Microbiología

Agrícola
• Esta área de la microbiología aborda el
estudio de los microorganismos presentes en
agro-ecosistemas (suelo, planta, atmósfera)
y el análisis comprensivo de sus
interacciones con especies vegetales de
importancia agrícola, con el fin de predecir su
comportamiento frente a las situaciones que
enfrentan estos sistemas productivos.
¿Cuál es el objetivo?

• Permitir proponer estrategias coherentes para la

fertilización de los cultivos y control de
enfermedades, con base en el uso y/o manipulación
racional de microorganismos o algunos de sus
productos, como parte esencial de una agricultura
sostenible.
 UNIDAD VIII

Ecología microbiana

Estudia las propiedades y el comportamiento de

los microorganismos en su ambiente natural,
sea el suelo, aguas, alimentos, animales.
 Ecología microbiana
Autoecología:
Sinecología: analiza las comprende el estudio de
interacciones en un una especie y el efecto
determinado lugar, que sobre ella en
considerando las particular ejerce el
especies, los factores ambiente
bióticos y abióticos en ese Ej.: -estudio de una cepa
lugar (suelo, mar, de Rhizobium,
estanque). -de patógenos vegetales,
 Jerarquía ecológica

• Ecosistema: es el sistema limitado en el espacio

constituido por el conjunto de condiciones
energéticas, físicas, químicas y biológicas que
rodean a estos organismos (ambiente).
 Ecosistema

Puede ser:

● microecosistema, como un cultivo

microbiano, agregado de un suelo

● macroecosistema complejo, un océano

●mesoecosistema, como el estudio de un

suelo, un estanque y su vegetación, el rumen
 Jerarquía ecológica

• Comunidad o biocenosis: está constituida por

todos los organismos que habitan el ecosistema.

• Población: está formada por las especies u

organismos de tipo distinguible, ej. población de
bacterias, de esporulados.
 Jerarquía ecológica

• Individuo: componentes únicos de la población:

células, hifa, cuerpo de reposo de hongo, espora
microbiana

Un ecosistema está integrado por:

●comunidad o biocenosis - poblaciones – individuos

●factores abióticos

• .
 Ecología microbiana

• Amplio rango de macro y microorganismos

• Tipos, número y diversidad de

microorganismos en distintas situaciones

• Actividades realizadas en el suelo y sus

efectos en la fertilidad en el crecimiento
vegetal

• Las interrelaciones entre organismos con las

plantas y los animales con el ambiente.
• Los microorganismos se encuentran en
ambientes extremos, la diversidad es enorme y
especies de bacterias, algas, hongos, protozoos,
se aíslan en todos los tipos de suelos, en
alimentos, aguas, restos orgánicos, animales.
• Sus funciones son variables
 Microbiología y agricultura

Existen microorganismos que:

➢ son patógenos para las plantas y otros que son

capaces de controlar a esos patógenos.

➢ son necesarios para transformar productos

agrícolas primarios en productos de mayor
valor agregado, sobre todo alimenticios.

➢ participan en procesos de deterioro

postcosecha.
 Microbiología y agricultura

➢Participan en los procesos de formación y

degradación del suelo y en todos los ciclos
elementales fundamentales: carbono, nitrógeno,
fósforo, azufre y hierro (ciclo biogeoquímico).

Para conocer la actividad microbiana que más

influye a la agricultura, tenemos que mirar para
abajo, al suelo.
Organismos en el ecosistema suelo-planta
 Interacciones en el ecosistema suelo-planta

➢1 -ocurren entre la comunidad microbiana y los

componentes del suelo,
➢2 -entre los microorganismos entre si,
➢3- entre las comunidades vegetales y microbianas
➢4- que involucran al suelo y la vegetación
 Interacciones en el ecosistema suelo-planta-rumen

rumen
5

➢5- ¿RUMEN?
 Microbiología del rumen

❖Los rumiantes se alimentan de hierba y de

otros vegetales que contienen celulosa, almidón,
pectina y hemicelulosa.

❖No poseen enzimas que puedan digerirlos y son

los microorganismos presentes en el rumen, los
que al fermentar el alimento permiten al rumiante
la obtención del alimento.
❖En el interior del rumen poblaciones de
bacterias y de arqueas convierten estos
complejos materiales vegetales en ácidos grasos
de bajo peso molecular, dióxido de carbono y
metano.

❖Los ácidos orgánicos de bajo peso molecular, como

el acetato, satisfacen las necesidades nutritivas
del animal.

❖ El dióxido de carbono y el metano se eliminan

como productos residuales.
La diversidad de microorganismos del rumen es
importante porque la presencia de especies distintas
aporta genes, enzimas, y reacciones bioquímicas
precisas para una conversión máxima de productos
alimenticios en células microbianas y productos de
fermentación.

Predominan las especies aerobias

❖Las bacterias constituyen la mayor y más
diversa comunidad microbiana presente
en el rumen, donde realizan varias de
las funciones vitales.

❖Contiene un gran número de bacterias,

protozoos ciliados, hongos anaerobios
del rumen y bacteriófagos.
 Ambientes microbianos

El término ambiente se refiere a todo lo que rodea

a un organismo: los factores físicos, químicos y
biológicos.
 Acuáticos

➢ Océanos, pantanos, lagos, ríos y manantiales.

➢ Difieren mucho entre sí en propiedades físicas y

químicas y en las especies microbianas activas.

➢ Los organismos fotosintéticos predominantes son

cianobacterias y algas (fitoplancton y bentónicas)

en las zonas aeróbicas y bacterias fotosintéticas
en las anaerobias.

➢ Son los productores primarios.

 Terrestres

➢ Sus efectos sobre el suelo depende en gran parte de

las características físicas y químicas de éste.

➢ Las actividades de los microorganismos en este

ambiente es altamente heterogéneo.

➢ Los microorganismos no actúan solos; con otros

microorganismos, micro (nematodos) y meso fauna
(lombrices, insectos), vegetación y las propiedades
físicas y químicas del suelo y la acción del clima y el
Componentes de suelo
La atmósfera subterránea es diferente de la
superficial porque tiene menos oxígeno y de
diez a cien veces más CO2 debido a la
actividad biológica
 La fracción orgánica
• Materiales orgánicos de origen animal o vegetal
llegan o son formados en el suelo, donde son
descompuestos por las actividades microbianas.

• La materia orgánica que no es completamente

degradada contribuye a la formación del humus.

• constituye la reserva nutritiva de un suelo.

• Los microorganismos contribuyen, junto
con otros organismos, a la alteración de la
roca madre, formando la reserva orgánica
(humus), pero participan también a su
degradación.
Biomasa del suelo

Manual de Microbiología, 2013

 Factores que afectan la actividad
microbiana

● características de los propios microorganismos

●disponibilidad de nutrientes: materia orgánica, O2,N,

S, P, etc.

●factores físicos: temperatura, aireación humedad, pH

 Factores que afectan la actividad
microbiana

●manejo: aireación/compactación; distribución de

la MO disponibilidad de agua; tº en primavera

●residuos vegetales o aplicación de abonos

●sistemas de cultivo y rotaciones

●interacciones con otros microorganismos

●interacciones con otros (plantas, animales)

El suelo constituye un medio único, ya que contiene
gran población de bacterias, actinomicetes, algas,
hongos, protozoos, virus, ocurren los procesos
bioquímicos vinculados a la degradación de la materia
orgánica, las transformaciones de los elementos
minerales muy importantes para la nutrición de las
plantas, como el N, P, S, Fe, Mn, etc.
 Rizósfera

❖Las interacciones entre los vegetales y los

microorganismos del suelo en la zona que está en
contacto con las raíces.

❖Las plantas producen exudados radicales y restos

tisulares.

❖En un mismo sistema radical, varía la intensidad del

efecto rizosférico y la colonización de la superficie
de las raíces (rizoplano)
 Rizósfera

❖Cada especie o variedad de planta induce un efecto

rizosférico característico que desaparece cuando
las raíces envejecen, dando lugar a microbios que
intervienen en la descomposición de los tejidos
vegetales muertos.

❖Los exudados radicales estimulan el crecimiento de

bacterias que sintetizan sustancias antimicrobianas,
enzimas y son antagonistas de bacterias y hongos
patógenos.
 Espermatósfera

• Es el origen de iniciación del efecto

rizosférico de las raíces en
desarrollo.

• A su nivel ocurren múltiples

interacciones entre la planta,
las poblaciones microbianas y
el ambiente
• Los productos liberados por |os granos son de
naturaleza variable, según la edad, la especie y
las características del medio (fuentes de C, N,
sustancias biológicamente activas, como
vitaminas, aminoácidos, otras inhibidoras)

• la solubilización de fosfatos, amonificación,

celulolisis, y ciertas actividades enzimáticas son
estimuladas
 La filósfera

❖Las hojas de las plantas presentan en su

superficie poblaciones de bacterias, levaduras,
hongos filamentosos, algas, líquenes, etc.

❖La transpiración de las hojas puede mantener un

microclima más húmedo que el del aire.
 La filósfera

❖Las poblaciones bacterianas de la filosfera son ricas

en especies pigmentadas: Flavobacterium,
Xanthomonas, Pseudomonas, levaduras, y
numerosas las especies de hongos.

❖Entre las funciones microbianas más estimuladas en

este hábitat se citan la amonificación, la fijación del
N2 y la lipólisis.

❖La producción de antibióticos es frecuente en las

 En resumen
• La rizósfera, la espermatósfera y la filósfera son
áreas donde se liberan materiales orgánicos que
pueden alterar la diversidad microbiana e
incrementar el número de microorganismos, la
actividad microbiana y las interacciones entre los
microorganismos con las semillas, las raíces y el
suelo adyacente.

• La comunidad microbiana en la rizósfera puede

afectar el crecimiento vegetal en forma benéfica,
neutra o perjudicial, afectando la salud, vigor y
productividad vegetal.