Tercer Parcial:

Materia: Bioquímica 1

Profesor: Carlos Alfonso Santos González

Carrera: Nutrición y Salud

Péptidos

Capitulo 3 Lehninger; Capitulo 3 Harper; Capitulo 5 McKee

Péptidos

¤ Son moléculas biológicas formadas por la unión covalente de dos o

más aminoácidos.

¤ La unión covalente entre los aminoácidos de un péptido es un

enlace tipo amida que se denomina enlace peptídico, y se forma
por la eliminación de una molécula de agua (deshidratación).

¤ Aunque en su mayoría son sintetizados por los ribosomas bajo

instrucciones genéticas, un número reducido de ellos especialmente
en hongos y bacterias son producidos mediante la acción de
enzimás (síntesis no ribosómica).

¤ Su estructura puede ser lineal, ramificada o cíclica.

¤ Usualmente contienen L-aminoácidos, pero pueden incluir D-aa.

¤ Las propiedades de un péptido dependen de los grupos “R”

presentes en sus aa constituyentes.
Enlace Peptídico
¤ Cada péptido presenta un grupo amino
libre en un extremo, y en el otro extremo
de la cadena un grupo carboxilo libre.

¤ El primer aa se denomina extremo Trans

amino-terminal (N-terminal) y el último
aa se denomina carboxi-terminal (C-
terminal).

¤ Cada aa en un péptido se denomina Trans

“residuo”.

¤ Se nombran comenzando por el

extremo N-terminal y desginando cada
residuo como el sustituyente acil del
grupo α-amino del siguiente aa. El
último aa conserva su nombre ya que
no es sustituyente.

¤ ¿Cuál será la carga del péptido a pH

fisiológico? Seril-Glicil-Tirosil-Alanil-Leucina
Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu
S-G-Y-A-L
Clasificación

¤ Oligopéptidos: péptidos que tienen entre 2 y 10 aa.

¤ Dipéptidos, tripéptidos, tetrapéptidos, pentapéptidos,
hexapéptidos, heptapéptidos, octapéptidos, nonapéptidos,
decapéptidos.

¤ Polipéptidos: Péptidos que poseen entre 11 y 50 aa.

¤ Proteínas: Péptidos que tienen más de 51 aa en us

molécula.
Funciones Biológicas
¤ Edulcorantes.

¤ Amortiguamiento del pH en células musculares.

¤ Cofactores enzimáticos.

¤ Neurotransmisores.

¤ Hormonas.

¤ Antibióticos.

¤ Inmunosupresores.

¤ Factores de crecimiento.

¤ Agentes vasoactivos.

¤ Inductores de malformaciones.
Aspartame Y Carnosina
¤ ASPARTAME
¤ Es el éster metílico de un dipéptido formado por
Ac. Aspártico y fenilalanina.
¤ Endulzante artificial bajo en calorias, 200 más
potente que la sacarosa.
¤ No produce caries debido a que no es un azúcar.
¤ La presencia de fenilalanina en su molécula es un
riesgo para individuos con fenilcetonuria.

¤ CARNOSINA
¤ Dipéptido: β-Alanina y L-Histidina
¤ Con un pKa 6.9 cumple un papel de buffer en los
músculos, neutralizando el ácido lactico producido
durante la actividad física.
¤ El 30% del amortiguamiento del pH en el cuerpo
humano es por la carnosina.
¤ También ocurre en corazón, cerebro, hígado y
otros tejidos.
¤ Funciona también como agente antioxidante. β-Alanina L-Histidina
¤ Neurotransmisor (información sensorial olfatoria).
Glutatión
¤ Tripeptido: Glu-Cys-Gly.

¤ Encontrado en plantas, animales y bacterias.

¤ Sufre oxidación-reducción reversible.

¤ Protege de los radicales libres y ROS.

¤ Mantiene el Fe2+ reducido en la hemoglobina y

mioglobina.

¤ Incorpora leucotrienos.

¤ Transporte de aa a través de la membrana.

¤ Cofactor enzimático.

¤ Desintoxicación del hígado.

¤ Su carencia provoca: desordenes articulares,

enfermedades cardíacas, cáncer, problemas
endócrinos, inmunológicos y nerviosos..
Péptidos Vasoactivos
¤ Péptidos que ejercen una acción constrictora de los vasos
sanguineos, ocasionando una elevación de la presión sanguínea.

¤ Las angiotensinas se producen a partir de una proteína

precursora llamada angiotensinógeno, molécula sin actividad
biológica.
¤ Angiotensina I (Decapéptido ).
¤ Angiotensina II (Octapéptido).
¤ Angiotensina III (Heptapéptido).

¤ La calidina (decapéptido) y bradiquinina (nonapéptido) se

producen a partir del quininógeno:
¤ Forman parte de moléculas mediadoras de la respuesta inflamatoria.
¤ Producen dolor, vasodilatación, incremento de la permeabilidad
capilar, edema y estimulan la síntesis de prostaglandinas.
Péptidos Hormonales
¤ Son aquellos péptidos que actúan como señales, al interactuar con un
receptor específico instalado en la membrana de una célula regulan su
fisiología y en consecuencia la del tejido u órgano.

¤ Oxitocina:
¤ Nonapéptido sintetizado por la hipófisis.
¤ Actúa sobre el útero provocando contracción del músculo uterino durante el
parto.
¤ En posparto estimula la secreción de leche por las glandulas mamarias.

¤ Vasopresina:
¤ Nonapéptido producido por la hipófisis.
¤ Efecto antidiurético. Promueve la reabsorción de agua por el riñon.
¤ Contracción de musculo liso de vasos sanguineos.

¤ Somatostatina:
¤ Tetradecapéptido sintetizado por el hipotálamo y páncreas.
¤ Actua sobre la hipófisis inhibiendo la producción de la HGH.
¤ Actúa en páncreas controlando la liberación de insulina y glucagon.
Antibióticos Peptídicos
¤ Gramicidina S:
¤ Decapéptido producido por la bacteria Bacillus brevis.
¤ Perfora la membrana celular permitiendo la salida de cationes
monovalentes (K+, Na+, H+). Agente ionóforo.

¤ Penicilina:
¤ Producido por hongos del género Penicillum.
¤ Inhibe la síntesis de peptidoglicano (pared celular bacterias).

¤ Bacitracina:
¤ Dodecapéptido producido por Bacillus licheniformis.
¤ Inhibe la síntesis de peptidoglicano .

¤ Actinomicina D:
¤ Producido por bacterias del género Streptomyces.
¤ Se intercala en el DNA inhibiendo la transcripción.
¤ Se usa como droga anti-cáncer.
Péptidos Neurotransmisores
¤ Met-Encefalina:
¤ Pentapéptido (YGGFM).
¤ Reductor del dolor.
¤ Indispensable para la memoria.

¤ Leu-Encefalina:
¤ Pentapéptido (YGGFL).
¤ Control endógeno del dolor.
¤ Menos potente que la Met-encefalina (20 veces menos).

¤ β-Endorfina:
¤ 31 aminoácidos.
¤ Control endógeno del dolor.
¤ Produce sed y hambre (favorece obesidad).

¤ Dinorfina:
¤ Tridecapeptido Producido por la hipófisis.
¤ Cambios en el balance hidrosalino del cuerpo.
Péptidos Inmunosupresores y Factores de Crecimiento

¤ Ciclosporina:
¤ Metabolito del hongo Tolypocladium inflatum gams.
¤ Se administra en pacientes con transplantes debido a su acción
inmunosupresora.
¤ Se administra en enfermedades autoinmunes como la artritis reumatoide,
psoriasis y la enfermedad de Crohn.

¤ Factor de Crecimiento Epidérmico: EGF

¤ 53 aminoácidos.
¤ Sintetizado por glándulas submaxilares.
¤ Estimula el crecimiento de diversos tipos de celulas en el desarrollo prenatal y
neonatal.

¤ Factor de Crecimiento Derivado de Plasma: PDGF

¤ Sintetizado por plaquetas durante la coagulación sanguínea.
¤ Estimula el crecimiento de las células del tejido conectivo, fibras musculares
lisas y células de la glia, favoreciendo la cicatrización.

¤ Factor de Crecimiento Esquelético: SGF

¤ Estimula el crecimiento de las células óseas.
Proteínas

Capitulo 3 y 4 Lehninger; Capitulo 4 y 5 Harper; Capitulo 5 McKee

Proteínas
¤ Son las biomoléculas más abundantes en cualquier organismo
vivo, llegan a representar más del 50% de su peso seco.

¤ Resultan de la asociación de más de 51 aa.

¤ Sus pesos moleculares oscilan entre los 5,000 Da hasta más de 50

millones de Da.

¤ A la totalidad de proteínas que están presentes en una célula se le

llama proteoma. El proteoma es más grande que el genóma.

¤ El proteoma de una célula cambia constantemente en respuesta

a los cientos de miles de señales intra y extracelulares que se
generan a medida que se ensamblan las proteínas nuevas y
destruyen las que ya no se necesitan.

¤ Al estudio de la estructura y propiedades de las proteínas se le

llama proteómica.
Proteínas

¤ Proteínas Monoméricas: Consisten de

una sola cadema polipétidica.

¤ Proteínas Oligoméricas: Formadas por

la asociación de varias cadenas
polipeptídicas, que pueden ser o no
similares entre sí.

¤ La polimerización de aa en una célula

es efectuada por los ribosomas.
Funciones
¤ Estructurales: Colágena, queratina, ¤ Digestivas: Tripsina.
espectrina, flagelina, fibroina.
¤ Coagulación sanguinea: Fibrina,
¤ Catalíticas: Enzímas. fibrinógeno, trombina.

¤ Defensa: Anticuerpos, Interferón. ¤ Hormonales: Insulina, HGH, Glucagon.

¤ Contracción y motilidad: Actina y ¤ Reservas (almacenamiento):

miosina, dienina. Albumina de huevo, caseína (leche).

¤ Transporte: lipoproteínas, ¤ Receptoras: Lectinas, integrinas,

hemoglobina. proteínas CD.

¤ Comunicación de membrana: ¤ Cromosómicas: Histonas.

Aquaporinas y canales iónicos.
¤ Expresión Génica: Factores de
¤ Transferencia de electrones: transcripción.
Citocromos.
¤ Tóxicas: Toxinas microbianas
¤ Ribosomales: Forman el ribosoma. (Tetanos), venenos animales.

¤ De la visión: Rodopsina (pigmentos ¤ Chaperonas: Plegamiento correcto

fotosensibles). de otras proteínas.
Clasificación-Forma
¤ En base a su forma, las proteínas se clasifican
en dos categorías:

¤ Proteínas fibrosas (forma alargada). Que

generalmente cumplen funciones
estructurales.
¤ Varias cadenas polipeptídicas asociadas entre sí.
¤ Insolubles en agua y soluciones salinas.
¤ Resistentes a la degradación química y
biológica.

¤ Proteínas globulares (forma compacta casi

esférica). El resto de las funciones.
¤ Se encuentran en el citoplásma o asociadas a la
membrana plasmática.
¤ Hidrofílicas en su superficie.
¤ Solubles en agua y soluciones salinas.
¤ Su estructura es sumamente labil afectada por
factores físicos y químicos.
¤ Susceptibles a la degradación química y
biológica.
Clasificación-Composición

¤ Considerando su composición química las proteínas se

clasifican en:

¤ Proteínas simples: Aquellas constituidas exclusivamente por L-

aminoácidos.

¤ Proteínas conjugadas: Aquellas que además de los L-aa

incluyen como parte de su estructura un componente orgánico
o inorgánico, el cual se denomina grupo prostético.

¤ Proteínas derivadas: Son aquellas que se obtienen a partir de las

proteínas simples o de las conjugadas mediante tratamiento
térmico o por la acción de procesos enzimáticos.
Proteínas Conjugadas

¤ Glicoproteínas. ¤ Metaloproteínas.

¤ Mucoproteínas. ¤ Porfirinoproteínas.

¤ Fosfoproteínas. ¤ Lipoproteínas.

¤ Flavoproteínas. ¤ Biliproteínas.

¤ Nucleoproteínas.
Proteínas Conjugadas

¤ GLICOPROTEÍNAS
¤ Su grupo prostético es un oligosacárido.
¤ Inmunoglobulinas.
¤ Lectinas.
¤ Colágena.

¤ MUCOPROTEÍNAS
¤ Su grupo prostético es un heteropolisacárido.
¤ Proteoglicanos.

¤ FOSFOPROTEÍNAS
¤ Su grupo prostético es un gurpo fosfato.
¤ Caseína de la leche.
¤ Vitelina de la yema de huevo.
Proteínas Conjugadas
¤ FLAVOPROTEÍNAS:
¤ Su grupo prostético es una molécula de FAD+ o
FMN+ el cual en ciertas proteínas puede estar unido
covalentemente mientras que en otras no.
¤ Succinato deshidrogenasa.

¤ NUCLEOPROTEÍNAS:
¤ Su grupo prostético es un ácido nucleico DNA o
RNA.
¤ Ribosomas.
¤ Nucleosomas (DNA+Histonas).
¤ Virus y fagos.

¤ METALOPROTEÍNAS:
¤ Su grupo prostético es cualquier átomo metálico.
¤ Superóxido dismutasa (Zn y Cu).
¤ Alcohol deshidrogenasa (Zn).
h t t p s : / / t w i t t e r. c o m / m o l e c u l d / s t a t u s /
721397664210952197
Proteínas Conjugadas
¤ PORFIRINOPROTEÍNAS:
¤ Su grupo prostético es un anillo de porfirina
que incluye Fe o Cu en su interior.
¤ Hemoglobina y mioglobina.
¤ Citocromo P-450

¤ LIPOPROTEÍNAS:
¤ Su grupo prostético es un lípido.
¤ HDL (colesterol bueno).
¤ LDL (colesterol malo).
¤ Rodopsina y bacteriorodopsina (tienen
retinol y retinal respectivamente).

¤ BILIPROTEÍNAS:
¤ Su grupo prostético es un tetrapirrol lineal
llamado “bilina” capaz de absorber luz.
¤ Son pigmentos que aparecen en las algas
rojas y cianobacterias.
¤ Ficoeritrina.
Estructura Protéica

¤ Niveles de organización de la
estructura de proteínas.
¤ Estructura primaria.
¤ Estructura secundaria.
¤ Estructura supersecundaria.
¤ Estructura terciaria.
¤ Estructura cuaternaria.
¤ Estructura quinaria.
Estructura Primaria
¤ Se refiere al esqueleto de la cadena
polipeptídica formada por la unión de los aa.

¤ Proporciona información respecto a:

¤ La identidad de los aa que conforman la
cadena.
¤ La cantidad relativa de cada aa que hay en la
proteína.
¤ Secuencia exacta de los aa en la cadena.
¤ Identidad y cantidad de cualquier grupo
prostético presente.
¤ La estructura primara contiene toda la
información necesaria para dirigir el
plegamiento tridimensional de la proteína.
Estructura Primaria
¤ La comparación de la estructura primaria de una misma
proteína en especies diversas, tiene un enorme interés desde los
puntos de vista funcional y filogenético (evolutivo).

¤ Entre más diferencias se observen en la estructura primaria de

proteínas análogas, más alejadas estarán esas especies en el
árbol filogenético.

AA dist. Chimpanc Oveja Cascabel Cabra Caracol Levadura Coliflor

é
Cit. C
Humano 0 10 14 18 29 44 44
Chimpan. 10 14 18 29 44 44
Oveja 20 11 24 44 46
Cascabel 26 28 47 45
Caracol 48 51
Levadura 47
Estructura Primaria
¤ A menudo se encuentra que el mismo aa se dispone
siempre en la misma posición en todas las especies
estudiadas.

¤ Estos aa reciben el nombre de aa invariantes o

conservados, y suelen ser indispensables para la función y
estructura correcta de las proteínas. Cualquier mutación
en estas posiciones resulta letal.
Estructura Secundaria
¤ Es la orientación geométrica que adoptan las distintas regiones
del esqueleto de la cadena polipeptídica.

¤ Son estructuras locales, repetitivas y comunes que aparecen en

las proteínas.

¤ Los grupos “R” de los aa determinan la orientación geométrica

que adoptan las distintas regiones del esqueleto de la cadena
polipeptídica.

¤ Se conocen 5 tipos:
¤ Alfa-hélice.
¤ Beta-tira plegada.
¤ Giro beta.
¤ Vuelta omega.
¤ Enrrollamientos al azar.
αHélice: La hélice se enrolla a la
derecha, es dextrógira.
Los grupos “R” se proyectan hacia el
exterior, evitando el impedimento
estérico.
Realmente los átomos están tan
empaquetados que no dejan un
hueco en medio.
La hélice se estabiliza por puentes H
entre el grupo amino y el carboxilo.
βTira Plegada: Disposición
completamente extendida, en forma
de zig-zag, se representa con una
felcha ancha cuya punta señala en
dirección al extremo C-Terminal.
Los grupos “R” se proyectan
alternadamente sobre el eje.
βTira Plegada:En proteínas como la
fibroina de la seda, las láminaβ se
empalman unas sobre otras,
formando apilamientos de láminas,
separadas por una distancia de
10Aº, por ello la fibra de la seda es
fuerte, flexible, pero resistente al
alargamiento.

Giroβ: Intervienen 4 aa, dos

de ellos son Gly y Pro. La
estructura se estabiliza por
un puente H entre el 1 y 3
aa.
 Vueltas Ω
Giroβ

Vueltas Ω: Son giros extendidos que

aparecen en la cadena
polipeptídica.
Poseen una longitud de 10 Aº
Incluyen entre 6 y 16 aa
Aparecen en la superficie de las
proteínas.

Enrrollamientos al Azar: Segmentos

de una cadena polipeptídica que
carecen de un patrón geométrico
repetitivo.

Enrrollamientos al Azar
βTira Plegada αHélice
Estructuras Supersecundarias
¤ Arreglos geométricos estables que aparecen en el interior de las proteínas
globulares.

¤ Formados por la combinación de varias estructuras secundarias.

¤ También reciben el nombre de motivos estructurales.

¤ Algunos de estos arreglos estructurales están asociados con una función

biológica particular, por ejemplo: unirse al DNA, ligar iones Ca+2.

¤ Formados por αHélice, βTira Plegada o por combinaciones de las dos.

Estructura Terciaria
¤ Es el plegamiento adicional de una cadena polipeptídica
completa, para formar una estructura estrechamente
empaquetada, casi esférica y algo rígida.

¤ Este plegamineto global de la proteína es promovido por el

efecto hidrofóbico.

¤ Aminoácidos que están muy separados en la estructura

primaria (secuencia aminoacídica), se pueden encontrar
cerca en el espacio.

¤ Los grupos “R” no polares se pliegan al interior de la

molécula, creando un núcleo interno compacto e
hidrofóbico.

¤ Los grupos “R” polares se colocan en la superficie de la

molécula, interactuando con el solvente (agua/
citoplasma/sangre) y permitiendo que la proteína
permanezca en solución.

¤ La conformación globular que se adquiere es la

responsable directa de sus propiedades biológicas, a través
de regiones con una configuración específica que le
permiten reconocer o reaccionar (SITIOS ACTIVOS).
¤ Las fuerzas estabilizadoras de la estructura terciaria son enlaces no
covalentes y enlaces covalentes entre los grupos “R” de los
aminoácidos.
Estructura Terciaria
¤ DOMINIOS:
¤ Agrupamientos de forma esférica u oblonga
que aparecen en una proteína globular,
formados por unos 50 a 300 residuos de aa.
¤ Consisten de una sola estructura
supersecundaria o un conjunto de ellas.
¤ El conjunto de dominios forma la estructura
terciaria.
¤ Cada dominio tiene una función específica. Dominio unión Sustrato
¤ Unir un ligando.
¤ Anclar la proteína en la membrana.
¤ Sitio catalítico.
¤ Sitio de unión al DNA.
¤ Interacción con otras proteínas.

Dominio unión NAD

Gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa
Estructura Cuaternaria

¤ Es el grado de asociación de las proteínas

para formar agregados oligoméricos.

¤ La asociación es un proceso espontáneo.

¤ La asociación de las cadenas genera una

molécula funcionalmente activa.

¤ Cada una de las cadenas polipeptídicas

que constituyen a una proteína
oligomérica, se denominan: protómero o
subunidad.

¤ Cuando una proteína consiste de una sola

cadena polipeptídica, carece por lo
tanto de estructura cuaternaria y se
denomina proteína monomérica.
Estructura Cuaternaria
¤ Proteínas Homoméricas.
¤ Las cadenas polipeptídicas que se
asocian son idénticas.
¤ Fosfoglucoisomerasa.
¤ Hexoquinasa.
¤ Lactato-deshidrogenasa.

¤ Proteínas Heteroméricas.
¤ Las cadenas polipeptídicas que se
asocian son diferentes.
¤ Lactosa sintasa.
HETEROTETRÁMERO
¤ Hemoglobina.
¤ Rubisco.
Estructura Quinaria
¤ Es el nivel de asociación adicional que exhiben las proteínas para formar estructuras
biológicas de gran tamaño.

¤ Las proteínas pueden agruparse entre si o con otras biomoléculas (azúcares, lípidos,
ácidos nucleicos) diferentes para formar estructuras supramoleculares.

Coágulo de Fibrina
Plegamiento y Desnaturalización
¤ El plegamiento de una proteína es un proceso
dirigido por la secuencia de sus aa y por el
efecto hidrofóbico.

¤ Algunas proteínas llevan a cabo su proceso

asistidas por otras proteínas especiales
llamadas chaperonas.

¤ La desnaturalización es un proceso que

consiste en la perdida total de la arquitectura
tridimensional.
¤ Factores físicos y químicos denominados agentes
desnaturalizantes.
¤ pH extremo, calor, agitación, metales pesados,
solventes orgánicos, detergentes.
¤ Una proteína desnaturalizada solo conserva su
estructura primaria y por lo tanto no presenta
actividad biológica.
Proteínas Fibrosas
¤ α y βQueratinas.
¤ Cubiertas protectoras.
¤ Cabello, cuernos, pezuñas,
escamas, caparazones,
picos, seda.

¤ Elastina.
¤ Sintetizada por fibroblastos.
¤ Tejidos elásticos como
pulmones, vasos sanguíneos,
ligamentos y piel.

¤ Colágeno.
¤ Principal proteína en todos
los tejidos y órganos.
¤ Es una glicoproteína, algunso
de sus residuos tienen
disacáridos de glucosa y
galactosa.
Proteínas Fibrosas

¤ Tropomiosina.
¤ Músculo esquelético de los vertebrados.
¤ Componente estructural de filamentos
delgados.
¤ Regula la interacción entre actina
(filamentos delgados) y miosina
(filamentos gruesos) en la contracción
muscular.
VIDEO
¿Qué es una proteína?

[Link]
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Enzimas

Capitulo 6 Lehninger; Capitulo 7,8 y 9 Harper; Capitulo 6 McKee

Enzimas
¤ Catalizadores orgánicos, principalmente de naturaleza protéica.

¤ Moléculas estructuralmente complejas, coloidales e hidrosolubles.

¤ No se consumen durante la reacción (usar más de una vez).

¤ Aunque su función es como catalizadores de reacciones al interior de

un organismo, también pueden funcionar fuera de él.

¤ Aceleran la velocidad de una reacción química en el orden de 103 –

1017 veces más rápido.

¤ Obedecen las leyes de la termodinámica (p. ej., no tienen efecto

sobre los valores de Keq)

¤ La capacidad para valorar la actividad de enzimas específicas en la

sangre, y otros líquidos histológicos, o extractos celulares, ayuda en el
diagnóstico y el pronóstico de enfermedades. Las deficiencias de la
cantidad o la actividad catalítica de enzimas clave pueden
sobrevenir por defectos genéticos, déficit nutricionales o toxinas.
Sitio Activo o Sitio Catalítico
¤ El rasgo distintivo de una reacción
catalizada enzimáticamente es que
tiene lugar dentro de los confines de
una “bolsa” de la enzima
denominada sitio activo.

¤ En donde se proporciona un
ambiente específico dentro del cual
una reacción determinada puede
transcurrir a mayor velocidad.

¤ El o los reactivos que se fijan al sitio

activo se denominan sustratos,
for mando el complejo enzima-
sustrato.

¤ El sitio activo de la enzima esta

revestido de aminoácidos con
grupos “R” que se unen al sustrato y
catalizan su transformación química.
Sitio Activo o Sitio Catalítico

El sitio activo es capaz de reconocer y unir su sutrato debido a que

existe complementaridad estructural entre ambos (llave-cerradura).
El sustrato establece enlaces no covaletes con los grupos R de los
aa presentes en el sitio activo.
Propiedades Enzimáticas
1. Las enzimas son catalizadoras altamente eficientes.
¤ Concentraciones de enzimas en el rango de micromolar son capaces de
catalizar una reacción a una velocidad extremadamente grande.
30,000 moléculas/segundo

¤ Sin ureasa tardaría 3 millones de años para realizar ese total de

reacciones.

2. Son catalizadores con una gran especificidad de acción.

¤ Una enzima actúa selectivamente sobre un sustrato específico y realiza
una reacción particular, no tiene efecto catalítico sobre moléculas
estructuralmente parecidad.
¤ La especificidad proviene de la formación de múltiples interacciones
Tiourea
débiles entre la enzima y su sustrato específico.

3. Son catalizadores regulables.

¤ La actividad de la enzima puede ser manejada por diversos factores, de
manera que puede pasar de un estado inactivo a uno activo.
Nomenclatura Enzimática
¤ 1) Nombres no descriptivos.
¤ Tripsina: origen griego que significa frotar. Se obtenía
moliendo tejido pancreático con glicerol.
¤ Papaína: Su fuente principal es la papaya.

¤ 2) Nombres descriptivos.
¤ Al nombre del sustrato se le aplica el sufijo “asa”.
¤ El nombre de la enzima considera tanto la identidad del
sustrato como el tipo de reacción que realiza la enzima.
Clasificación de las Enzimas
¤ La Comisión de Enzimas (EC) de la International Union of Biochemistry and
Molecular Biology (IUBMB), creó la siguiente clasificación de las enzimas y diseño un
código numérico para su identificación.

¤ CLASE 1. OXIDOREDUCTASAS. Catalizan reacciones de oxidación-reducción.

¤ CLASE 2. TRANSFERASAS. Transferencia de un grupo completo de átomos desde una

molécula donadora hasta una molñecula receptora.

¤ CLASE 3. HIDROLASAS. Ruptura de enlaces químicos con la participación de una

molécula de agua.

¤ CLASE 4. LIASAS. Ruptura de enlaces químicos sin la participación de una molécula

de agua.

¤ CLASE 5. ISOMERASAS. Cualquier tipo de isomerización como: racemización,

epimerización, isomeros cis y trans.

¤ CLASE 6. LIGASAS. Formación de un enlace al unir dos o más moléculas, con la

energía aportada por el ATP.
Clasificación de las Enzímas

1. Oxidoreductasas 2. Transferasas

Nombre común: Lactato deshidrogenasa Nombre común: Creatin-cinasa

Nombre científico: Lactato: NAD+ Nombre científico: ATP: creatin fosfotransferasa
oxidoreductasa Número: E.C. [Link]
Número: E.C. [Link]
Clasificación de las Enzímas

3. Hidrolasas 4. Liasas
¤ 4.1 Liasas carbono-carbono (C-C).
¤ 4.1.1 Carboxi-liasas (C-COOH).
H2O Pi
¤ [Link] Carboxi-liasa de
Histidina (C-COOH de la His).
¤ 4.1.2 Aldehido-liasas (C-CHO).

¤ 4.2 Liasas carbono-oxígeno (C-O).

¤ 4.3 Liasas carbono-nitrógeno (C-N).

¤ 4.4 Liasas carbono-azufre (C-S).

Nombre común: Glucosa 6 fosfatasa
Nombre científico: Glucosa 6 fosfato ¤ 4.5 Liasas carbono- halógeno (C-X).
fosgohidrolasa
Número: E.C. [Link] ¤ 4.6 Liasas fósforo-oxígeno (P-O).

Nombre común: Histidina

descarboxilasa
Nombre científico: Histidina
descarboxilasa
Número: E.C. [Link]
Clasificación de las Enzímas

5. Isomerazas 6. Ligasas

Nombre común: Maltosa epimerasa

Nombre científico: alfa-maltosa-beta maltosa
epimerasa
Número: E.C. [Link]
Nombre común: Glutamina sintetasa
Nombre científico: L-glutamato: amoniaco ligasa (formadora de ADP)
Número: E.C. 6.3.12
Cofactores Enzimáticos

¤ Sustancias de naturaleza orgánica o inorgánica que una

enzima requiere para desempeñar su actividad
catalítica.

¤ Su ausencia limita la actividad de una enzima.

¤ Son insustituibles.

Coenzimas
Orgánicos
Grupos prostéticos
TIPOS

Inorgánicos Activadores metálicos

Cofactores Enzimáticos

Coenzimas Grupo Prostético Metálicos

Bajo peso molecular Bajo peso molecular Iones monovalentes o
divalentes
Termoestable Termoestable Usualmente cationes
Dializable No dializble Uniones covalentes
Uniones no covalentes Uniones covalentes No son reemplazables
Ejemplos: Ejemplos: Ejemplos:
NAD+, NADH2 FAD+, FADH2 Zn+2
NADP+, NADPH2 FMN+, FMNH2 Fe+2
Ácido fólico Biotina Cu+
Pirofosfato de tiamina Ácido lipoico Mg+2
Zimógenos
¤ Son aquellas enzimas producidad
en un estado inactivo y cuya
activación ocurre mediante el
rompimiento de uno o varios
enlaces peptídicos con el
consiguiente cambio
conformacional.

¤ Este proceso es conocido como

“activación proteolítica”.

Zimógeno Agente activador Enzima activa

Pepsinógeno H+ o pepsina Pepsina
Tripsinógeno Enteroquinasa o tripsina Tripsina
Quimiotripsinógeno A Tripsina o quimiotripsina Quimiotripsina
Procarboxipeptidasa A Tripsina Carboxipeptidasa A
Prolastasa Tripsina Elastasa
Índice de Reacción
¤ La teoría cinética declara que para que dos
moléculas reaccionen, deben: 1) aproximarse
dentro de la distancia formadora de enlace
de la otra, o “chocar”, y 2) poseer suficiente
energía cinética para vencer la barrera de
energía para alcanzar el estado de
transición.

¤ Por ende, resulta que cualquier cosa que

aumente la frecuencia o energía de colisión
entre sustratos aumentará el índice de la
reacción en la cual participan.

¤ Aumentar la temperatura incrementa la

energía cinética de las moléculas.

¤ La frecuencia con la cual las moléculas

chocan es directamente proporcional a sus
concentraciones. Para dos moléculas
diferentes, A y B, la frecuencia con la cual
chocan se duplicará si se duplica la
concentración de A o de B.
Temperatura
¤ El aumento de la temperatura incrementa el índice de
reacciones tanto no catalizadas como catalizadas por
enzima al aumentar la energía cinética y la frecuencia de
choque de las moléculas que están reaccionando.

¤ Sin embargo, la energía calorífica también aumenta la

energía cinética de la enzima hasta un punto que excede la
barrera de energía para alterar las interacciones no
covalentes que mantienen su estructura tridimensional. La
cadena polipeptídica empieza entonces a desdoblarse, o
desnaturalizarse, con una pérdida acompañante de la
actividad catalítica.

¤ El rango de temperatura en el cual una enzima mantiene

una conformación estable, por lo general, excede de
manera moderada la temperatura normal de las células en
las cuales reside.

¤ Las enzimas de seres humanos por lo general muestran

estabilidad a temperaturas de hasta 45 a 55°C.

¤ Las enzímas de microorganismos termofilos pueden ser

estables a 100ºC.
pH
¤ El índice de casi todas las reacciones
catalizadas por enzima muestra una
dependencia importante de la
concentración de ion hidrógeno. Casi
todas las enzimas intracelulares
muestran actividad óptima a valores de
pH entre 5 y 9.

¤ La relación entre actividad y

concentración de ion hidrógeno refleja
el equilibrio entre la desnaturalización de
enzima a pH alto o bajo, y los efectos
sobre el estado cargado de la enzima,
los sustratos o ambos.

¤ Además, pueden ser afectados los

sustratos. Si un sustrato contiene un
grupo ionizable, un cambio del pH
puede alterar su capacidad para unirse
al sitio activo.
Energía de Activación
¤ En las reacciones espontáneas, los productos finales tienen menos
energía libre que los reactantes. Por tanto en las reacciones
espontáneas se libera energía de Gibbs.

¤ Sin embargo, el comienzo de la reacción requiere un aporte inicial

de energía. Esta energía inicial que hay que suministrar a los
reactantes para que la reacción transcurra se llama Energía de
Activación (Ea) ΔG≠. Es la diferencia entra la energía basal (inicial)
de las moléculas y el estado de transición.

¤ Cuanto menor es la Ea más fácilmente transcurre la reacción.

¤ En las reacciones enzimáticas, la reacción es más rápida debido a

que la enzima disminuye la energía de activación (Ea), esto se
debe a que posee un sitio activo a donde se unen los sustratos en
una orientación adecuada para que se desencadene
rápidamente la reacción.
Energía de Activación
¤ En una reacción enzimática:

¤ Equilibrio de reacción y velocidad de reacción El Estado de Transición es el

no es lo mismo. punto en la cumbre de la
colina energética en donde
¤ La función de un catalizador es aumentar la la caída hacia el estado S o P
velocidad de una reacción. Los catalizadores no
modifican los equilibrios de reacción. es igualmente probable.

¤ Un equilibrio favorable (ΔG-) no indica que la

conversión S àP sea rápida. La velocidad de
reacción depende de parámetros diferentes.

¤ Existe una barrera energética entre S y P que

representa la energía requerida para el
alineamiento de los grupos reactivos, la
formación de cargas inestables transitorias, los
reordenamientos de enlaces y otras
transformaciones.

¤ Para que haya reacción las moléculas deben

superar esta barrera por lo que se deben llevar a
un nivel energético superior.
Energía de Activación
¤ A una energía de activación más
elevada corresponde una
velocidad de reacción más lenta.

¤ La velocidad de reacción puede

aumentarse incrementando la
temperatura y/o la presión, de
modo alter nativo es posible
disminuir la energía de activación
añadiendo un catalizador (ej. una
enzíma).

¤ La catálisis aumenta la velocidad

de reacción al disminuir la energía
de activación.

¤ Las interacciones de fijación

débiles entre la enzima y su
sustrato proporcionan una fuerza
motriz sustancial para la catálisis
enzimática.
Cinética Enzimática
¤ El estudio cuantitativo de la
catálisis enzimática, conocido
como cinética enzimática,
p ro p o rc i o n a i n f o r m a c i ó n
sobre las velocidades de
reacción. Los estudios
cinéticos también miden la
afinidad de las enzimas por
los sustratos y por los
inhibidores y permiten
entrever los mecanismos de
reacción.

¤ Uno de los factores claves de

la velocidad de una reacción
catalizada por una enzima es
la concentración de [S].
Ecuación de Michaelis-Menten
¤ El modélo cinético de Michaelis-Menten propone que las reacciones
enzimáticas ocurren en dos etapas:

1. La enzima y el sustrato forman rápidamente un complejo enzima-sustrato.

La formación de este proceso es reversible.
K1
E+S E-S
K-1
1. El complejo enzima-sustrato da lugar a la formación del producto
liberando la enzima libre. Este paso es en esencia irreversible, dado que la
enzima se encuentra saturada y es el paso limitante de la velocidad.
k2
E-S E+P
K-2
Ecuación de Michaelis-Menten
¤ La ecuación de Michaelis-Menten ilustra en
términos matemáticos la relación entre la
velocidad de reacción inicial vi y la
concentración de sustrato [S].

¤ La constante Km de Michaelis es la
concentración de sustrato necesaria para
alcanzar la mitad de la velocidad máxima o
para alcanzar la semisaturación de la
enzima.

¤ Es una medida de la afinidad entre la

enzima y el sustrato, entre más bajo es el
valor de Km más alta es la afinidad, y entre
más alto es el valor de Km menor es la
afinidad.
Ecuación de Michaelis-Menten
Entre más bajo es el valor de Km más
alta es la afinidad, y entre más alto es
el valor de Km menor es la afinidad.
ENZIMA SUSTRATO Km (mM)
β-Lactamasa Bencil - Penicilina 0.02
Hexoquinasa D-Glucosa 0.05
Acetilcolinesterasa Acetilcolina 0.09
Hexoquinasa D-Fructosa 1.5
β-Galactosidasa Lactosa 4
Anhidrasa carbónica CO2 12
Quimiotripsina Gly-Try-Gly 108
Catalasa H2O 2 1,110
Inhibición Enzimática
¤ La inhibición enzimática es la
interferencia en el funcionamiento
de una enzíma debido a su
interacción con ciertas sustancias.

¤ Los inhibidores (I) se unen a la

enzima y evitan la formación del
complejo E-S, o evitan la
degradación del complejo E-S en E
+ P.

¤ Los inhibidores pueden ser:

¤ Naturales = Moléculas propias del
metabolismo.
¤ No naturales = Antibióticos, drogas,
insecticidas, herbicidas, etc.
Inhibición Enzimática

Irreversible Reversible
¤ El inhibidor se une a la ¤ El inhibidor se une a la enzima
enzima mediante enlaces mediante uniones no
covalentes.
covalentes.
¤ Tipos:
¤ La unión del inhibidor es ¤ Competitiva clásica.
con los grupos “R” de la ¤ Competitiva no clásica.
enzima. ¤ Acompetitiva.
¤ No competitiva
E+I E-I
¤ La constante de disociación
para este equilibrio es:
[E] [I]
Ki =
[E-I]
Inhibición Competitiva Clásica
¤ El inhibidor posee una estructura
análoga a la del sustrato original.

¤ El inhibidor compite con el sustrato por

ocupar el sitio activo de la enzima.

¤ El inhibidor sólo se une a las enzimas

libres, es decir, las que no tienen
asociado el sustrato.

¤ El inhibidor y el sustrato son mutuamente

excluyentes.

¤ La formación del complejo E-I puede ser

revertida incrementando la [S].
Inhibición Competitiva No Clásica

¤ Este tipo de inhibición es presentado por las

enzímas alostéricas, ya que los inhibidores se
unen a un sitio diferente (sitio alostérico) a
donde se une el sustrato (sitio activo).

¤ El inhibidor no tiene similitud estructural con el

sustrato, pero al unirse al sitio alostérico
ocasiona una modificación en el sitio activo.

¤ La inhibición se revierte incrementando la

concentración de [S].

¤ La inhibición competitiva no clásica exhibe

carácterísticas cinéticas similares a las
mostradas por la inhibición competitiva
clásica.
Inhibición Acompetitiva

¤ Los inhibidores solo son capaces

de asociarse a los complejos
enzima-sustrato generando un
trímero cataliticamente inactivo.

¤ No se pueden asociar a la enzima

en estado libre.

¤ Dado que las moléculas de

enzima se convierten a la forma
inactiva E-S-I la Vmax disminuye y
la Km también disminuye.
Inhibición No Competitiva o Mixta

¤ El inhibidor se puede unir a la enzima

libre o al complejo enzima-sustrato.

¤ El inhibidor no es un análogo
estructural del sustrato.

¤ El inhibidor se une con la enzima en un

sitio diferente al sitio activo.

¤ Cuando el inhibidor se acopla con la

enzima distorsiona el sitio activo, pero
el sustrato aún se puede asociar.

¤ Aunque el sustrato se asocia no se

modifica el sitio que aloja al inhibidor.

¤ Disminuye la Vmax y la Km no se
modifica.
Regulación Enzimática

¤ Es la capacidad de una enzima para ser cataliticamente

activa en el momento oportuno y en el sitio adecuado.

¤ Se conocen 4 vías principales de regulación:

¤ Activación proteolítica.
¤ Modificación química covalente.
¤ Control mediante proteínas.
¤ Control alostérico.
Activación Proteolítica
¤ La activación se logra mediante la hidrólisis de
uno o varios enlaces peptídicos en las
moléculas precursoras denominadas
zimógenos.

¤ El proceso de activación es irreversible.

¤ La activación ocurre en el exterior de la

célula.

¤ Es un proceso independiente de energía.

¤ Su inhibición ocurre por proteólisis.

¤ Ejemplos:
¤ Enzimas digestivas.
¤ Proteínas de la coagulación sanguínea.
Modificación Química Covalente
¤ La enzima se asocia
covalentemente con ligandos
químicos que modifican sus
propiedades catalíticas.

¤ La enzima posee varias

subunidades.

¤ La modificación es reversible.

¤ Las modificaciones químicas más

usuales son:
¤ Fosforilación (PO4-2).
¤ Adenilación (AMP).
¤ Uridilación (UMP).
¤ Metilación (CH3-)
¤ ADP-Ribosilación (ADP-Ribosa).
Control Mediante Proteínas
¤ En este tipo de regulación de enzimas,
ciertas proteínas actuan como ligandos
asociándose a una proteína inactiva, al
establecerse la interacción-proteína
enzima, la enzima se torna cataliticamente
activa.

¤ Una proteína que actúa comúnmente

activando enzimas es la calmodulina, una
molécula que al unir 4 iones Ca+2 sufre un
cambio conformacional que le permite
asociarse a enzimas inactivas y tornarlas
activas.

Al bajar la [Ca 2+ ], los

cationes se liberan y la
calmodulina sufre un
cambio conformacional
desligandose de la enzima
y esta se inactiva.
Control Alostérico
¤ Las enzimas alostéricas funcionan Positivos
mediante la unión reversible con Tipos de (activadores)
una molécula pequeña, de bajo
p e s o m o l e c u l a r l l a m a d a : moduladores Negativos
modulador o efector alostérico, (inhibidores)
esa unión es no covalente.

¤ Si el modulador es el mismo
sustrato de la enzima se le
denomina modulador
homotrópico, si es diferente se le
llama modulador heterotrópico.

¤ Las enzimas alostéricas, además

del sitio activo poseen un sitio
regulador o sitio alostérico a
donde se asocia el modulador.
VIDEO
¿Cómo trabajan las enzimas?

[Link]
v=yk14dOOvwMk
Nucleótidos y Ácidos Nucleicos

Capítulo 8 Lehninger; Capítulo 32 y 34 Harper ;Capitulo 17 McKee

Nucleótidos
¤ Los nucleótidos están formados
por tres componentes
característicos: una base
nitrogenada, una pentosa y un
grupo fosfato.
¤ La molécula sin el grupo fosfato
se denomina nucleósido.
¤ Las bases nitrogenadas son
derivados de purina y pirimidina.

¤ Las bases nitrogenadas de los

nucleótidos, están unidad
covalentemente por el N-1 en
las pirimidinas y el N-9 en las
purinas, a través de un enlace N-
β-glucosídico con el carbono 1
´de la pentosa, y el fosfato esta
esterificado (fosfoéster) con el
carbono 5´.
Nucleótidos

¤ El DNA consta de dos bases

purínicas, la adenina (A) y la
guanina (G), y dos bases
pirimidínicas, la citosina (C) y la
timina (T).

¤ El RNA se diferencia por que en

lugar de timina (T), contiene uracilo
(U).

¤ Los ácidos nucleicos contienen dos

tipos de pentosas.
¤ Los desoxiribonucleótidos del DNA
contienen 2´-desoxi-D-Ribosa.
¤ Los ribonucleótidos del RNA
contienen D-Ribosa.
Ácidos Nucleicos
¤ Los nucleótidos en el DNA y RNA están
unidos mediante enlaces covalentes de
puentes de grupos fosfato, en los cuales
el grupo hidroxilo en 5´de un nucleótido
está unido al grupo hidroxilo en 3´del
nucleótido siguiente mediante un
enlace fosfodiester.

¤ Los esqueletos del DNA y RNA son

hidrofílicos. Los grupos fosfato, con un
pKa cercano a 0, se encuentran
completamente ionizados y cargados
negativamente a pH 7.

¤ Olinucleótido: ácido nucleico de pocos

nucleótidos (hasta 50 nt).

¤ Polinucleótido: ácido nucleico de mayor

longitud.
 ultimately the function, of nucleic acids. The purines allel ( like
and pyrimidines common in DNA and RNA are highly modes of in
conjugated molecules ( Fig. 8–2) , a property with im- stacking a
portant consequences for the structure, electron distri- and dipole
bution, and light absorption of nucleic acids. Resonance stacking h

Ácidos Nucleicos
among atoms in the ring gives most of the bonds par- ter, and ba
tial double-bond character. One result is that pyrim- stabilizing
idines are planar molecules; purines are very nearly acids, as d

¤ Las pirimidinas y 14,000

purinas presentes en

Mola r ext in ct ion coefficien t , "

el DNA y el RNA son 12,000

m o l é c u l a s 10,000 Mola r ext in ct ion

aromáticas. (Tienen coefficien t a t 260
capacidad de 8,000 "260 (M #1cm #1 )
absorber la luz).
6,000 AMP 15,40

¤ Los ácidos nucleicos 4,000

GMP 11,70

absorben a UMP 9,90

longitudes de onda 2,000 dTMP 9,20
de 260nm. CMP 7,50
230 240 250 260 270 280
Wa velen gt h (n m )
Ácidos Nucleicos
¤ Las pirimidinas y
purinas libres son
c o m p u e s t o s
débilmente básicos y
por ello se denominan
bases.

¤ En 1953 Watson y Crick

descubren la
estructura del ADN.

¤ Entre la A y T siempre
se forman 2 puentes
hidrógeno, y entre la C
y G siempre se forman
3 puentes hidrógeno.

¤ Los organismos
termófilos tienen una
Las hebras son antiparalelas, una va
mayor cantidad de C
y G que de A y T.
de 5´a 3´y la otra va de 3´a 5´.
ADN

¤ Estructura primaria: Es su
estructura covalente y
secuencia de
nucleótidos.

¤ Estructura secundaría:
Doble hélice y
plegamientos propios de
la hélice.

¤ Estructura terciaria: Súper

empaquetamiento en
nucleosomas y
cromosomas.
 roots in the science of genetics, and its formal genetic
have been made in the laboratory ( under very high-salt
definition is beyond the scope of this text.) The mini-
or high-temperature conditions) . The B form of RNA
mum length of an mRNA is set by the length of the
has not been observed. Breaks in the regular A-form he-
polypeptide chain for which it codes. For example, a
lix caused by mismatched or unmatched bases in one
polypeptide chain of 100 amino acid residues requires
or both strands are common and result in bulges or in-
an RNA coding sequence of at least 300 nucleotides, be-
ternal loops ( Fig. 8–26) . Hairpin loops form between

ARN
cause each amino acid is coded by a nucleotide triplet
nearby self-complementary sequences. The potential for
( this and other details of protein synthesis are discussed
base-paired helical structures in many RNAs is exten-
in Chapter 27) . However, mRNAs transcribed from DNA
sive ( Fig. 8–27) , and the resulting hairpins are the most
are always somewhat longer than the length needed sim-
common type of secondary structure in RNA. Specific
ply to code for a polypeptide sequence ( or sequences) .
The additional, noncoding RNA includes sequences that
regulate protein synthesis. Figure 8–24 summarizes the
general structure of prokaryotic mRNAs.
¤ En
ManylosRNA
eucariotas el ADN se
s Have More Complex
encuentra confinado
Three-Dimensional Structures en el
núcleo, mientras
Messenger RNA que
is only one la síntesis
of several classes of cellu-
de proteínas
lar RNA. sucede
Transfer RNAs serve asen el molecules in
adapter
protein synthesis; covalently linked to an amino acid at
citoplasma.
one end, they pair with the mRNA in such a way that
amino acids are joined to a growing polypeptide in the
¤ Se necesita una molécula que
correct sequence. Ribosomal RNAs are components of
ribosomes. There is also a wide variety of special-func-
transporte el mensaje
tion RNAs, including some ( called genético
ribozymes) that have
del núcleo al citoplasma.
enzymatic activity. All the RNAs are considered in de-
tail in Chapter 26. The diverse and often complex func-
tions of these RNAs reflect a diversity of structure much
¤ Elricher
ARN mensajero
than that observed ines DNA solo una
molecules.
The product of transcription of DNA is always
de varias clases
single-stranded RNA. Thede moléculas
single strand tends to assume
de ARN.
a right-handed helical conformation dominated by base-
stacking interactions ( Fig. 8–25) , which are stronger be- FIGURE 8–25 Typical right-handed stacking pattern of single-
tween two purines than between a purine and pyrimi- stranded RNA. The bases are shown in gray, the phosphate atoms in
¤ Adine
diferencia
or between twodelpyrimidines.
ADN, esThedepurine-purine yellow, and the riboses and phosphate oxygens in green. Green is used

cadena sencilla.
interaction is so strong that a pyrimidine separating two
purines is often displaced from the stacking pattern so
to represent RNA strands in succeeding chapters, just as blue is used
for DNA.
RNA
¤ Las estructuras
tridimensionales de
muchos RNA, al igual que
las proteínas, son
complejas y únicas.
Desnaturalización-Hibridación
¤ Al igual que en las
proteínas globulares,
el ADN es susceptible
a modificar su
estructura por
factores como el pH y
la temperatura.

¤ La rotura de los
puentes de hidrógeno
entre los pares base y
del apiñamiento de
las bases provoca el
desenrrollamiento de
la doble hélice.
Desnaturalización-Hibridación
Otras Funciones de Nucleótidos

¤ Energía química (ATP).

¤ Los nucleótidos de
adenina forman
cofactores enzimáticos.

¤ Segundos mensajeros.

AMP cíclico
 zation, and this is reflected in the chromosome’s struc-overall size of genes that encode proteins. As descr
tural features. We begin by considering the different in detail in Chapter 27, each amino acid of a poly
types of DNA sequences and structural elements within tide chain is coded for by a sequence of three con
chromosomes.
8885d_c24_922 2/11/04 3:11 PM Page 922 utive mac76nucleotides in a single strand of DNA (Fig. 24
mac76:385_reb:
with these “codons” arranged in a sequence that co
Genes Are Segments of DNA That Code sponds to the sequence of amino acids in the poly

Flujo de la Información Genética

for Polypeptide Chains and RNAs
Our understanding of genes has evolved tremendously
tide that the gene encodes. A polypeptide chain of
amino acid residues (an average-size chain) co

over the last century. Classically, a gene was defined as

a portion of a chromosome that determines or affects a
DNA mRNA Polypeptide
single character or phenotype (visible property), such
922 Part III Information Pathways
as eye color. George Beadle and Edward Tatum proposed 5! 3! 5! Amino
¤ El dogma central de ladefinition of a gene in 1940. After exposing
a molecular C G C terminus
G C G Arg
biología molecular
spores explica
of the fungus Neurospora crassa to x rays and
T A U
other agents known to damage DNA and cause alterations
cómo fluye la información
in DNA sequence (mutations), they detected mutant
G C G upon which
genética. G C G Gly
fungal strains that lacked one or another specific en-
Replication DNA
A T A mation of p
zyme, sometimes resulting in the failure of an entire T A U
¤ Gen. Una secuencia
metabolicde ADNBeadle and Tatum concluded that a
pathway. A T A
bonds
Tyr
in pro
que codifica un producto
gene is a segmentfinal,
of genetic material that determines C G C arsenal of e
Transcription A T A
or codes for one enzyme: the one gene–one enzyme
ya sea una cadena C G C Part
Thr II. How
hypothesis. Later this concept was broadened to one
polipeptídica (proteína) o un
gene–one polypeptide, because many genes code for
T A U established
T A U
ARN con funciones
proteinsestructural
that are not enzymes or for one polypeptide
RNA of T A U thus
Phe far mu
o catalítica. a multisubunit protein. T A U
account mol
The modern biochemical definition of a gene is even G C G
more precise. A gene is all the DNA that encodes Translation
the C G C between
Ala par
¤ El ADN también posee otros
primary sequence of some final gene product, which can C G C
mers, avoidin
segmentos o secuencias que or an RNA with a structural or
be either a polypeptide G C G
T A U of sequence
Val
no codifican para un producto T A U
Protein thermodynam
especifico, pero que tienen T A U
una función reguladora.
C G C biosynthetic
Ser
The central dogma of molecular biology, showing the general
T A path-
U Carboxyl
3! 5! 3! quires an en
terminus
ways of information flow via replication, transcription, and transla-
and can be c
tion. The term “dogma” is a misnomer. Introduced by Francis Crick
Template at
strand
a time when little evidence supported these ideas, the dogma has be-
to synthesize
Empaquetamiento del ADN
 The E. coli cells grown in the N medium were
transferred to a fresh medium containing only the 14N
25.1 DNA Replication isotope, where they were allowed to grow until the cell
population had just doubled. The DNA isolated from
Long before the structure of DNA was known, scientists these first-generation cells formed a single band in the
wondered at the ability of organisms to create faithful CsCl gradient at a position indicating that the double-
copies of themselves and, later, at the ability of cells to helical DNA molecules of the daughter cells were hy-

Replicación
produce many identical copies of large and complex brids containing one new 14N strand and one parent 15N
macromolecules. Speculation about these problems cen- strand (Fig. 25–2b).
tered around the concept of a template, a structure This result argued against conservative replication,
that would allow molecules to be lined up in a specific an alternative hypothesis in which one progeny DNA
order and joined, to create a macromolecule with a
unique sequence and function. The 1940s brought the
revelation that DNA was the genetic molecule, but not DNA extracted and centrifuged
to equilibrium in CsCl
until James Watson and Francis Crick deduced its struc- density gradient
ture did the way in which DNA could act as a template
¤ La realización deltransmission
for the replication and ADN es of genetic informa-
tion become clear: one strand is the complement of
semiconservativa.
the other. The strict base-pairing rules mean that each (a)
strand provides the template for a sister strand with a Heavy
DNA (15N)
predictable and complementary sequence (see Figs Original parent
¤ [Link]
8–16, 8–17). Nucleotides: Building Blocks of Nucleic Acids molecule

watch?v=4gdWOWjioBE
The fundamental properties of the DNA replication
process and the mechanisms used by the enzymes that
catalyze it have proved to be essentially identical in all
species. This mechanistic unity is a major theme as we Hybrid DNA
(b) (15N–14N)
proceed from general properties of the replication
process, to E. coli replication enzymes, and, finally, to First-generation
replication in eukaryotes. daughter molecules

DNA Replication Follows a Set of Fundamental Rules

Early research on bacterial DNA replication and its en- Light
zymes helped to establish several basic properties that DNA (14N)
(c) Hybrid DNA
have proven applicable to DNA synthesis in every
organism.
Second-generation
DNA Replication Is Semiconservative Each DNA strand daughter molecules
serves as a template for the synthesis of a new strand, FIGURE 25–2 The Meselson-Stahl experiment. (a) Cells were grown
producing two new DNA molecules, each with one new for many generations in a medium containing only heavy nitrogen,
strand and one old strand. This is semiconservative 15
N, so that all the nitrogen in their DNA was 15N, as shown by a sin-
Replicación
¤ Topoisomerasa: Desenrrolla el
ADN.

¤ Helicasa: Abre la doble hélice.

¤ Primasa: Sintetiza un primer

(Cebador) de ARN que aporta
un extremo 3´(-OH) libre.

¤ Polimerasa: Sintetiza la nueva

hebra de ADN.

¤ SSB: proteínas de unión a

cadena simple, sirven para
estabilizar la cadena de ADN
cuando ya se abrió.

¤ Exonucleasa: Remueve los

primer y fragmentos de ADN
dañados.

¤ Ligasa: Sella los espacios entre

nucleótidos que quedan entre
fragmentos de okazaki.

¤ [Link]
watch?v=TNKWgcFPHqw
Transcripción

¤ Síntesis de RNA
dependiente de DNA.

¤ Síntesis de RNA
dependiente de RNA.

¤ Síntesis de DNA
dependiente de DNA.

¤ Síntesis de DNA
dependiente de RNA.
Transcripción
Transcripción

¤ [Link]
watch?v=jQKuyp2grHE
Traducción

¤ El proceso de síntesis de
una nueva proteína, cuya
información esta contenida
en una molécula de ARNm
se denomina traducción.

¤ Los participantes son:

¤ ARNm

¤ Ribosomas + ARNr

¤ ARNt + aminoácidos
034-1080 2/12/04 1:19 PM Page 1038 mac76 mac76:385_reb:

Código Genético
38 Chapter 27 Protein Metabolism

At about this time, a com- First letter of codon (5! end)

mentary approach was pro- Second letter
ed by¤H. El código
Gobind genético es
Khorana, of codon
o developed chemical
degenerado dado que U C A G
thods to synthesize poly-
diferentes codones codifican
onucleotides with defined,
UUU Phe UCU Ser UAU Tyr UGU Cys
UUC Phe UCC Ser UAC Tyr UGC Cys
un mismo
peating sequences aminoácido.
of two to U
r bases. The polypeptides UUA Leu UCA Ser UAA Stop UGA Stop
UUG Leu UCG Ser UAG Stop UGG Trp
oduced¤ byAUG (metionina)
these mRNAs es el codon
d one or adefewinicio.
amino acids CUU Leu CCU Pro CAU His CGU Arg
repeating patterns. These CUC Leu CCC Pro CAC His CGC Arg
C
terns,¤
when
UAA,combined
UAG,with
UGA,[Link] Gobind Khorana
codones CUA Leu CCA Pro CAA Gln CGA Arg
ormation from the random CUG Leu CCG Pro CAG Gln CGG Arg
debytérmino.
ymers used Nirenberg and colleagues, permitted
AUU Ile ACU Thr AAU Asn AGU Ser
ambiguous codon assignments. The copolymer AUC Ile ACC Thr AAC Asn AGC Ser
C)n, for [Link]
¤ example, has alternating ACA and CAC A
watch?v=kkpHy7nH3Dk
dons: ACACACACACACACA. The polypeptide syn- AUA
AUG
Ile
Met
ACA
ACG
Thr
Thr
AAA
AAG
Lys
Lys
AGA
AGG
Arg
Arg
sized on this messenger contained equal amounts of
eonine
¤and histidine. Given that a histidine codon has
[Link] GUU Val GCU Ala GAU Asp GGU Gly
e A and two Cs (Table 27–1), CAC must code for his- GUC Val GCC Ala GAC Asp GGC Gly
watch?v=gG7uCskUOrA G
ne and ACA for threonine. GUA Val GCA Ala GAA Glu GGA Gly
Consolidation of the results from many experiments GUG Val GCG Ala GAG Glu GGG Gly
rmitted the assignment of 61 of the 64 possible
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