TEMA 3: ÁC.

NUCLEICOS

3.1 Composición de los ácidos nucleicos

Nucleótidos:
Todos los ácidos nucleicos, es decir, el DNA y el RNA están compuestos por nucleótidos. Por tanto, la
composición del DNA será la de estos nucleótidos. Un nucleótido siempre está formado por:
Grupo fosfato: uno en el caso de los ácidos nucleicos, pero a veces los nucleótidos pueden tener tres
fosfatos unidos con el objetivo de acumular más unidades de energía, como en el caso del ATP
(adenosin trifosfato), que presenta varios grupos fosfatos, el α, el β y el γ.

Un monosacárido:
-Ribosa en el caso del RNA.
-Desoxirribosa en el caso del DNA. En el carbono 2’ de la desoxirribosa no hay grupo OH.
-Una base nitrogenada: son compuestos formados por C, N, H, O y que determina el tipo de
nucleótido que es. Se unen siempre al C1’ del monosacárido mediante el enlace N-glucosídico.

Tipos de bases nitrogenadas

-Purinas (bases púricas): derivan de la purina como son la adenina y la guanina. Se unen al
monosacárido por el Nitrógeno 9.
-Pirimidinas (bases pirimidínicas): derivan de la pirimidina, un único anillo. Son la timina (ADN), el
uracilo (RNA); y la citosina. Se unen al monosacárido por su nitrógeno 1.

La unión de un monosacárido y una base nitrogenada forma un nucleósido. Si más adelante se uniera
el grupo fosfato por el carbono 5 se formaría un nucleótido.

3.2 Estructura tridimensional de ADN

Antecedentes:
-El DNA de distintos tejidos de un mismo organismo tiene la misma composición de bases.
-La composición de bases cambia de una especie a otra.
-La composición de bases no se modifica con la edad, nutrición, entorno, etc. Esta no es del todo
cierta, con el tiempo vamos mutando pero no es muy perceptible.
La ley de Chargaff, nos dice que tiene que haber el mismo número de bases A y de T, y el mismo de
G y C porque son complementarias. Y que A+G = T+C (nº purinas = nº pirimidinas)
R. Franklin fue la primera mujer que fotografió la doble hélice del DNA pero no supo interpretarla en
cambio Watson y Crick, sí lo hicieron alrededor de los años 50.
-El DNA es una doble hélice en la que cada hebra se enrolla a lo largo de un eje central en sentido
dextrógiro.
-El fosfato junto con el azúcar se sitúan al exterior ya que son polares y las bases se encuentran en el
interior porque son apolares.
-Las hebras son antiparalelas entre sí. (5’-3’ y 3’-5’) El extremo 5’ acaba en P y el 3’ en OH.
-Las dos hebras son complementarias, en una hebra hay A y en la otra, T. O G en una y C en la otra.

-El DNA presenta un doble surco, es decir, presenta un surco mayor y un surco menor en la doble
hélice porque las ribosas no están situadas en forma paralela sino un poco desplazadas hacia abajo.
-Son cadenas complementarias. Las bases A y T están unidas mediante 2 puentes de H y las bases
G y C mediante 3 puentes de H.

3.3 Estabilización de la estructura del ADN

-Mediante enlaces covalentes.
-Enlaces débiles:
Puentes de H entre las bases nitrogenadas.
Interacciones hidrofóbicas.
Las fuerzas de Van der Waals que generan un dipolo.
Interacciones con cationes, el DNA tiene carga negativa por los grupos fosfatos negativos por lo que
se repelerían, en cambio en el medio hay Mg 2+ que hace que se estabilice y no se separen.

3.4 ADN circular

Los extremos de las hélices forman un enlace y el DNA se queda con forma circular de modo que no
presenta extremos 5’ ni 3’. Este tipo de compactación del DNA es la de todas las células procariotas y
las mitocondrias. Primero giran
ambos extremos en direcciones opuestas para enrollarse y se enlazan formando un DNA circular.
Luego se superenrollado gracias a la topoisomerasa I que debe cortar la hebra e introducirse en ella
para así poder enrollarla pero la topoisomerasa II evita el excesivo enrollamiento cortando ambas
hebras y uniéndose por el otro sentido.

3.5 Células eucariotas

El núcleo contiene la mayor cantidad de DNA. Se encuentra en forma de cromatina al asociarse a
histonas o a un octámero:
-5 histonas, H1, H2A, H2B, H3 y H4. Son ricas en Arg y Lys que son positivas, lo que lo hace
relacionarse con el DNA (-). Su función es la de estabilizar la estructura del DNA.
-La asociación al octámero origina los nucleosomas que están formados por H1 + 2(H2A, H2B, H3 y
H4). La histona 1 se queda separando ambos nucleosomas.

3.6 Estructura de ARN

El ARN o ácido ribonucleico es aquel polímero de nucleótidos formado por una molécula de ribosa
unida mediante un enlace N-glucosídico a uracilo, citosina, adenina y guanina y mediante un enlace
fosfodiéster a un fosfato. Normalmente presenta estructura monocatenaria (1 hebra) aunque hay
algunos virus que presentan una doble cadena. Está íntimamente ligado a la síntesis de proteínas, de
tal forma que si no existiese no se podría traducir el mensaje del DNA.

Tipos de RNA. (monocistrónicas)

En células procariotas y en mitocondrias:
-rRNA: encargado de formar los ribosomas. En las procariotas son 3 (5S, 16S, 23S) y en las
mitocondrias 2 (12S, 16S).
-tRNA: permite la llegada de los aminoácidos a los ribosomas. En las procariotas es una molécula
adaptadora.
-mRNA: lleva la información de los genes hasta los ribosomas para que los traducen y puedan dan
lugar a proteínas y enzimas proteicas.

En las células eucariotas: (policistrónicas)

-rRNA: hay 4 diferentes (5S, 8S, 18S, 28S)
-tRNA.
-mRNA: contiene exones y se han eliminado los intrones.
-hnRNA: es el RNA nucleolar heterogéneo, el precursor del mRNA, aún tiene los intrones.
-snRNA: elimina los intrones del hnRNA.

En las mitocondrias
-rRNA 12S, 16S
-tRNA
-mRNA

3.7 El RNA es químicamente más reactivo que el ADN La

presencia del grupo OH en 2’ de la ribosa es muy importante y afecta a las propiedades del RNA:
-Impide la conformación B de doble hélice.
-Permite un mayor número de interacciones terciarias, es decir, más puentes de hidrógeno por sus
OH.
-Promueve la reactividad química, el RNA es muy lábil de manera que se degrada rápidamente.

3.8 Replicación del ADN

Ni Watson ni Crick consiguieron descifrar cómo el DNA podía replicarse. Se descubrió con el tiempo
que el DNA para poder replicarse necesitaba separar sus hebras y replicar cada una de ellas por
separada.

Con el paso del tiempo y diversos experimentos se pudo deducir que la replicación del DNA es
semiconservativa puesto que, al dividirse las hebras nuevas viajan con aquellas de las que se han
copiado de forma complementaria y antiparalela. Por lo tanto podemos afirmar que surgen dos
nuevas hebras y dos se mantienen.

La replicación puede ser bidireccional desde un origen común hacia la derecha y hacia la izquierda.
La zona de separación de las dos hebras es conocida como horquilla de replicación. Está sometido a
la regulación celular, es decir, que antes de poder dividirse se da la replicación y la reparación si es
necesario. La velocidad
de replicación es de 45000 a 60000 nucleótidos por minuto en cada horquilla, esta velocidad es muy
necesaria ya que el DNA es muy largo y si no tardaría muchísimo en replicarse.

•Replicación del DNA en procariotas.

Como el DNA de las bacterias y el resto de las procariotas es circular, la forma de replicar el DNA
también será circular.

El DNA se replica gracias a la DNA polimerasa, una enzima con una serie de requerimientos:
-Tan solo puede sintetizar en sentido 5’ 3’
-Necesita los 4 dNTPs, si falta uno, no hay síntesis de DNA.
-También necesita Mg2+ que estabiliza el DNA y Zn 2+ que estabiliza el centro activo.
-Esta enzima está dirigida por la cadena molde, es decir, la concentración de un determinado
desoxirribonucleótido no supondrá que aparezca más, ya que se encarga de copiar el DNA.
-Necesita un cebador de RNA preformado para que la enzima pueda ir uniendo los dNTPs a partir de
este.
-La energía necesaria procede del enlace fosfodiéster que libera dos pirofosfatos.

-Cataliza la unión covalente de nuevas unidades de dNTP, por sus grupos α fosfato, al grupo 3’OH
libre de la cadena preexistente.
•DNA polimerasas: (polimerizan DNA)
Encontramos 3 tipos de DNA polimerasa destacamos de ellas sus actividades:
La actividad exonucleasa corrige los errores a la hora de la replicación de bases nitrogenadas,
encontramos en ambas direcciones. La
procesividad es la cantidad de nucleótidos que se añaden sucesivamente sin que se suelte el ADN
polimerasa.

En procariotas, la duplicación del DNA sucede en ambas hebras a la vez, por lo que se produce una
separación entre ambas hebras de DNA, lo que es conocido como horquilla de replicación. En la
hebra que se sintetiza en sentido 5’-3’ la lectura se hace en sentido 3’5’ originando una hebra en
sentido 5’- 3’ esta hebra se conoce como conductora.

La otra hebra es la retardada. Que aunque es 3’-5’, se sintetiza en sentido 5’-3’ en pequeños
fragmentos denominados fragmentos de Okazaki.

Proceso: primero se coloca un cebador de RNA que no necesita nada para comenzar con la
replicación creado por la primasa. Este RNA comienza a sintetizar en el sentido 5’-3’ gracias a una
DNA poli III. En el caso de la hebra conductora, seguirá sintetizando hasta el final pero en el caso
de la hebra retardada, habrá un momento que pare formando un fragmento de Okazaki. La DNA
poli I degrada el RNA con su actividad exonucleasa (5’-3’) y luego rellena el hueco con dNTPs.
Los fragmentos de Okazaki se unen mediante un enlace fosfodiéster por la acción de una DNA
ligasa (OH con P). En la otra horquilla sucede lo mismo, pero al revés.
Para poder formar la horquilla y que, por lo tanto se pueda dar lugar a la replicación de DNA es
necesario que una helicasa rompa los enlaces de puente de hidrógeno. A la vez, se unen unas
proteínas SSB (single-stranded binding protein) que impiden que vuelvan a unir las hebras, ya que
tienen tendencia a unirse. Además la DNA topoisomerasa (girasa) impide el superenrollamiento.
DNA polimerasa III: el lado izquierdo es para sintetizar la hebra continua y el lado derecho para la
hebra retardada.

3.9 Modelo explicativo de cómo se sintetizan las heras de ADN

El único modelo explicativo que permite explicar la formación de fragmentos de Okazaki es que se
forman bucles en la hebra de DNA retardada mientras que la hebra retardada mientras que la
hebra de conducción se transcribe de forma recta y continua. Al formarse un bucle en la hebra
retardada permite que esta se encuentre en sentido de lectura. El fragmento pequeño de Okazaki
bajará cuando se de un pequeño tirón en la hebra.

3.10 Corrección de errores tras la replicación

Como el DNA se replica a tanta velocidad, continuamente comete errores. El mecanismo de
corrección de errores es el siguiente:

3’- A T G A G -5’

5’- T A G -3’ Se nota un ensanchamiento.

La exonucleasa con sentido 3’-5’ va pasando y nota un estrechamiento en la hélice si son bases
pirimidínicas o un ensanchamiento si son bases púricas al avanzar la poli III lo detecta y elimina la
base para que se replique de forma correcta.

5’- A T G A G -3’

3’- T A C -5’

3.11 Iniciación de la replicación

Para que se inicie la replicación es necesario que el DNA presente un origen de replicación. En el
DNA circular, presenta el ORIC, que tiene una estructura única. Sólo tiene este punto de inicio.

● Tres secuencias en tándem de trece pares de bases (GATCTNTTNTTTT)

● Y luego hay cuatro fragmentos de nueve pares de bases. (TTATCCACA)

Para saber que es una secuencia de inicio, se corta el fragmento de ADN y se añade a otra
cadena, si se empieza a replicar, es la señal necesaria para saber que es una secuencia de inicio.
En la zona de las cuatro secuencias participan unas proteínas DnaA, de forma que se quedan en
el interior de un bucle, se abre la horquilla de replicación y puede iniciarse la replicación.

3.12 Replicación en eucariotas

El proceso es similar al de las procariotas pero las polimerasas son muy diferentes y múltiples
orígenes de replicación.

•DNA polimerasas
-α: Inicia la replicación, equivale a la primasa de las procariotas
-δ: es la verdadera polimerasa, equivale a la ADN polimerasa III
-γ: es la DNA polimerasa mitocondrial
-β, ε: se encargan de la reparación del DNA como la DNA polimerasa II

•Esquema de replicación en virus

-Antígeno T: abre el DNA como la DNA helicasa.
-Factor de replicación A (RFA): equivale a la proteína SSB que hace que las hebras no se
cierren.
-DNA polimerasa α: sintetiza el i-DNA (cebador). Como la primasa.
-Factor de replicación C: estimula la DNA polimerasa α
-PCNA: desplaza la DNA polimerasa α. Actúa como factor de procesividad unido a DNA
polimerasa δ
-DNA polimerasa δ: permite la elongación del DNA teniendo una función similar a la del DNA
polimerasa III.
-MF1: es una exonucleasa con sentido 5’-3’ que elimina el RNA de los fragmentos de Okazaki.
Ese DNA que elimina acaba siendo rellenado por la DNA polimerasa δ.
-DNA ligasa: une los fragmentos una vez que se le han retirado el RNA a los fragmentos de
Okazaki de la hebra retardada.
-Topoisomerasa I: evitan el superenrollamiento
-Topoisomerasa II: actúa de forma indistintamente, enrollando y desenrollando libremente.
3.13 Transcripción de ARN
El proceso de transcripción es el proceso por el cual se crea RNA a partir de DNA con el objeto de
dar en un futuro la síntesis de proteínas. La transcripción del DNA siempre se origina en la hebra
3’-5’ y se forma una hebra de RNA antiparalela y complementaria (pero presentando uracilo en
vez de timina).
Debido a que esa hebra de RNA presenta un sentido 5’-3’ a veces se emplea como modelo la
hebra que no se transcribe, debido a que es igual que la del RNA, pero presentando timina en
lugar de uracilo. Por ello hablamos de hebra codificante (la que no se transcribe pero contiene los
“codones” al presentar los tripletes que el mRNA que se formará) y hebra molde (a partir de la cual
transcribimos el RNA).

Mientras que la replicación replicaba todo el DNA, la transcripción es selectiva, ya que es posible
que a la célula tan solo le interese crear una determinada proteína o incluso que se deba a que se
encuentra muy compactada, lo que impide su transcripción. Además, la selección de la
información genética a transcribir depende del espacio, el tiempo y la edad, ya que por ejemplo
hay genes que sólo se transcriben en edad fetal, en edad embrionaria o en etapa adulta (como la
hemoglobina). Cabe destacar que esto dependerá del tejido en el que se encuentre la célula que
transcribe el DNA a RNA.

La síntesis de RNA lo realiza la RNA polimerasa que es DNA dependiente, lee la hebra y la pasa a
RNA

Características
-Depende del molde de DNA, controla la entrada de los nucleótidos por complementariedad con el
molde.
-Requiere la presencia de los 4 NTPs.
-Requiere Mg2+ (estabiliza hebras) y Zn2+ (en el centro activo).
-A→U TCG→AGC
-Dirección de síntesis 5’-3’
-Es una reacción que cataliza al crear el enlace fosfodiéster con OH en C 2’ y se liberan piruvatos.
-No requiere un cebador
-Empieza por el trío de bases ATP o GTP
-El molde se conserva completamente.
-No tiene actividad exonucleasa, si entra un NTP equivocado se queda en el mismo lugar. El RNA
se degrada muy rápido por lo que no importa que haya errores ya que se va a eliminar y no es de
gran importancia.
-La velocidad de síntesis es mucho menor que la replicación del DNA para no equivocarse.
-El primer nucleótido conserva su trifosfato ya que no tiene enlace con ningún otro

3.14 Transcripción de procariotas

Actúa una sola RNA polimerasa bacteriana, que transcribe todos los nucleótidos. Está dividida en
cinco subunidades, RNA polimerasa α 2ββ’σ
-α: se encarga de reconocer el promotor, relacionadas con el inicio de la transcripción.
-β: es la subunidad catalítica, es decir, es la verdadera enzima, se encarga de formar los enlaces
fosfodiéster que unen los ribonucleótidos.
-β’: mantiene unida la RNA polimerasa a la hebra molde del RNA.
-σ: reconoce la secuencia promotora que inicia la transcripción.

3.15 Etapas de la transcripción

1.Iniciación
Se une la RNA polimerasa a la secuencia promotora que dirige la transcripción. Este promotor es
reconocido por la subunidad σ de la RNA polimerasa. 7
-Estas secuencias promotoras son TGTTGACA región -35 (…) TATAAT región -10 (…). Se
inicia la transcripción. Caja TATA.
Esta secuencia es muy importante ya que se pueden producir cambios, por lo que hay que tener
en mente que cuanto más se parezca la secuencia real a esta, mejor funcionará la transcripción.

Antes de producirse la apertura del DNA, el complejo está cerrado, pero cuando se abre (por la
caja tata ya que solo hay dos enlaces H entre las bases al ser A y T) el DNA, se da el complejo
abierto que supone el inicio de la transcripción uniéndose 9 ribonucleótidos. Como la enzima
necesita moverse a lo largo de la hebra molde, se deshace de la subunidad σ que la anclaba, lo
que le permite avanzar. La subunidad σ pierde su función y se degrada

2 Elongación
Al darse el complejo abierto se forma una burbuja a partir de la cual se van uniendo los
ribonucleótidos a lo largo de la hebra. Esta burbuja tiene unos 17 NTPs. Mientras se forma, el
RNA y DNA están unidos. Conforme avanza la transcripción, avanza la burbuja por lo que se
siguen rompiendo enlaces de H del DNA por un extremo de la burbuja y por el otro se unen.
Se piensa que la RNA polimerasa también presenta función helicasa para abrir el RNA.

3 Terminación

Puede darse mediante dos mecanismos diferentes:

1. Dependiente de secuencia: se produce cuando la enzima llega a una zona con simetría radial,
es decir, dentro de la misma hebra hay un punto que presenta bases complementarias a su
derecha e izquierda, lo que es conocido como secuencias autocomplementarias que se unen. Se
forma una horquilla al replicarse por la unión de las bases complementarias y por un tirón salen
los uracilos. Teniendo como resultado un fragmento de RNA suelto que podrá realizar diferentes
funciones ligadas con la síntesis de proteínas.
2. Dependiente de rho ρ: la RNA polimerasa no replica a velocidad constante ya que presenta
diferentes pausas a lo largo de su transcripción. Las proteínas que se emplean para separar el
RNA del DNA en la terminación de la transcripción son las proteínas ρ. Estas proteínas necesitan
ATP, además de tener una función helicasa en su desplazamiento 5’-3

3.16 Transcripción en eucariotas

La primera diferencia es que en las procariotas el RNA se traduce conforme se sigue
transcribiendo, debido a que presenta una corta vida y no hay una membrana nuclear que lo
separe de los ribosomas. Sin embargo, en el caso de las células eucariotas, el RNA sólo se
traduce en el momento en el que acaba de ser transcrito y puede salir del núcleo hasta el
citoplasma de la célula. Además, en eucariotas no se forma directamente el mRNA, si no que se
transcribe un transcrito primario del RNA conocido como hnRNA.

En eucariotas encontramos cuatro o cinco modelos distintos de RNA. Estos RNA son transcritos
no solo por tres RNA polimerasa, lo que constituye otra diferencia más en el proceso en
eucariotas. Estas tres RNA polimerasa son:

También encontramos en las células eucariotas, la RNA polimerasa mitocondrial y la RNA

polimerasa de cloroplastos en las plantas que tan solo se encuentran en vegetales.

Se necesita un promotor que indique el inicio de la transcripción del ARN polimerasa II

-Región -75 : Caja CAAT
-Región -25: Caja TATA
-Caja GC que puede colocarse en cualquier región y potencia la transcripción.

Se necesitan factores de transcripción que son proteínas sin las cuales, la transcripción no tendría
lugar. Los factores no se unen a la RNA polimerasa si no que primero se unen al promotor (cajas)
que lo reconocen y luego la RNA polimerasa se une a los factores. Los factores de transcripción
son señales de dónde tiene que unirse la RNA polimerasa, se sueltan los factores y la RNA poli
empieza a transcribir.
Todos los RNAs que se originan lo hacen en forma de precursores, se deben modificar antes de
su uso.
Los mRNA en células eucariotas presentan una cola de poli(A) en el extremo 3’ que lo protegen
de la destrucción enzimática. Ese mRNA de eucariotas presenta en su extremo 5’ un casquete
que mantiene la estabilidad y le permite ser reconocido.

3.17 Maduración del ARN

Consiste en la eliminación de los intrones en la cadena de RNA y la unión de los exones. Este
proceso tiene varias partes:
-Adición de una capucha.
Se elimina el último fosfato de un NTP y se une la secuencia GTP. De modo que se une un Gp al
segundo fosfato que quedaba libre y se forma la capucha. Por último se metila añadiendo un
metilo en el extremo. Esta capucha evita la degradación en el sentido 5’-3’ del mRNA implica que
se pueda traducir posteriormente.
-Adición cola poli A.
Se añaden unos 250A en los mamíferos. Hace falta la secuencia AAUAAA en el extremo 3’ que se
añade tras el corte del RNA en el interior del núcleo.
Cuando pasa del núcleo al citoplasma disminuye el número de aminoácidos.
No se sabe muy bien su utilidad pero se cree que puede ser semejante a la capucha pero en el
sentido 3’-5’. Se pensó también que podía ser para facilitar el paso desde el núcleo al citoplasma
pero se desmintió.

-Eliminación de los intrones. (splicing)

Se necesita una señal para saber dónde ha de cortarse el intrón.
El intrón empieza por GU y termina por AG y entre medias tiene que haber una base A llamado
punto de ramificación que no es fijo

Ej.( Diapo) Si ocurre una mutación y hay otro TTAG antes, cortará allí y se quedará la hebra más
larga dando lugar a la enfermedad de la talasemia.

El grupo OH está libre en los NTP y ataca al fosfato entre el fin del exón y el inicio del intrón y deja
al fosfato unido al C2’. El exón ataca al fosfato del otro exón y lo corta dejando el intrón suelto.

Esto debería ocurrir en orden para que no haya equivocaciones pero tiene lugar el splicing
alternativo: el mismo gen puede generar diferentes RNA para traducir diferentes proteínas.
 En este proceso de eliminar los intrones participan los snRNA.
-U1: se une al 5’ de manera complementaria.
-U2: se une a la ramificación de aminoácidos.
-U3: se une al extremo 5’.
-U4 y U6: tienen la acción catalítica.

Se forma un corpúsculo con los snRNA llamado espliceosoma y participa en el splicing. Se forma
un lazo y se corta por el GU y el AG

3.18 Biosíntesis de proteínas y traducción del mensaje genético

El código genético
Es el conjunto de reglas que define la traducción del mensaje contenido en el DNA. La unidad
fundamental del código genético son los codones, que son las agrupaciones de tres NTP
formados en el mRNA.

• Los aminoácidos se codifican por los codones

-61 codones para los aminoácidos y 3 STOP
-AUG es el codón de inicio que codifica la Met
-UAG, UAA, UAG son los codones de terminación.

-Se hace una lectura continua de tres en tres no hay paradas, no solapante entre bases, sin
puntuación, no tiene pautas para la lectura correcta y en fase, el codón de inicio y el de
finalización se encuentran formados por 3 NTPs.
-Redundante o degenerado: varios codones codifican el mismo AA. Nunca 1 codón codifica
diferentes aminoácidos pero sí un aminoácido es codificado por varios codones.
-Es universal aunque hay excepciones. En mitocondrias es muy diferente.

3.19 Biosíntesis de proteínas

Es el proceso biosintético más complicado ya que participan más de 300 moléculas. Es muy
rápido a pesar de su complejidad. El proceso de lectura del mRNA 5’-3’, se sintetizan las proteínas
de N-terminal a C-terminal.

Se encarga de llevar la información genética del DNA a los ribosomas para que sea posible la
unión de varios aminoácidos.

-En procariotas el RNA es policistrónico, el mismo RNA lleva varios genes.

-En eucariotas el RNA es monocistrónico, solo llevan el gen de una proteína.
-En la mitocondria de los vertebrados, el mRNA no tiene tramo codificante en 5’ sólo ni tiene la
cadena de poli A en el extremo 3’.
Su función es transportar el aminoácido hasta donde se produce la síntesis de proteínas. Presenta
cadenas sencillas de 73-93 nucleótidos y son bases poco comunes como derivados metilados,
inosina, pseudouridina, ribotimidina, etc. Cuando se sintetizan las bases UACG posteriormente se
generan derivados de estos.

Tiene 4 tallos y uno que puede variar en tamaño, y también tiene 3 bucles.
Empieza por G y terminan en 3’OH con CCA. Puede estar codificado en el DNA y transcribirse al
RNA o puede añadirse tras la transcripción. A la ribosa de la última base (A) será donde se una el
aminoácido, en el C3’ OH.
El anticodón lee el codón del rRNA y es Py-U-X-Y-Z-Pum-N

Nomenclatura: tRNA (cualquier RNA), tRNA Ala (RNA específico de la alanina), Ala-tRNA Ala (RNA
cargado con alanina)
Las posiciones del anticodón van al revés del codón

Hipótesis de balanceo

Las uniones no son tan estrictas, ya que cuando la primera base del anticodón se une a la tercera
del codón no solo puede unirse un nucleótido, se pueden unir varios, como se muestra en la tabla.
Por ejemplo, la primera base del anticodón si es inosina puede unirse con uracilo, citosina o
adenina y si es guanina con cualquiera de las dos purinas, es decir con uracilo o con citosina. Esto
es lo que origina que no haya 61 tRANs sino 34

Forman parte de los ribosomas en su interior se produce la síntesis de las proteínas. Los
ribosomas se forman por distintos rRNA de diversos cocientes de sedimentación (tamaño), este
valor depende de la célula donde se encuentre.

Procariotas: 70S. Con una subunidad mayor 50S y una menor de 30S.
-Mayor: rRNA 5S, 23S y 33 proteínas.
-Menor: rRNA 16S y 21 proteínas.

Eucariotas: 80S. Subunidad mayor 60S y menor de 40S.

-Mayor: rRNA 5 '8S, 5S y 28S, además de 49 proteínas.
-Menor: rRNA de 18S y 33 proteínas.
El tRNA está compuesto por una sola cadena y presenta tres sitios o centros de gran importancia
para la síntesis de proteínas:

1. Sitio A (aceptil): sirve para la entrada de los tRNA unidos a los aminoácidos en el ribosoma.
2. Sitio P (peptil): es el sitio del ribosoma en el que se queda el péptido.
3. Sitio E (empty): es el que sirve para la salida de los rRNAs sin aminoácidos, ya que ya los han
cedido.

3.20 Biosíntesis de proteínas

Es el proceso biológico más complejo, participan más de 300 moléculas. A pesar de esta
complejidad, la velocidad de codificación en el caso de la E.coli es de 20AA/s.
La lectura del mRNA en los ribosomas se produce en sentido 5’-3’.

Para comenzar la síntesis, es necesaria la activación de los aminoácidos, mediante la siguiente

reacción:

AA + ATP → AA-AMP + PPi

AA-AMP → AA-tRNA + AMP

AA + ATP + AA-AMP → AA-AMP + AA-tRNA + AMP + PPi

Ambas reacciones están catalizadas por la enzima aminoacil tRNA sintetasa.

Hay dos tipos de aminoácidos:

-Clase I: el aminoácido se une al OH en C2’ de la adenosina que tras una isomerización, pasará a
estar en el C3’.
-Clase II: el aminoácido se une directamente con el OH del C3’.

La activación de los aminoácidos tiene una gran importancia ya que si eso no sucede las
proteínas que se originan no tendrían función.

Si hay un fallo en la toma del aminoácido, existe un sistema de control. El aminoácido que se vaya
a unir al tRNA entrará por el centro de activación (acilación), donde se une al tRNA. Si se tomase
un aminoácido más grande que el correcto, no podría entrar y si se tomase uno más pequeño, la
enzima tiene un compartimento denominado centro de hidrólisis (corrector) en el que solo pueden
entrar los aminoácidos que son más pequeños que en el centro activo. Por tanto, si entra, se
hidroliza impidiendo que ese fallo fuese a la futura proteína. Ej, entre la valina e isoleucina (mayor)

Tras este proceso ya no ocurre ninguna corrección de errores más. Si este proceso no existiese,
la síntesis de las proteínas sería errónea.
3.21 Iniciación

En procariotas la traducción comienza con una formilmetionina en la posición AUG. Pero si a lo

largo de la cadena vuelve a haber un AUG, se codifica con metionina.

En el RNA también hay una secuencia que indica que debe comenzarse la traducción, ya que
antes del indicador hay una secuencia rica en purina (AGGAAGGU) que es complementaria al
rRNA procariótico.

Paralelamente, el ribosoma se encuentra separado. En la subunidad menor, el sitio A se une con

el factor de iniciación IF1 y en un extremo del ribosoma se une el factor de iniciación IF3, de forma
que se pueden separar las subunidades. Tras esto llega el mRNA y avanza hasta que el triplete
que codifica a la primera metionina (AUG) se sitúa en el centro P (apareamiento codón y
anticodón). en ese momento llega la formil-metioniltRNAfMet. La entrada del aminoacil se da
gracias al IF2 y a GTP, que aporta la energía necesaria.

En ese momento tan solo el tRNA de iniciación (junto a la metionina formilada) entra en el sitio P,
siendo el único aminoacil-tRNA que entra al ribosoma sin pasar por el sitio A. en ese momento el
GTP anterior se hidroliza dando lugar a GDP+Pi, lo que permite la liberación de los factores de
iniciación IF1, IF2, IF3. Al quitar el IF3 se permite que se pueda unir la subunidad mayor, de forma
que formamos el complejo ribosómico. (A vacío y P con tRNA)

3.22 Elongación
Adición de un segundo AA: para este paso es necesaria la presencia de un factor de elongación
llamado EF-Tu-GTP-AA’tRNAAA’ + GTP. El nuevo aminoacil-tRNA se coloca en el sitio A, lo que
supone la hidrólisis del GTP que generará GDP+Pi.

Con ello se libera el tRNA con el aminoácido, además de liberarse el factor de elongación Tu para
buscar otro aminoacil-tRNA que sufrirá reacciones en las que interviene otro factor de elongación
que es el ETFs.
Formación de un enlace peptídico: uniéndose el aminoácido que estaba en P y el de A, de modo
que P se queda vacío y en A tenemos un dipéptido.

Translocación: El EF-GTP se mueve en el ribosoma 3NTPs hacia el extremo 3’, entonces el tRNA
se mueve al espacio E (empty), en el P queda el dipéptido y en el espacio A entrará otro
aminoácido
3.23 Terminación
En P se acaba quedando el polipéptido y en A entre un codón de terminación AUG. Como no hay
RNA complementarios a esta secuencia, tiene lugar la terminación de la traducción.

Entra el factor liberador TRF y se separan el polipéptido, el tRNA y las subunidades del ribosoma
para poder volver a iniciar la síntesis del RNA.
La peptidil transferasa es una actividad que une los péptidos asociada a 5 proteínas ribosómicas
de la subunidad 50ª, pero el centro catalítico está en el rRNA 23S se le llama la verdadera enzima.
Hay enzimas que son RNA ribosomas por ser unos vestigios ancestrales.

3.24 Los polisomas

El mRNA está unido a varios ribosomas que lo van traduciendo constantemente. El RNA tiene
unos 2-3 minutos de vida por lo que hay varios puntos de síntesis de las proteínas

3.25 Síntesis de proteínas en eucariotas

El proceso es muy similar pero presenta más factores de elongación y varias diferencias con el
proceso en las procariotas.
En las células eucariotas, los ribosomas presentan un mayor tamaño (80S).

El primer aminoácido es llevado por tRNA y es metionina sin formular Met.

La señal de iniciación es el primer AUG tras la caperuza. Si hay otro después no se codifica con
Met si no con fMet ya que existe un tRNA iniciador y otro tRNA interno.En el caso de la
terminación, solamente presenta un tipo de RF.

Asimismo, podemos observar una serie de diferencias en la formación del complejo ribosomal.
Esto hace referencia a que antes de que entre el mRNA, ya ha entrado el tRNA, de forma que el
ribosoma se coloca sobre el mRNA dándose el apareamiento codón-anticodón. Tras ello se coloca
la subunidad mayor.

Es necesario añadir que en células eucariotas el mRNA presenta un precursor, el hnRNA. Por
tanto, cuando acaba la transcripción y se une la cola poli(A) y se forma la caperuza, no se obtiene
el mRNA, sino un transcrito primario, que tras el splicing conseguiremos transformar en mRNA.

Además, eucariotas el mRNA se coloca casi en forma circular para su lectura

3.26 Antibióticos que pueden modificar la síntesis de proteínas

Podemos encontrarnos antibióticos que inhiban la síntesis de proteínas en las células, por lo que
tiene una verdadera importancia estudiarlos:

-Streptomycim y otros aminoglycosides: inhiben la iniciación, de forma que ya no se puede

producir la síntesis y aquellas traducciones que hayan empezado, acabarán siendo lecturas
erróneas.
-Tetraciclina: se une a la subunidad ribosómica de 30S en procariotas impidiendo que se una el
segundo aminoácido, lo que supone que la síntesis de proteínas se pare.
-Chloromphenicol: inhibe la peptidil transferasa en procariotas y también la síntesis proteica en las
mitocondrias.
-Ciclohexamida: inhibe la peptidil transferasa en eucariotas.
-Eritromicina: se une a la subunidad 50S de los ribosomas de las células procariotas
impidiendo la translocación.
-Puromicina: supone la terminación prematura de la síntesis de proteínas (con estructura simular
a la del tRNA, lo que permite que se acabe la síntesis, al no ser un tRNA).