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Fitomejoramiento 2

El fitomejoramiento es una ciencia que busca modificar la herencia de las plantas para mejorar su adaptación y rendimiento económico. Utiliza técnicas como la hibridación, selección artificial y biotecnología para desarrollar cultivares más productivos y resistentes a enfermedades. En Colombia, se enfoca en la mejora genética de la palma de aceite para aumentar su producción y calidad en condiciones agroclimáticas específicas.
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Fitomejoramiento 2

El fitomejoramiento es una ciencia que busca modificar la herencia de las plantas para mejorar su adaptación y rendimiento económico. Utiliza técnicas como la hibridación, selección artificial y biotecnología para desarrollar cultivares más productivos y resistentes a enfermedades. En Colombia, se enfoca en la mejora genética de la palma de aceite para aumentar su producción y calidad en condiciones agroclimáticas específicas.
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FITOMEJORAMIENTO

HERNANDO CASTELLANOS
PRECURSORES
• Manuel Torregroza
• Luis Castiblanco
• Alejandro Chaparro
FITOMEJORAMIENTO
Ciencia que basada en conceptos teórico-
prácticos de otras ciencias, tiene como
objetivo modificar y alterar la herencia de las
plantas para lograr tipos mejorados
agronómicamente mejor adaptados y de
mayores rendimientos económicos que los
genotipos nativos.
MECANISMO

Cambio de adaptación por sustitución de


genes bajo selección, seguido de
aislamiento del producto diferenciado. La
hibridación y la poliploidía amplía el
campo para la selección sin modificar el
mecanismo.
OBJETIVOS
• Rendimiento
• Calidad: organolépticos con o sin procesamiento
químico: aceite, azúcar, naturistas
mecánico: fibras
biológico: forrajes
VALOR NUTRITIVO
• Trigo
• Maíz
• Arroz
• Cebada
• Sorgo
• Lisina, triptófano
•C
OBJETIVOS BIOLOGICOS

•Resistencia
•Adaptación
•Tolerancia ambiental
•Mecanización
5-6mil años

•Vestigios lagos suizos


•Ruinas Mesopotamia, Egipto
•Hallazgos islas británicas
SISTEMAS EVOLUTIVOS

•Variación Mendeliana
•Hibridaciones interespecíficas
•Hibridación introgresiva
•Poliploidismo
VARIACION MENDELIANA
• Mutaciones de los genes, las cuales representan
la base de la evolución
• Recombinaciones por hibridaciones de mutantes:
selección natural, artificial
• Acumulación de diversidad genética: origen de
variedades adaptadas a diferentes ecologías,
mutaciones simples favorables (maíz tunicado).
HIBRIDACION INTERESPECIFICA
• Cruce entre especies taxonómicamente diferentes
• En divergencias grandes, los híbridos presentan esterilidad y
deficiencias, pudiendo llegar a incapacidad fisiológica
• Transferencia de caracteres de plantas silvestres a cultivadas
• Aparecen caracteres diferentes a los existentes en las especies
progenitoras
• Especies cultivadas mas importantes
• Un modo de acelerar la evolución para obtener especies de
utilidad.
HIBRIDACION INTROGRESIVA
• Cruces naturales, seguidos por el retrocruzamiento de uno
de los padres con la F1, en tal forma que las
características de una especie pueden transferirse a la
otra, sin perderse la integridad taxonómica de tales
especies.
• Habrá una nueva especie de características definidas,
según el grado de dominancia respectivo.
• La INFILTRACION se presenta en las regiones geográficas
en donde las especies en cuestión crecen entremezcladas.
El mejoramiento genético de
plantas tiene como objetivo
principal mejorar la productividad,
la calidad y la adaptabilidad de las
plantas cultivadas para satisfacer
las necesidades de la agricultura y
la alimentación. También puede
contribuir a la sostenibilidad
agrícola al reducir el uso de
pesticidas y fertilizantes, mejorar la
eficiencia en el uso de recursos y
aumentar la resistencia de las
plantas a las enfermedades y el
cambio climático.
La selección artificial implica
identificar plantas con
características deseables, como
resistencia a enfermedades,
mayor rendimiento o mejor
calidad de los productos, y luego
cruzarlas entre sí para producir
descendencia con esas
características. Este proceso se
repite durante varias
generaciones para obtener
variedades más mejoradas.
La hibridación es otro método
utilizado en el mejoramiento
genético de plantas. Consiste en
cruzar dos plantas de diferentes
variedades o especies para
combinar características
deseables de ambas. Esto puede
dar lugar a plantas híbridas con
características mejoradas, como
mayor resistencia a plagas o
adaptación a diferentes
condiciones ambientales.
La hibridación es otro método
utilizado en el mejoramiento
genético de plantas. Consiste en
cruzar dos plantas de diferentes
variedades o especies para
combinar características
deseables de ambas. Esto puede
dar lugar a plantas híbridas con
características mejoradas, como
mayor resistencia a plagas o
adaptación a diferentes
condiciones ambientales.
La ingeniería genética es una
técnica más reciente que permite
introducir genes específicos de
una especie en el ADN de otra
especie. Esto ha llevado al
desarrollo de plantas
transgénicas, que contienen
genes de otras especies para
conferirles características
deseables, como resistencia a
herbicidas o insectos, mayor
tolerancia a condiciones adversas
o mejor calidad nutricional.
La ingeniería genética es una
técnica más reciente que permite
introducir genes específicos de
una especie en el ADN de otra
especie. Esto ha llevado al
desarrollo de plantas
transgénicas, que contienen
genes de otras especies para
conferirles características
deseables, como resistencia a
herbicidas o insectos, mayor
tolerancia a condiciones adversas
o mejor calidad nutricional.
El mejoramiento genético de plantas tiene como objetivo principal mejorar la productividad, la calidad y la
adaptabilidad de las plantas cultivadas para satisfacer las necesidades de la agricultura y la alimentación.
También puede contribuir a la sostenibilidad agrícola al reducir el uso de pesticidas y fertilizantes, mejorar la
eficiencia en el uso de recursos y aumentar la resistencia de las plantas a las enfermedades y el cambio
climático.
Mejoramiento Genético de la
Palma en Colombia

OBJETIVO GENERAL
Obtener nuevos cultivares de palma de aceite con
elevada producción y calidad de aceite, resistentes a
enfermedades y adaptados a las condiciones
agroclimáticas colombianas a través de herramientas
biotecnológicas y de fitomejoramiento convencional
Esquema general de mejoramiento en Cenipalma

Colecta de recursos Selección de palmas en


genéticos Plantación, por ejemplo,
sobrevivientes a PC
Caracterización molecular, evaluación del
comportamiento agronómico, respuesta
fisiológica, respuesta a enfermedades -PC,
déficit hídrico, etc.
Genotipos
promisorios

Cruzamientos Clonación

Pruebas de progenie
(Comportamiento Evaluación
agronómico), GxA comportamiento
agronómico
Producción de
semillas mejoradas Proceso de Mejoramiento: Fijar
características
1. Mejoramiento Genético:
Recursos Genéticos
Objetivo 1: Establecer, conservar, manejar, caracterizar y evaluar las
colecciones biológicas de E. guineensis y E. oleífera
Camerún y Angola
2001 / 2007 2003 / 2011 2015 / 2025 2019 / 2022

2002 / 2008 2019 / 2022 2017 / 2025


Colecciones biológicas de E. guineensis de Cenipalma
C-48-2
C-56-2
C-07-5 C-72-1
C-56-1 C-48-1C-47-1
C-68-5 C-48-4
C-69-4
C-57-5C-10-1 C-47-2
C-47-3C-46-3
C-57-1 C-68-4 C-56-4
C-56-3 C-48-3 C-46-5
C-46-4 C-53-4
C-57-4 C-68-2
C-57-2 C-68-3
C-68-1 C-48-5 C-53-5
C-46-2
C-30-3
C-30-1 C-56-5 C-53-3
C-30-4 C-54-5
C-53-2
C-29-1 C-25-5
C-10-2 C-30-5
C-11-2 C-46-1 C-53-1
C-54-4
C-54-3 C-49-1
C-49-2
C-54-1 C-49-4
C-10-3 C-54-2 C-49-5

Zona geográfica Entradas


C-10-5 C-49-3
C-44-5
C-44-3 C-10-4 C-51-1
C-58-1
C-58-5 C-16-3 C-51-2
C-58-2 C-62-5 C-44-2
C-58-4 C-60-3
C-58-3 C-60-4
C-51-3 C-60-1
C-24-1 C-62-4C-44-1 C-60-2C-60-5
C-62-2 C-72-2
C-72-4
C-38-4 C-62-1
C-62-3 C-42-2
C-72-5 C-37-3

1. Caixito 9
71 C-72-3
99
86 C-33-5
C-41-2
C-41-3
C-41-4
C-41-1
92 71
59
66
C-37-1
C-37-4
C-37-2
ABONG
C-41-5 78 52 C-19-4
C-38-2C-24-2 76 86 74 C-19-3
C-38-3 93 C-19-1
C-38-1
C-23-1
C-38-5 82 50
66 C-17-5 C-19-2 EDEA

2. Sumbe 9
C-55-1
C-55-3 92 C-16-2 C-16-5
C-55-4 C-55-2
C-55-5 92 85
71
51 C-16-1
C-20-3
C-20-1
OBALA
C-20-4
C-19-5
C-09-3C-09-5
54
EBOLOWA
C-09-1
C-09-2 62 57 C-61-3
C-61-1
C-09-4 68 C-57-3
C-61-2

3. Cabinda 11
C-39-2 89 7288 C-61-5
C-22-1 98
51 58 C-61-4
C-22-2 C-63-2
C-22-4
C-20-5
C-22-5
C-25-1
C-22-3
74
70
66
54
90 C-63-1
C-59-5
BAFANG
81 56 C-59-4
C-59-2
C-64-4
C-64-3 67 74 C-59-3
C-16-4 C-59-1
C-64-5
C-64-1 C-66-4
C-66-3
81 58
68 C-52-3
C-52-2
C-07-4
C-52-4
MANKIN
C-64-2 C-66-5 C-52-1
C-51-4
C-51-5
51 C-50-5 C-52-5

4. Benguela 6
58
63 67 C-50-4
C-36-2 C-50-2
C-50-3
C-66-1 C-65-2
C-66-2 C-43-1 87 C-50-1
C-65-1C-65-5
C-65-3 C-69-3 C-35-3
C-65-4
C-69-1 71 C-35-2
C-35-5
C-43-2 C-12-4C-35-4
C-45-1 C-12-5 C-35-1
C-43-5
C-43-4 70 C-70-1C-12-2
C-43-3
C-39-1 C-14-1
C-76-2
C-73-4
C-26-4 C-73-1 C-12-1
C-73-3

5. Uige 9
C-20-2
C-69-2 C-26-5 C-73-5
C-76-4
C-26-1 C-76-5
C-26-2 C-40-2 C-33-2 C-74-2
C-26-3 C-40-4 C-33-3C-15-2 C-73-2
C-74-3
C-31-4 C-15-5 C-45-5
C-33-1
C-33-4 C-74-5
C-03-2 C-74-1
C-03-5 C-74-4
C-40-1 C-45-3 C-03-3
C-13-4
C-45-4 C-13-5
C-25-4 C-03-4
C-03-1
C-31-5 C-15-3
C-42-3
C-15-1
C-42-4 C-30-2
C-13-2
C-13-3
C-36-1
C-42-5 C-31-1 C-63-5
C-67-3 C-25-2C-34-1C-13-1

Total 44
C-45-2 C-11-1 C-34-4
C-34-3
C-42-1 C-06-2 C-67-5 C-01-5
C-07-2C-67-4 C-02-1 C-05-4C-40-3
C-36-4 C-34-2
C-36-5 C-69-5
C-31-3 C-07-3 C-01-3
C-67-2
C-44-4
C-06-5 C-05-2 C-36-3C-11-4 C-34-5

Angola - 2002
C-76-3 C-06-3 C-01-4
C-37-5 C-25-3
C-17-3
C-17-1C-40-5
C-76-1 C-17-4 C-11-5
C-31-2 C-06-4
C-07-1
C-02-4
C-01-2 C-02-3 C-05-5
C-11-3
C-02-2
C-06-1 C-63-4
C-67-1 C-17-2 C-01-1
C-63-3 C-02-5
C-05-3
C-05-1
C-15-4 C-12-3
0 0.2

Topología basada en el método de agrupamiento Neighbor-joining y el índice de disimilaridad. Incluye las 311 accesiones de
Zona geográfica Entradas E. guineensis de la Colecta de Camerún, las cuales no se observan separadas por su origen geográfico.

Abong-Mbang (A) 16
Edea (B) 8
Obala (C) 4
Ebolowa (D) 14
Bafang (E) 12
Mankim (F) 7
Total 61 Camerún - 2007
Contenidos de aceite y mesocarpio a fruto en Colección
Histograma de MF Biológica de Camerún
Normal

0,07
TF H istograma de A/R
dura
Normal
t enera
0,06
0, 1 2
TF
Media Desv.Est. N
N=787
44,90
en
7,657 1 01 7
dur a

0,05 t ener a
2020
70,06 1 2,24 201 0, 1 0
Media Desv.Est
1 4,79 4,029
D en sidad

0,04
21 ,33 7,21 1
0, 08

D en sidad
0,03
0, 06

0,02
0, 04

0,01
0, 02

0,00
0, 00
25,0 37,5 50,0 62,5 75,0 87,5 1 00,0
5 10 15 20 25 30 35

MF A/R
Se amplió la colección de E. oleifera con accesiones proveniente de diferentes
zonas de las regiones Caribe y Andina de Colombia. COLCIENCIAS 152

Imágenes de los nichos de la especie E. oleifera en


condiciones silvestres

Representación de los grupos que


representan la estructura genética de
la especie E. oleifera en Colombia
Evaluación de las coleciones biológicas de E. guineensis y E. oleifera

Variabilidad para los ácidos grasos saturados – Valor agregado/nuevos usos


Evaluación de las coleciones biológicas de E. guineensis y E. oleifera
Variabilidad de ácidos grasos saturados en el mesocarpio de la palma de aceite.
Híbridos para el mercado de
60 Naranja: Elaeis guineensis
aceites sólidos?
Verde: Elaeis oleifera
Azul: OxG-Coari x La Mé
50

Híbridos para el mercado de


40 aceites líquidos?
% SFA

30

20

10

0
Ácidos grasos híbridos OxG y en diferentes
ecotipos de E. oleifera

A B
Línea roja: referencia de E. guineensis para ácido palmítico
(C16:0) panel A y ácido oleico (C18:1) en el panel B.

Cenipalma 2020-2022: I. Ayala, A. Gonzalez, J.A. García, HM. Romero et al


Mejoramiento
Genético:
Producción de
cultivares
mejorados
Esquema general de mejoramiento en Palma

Colecta de recursos Selección de palmas en


1) genéticos Plantación, por ejemplo,
sobrevivientes a PC
Caracterización molecular, evaluación del
comportamiento agronómico, respuesta
2) fisiológica, respuesta a enfermedades -PC,
déficit hídrico, etc.
Genotipos
3) promisorios

Cruzamientos Clonación
4)

Pruebas de progenie
(Comportamiento Evaluación
5) comportamiento
agronómico), GxA
agronómico
Producción de
6) semillas mejoradas 7) Proceso de Mejoramiento: Fijar
características
Esquema general de mejoramiento en Palma

Colecta de recursos Selección de palmas en


1)
genéticos Plantación, por ejemplo,
sobrevivientes a PC
Caracterización molecular, evaluación del
comportamiento agronómico, respuesta
2)
fisiológica, respuesta a enfermedades -PC,
déficit hídrico, etc.
Genotipos
3)
promisorios

4) Cruzamientos Clonación
Datos confiables
para producción de Pruebas de progenie
5) (Comportamiento Evaluación
semillas: 2030-2032
agronómico), GxA comportamiento
agronómico
Producción de
6) semillas mejoradas 7) Proceso de Mejoramiento: Fijar
características
Pruebas de evaluación agronómica (PEA) de Cenipalma

1. PEA-1: Cultivares tenera de bajo porte (reducido


crecimiento del estípite) y alta producción de aceite
(alto RFF y altas producciones de aceite)

2. PEA-2: Clones con posible resistencia a la PC.

3. PEA-3: Cultivares OxG con alta producción de racimos


de fruta fresca, cantidad y calidad de aceite.

4. PEA-4: Cultivares tenera con posible resistencia a la


PC .
Pruebas de evaluación agronómica (PEA) de Cenipalma

• PEA: Diferentes localidades de evaluación para


identificar los mejores cultivares en cada una de las
Zona Agroecológicas (Genotipo x Ambiente)

• ICA: Registro de los mejores cultivares / localidad


PEA-1: Cultivares tenera de bajo porte (reducido crecimiento del estípite) y
alta producción de aceite (alto RFF y altas producciones de aceite)

PEA -> 2022-2023 a 2032-2033

0.70 m año-1 0.30 m año-1

28
Parentales PEA 1- Palmas de lento crecimiento

➢ Promedio población: 0,39 m año-1.


➢ El incremento anual de altura varió
entre 0,29 m año-1 (P6) y 0.47 m
año-1 (P1).

El punto rojo corresponde a la media general de las progenies o cultivares y la línea horizontal a la mediana. DxA: Deli x AVROS, DxL: Dele x La Mé y DxY:
Deli x Yangambi.

+ Otros
29 rasgos de interés, tasas de extracción de aceite, RFF, OER 29
Valor de selección para madres tipo dura de Valor de selección para madres tipo dura de
FFB 200 kg por palma-1. BNO 15 racimos por palma-1.

30 30
Pruebas de evaluación agronómica (PEA) de Cenipalma

1. PEA-1: Cultivares tenera de bajo porte (reducido crecimiento del


estípite) y alta producción de aceite (alto RFF y altas
producciones de aceite)

2. PEA-2: Clones con posible resistencia a la PC.

3. PEA-3: Cultivares OxG con alta producción de racimos de fruta


fresca, cantidad y calidad de aceite.

4. PEA-4: Cultivares tenera con posible resistencia a la PC .


PEA 2. Clones con posible resistencia a la PC

Objetivo:
Producir material clonal con resistencia a la pudrición de
cogollo (PC), con características agronómicas sobresaliente
como alta producción de aceite (alto RFF y altas producciones
de aceite) y evaluados en diferentes zonas palmeras
Palmas introducidas al proceso de clonación con interés para la palmicultura nacional

➢ Reclones Sobrevivientes Zona Central y Zona Suroccidental


Comportamiento de los clones en Tumaco
INCIDENCIA ACUMULADA
80

73,3
70

60

50
%

40 39,3

32,5
30

20 20,0
17,1
12,3 Clones
10
7,7 para
4,6
0 PEAs
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
Mes

O_34 O_36 O_28 O_33 O_35 Angola - Resistente Angola- Intermedio Angola-Susceptible
APROBACIÓN PRODUCCIÓN DE CLONES - ICA
Pruebas de evaluación agronómica (PEA) de Cenipalma

1. PEA-1: Cultivares tenera de bajo porte (reducido


crecimiento del estípite) y alta producción de aceite
(alto RFF y altas producciones de aceite)

2. PEA-2:Clones con posible resistencia a la PC.

3. PEA-3: Cultivares OxG con alta producción de racimos


de fruta fresca, cantidad y calidad de aceite.

4. PEA-4:Cultivares tenera con posible resistencia a la


PC .
PEA 3. Cultivares OxG con alta producción de racimos de fruta
fresca y altas tasas de extracción

O x G

A B
1. Clasificación por el número de racimos

25
Categoría 1
Fértiles: Medianamente fértiles: Infertile
20 fruit set superior al 60% y un fruit set entre el 20% y el 60% y fruit set

Número de racimos (NR)


PMR mayor a 10 kg. Categoría 2 un PMR mayor a 10 kg. PMR me
15

10 Categoría 3

P11
P13
P15
P17
P19
P21
P23
P25
P27
P29
P31
P33
P35
P37
P39
P41
P43
P45
P47
P49
P51
P53
P55
P57
P59
P61
P63
P1
P3
P5
P7
P9
Categoría 1: palmas que producen mas de 15 racimos al año (19).
Categoría 2: palmas que producen entre 12 y 15 racimos al año (8).
Categoría 3: palmas que producen menos de 12 racimos al año (37)
Métodos de mejoramiento en Palma de Aceite
Selección Recurrente Recíproca - SRR

Donde vamos:
2022 y 2023, semillas para PEA y
cruzamientos para nuevos ciclos y
futura producción de semillas
(incremento de posibles madres)

Datos confiables para


producción de semillas:
2030-2032

Tomado de Rajanaidu, 2015


- 2021
Búsqueda de fuentes de resistencia a la pudrición del cogollo en la colección
biológica de Elaeis guineensis Jacq. proveniente de Angola (Angola x Tester).
Meta: Progenies tenera con Resistencia a la PC

Resistente (R):
247 progenies
• Altamente R
Angola x tester
• R intermedia
Zona
Susceptible
geográfica Familias
(No resistente)
1. Caixito 9
2. Sumbe 9 Inmune
3. Cabinda 11
4. Benguela 6 International Seed
Federation (ISF)
5. Uige 9
2017-2020 Total 44
Búsqueda de fuentes de resistencia a la pudrición Mortalidad - Resultados Angola x
del cogollo en Elaeis guineensis Jacq. tester 2020

Identificación de
genotipos
resistentes

Angola x tester

Selección parentales

Pruebas de progenie

Adaptado de Durand-Gasselin, Findings and advances on Ganoderma in oil palm. 2015

Modificado de: Poland, J. 2014. Genomics Assisted Breeding and Field-Based


High Throughput Phenotyping. DOE ARPA-E – Advanced Plant Phenotyping
Workshop
Búsqueda de fuentes de resistencia a la pudrición del cogollo en la colección biológica de
Elaeis guineensis Jacq. proveniente de Angola (Angola x Tester).
100
90
80
36 meses de evaluaciones (2018-2020)
70
% Incidencia

60
50
40
30
Parentales seleccionados para los
20
parentales de las PEAs de PC
10
0
Progenies Angola x tester

C1: 0 - 25% C2: 26% - 50% C3: 51% - 75% C4: 76% - 100%
Selección de progenies: Baja incidencia/palmas erradicadas
para seleccionar parentales PEAs
Búsqueda de fuentes de resistencia a la pudrición del cogollo en
Elaeis guineensis Jacq. Variables epidemiológicas - AUDPC.

Tomado de Cruz Lab, Purdue University


Riesgos de no hacer PEAS

• No seleccionar las mejores progenies


para semilla comercial. Riesgos en la
productividad del cultivo

• Progenies con anormalidades o altas


susceptibilidades a factores bióticos o
abióticos, ejemplo “Plumero” (Eg),
pudrición de bases peciolares,
amarillamientos y baja producción de
RFF (Ejm Taisha x AVROS, y otros),
secamientos (Ejm Uwemyces eladeis)
Riesgos de no hacer PEAS
Pruebas de evaluación agronómica (PEA) entregadas en 2022

ZONA PLANTACIÓN Porte Bajo (PEA 1) Clones (PEA2) Híbridos (PEA 3) PC (PEA 4)
Tequendama PEA PEA PDO PEA
NORTE
Se han entregado dos tipos
El Roble PEA PEA PDO PEA
Sicarare PEA
de pruebas:
Monterrey PDO PDO
Yuma PEA PEA PEA 1. Pruebas de evaluación
CENTRAL Agrícola del
Norte PEA
agronómica - PEA con
PalNorte PDO PDO fines de registro ICA.
San Marcos PEA PEA PEA 2. Parcelas de observación
Palmasol PEA PEA PEA PEA (PDO) para seguimiento por
Sillatava PDO PDO parte de la plantación y
ORIENTAL
Manuelita PEA* acompañamiento de
Sapuga PDO PDO Cenipalma
La Estretta PDO
*Esta PEA fue establecida en campo en 2022
Pruebas de evaluación agronómica (PEA) entregadas en 2022

Prueba de
Parcela de
Evaluación
Prueba observación -
Agronómica -
PDO
PEA
Enanas 7 4
Clones 6 -
OxG 1 3
PC 5 4

Las PEAs y PDO restantes están siendo


entregadas en la vigencia 2023
PEAs futuras
Pruebas de evaluación agronómica (PEA) futuras de Cenipalma

1. PEA-5: Cultivares con posible tolerancia al


déficit hídrico (DH).
2. PEA-6: Cultivares con un alto uso
eficiente de nutrientes (UEN)
3. PEA-7: Cultivares OxG: Fase 2
4. PEA-8: Cultivares tenera con posible
resistencia a la PC: Fase 2
PEA-5: Cultivares con posible tolerancia al déficit hídrico (DH)
Colecta de recursos Selección de palmas en
1) genéticos Plantación, por ejemplo,
sobrevivientes a PC
Caracterización molecular, evaluación del
comportamiento agronómico, respuesta
2014- fisiológica, UEN, respuesta a enfermedades
2)
2023… -PC, déficit hídrico, etc.
Genotipos
3) promisorios

Cruzamientos Clonación
-2023-2024 4)

Pruebas de progenie
(Comportamiento Evaluación
-2024-2035 5) comportamiento
agronómico), GxA
agronómico
Producción de
6) semillas mejoradas 7) Proceso de Mejoramiento: Fijar
características
Tamizaje en condiciones de umbráculo para el DH

Recepción de semillas Siembra en camas de arena plántulas para trasplante


BBCH 04 BBCH 102

Trasplante en contenedores plásticos,


Evaluación de variables diagnósticas Capacidad de campo y DH (-1MPa)
8 semanas en capacidad de campo
Mejoramiento enfocado al
déficit hídrico: Selección
temprana por respuesta
fisiológica
,
Fotosíntesis Z_score

• Selección de
parentales por su
posible tolerancia al
DH
• Selección basada
por sus variables
diagnósticas.

Fotosíntesis Z_score
Años de DH
Mejoramiento enfocado al déficit hídrico: Selección Número de racimos en la colección Angola - FIPS
de parentales en las colecciones biológicas. Reducciones entre el 15 y 25%
25
6 YAP 7 YAP 8 YAP 9 YAP 10 YAP 11 YAP 12 YAP
Rank FAM BLUP_NR FAM BLUP_NR FAM BLUP_NR FAM BLUP_NR FAM BLUP_NR FAM BLUP_NR FAM BLUP_NR
20 1 5-10 23.7 5-9 21.1 3-10 15.8 3-10 16.3 3-10 15.9 3-10 12.9 5-9 14.3
Número de racimos

2 3-10 22.8 3-10 20.7 5-9 15.4 5-9 15.8 3-3 15.2 3-3 12.1 3-10 13.7
15 3 3-1 21.9 3-11 20.2 5-10 15.2 3-3 14.9 5-9 14.8 2-3 11.7 1-9 13.6
4 3-11 21.9 3-1 20.1 3-3 15.1 5-10 14.7 1-4 14.1 5-9 11.3 3-3 13.0
10 5 5-8 21.8 3-3 19.6 5-3 14.8 3-11 14.3 3-1 13.9 3-8 11.1 5-10 12.5
6 1-9 21.7 1-9 19.4 3-8 14.5 3-8 14.2 1-9 13.6 3-4 11.1 1-8 12.0
7 5-9 21.6 5-8 19.0 5-8 14.0 5-8 14.2 3-4 13.4 5-10 10.9 3-8 12.0
5
8 3-3 21.5 3-8 18.8 3-11 13.9 5-3 13.9 5-10 13.3 5-3 10.8 3-11 11.9
9 2-2 20.7 5-10 18.7 3-1 13.9 1-8 13.8 3-11 13.3 3-9 10.5 5-8 11.5
0 10 3-8 20.7 3-4 18.3 5-6 13.6 5-4 13.5 3-8 13.0 2-6 10.4 2-3 11.5
T1 (CC) T2 (75% CC) T3 (50% CC) T4 (25% CC) 11 3-4 20.6 2-3 18.1 1-8 13.6 3-4 13.5 5-3 13.0 1-9 10.3 5-3 11.3
12 5-3 20.6 1-8 18.1 1-9 13.0 3-1 13.2 3-9 12.9 2-2 10.2 2-2 10.9
No. Infl. Femen No. Infl. Masc No. Abortos
13 1-8 20.5 5-3 17.3 1-4 12.9 1-4 13.0 5-4 12.8 3-1 10.2 3-4 10.9
T. Delgado; G. Ladino; N. Arias; A. Rincón; J. Jimenez; A. Zapata 14 1-2 20.3 2-2 17.0 5-4 12.8 2-2 12.9 1-8 12.6 3-11 9.8 4-4 10.8
15 3-9 20.1 1-4 17.0 3-4 12.6 1-9 12.8 2-2 12.6 1-4 9.6 5-7 10.7
30
16 5-1 19.9 5-1 16.9 5-7 12.5 2-6 12.3 5-7 12.6 4-4 9.5 2-8 10.7
Número de racimos palma año-1

17 1-4 19.9 4-4 16.9 5-1 12.5 5-2 12.3 1-3 12.4 1-6 9.5 5-4 10.6
25 18 1-7 19.8 3-9 16.8 2-2 12.5 5-7 12.0 5-8 12.4 4-2 9.5 1-4 10.5
19 1-3 19.4 5-2 16.8 2-6 12.4 3-9 11.7 1-7 12.2 5-7 9.4 3-1 10.3
20 2-6 19.3 1-6 16.5 5-2 12.2 4-4 11.6 1-6 11.9 1-2 9.3 5-2 10.0
20 21 5-7 19.3 5-7 16.5 2-3 12.0 1-3 11.5 2-9 11.8 1-5 9.3 5-1 10.0
22 5-2 18.8 2-6 16.3 4-4 11.8 1-7 11.5 5-2 11.8 4-5 9.3 5-6 9.9
23 2-5 18.7 5-4 16.3 2-9 11.8 5-1 11.5 2-6 11.7 5-2 9.2 3-9 9.9
15 CV calculado 24 4-4 18.6 5-6 15.7 3-9 11.7 4-5 11.0 4-1 11.7 1-1 9.1 2-6 9.8
25 2-3 18.6 2-1 15.5 4-6 11.6 2-3 10.9 2-3 11.6 1-3 9.1 2-5 9.8
10 para los años 26 5-4 18.5 1-7 15.4 1-6 11.4 4-2 10.9 1-2 11.5 5-1 9.0 1-2 9.8
27 1-5 18.1 1-2 15.3 4-5 11.3 1-6 10.8 4-5 11.3 3-6 8.9 1-5 9.8
2009-2017 28 3-6 17.4 3-7 14.9 1-5 11.2 1-2 10.8 4-4 11.3 1-7 8.9 3-6 9.7
5 29 4-2 17.3 4-2 14.8 1-7 11.2 4-1 10.8 5-1 11.2 2-8 8.9 1-7 9.6
30 2-1 17.3 4-5 14.6 1-3 11.1 4-6 10.7 3-7 11.2 2-1 8.8 4-2 9.5
31 5-6 17.3 2-9 14.4 1-2 11.0 5-6 10.6 4-2 11.1 5-8 8.7 4-5 9.3
0 32 2-9 17.1 4-1 13.8 3-7 11.0 1-5 10.4 4-3 11.1 5-4 8.5 2-1 9.2
0 20 40 60 80 100 33 4-1 17.0 3-6 13.8 2-1 10.8 2-5 10.4 2-4 10.8 1-8 8.5 1-3 9.1
Coeficiente de variación (%) 34 4-3 16.9 2-5 13.8 3-6 10.7 2-4 10.0 3-6 10.7 2-4 8.5 3-7 9.1
35 3-7 16.9 1-5 13.6 4-1 10.7 2-8 9.9 4-6 10.6 3-2 8.4 4-3 8.9
36 1-6 16.7 4-6 13.5 2-5 10.6 2-7 9.8 1-1 10.6 4-1 8.4 1-6 8.8
37 4-6 16.4 1-3 13.5 4-2 10.5 1-1 9.7 2-5 10.4 2-5 8.3 4-6 8.8
38 4-5 16.3 2-8 13.5 2-4 10.4 3-7 9.5 2-8 10.4 2-7 8.3 2-9 8.7
PEA-5: Cultivares con posible tolerancia al
déficit hídrico (DH)
Pisiferas de Cenipalma
45 Conclusiones y perspectivas
40
35
➢ Se identificaron familias para generar progenies
DxP para la tolerancia al déficit hídrico (DH) a
30
RFF ha año-1

partir de parámetros fisiológicos y respuesta en


25 campo de los parentales (GxA).
20
15 ➢ Durante el 2023 se iniciará el plan de
cruzamientos de progenies DxP para DH, que
10
deben ser evaluadas en casa de malla y en
5 campo.
0
0 5 10 15 20 25
Número de racimos
Línea de tiempo PEA 5: Cultivares tolerantes al DH
Evaluación casa
de malla y
2014-2023…
colecciones

Cruzamientos 2023-2024
PEA-DH

PEA-DH en diferentes 2024-2035


ambientes (GxA)

Incremento de parentales (clones y/o


2030-2035
autofecundaciones), jardín semillero:
Requerimientos de terreno en campos

Producción comercial de semilla 2035…


Pruebas de evaluación agronómica (PEA) futuras de Cenipalma

1. PEA-5: Cultivares con posible tolerancia al


déficit hídrico (DH).
2. PEA-6: Cultivares con un alto uso
eficiente de nutrientes (UEN)
3. PEA-7: Cultivares OxG: Fase 2
4. PEA-8: Cultivares tenera con posible
resistencia a la PC: Fase 2
PEA-6: Cultivares con un alto uso eficiente de nutrientes (UEN)

2
Dos comportamientos en el
1 mejoramiento para incrementar el
uso eficiente de Nutrientes
(UEN):

1. Con menos fertilizantes


producir la misma cantidad
2. A mayor fertilizante, mayor es
la producción

Published in Botany 88:103-109.


DOI: 10.1139/B09-111
Tamizaje en condiciones de umbráculo evaluación de UEN

Recepción de semillas Siembra en camas de arena plántulas para trasplante


BBCH 04 BBCH 102

Evaluación de variables diagnósticas Aplicación de tratamientos


N-P-K-Mg
Trasplante en contenedores plásticos,
Evaluación UEN umbráculo -TAPACC

CODAZZI – MOTILONIA
Línea de tiempo PEA 6: Cultivares con alto UEN
Evaluación casa
de malla UEN
2022-2025…

Identificación de genotipos y 2026-2027


Cruzamientos PEA-DH

PEA-UEN en diferentes 2028-2039


ambientes (GxA)

Incremento de parentales (clones y/o


2033-2039
autofecundaciones), jardín semillero:
Requerimientos de terreno en campos

Producción comercial de semilla 2039…


Pruebas de evaluación agronómica (PEA) futuras de Cenipalma

1. PEA-5: Cultivares con posible PEA 7: OxG con mayor


tolerancia al déficit hídrico (DH).
resistencia a la PC
2. PEA-6: Cultivares con un alto uso donde los dos
eficiente de nutrientes (UEN)
parentales aportan
3. PEA-7: Cultivares OxG: Fase 2
una resistencia aditiva.
4. PEA-8: Cultivares tenera con
posible resistencia a la PC: Fase 2
PEA-8: Fase 2 de
nuevos cultivares
tenera con resistencia
a la PC
Uso de herramientas
genómicas para la
Selección de Plantas Élite
Búsqueda de Marcadores para Selección de Plantas Élite - PC

76 palmas:
680 Palmas - • Clones R y S
242 madres Angola
Angola x tester – • OxG R y S
en el CEPV
en TUMACO • DxD R y S
Zona • CIRAD comercial – R?
geográfica Familias
1. Caixito 9
2. Sumbe
Variables:
9
• Incidencia
3. Cabinda 11
• Erradicaciones (mortalidad)
4. Benguela 6
• Tasa de recuperación
5. Uige 9
• Cat: 1-4, donde 1: 0%-25%, 2:
Total 44
21%-50%, 3: 51%-75% y 4:
76%-100% de la incidencia
242 progenies Angola x tester
Análisis Búsqueda de Marcadores para Selección de Plantas Élite - PC
de Expresión
Diferencial: Genes
Genotipos KASP
Importantes Matriz de
contrastantes 1000 muestras
para resistencia genotipaje
1505 SNPs
en Palma a PC

QC
Datos
Genes GWAS Filtro Alelos
Filtrados
Significativos FarmCPU Maf > 5%
1066 SNPs
Datos > 70 %

Contrastación Fenotipo muestras


Incidencia Fenotipaje de
Erradicación las muestras
PC sin progreso
OPGP AUDPC
Anotación genes Letalidad
Librerías SSH
Gran número de Variantes significativas fueron detectadas.
Resultados GWAS PC - 2020 En proceso: determinar los materiales que tienen la variante de
interés para resistencia usando los mismos datos del
Análisis de Fenotipos
experimento y proceder a diseñar un SNP array para hacer al
MAS en campo para el plan de mejoramiento.

Distribución Incidencia
Q-Q plot Incidencia
Uso de herramientas genómicas para el
mejoramiento y manejo de las colecciones
genéticas.

1. GWAS: Mapeo por asociación


2. GS: Selección Genómica

https://www.plantbreeding.iastate.edu/project/turbocharging-gene-banks-through-genomic-selection
Resultados: Evaluación de las coleciones biológicas de E. guineensis:
Indentificación de genes asociados con rasgos de interés a través de “mapeo
de desequilibrio de ligamiento” o GWAS

GBS de 1000 accesiones de E. guineensis

GWAS - Gapit

Ejm: Incremento Altura Altamente heredable


Posibles SNPs asociados a el carácter de interés – h2= 0.6-0.8, Corley, 2005
meta MAS
QC - Filtro Alelos
Variabilidad GBS Variant Calling
maf > 5%
Colección de 1008 muestras DeepVariant
Datos > 70 %
Palmas 758.591 SNPs NGSEP
Bialélicos
Cenipalma GATK
Conteo mayor a 3

Regiones GWAS
Genes en Datos Filtrados
Significativas FarmCPU
LD FDR < 10% 63.590
20Kb

Altura Todos Exploratorio


Altura sin Bogor y Camerún PCAs
Contrastación Altura ajustada MDS
Anotación
IBS

OPGP Fenotipo de las


Anotación genes muestras
Librerías SSH
• Selección genómica (GS)
Breeding value -> valor de mejoramiento, de cría o
mérito genético) yi =  1n + G j +  ij
Genotypic Breeding Value (GEBV) p
yi =  1n +  xij  j +  i
Additive j =1
effect marker
of SNPs Effect of allele, effect
chromosome,
-- linearity haplotype,etc.

Bernardo and Yu (2007)


• Selección genómica (GS)

Para probar el modelo se realizaron diferentes pruebas de


predicción de acuerdo a n de la muestra:
N= 1003 muestras y 68953 marcadores GBS
• Selección genómica (GS) para optimizar los
procesos de mejoramiento genético en palma de
aceite
Iván Ayala, David Botero, Juan Malagón, Carmenza Montoya, Diego Jarquin, Hernán Romero

500
Esquemas de genotipos

validación cruzada
(CV) para selección
genómica
500
genotipos
2022
Resultados: Alta precisión genómica (pred vs obs) a través
de diferentes escenarios de validación cruzada en
genotipos contrastantes de palma de aceite
Beta- Beta- Alpha- Alpha- Beta-
Cross validation ALT NR PMR RFF Vit A Vit E Tocopherol Tocotrienol Tocopherol caroteno C 16:0 C18:1 C18:2 IY
caroteno
10% Training 0,26 0,39 0,41 0,31 0,34 0,24 0,04 0,20 0,15 0,26 0,36 0,16 0,22 0,16 0,09
20% Training 0,39 0,50 0,50 0,43 0,46 0,29 0,02 0,24 0,18 0,36 0,48 0,27 0,28 0,21 0,17
30% Training 0,46 0,59 0,57 0,49 0,54 0,37 0,17 0,30 0,23 0,43 0,56 0,31 0,31 0,25 0,22
40% Training 0,50 0,65 0,61 0,54 0,55 0,39 0,21 0,33 0,24 0,44 0,58 0,33 0,34 0,26 0,26
50% Training 0,54 0,69 0,63 0,56 0,57 0,40 0,21 0,36 0,24 0,46 0,59 0,37 0,35 0,28 0,25
60% Training 0,56 0,70 0,65 0,58 0,58 0,43 0,21 0,38 0,27 0,47 0,60 0,38 0,37 0,27 0,28
70% Training 0,58 0,72 0,66 0,59 0,58 0,43 0,26 0,39 0,26 0,48 0,61 0,39 0,38 0,30 0,29
80% Training 0,59 0,74 0,67 0,60 0,60 0,44 0,35 0,40 0,28 0,49 0,62 0,40 0,40 0,31 0,30
90% Training 0,61 0,75 0,68 0,61 0,61 0,45 0,36 0,41 0,29 0,51 0,63 0,41 0,40 0,32 0,32
100% Training 0,62 0,75 0,69 0,62 0,61 0,46 0,34 0,42 0,29 0,51 0,64 0,41 0,41 0,33 0,33

Es posible reducir la población de entrenamiento hasta en un


20% de la población total sin sacrificar drásticamente los
valores de predicción
Conclusiones
Breeding equation
Can be
r (u , uˆ ) u i
Genetic gain: G = modified
I
by GS
Annual Accuracy Generation Genetic Selection
progress Interval standard Intensity
deviation

La predicción genómica (GS) tiene un potencial enorme en


mejorar la ganancia genética en cultivos:
1. Reduciendo los tiempos en los ciclos de mejoramiento
2. Incrementando la intensidad de selección
3. Capturando la variación dentro de las familias
Heslot, N., Jannink, J.-L., Sorrells, M. E. (2015). Perspectives for genomic selection applications and research in
plants. Crop Sci. 55, 1–12. doi: 10.2135/cropsci2014.03.0249
Aplicaciones de selección genómica (GS) para el futuro cercano en palma de aceite
Mean cycle 0

Frequency
Palmas elite seleccionadas para cruces para
evitar al menos un ciclo de mejoramiento

Predicciones del GEBV: 20-60% in GS: -> Dependientes del caracter


de estudio
Mean cycle 1
Plantas seleccionadas en
Vivero para la siembra

Frequency
mediante GS.

• Reducción de ciclos de
mejoramiento

• Mejora el manejo de Mean cycle 1´

las colecciones? Ganancia genética adicional?


Frequency
Colecciones núcleo
basadas en selección
genómica
31
33
RFF 31
33
30 35 40 30 35 40
27 32 37
30%
27 32 37
26 31 36 26 31 36
24 29 34 39 44 24 29 34 39 44
25 30 35 40 45 25 30 35 40 45
23 28 33 38 43 23 28 33 38 43
16 21 26 31 36 41 46 16 21 26 31 36 41 46
17 22 27 32 37 42 47 17 22 27 32 37 42 47
20 25 30 35 40 45 50
20 25 30 35 40 45 50
14 19 24 29 34 39 44 49 54
14 19 24 29 34 39 44 49 54
12 17 22 27 32 37 42 47 52
12 17 22 27 32 37 42 47 52
10 a 15 16-20 21-25 26-30 31-35 36-40 41-45 45-50 51-55
10 a 15 16-20 21-25 26-30 31-35 36-40 41-45 45-50 51-55
42,7 t RFF ha/año
33 t RFF ha/año
33 t RFF ha/año

Diferencia en RFF Promedio % Precisión genómica Ponderación


Prom seleccionadas 42,7 0,3 12,8
r=0,25 2,4
Prom poblacion 33 0,7 23,1
r=0,30 2,9
Promedio esperado
población: Aumento entre 35,9 t RFF ha /
un 7 y 9% adicional en RFF año vs 33 t
Metodologías de selección
de materiales resistentes
de palma a la PC
Metodologías de selección de
materiales resistentes de palma a la PC
Conocer fuentes de resistencia a PC a
través de mecanismos moleculares entre
palma de aceite y P. palmivora.

Metodología de laboratorio para


seleccionar materiales

En el futuro: Edición de genes de


resistencia/susceptibilidad en materiales
de palma de aceite → Mejoramiento
genético.
Diversidad genética con genomas de aislamientos de P. palmivora

Dendograma de distancias genéticas de 14 aislamientos de P. palmivora

Dendograma de distancias genéticas de 12 aislamientos de P. palmivora


Relaciones evolutivas de P. palmivora basada en factores de
patogenicidad

Variación
Relación filogenética de intraespecifica P.
P. palmivora de palma palmivora de
de aceite de Colombia Colombia vs
Malasia-Indonesia-
vs P. palmivora de
Korea del Sur.
otros hospederos con
marcador PhHPAV
(Avr4 (PiAvr4) de P.
infestans)
Colección de P. palmivora
cenipalma evaluada con
marcador PhHPAV

Separación de
aislamientos de P.
Relación filogenética de P. palmivora de Colombia
palmivora de palma de aceite vs Malasia – Indonesia
de Colombia - Corea del Sur.
vs
P. palmivora de otros
hospederos con marcador
PhHPAV (Avr4 (PiAvr4) de P.
infestans)
Aislamientos P.
palmivora colección
Cenipalma
Perspectivas
Secuenciar los fectores en aislamientos de P. palmivora de la coleccion de
Cenipalma.

Caracterizar la diversidad de 27 aislamientos de P. palmivora (Genomas) a


partir de efectores.

Desarrollar marcadores que permita diferenciar aislamientos a nivel de


patogenicidad.
Catálogo de genes
validados por
su importancia en la
interacción planta-
patógeno.
Identificación y validación de genes de P. palmivora involucrados en la
interacción con Elaeis guineensis
2017-2019

Inoculación
P.palmivora
PCZC145

2017-
24,72 y 120h Genoma de palma versión 1
2019
2020-2022
2020-
Genoma de palma versión 2
2022

Selección de
genes asociados
a efectores
Validación de genes por
qRT-PCR
Interacción planta-patógeno: Genes de P. palmivora

http://apoplastp.csiro.au/
Categoría GEN ID
Hidrolasas PpalZC01_tig00001434_17240
Enzimas
PpalZC01_tig00000164_02111
degradadoras de
PpalZC01_tig00002102_25153
pared celular
Para-nitrobenzyl esterase PpalZC01_tig00000064_00541

Elicitinas PpalZC01_tig00001406_17013
PpalZC01_tig00002139_26439
Proteínas
Transglutaminasa PpalZC01_tig00002179_27211 inductoras de
defensa en plantas
Genes efectores Dominios de unión a celulosa PpalZC01_tig00001978_20964

de P.palmivora Proteínas inductoras de necrosis (NLP) PpalZC01_tig00001406_17027

seleccionados Inhibidoras de proteinasas PpalZC01_tig00000783_10459

PpalZC01_tig00000242_03280

Peptidasas Papaína PpalZC01_tig00001962_20248


PpalZC01_tig00001073_13846

Fosfatasa PpalZC01_tig00002013_22128

Proteinasas serina PpalZC01_tig00002015_22246

Pectinesterasas PpalZC01_tig00002180_27412

Proteínas Hipotéticas PpalZC01_tig00002763_42119


PpalZC01_tig00002349_32280
Regulación de
PpalZC01_tig00002656_40028
Fosfato diquinasa 1 esporulación
Genes degradadores de pared celular vegetal
Hydrolase family 17 (GH17)
1,5 5
4

qRT-PCR

RNAseq
1 3
0,5 2
1
0 0
Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57
24h 24h 72h 72h 120h 120h

FC qRT-PCR FC RNAseq

Hydrolase family 6 _02111 (GH6)


2 8

FC RNAseq
1,5 6

FC qRT-PCR
1 4
0,5 2
0 0
Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57
24h 72h 120h

Para-nitrobenzyl esterase (CE10)


0,6 10
0,5 8

FC qRT-PCR

FC RNAseq
0,4
6
0,3
4
0,2
0,1 2
0 0
Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57
Clon 34→Resistente 24h 72h 120h
Clon 57→Susceptible
Genes inductores de defensa en planta
Elicitina_26439 (ELI26)
2 10
1,5 8

FC qRT-PCR
6

FC RNAseq
1
4
0,5 2
0 0
Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57
24h 24h 72h 72h 120h 120h

qRT-PCR RNAseq

0,6
Elicitina_17013 (ELI17) 8
0,5
6

FC RNAseq
0,4

FC qRT-PCR
0,3 4
0,2
2
0,1
0 0
Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57
24h 24h 72h 72h 120h 120h

1,5
Transglutaminasa (TG1) 6

FC qRT-PCR
1 4

FC RNAseq
0,5 2

0 0
Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57 Clon 34 Clon 57
24h 24h 72h 72h 120h 120h
qRT-PCR RNAseq
Clon 34→Resistente
Clon 57→Susceptible
Conclusiones
• Los genes validados son de importancia para las etapas tempranas del proceso de infección de P.palmivora.

• Algunos de los genes codifican para hidrolasas degradadoras de pared celular y proteínas inductoras de
sistema de defensa de la planta, y su expresión varía dependiendo del hospedero.

Perspectivas
• Continuar con la validación por PCR en tiempo real de genes.
• Validación funcional de genes mediate técnicas de edición (CRISPR/Cas).
Evaluación de genotipos de
E. guineensis mediante
inoculaciones con P. palmivora
transformada genéticamente
2021

Evaluación de dos progenies contrastantes

Desde las 48 hpi se evidencian diferencias significativas entre


progenies de E. guineensis
Microscopía de Evaluación de genotipos contrastante de E.
fluorescencia
T inción con Yoduro de propidio guineensis mediante fluorescencia de P. palmivora

Necrosis

Cuantificación del área de


fluorescencia GFP y IP

DeDefolíolos
folíolosseC/hpi se
tomaron
tomaron a la 5longitud
fotos al de
azar
Gota inoculación

fotos la
Longitud de por cada
zona zona. Se
de lesión.
lesión
toman fotografías con 32
filtros.

Comparación de
Avance de lesión
genotipos.
Microscopía de
fluorescencia Proceso de infección de genotipos contrastantes de E.
guineensis
GFP IP

28-Clon 30-DxD 33-Clon 28-Clon 30-DxD 33-Clon

34-Clon 36-DxD 34-Clon 36-Clon 36-DxD


36-Clon

40-Clon 48-DxD 82-DxD 40-Clon 48-DxD 82-DxD

¿Se evidencian diferencias en la


fluorescencia entre genotipos evaluados?
Microscopía de Evaluación de genotipos contrastante de E.
fluorescencia
guineensis mediante fluorescencia

Se evidencian genotipos con diferencias en


el tamaño de lesión
-S:28C,30D,33C,34C,82D
+S: 36C,36D,40C,48D
IDENTIFICACIÓN MOLECULAR DEL
AGENTE CAUSAL DE LA
PUDRICIÓN BASAL DEL ESTÍPITE
(PBE) EN COLOMBIA
En Colombia la Pudrición Basal del Estípite (PBE) se presenta principalmente en plantaciones de Zona Norte y la Zona
Central, aunque la incidencia es baja y ha sido limitada a focos, es una enfermedad que requiere atención, debido a los
antecedentes que se han presentado en plantaciones del sudeste asiático. Agente Causal: Ganoderma sp.

¿Cómo se determina la identidad de un ¿Cómo se resuelve la identidad


patógeno?
molecular de una especie ?
✓ Sintomatología Uso de herramientas moleculares
✓ Identificación macroscópica y microscópica que permiten explorar partes del
genoma que se han determinado
de estructuras. como claves para identificación a
nivel de especie o género.
✓ Pruebas de patogenicidad
✓ Pruebas de trasmisión

RNA polymerase II subunit 2


Detalle de muestras colectadas de palmas afectadas por PBE (Zona Norte).
A) Zona de Reacción. B) Zona Externa. C) raíces D) Basidiocarpo (M. Navia
2012)
Genes involucrados en
la partenocarpia
inducida con ANA en
híbridos OxG
Metodología:
Campo Laboratorio

Gen 1 Gen 2 Gen 3 Gen 4 Gen 5 Gen 6 Gen


Gen 1 1
Gen 2 0,7 1
Gen 3 1 5 1
Gen 4 2,4 -2 0 1
Polen 1:9 ANA Líquido Gen 5 3,5 -2 0,1 -3,6 1
Gen 6 -3,3 3,4 3,3 2,2 -2 1
1.200 ppm Gen 7 -4,8 4,9 -6,3 -1,5 0 2 1

603 607 700

T0 T1 T2 T0 T1 T2 T0 T1 T2

T0 = 0H T1 = 24H T2 = 48H
Carmenza Montoya, Santiago, Mejía, David Botero,, Iván Ayala y Hernán Mauricio Romero Bioinformática
Genes involucrados en la
partenocarpia inducida con ANA

Pre-antesis III Antesis Post-antesis


PS 603 PS 607 PS 700

• La identificación de genes involucrados en la partenocárpia


permitirá mejorar las practicas de polinización desarrolladas, y, en
un futuro, desarrollar nuevos cultivares mediante edición genética.
Redes de coexpresión
Publicaciones
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PalmElite-CIRAD con más de 80 años de trabajo en mejoramiento, actualmente
ofrecen soluciones para problemas como la Fusariosis en África, Ganoderma en el
Sudeste Asiático y PC en Latino América

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