Estructuras Biomoleculares 2025: Algunos ajustes al cronograma
Videos en campus
ABP Estructuras Biomoleculares: Propuesta 2025
Educación
Martes de 14:00 a 16:30hs, virtual
pública
5/3/25: Renuncia
masiva de prof. de
programas de
vacunas, VIH,
tuberculosis y lepra
Salud
pública
Infecciones emergentes, zoonosis y ecoepidemiología
Murciélagos, reservorios “ideales” de zoonosis virales…
Únicos Mamíferos Voladores
(algunas spp migratorias) ✔
Cuando yo estudiaba…(2000’) Superorden: Tokotheria
Gran-orden Anagalida:
Roedores
.T o k o t h e r i a.
Musarañas (macroscelidea)
Lagomorfos (liebres
y conejos)
Gran-orden Archonta:
Primates
Scandentidos
(musarañas
arbóreas)
Ardillas voladoras (Dermoptera) Murciélagos
Ahora… Morphology Genetics Euarchontoglires
Laurasiatheria
Murciélagos, reservorios “ideales” de zoonosis virales…
Mamíferos Voladores (migración) ✔
Sinantrópicos ✔ Gregarios (coloniales) ✔
https://www.instagram.com/reel/DFp-0YBOaCI/?igsh=MTVwemRkOGlzN2N1bg%3D%3D
Murciélagos, reservorios “ideales” de zoonosis virales…
Mamíferos Voladores (migración) ✔
Sinantrópicos ✔ Gregarios (coloniales) ✔
Longevos ✔
Longevidad y la regla del “billon beats”
Uroderma
bilobatum
Bradicardia cíclica!!!!
Mu
rcié
lag
os
Peto’s Paradox:
4/11 spp
-> 0%
Data on adult zoo mammals (110,148 individuals, 191 species)
DNA repair?
Dieta? Metabolismo?
Murciélagos, reservorios “ideales” de zoonosis virales…
Mamíferos Voladores (migración) ✔
Sinantrópicos ✔ Gregarios (coloniales) ✔
Longevos ✔
Además (y no menos importante):
Alta viremia asintomática ❓❓
Respuesta a estrés (1h)
Ahorro energético Uroderma bilobatum
hormona pleiotrópica
En humanos…
Viremia asintomática: en qué consiste?
Inmunología de los murciélagos… porque estudiarla?
Inmunología de los murciélagos… porque estudiarla?
Propuestas p/ABP de EB2025:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1zDxAqpt7uOeaP2_e1679G7VzwWBH5hO_o1hO0kmxgMQ/edit?usp=sharing
1000 genomas
(Inmuno)Biología Estructural comparada de microquirópteros de interés:
Flia Especies c/genomas secuenciados y/o anotados (Bat1K)
Phyllostomidae Desmodus rotundus, Diaemus youngi
Molossidae Molossus molossus, M. nigricans, Tadarida brasiliensis
Vespertilionidae Eptesicus furinalis, E. fuscus, Myotis lucifugus, M. yumanensis
Marcadores leucocitarios (CD), qué son y para qué sirven?.
mAb dirigidos contra marcadores leucocitarios (CD), la principal herramienta
del inmunólogo:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1
zDxAqpt7uOeaP2_e1679G7VzwWBH5h
O_o1hO0kmxgMQ/edit?usp=sharing
Interacción Ag-Ab
Ab
Parátope
Epítope
Ag
Parátope y epítope, un tipo especial de interacción
proteina-proteina (PPI)
ABP: Ab repurposing
Objetivo: Re-paratoping de Ab conocidos dirigidos contra marcadores leucocitarios (CD)
de especies modelo.
Euarchontoglires Laurasiatheria
Regla 1: la secuencia de la fracción extracelular
(“ectodomain”) de una proteína integral de
membrana es mucho menos conservada entre
especies que la fracción intracelular
Variabilidad aa
interespecífica
Regla 2: la Estructura 2º y 3º de una proteína (función) se conserva mucho más que la
secuencia 1º (filogenia).
ABP: Ab repurposing
Objetivo: Reparatoping de Ab conocidos dirigidos contra marcadores leucocitarios (CD).
DeepPPAPredMut
Estrategia?
1.Estructuras 3D de 3.Hom.Modeling -> 5. Retro-mutación Iterativa
complejos Ag-Ab Epitope-chirpAg.
6. Cross-validation
2.Seq.homólogas chirp. de Ag 4. Alineamiento estructural
2.1 Alineamiento Ag-chirpAg Ab->Epitope-chirpAg. 7. Automatization (en común?)
2.2 Proteína de fusión: Epitope-chirpAg.
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1zDxAqpt7uOeaP2_e1679G7VzwWBH5hO_o1hO0kmxgMQ/edit?usp=sharing
5. Retro-mutación Iterativa Ab experimental (PDB)
Estabilidad
del complejo
ΔΔG Prediction
Iteración 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Ag chimerico = scaffold de murci +
epitope original (PDB)
DeepPPAPredMut
Ab experimental mutado en residuo/s q
5. Retro-mutación Iterativa contacta/n residuo #1
A G
P D
A
ΔΔG Prediction I W
W
P
G
0 ?
I 1 <5Å
mínimo
Iteración 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Iteración #1:
?
Ag chimerico retro-mutado en residuo #1
DeepPPAPredMut
Ab experimental mutado en residuo/s q
contacta/n residuo #1
PPI: Interacciones Proteína-Proteína
A G
P D
I W
1 5Å
Iteración #1:
Ag chimerico retro-mutado en residuo #1
Opción #2:
Chain B
Q45
QB45A
QB45C
… 20
QB45V
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1zDxAqpt7uOeaP2_e1679G7VzwWBH5h
O_o1hO0kmxgMQ/edit?usp=sharing
Opción #1:
Para acelerar: 2 retromutaciones distantes en
simultáneo
Chain B
Q45
Y21
QB45A YB21A No al azar… 2
QB45I YB21M
QB45T YB21N
Opción #2:
Chain 2
2
1
4
5
3
7
6
9 10
6. Cross-validation
del reparatopeado
Afinidad aparente
G1 Intento 2
G1 Intento 3
G1 Intento 2
G1 Intento 1
Afinidad aparente del crystal (PDB)
6. Cross-validation: puesta en común
del reparatopeado
Afinidad aparente
G1 Intento 2
G2 Intento 2
G1 Intento 3
G2 Intento 2
G1 Intento 2
G2 Intento 1
G1 Intento 1
Afinidad aparente del crystal (PDB)
Opción #3:
Chain B
Q45
1
5. Retro-mutación Iterativa
Ab re-paratopeado
ΔΔG Prediction
R
0 I
A
F
G A
2
1 R W
4
5
3
H
I R A F G R A W H L 7
6
8
L
Retro- 9 10
mutación 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
DeepPPAPredMut
Idea #2: Respuesta a estrés y SI
Objetivo: Biología estructural comparativa de
Hormonas y receptores del eje H->P->A en géneros
de interés (urbanos, insectívoros, etc.)
Idea #3: Receptores Fc de Ab?
Objetivo: Análisis comparativo estructural-funcional de los
receptores de Fc de anticuerpos IgG, IgA, IgE e IgG
transplacentarios de géneros de interés.
Idea #3: Receptores Fc de Ab?
Objetivo: Análisis comparativo estructural-funcional de los receptores de Fc de
anticuerpos IgG, IgA, IgE e IgG transplacentarios de géneros de interés
Idea #3: Receptores Fc de Ab?
Objetivo: Análisis comparativo estructural-funcional de los receptores de Fc de
anticuerpos IgG, IgA, IgE e IgG transplacentarios de géneros de interés
Tareas iniciales?
CD64
Model affinity
CD32
1.Estructuras 3D Receptores Fc
CD16
en complejos con Fc (o solas)
3.Hom.Modeling
4.Cálculo de afinidad de los Crystal affinity
2.Seq.homólogas de complejos Exp. vs. modelados
Fc y FcR en spp
Idea #4: Dengue/Hantavirus reservoir?
Objetivo: Análisis comparativo estructural-funcional de los receptores virales
en géneros de interés (urbanos, insectívoros, etc.)
Tareas iniciales?
1.Receptores conocidos de Dengue
2.Estructuras 3D de receptores
3.Seq.homólogas 4.Hom.Modeling
