1. ¿Qué es biofísica? ¿Qué ciencias incluye? ¿Cómo aporta a nuestro trabajo?
¿Puedes
ver la presencia de biofísica en tu carrera?
La biofísica es una disciplina científica que aplica los principios y métodos de la física al
estudio de sistemas biológicos, buscando entender los mecanismos y procesos de los
organismos vivos en términos físicos y matemáticos. La biofísica incluye ciencias como la
biología, la física, la química, y la matemática, integrando conceptos como la mecánica
cuántica, la termodinámica y la teoría de sistemas complejos. En el trabajo de un
biotecnólogo molecular, la biofísica es fundamental ya que permite analizar estructuras
moleculares, dinámicas de proteínas, y procesos celulares a niveles atómicos, facilitando el
desarrollo de medicamentos, estudios de genética y tratamientos médicos. En la carrera de
biotecnología molecular, la biofísica está presente en el análisis de interacciones moleculares
y la modelación de sistemas biológicos, esenciales para innovaciones biotecnológicas y
farmacéuticas.
2. Menciona 3 técnicas que facilitan el análisis del nanomundo y se lograron a través de
la física. ¿Qué información nos dan?
Tres técnicas clave en el análisis del nanomundo incluyen:
• Microscopía electrónica de transmisión (TEM): Permite observar estructuras a
nivel atómico, brindando información detallada sobre la organización y el tamaño
de las partículas en muestras biológicas.
• Microscopía de fuerza atómica (AFM): Permite analizar la topografía de
superficies biológicas, estudiando interacciones entre moléculas y brindando
información sobre la mecánica y elasticidad de proteínas y células.
• -Difracción de rayos X: Esta técnica es fundamental para determinar la estructura
tridimensional de macromoléculas como proteínas y ácidos nucleicos,
proporcionando datos estructurales esenciales para comprender su función y
diseñar fármacos.
3. El organismo como máquina química. ¿Qué querían expresar con esto los autores?
Pensamientos pro y contra.
Al referirse al organismo como una "máquina química", los autores pretendían enfatizar que
los organismos funcionan mediante reacciones químicas controladas y reguladas. Esto
implica que las células, tejidos y órganos operan como una serie de sistemas interconectados
y programados de procesos químicos. A favor de esta visión, este concepto permite entender
las funciones biológicas en términos de transformaciones y energía química, facilitando el
desarrollo de tratamientos y terapias. En contra, este enfoque puede ser reduccionista al no
considerar adecuadamente factores como la adaptabilidad y complejidad de los seres vivos,
que no operan como máquinas rígidas y pueden evolucionar y adaptarse al ambiente.
4. Compara los modelos biológicos, bioquímicos y físicos de sistemas vivos. ¿Cómo
cambia la apariencia de un sistema si miramos a través de diferentes lentes? (Del
biólogo, del bioquímico y del físico)
Desde el enfoque biológico, un sistema vivo se observa como una organización de células y
tejidos que mantienen la homeostasis y cumplen funciones específicas para la supervivencia
del organismo. En el enfoque bioquímico, se enfatiza la composición molecular y los
procesos metabólicos, estudiando las reacciones químicas que ocurren en los sistemas vivos
y su papel en la producción de energía y síntesis de biomoléculas. Desde el enfoque físico,
se analiza al sistema vivo en términos de fuerzas, energía y leyes de la termodinámica,
evaluando propiedades como la difusión, la dinámica de membranas y la interacción de
biomoléculas. Estos diferentes modelos ofrecen perspectivas complementarias que ayudan a
comprender la complejidad de los sistemas vivos.
5. Importancia del conocimiento de la estructura de las proteínas. ¿Qué posibilidades
tenemos para la determinación de la estructura de las proteínas?
Conocer la estructura de las proteínas es crucial, ya que la estructura determina la función de
la proteína en los procesos celulares. Al conocer su estructura tridimensional, es posible
diseñar fármacos que interactúen de manera específica con proteínas, optimizar procesos
biotecnológicos y comprender las bases de muchas enfermedades. Entre las técnicas para
determinar estructuras de proteínas se incluyen la cristalografía de rayos X, la resonancia
magnética nuclear (RMN) y la criomicroscopía electrónica, cada una brindando detalles
únicos de las conformaciones y permitiendo a los investigadores manipular y utilizar las
proteínas de forma específica.
6. Cristalización de proteínas. Técnicas vistas en laboratorio.
La cristalización de proteínas es el proceso mediante el cual se obtienen cristales de proteínas
para su posterior análisis estructural, generalmente por difracción de rayos X. En el
laboratorio, se pueden utilizar métodos como la cristalización en gota colgante o en gota de
vaporización, donde se mezclan proteínas en soluciones de precipitación para formar cristales
en condiciones controladas de temperatura y concentración de sales. La obtención de cristales
adecuados es esencial para analizar la estructura de las proteínas a nivel atómico.
7. ¿De qué manera ayuda al trabajo con las proteínas el uso de química computacional
y realidad virtual? ¿Cuál era tu experiencia? ¿Qué piensas sobre el uso de química
computacional y/o realidad virtual en tu carrera?
El uso de química computacional y realidad virtual permite simular y visualizar las
interacciones moleculares en tres dimensiones, facilitando la comprensión de la estructura y
función de las proteínas. Estas herramientas permiten predecir la conformación de las
proteínas, observar interacciones específicas y diseñar fármacos con mayor precisión. Mi
experiencia con estas herramientas ha sido enriquecedora, ya que permiten ver las proteínas
en un contexto que va más allá de las estructuras bidimensionales, profundizando el
entendimiento de la dinámica molecular. En mi carrera, considero que la química
computacional y la realidad virtual serán esenciales para innovar en la biotecnología,
especialmente en la bioinformática y el diseño de fármacos.
• 8. Fases de construcción y realización de un proyecto de investigación. ¿Dónde inicia
el proyecto y cuáles son los pasos más importantes y por qué?
Un proyecto de investigación inicia con la identificación de una pregunta o problema
relevante. Las fases incluyen:
• Planteamiento de hipótesis, que permite establecer una base teórica;
• Revisión de la literatura, que contextualiza el estudio;
• Diseño experimental, crucial para asegurar la validez de los resultados;
• Recolección de datos, fase en la cual se obtienen los resultados;
• Análisis e interpretación de datos, donde se extraen conclusiones;
• Publicación de resultados, que permite compartir hallazgos con la comunidad
científica.
9. Enlaces y su rol en la formación de estructuras, reacciones.
Los enlaces químicos juegan un rol central en la formación de estructuras moleculares y en
las reacciones químicas. Enlaces covalentes y no covalentes permiten la formación de
complejas estructuras tridimensionales, como las proteínas y ácidos nucleicos, determinando
su estabilidad y reactividad. La formación de enlaces también permite la interacción entre
biomoléculas, facilitando procesos celulares y reacciones químicas en sistemas biológicos.
10. Enlaces primarios y secundarios. ¿Cómo se forman? ¿Cómo puedes
caracterizarlos? Enlaces primarios y secundarios, localización en biomoléculas y su
función.
Los enlaces primarios o covalentes se forman mediante el compartimiento de electrones entre
átomos y son caracterizados por su gran estabilidad y fortaleza, formando el esqueleto básico
de biomoléculas como proteínas y ADN. Los enlaces secundarios, como los puentes de
hidrógeno y las interacciones de Van der Waals, son más débiles y permiten la formación de
estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias en proteínas. Estos enlaces secundarios son
fundamentales para mantener la estructura y función de las biomoléculas, localizándose en
zonas de plegamiento y estabilización molecular.
11. Relación del contenido de curso con tu interés en ciencias, tu tema de tesis o tu futuro
trabajo.
El contenido del curso de biofísica se relaciona directamente con mi interés en la
biotecnología molecular y mi desarrollo profesional. La comprensión de los principios físicos
que gobiernan las interacciones moleculares es esencial para mi tema de tesis, enfocado en
el estudio de proteínas y sus aplicaciones en biomedicina. Este conocimiento también es
relevante para mi futuro en la investigación biotecnológica, donde planeo aplicar técnicas
biofísicas para la innovación en el diseño de medicamentos y en la terapia génica.
