entre
regiones polares y no polares, como el
interior hidrofóbico de una proteína en su entorno acuoso.
La hemoglobina presenta 8 segmentos de alfa hélice estabilizados por puente
hidrogeno intracatenarios. En los codos, el enrollamiento es al AZAR, por la aparición de
prolina, que carece de un hidrogeno para formar un puente.
Hoja plegada (beta-conformacion)
Son dos o más cadenas polipeptídicas que pueden ir en paralelo o antiparalelo con los
radicales que se estabiliza hacia arriba generalmente. Los puentes hidrogeno se
establecen entre las distintas cadenas y son INTERCATENARIAS.
Es la forma típica de organización tridimensional de una proteína globular constituida
por una sola cadena polipeptídica. Alterna porciones de hélices alfa, ovillos al azar y
laminas beta, lo que le permite plegarse en su forma característica.
− Las proteínas con conformación globular son solubles en agua y/o en soluciones
salinas.
− Son globulares: las enzimas, las proteínas de membrana y algunas proteínas de
transporte.
− Los fragmentos hidrofóbicos se orientan hacia el interior de la molécula y los
hidrofílicos hacia afuera
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Estructura de la globina
La hemoglobina posee una estructura proteica globular, donde resíduos de aminoácidos
que están alejados en la estructura primaria están cercanos en la terciaria.
Estructura tridimensional de una proteína oligomérica; particularmente el modo cómo
interactúan entre sí las cadenas. Estabilizada por uniones o puentes salinos. Sólo pueden
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presentar estructura cuaternaria las moléculas formadas por dos o más cadenas
pépticas.
Muchas cadenas polipeptídicas se asocian a otras para cumplir sus funciones biológicas
y llamamos estructura cuaternaria de una proteína la configuración espacial
tridimensional que adoptan estas estructuras oligoméricas de dos o más cadenas
polipeptídicas. La estructura cuaternaria es la estructura funcional final de
mayor parte de las proteínas.
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Curvas de disociación
Posee una disposición sigmoidea porque la hemoglobina está formada por 4 cadenas
polipeptídicas entre ellas hay puentes salinos y hay un tiempo en el que pierden esta
estructura. Esta curva nos muestra el p50, el cual nos indica que tan afín es la
hemoglobina al oxígeno, ya que el p50 nos muestra cuando la hemoglobina se satura al
50%. Si el p50 se corre hacia la izquierda significa que es más afín.
Posee una disposición exponencial, ya que la mioglobina está formada por 1 cadena
polipeptídica, con estructura primaria, secundaria, terciaria pero NO cuaternaria, va a
tener más afinidad por el oxígeno, ya que no tiene tantos puentes que romper. Esto
ocurre ya que la mioglobina necesita poseer más afinidad por el oxígeno porque esta se
encuentra en el músculo esquelético y necesita almacenarlo para ser utilizado en
momentos de contracción.
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