Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
BASES MOLECULARES DE LA HERENCIA.
INTRODUCCIÓN: La correcta expresión del material genético contenido en la célula de los
seres vivos hace posible el adecuado desarrollo de todas las funciones celulares y el
mantenimiento de la vida.
El material genético controla todas las características estructurales y metabólicas de los
seres vivos, transmitiendo las mismas de una generación a otra.
Hay un cierto número de biomoléculas que se encuentran dentro de las células y son las
encargadas de desarrollar un papel fundamental en la transmisión del material genético. La
información genética se halla contenida y codificada dentro de una macromolécula de vital
importancia: el ADN ácido desoxirribonucleico
Casi todos los organismos están constituidos por ADN, un polinucleótido que deriva
de los ácidos nucleicos.
DEFINICIONES GENERALES:
Ácido nucleico: Es un polímero formado por nucleótidos.
¿Qué es un polímero?, es una sustancia ¿Qué es un nucleótido?, son moléculas
compuesta por grandes moléculas. formadas por una base nitrogenada, una
aldopentosa y un grupo fosfato.
Nucleótidos. Estructura y características generales:
Los nucleótidos participan en multitud de funciones celulares:
o Colaboran en funciones de óxido-reducción,
o Participan en la transferencia energética (ATP)
o Están presentes en el envío de señales intercelulares: actúan como señales químicas
celulares en respuesta a las hormonas y otros estímulos extracelulares (AMPc)
o Forman parte de las reacciones de biosíntesis: son componentes extracelulares de una
serie de coenzimas e intermediarios metabólicos (NAD+, FAD+, NADP+)
o Son los constituyentes del ADN y ARN
Composición química: los nucleótidos se hallan constituidos por tres componentes
característicos:
o Base nitrogenada: compuesto orgánico cíclico, que
incluye en su constitución dos o más átomos de
nitrógeno.
o Azúcar simple: es una pentosa, la cual es un
monosacárido de cinco carbonos, que a su vez presenta
un grupo funcional aldehído aldopentosa.
Laura A. Ferri Página 1
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
o Un grupo fosfato: el cual proviene de la combinación con ácido fosfórico.
a) Base nitrogenada: son moléculas planas, de anillo aromático, heterocíclicas. Las bases que
componen a los ácidos nucleicos son aquellas que derivan de la purina y la pirimidina.
- Purina: compuesto orgánico, cuya estructura posee dos anillos
fusionados; uno de seis átomos y otro de cinco.
- Pirimidina: compuesto orgánico derivado de las aminas (grupo funcional). Su
estructura es similar al anillo de benceno.
Existen seis bases nitrogenadas relevantes:
Bases púricas: adenina, guanina.
Bases pirimídicas: timina, citosina,
uracilo.
Adenina, citosina y guanina aparecen en
ADN/ARN
Timina solo aparece en ADN.
Uracilo solo aparece en ARN.
b) Pentosa: son monosacáridos (azúcar o glúcido simple) formados por una cadena de cinco
carbonos. Además, en su estructura podemos observar un grupo –OH, un grupo cetónico
(cetopentosas) o un grupo aldehído (aldopentosas).
Dentro de las aldopentosas tenemos:
Ribosa: su forma cíclica (β-D-ribofuranosa) es la que constituye al ARN. Posee un grupo
–OH en su carbono 2’. Mediante un proceso denominado “ruta de la pentosa-fosfato”,
que se da en el citosol, se obtiene la ribosa y la desoxirribosa.
Desoxirribosa: es la aldopentosa que constituye al ADN. Al perder oxígeno en el grupo –
OH de su carbono 2’, solo permanece un átomo de hidrógeno.
Laura A. Ferri Página 2
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
El compuesto resultante de la unión de una base nitrogenada y una pentosa se denomina
nucleósido.
Forma de enlace de un nucleósido: las bases nitrogenadas se unen al carbono prima uno (C’ 1
ó 1’) de una aldopentosa, mediante un enlace N-β-glicosídico, es decir con el carbono 1 de la
pentosa en configuración β (configuración β: el grupo –OH de la pentosa se orienta hacia
arriba).
Las bases púricas se unen a través del N-9
de su cadena.
Las bases pirimídicas se unen a través del
N-1 de su cadena.
Se denomina “carbono prima” a los carbonos de
la cadena carbonada de la pentosa, para
diferenciarlos de los carbonos que componen la
cadena carbonada de las bases nitrogenadas.
c) Ácido fosfórico: la esterificación del grupo –OH del C’5 de la aldopentosa de un nucleósido
con ácido fosfórico forma un nucleótido.
Laura A. Ferri Página 3
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
Como se mencionó anteriormente, el grupo fosfato se une a la aldopentosa a través
del carbono 5 prima (C’5) de ésta última.
La unión entre varios nucleótidos forma al ÁCIDO NUCLÉICO.
ÁCIDO NUCLÉICO. ESTRUCTURA QUÍMICA:
Los nucleótidos se unen entre sí
mediante esterificación entre el –OH que se
halla en el grupo fosfato de un nucleótido,
(dicho fosfato ubicado en el C’5) y el grupo
–OH del C’3 de la aldopentosa del nucleótido
adyacente, con pérdida de agua. A esto se lo
denomina puentes de grupos fosfato. Se da
entre ambos grupos –OH una unión
fosfodiéster.
Todos los enlaces fosfodiéster tienen la
misma orientación a lo largo de la cadena, con
Laura A. Ferri Página 4
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
lo cual cada cadena lineal de ácido nucleico tiene una polaridad específica y extremos 5’ y 3’
diferenciados. Así como ocurría en los aminoácidos, el residuo terminal cuyo C’5 no se halla
unido a otro nucleótido se denomina extremo 5’, mientras que el residuo C’3 es el extremo 3’.
Por convención, la secuencia de residuos se escribe desde el extremo 5’ al extremo 3’ (de
izquierda a derecha) ORIENTACIÓN DE 5’ A 3’
- Ácidos nucleicos de menos de 50 nucleótidos: oligonucleótidos.
- Ácidos nucleicos de más de 50 nucleótidos: polinucleótidos.
Según la pentosa integrante de la molécula y las bases nitrogenadas que lo componen, se
distinguen dos tipos de ácidos nucleicos:
ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO ADN
ÁCIDO RIBONUCLEICO ARN
ADN: ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO:
Generalidades:
El ácido desoxirribonucleico se encuentra casi en su totalidad formando parte del núcleo
de las células eucariotas; más precisamente, en el material que forma la cromatina. Hay
también una pequeña cantidad de ADN en el ribosoma y en el cloroplasto.
El ADN es una molécula lineal de gran longitud. En la célula se encuentra densamente
empaquetado.
COMPOSICIÓN QUÍMICA: GRUPO FOSFATO + DESOXIRRIBOSA + BASE NITROGENADA
Bases nitrogenadas que componen los nucleótidos del ADN: adenina, timina, citosina,
guanina.
Nucleótidos que forman el ADN:
- Con base ADENINA: DESOXIADENOSINA 5’
MONOFOSFATO (dAMP)
- Con base TIMINA: DESOXIGUANOSINA 5’
MONOFOSFATO (dGMP)
- Con base CITOSINA: DESOXICITIDINA 5’
MONOFOSFATO (dCMP)
- Con base TIMINA: DESOXITIMIDINA 5’
MONOFOSFATO (dTMP)
Laura A. Ferri Página 5
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
ESTRUCUTRA TRIDIMENSIONAL: El ADN consiste en
dos cadenas de polinucleótidos enfrentadas entre sí,
enrolladas sobre un mismo eje conformando una doble
hélice. Las dos cadenas son anti-paralelas: el extremo 3’
de una cadena se enfrenta con el extremo 5’ de la otra.
Cada cadena forma una hélice dextrógira (giro de izquierda
a derecha, en sentido horario).
En cada cadena de ADN la aldopentosa junto con el
grupo fosfato (de naturaleza hidrofílica) se sitúan en el
exterior, en contacto con el agua; mientras que las bases
nitrogenadas (poco polares e hidrofóbicas) ocupan el
centro de la hélice, en dirección perpendicular al eje
central. Esto minimiza las repulsiones entre los grupos
fosfato. La superficie de la hélice contiene dos hendiduras
o surcos de ancho desigual, una menor y otra mayor.
La base nitrogenada de una hebra se une a la base
de la hebra opuesta mediante puentes de hidrógeno,
conformando un par de bases. La base adenina se
conjuga con timina, mientras que la guanina conjuga con la
citosina. A esto se lo denomina complementariedad de
bases: A-T/C-G. Entre G y C se pueden formar tres
enlaces de hidrógeno, mientras que solamente se pueden
establecer dos puentes de hidrógeno entre A y T.
La doble hélice es una estructura muy estable
gracias a los enlaces de hidrógeno entre las bases. Estas
fuerzas resultan significativas al multiplicarse a lo largo de
la molécula, constituida por un enorme número de pares
de bases. Otras fuerzas que contribuyen al
mantenimiento de la doble hélice son las interacciones
hidrofóbicas y las fuerzas de van der Waals en los pares
de bases apilados en la molécula.
Existe una relación cuantitativa de los nucleótidos que
forma la doble hélice de ADN, denominada “ley de
Chargaff”. Establece que El número total de bases
púricas es igual al número total de bases pirimídicas
la cantidad de adenina más timina y es igual a la
cantidad de guanina más citosina:
A+T = G+C
Laura A. Ferri Página 6
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
Esta regla es sólo aplicable a las moléculas de ADN, ya que el ARN posee una hélice simple;
por lo que no se da conjugación de bases.
ARN: ÁCIDO RIBONUCLEICO:
DEFINICIÓN: Es un polinucleótido encargado de transportar el mensaje genético necesario
para la síntesis de proteínas, desde el núcleo celular al citoplasma.
Características generales: Si bien presenta ciertas características similares con el ADN, la
mayor parte de su estructura química, como así también su función dentro del organismo son
muy diferentes…
ADN ARN
Estructura Formado por: Formado por:
Bases nitrogenadas: Bases nitrogenadas:
adenina, citosina, adenina, citosina,
guanina, timina. guanina, uracilo.
Aldopentosa: Aldopentosa: ribosa.
desoxirribosa. Ácido fosfórico
Ácido fosfórico
- Estructura tridimensional:
- Estructura tridimensional: simple hebra
doble hélice.
Función Contiene la información Participa en el proceso de
genética. síntesis de proteínas.
OTROS - El número de bases Como posee una sola
púricas es igual al número hebra, no se cumple la regla
de bases pirimídicas. de Chargaff con respecto a
las bases púricas y
- Hay un solo tipo de ADN pirimídicas.
- La gran mayoría se - Hay varios tipos de ARN.
localiza en el núcleo de las
células, hay una pequeña - El ARN se localiza tanto en
cantidad en ribosoma y el núcleo como en el
cloroplasto. citoplasma celular,
especialmente en el
ribosoma.
TIPOS DE ARN EN EL ORGANISMO: En la célula existen cuatro tipos principales de ácido
ribonucleico:
o ARN MENSAJERO (ARNm): es el menos abundante, representando aproximadamente
entre el 5-10% total de ARN en la célula. Es una secuencia complementaria al mensaje
contenido en un segmento específico de ADN. Esto significa que el ARNm tiene como
función transmitir la información genética que se encuentra codificada en el ADN hacia el
sistema de síntesis de proteínas del citoplasma. El ARNm sirve como guía para el correcto
orden de la secuencia de ensamble de los aminoácidos que conforman una proteína; por lo
que se lo considera como un molde de la síntesis proteica.
Laura A. Ferri Página 7
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
El ARNm se forma en el núcleo de la célula a partir de un ARN precursor, el ARN
heterogéneo nuclear o transcripto primario (ARNhn). El ARNhn se localiza únicamente
en el núcleo y se caracteriza por tener tanto exones como así también intrones (ver
tema “Gen”). En la síntesis de ARNm, el ARNhn es sometido a un proceso denominado
splicing (splice es empalmar), donde las cadenas precursoras de ARN son seccionadas
en trozos, algunos de los cuales vuelven a unirse conformando las hebras de ARNm.
Aproximadamente el 20% del ARNhn es utilizado para formar ARNm, mientras que el resto
es degradado. El producto final es una hebra de ARN de menor longitud que su precursora.
El ARNm procesado final es modificado en sus extremos. Al extremo 5’ terminal se le
une 7-metil-guanosina trifosfato, formando un “capuchón”. Este nucleósido sirve como
“marcador” para el reconocimiento del ARNm por parte del sistema de síntesis de
proteínas; a la vez que contribuye a la estabilidad de la molécula, ya que protege el
extremo 5’ terminal de la acción de enzimas hidrolíticas. El extremo 3’ terminal fija un
polímero constituido por 100 a 250 de AMP (ácido adenílico), denominado poli-A. Esta
“cola” de poli-A le otorga al ARNm estabilidad.
o ARN RIBOSOMAL (ARNr): Es la especie más abundante, constituyendo aproximadamente
el 80% del ARN contenido en la célula. Es el núcleo protético de nucleoproteínas
componentes de ribosomas. Más del 55% de la masa del ribosoma corresponde de ARNr;
el resto, a proteínas. Para separar los componentes de los ribosomas se utilizó una técnica
de sedimentación. Así, se descubrió que el ARNr posee un coeficiente de sedimentación
de 80S (Sverdberg).
Los ribosomas de organismos eucariotas se hallan compuestos por dos tipos de ARNm:
uno mayor, integrado por 3 moléculas de ARN (5S, 5,8S, 28S) y 45 proteínas diferentes; y
una menor, compuesto por una molécula de ARN (18S) y unas 30 proteínas.
Las moléculas de ARNr presentan plegamientos definidos y numerosos segmentos en
doble hélice. El ARNr de cada partícula cumple un papel fundamental desde el punto de
vista estructural como así también funcional en el ribosoma.
o ARN DE TRANSFERENCIA (ARNt): es una de las moléculas de ARN más pequeñas; su
cadena consta de alrededor de 75 nucleótidos. El ARNt participa en la síntesis de
proteínas, transportando aminoácidos libres del citosol hasta el lugar de ensamble. Actúa
como molécula adaptadora, que asegura la ubicación de cada aminoácido en el sitio
Laura A. Ferri Página 8
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
correspondiente. En cada célula existen distintas especies de ARNt, específicos para cada
uno de los 20 aminoácidos conformadores de proteína.
La molécula de ARNt puede dibujarse como una hoja de trébol. La cadena
polinucleotídica posee segmentos complementarios que se aparean anti-paralelamente.
Aproximadamente la mitad de los residuos constituyentes del ARNt están enfrentados en
cuatro zonas de doble hélice. La estructura se mantiene gracias a la formación de enlaces
de puentes de hidrógeno intracatenarios; por lo que las bases nitrogenadas se
complementan en A-U/C-G, similar pero diferente al ADN.
Las porciones de la molécula unidas por puentes de hidrógeno se denominan “tallos”.
También se observan extremos desplegados hacia afuera de la cadena; son los lóbulos o
“brazos” de la molécula:
o Brazo anticodón: contiene al grupo anticodón, el cual se halla compuesto por tres
bases nitrogenadas. Es el responsable de la especificidad del aminoácido y posee
la función de adaptador.
o Brazo TΨC: contiene ribotimina (T) y pseudouridina (Ψ).
o Brazo D: dihidrouridina. Tanto el brazo D como el brazo TΨC contribuyen al
plegamiento de las moléculas de ARNt.
o Brazo o sitio de unión del aminoácido : posee un residuo guanilato (pG) en el
extremo 5’ y una secuencia de tres bases CCA en el extremo 3’ (todos los ARNt
poseen dicha secuencia en 3’). El aminoácido se une a este extremo por enlace
tipo éster entre su grupo carboxilo y el grupo –OH del carbono 3’ de la ribosa de la
última adenosina. Debido a esta función de fijación, este extremo se denomina
brazo aceptor.
o Brazo adicional: su longitud varía según el tipo de ARNt.
Laura A. Ferri Página 9
Química Biológica (Crecimiento y Desarrollo).
o OTROS:
ARN NUCLEAR PEQUEÑO (ARNnp): se encuentra en el núcleo de las células
eucariotas. Está conformado por entre 100 a 250 nucleótidos. En la célula se
acompleja con proteínas para formar las ribonucleoproteínas nucleares pequeñas
(snRNP), las cuales son ricas en uracilo (por lo que se las denomina con la letra U).
Su función es contribuir al procesamiento del ARNhn que se transcribe en el
núcleo partiendo del ADN para formar ARNm. Este proceso es el denominado
splicing. Luego el ARNm es exportado fuera del núcleo al citoplasma
ARN INTERFERENTES PEQUEÑOS (siRNA) Y MICRO ARN (miRNA): presentes
en las células eucariotas, son los responsables del “apagado” de la expresión
genética; mediante un proceso llamado interferencia por ARN.
La interferencia por ARN es un mecanismo preciso por el cual las células
eucariotas limitan la invasión de genes extraños (virus y transposones) y silencian la
expresión de los genes propios.
Ambos poseen una longitud entre 21 y 22 nucleótidos. Si bien los siRNA surgen
del corte de moléculas de ARN, transposones de ARN y virus de ARN; los miRNA
habitualmente se escinden de moléculas de ARN transcriptas de secuencias que
son diferentes de las de otros genes.
Los siRNa y los miRNA particioan en una variedad de procesos, entre ellos la
degradación del ARNm, inhibición de la traducción, metilación del ADN y el
remodelamiento de la cromatina.
El ARN es sintetizado a partir de una molécula de ADN a través de un proceso denominado
TRANSCRIPCIÓN.
Las proteínas son sintetizadas gracias a la TRADUCCIÓN del ARN.
El ADN se duplica en el proceso de mitosis celular gracias a la REPLICACIÓN.
Laura A. Ferri Página 10