SEGUNDA PRUEBA DE
EVALUACIÓN CONTINUA
BIOLOGÍA
GRADO EN FÍSICA
Mónica Morales Camarzana, Raquel Martín Folgar
2024-2025
Nombre: Lucas Saúl ..........................................................................................
Apellidos: Jiménez Férriz
E-mail: [email protected]
Teléfono: 688736423
Centro Asociado: Centro Asociado Elche
PRUEBA DE EVALUACIÓN CONTINUA 2
En esta práctica se proponen una serie de ejercicios para aplicar los contenidos estudiados en el
temario de la asignatura relacionados con la estructura del DNA, la expresión génica, técnicas de
DNA recombinante y Ecología. Usted debe contestar a las cuestiones planteadas en cada uno de los
ejercicios.
Ejercicio 1. El gen: su estructura básica en los eucariotas (2,5 puntos)
Ejercicio 2. Del gen a la proteína: obtención de una secuencia proteica (2,5 puntos)
Ejercicio 3. Digestión de DNA con enzimas de restricción (2,5 puntos)
Ejercicio 4. Tecnología del DNA recombinante (2,5 puntos)
1
EJERCICIO 1. EL GEN: SU ESTRUCTURA BÁSICA EN LOS EUCARIOTAS (2,5 puntos)
El gen es la unidad de transcripción básica. Consta de varios elementos que a lo largo del tiempo se
han identificado e incorporado a la definición del mismo. A pesar de que en un principio se definió un
gen como el fragmento de DNA que contiene información para codificar una proteína, hoy en día se
admite que un gen es aquel fragmento de DNA que contiene información para transcribir un RNA
funcional, es decir que no necesariamente se traduce en una proteína pero tiene una función celular.
En este ejercicio nos centraremos en un gen tipo que codifica para una proteína, pero el alumno ha de
tener presente que existen muchas variaciones sobre este esquema básico y que además de
productos proteicos los genes también codifican para RNAs con diversas funciones celulares.
1. En la figura se muestra el esquema general de un gen eucariota. Se representan varios
elementos, unos estructurales y otros implicados en la transcripción. Identifique cada uno de
los elementos señalados. (1,5 puntos)
1 2
3 4
DNA
5 6 7 8 9
Respuesta:
1. Región reguladora.
2. Región codificante.
3. Exones.
4. 3’.
5. Intensificador.
6. Promotor.
7. Caja TATA.
8. 5’.
9. Intrones.
2. Describa brevemente el proceso de transcripción en los eucariotas. (1 punto)
Respuesta:
En primer lugar, la ARN polimerasa produce una molécula de ARN cuya secuencia de bases es
complementara a la secuencia de la cadena molde de ADN. Luego la transcripción comienza
cuando unas proteínas llamadas factores de transcripción basales se unen a un promotor. En
respuesta, la ARN polimerasa se une al sitio. A partir de esto, el ARN se elonga en dirección 5’3’.
Finalmente, la transcripción termina después de que el ADN sea cortado en la dirección 3’ de la
secuencia poli(A).
2
EJERCICIO 2. DEL GEN A LA PROTEÍNA (2,5 puntos)
OBTENCIÓN DE UNA SECUENCIA PROTEICA
1. Dada la secuencia:
5´…CCUCAUAUGCGCCAUUAUAAGUGACACACA…3´
a) ¿A qué tipo de ácido nucleico pertenece? ¿Por qué? (0,5 puntos)
b) Señale los tripletes de iniciación y/o terminación de esta secuencia, si es que existen. (0,5
puntos)
c) ¿Qué péptido se obtendrá tras la traducción? (0,5 puntos)
d) ¿Cuál sería la secuencia de DNA a partir de la cual se transcribe esta secuencia? (0,5 puntos)
e) Proponga mutaciones que afecten al 12º nucleótido de la secuencia dada y que den como
resultado lo siguiente: mutación sinónima (0,5 puntos)
TABLA DEL CÓDIGO GENÉTICO
Respuesta:
a) Es una molécula de ARN, ya que contiene uracilo (U), una base nitrogenada exclusiva de este
tipo de ácido nucleico.
b) La secuencia incluye un triplete de inicio, AUG, y un triplete de terminación, UGA.
c) Met-Arg-His-Tyr-Lys
d) 3’…GGAGTATACGCGGTAATATTCACTGTGTGT…5’
e) El duodécimo nucleótido de la secuencia es una citosina (C). Una mutación sinónima no altera el
aminoácido resultante. Como este nucleótido forma parte del codón CGC, que codifica para
arginina (Arg), una posible mutación podría ser CGG.
3
EJERCICIO 3. DIGESTIÓN DE DNA CON ENZIMAS DE RESTRICCIÓN (2,5 puntos)
Las enzimas de restricción son una herramienta habitual en los laboratorios que se dedican a la
investigación en biología molecular, así como en el diagnóstico de numerosas patologías. A menudo,
se combinan con otras herramientas, como pueden ser los plásmidos, dando lugar a potentes
métodos que, hoy en día, hacen que sean imprescindibles para el análisis del DNA. El objetivo de
este ejercicio es familiarizar al alumno con las enzimas de restricción y proporcionar un primer
contacto en relación a su uso para que aprecie su utilidad a la hora de realizar el mapa de un
fragmento de DNA. Gracias a estas enzimas, podemos conocer la localización y orientación del
fragmento dado dentro del genoma y realizar posteriormente la clonación del mismo en plásmidos,
que se emplean para secuenciar el DNA, realizar estudios funcionales de ese DNA y/o de la proteína
que codifica.
Puede visitar la siguiente página web para aprender a interpretar geles de DNA cortados con enzimas
de restricción, y a continuación responda a las cuestiones planteadas en este ejercicio:
http://biomodel.uah.es/an/plasmido/3/index.htm.
1. En la figura 1 se muestra un plásmido (DNA circular de origen procariota) con un tamaño de 20.000
pares de bases (20kb). Contiene varios sitios de restricción, que corresponden a dos endonucleasas o
enzimas de restricción, BamHI y EcoRI. La presencia de 4 sitios de corte y sólo 2 enzimas indica que
una o las dos enzimas pueden tener más de un sitio de corte.
Bam HI
(1)
pX
Bam HI (20000pb)
(14000)
(12000)
Bam HI (8000)
EcoRI
Figura 1. Mapa del plásmido pX y puntos de referencia de la secuencia.
a) Analice el mapa representado y deduzca el tamaño de los fragmentos esperados si este
plásmido fuese digerido con la endonucleasa Bam HI, con EcoRI o con ambas enzimas a la
vez. (0,5 puntos)
En la figura 2 se muestra el resultado de una electroforesis en un gel de agarosa de los productos de
las digestiones del plásmido anterior con las enzimas de restricción. En la electroforesis se separan
los fragmentos de DNA generados, como consecuencia del corte con las enzimas, en función de su
tamaño. El tamaño, como se ha comentado antes, se expresa en pares de bases. El gel tiene cuatro
carriles que corresponden a:
Marcador (I) - consiste en una serie de fragmentos de DNA con un tamaño conocido que
se emplean como referencia para conocer el tamaño de los fragmentos obtenidos en la
digestión con las enzimas de restricción.
II, III y IV - Corresponden a los fragmentos de DNA obtenidos al digerir el plásmido con
una enzima o con las dos enzimas.
b) Analice los resultados del gel y deduzca con qué enzimas ha sido digerido el DNA cargado
en los carriles II, III y IV. (0,5 puntos)
4
Figura 2
Respuesta:
a.
Digestión con la endonucleasa Tamaños de los fragmentos esperados:
BamHI 12kb, 2kb, 6kb
EcoRI 20kb
BamHI/EcoRI 8kb, 4kb, 2kb, 6kb
b.
Carriles Enzimas utilizadas:
Carril II BamHI
Carril III BamHI/EcoRI
Carril IV EcoRI
2. Dada la secuencia de DNA siguiente:
5´- ATGCGAATTCCCGCCAGGTTATGCAATTCATG-3´
3´- TACGCTTAAGGGCGCTCCAATACGTTAAGTAC-5´
a) ¿Cuántos y cuáles serían los fragmentos que se originarían si se corta con la enzima de
restricción EcoRI? (0,25 puntos)
b) ¿Cuántos y cuáles serían los fragmentos que se originarían si se corta con la enzima de
restricción EcoRII? (0,25 puntos)
c) ¿Cuántos fragmentos se obtendrían si se cortara la secuencia de DNA con las dos enzimas
anteriores de forma simultánea? (0,25 puntos)
d) ¿Qué tipos de extremos en el DNA cortado generan estas enzimas de restricción? (0,25
puntos)
En el siguiente cuadro se incluyen las secuencias de reconocimiento de las enzimas de restricción
utilizadas en este ejercicio:
5
Respuesta:
a) EcoRI corta a la secuencia de ADN en dos fragmentos, 5´-ATGCG-3’ y 5’-
AATTCCCGCCAGGTTATGCAATTCATG-3´, y a su complementaria en tres fragmentos, 3’-
TACGCTTAA-5’, 3’- GGGCGCTCCAATACGTTAA-5’ y 3’- GTAC-5´.
b) EcoRII solo corta a la cadena de arriba de ADN en dos fragmentos: 5´-ATGCGAATTCCCG-
3’ y 5’-CCAGGTTATGCAATTCATG-3´.
c) Con las dos enzimas de forma simultánea se obtendrían tres fragmentos en ambas
cadenas. El primer fragmento: 5´-ATGCG-3’ y 3’-TACGCTTAA-5’, el segundo fragmento: 5’-
AATTCCCG-3’ y 3’- GGGCGCTCCAATACGTTAA-5’, el tercer fragmento: 5’-
CCAGGTTATGCAATTCATG-3´ y 3’- GTAC-5´.
d) Generan extremos cohesivos.
3. La Ingeniería genética es un conjunto de técnicas que permiten la manipulación y la transferencia
de genes de un organismo a otro. De este modo obtenemos organismos genéticamente modificados.
El DNA formado por la unión de fragmentos de DNA procedentes de organismos diferentes se
denomina DNA recombinante. Además, cuando introducimos el fragmento de DNA que se quiere
multiplicar en una bacteria, la bacteria multiplicará el DNA (clonación o replicación), esto nos permite
obtener grandes cantidades de un gen o de un DNA de interés.
a) Ordene la siguiente secuencia de hechos que se emplean en ingeniería genética: (0,25
puntos)
1)
1) Transferencia del vector que contiene el DNA de interés (vector recombinante) a
una célula en donde se replique, proceso llamado “transformación” de la célula
huésped.
2)
2) Obtención de un fragmento o fragmentos de DNA que han de utilizarse o
manipularse.
3)
3) Selección de aquellas células que llevan las moléculas de DNA recombinante
deseado, y su replicación como clones.
3)
4) Unión de los fragmentos de DNA formando una molécula compuesta, DNA
recombinante, que puede actuar como vector, o ser incorporado en un vector para
su posterior transmisión.
b) A continuación se presenta un esquema general para construir un clon de moléculas de
DNA recombinante utilizando plásmidos y endonucleasas de restricción. Observe y complete
los recuadros del esquema utilizando las siguientes referencias: (0,25 puntos)
a) Transferencia del vector a una célula huésped
b) Selección de las células con el DNA recombinante
c) Replicación del vector
6
d) Cortes realizados por la enzima de restricción
e) Apareamiento y unión (ligasa) del vector y el DNA de interés
f) Cromosoma célula huésped
g) Vector recombinante
h) Secuencias de corte
de la enzima de
restricción
Respuesta:
a) 2, 4, 1, 3.
b) a.5
b.7
c.8
d.2
e.3
f.6
g.4
h.1
7
EJERCICIO 4. TECNOLOGIA DEL DNA RECOMBINANTE (2,5 puntos)
(Fuente:
http://biomodel.uah.es/epb/molecular_bio/problem_sets/Recombinant_DNA_Technology/
recombinant_dna.html)
El rápido avance de las técnicas en el campo de la biología molecular está revolucionando la práctica
de la medicina. Son muchos los usos de estas técnicas para el diagnóstico y el tratamiento de
enfermedades.
El término del DNA recombinante hace referencia a la generación de nuevas secuencias de DNA en
combinaciones nuevas (DNA recombinante) de segmentos o de moléculas de DNA que no se
encuentran juntas de manera natural.
La tecnología del DNA recombinante utiliza técnicas que provienen de la bioquímica de los ácidos
nucleicos unidas a metodologías genéticas desarrolladas originalmente para la investigación de
bacterias y de virus. La utilización del DNA recombinante es una herramienta muy poderosa para
explorar y manipular los genes, y actualmente son utilizadas para identificar genes defectuosos
asociados con enfermedades y para corregir defectos genéticos.
Con el conjunto de problemas que se proponen a continuación, se revisan algunas técnicas básicas
de DNA recombinante y su aplicación en la mejora de la salud humana.
Una de las aplicaciones de la huella genética o huella de DNA en la ciencia forense, es la
identificación de los culpables en casos de violación, mediante la comparación de los sospechosos
con muestras de sangre, cabello, saliva o semen encontradas en las víctimas. Se obtuvieron muestras
de DNA de 4 sospechosos en el caso de una violación y las muestras fueron comparadas con el
semen encontrado en la víctima utilizando la “huella de DNA”. Las muestras de DNA se amplificaron
por PCR para amplificar las regiones que contienen un número variable de repeticiones en tándem
(VNRT). Los resultados, utilizando una sonda para una de las secuencias repetidas en el DNA
humano, se muestran en la imagen:
8
1. Si fuera Ud. el analista de DNA, sacaría como conclusión (subraye la respuesta correcta) (0,5
puntos):
a. Los sospechosos 2 y 3 quedan excluidos como origen de la prueba del delito.
b. El sospechoso 4 tiene un patrón similar al del semen encontrado en la víctima y no se puede
descartar como culpable del delito.
c. El sospechoso 3 queda excluido como origen de la prueba del delito, pero no se puede descartar al
sospechoso 1.
d. El sospechoso 3 tiene un patrón idéntico al del semen encontrado en la víctima y se confirma como
culpable del delito.
2. Explique brevemente en qué consiste la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). (1 punto)
Respuesta:
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una técnica de biología molecular que amplifica
fragmentos específicos de DNA. Consiste en tres etapas: desnaturalización (separación de las
cadenas de DNA, alineamiento (unión de cebadores a las cadenas) y extensión (síntesis de nuevas
cadenas de DNA por la enzima DNA polimerasa). Este proceso se repite en ciclos, permitiendo la
amplificación exponencial del DNA objetivo.
3. La organización del gen rhoS en Enterobacter es variable. En algunas estirpes aparece un
inserto entre el promotor y la secuencia codificante del gen. Se analizó la presencia de dicho
inserto en varias estirpes. El análisis se basó en una amplificación mediante PCR utilizando los
oligonucleótidos que se indican en la figura. Se muestran los resultados obtenidos.
¿Qué estirpes presentan el inserto? (1 punto)
210pb 523pb 98pb 917pb
Inserto rhoS
Oligo 1 Oligo 2 Oligo 3
9
EcIUCM01
EcIFJD23
EcIMJ44
EcIMK
1748pb
1225pb
917pb
Respuesta:
EcIMK y EcIUCM01 no presentan el inserto, puesto que solo presentan bandas en 917pb y
1225pb, que es la suma de todos los segmentos, excepto el del inserto. En cambio, EcIMJ44 y
EcIFJD23 sí presentan el inserto, ya que tienen bandas en 917pb y 1748pb, que es la suma de
todos los segmentos, además del inserto.
10
