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Guia de Contenidos y Actividades Nº2 Barcelo

El documento aborda la biocatálisis, definiendo conceptos clave como catalizadores, enzimas y sustratos, y discutiendo las propiedades distintivas de las enzimas frente a catalizadores no biológicos. Se exploran ejemplos de vitaminas y metales importantes en reacciones enzimáticas, así como la cinética enzimática y los tipos de inhibición. Además, se analizan mecanismos de regulación de la actividad enzimática, incluyendo la regulación alostérica y el uso de zimógenos.

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Guia de Contenidos y Actividades Nº2 Barcelo

El documento aborda la biocatálisis, definiendo conceptos clave como catalizadores, enzimas y sustratos, y discutiendo las propiedades distintivas de las enzimas frente a catalizadores no biológicos. Se exploran ejemplos de vitaminas y metales importantes en reacciones enzimáticas, así como la cinética enzimática y los tipos de inhibición. Además, se analizan mecanismos de regulación de la actividad enzimática, incluyendo la regulación alostérica y el uso de zimógenos.

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Guia de Contenidos

y Actividades Nº2:
Biocatálisis
1. Aspectos básicos de la
catálisis y los
catalizadores. Las
enzimas como
catalizadores
biológicos
1) Definí los siguientes términos:

Acelera una reacción sin


Catalizador consumirse Enzima Catalizador biológico
Molécula sobre la que actúa la
Sustrato enzima Producto Resultado de la acción enzimática
Zona reguladora distinta del centro
Centro activo Sitio donde se une el sustrato Sitio alostérico activo
Sustancia no proteica necesaria Cofactor orgánico, muchas veces
Cofactor para la función enzimática Coenzima derivado de vitaminas
Cofactor unido permanentemente
Grupo prostético a la enzima Holoenzima Enzima activa (apoenzima + cofactor)
Parte proteica inactiva de una Sustancia que disminuye la actividad
Apoenzima enzima Inhibidor enzimática
2) ¿qué propiedades diferentes y distintivas presentan las enzimas
como catalizadores biológicos respecto de otro tipo de
catalizadores no biológicos? ¿Por qué estas propiedades
permiten adecuar el proceso catalítico de las enzimas en el
ámbito biológico?
Alta especificidad: Actúan sobre un sustrato y reacción determinados
↳ Evita errores en el metabolismo

Gran eficiencia: Aceleran reacciones miles a millones de veces


↳ Permite que ocurran rápidamente en el cuerpo

Condiciones suaves: Funcionan a temperatura y pH fisiológicos


↳ Ideal para organismos vivos

Regulación precisa: Se pueden activar o inhibir según necesidad


↳ Controla y ajusta el metabolismo
3) Explica a través de qué mecanismo una enzima cataliza una
reacción química.

- Unión al sustrato
- Modelo llave-cerradura
- Modelo del ajuste inducido
- Formación del complejo enzima-sustrato
- Disminución de la energía de activación
- Conversión del sustrato en producto
- Estabilización de intermediarios del estado de transición
- Liberación del producto
4) Mencioná algunos ejemplos de vitaminas,
coenzimas y metales que sean importantes en
las reacciones enzimáticas y justificá por qué lo son.

Vitamina Coenzima derivada Función enzimática


Participa en reacciones de
B1 (Tiamina) Tiamina pirofosfato (TPP) descarboxilación (ej. ciclo de Krebs)
Transportan electrones en reacciones
B2 (Riboflavina) FAD y FMN redox (cadena respiratoria)
Coenzimas clave en reacciones de
óxido-reducción (glucólisis, ciclo de
B3 (Niacina) NAD⁺ / NADP⁺ Krebs)
Interviene en reacciones de
transaminación (metabolismo de
B6 (Piridoxina) Fosfato de piridoxal aminoácidos).
Transporte de grupos monocarbonados
B9 (Ácido fólico) Tetrahidrofolato (THF) (síntesis de ADN y aminoácidos)
Participa en reacciones de isomerización
B12 (Cobalamina) Cobalamina activa y metabolismo del folato
4) Mencioná algunos ejemplos de vitaminas,
coenzimas y metales que sean importantes en
las reacciones enzimáticas y justificá por qué lo son.

Coenzima Función

NAD⁺ / NADP⁺ Transporte de electrones en reacciones redox


Transporta grupos acilo (ej. Acetil-CoA en el metabolismo
Coenzima A (CoA) energético)

Biotina Transporte de grupos carboxilo (coenzima en carboxilasas).


Cofactores redox en enzimas como la succinato
FAD / FMN deshidrogenasa
Transporte de fragmentos de un carbono en síntesis de
THF (ácido fólico) nucleótidos
4) Mencioná algunos ejemplos de vitaminas,
coenzimas y metales que sean importantes en
las reacciones enzimáticas y justificá por qué lo son.

Metal Función enzimática


Participa en la anhidrasa carbónica y alcohol deshidrogenasa.
Zn²⁺ (Zinc) Estabiliza estructuras.

Mg²⁺ (Magnesio) Necesario para enzimas que usan ATP (ej. quinasas).
En citocromos y catalasas, vital en transporte de electrones y
Fe²⁺ / Fe³⁺ (Hierro) redox.
Presente en citocromo c oxidasa, esencial en la respiración
Cu²⁺ (Cobre) celular.

Mn²⁺ (Manganeso) Cofactor en enzimas del ciclo de la urea y antioxidantes.


5) Observá y analizá las siguientes reacciones. En cada una indicá
qué clase de enzima la catalizaría
5) Observá y analizá las siguientes reacciones. En cada una indicá
qué clase de enzima la catalizaría

(a)
(Acetaldehído
(Etanol)
)

- Tipo de reacción: Oxidación

- Enzima: Oxidorreductasa (más específicamente, una alcohol deshidrogenasa)

- Justificación: Transfiere electrones (hidrógenos) del alcohol al NAD⁺


(oxidación-reducción)
5) Observá y analizá las siguientes reacciones. En cada una indicá
qué clase de enzima la catalizaría

(b)
(Ácido
(Glutamato) (Aspartato) (α-cetoglutarato)
oxalacético)

- Tipo de reacción: Transaminación

- Enzima: Transferasa (específicamente, una aminotransferasa o transaminasa)

- Justificación: Transfiere un grupo amino de un aminoácido a un ácido ceto


5) Observá y analizá las siguientes reacciones. En cada una indicá
qué clase de enzima la catalizaría

(c)

- Tipo de reacción: Deshidratación

- Enzima: Liasa

- Justificación: Rompe enlaces sin usar agua ni redox, y genera dobles enlaces al
eliminar agua
5) Observá y analizá las siguientes reacciones. En cada una indicá
qué clase de enzima la catalizaría

- Tipo de reacción: Isomerización

- Enzima: Isomerasa

- Justificación: Reorganiza los átomos


dentro de la molécula sin cambiar su
fórmula molecular

(d)
5) Observá y analizá las siguientes reacciones. En cada una indicá
qué clase de enzima la catalizaría

(e)

- Tipo de reacción: Carboxilación

- Enzima: Ligasa (específicamente, una carboxilasa)

- Justificación: Une dos moléculas (fija CO₂) con gasto de energía (ATP)
2. Cinética enzimática
1) Observa con detenimiento el gráfico.
De acuerdo con el:

a. Explicá qué información


proporciona.

b. ¿Cuáles son los parámetros


cinéticos de una enzima con
una cinética de Michaelis
Menten?

c. Señalá Km y Vmáx.

d. ¿Cómo harías para realizar un


gráfico de Lineweaver-Burke y
dónde ubicarías Km y Vmáx?
1) Observa con detenimiento el gráfico.
De acuerdo con el:

a. Explicá qué información


proporciona.
Este gráfico muestra la relación entre la velocidad
inicial de una reacción enzimática (Vo) y la
concentración de sustrato

- Al principio, pequeños aumentos de sustrato


hacen que la velocidad crezca rápido
- Luego, la velocidad empieza a aumentar cada
vez menos (se "aplana"), hasta llegar a un
máximo donde agregar más sustrato ya no
aumenta la velocidad
- Ese máximo es Vmax, la velocidad máxima de
la enzima cuando está saturada de sustrato
1) Observa con detenimiento el gráfico.
De acuerdo con el:

b. ¿Cuáles son los parámetros


cinéticos de una enzima con
una cinética de Michaelis
Menten?

1. Vmax: Es la velocidad máxima que alcanza la


reacción cuando todos los sitios activos de la
enzima están ocupados por sustrato

2. Km (constante de Michaelis): Es la
concentración de sustrato a la cual la velocidad
de reacción alcanza el 50% de Vmax. Refleja la
afinidad de la enzima por su sustrato:
Km bajo → alta afinidad
Km alto → baja afinidad
1) Observa con detenimiento el gráfico.
De acuerdo con el:

c. Señalá Km y Vmáx.
Vmax= 98
Cómo hacerlo:
- Busque el valor más alto de velocidad (Vo) en
el eje Y → eso es Vmax
- Marque la mitad de Vmax → busque qué
concentración de sustrato corresponde → eso
es Km

Km=25
1) Observa con detenimiento el gráfico.
De acuerdo con el:

d. ¿Cómo harías para realizar un


gráfico de Lineweaver-Burke y 0.04
dónde ubicarías Km y Vmáx?
El gráfico de Lineweaver-Burke es simplemente la 0.03
doble inversa
0.02
Pasos:
1. Tome los datos originales de [S] y Vo. 0.01
2. Calcule -1/[S] y 1/Vo para cada par de datos.
3. Haga el gráfico:
Eje X: -1/[S] (-1/25 = -0.04)
Eje Y: 1/Vo (1/98 = 0.012)
4. Una los puntos para formar una recta
2) ¿a qué se debe el comportamiento diferente
a bajas temperaturas frente a las altas temperaturas?

Comportamiento de las enzimas a bajas temperaturas


- A bajas temperaturas, todas las moléculas (sustrato y
enzima) se mueven más lento.
- Hay menos choques entre enzima y sustrato → la
formación del complejo enzima-sustrato es más lenta.
- Resultado: La velocidad de la reacción disminuye.

Comportamiento de las enzimas a altas temperaturas


- Inicialmente, un aumento moderado de temperatura
acelera la reacción porque:
- Aumenta la energía cinética.
- Favorece más choques enzima-sustrato.
- Pero, si la temperatura sigue subiendo demasiado:
- La proteína empieza a desnaturalizarse: se
rompen los enlaces débiles (puentes de
hidrógeno, interacciones hidrofóbicas, etc).
- Cambia la estructura tridimensional de la
enzima → pierde su sitio activo → pierde su
actividad catalítica
2) En el siguiente gráfico se muestran los pH óptimos
de tres enzimas. Reflexioná y debatí sobre la relación entre el pH
óptimo de estas enzimas, su localización y los procesos que
catalizan.
-

Enzima pH Óptimo Localización Función principal

Pepsina ~2 (ácido) Estómago Digesta proteínas

Amilasa ~7 (neutro) Boca e intestino delgado Digesta almidones

Tripsina ~8 (básico) Intestino delgado Digesta proteínas


3. Inhibición enzimática
1) Distinguí entre inhibición e inactivación 2) Define el concepto de inhibición enzimática
enzimática. y explica en qué se basa cada tipo de
inhibición

Inhibición Enzimática: Inhibición irreversible: El inhibidor se une de forma


covalente y permanente, destruyendo la actividad
La inhibición enzimática se refiere a la reducción de la enzimática.
actividad enzimática debido a la interacción de una
molécula con la enzima, que impide o reduce la Inhibición reversible:
capacidad de la enzima para catalizar la reacción. La
inhibición puede ser reversible o irreversible. ● Competitiva: El inhibidor compite con el sustrato por
el sitio activo.
Inactivación Enzimática:

La inactivación enzimática, por otro lado, se refiere a ● No competitiva: El inhibidor se une a un sitio distinto
la pérdida de actividad enzimática debido a la al activo, alterando la estructura de la enzima.
destrucción o modificación irreversible de la enzima,
generalmente debido a cambios en su estructura o
Sustrato suicida: El sustrato se transforma en un producto
condiciones ambientales desfavorables (como pH
reactivo que inactiva la enzima de forma irreversible.
extremo, temperatura alta, o reacciones covalentes con
compuestos que modifican de manera permanente la
enzima).
3) Se determinaron los parámetros cinéticos de una enzima con
cinética de Michaelis Menten, en ausencia y en presencia de un
inhibidor enzimático. Se obtuvo el siguiente gráfico.

a. ¿Cómo calcularías los parámetros


cinéticos? ¿Qué valor calculás para
Km y Vmáx de cada situación?

b. Indicá cuál recta corresponde a la


reacción en ausencia o presencia de
dos concentraciones diferentes de un
inhibidor I (I1 , I2 ). Considera [I2 ] >
[I1 ]

c. ¿A qué tipo de inhibición


corresponde?
Inhibición No Competitiva
El inhibidor se une a la enzima en

Velocidad de reacción
un punto distinto al sitio activo,
Reduce la actividad de la enzima.
Reduce el Vmax pero no altera la
Km.

Concentración de sustrato
4) Se determinaron los parámetros cinéticos de otra
enzima michaeliana, en ausencia y en presencia
de un inhibidor enzimático. Se obtuvo el siguiente gráfico

a. ¿Cómo calcularías los parámetros


cinéticos? ¿Qué valor calculás para
Km y Vmáx de cada situación?

b. Indicá cuál recta corresponde a la


reacción en ausencia o presencia de
dos concentraciones diferentes de un
inhibidor I (I1 , I2 ). Considerá [I2 ] >
[I1 ]

c. ¿A qué tipo de inhibición


corresponde?
Inhibición Competitiva
El inhibidor se une al sitio activo de

Velocidad de reacción
la enzima, Reduce la disponibilidad
de enzima. Reduce el Km pero no
altera la Vmax. Es contrarrestado
por un aumento de [S]

Concentración de sustrato
4. Regulación de la
actividad enzimática
1) Explicá el fundamento de los siguientes
mecanismos de regulación de la actividad enzimática:

Mecanismo Descripción Mecanismo Descripción

La enzima se regula por moléculas Son formas inactivas de


(efectores alostéricos) que se unen a un enzimas que requieren una
Regulación sitio diferente al sitio activo, induciendo modificación proteolítica para
Alostérica cambios conformacionales Zimógenos activarse
Son diferentes formas de una
enzima que catalizan la misma
La actividad enzimática se regula reacción pero con
Modificación mediante la adición o eliminación de características estructurales y
Covalente grupos químicos (ej., fosfatos) Isoenzimas cinéticas distintas
Localización de las enzimas en
diferentes compartimentos
Controla la cantidad de enzimas celulares, lo que permite un
Regulación sintetizadas a través de la regulación de Compartimentación control eficiente de los procesos
Génica la transcripción y traducción de los genes Celular metabólicos
2) Leé el siguiente párrafo y luego repondé a la pregunta
relacionada con él.

“La velocidad del ciclo de Krebs se controla continuamente para cumplir con
las necesidades energéticas exactas de la célula. La isocitrato deshidrogenasa,
que cataliza la descarboxilación oxidativa del isocitrato: Isocitrato + NAD+
alfa-cetoglutarato + CO2 + NADH + H+ (…) es la enzima clave de la vía, siendo
estimulada por la presencia de ADP, que aumenta la afinidad de la enzima por
el sustrato e inhibida por NADH como consecuencia del desplazamiento directo
de NAD+.”
¿Qué tipos de mecanismos de regulación se definen
sobre la isocitrato deshidrogenasa? Justificá

1. Regulación Alostérica:
○ Estimulación por ADP: El ADP actúa como un efector positivo alostérico, ya que aumenta la
afinidad de la enzima por su sustrato. Esto es típico de la regulación alostérica, donde un
metabolito (en este caso, el ADP) se une a un sitio distinto al sitio activo y aumenta la actividad de
la enzima, favoreciendo la producción de energía cuando la célula lo necesita

2. Inhibición por retroalimentación negativa (inhibición competitiva):


○ Inhibición por NADH: El NADH actúa como un inhibidor competitivo, desplazando el sustrato
(NAD+). Esta inhibición es un ejemplo de retroalimentación negativa, donde la acumulación de un
producto (en este caso, NADH) reduce la actividad enzimática para evitar la sobreproducción de
productos y equilibrar la producción de energía en la célula
3) Indicá las afirmaciones correctas y reescribí de
manera adecuada aquellas que consideres falsas:
a. Una enzima presenta regulación alostérica cuando distintas sustancias compiten
con el sustrato a nivel del centro activo. FALSO
Corrección: Una enzima presenta inhibición competitiva cuando distintas sustancias compiten con el sustrato a
nivel del centro activo
Justificación: La regulación alostérica no implica competencia en el sitio activo, sino que ocurre cuando un efector
se une a un sitio distinto del sitio activo, modificando la actividad de la enzima

b. Se dice que una enzima se regula covalentemente cuando su actividad es


modificada por la unión de ciertos grupos químicos a residuos de aminoácidos.
VERDADERO
Justificación: La regulación covalente involucra la modificación de la actividad enzimática a través de la unión de
grupos químicos, como fosfatos, a residuos de aminoácidos en la enzima

c. Hablamos de zimógenos cuando una enzima presenta distintas estructuras


moleculares que catalizan la misma reacción. FALSO
Corrección: Hablamos de isoenzimas cuando una enzima presenta distintas estructuras moleculares que
catalizan la misma reacción
Justificación: Los zimógenos son formas inactivas de las enzimas que requieren un corte proteolítico para
activarse, no tienen que ver con la variabilidad estructural
d. La inducción o represión genética permite modificar la
actividad de una enzima haciéndola más o menos activa,
respectivamente. INCORRECTA
Corrección: La inducción o represión genética modifica la cantidad de enzima producida, haciendo que la enzima esté más
o menos presente en la célula
Justificación: La inducción y represión genética afectan la expresión génica, no directamente la actividad de la enzima

e. Las isoenzimas son enzimas que catalizan distintas reacciones y presentan estructura
molecular idéntica. INCORRECTA
Corrección: Las isoenzimas son enzimas que catalizan la misma reacción pero tienen estructuras moleculares distintas
Justificación: Las isoenzimas tienen diferentes estructuras y propiedades, pero catalizan la misma reacción, no reacciones
diferentes

f. La presencia de isoenzimas junto con la compartimentación celular es una estrategia


biológica que permite establecer un mecanismo eficiente de regulación enzimática.
CORRECTA
Justificación: La presencia de isoenzimas y compartimentación celular permite regular la actividad enzimática de manera
eficiente en diferentes condiciones o tejidos

g. Los mecanismos de regulación por retroalimentación negativa permiten el control de una


vía metabólica por su producto final. CORRECTA
Justificación: La retroalimentación negativa es un mecanismo de regulación enzimática donde el producto final de una vía
metabólica inhibe la actividad de una enzima clave en la misma vía, para evitar la sobreproducción
h. Todas las enzimas se regulan a través de mecanismos alostéricos, covalentes y genéticos.
INCORRECTA
Corrección: No todas las enzimas se regulan a través de mecanismos alostéricos, covalentes y genéticos
Justificación: Aunque muchos procesos metabólicos están sujetos a estas formas de regulación, algunas enzimas no
experimentan todos estos mecanismos de control
Muchas
Gracias!

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