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CAPÍTULO 34: Estructura y función del ácido nucleico

P. Anthony Weil

OBJETIVOS

OBJETIVOS

Después de estudiar este capítulo, el lector debería:

Comprender la estructura química monomérica y polimérica del material genético, ácido desoxirribonucleico o DNA, que se encuentra de
manera preponderante en el núcleo de las células eucariotas, pero también en los organelos.

Explicar por qué el DNA genómico es de doble cadena y presenta una fuerte carga negativa.

Comprender el esquema de cómo la información genética del DNA se puede duplicar fielmente a través del proceso de replicación del ácido.

Describir cómo se transcribe o copia la información genética del DNA en innumerables formas distintas de RNA.

Apreciar que una forma de RNA rico en información, el llamado RNA mensajero (mRNA), se procesa después de la transcripción, se transporta
al citoplasma y luego se traduce en proteínas, las moléculas que forman las estructuras, las formas y, en última instancia, las funciones de las
células individuales, tejidos y órganos.

IMPORTANCIA BIOMÉDICA
El descubrimiento de que la información genética está codificada a lo largo de una molécula polimérica compuesta de sólo cuatro tipos de unidades
monoméricas fue uno de los principales logros científicos del siglo XX. Esta molécula polimérica, el ácido desoxirribonucleico (DNA,
deoxyribonucleic acid), es la base química de la herencia y está organizada en genes, las unidades fundamentales de la información genética. Se ha
dilucidado la vía de información básica, es decir, el DNA, que dirige la síntesis de ácido ribonucleico (RNA, ribonucleic acid) que, a su vez, dirige y regula
la síntesis de proteínas. Los genes no funcionan de forma autónoma; más bien, su replicación y función están controladas por varios productos
genéticos, en primer lugar proteínas, a menudo en colaboración con componentes de varias vías de transducción de señales. El conocimiento de la
estructura y función de los ácidos nucleicos es esencial para comprender la genética y muchos aspectos de la fisiopatología, así como la base genética
de la enfermedad.

EL DNA CONTIENE LA INFORMACIÓN GENÉTICA

La demostración de que el DNA contenía la información genética se hizo por primera vez en 1944 en una serie de experimentos clásicos de Avery,
MacLeod y McCarty. Ellos demostraron que la determinación genética del carácter (tipo) de la cápsula de una bacteria neumocócica concreta podía
transmitirse a otra de diferente tipo capsular al introducir DNA purificado de la del primer neumococo en esta última. Estos autores se refirieron al
agente (más tarde se demostró que era DNA) que lograba el cambio como “factor de transformación”. Más tarde, este tipo de manipulación genética
acabó por convertirse en un lugar común. Experimentos conceptualmente similares ahora se realizan con regularidad basados en una variedad de
células, incluidas las células humanas y embriones de mamíferos como receptores y moléculas clonadas de DNA como donantes de información
genética.

El DNA contiene cuatro desoxinucleótidos distintos

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La naturaleza
CAPÍTULO química
34: de las
Estructura unidades
y función delmonoméricas de desoxinucleótidos
ácido nucleico, P. Anthony Weil de DNA (desoxiadenilato, desoxiguanilato, desoxicitidilato y 1 / 18
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Policy en el capítulo 32; tales unidades monoméricas de DNA se
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mantienen en forma polimérica mediante enlaces 3′,5′­fosfodiéster que constituyen una sola cadena, como se muestra en la figura 34–1. El
contenido informativo del DNA (el código genético) reside en la secuencia en que se ordenan estos monómeros (desoxirribonucleótidos de purina y
acabó por convertirse en un lugar común. Experimentos conceptualmente similares ahora se realizan con regularidad basados en una variedad de
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células, incluidas las células humanas y embriones de mamíferos como receptores y moléculas clonadas de DNA como donantes de información
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genética.

El DNA contiene cuatro desoxinucleótidos distintos

La naturaleza química de las unidades monoméricas de desoxinucleótidos de DNA (desoxiadenilato, desoxiguanilato, desoxicitidilato y
timidilato) se describe en Química de purinas, pirimidinas, nucleósidos y nucleótidos, en el capítulo 32; tales unidades monoméricas de DNA se
mantienen en forma polimérica mediante enlaces 3′,5′­fosfodiéster que constituyen una sola cadena, como se muestra en la figura 34–1. El
contenido informativo del DNA (el código genético) reside en la secuencia en que se ordenan estos monómeros (desoxirribonucleótidos de purina y
pirimidina). El polímero representado posee una polaridad; un extremo tiene un extremo 5′­hidroxilo o fosfato mientras que el otro tiene un extremo
3′­fosfato o hidroxilo. La importancia de esta polaridad se hará evidente. Dado que la información genética reside en el orden de las unidades
monoméricas dentro de los polímeros, debe existir un mecanismo para reproducir o replicar esta información específica con un alto grado de
fidelidad. Ese requisito, junto con los datos de difracción de rayos X de la molécula de DNA generados por Franklin, y la observación de Chargaff de
que en las moléculas de DNA la concentración de los nucleótidos de desoxiadenosina (A) es igual a la de los nucleótidos de timidina (T) (A = T),
mientras que la concentración de los nucleótidos de desoxiguanosina (G) es igual a la de los nucleótidos de desoxicitidina (C) (G = C), llevó a Watson,
Crick y Wilkins a proponer, a principios de la década de 1950, un modelo de molécula de DNA de doble cadena (d s, double­stranded). El modelo que
propusieron se representa en la figura 34–2. Las dos cadenas de esta hélice de doble cadena se mantienen unidas por enlaces de hidrógeno
(enlaces H; véase la figura 2–2) entre las bases de purina y pirimidina de las respectivas moléculas lineales y por interacciones hidrófobas y de van
der Waals (véase Fuerzas de van der Waals, en el capítulo 2, y la figura 2–4) entre los pares de bases adyacentes apilados. Los apareamientos entre los
nucleótidos de purina y pirimidina en las cadenas opuestas son muy específicos y dependen de los enlaces de hidrógeno de A con T y G con C (figura
34–2). A menudo, los pares de bases A­T y G­C se denominan pares de bases de Watson­Crick.

Figura 34–1.

Segmento de una cadena de una molécula de DNA en el que las bases de purina y pirimidina guanina (G), citosina (C), timina (T) y
adenina (A) se mantienen unidas por un esqueleto de fosfodiéster entre 2′­residuos de desoxirribosilo unidos a las nucleobases
por un enlace N ­glucosídico. Es preciso tener en cuenta que el esqueleto de fosfodiéster tiene carga negativa y una polaridad (es decir, una
dirección). La convención dicta que una secuencia de DNA monocatenario se escribe en la dirección 5′ a 3′ (es decir, pGpCpTpAp, donde G, C, T y A
representan las cuatro bases y P representa los fosfatos interconectados).

Figura 34–2.

Representación esquemática del modelo de Watson y Crick de la estructura de doble hélice de la forma B del DNA. La flecha horizontal
indica el ancho de la doble hélice (20 Å) y la flecha vertical indica la distancia que abarca una vuelta completa de la doble hélice (34 Å). Una vuelta de B­
DNA incluye 10 pares de bases (pb), por lo que el aumento es de 3.4 Å por pb. El eje central de la doble hélice está indicado por la barra vertical. Las
flechas cortas designan la polaridad de las cadenas antiparalelas. Se representan los surcos mayor y menor. (A, adenina; C, citosina; G, guanina; P,
fosfato; S, azúcar [desoxirribosa]; T, timina). Los enlaces de hidrógeno entre las bases A/T y G/C se indican mediante líneas horizontales rojas cortas.

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indica el ancho de la doble hélice (20 Å) y la flecha vertical indica la distancia que abarca una vuelta completa de la doble hélice (34 Å). Una vuelta de B­
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DNA incluye 10 pares de bases (pb), por lo que el aumento es de 3.4 Å por pb. El eje central de la doble hélice está indicado por la barra vertical. Las
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flechas cortas designan la polaridad de las cadenas antiparalelas. Se representan los surcos mayor y menor. (A, adenina; C, citosina; G, guanina; P,
fosfato; S, azúcar [desoxirribosa]; T, timina). Los enlaces de hidrógeno entre las bases A/T y G/C se indican mediante líneas horizontales rojas cortas.

Se dice que esta forma común de DNA es diestra porque cuando uno mira hacia abajo en la doble hélice, los residuos de la base forman una espiral en
el sentido de las agujas del reloj. En la molécula de doble cadena, las restricciones impuestas por la rotación alrededor del enlace fosfodiéster, la
anticonfiguración favorecida del enlace glucosídico (véase la figura 32–5) y los tautómeros predominantes (véase la figura 32–2) de las cuatro bases (A,
G, T y C) permiten que A se empareje sólo con T y G sólo con C, como se muestra en la figura 34–3. Estas restricciones de apareamiento de bases
explican la observación anterior de que en una molécula de DNA de doble cadena el contenido de A es igual al de T y el contenido de G es igual al de C.
Las dos cadenas de la molécula de doble hélice, cada una de las cuales posee una polaridad, son antiparalelas; es decir, una cadena corre en la
dirección de 5′ a 3′ y la otra en la dirección de 3′ a 5′. En las moléculas de DNA de doble cadena, dentro de un gen particular, la información genética
reside en la secuencia de nucleótidos de una cadena, la cadena molde. Ésta es la cadena de DNA que se copia o transcribe durante la síntesis del
ácido ribonucleico (RNA); a veces se la denomina cadena no codificante. La cadena opuesta se considera la cadena codificante porque coincide
con la secuencia del transcrito de RNA (pero que contiene uracilo en lugar de timina; ver la figura 34–8) que codifica la proteína.

Figura 34–3.

El apareamiento de bases de DNA clásico de Watson­Crick entre desoxinucleótidos complementarios implica la formación de
enlaces de hidrógeno. Dos de estos enlaces H se forman entre la adenina y la timina, y tres enlaces H se forman entre la citidina y la guanina. Las
líneas discontinuas representan enlaces H.

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Figura 34–3.

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El apareamiento de bases de DNA clásico de Watson­Crick entre desoxinucleótidos complementarios implica la formación de
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enlaces de hidrógeno. Dos de estos enlaces H se forman entre la adenina y la timina, y tres enlaces H se forman entre la citidina y la guanina. Las
líneas discontinuas representan enlaces H.

Las dos cadenas, en las que las bases opuestas se mantienen unidas por enlaces de hidrógeno intercatenarios, se enrollan alrededor de un eje central
en forma de doble hélice. En el tubo de ensayo, el DNA de doble cadena puede existir en al menos seis formas (A­DNA, E­DNA y Z­DNA). Estas
diferentes formas de DNA difieren con respecto a las interacciones intracatenarias e intercatenarias, e implican reordenamientos estructurales dentro
de las unidades monoméricas de DNA. Por lo general, en condiciones fisiológicas, la que se encuentra es la forma B. Una sola vuelta de DNA en forma
de B alrededor del eje largo de la molécula contiene 10 pb. La distancia recorrida por una vuelta de B­DNA es de 3.4 nm (34 Å). El ancho (diámetro
helicoidal) de la doble hélice en el B­DNA es de 2 nm (20 Å).

En la molécula de DNA hay surcos

El examen del2025­1­13
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figura 34–2 revela un surco principal y un surco menor que se enrollan a lo largo de la molécula en
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paralelo a los esqueletos de fosfodiéster. En estos surcos, [Link]
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nucleótidos (a través de interacciones hidrófobas y iónicas específicas), donde reconocen y se unen a secuencias de nucleótidos específicas, así como
a las formas únicas formadas a partir de ellas. Por lo general, la unión se produce sin interrumpir el apareamiento de bases de la molécula del DNA de
de las unidades monoméricas de DNA. Por lo general, en condiciones fisiológicas, la que se encuentra es la forma B. Una sola vuelta de DNA en forma
de B alrededor del eje largo de la molécula contiene 10 pb. La distancia recorrida por una vuelta de B­DNA es deAutonoma
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El ancho (diámetro UAT
helicoidal) de la doble hélice en el B­DNA es de 2 nm (20 Å). Access Provided by:

En la molécula de DNA hay surcos

El examen del modelo representado en la figura 34–2 revela un surco principal y un surco menor que se enrollan a lo largo de la molécula en
paralelo a los esqueletos de fosfodiéster. En estos surcos, las proteínas suelen interactuar de manera específica con los átomos expuestos de los
nucleótidos (a través de interacciones hidrófobas y iónicas específicas), donde reconocen y se unen a secuencias de nucleótidos específicas, así como
a las formas únicas formadas a partir de ellas. Por lo general, la unión se produce sin interrumpir el apareamiento de bases de la molécula del DNA de
doble hélice. Como se analiza en Importancia biomédica, en el capítulo 35, en El RNA se sintetiza a partir de una plantilla de DNA mediante la RNA
polimerasa, en el capítulo 36, y en La regulación génica en procariotas y eucariotas se diferencia en otros aspectos importantes, en el capítulo 38, las
proteínas reguladoras que controlan la replicación, la reparación y la recombinación del DNA, así como la transcripción de genes específicos, actúan a
través de tales interacciones proteína­DNA y, por tanto, contribuyen de manera crítica a la función celular.

La desnaturalización del DNA se utiliza para analizar su estructura

Como se muestra en la figura 34–3, tres enlaces H, formados por átomos de hidrógeno unidos a átomos de N u O electronegativos, mantienen el
nucleótido de desoxiguanosina con el nucleótido de desoxicitidina. Por el contrario, el otro par de bases canónicas, el par A­T, se mantiene unido por
dos enlaces H. Téngase en cuenta que las cuatro bases de nucleótidos del DNA ([dG, dA] purinas y [dT, dC] pirimidinas) son moléculas planas (véase la
figura 32–1 y el cuadro 32–1). Estas dos propiedades clave de las bases de nucleótidos les permiten apilarse de forma estrecha dentro del DNA dúplex
(figura 34–2). Además, los átomos internos de las bases heterocíclicas aromáticas son muy polarizables y, junto con el hecho de que muchos de los
átomos dentro de las bases contienen cargas parciales, permite que las bases apiladas formen interacciones electrostáticas y de van der Waals. En
conjunto, estas fuerzas se denominan fuerzas de apilamiento de bases o interacciones de apilamiento de bases. Las interacciones de apilamiento de
bases entre pares de bases G­C (o C­G) adyacentes son más fuertes que las de los pares de bases A­T (o T­A). Por tanto, las secuencias de DNA ricas en
G­C son en general más resistentes a la desnaturalización, o separación de cadenas, denominada “fusión”, que las regiones de DNA ricas en A­T.

El DNA puede desnaturalizarse de forma reversible y renaturalizarse de forma específica, tanto en el tubo de
ensayo como en las células vivas

En el laboratorio, la estructura de doble cadena del DNA puede separarse o desnaturalizarse en sus dos cadenas componentes en solución:
si se aumenta la temperatura, se disminuyen las concentraciones de sal en la solución, se agregan agentes caotrópicos, que pueden formar
enlaces H competitivos con las bases de desoxinucleótidos individuales, o, a menudo, de manera experimental, mediante una combinación de los
tres tratamientos. En tales condiciones, no sólo se separan las dos pilas de bases, sino que las propias bases se desapilan mientras permanecen
conectadas dentro de los dos polímeros monocatenarios, que están conectados por sus cadenas principales de fosfodiéster. Concomitante con la
desnaturalización de la molécula de DNA en dos cadenas sencillas hay un aumento en la absorbancia óptica en el espectro de luz ultravioleta (260 nm;
(véase Los nucleótidos absorben la luz ultravioleta, en el capítulo 32) de las bases de purina y pirimidina de cada cadena; este fenómeno se denomina
hipercromicidad de la desnaturalización. Debido a la fuerza combinada del apilamiento de bases y el enlace H entre las bases complementarias en
cada cadena, la molécula de DNA de doble cadena exhibe propiedades similares a las de una barra rígida; por tanto, el DNA nativo de doble cadena en
solución es un material en extremo viscoso. Sin embargo, al desnaturalizarse, las soluciones de DNA pierden su viscosidad.

Las cadenas de una molécula dada de DNA de doble cadena se separan en un rango de temperatura. El punto medio de la desnaturalización del
DNA medido se denomina temperatura de fusión, o T m . La Tm (melting temperature) está influenciada por la composición de bases del DNA y por
la concentración de sal u otros componentes de la solución (considere la siguiente explicación). El DNA rico en pares G­C se funde a una temperatura
más alta que el DNA rico en pares A­T, debido, como ya se mencionó, a las diferencias en el contenido de enlaces de hidrógeno y el apilamiento de
bases. Un aumento de 10 veces la concentración de cationes monovalentes incrementa de manera significativa la Tm al neutralizar la repulsión
intrínseca entre cadenas entre los fosfatos con altas cargas negativas del esqueleto de fosfodiéster de cada cadena de DNA. Por ejemplo, un aumento
de la concentración de NaCl de 0.01 a 0.1 M aumenta la Tm en 16.6 °C. Por el contrario, los caotropos como la urea (NH2CONH2; véase la figura 28–16) y
la formamida (CH3NO) pueden formar enlaces de hidrógeno de manera eficiente con las bases de nucleótidos, lo que desestabiliza los enlaces de
hidrógeno entre las bases; tales condiciones de la solución reducen la Tm. La adición de caotropos permite que las cadenas de DNA o DNA­RNA
complementario y los híbridos intramoleculares de RNA­RNA (consulte el tema siguiente) se separen a temperaturas mucho más bajas. Las
temperaturas más bajas minimizan la rotura del enlace fosfodiéster y el daño químico a los nucleótidos que puede suscitarse en una incubación
prolongada en solución. En las células vivas, tanto la desnaturalización como la renaturalización del DNA suceden de forma natural durante los
procesos de replicación del DNA, recombinación del DNA, reparación del DNA (véase Importancia biomédica, en el capítulo 35) y transcripción del gen
del DNA (véase El RNA se sintetiza a partir de una plantilla de DNA mediante la RNA polimerasa, en el capítulo 36). En todos estos casos, la separación y
renaturalización de la cadena de DNA está mediada por la acción de proteínas de unión de ácido nucleico específicas y varias enzimas, en combinación
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con energía 34:
CAPÍTULO térmica o química
Estructura suministrada
y función a través
del ácido de la
nucleico, [Link]ólisis
Anthony del ATP.
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La renaturalización del DNA requiere una coincidencia precisa de los pares de bases
complementario y los híbridos intramoleculares de RNA­RNA (consulte el tema siguiente) se separen a temperaturas mucho más bajas. Las
Universidad
temperaturas más bajas minimizan la rotura del enlace fosfodiéster y el daño químico a los nucleótidos Autonoma
que puede de Tamaulipas_123444
suscitarse en una incubación UAT
prolongada en solución. En las células vivas, tanto la desnaturalización como la renaturalización delProvided
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procesos de replicación del DNA, recombinación del DNA, reparación del DNA (véase Importancia biomédica, en el capítulo 35) y transcripción del gen
del DNA (véase El RNA se sintetiza a partir de una plantilla de DNA mediante la RNA polimerasa, en el capítulo 36). En todos estos casos, la separación y
renaturalización de la cadena de DNA está mediada por la acción de proteínas de unión de ácido nucleico específicas y varias enzimas, en combinación
con energía térmica o química suministrada a través de la hidrólisis del ATP.

La renaturalización del DNA requiere una coincidencia precisa de los pares de bases

Es importante destacar que las cadenas separadas de DNA se renaturalizarán o se reasociarán cuando se alcancen las condiciones adecuadas de
temperatura y sal. A menudo, el recocido se denomina renaturalización o hibridación. La tasa de reasociación de cadenas depende de la
concentración de las cadenas complementarias. A una temperatura y concentración de sal dadas, una cadena de ácido nucleico en particular sólo se
vincula con fuerza con su cadena complementaria. Por tanto, la renaturalización es de alta especificidad. De hecho, los investigadores han
demostrado que las moléculas híbridas de DNA renaturalizadas con un desajuste de un par de bases son fáciles de detectar y cuantificar. Es
importante destacar que las moléculas híbridas de DNA­DNA, DNA­RNA y RNA­RNA también se forman en las condiciones apropiadas. Por ejemplo, el
DNA forma una molécula híbrida de doble cadena perfecta con una secuencia de DNA complementaria (cDNAc), o con un RNA complementario
afín. Cuando la hibridación se combina con varias técnicas analíticas complejas, los científicos pueden detectar, identificar e incluso determinar de
manera específica la secuencia de cantidades cada vez más pequeñas de ácidos nucleicos (tanto DNA como RNA). En Las técnicas de
electrotransferencia e hibridación permiten la visualización de moléculas objetivo blanco específicas, en el capítulo 39, se describe una descripción
general de gran parte de la tecnología que permite tales análisis de ácidos nucleicos.

El DNA existe en formas relajadas y superenrolladas

En algunos microorganismos, como las bacterias, los bacteriófagos, muchos virus animales que contienen DNA, así como en organelos como las
mitocondrias (véase la figura 35–8), los extremos de las moléculas de DNA se unen para crear un círculo cerrado sin extremos covalentes libres. Como
era de esperar, esto no destruye la polaridad de las moléculas, pero elimina todos los grupos hidroxilo y fosforilo 3′ y 5′ libres. Los círculos cerrados
existen en formas relajadas o superenrolladas. Los superenrollamientos se introducen cuando se tuerce un círculo cerrado alrededor de su propio eje
o cuando se tuerce una pieza lineal de DNA dúplex, cuyos extremos están fijos. Este proceso que requiere energía pone a la molécula bajo tensión de
torsión, y cuanto mayor sea el número de superespiras, mayor será la tensión o torsión (una prueba sencilla consiste en torcer una banda elástica).
Los superenrollamientos negativos se forman cuando la molécula se tuerce en la dirección opuesta a los giros en el sentido de las agujas del reloj
de la doble hélice dextrógira que se encuentra en el DNA­B; se dice que dicho DNA está enrollado por debajo. La energía requerida para lograr este
estado se halla, en cierto sentido, almacenada en las superespiras. La transición a otra forma que requiere energía se facilita por el subenrollamiento
(véase la figura 35–19). Una de esas transiciones es la separación de cadenas, que es un requisito previo para la replicación y transcripción del DNA.
Por consiguiente, el DNA superenrollado es una forma preferida en los sistemas biológicos. Las enzimas que catalizan los cambios topológicos del
DNA se denominan topoisomerasas, las cuales pueden relajarse o insertar superenrollamientos, para lo que utilizan ATP como fuente de energía.
Los homólogos de esta enzima existen en todos los organismos y son objetivos importantes para la quimioterapia del cáncer. Los
superenrollamientos también se pueden formar dentro de los DNA lineales si determinados segmentos del DNA están restringidos al interactuar de
forma estrecha con proteínas nucleares que establecen dos sitios límite que definen un dominio topológico.

EL DNA PROPORCIONA UNA PLANTILLA PARA LA REPLICACIÓN Y LA TRANSCRIPCIÓN

La información genética almacenada en la secuencia de nucleótidos del DNA tiene dos propósitos: es la fuente de información para la síntesis de todas
las moléculas de proteínas de la célula y el organismo, y proporciona la información heredada por las células hijas o descendientes. Ambas funciones
requieren que la molécula de DNA sirva como plantilla, en el primer caso para la transcripción de la información en el RNA, y en el segundo caso para la
replicación de la información en las moléculas hijas del DNA.

Cuando cada cadena de la molécula de DNA parental de doble cadena se separa de su complemento durante la replicación, cada una sirve de forma
independiente como molde sobre el cual se sintetiza una nueva cadena complementaria (figura 34–4). Las dos moléculas hijas del DNA de doble
cadena recién formadas, cada una de las cuales contiene una cadena (pero complementaria en lugar de idéntica) de la molécula de DNA de doble
cadena original, luego se ordenan entre las dos células hijas durante la mitosis (figura 34–5). Cada célula hija contiene moléculas de DNA con
información idéntica a la que poseía el DNA padre; sin embargo, en cada célula hija, la molécula de DNA de la célula madre sólo se ha semiconservado.

Figura 34–4.

La síntesis de DNA mantiene la secuencia y la estructura de la plantilla original del DNA. Estructura de doble cadena del DNA y la función
de plantilla de2025­1­13
Downloaded cada cadena parental
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información idéntica a la que poseía el DNA padre; sin embargo, en cada célula hija, la molécula de DNA de la célula madre sólo se ha semiconservado.
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Figura 34–4.

La síntesis de DNA mantiene la secuencia y la estructura de la plantilla original del DNA. Estructura de doble cadena del DNA y la función
de plantilla de cada cadena parental antigua (naranja) en la que se sintetiza una nueva cadena hija complementaria (azul).

Figura 34–5.

La replicación del DNA es semiconservadora. Durante una ronda de replicación, cada una de las dos cadenas de DNA se utiliza como plantilla
para la síntesis de una nueva cadena complementaria. La naturaleza semiconservadora de la replicación del DNA tiene implicaciones para el control
bioquímico (véase la figura 35–16), citogenético (véase la figura 35–12) y epigenético de la expresión génica (véanse las figuras 38–8 y 38–9).

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Figura 34–5.

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La replicación del DNA es semiconservadora. Durante una ronda de replicación, cada una de las dos cadenas de DNA se utiliza como plantilla
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para la síntesis de una nueva cadena complementaria. La naturaleza semiconservadora de la replicación del DNA tiene implicaciones para el control
bioquímico (véase la figura 35–16), citogenético (véase la figura 35–12) y epigenético de la expresión génica (véanse las figuras 38–8 y 38–9).

LA NATURALEZA QUÍMICA DEL RNA SE DIFERENCIA DE LA DEL DNA

El RNA es un polímero de ribonucleótidos de purina y pirimidina unidos por enlaces 3′,5′­fosfodiéster análogos a los del DNA (figura 34–6). Aunque
comparte muchas características con el DNA, el RNA posee varias diferencias específicas:

1. En el RNA, el residuo de azúcar al que se unen los fosfatos y las bases de purina y pirimidina es la ribosa en lugar de la 2′­desoxirribosa del DNA
(véase la figura 19–2 y 32–3).

2. Los componentes de pirimidina del RNA pueden diferir de los del DNA. Aunque el RNA contiene los ribonucleótidos de adenina, guanina y citosina,
no posee timina, excepto en el raro caso que se menciona en la siguiente descripción. En lugar de timina, el RNA contiene el ribonucleótido de
uracilo.

3. El RNA puede existir como una sola cadena, mientras que el DNA existe como una molécula helicoidal de doble cadena. Sin embargo, dada la
secuencia de bases complementaria adecuada con polaridad opuesta, la cadena sencilla de RNA, como se muestra en las figuras 34–7 y 34–11, es
capaz de plegarse sobre sí misma como una horquilla y adquirir así características de doble cadena: apareamiento de G con C y apareamiento de A
con U. Los pares de bases G­C forman tres enlaces H y las bases A­U forman sólo dos.
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4. Dado que34:
CAPÍTULO la Estructura
molécula de y RNA es una
función sola cadena
del ácido complementaria
nucleico, de sólo una de las dos cadenas de un gen, su contenido de guanina no
P. Anthony Weil es por
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necesidad igual a su contenido de uracilo.

5. El RNA suele hidrolizarse con álcalis a diésteres cíclicos 2′,3′ de los mononucleótidos, compuestos que no pueden formarse a partir del DNA
 uracilo.
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3. El RNA puede existir como una sola cadena, mientras que el DNA existe como una molécula helicoidal de doble
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secuencia de bases complementaria adecuada con polaridad opuesta, la cadena sencilla de RNA, como se muestra en las figuras 34–7 y 34–11, es
capaz de plegarse sobre sí misma como una horquilla y adquirir así características de doble cadena: apareamiento de G con C y apareamiento de A
con U. Los pares de bases G­C forman tres enlaces H y las bases A­U forman sólo dos.

4. Dado que la molécula de RNA es una sola cadena complementaria de sólo una de las dos cadenas de un gen, su contenido de guanina no es por
fuerza igual a su contenido de citosina, ni su contenido de adenina es por necesidad igual a su contenido de uracilo.

5. El RNA suele hidrolizarse con álcalis a diésteres cíclicos 2′,3′ de los mononucleótidos, compuestos que no pueden formarse a partir del DNA
tratado con álcali debido a la ausencia de un grupo 2′­hidroxilo. La labilidad alcalina del RNA es útil tanto para el diagnóstico como para el análisis.

Figura 34–6.

Segmento de una molécula de ácido ribonucleico (RNA) en el que las bases de purina y pirimidina (guanina [G], citosina [C], uracilo
[U] y adenina [A]) se mantienen unidas por enlaces fosfodiéster entre residuos de ribosilo unidas a las nucleobases por enlaces N ­
glucosídicos. Cabe recordar que las cargas negativas en el esqueleto de fosfodiéster no se ilustran (como en la figura 34–1) y que el polímero tiene
una polaridad como lo indican los fosfatos unidos en 3′ y 5′ marcados.

Figura 34–7.

Estructura secundaria del RNA. (Izquierda) Representación esquemática de la estructura secundaria de una molécula hipotética de
RNA monocatenario en la que se ha formado un asa de tallo u “horquilla”. La formación de esta estructura depende del emparejamiento de
bases intramoleculares indicado (líneas horizontales coloreadas entre bases complementarias). Hay que tener en cuenta que en el RNA G se empareja
con C como en el DNA, pero que A se empareja con U. (Derecha) Esquema de A­U (arriba) en comparación con los pares de bases A­T (abajo).

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Estructura secundaria del RNA. (Izquierda) Representación esquemática de la estructura secundaria de una molécula hipotética de
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RNA monocatenario en la que se ha formado un asa de tallo u “horquilla”. La formación de esta estructura depende del emparejamiento de
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bases intramoleculares indicado (líneas horizontales coloreadas entre bases complementarias). Hay que tener en cuenta que en el RNA G se empareja
con C como en el DNA, pero que A se empareja con U. (Derecha) Esquema de A­U (arriba) en comparación con los pares de bases A­T (abajo).

La información dentro de la cadena simple de RNA está contenida en su secuencia (“estructura primaria”) de nucleótidos de purina y pirimidina
dentro del polímero. La secuencia es complementaria a la cadena plantilla del gen a partir del cual se transcribió. Debido a esta complementariedad,
una molécula de RNA puede unirse de forma específica mediante las reglas del emparejamiento de bases a su cadena de DNA plantilla (A–T, G–C, C–G,
U–A; la base de RNA en negritas); no se unirá (“hibridará”) con la otra cadena (codificante) de su gen. La secuencia de la molécula de RNA (excepto por
U que reemplaza a T) es la misma que la de la cadena codificante del gen (figura 34–8).

Figura 34–8.

Relación entre las secuencias de un transcrito de RNA y su gen, en la que se muestran las cadenas codificante y plantilla con sus
polaridades. La transcripción de RNA con una polaridad de 5′ a 3′ es complementaria de la cadena plantilla con su polaridad de 3′ a 5′. Tomar en
cuenta que la secuencia en la transcripción del RNA y su polaridad es la misma que en la cadena codificante, excepto que la U de la transcripción
reemplaza a la T del gen; el nucleótido iniciador de los RNA contiene un 5­trifosfato terminal (es decir, pppA, arriba).

CASI TODAS LAS ESPECIES DE RNA ABUNDANTES Y ESTABLES ESTÁN INVOLUCRADAS EN

ALGÚN ASPECTO DE LA SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
Aquellas moléculas de RNA citoplásmico que sirven como plantillas para la síntesis de proteínas (es decir, que transfieren información genética desde
el DNA a la maquinaria de síntesis de proteínas) se denominan RNA mensajeros (mRNA, messenger RNA). Muchas otras moléculas de RNA
citoplásmico muy abundantes (RNA ribosómico [rRNA, ribosomic RNA]) tienen funciones estructurales en las que contribuyen a la formación y
función de los ribosomas (la maquinaria organelar para la síntesis de proteínas) o sirven como moléculas adaptadoras (RNA de transferencia
[tRNA, transfer RNA]) para la traducción de información del RNA en secuencias específicas de aminoácidos polimerizados.

Como dato curioso, algunas moléculas de RNA tienen actividad catalítica intrínseca. La actividad de estas enzimas de RNA, o ribozimas, a menudo
implica la escisión de un ácido nucleico. Son dos las ribozimas que participan en el empalme del RNA y la peptidiltransferasa que cataliza la formación
de enlaces peptídicos en el ribosoma.

En todas las células eucariotas existen especies de RNA nuclear pequeño (snRNA, small nuclear RNA) que no tienen una relación directa con la
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fundamental en el procesamiento del RNA, en particular en el procesamiento del mRNA. Estas
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moléculas relativamente pequeñas varían en tamaño desde 90 hasta alrededor de 300 nucleótidos (cuadro 34–1). Las propiedades de las diversas
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clases de RNA celulares se detallan en el siguiente tema.

Cuadro 34–1.
[tRNA, transfer RNA]) para la traducción de información del RNA en secuencias específicas de aminoácidos polimerizados.
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Como dato curioso, algunas moléculas de RNA tienen actividad catalítica intrínseca. La actividad de estas enzimas de RNA, o ribozimas, a menudo
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implica la escisión de un ácido nucleico. Son dos las ribozimas que participan en el empalme del RNA y la peptidiltransferasa que cataliza la formación
de enlaces peptídicos en el ribosoma.

En todas las células eucariotas existen especies de RNA nuclear pequeño (snRNA, small nuclear RNA) que no tienen una relación directa con la
síntesis de proteínas, pero desempeñan un papel fundamental en el procesamiento del RNA, en particular en el procesamiento del mRNA. Estas
moléculas relativamente pequeñas varían en tamaño desde 90 hasta alrededor de 300 nucleótidos (cuadro 34–1). Las propiedades de las diversas
clases de RNA celulares se detallan en el siguiente tema.

Cuadro 34–1.
Algunas de las especies de RNA estables pequeñas que se encuentran en las células de los mamíferos.

Nombre Longitud (nucleótidos) Moléculas por célula Localización

U1 165 1 × 106 Nucleoplasma

U2 188 5 × 105 Nucleoplasma

U3 216 3 × 105 Nucleolo

U4 139 1 × 105 Nucleoplasma

U5 118 2 × 105 Nucleoplasma

U6 106 3 × 105 Gránulos de pericromatina

4.5S 95 3 × 105 Núcleo y citoplasma

7SK 280 5 × 105 Núcleo y citoplasma

El material genético de algunos virus animales y vegetales es RNA en lugar de DNA. Aunque la información de algunos virus de RNA nunca se transcribe
en una molécula de DNA (p. ej., la influenza y los coronavirus como el COVID­19), ciertos virus de RNA de animales, de manera específica los retrovirus
(p. ej., el virus de la inmunodeficiencia humana o el HIV), se transcriben por la DNA polimerasa dependiente de RNA viral, la llamada
transcriptasa inversa, para producir una copia de DNA de doble cadena de su genoma de RNA. En muchos casos, la transcripción del DNA de doble
cadena resultante se integra en el genoma del huésped y luego sirve como plantilla para la expresión génica a partir de la cual se pueden transcribir
nuevos genomas de RNA viral y mRNA viral, a los que más tarde la maquinaria de la célula huésped traduce en proteínas virales. La inserción genómica
de tales moléculas de DNA “provirales” que se integran puede, según el sitio involucrado, ser mutágena, al inactivar un gen o desregular su expresión
(véase la figura 35–11).

EXISTEN VARIAS CLASES DIFERENTES DE RNA

Como ya se señaló, en todos los organismos procariotas y eucariotas existen cuatro clases principales de moléculas de RNA: mRNA, tRNA, rRNA y RNA
pequeños. Cada uno se diferencia de los demás por su abundancia, tamaño, función y estabilidad general.

RNA mensajero

Esta clase es la más heterogénea en abundancia, tamaño y estabilidad; por ejemplo, en la levadura de cerveza, los mRNA específicos están presentes
en 100/célula, en promedio, ≤ 0.1/mRNA/célula en una población genéticamente homogénea. Como se detalla en El RNA mensajero sufre
modificaciones amplias tanto en su interior como en las terminales 5′ y 3′, en el capítulo 36, y en La regulación de la estabilidad del RNA mensajero
proporciona otro mecanismo de control, en el capítulo 38, los mecanismos transcripcionales y postranscripcionales específicos contribuyen a este
amplio rango dinámico en el contenido de mRNA. En células de mamíferos, la abundancia específica de mRNA quizá varía en un rango de 104 veces.
Todos los miembros de esta clase de RNA funcionan como mensajeros que transmiten la información de un gen a la maquinaria de síntesis de
proteínas, donde cada mRNA sirve como plantilla en la que se polimeriza una secuencia específica de aminoácidos para formar una molécula de
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proteína específica, en este caso el producto génico final (figura 34–9).
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Figura 34–9.
en 100/célula, en promedio, ≤ 0.1/mRNA/célula en una población genéticamente homogénea. Como se detalla en El RNA mensajero sufre
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modificaciones amplias tanto en su interior como en las terminales 5′ y 3′, en el capítulo 36, y en La regulación Autonoma de Tamaulipas_123444
de la estabilidad del RNA mensajero UAT
proporciona otro mecanismo de control, en el capítulo 38, los mecanismos transcripcionales y postranscripcionales
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amplio rango dinámico en el contenido de mRNA. En células de mamíferos, la abundancia específica de mRNA quizá varía en un rango de 104 veces.
Todos los miembros de esta clase de RNA funcionan como mensajeros que transmiten la información de un gen a la maquinaria de síntesis de
proteínas, donde cada mRNA sirve como plantilla en la que se polimeriza una secuencia específica de aminoácidos para formar una molécula de
proteína específica, en este caso el producto génico final (figura 34–9).

Figura 34–9.

Se muestra la expresión de la información genética dentro del DNA bajo la forma de un transcrito de mRNA con polaridad de 5′ a 3′
y luego en una proteína con polaridad N a C. El DNA se transcribe en un mRNA, que a continuación traducen los ribosomas en una molécula de
proteína específica que exhibe polaridad N­terminal (N) a C­terminal (C).

Los mRNA eucariotas tienen características químicas únicas. El extremo 5′ del mRNA está “cubierto” por un 7­metilguanosina trifosfato, que está unido
a un 2′­O­metil­ribonucleósido adyacente en su 5′­hidroxilo a través de los tres fosfatos (figura 34–10). Las moléculas de mRNA contienen con
frecuencia N6­metiladenina interna y otros nucleótidos 2′­O­ribosa­metilados. La tapa está involucrada en el reconocimiento del mRNA por la
maquinaria de traducción y también ayuda a estabilizar el mRNA al prevenir el ataque nucleolítico de las 5′­exorribonucleasas. La maquinaria de
síntesis de proteínas comienza a traducir el mRNA en proteínas y lo hace corriente abajo del extremo 5′ terminal o cubierto. En el otro extremo de casi
todas las moléculas de mRNA eucariotas, el extremo 3′­hidroxilo tiene un polímero unido, que carece de una codificación genética, de residuos de
adenilato de 20 a 250 nucleótidos de longitud. La “cola” de poli(A) en el extremo 3′ de los mRNA mantiene la estabilidad intracelular del mRNA
específico al prevenir el ataque de las 3′­exorribonucleasas y también facilita la traducción (figura 37–7). Después de la transcripción, tanto la “tapa”
del mRNA como la “cola poli(A)” se agregan mediante enzimas no dirigidas por plantilla a las moléculas precursoras del mRNA (pre­mRNA). El mRNA
representa de 2 a 5% del RNA celular eucariota total.

Figura 34–10.

La estructura de caperuza unida al extremo terminal 5′ de la mayoría de las moléculas de RNA mensajero eucariota. Un trifosfato de 7­
metilguanosina (negro) se une al extremo 5′ del mRNA (rojo), que por lo general también contiene un nucleótido de 2′­O­metilpurina. Estas
modificaciones (la caperuza y el grupo metilo) se agregan después de que el mRNA se transcribe a partir del DNA. Cabe recordar que los fosfatos γ y β
del GTP agregados para formar la caperuza (negro en la figura) se pierden al agregar ésta, mientras que el fosfato γ del nucleótido iniciador (aquí un
residuo A; rojo en la figura) se pierde durante la adición de la caperuza.

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metilguanosina (negro) se une al extremo 5′ del mRNA (rojo), que por lo general también contiene un nucleótido de 2′­O­metilpurina. Estas
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modificaciones (la caperuza y el grupo metilo) se agregan después de que el mRNA se transcribe a partir del DNA. Cabe recordar que los fosfatos γ y β
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del GTP agregados para formar la caperuza (negro en la figura) se pierden al agregar ésta, mientras que el fosfato γ del nucleótido iniciador (aquí un
residuo A; rojo en la figura) se pierde durante la adición de la caperuza.

En las células de mamíferos, incluidas las células humanas, las moléculas de mRNA presentes en el citoplasma no son los productos de RNA que
acaban de sintetizarse a partir de la plantilla de DNA, sino que deben formarse mediante el procesamiento a partir del precursor o pre­mRNA antes de
ingresar al citoplasma. Por tanto, en los núcleos de las células de los mamíferos, los productos inmediatos de la transcripción de genes (transcritos
primarios) son muy heterogéneos y pueden ser de 10 a 50 veces más largos que las moléculas de mRNA maduras. Como se explica en Las porciones de
codificación (exones) de la mayoría de los genes que codifican el mRNA eucariota son interrumpidas por intrones, en el capítulo 36, las moléculas de
pre­mRNA se procesan para generar moléculas de mRNA, que luego ingresan al citoplasma para servir como plantillas para la síntesis de proteínas.

RNA de transferencia

Las moléculas de tRNA varían en longitud de 74 a 95 nucleótidos y, como muchos otros RNA, también se generan por el procesamiento nuclear de una
molécula precursora (véase Tanto los RNA ribosómicos como la mayoría de los RNA de transferencia se procesan a partir de precursores más grandes,
en el capítulo 36). Las moléculas de tRNA sirven como adaptadores para la traducción de la información en la secuencia de nucleótidos del mRNA en
aminoácidos específicos. Hay al menos 20 especies de moléculas de tRNA en cada célula, al menos una (y a menudo varias) correspondiente a cada
uno de los 20 aminoácidos necesarios para la síntesis de las proteínas. Aunque cada tRNA específico difiere de los demás en su secuencia de
nucleótidos, como clase, las moléculas de tRNA tienen muchas características en común. La estructura primaria, es decir, la secuencia de nucleótidos,
de todas las moléculas de tRNA permite el plegamiento extenso y la complementariedad intracatenaria para generar una estructura secundaria que
aparece en dos dimensiones como una hoja de trébol (figura 34–11).

Figura 34–11.

Estructura de un tRNA funcional maduro, fenilalanil­tRNA de levadura (tRNAFen) . Se muestran las estructuras primaria (1.a), secundaria
(2.a) y terciaria (3.a) (superior, inferior izquierda e inferior derecha, respectivamente) del tRNAFen. Los números debajo de la estructura primaria del
tRNAFen de 76 nucleótidos de longitud indican la numeración de los nucleótidos desde el extremo 5′ (+1) hasta el extremo 3′ (+76) de la molécula.
Observe que el nucleótido +1 contiene un residuo de fosfato 5′ (P), mientras que el nucleótido 3′ tiene un grupo hidroxilo 3′ libre (OH). Dentro de la
secuencia del tRNAFen, las bases subrayadas en negritas muestran una fuerte modificación en los nucleótidos que se muestran en la representación
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nucleótidos U16 y U17 se modifican a D16, D17; G37 a Y37; U39 y U55
a Ψ; y U54 a T54 (consulte el tema siguiente para obtener más detalles). Las líneas rectas entre las bases dentro de la estructura secundaria del tRNA
Estructura de un tRNA funcional maduro, fenilalanil­tRNA de levadura (tRNAFen) . Se muestran las estructuras
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(2.a) y terciaria (3.a) (superior, inferior izquierda e inferior derecha, respectivamente) del [Link]
Los números
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tRNAFen de 76 nucleótidos de longitud indican la numeración de los nucleótidos desde el extremo 5′ (+1) hasta el extremo 3′ (+76) de la molécula.
Observe que el nucleótido +1 contiene un residuo de fosfato 5′ (P), mientras que el nucleótido 3′ tiene un grupo hidroxilo 3′ libre (OH). Dentro de la
secuencia del tRNAFen, las bases subrayadas en negritas muestran una fuerte modificación en los nucleótidos que se muestran en la representación
estructural 2.a del tRNAFen. A menudo, esta estructura se denomina “hoja de trébol”. Algunos de estos nucleótidos tienen nombres de ribonucleótidos
no canónicos, como se representa en el modelo estructural 2o. Dentro del tRNAFen, los nucleótidos U16 y U17 se modifican a D16, D17; G37 a Y37; U39 y U55
a Ψ; y U54 a T54 (consulte el tema siguiente para obtener más detalles). Las líneas rectas entre las bases dentro de la estructura secundaria del tRNA
representan enlaces de hidrógeno formados entre las bases (A­U; G­C). Es importante tener presente que estas regiones de estructura secundaria se
forman con la misma polaridad de la cadena (es decir, 5′ a 3′ y 3′ a 5′) que las regiones de DNA con pares de bases. Las tres bases del asa anticodón se
muestran en rojo. En el caso de los tRNA cargados de aminoácidos, se esterifica un resto aminoacilo al extremo 3′­CCAOH (café; en este caso, el
aminoácido sería fenilalanina; aunque no se muestra). El tipo azul resalta los nucleótidos no tradicionales introducidos por modificación
postraduccional, abreviados de la siguiente manera: m2G, 2­metilguanosina; D, 5,6­dihidrouridina; m22G, N2­dimetilguanosina; Cm, O2′­metilcitidina;

Gm, O2′­metilguanosina; T, 5­metiluridina; Y, wybutosina; Ψ, seudouridina; m5C, 5­metilcitidina; m7G, 7­metilguanosina; m1A, 1­metiladenosina. En

esencia, todos los tRNA se pliegan en estructuras terciarias características similares (3.a), como se muestra abajo a la derecha. Las distintas porciones
de la molécula en configuraciones 2a. (inserto) y 3.a están codificadas por colores en esta imagen para mayor claridad. El tRNAFen fue el primer ácido
nucleico cuya estructura se determinó mediante cristalografía de rayos X. Estas estructuras de tRNA tridimensionales distintas se unen de manera
específica a sitios funcionales importantes tanto en las aminoacil­tRNA sintetasas como en los ribosomas durante la síntesis de proteínas (véase Unión
del aminoacil­tRNA al sitio A, en el capítulo 37). (Reproducida con autorización de Transfer RNA/Wikipedia Commons
[Link]

Todas las moléculas de tRNA contienen cuatro brazos o tallos principales de doble cadena, conectados por asas de una sola cadena llamados así por
su respectiva composición o función de nucleótidos. El brazo aceptor de aminoácidos termina en los nucleótidos CpCpAOH. Al igual que con la
“tapa” 5′ y la “cola poli(A)” 3′ del mRNA, estos tres nucleótidos (CCA) se agregan después de la transcripción, en este caso por una enzima
nucleotidiltransferasa específica. El aminoácido apropiado para cada tRNA se une o se “carga” en el grupo 3′­OH agregado postranscripcionalmente
de la fracción A del brazo aceptor mediante la acción de aminoacil­tRNA sintetasas específicas (figura 37–1). Los brazos D, TψC y adicionales ayudan
a definir un tRNA específico. Los tRNA componen alrededor de 20% del RNA celular total. Trabajos recientes demostraron que ciertas ribonucleasas
escinden específicamente muchos tRNA para generar subfragmentos únicos denominados RNA pequeños derivados de tRNA (tsRNA, tRNA­
derived small RNA). Se cree que estos tsRNA relativamente estables regulan tanto la transcripción como la traducción (véase Existen dos clases
principales de RNA, en el capítulo 36, Al igual que la transcripción, la síntesis de proteínas puede describirse en tres fases: iniciación, elongación y
terminación, en el capítulo 37, y La regulación de la estabilidad del RNA mensajero proporciona otro mecanismo de control, en el capítulo 38).

RNA ribosómico

Un ribosoma es una estructura de nucleoproteína citoplásmica que actúa como maquinaria para la síntesis de proteínas a partir de las plantillas de
mRNA. En los ribosomas, las moléculas de mRNA y tRNA interactúan para traducir la información transcrita del gen durante la síntesis del mRNA en una
proteína específica. Durante los periodos de síntesis proteínica activa, muchos ribosomas se pueden juntar con cualquier molécula de mRNA
individual para formar un conjunto denominado polisoma (véase la figura 37–7).
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Los componentes del ribosoma de los mamíferos, que tiene un peso molecular de alrededor de 4.2 × 106 y un coeficiente de velocidad de
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sedimentación de 80S (S = unidades Svedberg, un parámetro sensible al tamaño y forma molecular) se muestran en el cuadro 34–2. El ribosoma
de los mamíferos contiene dos subunidades principales de nucleoproteína: una más grande con un peso molecular de 2.8 × 106 (60S) y una subunidad
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Un ribosoma es una estructura de nucleoproteína citoplásmica que actúa como maquinaria para Access
la síntesis de
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mRNA. En los ribosomas, las moléculas de mRNA y tRNA interactúan para traducir la información transcrita del gen durante la síntesis del mRNA en una
proteína específica. Durante los periodos de síntesis proteínica activa, muchos ribosomas se pueden juntar con cualquier molécula de mRNA
individual para formar un conjunto denominado polisoma (véase la figura 37–7).

Los componentes del ribosoma de los mamíferos, que tiene un peso molecular de alrededor de 4.2 × 106 y un coeficiente de velocidad de
sedimentación de 80S (S = unidades Svedberg, un parámetro sensible al tamaño y forma molecular) se muestran en el cuadro 34–2. El ribosoma
de los mamíferos contiene dos subunidades principales de nucleoproteína: una más grande con un peso molecular de 2.8 × 106 (60S) y una subunidad
más pequeña con un peso molecular de 1.4 × 106 (40S). La subunidad 60S contiene un rRNA 5S, un rRNA 5.8S y un rRNA 28S; también hay más de 50
polipéptidos específicos. La subunidad 40S es más pequeña y contiene un solo rRNA 18S y 30 cadenas polipeptídicas distintas. Todas las moléculas de
rRNA, excepto el rRNA 5S, que se transcribe de forma independiente, se procesan a partir de una única molécula de RNA precursor 45S en el nucleolo
(véase Tanto los RNA ribosómicos como la mayoría de los RNA de transferencia se procesan a partir de precursores más grandes, en el capítulo 36).
Los rRNA presentan una alta metilación postranscripcional y se empaquetan en el nucleolo con las proteínas ribosómicas específicas. En el
citoplasma, los ribosomas permanecen bastante estables y son capaces de muchos ciclos de traducción. Las funciones exactas de las moléculas de
rRNA en el ribosoma, más allá de sus funciones de andamiaje, aún no se comprenden por completo. Sin embargo, está claro que los rRNA son
necesarios para el ensamblaje de los ribosomas y también juegan un papel clave en la unión del mRNA a los ribosomas y en la traducción del mRNA.
Estudios recientes indican que el componente de rRNA grande realiza la actividad de peptidiltransferasa y, por tanto, es una ribozima. Los rRNA (28S +
18S) representan alrededor de 70% del RNA celular total.

Cuadro 34–2.
Componentes de los ribosomas de mamíferos.

Proteína RNA
Componente Masa (MW)
Número Masa Tamaño Masa Bases

Subunidad 40S 1.4 × 106 33 7 × 105 18S 7 × 105 1900

Subunidad 60S 2.8 × 106 50 1 × 106 5S 3.5 × 104 120

5.8S 4.5 × 104 160

28S 1.6 × 106 4700

Nota: Las subunidades ribosómicas se definen según su velocidad de sedimentación en unidades Svedberg (S) (40S o 60S). Se enumeran el número de proteínas
únicas y su masa total (MW), así comó los componentes de RNA de cada subunidad en tamaño (unidades Svedberg), masa y número de bases.

RNA pequeño

En las células eucariotas se encuentra un gran número de especies pequeñas de RNA discretas y muy conservadas; algunas son bastante estables. La
mayoría de estas moléculas forma complejos con proteínas para dar origen a ribonucleoproteínas y se distribuyen en el núcleo, el citoplasma o
ambos. Varían en tamaño de 20 a 1000 nucleótidos y están presentes en 100 000 a 1 000 000 de copias por célula, lo que en conjunto representa menos
o hasta 5% del RNA celular.

RNA nucleares pequeños

Los snRNA, un subconjunto de los RNA nucleares pequeños (cuadro 34–1), participan de manera significativa en el procesamiento de rRNA y mRNA y
en la regulación génica. De los varios snRNA, U1, U2, U4, U5 y U6 intervienen en el empalme de mRNA, un proceso nuclear mediante el cual se eliminan
intrones de moléculas precursoras de mRNA para generar mRNA citoplásmicos traducibles y funcionales (véase Existen dos clases principales de RNA,
en el capítulo 36). El snRNA U7 participa en la producción de los extremos 3′ correctos del mRNA de la histona, que carece de una cola poli(A). El 7SK
RNA se vincula con varias proteínas para formar un complejo de ribonucleoproteína, denominado P­TEFb, que modula la elongación de la
transcripción del gen mRNA por la RNA polimerasa II (véase El RNA se sintetiza a partir de una plantilla de DNA mediante la RNA polimerasa, en el
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capítulo 36).
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RNA reguladores no codificantes grandes y pequeños: miRNA, siRNA, lncRNA y circRNA
Los snRNA, un subconjunto de los RNA nucleares pequeños (cuadro 34–1), participan de manera significativa en el procesamiento de rRNA y mRNA y
Universidad
en la regulación génica. De los varios snRNA, U1, U2, U4, U5 y U6 intervienen en el empalme de mRNA, un proceso Autonoma de Tamaulipas_123444
nuclear mediante UAT
el cual se eliminan
intrones de moléculas precursoras de mRNA para generar mRNA citoplásmicos traducibles y funcionales (véase Existen dos clases principales de RNA,
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en el capítulo 36). El snRNA U7 participa en la producción de los extremos 3′ correctos del mRNA de la histona, que carece de una cola poli(A). El 7SK
RNA se vincula con varias proteínas para formar un complejo de ribonucleoproteína, denominado P­TEFb, que modula la elongación de la
transcripción del gen mRNA por la RNA polimerasa II (véase El RNA se sintetiza a partir de una plantilla de DNA mediante la RNA polimerasa, en el
capítulo 36).

RNA reguladores no codificantes grandes y pequeños: miRNA, siRNA, lncRNA y circRNA

Uno de los descubrimientos más emocionantes e inesperados en la última década de la biología reguladora eucariota ha sido la identificación y
caracterización de RNA reguladores que no codifican proteínas (ncRNA, nonprotein coding RNA). Los ncRNA existen en dos clases generales de
tamaño, grandes (50 a 1000 nt) y pequeños (20 a 22 nt). Se han descrito ncRNA reguladores en la mayoría de los eucariotas (véase Los ncRNA modulan
la expresión génica al alterar la función del mRNA, en el capítulo 38).

De manera habitual, los ncRNA pequeños denominados micro­RNA (miRNA) y RNA silenciadores (siRNA, silencing RNA) inhiben la
expresión génica a nivel de la producción de proteínas específicas al dirigirse a los mRNA a través de uno de varios mecanismos distintos. Los miRNA
se generan mediante procesamiento nucleolítico específico de los productos de distintos genes/unidades de transcripción (véase la figura 36–17). Los
precursores de miRNA, que están cubiertos en 5′ y poliadenilados en 3′, por lo general varían en tamaño entre 500 y 1000 nucleótidos.

Por el contrario, los siRNA se generan mediante el procesamiento nucleolítico específico de dsRNA grandes que se producen a partir de otros RNA
endógenos o dsRNA introducidos en la célula, por ejemplo, por virus de RNA. Tanto los siRNA como los miRNA se hibridan mediante la
formación de hibridación RNA­RNA con sus mRNA objetivo (véase la figura 38–19). Hasta la fecha se han descrito cientos de miRNA y siRNA
distintos en los humanos; las estimaciones sugieren que es probable que haya miles de genes humanos que codifican miRNA. Dada su exquisita
especificidad genética, tanto los miRNA como los siRNA representan nuevos e interesantes agentes potenciales para el desarrollo de fármacos.
En el laboratorio, los siRNA se usan con frecuencia para disminuir o “eliminar” niveles específicos de proteínas (a través de la degradación del mRNA
dirigida por homología de siRNA) y, por tanto, sirven como una alternativa de extrema y poderosa utilidad a la tecnología de desactivación de genes
(véase Enzimas de restricción, endonucleasas, recombinasas y DNA ligasa se utilizan para diseñar y preparar moléculas de DNA quiméricas, en el
capítulo 39). De hecho, están en proceso varios ensayos clínicos terapéuticos basados en siRNA para probar la eficacia de estas nuevas moléculas
como fármacos para el tratamiento de enfermedades humanas.

Otras interesantes observaciones recientes en el ámbito del RNA son la identificación y caracterización de dos clases de RNA no codificantes más
grandes, los RNA circulares (circRNA, circular RNA) y los RNA largos no codificantes (lncRNA, long noncoding RNA). En tiempos recientes se han
descubierto y caracterizado muchos circRNA. Los circRNA parecen ser productos de reacciones de tipo empalme de RNA a partir de una amplia gama
de RNA precursores, tanto precursores de mRNA como precursores de lncRNA que no codifican proteínas (el tema siguiente presenta más información
sobre los lncRNA). Aunque no es una clase abundante de moléculas de RNA en la mayoría de las células, los circRNA se han detectado en todos los
eucariotas probados y parecen ser más abundantes en los metazoos. Si bien las funciones de los circRNA aún se están dilucidando, parecen ser más
abundantes en las células del sistema nervioso. Al igual que los lncRNA, es probable que estas moléculas desempeñen funciones importantes en la
biología celular al regular la expresión génica en múltiples niveles. Los lncRNA, como su nombre lo indica, no codifican proteínas y varían en tamaño
desde ~ 300 a 1000 de nucleótidos de longitud. De manera habitual, estos RNA se transcriben a partir de las grandes regiones de los genomas
eucariotas que no codifican proteínas (es decir, los genes que codifican el mRNA). De hecho, los análisis de transcriptomas indican que más de 90%
de todo el DNA genómico eucariota puede transcribirse en algún nivel. Los ncRNA constituyen una parte significativa de esta transcripción. Los
ncRNA desempeñan muchas funciones, que van desde contribuir a los aspectos estructurales de la cromatina hasta la regulación de la transcripción
del gen mRNA por la RNA polimerasa II. El trabajo futuro caracterizará aún más esta importante clase recién descubierta de moléculas de RNA.

Como hecho curioso, las bacterias también contienen RNA reguladores pequeños y heterogéneos denominados sRNA. Los sRNA bacterianos varían en
tamaño de 50 a 500 nucleótidos y, al igual que los mi/si/lncRNA eucariotas, controlan la expresión/actividad de una gran variedad de genes distintos. A
menudo, los sRNA reprimen, pero a veces activan la síntesis de proteínas al unirse a un mRNA específico.

ÁCIDOS NUCLEICOS DIGERIDOS POR NUCLEASAS ESPECÍFICAS

Las enzimas capaces de degradar los ácidos nucleicos cuentan con un reconocimiento de muchos años; estas nucleasas se pueden clasificar de varias
maneras. Las que muestran especificidad por el DNA se denominan desoxirribonucleasas. Las nucleasas que hidrolizan de manera específica el
RNA son las ribonucleasas. Algunas nucleasas degradan el DNA y el RNA. Dentro de estas dos clases, hay enzimas capaces de escindir enlaces
fosfodiéster internos para producir terminales 3′­hidroxilo y 5′­fosforilo, o terminales 5′­hidroxilo y 3′­fosforilo; éstas se conocen como
endonucleasas. Algunas pueden hidrolizar ambas cadenas de una molécula de doble cadena, mientras que otras sólo escinden cadenas
individuales de ácidos nucleicos. Algunas nucleasas pueden hidrolizar sólo cadenas simples no apareadas, mientras que para otras es posible
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escinden ambas cadenas de DNA, casi siempre DNA dentro del elemento de secuencia de unión/reconocimiento. La segunda clase de enzimas, que
Las enzimas capaces de degradar los ácidos nucleicos cuentan con un reconocimiento de muchos años; estas nucleasas se pueden clasificar de varias
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RNA son las ribonucleasas. Algunas nucleasas degradan el DNA y el RNA. Dentro de estas dos clases, hay enzimas capaces de escindir enlaces
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fosfodiéster internos para producir terminales 3′­hidroxilo y 5′­fosforilo, o terminales 5′­hidroxilo y 3′­fosforilo; éstas se conocen como
endonucleasas. Algunas pueden hidrolizar ambas cadenas de una molécula de doble cadena, mientras que otras sólo escinden cadenas
individuales de ácidos nucleicos. Algunas nucleasas pueden hidrolizar sólo cadenas simples no apareadas, mientras que para otras es posible
hidrolizar cadenas simples que participan en la formación de una molécula de doble cadena. Existen clases de endonucleasas que reconocen
secuencias específicas en el DNA. Una clase de estas enzimas que escinden el DNA, las endonucleasas de restricción, también denominadas
enzimas de restricción, lo hacen de forma directa al unirse a pares de bases de DNA específicos (por lo general) contiguos (típicamente 4, 5, 6 u 8 pb) y
escinden ambas cadenas de DNA, casi siempre DNA dentro del elemento de secuencia de unión/reconocimiento. La segunda clase de enzimas, que
son complejos de ribonucleoproteínas, utiliza un “RNA guía” de una secuencia de nucleótidos específica que se dirige a una nucleasa para escindir
distintas secuencias de DNA o RNA. Éstas son la familia de enzimas CRISPR­Cas. Ambas clases de enzimas que escinden el DNA se describen con
mayor detalle en Enzimas de restricción, endonucleasas, recombinasas y DNA ligasa se utilizan para diseñar y preparar moléculas de DNA quiméricas,
en el capítulo 39.

Algunas nucleasas son capaces de hidrolizar un nucleótido sólo cuando está presente en la terminal de una molécula; éstas se denominan
exonucleasas. Las exonucleasas sólo actúan en una dirección (3′ → 5′ o 5′ → 3′). En las bacterias, una exonucleasa 3′ → 5′ es una parte integral de la
maquinaria de replicación del DNA y sirve para editar, o corregir, el desoxinucleótido que acaba de agregarse en busca de errores de emparejamiento
de bases.

Además de sus funciones en el metabolismo de los ácidos nucleicos en las células vivas, las nucleasas descritas aquí, junto con una amplia variedad de
otras enzimas que sintetizan y modifican los ácidos nucleicos, así como las técnicas de secuenciación y clonación de ácidos nucleicos, representan las
herramientas esenciales de la genética molecular moderna y de la medicina molecular (véase La clonación amplifica el DNA, en el capítulo 39).

RESUMEN
El DNA consta de cuatro bases (A, G, C y T) que se mantienen en una disposición lineal mediante enlaces fosfodiéster a través de las posiciones 3′ y
5′ de los residuos de desoxirribosa adyacentes.

El DNA se organiza en dos cadenas mediante el emparejamiento de bases A con T y G con C en cadenas complementarias. Estas cadenas forman
una doble hélice alrededor de un eje central.

Los ~3 × 109 pb de DNA en los humanos están organizados en el complemento haploide de 23 cromosomas. La secuencia exacta de estos 3000
millones de nucleótidos define la singularidad de cada individuo.

El DNA proporciona una plantilla, tanto para su propia replicación y, por tanto, para el mantenimiento del genotipo, como para la transcripción de
cerca de 25 000 genes humanos que codifican proteínas, así como una gran variedad de ncRNA reguladores que no codifican proteínas.

El RNA existe en varias estructuras de nucleoproteínas celulares diferentes, la mayoría de las cuales se involucran de forma directa o indirecta en
la síntesis de proteínas o su regulación. En el RNA, la matriz lineal de nucleótidos consta de A, G, C y U, y el residuo de azúcar es la ribosa.

Las principales formas de RNA incluyen mRNA, rRNA, tRNA, snRNA y ncRNA reguladores. Ciertas moléculas de RNA actúan como catalizadores
(ribozimas).

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