BLOQUE A: LAS
BIOMOLÉCULAS.
TEMA 5: LOS ÁCIDOS
NUCLEICOS
IMPORTANCIA DE
LOS ÁCIDOS o Son las moléculas que dirigen y controlan la síntesis de
NUCLEICOS proteínas proporcionando la información que determina su
especificidad y sus características biológicas, es decir que
contienen la información necesaria para realizar los procesos
vitales y son los responsables de las funciones básicas de los
seres vivos.
o Dirigen y controlan todos los procesos biológicos y si se
alteran por alguna causa, se producen modificaciones
importantes en la actividad y en la supervivencia del
organismo afectado.
o Son macromoléculas o polímeros formados por la unión de
muchos monómeros llamados NUCLEÓTIDOS.
Son los componentes de los ácidos nucleicos.
LOS NUCLEÓTIDOS
Además, los nucleótidos desempeñan otras funciones importantes en
los seres vivos sin formar parte de los ácidos nucleicos. Participan en
muchos procesos metabólicos o intervienen como mensajeros químicos
o Monosacárido: una pentosa
o UNA BASE NITROGENADA: es una molécula cíclica que
Cada nucleótido está puede estar constituida por uno o dos anillos. Tienen
formado por 3
componentes
carácter básico y en su estructura tienen átomos de
nitrógeno.
o Uno o varios grupos fosfato
Es siempre una aldopentosa:
PENTOSA
▪ Si se trata de una β-D-ribofuranosa, se trata de un ribonucleótido.
▪ Si la aldopentosa es la β-D-2-desoxirribofuranosa, da lugar a
desoxirribonucleótidos.
A la pentosa se le unen tanto la base nitrogenada al carbono 1 como el
grupo fosfato en posición 3 o 5.
La presencia de átomos de nitrógeno proporciona a estas moléculas
BASE carácter básico.
NITROGENADA
Pueden ser de dos tipos:
o PÚRICAS: derivadas de la purina. ADENINA (A) Y GUANINA (G)
o PIRIMIDÍNICAS: derivadas de la pirimidina. CITOSINA (C ), TIMINA (T) Y
URACILO (U).
PURINA PIRIMIDINA
La molécula formada por la unión entre la pentosa y la base nitrogenada recibe en nombre de
NUCLEÓSIDO. En esta unión participan el carbono 1 de la pentosa y el nitrógeno 1 de la base
pirimidínica o el nitrógeno 9 de la base púrica. El enlace entre ellos es el N-glucosídico
Para nombrar los nucleósidos se tiene en cuenta
varias cosas:
▪ Si la pentosa es la desoxirribosa se coloca el
prefijo desoxi y si es la ribosa no se pone nada.
▪ Se añade un prefijo que indica la base
nitrogenada (cit- tim- ur- aden- guan-) y la
terminación idina si la base es pirimidínica y osina
si es púrica.
Aunque teóricamente existen 10 nucleósidos distintos, dos
de ellos, el formado por ribosa y timina y el constituido por
desoxirribosa y uracilo no son componentes de los ácidos
nucleicos.
La unión de uno o varios grupos fosfato en el carbono 3' o 5' de la pentosa, mediante
GRUPO enlace éster fosfórico, da lugar al nucleótido completo.
FOSFATO
Para nombrarlos Se elimina la última letra del nombre del nucleósido y se indica a
continuación el lugar de unión a la pentosa y el número de fosfatos unidos. Por
ejemplo: el nucleósido desoxiadenosina y el nucleótido desoxiadenosin 5’ trifosfato.
Si no se indica numeración se sobreentiende que la unión se realiza con el carbono 5’
y que es solo un grupo fosfato.
Cuando existe más de un grupo fosfato se unen a la cadena uno a continuación de
otro.
A los pH biológicos habituales, el
grupo fosfato suele encontrarse
ionizado (con los O-), aunque en
algunas ocasiones se encuentran no
ionizados (con los OH)
FUNCIONES Son moléculas de gran interés biológico ya que además de formar parte
de los ácidos nucleicos, llevan a cabo otras funciones.
DE LOS
NUCLEÓTIDOS
✔ MOLÉCULAS ACUMULADORAS Y DONANTES DE ENERGÍA
Algunas reacciones bioquímicas tienen como finalidad la producción de energía, que si se desprendiera
libremente no tendría utilidad para los seres vivos. Es más eficaz que algunos nucleótidos, sobre todo de
adenosina y menor medida de guanosina, sean capaz de acumular esa energía en sus enlaces químicos (en
los que participan los grupos fosfato).
Por ejemplo cuando hay energía disponible, una molécula de adenosin difosfato (ADP), la emplea para
formar un tercer enlace con el grupo fosfato que se une a los dos anteriores para formar un adenosin
trifosfato:
ADP + P ATP
El enlace formado es altamente energético, por tanto, para su formación hace falta una cantidad importante
de energía (7,3 kcal/mol) y al romperse, liberará esa cantidad de energía. Así, el sistema ATP/ADP constituye
una forma eficaz de almacenar la energía liberada en las reacciones exotérmicas.
Los enlaces ricos en energía suelen representarse con el símbolo ~P en lugar de –P.
5´Adenosin
monofosfato, AMP 5´Adenosin difosfato, ADP
-
-
5´Adenosin trifosfato, ATP
H2O
ATP ADP+Pi+ Energía (7,3 kcal/mol)
H2O
✔ ADENOSÍN MONOFOSFATO CÍCLICO (AMPc)
Esta molécula interviene en el desencadenamiento de las respuestas de la célula ante la información que
recibe del medio extracelular. La unión de moléculas mensajeras (hormonas neurotransmisores) a
determinados receptores de la membrana plasmática activan la enzima adenil ciclasa, que actúa:
ATP → AMPc + P - P
El AMPc sintetizado permite la ejecución de varios procesos bioquímicos que, finalmente, originan una
respuesta celular. Actúa pues como mediador entre la información externa y la respuesta celular final. Por
esta razón se denomina segundo mensajero.
✔ MOLÉCULAS CON FUNCIÓN COENZIMÁTICA.
Ciertos dinucleótidos intervienen como coenzimas en algunas reacciones enzimáticas importantes (moléculas
que participan en la actividad metabólica formando la parte no proteica de las enzimas):
Nicotinamín adenín dinucleótido (NAD+) y nicotinamín adenín dinucleótido fosfato (NADP+) .
Son derivados de la vitamina B3, o nicotinamida.
Flavín adenín dinucleótido (FAD) que es un derivado de la vitamina B2 o riboflavina.
Todas ellas participan en reacciones de deshidrogenación, fundamentales en el catabolismo celular. Estas
reacciones toman protones y electrones de algunas moléculas y quedan cono NADH, NADPH Y FADH2
respectivamente. Estas coenzimas, en estado reducido, ceden fácilmente electrones y protones a otras
moléculas, acción importante en múltiples procesos metabólicos.
EL ENLACE
NUCLEOTÍDICO
La existencia de grupos hidroxilo, tanto en la pentosa como en el grupo fosfato, permite la unión de los
nucleótidos, mediante la formación de enlaces entre ambos grupos. Esta unión es una esterificación que se
realiza entre el grupo fosfato situado en posición 5’ de un nucleótido y el grupo hidroxilo que se encuentra en
el carbono 3’ de otro nucleótido.
Este enlace genera un DINUCLEÓTIDO, que es una molécula formada por la unión de dos nucleótidos mediante
un ENLACE NUCLEOTÍDICO O ENLACE TIPO ÉSTER FOSFÓRICO (FOSFODIÉSTER), liberándose una molécula de
agua.
Dado que existen aún grupos hidroxilos libres, el dinucleótido se puede unir a más nucleótidos y formar
trinucleótidos, tetranucleótidos…etc. La unión de cientos o miles de nucleótidos constituyen cadenas de
polinucleótidos o ácidos nucleicos, de masa molecular muy elevada.
Las cadenas de nucleótidos presentan dos extremos: un extremo 5´ donde hay un grupo fosfato unido al
carbono 5´ del primer nucleótido y un extremo 3´ donde hay un radical hidroxilo unido al carbono 3´ del último
nucleótido.
ESTRUCTURA QUÍMICA DE
LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
Son polinucleótidos que fueron aislados en 1869 por Friedrich Miescher a partir de extractos de núcleos
celulares y posteriormente también se aislaron en citoplasma. Existen 2 tipos:
✔ ADN O ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (o DNA)
✔ ARN O ÁCIDO RIBONUCLEICO (o RNA)
ADN Está formado por la unión de desoxirribonucleótidos formados por:
- Desoxirribosa
- Bases nitrogenadas: A, C, G, T
Excepto en algunos virus, el ADN está formado por una doble cadena de polinucleótidos
unidas entre sí en toda su longitud que se dispone de manera lineal en el núcleo de células
eucariotas o de forma circular en células procariotas, algunos virus y orgánulos de células
eucariotas (mitocondrias y cloroplastos).
Porta la información necesaria para el desarrollo de las características biológicas de un
individuo y contiene también los mensajes e instrucciones para que las células puedan
realizar sus funciones, es decir lleva codificada la información a partir de la cual se forma
un organismo vivo, por lo que constituye el material genético.
Es una molécula muy estructurada en la que se distinguen distintos niveles de complejidad, lo que les
permite empaquetarse en cromosomas de pocos micrómetros.
En el ADN se distinguen los tres niveles estructurales:
ESTRUCTURA
DEL ADN - La estructura primaria o secuencia de nucleótidos.
- La estructura secundaria o doble hélice.
- La estructura terciaria o ADN superenrollado: torsión de la doble hélice
sobre sí misma.
ESTRUCTURA PRIMARIA
Está formada por la secuencia de
desoxirribonucleótidos. En el extremo 5´ de la cadena
existe un fosfato y en el extremo 3´una pentosa con el
OH del carbono 3´libre.
La diferencia entre las moléculas de ADN de los
distintos organismos radica en el orden de las bases
nitrogenadas unidas a las pentosas. LAs bases que
aparecen en el ADN son A, T, C, G nunca U.
ESTRUCTURA SECUNDARIA
La secuencia de polinucleótidos se dispone en el espacio en forma de doble hélice según la estructura propuesta
por James Watson y Francis Crick en 1953 basado en estudios previos (ley de equivalencia de bases de Chargaff y
los estudios cristalográficos de difracción de rayos X de Rosalind Franklin y Maurice Wilkins. El modelo
tridimensional elaborado por Watson y Crick se caracteriza por:
✔ El ADN esta formado por dos cadenas de polinucleótidos unidas entre si en toda su longitud.
✔ Las dos cadenas son ANTIPARALELAS, el extremo 3´de una de ellas se enfrenta al extremo 5´de la otra.
✔ La unión entre ambas cadenas se lleva a cabo por puentes de hidrógeno entre bases nitrogenadas, la adenina
forma dos puentes de H con la Timina y la guanina forma 3 con la citosina. Por ello las dos cadenas no son
idénticas sino complementarias.
✔ Las dos cadenas están enrolladas en espiral formando una doble hélice alrededor de un eje imaginario común.
✔ Las bases nitrogenadas quedan en el interior de la doble hélice mientras que los esqueletos pentosas-fosfatos
quedan hacia el exterior. De esta forma las cargas negativas de los grupos fosfato se unen a cargas positivas de
cationes presentes en el medio, estabilizando la estructura.
✔ Los planos de las bases nitrogenadas enfrentadas son paralelos entre sí y perpendiculares al eje de la hélice
✔ El enrollamiento de la doble hélice es plectonémico, las cadenas no se pueden separar sin desenrollarlas y la
hélice es dextrógira, gira en sentido de las agujas del reloj.
✔ La anchura de la hélice es de 2 nanometros mientras que la longitud de cada vuelta es de 3,4 nm, por tanto existen 10
pares de nucleótidos por cada vuelta.
Además de esta estructura del ADN, que corresponde a la forma B, se conocen otros dos
tipos de estructura en doble hélice:
- Forma A: los planos de las bases nitrogenadas no son perpendiculares al eje de la hélice.
- Forma Z: la doble hélice presenta irregularidades y es levógira.
No se conoce su papel exacto, pero se cree que ambas podrían estar relacionadas con los
mecanismos de regulación de la expresión de los genes.
ESTRUCTURA TERCIARIA
La doble hélice se puede plegar aún más y sufrir un superenrollamiento para dar lugar a un
tercer nivel estructural. Esta estructura es compleja y no ha llegado a ser bien descrita, pero
si se sabe que existen unas proteínas que están asociadas al ADN que organizan su
estructura. Como resultado final el ADN aparece formando la cromatina y los cromosomas.
Esta estructura es necesaria por:
- Las largas cadenas de ADN deben acoplarse en el reducido espacio disponible en el
interior celular y deben empaquetarse más aún en eucariotas porque debe quedar en el
interior de núcleo.
- La regulación de la actividad del ADN depende en gran medida del grado de plegamiento
que posea la molécula.
LA DESNATURALIZACIÓN DEL ADN
Cuando la doble hélice de ADN se somete a temperaturas elevadas, cambios en el pH o a
altas concentraciones salinas, los puentes de H entre bases se rompen y las dos cadenas se
separan. Es la desnaturalización y puede ser reversible, si las condiciones aplicadas no han
sido muy drásticas.
Si la renaturalización se lleva a cabo con ADN procedente de otro organismo, es posible
estudiar el grado de semejanza entre la secuencia de bases de los dos ADN ya que solo se
producirá emparejamiento en los tramos en los que las bases sean complementarias. Se
obtienen ADN híbridos con importantes implicaciones biotecnológicas.
ARN Es un polímero no ramificado, formado por ribonucleótidos unidos por
enlace éster fosfóricos. Difiere del ADN en:
- Su pentosa es la ribosa
- Sus bases nitrogenadas son A, U, C, G. No tiene T
- En algunos tipos de ARN de transferencia presentan bases nitrogenadas
Existen distintos tipos de
especiales, derivadas de las anteriores, aunque suelen ser minoritarias.
ARN:
- Sus cadenas suelen ser más cortas que las del ADN y pueden estar tanto
en el núcleo como en el citoplasma
• ARN mensajero o
ARNm
Excepto en algunos virus, el ARN es monocatenario (una sola cadena),
• ARN transferente o
aunque en el ARN de transferencia existen emparejamientos de bases
ARNt
intracatenarios, lo que hace que aparezcan tramos bicatenarios, por el
• ARN ribosómico o ARNr
plegamiento de la cadena sobre sí misma.
• ARN nucleolar o ARNn
El ARN se encarga de sintetizar proteínas específicas de un organismo
transmitiendo el mensaje genético codificado por el ADN, es decir, mientras
el ADN contiene la información, el ARN la utiliza para que se sinteticen las
proteínas específicas del individuo. En ciertos virus almacenan la
información genética y algunos tienen función enzimática
▪ Es monocatenario y lineal y es minoritario, constituye un 3-5% del ARN
ARN MENSAJERO celular.
▪ Es una copia de una parte del ADN (la correspondiente a la parte del gen
que se va a expresar) que será leída por los ribosomas con la información
para unir los aminoácidos en el orden adecuado y poder formar una
proteína concreta.
▪ Estas cadenas de ARN tienen la vida muy corta ya que si no fueran
destruidas por las ribonucleasas, la síntesis proteica se prolongaría
indefinidamente y se originaría una superproducción de proteínas. Así,
cuando se necesita una proteína concreta, se fabrica un nuevo ARNm.
▪ Forma parte de los ribosomas, uniéndose a proteínas y
ARN RIBOSÓMICO participa en el proceso de unión de los aminoácidos
para sintetizar las proteínas.
▪ No es una molécula específica de cada organismo, pues
a diferencia con el ARNm, no contiene información
sobre la clase de proteína que se va a sintetizar.
▪ Es el tipo de ARN más abundante. Constituye de 80-85%
del total.
▪ Existen cadenas distintas que se diferencian en el
coeficiente de sedimentación (medida de la velocidad a
la que sedimenta una molécula al someterla a una
fuerza centrífuga elevada y se mide en Svedberg)
▪ Se encarga de transportar los aminoácidos presentes en el citoplasma celular hasta
ARN los ribosomas, donde se unirán para formar las proteínas. Cada molécula de ARNt
transporta a un aminoácido concreto.
TRANSFERENTE ▪ Tiene forma de hoja de trébol, aunque en la célula se encuentra plegada formando
una estructura llamada estructura en boomerang.
▪ La diferencia entre los ARNt son debidas, sobre todo a una secuencia de 3 bases
nitrogenadas, el ANTICODÓN, que varía entre los distintos ARNt.
▪ Los ARNt están formados por cadenas cortas de 70-90 nucleótidos que contienen el
10% de las bases nitrogenadas diferentes a las 4 mayoritarias.
▪ Poseen una estructura secundaria característica, en la que existen tramos de doble
cadena, por emparejamiento intracatenario. Estos tramos se denominan brazos y
hay 4 en cada molécula, pueden tener otro brazo más pequeño, En los extremos de
3 de los brazos existen zonas sin emparejar llamadas bucles. Los brazos son:
- Brazo D se denomina así porque tiene dihidrouridina
- Brazo T contiene ribotiminida es el brazo de reconocimiento del ribosoma
- Brazo anticodón contiene un triplete de nucleótidos denominado anticodón
complementario al codón del ARNm
- Brazo aceptor: en el extremo 3' siempre hay una secuencia CCA. El aminoácido que
se va a transportar se une a un grupo OH de este nucleótido terminal de adenina. El
extremo 5'siempre tiene un nucleótido de guanina.
ARN Se encuentra constituyendo en parte el
nucleolo.
NUCLEOLAR
Se origina a partir de segmentos de ADN
denominados región organizadora nucleolar.
Al salir del nucleolo dará origen al ARN
ribosómico y luego, al unirse a las proteínas,
formarán los ribosomas.