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Tema 2

Las proteínas son polímeros de aminoácidos que se clasifican según su forma, solubilidad, composición química y función. Su estructura se organiza en cuatro niveles: primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria, cada uno determinando su función biológica. La desnaturalización afecta la estructura tridimensional de las proteínas, mientras que sus propiedades físico-químicas y eléctricas son fundamentales para su funcionamiento y diagnóstico en laboratorio.

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Tema 2

Las proteínas son polímeros de aminoácidos que se clasifican según su forma, solubilidad, composición química y función. Su estructura se organiza en cuatro niveles: primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria, cada uno determinando su función biológica. La desnaturalización afecta la estructura tridimensional de las proteínas, mientras que sus propiedades físico-químicas y eléctricas son fundamentales para su funcionamiento y diagnóstico en laboratorio.

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2 ESTRUCTURA Y FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS Y DE LOS

AMINOÁCIDOS.

PROTEÍNAS
Las proteínas son polímeros de aminoácidos unidos por enlace peptídico, con
peso molecular mayor de 5000 Daltons.
Además existen otras sustancias formadas por la unión de aminoácidos que son
los péptidos, con peso molecular menor de 5000 Daltons, que pueden ser
oligopéptidos y polipéptidos.
Se denominan oligopéptidos cuando tienen de 2 a 7 residuos de aminoácidos,
ejemplos de ellos son las hormonas liberadoras hipotalámicas, que controlan las
secreciones adenohipofisarias.
Se consideran polipéptidos cuando tienen más de 7 aminoácidos, pero su peso
molecular es menor de 5000 Daltons, por ejemplo las hormonas oxitocina, la
bradiquinina y el glucagón.

A continuación estudiaremos la clasificación de las proteínas según diferentes


criterios.

CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS


Por su forma se clasifican en:
 Globulares: Presenta estructura tridimensional, esferoidal y predomina el
volumen sobre la longitud es decir sus ejes axiales es menor de 10 y no
exceden de 3 a 4 ej. Mioglobina, Hemoglobina, histonas enzimas etc.
 Fibrosa: aquellas que su estructura tridimensional es alargada y predomina
la longitud sobre el volumen. La relación entre sus ejes axiales es mayor
que 10.
Por su solubilidad pueden ser:
 Insolubles: cuya forma empaquetada les permite formar los diferentes
tipos de fibras predominan las cadenas laterales de residuos amino
á[Link]. Aquí se encuentran todas las proteínas fibrosas y
globulares que forman parte de las membranas biológicas.
 Solubles: Cuando tienen una estructura espacial globular donde emergen
residuos de aminoácidos polares que establecen interacciones débiles no
covalentes con el agua.
 Poco solubles: Cuando son solubles en soluciones de sales neutras, como
el cloruro de sodio, ejemplo de ellas son las globulinas.
Por su composición química se clasifican en:
 Simples: formadas sólo por aminoácidos.
 Conjugadas: aquellas que presentan unida a la estructura proteica un
grupo prostético que puede ser lípidos (lipoproteínas), glúcidos
(glicoproteínas), grupos fosfatos (fosfoproteínas), hemo (hemoproteinas),
flavin nucleótidos(flavoproteinas).metaloproteinas

Por su función se clasifican en:
 Enzimas
 De transporte
 De reserva
 Contráctiles
 Estructurales
 De defensa
 Reguladoras
Seguidamente orientaremos los diferentes niveles estructurales en que se
organizan las proteínas para su estudio, que son primario, secundario, terciario y
cuaternario

ESTRUCTURA PRIMARIA
La estructura o nivel de organización primario, se define como el orden o
secuencia de los residuos de aminoácidos en la cadena peptídica.
Constituye la estructura básica, la más importante de las proteínas, sobre la cual
se erigen las demás estructuras está codificada genéticamente y es única para
cada proteína.
Es el nivel más importante, ya que determina el resto de los niveles de
organización y por tanto la estructura tridimensional y la función de las proteínas.
La composición es el número total de residuos de amino ácidos que lo componen
y es desigual de la secuencia.
Este nivel está estabilizado por enlace peptídico por lo que no sufre la afectación
de la desnaturalización
En ello se da lo monótono (carbono alfa - enlace peptídico - carbono alfa y lo
diverso (las cadenas laterales R). lo monótono garantiza la aparición de
estructuras alargadas mientras que lo diverso interacciona con el medio y consigo
mismo que garantiza la formación de interacciones débiles formando la estructura
tridimensional
Son 20 los aminoácidos que pueden formar las proteínas y estos varían de
acuerdo a la estructura de su cadena lateral R, lo cual le confiere propiedades
físico-químicas específicas.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
La estructura o nivel secundario es el ordenamiento regular que adoptan sectores
de la cadena peptídica a lo largo de un eje, debido a la interacción entre los
grupos carbonílicos y amídicos de los enlaces peptídicos con formación de
puentes de hidrógenos.
Los tipos fundamentales de esta estructura son alfa hélice, hoja plegada y triple
hélice del colágeno.
La estructura secundaria en alfa hélice. Los puentes de hidrógeno son
intracatenarios, es decir, se establecen entre los elementos del enlace peptídico
de la misma cadena y son paralelos al eje longitudinal de la molécula.
Las cadenas laterales se disponen hacia el exterior de la molécula.
La conformación β u hoja plegada, las cadenas polipéptidica se dispone en zig zag
se estabiliza también por puentes de hidrógeno que se establecen entre los
elementos del enlace peptídico, pero en este caso son intercatenarios, es decir
entre cadenas diferentes o de la misma cadena que se pliega.
Las cadenas laterales de los aminoácidos se disponen por encima y por debajo
del plano de la estructura. Puede ser paralela y anti paralela
La estructura secundaria en triple hélice del colágeno, proteína que cumple una
importante función estructural como soporte.

ESTRUCTURA TERCIARIA
La estructura terciaria es la disposición tridimensional de las cadenas
polipeptídicas; estabilizada por interacciones débiles y enlaces covalentes por
puente disulfuro que se establecen entre las cadenas laterales de los residuos de
aminoácidos.
Deben recordar que las interacciones débiles son: uniones salinas o iónicas,
fuerzas de Van der Waals, puentes de hidrógeno y uniones hidrofóbicas.

ESTRUCTURA CUATERNARIA
La estructura cuaternaria es la asociación de varias cadenas polipeptídicas para
formar una unidad biológicamente activa.
Generalmente está constituida por un número par de cadenas polipeptídicas,
idénticas o diferentes en su estructura que se unen por interacciones débiles y
algunas por puente disulfuro.
Las proteínas con nivel cuaternario de organización son de mayor complejidad
este nivel es el más complejo pero no es el más
importante .
La hemoglobina esta formada por 4 cadenas polipeptídicas, 2 alfa y 2 beta, unidas
por interacciones débiles, cada cadena tiene unido un grupo prostético hemo que
le permite la unión con el oxígeno.
Por su parte la insulina posee dos cadenas polipeptídicas que se unen por
interacciones débiles y puentes disulfuro.
Existe una estrecha relación entre la estructura y la función de las proteínas, lo
que se puede ejemplificar con el proceso de desnaturalización.

DESNATURALIZACIÓN
La desnaturalización de las proteínas se debe a la pérdida de su estructura
tridimensional(nativa) y por ende de su función biológica. Ello se debe a la acción
de agentes físicos o químicos que rompen las interacciones débiles que
estabilizan la estructura tridimensional, este fenómeno no afecta la estructura
primaria.

Estos agentes se denominan desnaturalizantes y entre ellos se encuentran el


calor, los alcoholes, la urea y las variaciones extremas de pH entre otros.
.

PROPIEDADES FÍSICO QUÍMICAS


Las propiedades físico químicas de las proteínas son consecuencia de su gran
tamaño y la presencia de grupos ionizables.
Debido a su gran tamaño forman sistemas coloidales cuando se encuentran
dispersas en medios acuosos. No dializan, o sea no pueden difundir a través de
las membranas.
Fisiológicamente, las proteínas al no difundir a través de las membranas
biológicas crean una presión osmótica, que en este caso particular se denomina
oncótica, la que contribuye a la distribución del agua y los electrolitos entre las
células y el medio extracelular.
La presencia de grupos ionizables en determinados residuos aminoacídicos
explica las propiedades eléctricas de las proteínas que orientaremos a
continuación.
PROPIEDADES ELÉCTRICAS
Las proteínas presentan grupos ionizables, entre los que se encuentran el grupo
amino de un extremo de la cadena y el carboxilo del otro. También presentan
grupos ionizables en las cadenas laterales de los aminoácidos que la componen.
Algunos de estos grupos se representan en la imagen.
Cuando la proteína se encuentra en un medio con alta concentración de iones
hidrógeno, es decir en un medio ácido o de pH bajo, algunos grupos ionizables,
como los aminos aceptan iones hidrógeno y la proteína adquiere carga positiva.
Cuando la proteína se encuentra en un medio con baja concentración de iones
hidrógeno, es decir, en un medio básico o de pH alto, cede al mismo los iones
hidrógeno quedando entonces con carga negativa.
Existe una concentración de iones hidrógeno correspondiente a un pH
determinado, en el cual la proteína presenta el mismo número de cargas positivas
que negativas.
Al valor de pH del medio en que se cumple esta condición y la proteína tiene carga
neta cero, se le llama punto isoeléctrico.
Cada proteína tiene un punto isoeléctrico propio, que depende de su estructura o
nivel primario.
Las propiedades eléctricas se utilizan como base en el laboratorio para muchas
técnicas de separación de proteínas como por ejemplo la electroforesis, muy
utilizada para el diagnóstico de diversas patologías.
Cuando el pH del medio es bajo los grupos carboxilos se desprotonizan liberando
un protón hidrogeno al medio y se cargan negativamente los grupo a aminos
aceptan el protón y se cargan positivamente.
Si pH > PI la proteína se comportan como un anión (-) y migra al Ánodo
Si pH < PI la proteína se comportan como un catión (+) y migra al Cátodo
Si pH = PI la proteína tiene carga neta 0 y es incapaz de migrar

ELECTROFORESIS
Se denomina electroforesis al método de separación de moléculas, basado en su
desplazamiento en un campo eléctrico.
Es un importante método diagnóstico ya que se pueden separar proteínas que
presentan cargas eléctricas diferentes.
Ya conocen que las proteínas cambian su carga eléctrica en dependencia del pH
del medio en que se encuentran.
El medio más utilizado en los laboratorios clínicos es el de pH 8,6 en el cual las
proteínas de la sangre adquieren carga negativa, al colocar las mismas en un
campo eléctrico migran del polo negativo llamado cátodo al polo positivo llamado
ánodo.
A medida que sea mayor su carga y menor su masa molecular, migrarán más
rápido, por lo que se separan.
Finalmente se añade un colorante para visualizarlas.
Otro tipo de macromolécula que estudiaremos en esta actividad son los
polisacáridos, que se caracterizan por presentar monotonía estructural.

Los organismos vivos para mantener su estado es decir su integridad deben


mantener un intercambio constante de sustancia, energía e información con el
medio que los rodea. Este intercambio constituye la base de la vida el cual al
cesar cesa la vida.
Reacción química.
Cuando una o más sustancias químicas se ponen en contacto, colocadas en
condiciones adecuadas que conducen a una transformación que da como
resultado la aparición de una nueva sustancia

Debemos recordar que para que se produzca una reacción química deben
cumplirse ciertas condiciones, como son:
• Que los reactivos se pongan en contacto.
• Que por su naturaleza química sean capaces de reaccionar.
• Que choquen sus moléculas con la fuerza suficiente y en la dirección
adecuada.
En las reacciones químicas basado en el principio de conservación de la materia
sólo se produce un reordenamiento o reagrupamiento de los elementos que
constituyen las sustancias reaccionantes (sustrato), que de esa forma dan origen
a una nueva sustancia (producto).

Las reacciones químicas se efectúan a una determinada velocidad, que depende


de diversos factores.
Toda reacción química, se acompaña de un cambio en el contenido energético del
sistema reaccionante; este cambio determina tanto la dirección como la velocidad
y el alcance de las reacciones.
Energía: es la capacidad de un sistema de realizar un trabajo útil.
Los átomos y las moléculas que están formando los compuestos del organismo
poseen energía potencial por lo cual pueden intervenir en reacciones que liberan
esa energía, manifestándose en su habilidad para formar o romper enlaces
químicos.
La variante de energía potencial que se presenta en los sistemas biológicos y
bioquímicos es la energía libre (ΔG) que depende de dos factores la entalpía
(Variación en el contenido calórico entre los reactantes y los productos) y la
entropía(S) (grado de desorden de un sistema)
La entalpía se relaciona con el nivel calórico si absorben o liberan calor las
reacciones y pueden ser endotérmicas (ΔH +) y exotérmicas (ΔH-)
Reacción exotérmica se libera calor y AH es negativo, los productos tienen menor
energía que los reactantes
Reacción endotérmica se absorbe calor y AH es positivo.
A+B→C

Como se muestra en la siguiente ecuación el curso de una reacción química,


donde las sustancias reaccionantes son A y B, que se transforman en el producto
C. Cada una de estas sustancias tiene un nivel energético Las sustancias
reaccionantes incrementan su energía en el transcurso de la reacción para formar
el complejo activado.
La energía que hay que suministrar a las sustancias reaccionantes para formar el
complejo activado se denomina energía de activación, actúa como una barrera
energética para el desarrollo de la reacción, de ahí que a mayor energía de
activación, menor será la velocidad de la reacción y viceversa.

La diferencia de energía entre las sustancias reaccionantes y los productos es el


valor de la energía de reacción

Si el nivel energético de los productos es inferior al de las sustancias


reaccionantes, la reacción es exergónica, donde parte de la energía se ha cedido
al entorno. Este tipo de reacción se produce de forma espontánea.

Cuando el nivel energético de los productos es superior al de las sustancias


reaccionantes, la reacción es endergónica, es decir, es necesario suministrar
energía para que se produzca la misma. Este tipo de reacción no es espontánea.

Existen varios procedimientos para provocar el aumento de la velocidad de la


reacción, uno de ellos es la adición de un catalizador.
Todas las funciones que realizan los organismos vivos tienen su fundamento en
un gran número de reacciones químicas que se agrupan de manera funcional y
dan lugar a los procesos encargados de mantener, desarrollar y perpetuar en cada
organismo. Por lo que cada una de las reacciones químicas que ocurren en el
organismo son catalizadas

Catalizadores

Son sustancias que tienen en común la propiedad de aumentar la velocidad de las


reacciones químicas, sin que su estructura o concentración se modifique como
resultado de la reacción.

Formas de actuación de los catalizadores

Los catalizadores aceleran la velocidad de las reacciones realizando los siguientes


efectos:
• Fijan y concentran sobre su superficie las sustancias reaccionantes y las
orientan en el espacio.
• Interactúan con las sustancias reaccionantes, creando tensiones en su
interior, que debilitan sus enlaces de modo que es más fácil romperlos.
Los catalizadores son de dos tipos:
• Catalizadores abióticos o no biológicos, que son aquellos que su actividad
generalmente no está relacionada con los seres vivos, entre los que
encontramos: platino, níquel, ácido sulfúrico e hidróxido de sodio entre otros
y
• Los catalizadores bióticos o biocatalizadores, que son aquellos sintetizados
por los seres vivos. Estos son proteínas especializadas denominadas
enzimas, aunque debemos señalar que existen ácidos ribonucleicos con
actividad enzimática, que se denominan ribozimas.
Las enzimas son catalizadores generalmente de naturaleza proteica, específicos,
versátiles, de gran eficiencia catalítica y susceptible de ser regulados en su
actividad.
Se define como eficiencia catalítica, la relación entre la velocidad de la reacción
catalizada y la no catalizada.
Orientaremos a continuación las características fundamentales de cada uno de
los tipos. Observen la comparación entre los catalizadores abióticos y los bióticos:
Catalizadores Abióticos
 Los catalizadores abióticos, presentan menor complejidad estructural ya
que generalmente son metales, sales, ácidos o bases.
 Presenta menor especificidad, ya que solo tienen algún grado de
especificidad en cuanto al tipo de reacción que catalizan, por ejemplo: el ión
permanganato se utiliza en reacciones de oxidación.
 Presenta una menor eficiencia catalítica.
 Producen menores aumentos de las velocidades de las reacciones
catalizadas.
Catalizadores Bióticos.
 Los catalizadores bióticos, presentan mayor complejidad estructural al ser
de naturaleza proteica con una estructura tridimensional compleja.
 Presenta mayor especificidad al ser específicos sobre el sustrato que actúa
y el tipo de reacción que catalizan incluso hasta la serie estérica.
 Elevada eficiencia catalítica.
 Las enzimas producen un aumento de la velocidad de la reacción
generalmente hasta un millón de veces.

Observe durante el desarrollo de la actividad la imagen que muestra el gráfico de


las variaciones de energía durante el curso de una reacción química, sin catalizar
y luego catalizada.
Observen ahora que la energía de activación de la reacción catalizada delta E dos
(ΔE2) es mucho menor que la energía de activación de la reacción no catalizada
ΔE1.
La velocidad de la reacción se acelera considerablemente, ya que la barrera
energética es menor en este caso, es decir, los biocatalizadores al disminuir la
energía de activación aumentan la velocidad de la reacción.
En la imagen delta E tres (ΔE3) representa el valor de la energía de reacción, que
es la diferencia de energía entre las sustancias reaccionantes y los productos.
Como se aprecia claramente, la energía de reacción es la misma, es decir, la
presencia de un catalizador no la modifica.
A continuación orientaremos la forma en que las enzimas o biocatalizadores
actúan para acelerar la velocidad de las reacciones.
Mecanismo básico de acción de las enzimas

A + E ↔ C D→E +P
Etapas
El mecanismo básico de acción de las enzimas consta de dos etapas:
• Etapa I o de unión, en que se une se produce el contacto físico entre los
sustrato y una pequeña porción del volumen total de la enzima llamado
centro activo(CA) la sustancia reaccionante o sustrato a la enzima y forma
el complejo enzima sustrato
• Etapa II o de transformación, en que se modifica el complejo enzima
sustrato para producirse el rompimiento o establecimiento de determinadas
interacciones en la estructura del complejo enzima sustrato originándose
los productos y la enzima libre para iniciar otro ciclo catalitico.
Tanto en la etapa I como en la II se produce el fenómeno de transconformación en
la primera etapa ocurre el reconocimiento molecular entre los grupos químicos de
la superficie del centro activo de la enzima y el sustrato se produce la
complementariedad eléctrica (química) y la espacial (estérica o de forma), esta
etapa es reversible en la reacción catalizada enzimáticamente.

Centro activo

Es una concavidad o hendidura en la superficie de las proteínas enzimáticas


donde el sustrato se une por fuerzas no covalentes de forma específica
ampliamente reversible.
El centro activo es una estructura tridimensional no es un plano, no es un punto
porque está relacionado con la porción monótona de ls proteínas es decir de su
secuencia que determina la estructura tridimensional y la función poniéndose en
evidencia la relación estructura función

La existencia del complejo enzima sustrato y el hecho de que la mayoría de los


sustratos tienen un tamaño varias veces menor que la enzima, implican que la
enzima solo se pone en contacto con el sustrato en una pequeña parte de su
estructura denominada centro activo.

En la imagen que se proyecta en la video observe la imagen que representa una


enzima destacándose el centro activo.
Observen su forma tridimensional definida y su tamaño comparativamente
pequeño con relación a la molécula de la enzima.
En su estructura se distinguen varios componentes, cada uno participa en la
catálisis de forma diferente:
• Eje o esqueleto peptídico, formado por la parte monótona de la cadena
polipeptídica, es decir el eje covalente. Brindando la complementariedad
estérica
• Grupos de ambientación, que son las cadenas laterales de residuos de
aminoácidos de naturaleza apolar que se encuentran en el centro activo,
los que impiden la entrada de agua (debilita la catálisis) al centro activo y
refuerzan las interacciones débiles entre la enzima y el sustrato
favoreciendo la catálisis al crear un microambiente apolar.
• Grupos de fijación o ligantes, que son cadenas laterales de aminoácidos
que presentan grupos funcionales capaces de establecer interacciones
débiles con el sustrato como puentes de hidrógenos, salinas o
electrostáticas y las fuerzas de Van der Waals. Estos grupos permiten la
complementariedad eléctrica entre el sustrato y el centro activo
Estos tres componentes participan en la unión de la enzima con el sustrato,
determinada por dos factores principales;
 La complementariedad estérica o espacial entre la conformación del centro
activo y la estructura del sustrato(complementariedad estérica)
 La complementariedad química entre los grupos del centro activo y los del
sustrato.( complementariedad eléctrica)
También forman parte de la estructura del centro activo:
• Grupos catalíticos, que son cadenas laterales de residuos de aminoácidos
muy reactivos que participan de forma directa en la transformación del
sustrato al permitir el rompimiento o establecimiento de interacciones o
enlaces. Entre los que cumplen con mayor frecuencia esta función están el
grupo imidazol de la histidina y el hidroxilo de la serina el amino de la lisina
y el carboxilo del aspártico.
Desde el punto de vista estructural las enzimas difieren del resto de las proteínas
no enzimáticas por la presencia de un centro activo por lo que las propiedades
particulares depende de la presencia de esa estructura
Especificidad

La especificidad de las enzimas está relacionada con las características


estructurales del centro activo y es de dos tipos:

Especificidad de sustrato, es decir, que la enzima solo puede unirse a un


sustrato o a un número muy limitado de ellos que presenten una estructura
tridimensional muy similar. Esta puede ser absoluta si solo se puede unir a un
sustrato o relativa si es a un grupo de sustratos.

Especificidad de acción, se basa en que al unirse el sustrato al centro activo solo


uno de los enlaces del sustrato queda al alcance de los grupos catalíticos de la
enzima, por lo que la enzima solo podrá realizar una de las posibles
transformaciones que puede experimentar el sustrato
Factores que modifican la estructura del centro activo
Entre los factores que modifican la estructura del centro activo y por lo tanto su
función se encuentran los:
 Agente que modifican la conformación o la estructura tridimensional del CA
la temperatura o agentes desnaturalizantes

 Modificadores de la distribución eléctrica del centro activo, aquellos que


cambian las cargas eléctricas de sus grupos ionizables, ejemplo de ello es
el pH del medio.

 Análogos estructurales a los sustratos, que se unen al centro activo pero no


son susceptibles a ser transformados por la enzima, por ejemplo algunos
inhibidores.

 Sustancias capaces de reaccionar específicamente con grupos claves del


centro activo y modificarlo.
Clasificación de las enzimas
Dos propiedades fundamentales de las enzimas y todas ellas derivan de las
características del centro activo son su gran eficiencia catalítica y la elevada
especificidad partiendo de esta última en sus 2 aspectos es la que sirve de
fundamento a la clasificación y nomenclatura de las enzimas.
Las enzimas pueden ser clasificadas atendiendo a diversos criterios de
clasificación por ejemplo:.
1. Atendiendo a su composición pueden ser:

Simples: Cuando están formadas sólo por la proteína enzimática y su hidrolisis


solo brinda aminoácidos
Compuestas o conjugadas: Cuando están unidas a otra sustancia que se
denomina cofactor. Y la hidrólisis aporta aminoácidos más un cofactor de origen
no proteico
En este caso la parte proteica de la enzima se le denomina apoenzima , la
porción no proteica se denomina cofactor y a la enzima completa holoenzima. Es
decir, la holoenzima está formada por la unión de la apoenzima con el cofactor.
Holoenzima = Apoenzima + Cofactor
Clasificación atendiendo la especificidad de acción
Tomando como fundamento la especificidad de acción, con lo cual se establecen
6 grupos principales, teniendo en cuenta la reacción global que ellas catalizan
Atendiendo a la misma se distinguen las:
Oxidorreductasas: Catalizan reacciones de óxido reducción o sea la
transferencia de electrones o sus equivalentes entre un donante y un aceptor.
Transferasas: Catalizan reacciones de transferencia un grupo químico que no
sean electrones o sus equivalentes entre un donante y un aceptor.
Hidrolasas: Catalizan la ruptura de un enlace covalente mediante la incorporación
de moléculas de agua, y otras como las
Liasas: Catalizan reacciones en las cuales se produce la adición o sustracción de
grupos químicos a dobles enlaces.
Isomerasas: Catalizan la interconversión de 2 isómeros.
Ligasas: Catalizan la unión covalente de 2 sustratos mediante la energía de
hidrólisis de nucleósidos trifosfatados, generalmente el ATP.

Factores que modifican la velocidad de la reacción catalizada


La función fundamental de las enzimas es aumentar la velocidad de las reacciones
químicas que ocurren en los seres vivos. El comportamiento de esa velocidad y su
modificación debido a la presencia de diferentes agentes físicos o químicos
La velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas se modifica bajo la acción
de diferentes factores que orientaremos a continuación.

La cinética enzimática estudia el comportamiento de la velocidad de las


reacciones catalizadas por las enzimas y su modificación debido a la presencia de
agentes físicos o químicos.
Los factores que modifican la velocidad de la reacción enzimáticamente catalizada
son:
 Concentración de enzimas.

 Concentración de sustrato.

 Concentración de cofactores.

 Temperatura.

 Concentración de hidrogeniones o su expresión en forma de pH.

 Presencia de activadores

 Presencia de inhibidores.

Es necesario puntualizar que cuando se estudia en el laboratorio uno de estos


factores es que se varía mientras que el resto permanecen constante.
Debemos precisar algunos aspectos para abordar el estudio de dichos factores.
La velocidad de reacción es la cantidad de sustrato que se transforma en producto
en la unidad de tiempo. Una medida de cómo se efectúa una reacción química es
mediante su velocidad; por ello se entiende cómo aumenta la concentración del
producto (aparición de producto) por unidad de tiempo o la transformación del
sustrato en la unidad del tiempo.
En el estudio de la cinética enzimática se utiliza la velocidad inicial, que es la
velocidad de la reacción cuando aún no se ha consumido el 10 % del sustrato
inicial.
El trabajar con velocidades iniciales evita que las determinaciones estén influidas
por otros factores como:
1. Si la reacción es reversible, la velocidad de la reacción inversa aumentará el la
misma medida que la concentración del producto y descenderá la velocidad de
transformación del sustrato.
2. Si no se proporciona sustrato en exceso su concentración descenderá con el
tiempo, lo que provocaría una disminución progresiva de la velocidad.
3. El producto de la reacción puede inhibir la actividad de la enzima
A continuación orientaremos algunas características de los factores que influyen
en la cinética enzimática.
Concentración de enzima

A medida que aumenta la concentración de enzima, aumenta de forma directa y


proporcional la velocidad inicial de la reacción, lo que se debe al aumento del
número de centros activos útiles unidos al sustrato.

Esta característica es muy importante, ya que se utiliza en los laboratorios clínicos


para determinar la concentración de algunas enzimas en sangre y otros líquidos o
tejidos corporales, midiendo la velocidad con la cual se transforma un sustrato.
Ejemplo de ello es la determinación de las transaminasas.

Concentracion de sustrato

A medida que aumenta la concentración de sustrato, la velocidad inicial de la


reacción aumenta, al principio marcadamente y luego el aumento de la velocidad
se hace menor, hasta que se alcanza una concentración de sustrato a partir de la
cual no sigue [Link] este punto la enzima alcanza su velocidad máxima
y se debe a que todos los centros activos útiles se encuentran ocupados por
moléculas de sustrato. Ha ocurrido el fenómeno de saturación enzimatica.

La concentración de sustrato es importante, ya que su estudio define dos


parámetros cinéticos de la actividad enzimática:
• La velocidad máxima(Vm)
• La constante de Michaelis(KM), que se representa por Km, que es la
concentración de sustrato en que la enzima alcanza la mitad de la velocidad
máxima.

Analizaremos a continuación el significado de ambos.

La velocidad máxima se alcanza cuando las moléculas de sustrato se han unido a


todos los centros activos de las moléculas de la enzima, que se satura por el
sustrato. La velocidad de la reacción en ese momento depende de la capacidad
que tenga la enzima de transformar el sustrato, es decir, refleja la capacidad
catalítica total de la enzima.

La velocidad máxima se relaciona con la etapa de transformación del mecanismo


básico de acción de las enzimas.

En cambio, la constante de Michaelis representa una medida de la afinidad de la


enzima por el sustrato, de forma que mientras mayor sea la afinidad, menor será
el valor de la Km. La Km se relaciona con la etapa de unión del mecanismo
básico de acción de las enzimas.

A mayor KM menor afinidad de la enzima por su sustrato.

A menor KM mayor afinidad de la enzima por su sustrato

Concentración de cofactores

La concentración de cofactores tiene un comportamiento similar a la de sustrato,


deben estudiarlo siguiendo las orientaciones del CD.

Temperatura.
A medida que aumenta la temperatura, aumenta la velocidad de la reacción
enzimática, ya que aumenta la energía del sistema, pero como las enzimas son
proteínas, llega un valor de temperatura en que la enzima comienza a
desnaturalizarse, con lo que cae bruscamente la velocidad inicial.

PH

La concentración de iones hidrógeno o su expresión en forma de pH influye sobre


la velocidad de la reacción catalizada enzimáticamente, ya que modifica el estado
de disociación de los grupos químicos presentes en la enzima, con lo que puede
modificarse tanto la etapa de unión como la de transformación.

En valores extremos de pH puede incluso desnaturalizarse la enzima.

El valor de pH en que la enzima manifiesta su mayor actividad catalítica se


denomina pH óptimo y es característico para cada enzima.

Los activadores son pequeñas moléculas que estimulan la actividad enzimática


aumentando la velocidad de reacción favoreciendo la conformación más adecuada
y no participan en la reacción propiamente.

En cambio los inhibidores son sustancias que disminuyen la velocidad y se unen


a conformación evitando que pasen a la más favorecida y pueden ser, entre otros:
• Competitivos
• No competitivos.
• Acompetitivos

Orientaremos a continuación algunas características de los mismos.

En la inhibición competitiva el inhibidor es similar estructuralmente al sustrato, por


lo que puede unirse al centro activo e incluso en algunas ocasiones ser
transformado por el mismo.

El efecto sobre la reacción enzimática es un aumento de la constante de


Michaelis,aumenta la KM es decir la disminución de la afinidad de la enzima por el
sustrato mientras que la velocidad máxima se conserva igual.
La inhibición competitiva es muy utilizada en la práctica médica, por ejemplo, las
sulfamidas compiten con el ácido para-aminobenzoico en la síntesis de la pared
bacteriana, por lo que se utilizan como antibióticos.

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