Oscar Alejandro Bonilla Sepulveda1* https://orcid.
org/0000-0001-9485-7483
1
Universidad CES. Medellín. Colombia.
*
Autor para la correspondencia: Correo electrónico:
[email protected]
RESUMEN
Introducción: el SARS-CoV-2 fue aislado recientemente de células
epiteliales de la vía aérea humana (enero de 2020). Este virus ha causado
una pandemia que desafía la infraestructura de la salud pública mundial.
Objetivo: revisar la bibliografía disponible sobre el COVID-19.
Métodos: se realizó una búsqueda sistemática de publicaciones en las
bases de datos Medline y PubMed; se utilizaron las siguientes palabras
claves: COVID-19, COVID-2019, 2019-nCoV, SARS-CoV-2, 2019nCoV,
Wuhan, y coronavirus.
Conclusiones: se seleccionaron 42 publicaciones que fueron trascendentes
para entender las características patogénicas del COVID-19 en el contexto
de la pandemia decretada por la Organización Mundial de la Salud.
DeCS: infecciones por coronavirus; virus del SRAS; literatura de revisión
como asunto.
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ABSTRACT
Introduction: SARS-CoV-2 was recently isolated from human airway
epithelial cells in January 2020. This virus has caused a pandemic that
challenges the global public health infrastructure.
Objective: to review the available bibliography on COVID-19.
Methods: a systematic review of publications in Medline and PubMed
databases was performed using the following key words: COVID-19,
COVID-2019, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, 2019-
nCoV, SARS-CoV-2, 2019-nCoV, Wuhan, and coronavirus.
Conclusions: there were selected forty-two publications which were
important to understand the pathogenic characteristics of COVID-19 in the
context of the pandemic declared by the World Health Organization.
DeCS: coronavirus infections; SARS virus; review literature as topic.
Recibido:
14/05/2020
Aprobado:
4/06/2020
INTRODUCCIÓN
En diciembre de 2019 un brote de neumonía de causa desconocida se
presentó en Wuhan, provincia de Hubei, China, y se extendió rápidamente
en todo el país en solo un mes. (1) Estos pacientes estaban
epidemiológicamente vinculados a un mercado mayorista de mariscos. (1,2)
El patógeno de esta enfermedad fue confirmada por métodos de biología
molecular como un nuevo coronavirus, el 7 de enero de 2020, (3)
cuando el
mundo fue informado de este nuevo patógeno que inicialmente 596
fue
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llamado nuevo coronavirus 2019 (2019-nCoV) por la Organización mundial
de la Salud (OMS), y posteriormente el Comité Internacional de Taxonomía
de estudio para coronavirus cambio su nombre, por el de síndrome
respiratorio agudo grave por
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coronavirus-2 (SARS-CoV-2) basado en su filogenia, taxonomía y práctica,
y la enfermedad que ocasiona fue nombrada coronavirus disease 2019
(COVID-19).(4)
El 30 de enero de 2020, la OMS declaró el brote de COVID-19 como la
sexta emergencia de salud pública de interés internacional, por lo tanto,
este brote constituye un riesgo para la salud pública, de propagación
internacional y que requiere una coordinación de los sistemas de salud de
todo el mundo.(5)
Los coronavirus se denominan así por los picos en forma de corona en su
superficie, pertenecen a la familia coronaviridae dentro del orden nidovirales.
Los coronavirus infectan ampliamente a los vertebrados, incluidos
humanos, pájaros, murciélagos, serpientes, ratones y otros animales
salvajes.(6) A mediados de la década de 1960, se conocían siete
coronavirus que infectaban los humanos (HcoV). (7)
En un estudio realizado, dos tipos de HCoV (229E, OC43) representaron
aproximadamente del 15 % al 29 % de los patógenos de las vías
respiratorias superiores, que incluyen: el virus de la influenza, el rinovirus,
virus de parainfluenza, estreptococos del grupo A, B y el virus sincitial
respiratorio, con virulencia relativamente baja en humanos. (8) Otro estudio
en adultos estimó que el coronavirus causa aproximadamente el 15 % de
los resfriados comunes,(9) pero dos tipos de coronavirus tienen una
patogenicidad diferente y conducen a una mayor tasa de mortalidad en
poblaciones humanas: en 2002-2003, el síndrome de dificultad respiratoria
grave aguda (SARS-CoV), con más de 8000 pacientes infectados y 774
muertes,(10) y en septiembre de 2012, el síndrome respiratorio del oriente
medio (MERS-CoV), que informó 2 494 casos de infección, con 858
muertes.(11)
En esta revisión se presenta una descripción general de la información
disponible actualmente sobre: la patogénesis, epidemiología, presentación
clínica, diagnóstico y tratamiento de la COVID-19 hasta el 31 mayo de
2020.
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MÉTODOS
Se realizó una búsqueda sistemática de publicaciones en la base de datos
Medline- PubMed; se utilizaron los términos: COVID-19, COVID-2019, o
severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, 2019-nCoV, SARS-CoV-2,
2019nCoV, Wuhan y
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coronavirus. Se seleccionaron artículos originales y de revisión, revisiones
sistemáticas y metanálisis escritos en inglés, los cuales fueron publicados
entre diciembre de 2019 y el 27 de mayo de 2020. Estos artículos hacían
una revisión de las características virológicas, epidemiológicas, y clínicas
del COVID-19.
DESARROLLO
La búsqueda mediante los términos seleccionados arrojó un resultado de
133 publicaciones en PubMed-Medline; se descartaron 3 por duplicado. Se
revisaron todos los resúmenes y se descartaron 5 que no contaban con el
texto completo, 2 porque tenían resumen en inglés pero el texto completo
en chino, y 82 porque no correspondían a una revisión. Finalmente, se
seleccionaron 42 publicaciones que fueron consideradas de
transcendencia, para describir las características clínico patológicas del
COVID- 19 para la redacción de este manuscrito (Figura 1).
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Figura 1. Publicaciones de PubMed de transcendencia,
para describir las características clínico patológicas del
COVID- 19.
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Hay evidencias de dos episodios en los últimos veinte años, en los cuales
dos tipos de coronavirus de origen animal han infectado a humanos con
enfermedad grave. El primer caso fue en 2002– 2003, cuando un nuevo
coronavirus del género β, con origen en los murciélagos, cruzó a los
humanos, a través del gato de civeta como intermediario en la provincia
china de Guangdong. Este virus fue designado como SARS-CoV, afectó a 8
422 personas principalmente en Hong Kong (China), y causó 916 muertes
(tasa de mortalidad del 11 %).(12) Casi una década después, en el año
2012, en Arabia Saudita, surgió el coronavirus MERS-CoV, también de
origen en murciélagos, y con transmisión a humanos a través de camellos
y dromedarios como el anfitrión intermedio, afectó a 2 494 personas y
causó 858 muertes (tasa de mortalidad del 34 %).(13)
En el último y actual episodio de aparición de brote de coronavirus, desde
el 18 de diciembre de 2019 hasta 29 de diciembre de 2019, cinco
pacientes fueron hospitalizados con neumonía de causa desconocida y uno
de estos pacientes falleció. Los casos se vincularon al mercado mayorista
de mariscos Huanan y al mercado de sur de China (en inglés Huanan
Seafood Wholesale Market, South China Seafood Market), en Wuhan, provincia
de Hubei, China, con una población de 11 millones de habitantes en
diciembre de 2019.(14)
En respuesta al brote, el Centro Chino para Control y Prevención de
Enfermedades, envió un equipo de respuesta rápida establecido después
del brote de SARS-CoV; los investigadores tomaron muestras en 15
pacientes de líquido pulmonar, sangre e hisopado faríngeo para realizar
pruebas de laboratorio. Estas pruebas de laboratorio estaban dirigidos a
patógenos conocidos como: el SARS-CoV, MERS-CoV, influenza, influenza
aviar, adenovirus y otros patógenos respiratorios comunes. El 31 de
diciembre de 2019, China notificó el brote a la Organización Mundial de la
Salud, y el 1 de enero de 2020, el mercado de marisco Huanan estaba
cerrado. El 7 de enero el virus fue identificado como un coronavirus con
más del 95 % de homología con el coronavirus del murciélago, y más 600
del
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70 % de similitud con el SARS-CoV. Aunque el SARS-CoV-2 se originó a
partir de murciélagos, estos no están disponibles para la
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venta en el mercado de mariscos, (15) por lo que el intermediario animal a
través del cual cruzó hacia los humanos es incierto, se presume pudieran
ser los pangolines.
Los coronavirus son virus de ácido ribonucleico (ARN) monocatenario, con
un tamaño que va desde 60 nm a 140 nm de diámetro, con proyecciones
como espiga en su superficie, que le dan una apariencia de corona bajo el
microscopio electrónico, de ahí el nombre coronavirus. Su genoma varía
de 26 000 a 37 000 bases; este es el genoma más grande conocido entre
los virus de ARN.(16) Hay genes accesorios intercalados dentro de los
genes estructurales,(17) algunos de los cuales han demostrado desempeñar
un importante papel en la patogénesis viral. (18) Está envuelto por una
nucleocapside cubierta de una bicapa lipídica, que contiene la proteína S
(spike) que es responsable de la unión al receptor, y posterior entrada
viral en las células huésped; las proteínas M y E juegan un papel
importante en el ensamblaje viral, y la proteína N es necesaria para la
síntesis del ARN.(19)
Los diversos coronavirus de origen animal experimentan mutaciones que
pueden ser altamente patogénicas y potencialmente mortales para los
humanos.(7) Para el SARS-CoV, se estimó que la tasa de mutación en el
genoma es 0,80–2,38×103 sustituciones de nucleótidos por sitio por año,
que son similares a la de otros virus de ARN.(20) Esta mutación la
experimentan ya sea dentro de la especie huésped o al saltar de una
especie a otra. Estos cambios tienen el potencial de conducir a variantes
que tienen un alto potencial patogénico cuando se transmiten a los
humanos.(21)
Se analizó el genotipo de SARS-CoV-2 en diferentes pacientes de varios
provincias de China, y se descubrió que este había mutado en diferentes
pacientes, aunque en menor el grado que la mutación de la gripe aviar
H7N9.(22) Tang y colaboradores(23) realizaron un análisis genético de 103
genomas de SARS-CoV-2, y clasificaron dos tipos prevalentes: el tipo L (~
70 %) y tipo S (~ 30 %); las cepas derivadas del tipo S son evolutivamente
más agresivas y contagiosas. 602
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Los coronavirus (CoV) se dividen en cuatro géneros: α-CoVs, β-CoVs, γ-
CoVs y δ- CoVs,(24) de los cuales: α- y los β-CoV pueden infectar mamíferos,
y los γ-CoVs y δ- CoVs pueden infectar a las aves y también podría infectar
a los mamíferos.(25) Hasta ahora se ha encontrado que siete tipos de
coronavirus infectan a los humanos y
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causan enfermedades respiratorias, de los cuales, cuatro son comunes en
humanos (HCoV): HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63 y HCoV-HKU1 y
generalmente llevan a enfermedad respiratoria alta auto limitada.
Se conocen los dos primeros desde la década de 1960; posteriormente, en
2002 se identificó el SARS-CoV, y en 2004 y 2005 se identificaron el HCoV-
NL63 y HcoV- HKU1, respectivamente. (26) En 2012 se aisló el MERS-CoV,
que tiene características similares al SARS-CoV ya que ambos pueden
ocasionar neumonía y síndrome de dificultad respiratoria grave en
humanos,(27) con una tasa de letalidad de 35,5 % y
10 %, respectivamente.(28) El SARS-CoV-2 fue aislado recientemente de
células epiteliales de la vía aérea humana en enero de 2020, e identificado
como un nuevo miembro de β-CoVs.(14)
La Organización Mundial de la Salud (OMS) ha clasificado el SARS-CoV-2
como un β CoV del grupo 2B.(29) Diez secuencias de su genoma obtenidas
de un total de nueve pacientes mostraron 99,98 % de concordancia. (30) La
secuencia genética del SARS-CoV-2 mostró más del 80 % de identidad con
el SARS-CoV y el 50% con el MERSCoV, (30,31) y tanto el SARS-CoV como el
MERS-CoV se originan en los murciélagos. (32) El SARS-CoV-2 representa el
séptimo miembro de la familia de los coronavirus que infecta a los
humanos y ha sido clasificado bajo la subfamilia ortocoronavirinas,
subgénero sarbecovirus.(33)
Los coronavirus que son de origen zoonótico, pueden convertirse en una
cepa que puede infectar a seres humanos y conducir a enfermedades
fatales.(7) Se requiere de un animal intermediario que sirva como
hospedero en el cual se produce recombinación genética y mutación del
virus.(34) Las espigas de la corona del virus llamada glucoproteína S,
permiten al virión la unión a la membrana celular del huésped.(35)
El SARS-CoV utiliza su proteína S en la superficie celular asociada a una
serina proteasa 2 transmembrana(36) y catepsina,(37) a través del receptor
de la enzima convertidora de angiotensina tipo 2 (ACE2), (38) para permitir
la invaginación del virus en la membrana celular de los neumocitos tipo 2
y las células epiteliales ciliadas bronquiales. (31) El MERS-CoV usa 604
la
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dipeptidil peptidasa 4, una glucoproteína
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transmembrana para infectar los neumocitos tipo 2 y células epiteliales
bronquiales no ciliadas.(39)
En general, los coronavirus se replican en células epiteliales de las vías
respiratorias y células entéricas, lo que conduce a cambios citopáticos. (40)
Los estudios más recientes aislaron SARS-CoV2 del lavado broncoalveolar
de un paciente en Wuhan(14) y se ha confirmado que la proteína S del
SARS-CoV-2 usa la ACE2, como receptor de entrada celular similar al
SARS-CoV.(41)
La unión de la glucoproteína S de SARS-CoV-2 y el receptor ACE2 es un
paso crítico para la entrada del virus.(42) Otro estudio mostró que la
proteína S, y su unión a la ACE2, es de 10 a 20 veces más eficiente que el
del SARS-CoV.(43) La glucoproteína S incluye dos subunidades: S1 y S2. (44)
La S1 determina el rango de tropismo celular con el dominio clave de
función, mientras que la S2 media la fusión de la membrana celular del
virus por dos dominios en tándem, heptad repite 1 y 2 (HR1, HR2). (45)
Después de la fusión a la membrana, el genoma viral ARN se libera en el
citoplasma, y el ARN no recubierto traduce dos poliproteínas, pp1a y
pp1ab,(35) las cuales codifican proteínas no estructurales,y
forman el complejo de replicación- transcripción (RTC) en
vesículas de doble membrana.(46) La RTC replica y sintetiza continuamente
un conjunto de ARN subgenómicos anidado,(47) que codifican
proteínas accesorias y proteínas estructurales a través del retículo
endoplásmico de Golgi.(48) El ARN genómico recién formado, las
proteínas nucleocapsídicas y las glicoproteínas de envoltura, se
ensamblan y forman brotes de partículas virales. Por último, las vesículas
que contienen viriones se fusionan con la membrana plasmática para
liberar el nuevo virus.
Desde el inicio del brote de la COVID-19 en Wuhan, a finales de diciembre
de 2019 y hasta el 31 de marzo de 2020, la OMS declaró la pandemia y
confirmó la propagación a 205 países, 750 890 casos fueron confirmados
por biología molecular y 36 405 muertes por esta causa. (49) Hasta el 16 de
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abril de 2020, la región geográfica más afectada por la infección por
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SARS-CoV-2 ha sido Europa con 1 013 093 casos confirmados y 89 317
muertes, y la menos afectada es la región africana con 11 843 casos y 550
muertes.(50) (Tabla 1).
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Tabla 1. Distribución de casos confirmados y muertes de
COVID-19 por regiones según OMS.
OMS: Organización mundial de la salud.
La mayoría de los casos informados en Wuhan fueron adultos, aunque
todas las edades son susceptibles; se informó una edad media de 55,5
años (15 a 89 años) en tres estudios separados.(51) Un hallazgo similar se
observó en un estudio que incluyó 4 021 casos confirmados en 30
provincias de China, en los cuales, la edad media fue 49 años, y el 50,7 %
de los pacientes tenían edades comprendidas entre 20 y 50 años. (52) El
equipo de epidemiología de respuesta a emergencias de neumonía por el
nuevo coronavirus en China, informó que el 66,7 %, (n: 29 798) de 44 672
casos de COVID-19, estaban entre 20 y 60 años de edad.
Sobre los pacientes ancianos, un estudio mostró que el 14,6 % de los
pacientes tenían 65 años,(3) mientras que otro estudio mostró que el 15,2
% tenían 70 años. Según el reciente informe del Centro de control de
enfermedades de China, el 12 % (n: 5 326) de los pacientes tenían 70 años
de edad.(53)
Respecto a los niños, en un estudio se encontró que el 0,9 % de los
pacientes con la COVID-19 tenían entre 0 y 14 años de edad. Otro
estudio en China, con 416 pacientes, mostró que el 0,9 % de los
pacientes eran menores de 10 años. Con respecto al género, la
proporción de hombres varió de 51,4 % a 73,2 %.(53,54,55) Según la
información actual, la transmisión transplacentariade
mujeres embarazadas a su feto no ha sido descrita. Sin
embargo, si se ha descrito la transmisión postnatal a neonatos en
contactos con familiares infectados.(56)
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La propagación nosocomial del SARS-CoV-2 es una seria preocupación, la
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Comisión nacional de salud de China el 14 de febrero de 2020 confirmó la
transmisión a trabajadores sanitarios en un 3,8 %. Otros dos estudios
mostraron que el 2,1 % (n: 23) y 3,8 % (n: 1 716) de los pacientes eran
trabajadores de la salud.(53,55) Un estudio
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en el Hospital de Zhongnan de la Universidad de Wuhan, mostró que
el 29 % (n: 40) fue personal médico y el 12,3 % (n: 17) contrajeron la
COVID-19 durante la hospitalización.(51)
El contacto directo con animales intermedios domésticos, o el
consumo de animales salvajes, fue la ruta inicial de transmisión del
SARS-CoV-2 a los humanos; sin embargo, se desconoce exactamente
el mecanismo. La infección entre humanos se transmite a través de
grandes gotas generadas durante la tos y estornudos de pacientes
sintomáticos, pero también puede ocurrir en personas asintomáticas
en la fase de incubación.(57,58)
Estas gotitas infectadas pueden extenderse uno a dos metros y depositarse en
las superficies. El virus puede permanecer viable en las superficies durante
días en condiciones atmosféricas favorables, pero se destruye en menos que
un minuto con desinfectantes comunes como: el hipoclorito de sodio, peróxido
de hidrógeno y otros.(59) La infección se puede adquirir por: inhalación de estas
g
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