Carrera de Medicina
Bioquímica
Tema III
LA MATERIA
Llamamos materia a todo aquello que ocupa un lugar determinado en el universo o espacio, posee
una cantidad determinada de energía y está sujeto a interacciones y cambios en el tiempo, que
pueden ser medidos con algún instrumento de medición. La química es la ciencia que se ocupa de
estudiar la composición y transformación de la materia.
La materia existe en tres estados físicos fundamentales:
a.- Gas: es una materia cuya forma y volumen es infinitamente variable. Ej.: con el mismo peso de
gas puede llenarse una pequeña caja o un enorme balón.
b.- Líquido: es una materia cuya forma es infinitamente variable, adaptándose a la forma del
recipiente que lo contiene.
c.- Sólido: es una materia cuya forma permanece constante.
Concepto de cuerpo: Para definir un cuerpo es fundamental indicar su forma, porque si ésta
desaparece origina otro u otros cuerpos. Ej.: si destrozo una botella, los fragmentos serán
cualquier otro cuerpo menos una botella. O sea que: CUERPO es una porción limitada de materia.
Concepto de sustancia: Existen diferentes clases de materia que le dan a los cuerpos propiedades
particulares. Ej.: si tengo tres cuerpos esféricos; uno de vidrio, otro de cobre, otro de plomo;
tienen en común su forma, pero se diferencian por su color y su peso. Estas distintas clases de
materia se llaman: SUSTANCIA: Para definirla no es necesario indicar su forma porque si destruyo,
por ejemplo, el cuerpo esférico de vidrio, cada uno de los trozos sigue teniendo las propiedades
del vidrio. Es decir que se ha destruido el cuerpo, pero no la sustancia.
Existen dos clases de sustancias:
Sustancias simples, formadas por átomos y moléculas de un solo elemento químico ejemplo
oxigeno O2.
Sustancias compuestas, formadas por elementos distintos, ejemplo agua H2O.
Elemento químico: Elemento químico es el componente presente en todas las sustancias simples.
Símbolos: Para simplificar la escritura de los elementos químicos se utilizan letras que se
denominan símbolos. “Símbolo de un elemento es la abreviatura admitida para representarlo”
ejemplo; Hidrogeno H.
Los elementos se clasifican en metales, no metales, metaloides, elementos inertes gases raros o
gases nobles.
Metales: Estos elementos presentan las propiedades generales siguientes:
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Poseen brillo metálico
Son buenos conductores del calor y de la electricidad
Sólidos a la temperatura de 20º C, con excepción del mercurio (Hg) que es líquido.
No metales: Estos elementos tienen los caracteres generales siguientes:
Carecen de brillo metálico
Malos conductores del calor y electricidad
Algunos son sólidos (yodo, carbono, azufre, etc.); líquidos (bromo) y gaseosos (oxígeno, hidrógeno,
nitrógeno, cloro, etc.)
Metaloides: Estos elementos tienen algunas propiedades metálicas y otras no metálicas. De los
104 elementos conocidos, sólo 5 son metaloides: boro, silicio, germanio, arsénico y antimonio.
Elementos inertes, gases raros o gases nobles: Se presentan sólo en estado libre como
monoatómicos. Son muy inertes y no forman generalmente sustancias compuestas, es decir, no se
combinan con facilidad con otros átomos.
En la naturaleza las formas de carbono, tanto orgánicas como inorgánicas, se encuentran
ampliamente distribuidas. Los compuestos orgánicos son aquellos en los que los átomos de
carbono se unen covalentemente entre sí para formar el esqueleto de la molécula. Algunos
compuestos de carbono muy simples se consideran inorgánicos, en especial si el carbono no está
unido a otro átomo de carbono o hidrógeno. Los compuestos orgánicos se denominan así porque
durante algún tiempo se creyó que solo eran producidos por organismos vivos (orgánicos).
Bioelementos
Los bioelementos o elementos biogénicos son los elementos químicos, presentes en seres vivos.
La materia viva está constituida por unos 70 elementos, la práctica totalidad de los elementos
estables que hay en la Tierra, excepto los gases nobles. No obstante, alrededor del 99% de la masa
de la mayoría de las células está constituida por cuatro elementos, carbono (C), hidrógeno
(H), oxígeno (O) y nitrógeno (N), que son mucho más abundantes en la materia viva que en la
corteza terrestre.
Según su intervención en la constitución de las biomoléculas, los bioelementos se clasifican en
primarios y secundarios.
Bioelementos primarios
Los bioelementos primarios son los elementos indispensables para formar las biomoléculas
orgánicas (glúcidos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos); constituyen el 96% de la materia viva
seca. Son el carbono, el hidrógeno, el oxígeno, el nitrógeno, el fósforo y el azufre (C, H, O, N, P, S,
respectivamente).
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Carbono: forman largas cadenas carbono-carbono (macromoléculas) mediante enlaces simples
(-CH2-CH2) o dobles (-CH=CH-), así como estructuras cíclicas. Pueden incorporar una gran
variedad de radicales (=O, -OH, -NH2, -SH, PO43-), lo que da lugar a una variedad enorme de
moléculas distintas. Los enlaces que forma son lo suficientemente fuertes como para formar
compuestos estables, y a la vez son susceptibles de romperse sin excesiva dificultad.
Hidrógeno: además de ser uno de los componentes de la molécula de agua, indispensable para
la vida y muy abundante en los seres vivos, forma parte de los esqueletos de carbono de las
moléculas orgánicas. Puede enlazarse con cualquier bioelemento.
Oxígeno: es un elemento muy electronegativo que permite la obtención de energía mediante
la respiración aeróbica. Además, forma enlaces polares con el hidrógeno, dando lugar a
radicales polares solubles en agua
Nitrógeno: principalmente como grupo amino (-NH2) presente en las proteínas ya que forma
parte de todos los aminoácidos. También se halla en las bases nitrogenadas de los ácidos
nucleicos. Prácticamente todo el nitrógeno es incorporado al mundo vivo como ion nitrato, por
las plantas. El gas nitrógeno solo es aprovechado por algunas bacterias del suelo y algunas
cianobacterias.
Fósforo. Se halla principalmente como grupo fosfato formando parte de los nucleótidos. Forma
enlaces ricos en energía que permiten su fácil intercambio (ATP).
Bioelementos secundarios
Los bioelementos secundarios se encuentran en menor proporción en todos los seres vivos, en
forma iónica, en proporción de 4.5%. Estos realizan funciones de vital importancia en
la fisiología celular.
Calcio (Ca): Integra los carbonatos de calcio de estructuras esqueléticas. Iónicamente
interviene en la contracción muscular, la coagulación sanguínea y el impulso nervioso.
Sodio (Na): Es un catión abundante en el medio extracelular; muy necesario en la conducción
nerviosa y en la contracción muscular.
Potasio (K): Constituye el catión más abundante en el interior de las células; es necesario para
el sistema nervioso y en la contracción muscular.
Magnesio (Mg): Constituye un elemento esencial en la cadena alimentaria de los seres vivos, ya
que es parte integrante de la molécula de clorofila, imprescindible en la fotosíntesis: todos
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nuestros alimentos proceden, directa o indirectamente de la función vegetal de fotosíntesis.
Como ion actúa junto con las enzimas en muchas reacciones químicas del organismo.
Cloro (Cl): Es el anión más frecuente; resulta necesario para mantener el balance de agua en
la sangre y en el fluido que se encuentra entre unas y otras células en los tejidos.
Hierro (Fe): Asociado a los componentes proteínicos (hemoglobina, mioglobina, citocromos).
Permite el almacenamiento y transporte de minerales.
Cobre (Cu): Forma parte de la hemocianina, activador coenzimático, también participa en la
formación de la hemoglobina.
Yodo (I): Componente de la hormona tiroxina, su deficiencia ocasiona el cretinismo en
los niños y el bocio en los adultos.
Cobalto (Co): Componente de la vitamina B12
Zinc (Zn): Componente de la insulina, participa en el desarrollo y crecimiento de los huesos.
Cromo (Cr): Participa en el metabolismo de los glúcidos.
Níquel (Ni): Activa e inhibe enzimas, participa en la coagulación sanguínea.
Oligoelementos
Glúcidos
Son las biomoléculas más abundantes en los seres vivos. Están formados por C, H y O. Se clasifican
en monosacáridos, disacárido y polisacáridos. Proporcionan energía a los seres vivos.
Monosacáridos. Son los más sencillos. El principal es la glucosa, cuya fórmula molecular es C6H12O6.
Otros son la fructosa, la ribosa o la galactosa. Tienen sabor dulce y todos son solubles en agua.
Disacáridos. Resultan de la unión de dos monosacáridos con eliminación de una molécula de agua.
Son solubles en agua y tienen sabor dulce. Los principales son la sacarosa y la lactosa.
Polisacáridos. Son polímeros que se componen de muchas unidades de monosacáridos. Son
insolubles en agua y no tienen sabor dulce. Los principales son el almidón, la celulosa y
el glucógeno.
Lípidos
Son compuestos orgánicos que están formados por C, H y O. Son insolubles en agua, tienen menor
densidad que ésta, no forman polímeros y son reservas energéticas de los seres vivos.
Los principales son los glicéridos, fosfolípidos y esteroides.
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Glicéridos. Pueden ser mono, di o triglicéridos. Están formados por ácidos grasos y glicerina y
según el tipo de ácido graso pueden ser.
Grasas. Predominan los ácidos grasos saturados, son sólidas a temperatura ambiente. Proceden,
en general, de animales.
Aceites. Predominan los ácidos grasos insaturados, son líquidos a temperatura ambiente.
Proceden, en general, de vegetales.
Fosfolípidos. Su estructura es similar a los triglicéridos donde un ácido graso ha sido sustituido por
un ácido fosfórico, forman parte de las membranas celulares. El más abundante es la lecitina.
Esteroides. Son derivados de un hidrocarburo cíclico. El más importante es el colesterol que forma
parte de las membranas celulares
Proteínas
Son polímeros naturales que contienes C, H, O, N, y también pueden llevar S y P. Están
constituidas por aminoácidos, que son moléculas que tienen grupo amino (-NH2) y un grupo
carboxilo (-COOH) en la misma unidad.
Se forman mediante una reacción entre el grupo amino y el grupo acido de distintas moléculas,
que se une mediante un enlace denominado peptídico.
Ácidos nucleicos
Son macromoléculas formadas por C, H, O, N y P. Los monómeros que los originan son los
nucleótidos, que a su vez, se forman a partir de las siguientes moléculas sencillas:
El ácido fosfórico: H3PO4
Un monosacárido de cinco átomos de carbono: ribosa o desoxirribosa
Una base nitrogenada: adenina (A), guanina (G), citosina (C), uracilo (U) y timina (T).
Enlaces químicos
Los átomos pueden mantenerse unidos por fuerzas de atracción denominadas enlaces químicos.
Cada enlace equivale a una determinada cantidad de energía química. Los dos tipos principales de
enlaces químicos son los enlaces covalentes y los iónicos.
Enlace covalente
Los enlaces covalentes suponen compartir electrones entre átomos de tal manera que cada átomo
queda con su capa de valencia completa.
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Cuando dos átomos comparten un par de electrones, el enlace covalente se denomina enlace
covalente sencillo. El enlace covalente se denomina enlace covalente doble cuando dos pares de
electrones se comparten de este modo, lo que se representa con dos líneas continuas paralelas.
De forma similar, se forma un enlace covalente triple (que se representa por tres líneas continuas
paralelas) cuando dos átomos comparten tres pares de electrones.
Enlaces iónicos
Un átomo se convierte en un ión cuando acepta o dona uno o más electrones. Los átomos con 1,2
o 3 electrones en su capa de valencia tienden a donar electrones a otros átomos. Al hacerlo,
adquieren carga positiva debido a que su núcleo contiene más protones que electrones orbitando
a su alrededor. Estos iones cargados positivamente se denominan cationes. Los átomos con 5,6 o 7
electrones de valencia tienden a aceptar electrones de otros átomos y se convierten en aniones
cargados negativamente.
Un enlace iónico se forma como consecuencia de la atracción entre la carga positiva de un catión y
la carga negativa de un anión. Un compuesto iónico es una sustancia compuesta de aniones y
cationes unidos mediante sus cargas opuestas.
Enlaces de hidrógeno o puente de hidrógeno
Cuando este elemento se combina con oxígeno (u otro átomo relativamente electronegativo como
el nitrógeno), adquiere carga parcial positiva debido a que su electrón está más tiempo cerca del
átomo electronegativo. Los enlaces de hidrogeno tienden a formarse entre un átomo con carga
parcial negativa y otro de hidrogeno que está unido covalentemente al oxigeno o nitrógeno.
Los enlaces de hidrogeno se forman y rompen con facilidad. Aunque que a nivel individual son
relativamente débiles, en conjunto son fuertes cuando se encuentran en gran número
Interacciones hidrófobas
Es la tendencia que presentan las moléculas apolares a agruparse cuando se encuentran en un
medio acuoso. Realmente, es el agua el que tiende a comprimirlas entre si hasta que se unen. La
fuerte inclinación de las moléculas de agua a formar enlaces de hidrógeno con otras moléculas,
determina su comportamiento frente a moléculas no polares, incapaces de formar enlaces de
hidrógeno, tales como alcanos, hidrocarburos en general, fluorcarburos, átomos inertes. Cuando
las moléculas de agua entran en contacto con este tipo de moléculas se encuentran con un
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aparente dilema: cualquiera que sea el sitio al que la molécula de agua enfoque, parece que una o
más de las cuatro cargas moleculares tiene que apuntar hacia la molécula inerte de soluto y por
tanto pierde capacidad de formar enlaces de hidrógeno. Claramente la mejor configuración sería
la de tener el menor número de cargas tetraédricas apuntando hacia la especie de soluto, de
modo que las otras cargas pudieran apuntar hacia la fase acuosa siendo por tanto capaces de
participar en enlaces de hidrógeno, tanto como antes.
Enlace por Fuerzas de Van der Walls
Incluso las moléculas no polares eléctricamente neutras pueden desarrollar de forma transitoria
regiones con carga débil positiva o negativa. Estas pequeñas cargas se desarrollan como
consecuencia del hecho de que los electrones están en constante movimiento. Una región con un
exceso temporal de electrones tendrá una carga negativa débil, mientras que aquella con un
déficit de electrones tendrá una carga positiva débil. Las moléculas adyacentes pueden
interaccionar con regiones de carga ligeramente opuesta. Estas fuerzas de atracción, denominadas
fuerzas de van der walls, que actúan en distancias muy cortas y son más débiles y menos
específicas que los demás tipos de interacciones que hemos estudiado. Estas son las más
importantes cuando se dan en gran número y cuando las formas de las moléculas permiten un
contacto estrecho entre los átomos. Aunque una única interacción es muy débil, la fuerza de unión
de un número elevado de interacciones de este tipo actuando a la vez puede ser importante.
Grupos funcionales
El grupo funcional es un átomo o conjunto de átomos unidos a una cadena carbonada,
representada en la fórmula general por R para los compuestos alifáticos y como Ar (radicales
alifáticos) para los compuestos aromáticos. Los grupos funcionales son responsables de la
reactividad y propiedades químicas de los compuestos orgánicos.
La combinación de los nombres de los grupos funcionales con los nombres de los alcanos de los
que derivan brinda una nomenclatura sistemática poderosa para denominar a los compuestos
orgánicos.
Hidroxilo (-OH)
El grupo hidroxilo es un grupo funcional formado por un átomo de oxígeno y otro de hidrógeno,
característico de los alcoholes, fenoles y ácidos carboxílicos entre otros compuestos orgánicos.
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Hidroxilo u oxhidrilo es también el nombre usado para referirse al anión OH-, uno de los iones
poliatómicos más simples y más importantes que se encuentra en los hidróxidos. Este ion está
formado por un oxígeno y un hidrógeno y su carga eléctrica es -1.
Carbonilo (C=O)
Un grupo carbonilo es un grupo estructural que consiste en un átomo de carbono con un doble
enlace a un átomo de oxígeno. La palabra carbonilo puede referirse también al monóxido de
carbono como ligando en un complejo inorgánico u organometálico (eje. níquel carbonilo); en este
caso, el carbono tiene un doble enlace con el oxígeno.
Un grupo carbonilo caracteriza los tipos siguientes de compuestos (-CO quiere decir un grupo
carbonilo):
Aldehído
Cetona
Ácido carboxílico
Éster
Amida
Enona
Acetilo
Cloruro de acilo
Anhídrido
Carboxilo (-COOH)
Los ácidos carboxílicos tienen como fórmula general R-COOH. Tienen propiedades ácidas; los dos
átomos de oxígeno son electronegativos y tienden a atraer a los electrones del átomo de
hidrógeno del grupo hidroxilo con lo que se debilita el enlace, produciéndose en ciertas
condiciones una ruptura heterolítica, cediendo el correspondiente protón o hidrón, H+, y
quedando el resto de la molécula con carga -1 debido al electrón que ha perdido el átomo de
hidrógeno, por lo que la molécula queda como R-COO-.
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Generalmente los ácidos carboxílicos son ácidos débiles, con sólo un 1 % de sus moléculas
disociadas para dar los correspondientes iones, a temperatura ambiente y en disolución acuosa.
Amino (-NH2)
Un grupo amino es un grupo funcional derivado del amoníaco o alguno de sus derivados
alquilados por eliminación de uno de sus átomos de hidrógeno. Se fórmula según su procedencia
como -NH2, -NRH o -NR2. Un compuesto que contiene un grupo amino es una amina o una amida.
Los grupos amino, y las aminas, se clasifican según la cantidad de sustituyentes diferentes al
hidrógeno en aminas primarias (RNH2), secundarias (R2NH), terciarias (NR3) y cuaternarias ((NR4)
+).
Sulfhídrilo (-SH)
Un tiol es un compuesto que contiene el grupo funcional formado por un átomo de azufre y un
átomo de hidrógeno (-SH). Siendo el azufre análogo de un grupo hidroxilo (-OH), este grupo
funcional es llamado grupo tiol o grupo sulfhidrilo. Tradicionalmente los tioles son denominados
mercaptanos.
Biomoléculas inorgánicas
Agua
Gran parte de la masa de la mayoría de los organismos es agua. En los tejidos humanos, el
porcentaje de agua varia del 20% en los huesos al 85% en las células cerebrales; alrededor del 70%
de nuestro peso corporal total corresponde al agua. La proporción de hasta 95% en las medusas y
en algunas plantas. Las moléculas de agua son polares; es decir, en extremos de cada molécula
posee carga parcial positiva y el otro tiene carga parcial negativa. En el agua líquida y en el hielo,
las moléculas están asociadas por enlaces de hidrogeno, los cuales se forman cuando un átomo de
hidrógeno, con su carga parcial positiva, es atraído por el de oxigeno de una molécula adyacente,
con carga parcial negativa.
Debido a que sus moléculas son polares, el agua es un disolvente excelente, un líquido capaz de
disolver muchos tipos de sustancias, en particular compuestos polares e iónicos. Sus propiedades
de disolvente y la tendencia de los átomos de determinados compuestos a formar iones cuando
están en solución hacen que el agua tenga una importante función facilitando las reacciones
químicas. Las sustancias que interaccionan fácilmente con el agua son hidrófilas.
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Propiedades del agua:
Alto calor específico: esta propiedad está en relación con los puentes de hidrógeno que se
forman entre las moléculas de agua. El agua puede absorber grandes cantidades de "calor" que
utiliza para romper los puentes de hidrógeno por lo que la temperatura se eleva muy
lentamente. Esto permite que el citoplasma acuoso sirva de protección ante los cambios de
temperatura. Así se mantiene la temperatura constante.
Alto calor de vaporización: también los puentes de hidrógeno son los responsables de esta
propiedad. Para evaporar el agua, primero hay que romper los puentes y posteriormente dotar
a las moléculas de agua de la suficiente energía cinética para pasar de la fase líquida a la
gaseosa. Para evaporar un gramo de agua se precisan 540 calorías, a una temperatura de 20º
C.
Alta tensión superficial: La fuerza de interacción de la tensión superficial del agua es la fuerza
de van der Waals entre moléculas de agua. La aparente elasticidad causada por la tensión
superficial explica la formación de ondas capilares. A presión constante, el índice de tensión
superficial del agua disminuye al aumentar su temperatura. También tiene un
alto valor adhesivo gracias a su naturaleza polar.
Capilaridad: se refiere a la tendencia del agua a moverse por un tubo estrecho en contra de la
fuerza de la gravedad. Esta propiedad es aprovechada por todas las plantas vasculares, como
los árboles.
Bajo grado de ionización: la mayor parte de las moléculas de agua no están disociadas. Sólo un
reducido número de moléculas sufre disociación, generando iones positivos (H+) e iones
negativos (OH-). En el agua pura, a 25ºC, sólo una molécula de cada 10.000.000 está disociada,
por lo que la concentración de H+ es de 10-7. Por esto, el pH del agua pura es igual a 7.
La densidad del agua: En estado líquido, el agua es más densa que en estado sólido. Por ello, el
hielo flota en el agua. Esto es debido a que los puentes de Hidrógeno formados a temperaturas
bajo cero unen a las moléculas de agua ocupando mayor volumen.
Las sales minerales
Las sales minerales son biomoléculas inorgánicas que aparecen en los seres vivos de forma
precipitada, disuelta en forma de iones o asociada a otras moléculas.
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Precipitadas: Las sales se forman por unión de un ácido con una base, liberando agua. En forma
precipitada forman estructuras duras, que proporcionan estructura o protección al ser que las
posee. Ejemplos son las conchas, los caparazones o los esqueletos.
Disueltas: Las sales disueltas en agua manifiestan cargas positivas o negativas. Los cationes más
abundantes en la composición de los seres vivos son Na+, K+, Ca2+, Mg2+... Los aniones más
representativos en la composición de los seres vivos son Cl-, PO43-, CO32-... Las sales disueltas en
agua pueden realizar funciones tales como:
Mantener el grado de grado de salinidad.
Amortiguar cambios de pH, mediante el efecto tampón.
Controlar la contracción muscular
Producir gradientes electroquímicos
Estabilizar dispersiones coloidales.
Asociadas a otras moléculas: Los iones pueden asociarse a moléculas, permitiendo realizar
funciones que, por sí solos no podrían, y que tampoco realizaría la molécula a la que se asocia, si
no tuviera el ión. La hemoglobina es capaz de transportar oxígeno por la sangre porque está unida
a un ión Fe++. Los citocromos actúan como transportadores de electrones porque poseen un ión
Fe+++. La clorofila captura energía luminosa en el proceso de fotosíntesis por contener un ión Mg+
+ en su estructura.
Biomoléculas orgánicas: Carbohidratos
Los carbohidratos son moléculas biológicas muy abundantes. Se les conoce con el nombre de
azúcares y están formadas por carbono, hidrógeno y oxígeno. Los carbohidratos o azúcares se
pueden encontrar en diferentes formas.
Los monosacáridos
Están formados por una cadena de tres a siete átomos de carbonos. De acuerdo al número de
carbonos se les llama triosa (3 carbonos), tetrosa (4 carbonos), pentosa (5 carbonos) y así
sucesivamente, la glucosa que está formada por 6 carbonos, es una hexosa, lo mismo que la
fructosa o azúcar de las frutas. La glucosa no se encuentra en la naturaleza en forma lineal, sino
que tiende a formar anillos.
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Oligosacáridos
La sacarosa es el azúcar que ponemos en la mesa todos los días, se obtiene de la caña de azúcar o
remolacha. Los disacáridos están formados por dos monosacáridos. En la sacarosa se une una
molécula de glucosa y una de fructosa. Otro disacárido familiar es la lactosa, que es el azúcar de
la leche, está formada de la unión de la glucosa y la galactosa. La maltosa está formada por la
unión de dos moléculas de glucosa.
Polisacáridos
Son polímeros formados por la unión de muchos monosacáridos, algunos funcionan como reserva
energética tanto en plantas como en animales mientras que otros cumplen funciones
estructurales, es decir, que dan forma y firmeza a ciertos organismos.
