23.
Iniciación de la traducción
24. Elongación y translocación
25. Terminación de la traducción
26. Transcripción y enfermedad
27. Análisis de la transcripción a escala global
Iniciación de la traducción
Síntesis de proteínas
Durante la síntesis de proteínas, el ribosoma reúne el ARNt
cargado con aminoácidos y el ARNm, el codón y el anticodón se
combinan y los aminoácidos se unen en la secuencia correcta.
Hay tres fases en este proceso: iniciación donde el ribosoma se
ensambla en el ARNm, elongación donde se lee el código del
triplete y se agregan aminoácidos a la cadena peptídica en
crecimiento y terminación donde se detiene la síntesis de
proteínas.
Figura 10
VER GRANDEDESCARGAR DI
La estructura de un gen eucariota codificador de proteínas
El ADN incluye una región no traducida en los extremos 5 y 3, así como
intrones y exones. Se muestran el codón donde comienza la traducción
(verde) y el codón de parada (rojo). El ADN se transcribe en ARNm y se
procesa mediante la adición de la tapa 5, empalmando los intrones y la
adición de la cola de poli A. Este ARNm maduro se exporta desde el núcleo
al citoplasma.
Iniciación
Un complejo de proteínas llamado complejo de unión a la tapa
se une a la tapa 5 'del ARNm (Figura 10) en el núcleo. El
ARNm se exporta al citoplasma donde recluta factores de
iniciación, ARNt cargado con una metionina y la pequeña
subunidad ribosómica (40S). Los factores de iniciación también
se unen y la pequeña subunidad escanea a lo largo de la región
no traducida 5 'del ARNm hasta que encuentra el primer codón
de inicio AUG (Figura 16A). Esto es reconocido por el codón
anticodón del ARNt iniciador, la gran subunidad entonces atraca
para dar el complejo de traducción. El ribosoma 80S con el
ARNt cargado con metionina en el sitio P ahora está listo para
aceptar el siguiente ARNt (Figura 16B).
Figura 16
Síntesis de proteínas
(A) Durante el inicio, el ARNm recluta un ARNt cargado con una metionina y la
pequeña subunidad ribosómica, (B) la subunidad grande entonces atraca para dar el
complejo de traducción, (C) un ARNt con un aminoácido unido entra en el sitio A,
(D) el enlace peptídico se forma entre el aminoácido en el sitio P y el del sitio A. El
efecto es que la cadena peptídica en crecimiento se transfiere al ARNt de aminoacilo
entrante en el sitio A, dejando un ARNt vacío en el sitio P. (E) Finalmente, todo se
mueve a lo largo del ARNm por un codón en un proceso llamado translocación, por lo
que el ARNt de peptidilo con la cadena peptídica en crecimiento unida se mueve al
sitio P y el ARNt gastado al sitio E desde donde sale del ribosoma. (F) Cuando un
codón de parada está en el sitio A, un factor de terminación o liberación entra en el
sitio A, (G) el péptido se libera del ribosoma y (H) las dos subunidades del ribosoma
se disocian y se reciclan.
Elongación
Con la iniciación completa, el ARNm está en el marco de
lectura correcto con el sitio A vacío y el siguiente codón
expuesto. En la fase de elongación, un ARNt de aminoacilo, uno
cargado con un aminoácido, se lleva al ribosoma en un complejo
con un factor de elongación y entra en el sitio A. Si el anticodón
que lleva es complementario al codón expuesto, se coloca
correctamente en el sitio del aceptor y el GTP se hidroliza en el
factor de alargamiento (Figura 16C). Un enlace peptídico
(Figura 17) luego se forma entre el extremo C del aminoácido
en el sitio P y el extremo N del aminoácido en el sitio A, esta
reacción se cataliza en el centro de transferencia de peptidilo de
la gran subunidad del ribosoma. El efecto es que la cadena
peptídica en crecimiento se transfiere al ARNt de aminoacilo
entrante en el sitio A, dejando un ARNt vacío o gastado en el
sitio P (Figura 16D). Finalmente, el ARNt de peptidilo con la
cadena peptídica en crecimiento unida se mueve al sitio P. Este
paso se llama translocación y la energía es proporcionada por la
hidrólisis de GTP por el factor de elongación EF-G. El ARNt
gastado se mueve al sitio de salida desde donde puede salir del
ribosoma. El ARNm se mueve de modo que el siguiente codón
se expone en el sitio A (Figura 16E) listo para aceptar un nuevo
aminoacil-ARNt cargado con otro aminoácido. Durante la fase
de alargamiento, el ribosoma pasa por este proceso, agregando
aminoácidos a la cadena peptídica en crecimiento hasta que se
expone un codón de parada en el sitio A. La nueva proteína
emerge del ribosoma a través de un túnel de salida en la
subunidad grande.
Figura 17
Aminoácidos y enlaces peptídicos
(A) Los aminoácidos consisten en un átomo de carbono con un grupo amina (el
extremo N), un grupo ácido carboxílico (el extremo C) y un grupo R variable. El
grupo R más simple es un grupo metilo que proporciona el aminoácido alanina. (B)
Cuando dos aminoácidos se unen, se forma un enlace peptídico entre el extremo N de
un aminoácido y el extremo C de otro. Esta es una reacción de condensación que
libera una molécula de agua.
Terminación
El codón de parada no se decodifica al ser reconocido por un
anticodón en un ARNt. En cambio, es detectado por proteínas
llamadas factores de terminación o liberación. En eucariotas hay
un único factor de liberación (RF1) que reconoce los tres
codones de parada que entran en el sitio A (Figura 16F). El
enlace éster que une la cadena peptídica al ARNt en el sitio P se
rompe y el péptido se libera del ribosoma (Figura 16G) Las dos
subunidades del ribosoma se disocian y se reciclan (Figura
16H).
La estructura y función de los ribosomas están altamente
conservados con un gran núcleo de proteínas y ARNr
estructuralmente conservados que se encuentran tanto en los
ribosomas eucariotas como en los procariotas. Sin embargo, hay
algunas diferencias tanto en los ARNr como en algunas de las
proteínas adicionales involucradas en la traducción (Tabla 2).
Propiedades de los ribosomas
Ribosoma bacteriano Ribosoma eucariota
Tamaño 70S*2.3–2.6 MDa 80S, 3.3–4.5 MDa
Subunidad pequeña 30S 40S
Aproximadamente 20 proteínas 32 proteínas
ARNr 16S, ∼1600 nucleótidos ARNr 18S
Subunidad grande 70S 60S
Aproximadamente 33 proteínas 79–80 proteínas
ARNr 23S, ∼2900 nucleótidos ARNr 25S
ARNr 5S, ∼120 nucleótidos 5.8S Y 5S
La fase de alargamiento está altamente conservada, pero existen
diferencias importantes en cómo se inicia la síntesis de
proteínas. Los ARNm bacterianos tienen una secuencia
específica llamada sitio de unión al ribosoma o secuencia de
Shine–Dalgarno. Con el fin de garantizar que el ARNm se
coloca correctamente en el ribosoma, la secuencia de Shine–
Dalgarno se une a una secuencia complementaria del ARNr 16S
en la subunidad pequeña. En bacterias, el ARNt iniciador se
carga con un aminoácido modificado N-formilmetionina.
Las diferencias entre la estructura de los ribosomas bacterianos
y eucariotas pueden ser explotadas por antibióticos que son
selectivos ya que afectan la síntesis de proteínas en bacterias
pero no en células de mamíferos. Los antibióticos macrólidos
como la eritromicina, bloquean el túnel de salida en la gran
subunidad de los ribosomas bacterianos y detienen la síntesis de
proteínas. El túnel de salida en los ribosomas eucariotas es
ligeramente más estrecho, lo que significa que los ribosomas
eucariotas no se ven afectados. La estreptomicina, un antibiótico
importante en el tratamiento de la tuberculosis, se une al 16S de
los ribosomas bacterianos. Esto distorsiona la estructura del sitio
de decodificación y da como resultado una lectura errónea del
ARNm.
Transcripción y enfermedad
Los factores de transcripción y los promotores desempeñan un
papel importante en la salud y la enfermedad, a continuación se
presentan solo algunos ejemplos para dar una idea de su papel
en la salud y la enfermedad.
El factor de transcripción p53 es una proteína supresora de
tumores, protege contra el cáncer y algunos cánceres humanos
tienen mutaciones que eliminan la función p53.
El medicamento Tamoxifen utilizado en el tratamiento del
cáncer de mama se une al receptor de estrógenos que inhibe su
función. El receptor de estrógeno es un factor de transcripción
que activa la transcripción de genes en respuesta al estrógeno.
El síndrome de Rett es un trastorno del desarrollo neurológico
que afecta aproximadamente a 1 de cada 15000 nacimientos
femeninos. Es debido a mutaciones en un factor de transcripción
que normalmente reprimiría la transcripción de genes
específicos, las mutaciones conducen a la transcripción
inadecuada de estos genes.
El uso de cocaína da como resultado cambios en la expresión de
muchos genes, esto puede incluir cambios epigenéticos dentro
de los genes involucrados en la cognición y la función cerebral.
Estos cambios epigenéticos pueden ser heredados y hay
evidencia de que el consumo de cocaína por parte de un padre
puede resultar en cambios epigenéticos que resultan en que la
descendencia masculina, pero no femenina, sea resistente a la
cocaína
Análisis de la transcripción génica a escala global
La transcripción génica es un proceso fundamental en la expresión de los genes,
donde el ADN se convierte en ARN mensajero (ARNm) como paso previo a la
síntesis de proteínas. A escala global, su análisis tiene aplicaciones en la biomedicina,
la biotecnología, la evolución y la regulación genética en distintos organismos.
1. Mecanismos y Regulación Global de la
Transcripción Génica
A nivel global, la transcripción génica varía en función de:
Factores ambientales: La temperatura, disponibilidad de nutrientes y señales
externas pueden influir en la activación o represión de genes.
Epigenética: Modificaciones químicas en el ADN (metilación) y en las
histonas pueden alterar la transcripción sin modificar la secuencia genética.
Factores de transcripción: Proteínas que regulan la expresión de genes
mediante su interacción con promotores y potenciadores.
2. Herramientas para el Análisis Global
de la Transcripción
Con el avance tecnológico, se han desarrollado varias técnicas para estudiar la
transcripción en todo el genoma:
RNA-Seq (Secuenciación de ARN): Tecnología de secuenciación masiva que
permite analizar la expresión de genes en diferentes tejidos y condiciones.
Microarrays: Permiten medir los niveles de expresión de miles de genes
simultáneamente.
qPCR en tiempo real: Técnica precisa para cuantificar la expresión génica de
genes específicos.
3. Aplicaciones en Salud y Biotecnología
Cáncer y Enfermedades Genéticas: El análisis global de la transcripción
ayuda a identificar genes involucrados en enfermedades como el cáncer, lo
que permite el desarrollo de biomarcadores y terapias dirigidas.
Medicina Personalizada: Permite ajustar tratamientos según el perfil de
expresión génica de cada individuo.
Ingeniería Genética: En biotecnología, el estudio de la transcripción es clave
para modificar organismos y producir fármacos, biocombustibles y cultivos
mejorados.
4. Desafíos y Tendencias
Grandes volúmenes de datos: La transcripción génica a escala global genera
una cantidad masiva de datos que requieren herramientas avanzadas de
bioinformática para su análisis.
Regulación ética: La manipulación de la expresión génica plantea dilemas
éticos, especialmente en terapias génicas y edición genética con CRISPR.
Impacto ambiental y evolución: El estudio de la transcripción en organismos
expuestos a cambios ambientales ayuda a entender la adaptación evolutiva y el
impacto del cambio climático.
En resumen, el análisis de la transcripción génica a nivel global es clave para entender
la biología molecular, desarrollar terapias avanzadas y mejorar la biotecnología.
