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Del Gen a la Proteína: Expresión Genética

El documento describe los procesos de transcripción y traducción que vinculan genes y proteínas, destacando la relación entre la secuencia de nucleótidos en el ADN y la síntesis de proteínas. Se menciona la investigación de Beadle y Tatum sobre mutantes de Neurospora crassa, que apoyó la hipótesis de que un gen codifica para una enzima específica. Además, se detalla el procesamiento del RNA mensajero en eucariotas y la importancia del código genético en la ingeniería genética.

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Del Gen a la Proteína: Expresión Genética

El documento describe los procesos de transcripción y traducción que vinculan genes y proteínas, destacando la relación entre la secuencia de nucleótidos en el ADN y la síntesis de proteínas. Se menciona la investigación de Beadle y Tatum sobre mutantes de Neurospora crassa, que apoyó la hipótesis de que un gen codifica para una enzima específica. Además, se detalla el procesamiento del RNA mensajero en eucariotas y la importancia del código genético en la ingeniería genética.

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06/12/2018

2 Procesos enlazan los genes a proteínas


Capítulo 17
Del gen a la proteína

 expresión genética 1. Transcripción:


proteínas DNA  RNA
fenotipo
2. Traducción
Fenotipo = rasgos físicos RNA  proteínas
visibles, bioquímicos…

Genes proteínas Genes proteínas

•1909 -A. Garrod  “errores innatos del •1930 -Beadle & Tatum
metabolismo”
Estudian mutantes de Neurospora crassa
Alkaptonuria = condición hereditaria en la cual
– hongo del pan
hay deficiencia de la enzima que metaboliza
alkaptón. Caracterizan defectos metabólicos.
Postula que los síntomas de las enfermedades
heredadas provienen de defectos en la síntesis
de enzimas.
Genes  enzimas  fenotipo

1- Se expone el hongo a
Creando mutantes para arginina rayos X para crear
Neurospora crassa mutaciones. Diferentes
mutaciones se manifestarán
en diferentes individuos
•Salvaje (Wild-type) - crece en medio mínimo =
2-Hijos en cientos
agar, sales inorgánicas, sucrosa, biotina, de tubos de
precursores. ensayo con medio
completo (todo lo
que necesitan
para crecer)

•Expone los organismos a rayos X para crear 3-Para encontrar


mutaciones los mutantes, se
toma muestra de
Con arginina se reestablece el cada tubo se
•Mutantes – requieren de arginina (aminoácido) crecimiento. Mutación de pone en medio
MINIMO.
estos hongos en la síntesis de
para poder sobrevivir arginina Aprox. 2% de los
mutantes no
4-Para encontrar los mutantes pueden crecer
para arginina, se ponen en
medio mínimo + arginina

1
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Mutantes
•Cada mutante no podía llevar a cabo la síntesis
•La síntesis de arginina puedes estar bloqueada
en tres pasos distintos. de arginina en uno de los pasos ya que no
•Experimento intenta determinar en cúal de los
tres pasos está el defecto. poseía la enzima necesaria

•Cada mutación ocurrió en un gen diferente


E1 E2 E3
Precursor  Ornitina  Citrulina  Arginina • Se comprueba la hipótesis un gen una enzima

•Los mutantes solo crecen cuando se agrega el

compuesto después del paso defectuoso

•La síntesis de arginina puede estar


bloqueada en tres pasos distintos.
•Cada mutante carece de una enzima distinta.
•Cada mutante = un gene
•Hipótesis  un gen = una enzima

Un gen = una enzima


Un gen = una proteína
Un gen = un polipéptido

2 Procesos enlazan los


genes a proteínas

1. Transcripción:
DNA  RNA
2. Traducción
RNA  proteínas

RNA

2
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•Transcripción
replicación  síntesis de RNA a partir del DNA como molde
Transcripto primario

DNA RNA proteínas Procesamiento – transcriptos maduros


tRNA = moviliza aminoacidos
transcripción traducción rRNA = ribosomoas
mRNA –lleva el mensaje genético del DNA hacia
la maquinaria de síntesis de proteínas.

•Traducción

Síntesis del polipéptido bajo la dirección del mRNA


a) Procariotas
Se traduce la información de: Transcripción y traducción
están acopladas.
 ácidos nucléicos  amino ácidos

Ocurre en los ribosomas b) Eucariotas


 Transcripción ocurre en el
núcleo.
 transcripto primario
mensajero maduro
(mRNA)
 Traducción ocurre en el
citoplasma

Código genético

• Relación entre la secuencia de nucleótidos en el


AND  ARN y la secuencia de amino ácidos en
un polipéptido.
Cadena templado – DNA
• 3 nucleótidos del mRNA codifican para 1
aminoácido
•Tripletas en el mRNA =
codones mRNA
• Cada grupo de 3 nucleótidos (tripleta) se • #Nucleótidos 3x más que
conoce como CODON los amino ácidos
-Ej. 4 aminoácidos = 12
nucleótidos
Codones = unidades básicas del código
genético.

3
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¿Por qué es importante la universalidad del


código genético?
•61 codifican para
amino ácidos Codones de •Importancia evolutiva – evolucionó temprano
Terminación
•Redundante – no en la historia de la vida.
ambiguo
•Es universal-
•Ingeniería genética – tecnología de transferir
genes de una especie a otra.
Ej. Gene humano de insulina en bacterias

Codón de
iniciación

DEL GEN A LA PROTEINA Transcripción – síntesis y procesamiento del RNA

Pasos: Transcripción:
• Transcripción • Iniciación
• Iniciación • Extensión
• Extensión • Terminación
• Terminación
• Traducción
• Iniciación
• Extensión
• Terminación

Promotor

• secuencia específica en el DNA


Polimerasa de RNA
• a ella se enlaza la polimerasa de RNA
• enzima que cataliza el enlace entre los
• determina cúal de las dos cadenas se transcribe
ribonucleótidos

durante la transcripción • Indica el lugar en donde comienza la transcripción

• añade al carbono 3’ del polinucleótido • incluye nucleótidos “río arriba”. Incluye el TATA box

•secuencia en el promotor necesaria para formar

el complejo iniciador de transcripción.

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Terminador

• secuencia final que la polimerasa de RNA promotor terminador

transcribe

• señal de terminación
Unidad de transcripción – segmento que se transcribe

Iniciación
Extensión
Polimerasa de RNA se Polimerasa de RNA se
enlaza al promotor mueve a lo largo del DNA,
exponiendo 10-20 bases.
(encuentra TATA box).
•En eucariotas con la
ayuda de varias proteínas Añade nucleótidos al
= factores de terminal 3’ (crece 5’  3’)
transcripción.

A medida que crece el RNA se despega del templado y las


 Cadenas de DNA se
desenrollan y comienza la
cadenas del DNA se enrollan

transcripción de la cadena Un gen puede ser transcrito simultáneamente por varias
templado. polimerasas de RNA

Terminación

La transcripción continua
hasta llegar al terminador
=Secuencia de RNA 
señal de terminación
•En eucariotas termina
10-35 nucleótidos “río
abajo” Producto de la
transcripción = transcripto
primario
Pre-mRNA

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Lo que se ha formado hasta ahora no es el


mRNA sino un premensajero (transcripto
primario)
 Eucariotas
 Ocurre en el núcleo
 Procesamiento de premensajero
comprende:

1. Alteración de los terminales – 5’ y 3’


2. Empalme del RNA (“splicing”)

1. Alteración los terminales 1. Alteración los terminales

a. Terminal 5’ b. Terminal 3’
5’ cap – nucleótido modificado de guanina  Rabo de poli (A) = 50-250 nucleótidos de adenina
Protege el mRNA de ser degradado.  Inhibe la degradación
En el citoplasma sirve de señal para el enlace de los  Ayuda para el enlace de los ribosomas.
ribosomas.  Facilita el transporte hacia el citoplasma.

2. Empalme de RNA (splicing)

 EL premensajero tiene partes que no cofidican para


nada
Puede tener un largo de aproximadamente 8000
nucleótidos de largo
Las proteínas promedio tienen 400 aa = 1200
nucleótidos
NO codifican = INTRONES
Codifican = EXONES
Remoción de porciones de RNA

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Señales que identifican en donde cortar  Secuencias


cortas al final de los intrones

Particulas llamadas snRNPs = reconocen estos sitios


empalmosoma
snRNPs = ribonucleoproteínas pequeñas
Tiene ARN …..que para poner mas nombres…se llama
snRNA (small nuclear RNA)
Intron se libera

Empalmosoma – complejo de proteínas y snRNPs


Interactua con algunas partes de los intrones
Empalmosoma
liberandolo y uniendo los dos exones que tiene al lado se libera

Exones se pegan
RNA con función de enzimas = Ribozimas

Funciones de los intrones (no codifican)


Las proteinas tiene arquitectura modular
1. Regulación de la expresión genética.
•Consisten de regiones estructurales
2. Regular paso del mRNA hacia el citoplasma.
3. “RNA splicing” alterno – mismo gen distintas y funcionales llamadas dominios

proteínas. •En muchos casos


4. Evolución de nuevas proteínas •Exones diferentes codifican para

diferentes dominios en una

proteína

Gen

Unidad de información hereditaria que consiste de una


secuencia específica de DNA (RNA en algunos virus).

Contiene secuencias que no se transcriben y secuencias


que se transcriben pero no se traducen.

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Estructura
Es una cadena sencilla de RNA de aproximadamente 80
tRNA
•Transfiere amino ácidos nucleótidos de largo.
a los ribosomas. La cadena está doblada, conteniendo regiones de doble
•Reconoce los codones cadena.
correctos en el mRNA. Si observamos la molécula en solo plano, parece un trébol.
Las células eucariotas Terminal 5’
tienen ~ 45 tipos de Terminal 3’ – lugar de enlace para el amino ácido
tRNA, cada uno En uno de los extremos está el anticodón.
codificado por un gen.
Anticodón = triplete de nucleótidos en el tRNA que parea
con el codón en mRNA

Sintetasa de aminoacil-tRNA
 Enzima que cataliza el enlace del amino ácido correcto a
su tRNA.
 Para cada aa hay una sintetasa de aminoacil-tRNA
específica (20).
 La reacción es endergónica.
 Ocurre en dos pasos:
1. Activación del aa -
aa + ATP aminoacil-AMP + PPi
2. Formación del enlace con el tRNA
aminoacil-AMP + tRNA aminoacil-tRNA

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Aminoacyl-tRNA
sintetasa (enzima)

Aminoácido
Al sitio activo se pega el
P P P Adenosine
aminoácido con el ATP 1 Ribosomas
•Organelos que coordinan el apareo entre el tRNA y el
ATP

ATP pierde 2 grupos P


y se une al aminoácido como AMP mRNA durante la traducción.
P Adenosine
P Pi •Se componen de dos subunidades (pequeña y grande)
Pi
Fosfatos
Pi
•Se componen de proteína (40%) y de RNA ribosomal
tRNA
(60%)
tRNA apropiado para llevar
el aminoácido se le pega
P Adenosine
sacando el AMP AMP

tRNA + aminoácido se liberan


de la enzima

Ribosomas
•Se sintetizan en el nucleolo.
•Son transportadas a traves de los poros nucleares hacia el
citoplasma.
•Se ensamblan al enlazarse al mRNA.
•Es el tipo de RNA más abundante.

P site (Peptidyl-tRNA
binding site)
A site (Aminoacyl-
tRNA binding site)
E site
Cada ribosoma tiene: (Exit site)
•Un lugar de enlace con Large
subunit
el mRNA. E P A
•Tres lugares de enlace
para los tRNA. mRNA
•P binding site Small

•A subunit

•E
1. Sitio P (polipéptido) – tRNA que lleva la cadena
polipeptídica.
2. Sitio A (amino ácido) – tRNA que trae el nuevo aa.
3. Sitio E (exit) – tRNA sale del complejo ribosomal.

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aminoacidos Polipeptido en crecimiento


Traducción
Sale tRNA Aminoácido que se pegará
•Síntesis de un polipéptido a partir del mRNA.
•El mensaje genético se encuentra en la secuencia de
tRNA
codones en el mRNA.
3
mRNA
•Acido nucléico  amino ácido
Codons
5

Traductor = tRNA

La precisión de la traducción depende de:


1. El aa correcto debe ser seleccionado para
enlazarlo covalentemente a un tRNA.
2. El aminoacil-tRNA correcto tiene que parearse
con el mRNA en el ribosoma.

Interacciones codón-anticodón Interacciones codón-anticodón

•El tRNA apropiado es •Los tres nucleótidos en el


seleccionado en base a la mRNA aparean con tres
interacción entre el codón nucleótidos en el tRNA
y el anticodón. complementarios.

•El grupo aminoacil NO •Excepción a la regla de


participa en este proceso. pareo de bases =

“Wobble” ---- Vacilar

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“Wobble”
•tRNA reconoce 2-3 codones
•Las primeras dos bases se aparean correctamente
•El apareamiento en la tercera base (terminal 5’) vacila.
Hay cierto “juego”, de manera que la tercera base en el
anticodón puede formar puentes de hidrógeno con más de
una base (3’) en el codón

5’-base anticodón 3’-base codón


tRNA mRNA
C G
A U
U A/G
G U/C

Iniciación
Traducción 1. Enlace entre el mRNA, la
1. Iniciación subunidad pequeña ribosomal
2. Extensión y el tRNA iniciador.
3. Terminación

2. Enlace entre la subunidad


• Las tres etapas requieren enzimas y otras ribosomal grande y la
subunidad pequeña.
proteínas.
Requiere de
•Las etapas de iniciación y alargamiento
•Factores de iniciación
requieren energía que proviene de GTP. •GTP

Iniciación

 5’cap ayuda a enlazar la


secuencia líder al
ribosoma
 Se aparea el tRNA inicador
enlazado a metionina con  El sitio A vacio está listo
su codón (AUG). para el siguiente aminoacil-
 Ocurre en el sitio P tRNA.
 Lugar en donde comienza
la traducción.

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Extensión
Ciclo de tres pasos que añaden aa uno a uno a aa inicial

1. Reconocimiento
del codón

Extensión Extensión
Ciclo de tres pasos que añaden aa uno a uno a aa inicial Ciclo de tres pasos que añaden aa uno a uno a aa inicial

Sitio A queda vacío para


recibir el próximo
Met
tRNA

3. Translocación
mRNA y tRNA se
2. Formación
mueven como una
del enlace unidad
peptídico
mRNA se mueve de 5’ a
3’
Ribosoma no se mueve

Extensión
Ciclo de tres pasos que añaden aa uno a uno a aa inicial
1. Reconocimiento del codón – Codón (mRNA) en el sitio

A forma puentes de hidrógeno con el anticodón del


1. Reconocimiento del
codón aminoacil-tRNA que va a ocupar el sitio A.

 Requiere : factores de extensión, GTP

3. Translocación
mRNA y tRNA se mueven
como una unidad 2. Formación del
enlace peptídico
mRNA se mueve de 5’ a 3’
Ribosoma no se mueve

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2. Formación del enlace peptídico entre el polipéptido en 3. Translocación – tRNA en el sitio A se mueve al sitio P y

el sitio P y el nuevo aa del tRNA que ocupa el sitio A. el que ocupaba el sitio P se mueve al sitio E y sale del

 La enzima responsable de este enlace es la ribosoma

peptidil transferasa y es parte del la subunidad  Cada translocación requiere GTP

ribosomal grande.

 El polipéptido se separa de su tRNA y es transferido

al nuevo aa / tRNA que ocupa el sitio A

Terminación
Terminación
•Codón de terminación llega al
sitio A
UAA, UAG, UGA
No codifican para aa
•Un factor protéico
de liberación se
enlaza al codón en el
sitio A

Terminación

• El factor protéico de liberación


hidroliza el enlace entre el
Procariotas
polipéptido y el tRNA que ocupa el
La traducción
sitio P
ocurre
 Se liberan tRNA y simultaneamente
polipéptido con la
transcripción

 Se disocia el complejo de
traducción

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Resumiendo
Poliribosomas

• Varios ribosomas pueden traducir una molécula


de mRNA en forma simultánea

Completed
polypeptide
Growing
polypeptides

Incoming
ribosomal
subunits

Start of
End of
mRNA
mRNA
(5 end)
(3 end)

La proteína aun no esta lista La proteína aun no esta lista

•Cadenas de polipeptidos son modificadas •Hay modificaciones post traducción antes que la

después de la traducción proteína pueda llevar a cabo un trabajo

•Estructura tridimensional •Modificación química de algunos aminoácidos

•Durante la síntesis la cadena de polipéptido se •Se recorta la cadena

empieza a enrollar y doblar en forma espontánea •Se divide el polipéptido en dos cadenas mas

con estructura secundaria y terciaria cortas

•Se unen dos polipéptidos que se sintetizaron

independientemente

Mutaciones = cambios en el material genético.


1 Polypeptide 2 An SRP binds 3 The SRP binds to a 4 The SRP leaves, and 5 The signal- 6 The rest of
synthesis begins to the signal receptor protein in the ER the polypeptide resumes cleaving the completed
on a free peptide, halting membrane. This receptor growing, meanwhile enzyme polypeptide leaves
ribosome in synthesis is part of a protein complex translocating across the cuts off the the ribosome and
the cytosol. momentarily. (a translocation complex) membrane. (The signal signal peptide. folds into its final
that has a membrane pore
and a signal-cleaving enzyme.
peptide stays attached
to the membrane.)
conformation.
•Mutaciones de punto = cambios químicos en un par de
Ribosome
bases de un gen.
mRNA
Signal
Sustitución
peptide ER

Inserción
membrane
Signal
Signal-
peptide
recognition Protein
removed
particle
(SRP) SRP
receptor Deleción
CYTOSOL protein

Translocation
ERLUMEN
complex

Figure 17.21

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Mutaciones de punto
Ejemplo: Anemia falciforme →Sustitución de Timina por Adenina
Sustitución

•Mutaciones silenciosas

redundancia del código genético.

mismo amino ácido

amino ácido con propiedades similares

•Mutaciones con sentido falso

•Mutaciones sin sentido

Deleciones y/o inserciones


Polipéptido sin mutación
•Al quitar un nucleotido se leeran cosas diferentes
Mutaciones silenciosas •Se agregan aminoácidos que no corresponden
•Al final el
aminoácido que se
pega es el mismo

Mutaciones con sentido falso


•Se pega un aminoácido
que no corresponde

Mutaciones sin sentido


•Termina el polipeptido
antes de tiempo

Deleciones y/o inserciones Deleciones y/o inserciones


•Terminación prematura
•Si se agregan o pierden 3 nucleótidos en este caso se
pierde un aa (si se agregan 3 se tendrá un aa extra)

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