ENZIMAS
1) ENZIMAS
Las enzimas son catalizadores biológicos que intervienen en la mayoría de las reacciones químicas que tienen lugar
en el cuerpo. Los catalizadores aumentan la velocidad de la reacción y modifican la forma en la que esta sucede, pero no la
reacción en sí.
Las reacciones químicas en las células deben suceder a unas velocidades increíblemente rápidas en las suaves
condiciones de pH (7,4) y temperatura (37 °C) del cuerpo.
Las enzimas reducen la energía de activación de las reacciones químicas, por lo que se necesita menos energía para
transformar los reactivos en productos, y se incrementa la velocidad de una reacción biológica en relación con la misma
reacción no catalizada.
Energía de activación: es la barrera energética a vencer, para formar los productos.
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS
Los nombres de las enzimas indican el compuesto o la reacción química que catalizan, sustituyendo el final del
nombre del compuesto o de la reacción por el sufijo -asa. Ejemplos: una oxidasa cataliza una reacción de oxidación, y una
deshidrogenasa elimina átomos de hidrógeno.
El nombre de algunas de las primeras enzimas que se descubrieron termina con el sufijo ina, como la papaína, (que se
encuentra en la papaya), la renina (en la leche) o la pepsina y la tripsina, que son enzimas que catalizan la hidrólisis de las
proteínas.
El nombre y el grupo de cada enzima indican el tipo de reacción que cataliza, se han establecido 6 clases principales de
enzimas.
2) ACCIÓN ENZIMÁTICA
La mayoría de las enzimas son proteínas globulares, y cada una de ellas tiene una forma tridimensional única que le
permite reconocer y unirse a un grupo limitado de moléculas reactivas, que se denominan sustratos. La estructura
terciaria de las enzimas juega un papel determinante en su actividad enzimática. Aunque existen un grupo pequeño de
moléculas de ARN con actividad catalítica: las ribozimas.
SITIO ACTIVO
En el transcurso de las reacciones que catalizan, las enzimas tienen que unirse a un sustrato de un modo que favorezca el
proceso catalítico. Las enzimas son mucho mayores que los sustratos.
En su estructura terciaria hay una región llamada sitio activo, donde los sustratos se unen con la enzima y se produce
la reacción. Suele ser una cavidad o bolsillo en el que encaja perfectamente el sustrato
Las cadenas laterales de los aminoácidos se unen al
sustrato mediante enlaces de hidrógeno, puentes
iónicos o atracciones hidrófobas, y solo unos pocos
sustratos distintos pueden encajar en el sitio activo, lo que
hace que las enzimas sean muy específicas respecto a
los sustratos con los que se unen.
REACCIONES CATALIZADAS ENZIMÁTICAMENTE
La disposición adecuada de un sustrato en el sitio activo da lugar a la formación del complejo enzima-sustrato (ES). La
combinación de la enzima con el sustrato proporciona un camino alternativo, con un contenido energético menor, para que se
produzca la reacción y, además, las cadenas laterales de los aminoácidos también participan en la catálisis.
Una vez que la reacción ha tenido lugar, los productos son rápidamente liberados por la enzima, de forma que esta
puede unirse a una nueva molécula de sustrato. La reacción catalizada entre la enzima (E) y el sustrato (S) para formar el
producto (P).
MODELO LLAVE-CERRADURA Y DE AJUSTE INDUCIDO
En el modelo llave-cerradura, el sitio activo tiene una forma rígida e inflexible, por lo que solo las sustancias que
encajan a la perfección en el mismo pueden unirse con la enzima. La forma del sitio activo es análoga a una cerradura, y el
sustrato es la llave que encaja en ella.
El modelo de ajuste inducido establece que cuando se produce la interacción entre la enzima y el sustrato, el sitio
activo también se modifica para ajustarse mejor a la forma del sustrato. Al mismo tiempo, el sustrato también modifica
su geometría, para encajar mejor en el sitio activo. La consecuencia es que la parte del sustrato que va a reaccionar queda
perfectamente dispuesta respecto a los grupos del sitio activo que va a catalizar la reacción.
Las isoenzimas son las distintas formas de una enzima que catalizan la misma reacción metabólica, pero en diferentes
células o tejidos del cuerpo. Son estructuras cuaternarias con pequeñas variaciones en los aminoácidos de las
subunidades polipeptídicas.
3) HOLOENZIMAS
Se ha demostrado que numerosas enzimas tienen un
componente no proteico, denominado cofactor (cationes metálicos)
o coenzima (moléculas orgánicas), que es necesario para su correcto
funcionamiento.
Cuando las enzimas están formadas exclusivamente por
proteínas, se denominan enzimas simples.
En este tipo de enzimas que requieren un componente
adicional, la porción proteica se denomina apoenzima y la molécula
completa holoenzima (la apoenzima más el cofactor o coenzima).
Las coenzimas y los grupos prostéticos son dos tipos específicos de cofactores de naturaleza orgánica. Una coenzima
se une de forma débil mientras que un grupo prostético se une covalentemente y no se puede separar de la proteína,
participa unido durante toda la actividad catalítica.
El grupo hemo es un ejemplo típico de grupo prostético. Las proteínas que contiene el grupo hemo se conocen como
hemoproteínas. Este grupo incluye proteínas con importantes funciones biológicas. Ejemplos: Hemoglobina y mioglobina.
CATIONES METÁLICOS
Muchas enzimas necesitan de la presencia de cationes metálicos para llevar a cabo su actividad catalítica. Los
cationes metálicos se suelen unir a una o más de las cadenas laterales de los aminoácidos.
LAS VITAMINAS COMO COENZIMAS
En función de su solubilidad, las vitaminas se clasifican en 2 grupos: hidrosolubles y liposolubles. Las vitaminas
hidrosolubles tienen grupos polares, como — OH y — COOH, que las hacen solubles en el medio acuoso celular.
Numerosas enzimas emplean vitaminas hidrosolubles como cofactores para llevar a cabo su acción catalítica.
Las coenzimas no permanecen unidas a una enzima particular, sino que son utilizadas repetidamente por diferentes enzimas.
Las vitaminas liposolubles A, D, E y K no participan en el metabolismo como coenzimas.
4) FACTORES QUE AFECTAN A LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
La actividad de una enzima indica la rapidez con la que la dicha sustancia cataliza la reacción de transformación de
un sustrato en un producto y depende considerablemente de las condiciones de reacción. Se puede expresar de la
siguiente manera:
o Unidad Internacional de Actividad Enzimática (U): Cantidad de enzima que cataliza la conversión de 1 μmol
de sustrato en un minuto bajo condiciones.
o Actividad específica: Es el número de U de enzima por mg de proteína (U/mg de prot) o por mililitro de
disolución (U/ml). Es decir, una medida de la pureza de la E. Al purificarla, el valor llega a un máximo y es estable
o Número de recambio (PM, nº centros activos): número de moléculas de S transformadas /unidad de tiempo,
por una molécula de E (o por un solo sitio catalítico).
TEMPERATURA ÓPTIMA
A bajas temperaturas, la mayoría de las enzimas tienen una baja actividad. Al aumentar la temperatura, la
actividad enzimática se incrementa, ya que las moléculas de reactivo se mueven más rápidamente y la frecuencia de
colisiones con las enzimas es mayor.
La mayoría de las enzimas muestra un máximo de actividad a una temperatura óptima, que es de 37°C, la
temperatura corporal. A temperaturas superiores a 50°C, la estructura terciaria, se destruye, causando la pérdida de
actividad.
PH ÓPTIMO
Las enzimas son más activas cuando se encuentran a un pH óptimo (7,4), que es el pH al que se mantiene la
estructura terciaria de la proteína. Valores de pH superiores o inferiores al pH óptimo provocan cambios en la estructura
tridimensional de la enzima, que pierde su sitio activo. Por tanto, la enzima ya no puede unirse adecuadamente al sustrato
y no puede darse la reacción.
CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO
Cuando la concentración de la enzima se mantiene constante, al aumentar la concentración de sustrato aumenta
la velocidad de la reacción catalizada, hasta que se satura la enzima. Cuando todas las moléculas de la enzima están
unidas al sustrato, la velocidad de la reacción catalizada alcanza la máxima (vmáx), y la adición de más moléculas de sustrato
no modifica la reacción.
Al aumentar la concentración de sustrato, aumenta la velocidad de la reacción hasta que todas las moléculas
de enzima se saturan.
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Los inhibidores son moléculas capaces de hacer que las enzimas pierdan su actividad catalítica. Todos los
inhibidores impiden la unión entre el sustrato y el sitio activo. La inhibición puede ser de dos formas:
o COMPETITIVA: el inhibidor compite con el sustrato por el sitio activo.
o NO COMPETITIVA: el inhibidor actúa en un lugar distinto del sitio activo.
Los inhibidores pueden ser:
o IRREVERSIBLES:
• Inhibición permanente.
• Unión irreversible por enlaces covalentes.
• Modificaciones químicas de los grupos catalíticos.
• La enzima modificada está siempre inhibida.
o REVERSIBLES:
• La unión del inhibidor y la enzima es reversible.
• Al quitar el inhibidor del medio, se recupera la actividad.
• Competitiva – No Competitiva – Acompetitiva
Los inhibidores competitivos tienen estructuras muy similares a las del sustrato que compiten con él por unirse con el sitio
activo. En la medida en que el inhibidor ocupa el sitio activo, el sustrato no puede unirse a la enzima y, por lo tanto, no se
produce la reacción deseada.
Cuando la concentración del inhibidor es considerable, se produce la pérdida de la actividad enzimática. Si se incrementa la
concentración del sustrato, se desplazan las moléculas de inhibidor y a medida que se unen más moléculas de sustrato
a la enzima (ES), la actividad enzimática se recupera.
Cuando un inhibidor no competitivo se une, tanto a la enzima libre como al complejo [ES], provoca en el sitio activo la
distorsión de su geometría, y la inhibición se produce porque el sustrato ya no encaja en el sitio activo o no lo hace
adecuadamente, y sin el adecuado alineamiento del sustrato con los grupos laterales de los aminoácidos, la catálisis no
tiene lugar.
Un inhibidor acompetitivo es el que se fija a un sitio distinto al que se fija el sustrato en el sitio activo y que, a diferencia
del inhibidor competitivo, sólo se une al complejo [ES].
5) CINETICA ENZIMÁTICA
La cinética química estudia las velocidades de reacción y los mecanismos por los cuales ocurre la reacción
química.
En una reacción S → P, la velocidad se puede expresar matemáticamente como:
o Desaparición del sustrato por unidad de tiempo: V0 = - Δ[𝑆] / Δt
o Aparición del producto por unidad de tiempo: V0 = Δ[P] / Δt
Las unidades de la velocidad serán, por tanto, unidades de concentración divididas por unidades de tiempo y se
suelen expresar como M.s-1(molar por segundo).
Expresión de la Ley de Velocidad inicial: V0= k [S]α
o V0: velocidad inicial
o K: constante específica de velocidad, su valor depende de la temperatura.
o [S]: concentración inicial de sustrato
o α: orden parcial de reacción, se calcula experimentalmente, tomando valores de 0, 1 y 2.
Las reacciones químicas se pueden clasificar, según su comportamiento cinético, en reacciones de orden cero, orden
uno y de orden dos. La velocidad es proporcional a una constante específica de velocidad (k) y a la concentración de uno o
más sustratos en unas condiciones determinadas.
REACCIONES DE ORDEN CERO
La velocidad es independiente de la concentración de sustrato.
Expresión de la ley de velocidad: V0= k, siendo α igual a cero
REACCIONES DE ORDEN UNO
Son reacciones del tipo A → B, en las que la velocidad depende de un solo sustrato:
V0= k[S], siendo α igual a uno
En este tipo de reacciones, k se da en unidades de tiempo-1 (s-1). Un valor elevado de k, implica una velocidad elevada.
CINÉTICA DE LAS REACCIONES DE UN SOLO SUSTRATO
Los estudios de la velocidad de las reacciones enzimáticas de un solo sustrato se realizan mezclando una
concentración conocida de enzima con una concentración concreta de sustrato, y midiendo la desaparición del sustrato
o aparición del producto a lo largo del tiempo.
Para expresar este comportamiento mediante una expresión matemática Leonor Michaelis y Maud Menten en 1913,
desarrollaron un razonamiento a través de supuestos logran la siguiente expresión de una curva hiperbólica, conocida como
Ecuación de Michaelis – Menten:
o V0: velocidad inicial
o [S]: concentración de sustrato
o Vmáx: velocidad máxima, enzima saturada
o Km: concentración de sustrato cuando V0= Vmáx/2
SIGNIFICADO DE Vmáx
La velocidad máxima es la tasa máxima teórica que se obtiene en unas condiciones determinadas. El valor
exacto se obtiene un valor aproximado cuando la velocidad comienza a ser independiente de la concentración de sustrato.
Para alcanzar la Vmáx sería necesario que todas las moléculas de enzimas estuvieran estrechamente unidas
con el sustrato (saturación de la enzima).
SIGNIFICADO DE Km
El valor de Km (en unidades de concentración) equivale a la concentración de sustrato que se requiere para
alcanzar la mitad de la velocidad máxima. El valor de Km representa la concentración de sustrato a la cual la mitad de los
centros activos de las moléculas de enzima del ensayo están ocupados por moléculas de sustrato.
El valor de Km se lo considera una medida de afinidad de la enzima por el sustrato, que será inversamente
proporcional a su afinidad.
Un valor bajo de Km indica una elevada afinidad de la enzima por el sustrato, significando que necesita poca cantidad
de sustrato para cubrir el 50 % de los sitios activos de la enzima.
Relación de la velocidad con la concentración de enzima: la velocidad de la reacción es directamente
proporcional a la concentración de la enzima a cualquier concentración de sustrato.