Aguilera Rodríguez Cesar Eduardo

Compendio. Proteínas, membranas biológicas, metabolismo.

Propiedades de las proteínas. Estructura y función.

Aminoácidos.

Clasificación por su cadena lateral:

● No polares.
● Polares sin carga a pH fisiológico.
● Polares con carga negativa o positiva a pH fisiológico.

Masa molar promedio, solubles en disolventes polares, punto de fusión (forma

cristalizada) 250°C aproximadamente, los que tienen cadena lateral aromática
absorben luz UV (280 nm), propiedades ácido - base, zwitteriónicos en disolución
acuosa.

Niveles de estructuración.

1. Primaria: cadena lineal de aminoácidos con amino y carboxilo terminales,

secuencia específica, enlaces peptídicos.
2. Secundaria: plegamientos locales entre residuos de aminoácidos debido a
puentes de H entre el O del carbonilo y el H del amino. Hélice alfa,
lámina/hoja beta plegada y “vueltas o giros”.
a. Hélice alfa: cadena con forma helicoidal, enrollada hacia la derecha,
cadenas laterales hacia afuera, puentes de hidrógeno con periodicidad
entre los grupos amino y carbonilo.
 b. Hoja beta/lámina beta/beta plisada: estructura planar, con puentes de
hidrógeno entre el grupo amino y carbonilo de dos aminoácidos
diferentes, que pueden ser paralelos o antiparalelos. Las cadenas
laterales se orientan hacia afuera y hacia adentro.}
c. Vueltas o giros: estructuras pequeñas, de 3 o 4 aminoácidos,
favorecidas por la prolina y glicina, orientan la cadena hacia el interior
de la misma, por lo que se encuentran en la superficie de las proteínas
comúnmente. Dan compacticidad a la cadena.
3. Estructura terciaria: Formación de la estructura nativa (actividad biológica) de
las proteínas debido al plegamiento espacial general de una cadena
polipeptídica, dado por interacciones débiles entre las cadenas laterales de
los aminoácidos que forman la secuencia específica del polipéptido
(interacciones hidrofóbicas, electrostáticas, puentes de hidrógeno) y enlaces
disulfuro. Es estable y dinámica, con grupos polares al exterior y no polares al
interior. Es la forma más compacta de la proteína. Globulares o fibrosas.
4. Estructura cuaternaria: combinación de dos o más cadenas polipeptídicas
para formar una proteína con función biológica. Subunidades o monómeros
que forman di, tri, tetrámeros, etc. estabilizados por interacciones débiles y
enlaces disulfuro. Pueden ser globulares o fibrosas según su acomodo.
Pueden ser homooligómeros o heterooligómeros según la igualdad o
diferencia entre las cadenas.

Desnaturalización.

Pérdida del estado nativo de la proteína, y por lo tanto de su actividad biológica y

estabilidad termodinámica, además de su estructura cuaternaria, terciaria y
secundaria. Debido a agentes desnaturalizantes como lo son: pH, disolventes,
detergentes, fuerza iónica alta, agentes reductores del grupo disulfuro y la
temperatura.

Función de proteínas.

Función estructural. Proteínas fibrosas.

● Gran fuerza de tensión, estructura secundaria en su mayoría, moléculas

largas.
○ Colágeno: Su estructura cuaternaria (o secundaria única) es una triple
hélice dextrógira llamada tropocolágeno, formada por hélices levógiras
de cadenas alfa (estructura secundaria), formadas a su vez por
prolina, hidroxiprolina y glicina. La segunda estabiliza la forma
helicoidal, y la tercera favorece al denso empaquetamiento.
○ Queratina, fibroína, elastina.

Función de unión a ligandos. Mioglobina y hemoglobina.

 ● Mioglobina: Se encuentra en células musculares, grupo prostético (coenzima)
“hemo” que es un tetrapirrol con un átomo de hierro que une al oxígeno.
● Hemoglobina: en eritrocitos, con cuatro subunidades alfa y beta, cada una
con un grupo hemo. Cooperatividad positiva gracias a un cambio
conformacional alostérico que conecta los cuatro grupos hemo.

Función catalítica. Enzimas.

● Proteínas con función catalítica específica, regulables, algunas poseen

cofactores (coenzimas o iones metálicos) que a su vez pueden ser solubles o
grupos prostéticos.
● Sitio activo: hendidura semisuperficial de la proteína, con tamaño pequeño
relativo al de la proteína completa, con los grupos reactivos y cofactores, que
unen al sustrato, al que puede orientar, de manera específica para cada
enzima. La unión con el sustrato, es en general, no covalente y reversible.
● Temperatura, fuerza iónica, pH y solventes afectan a la actividad enzimática.
● Las enzimas facilitan la formación del estado de transición, lo que es lo
mismo que disminuir la energía de activación de la reacción.
● Constantes de catálisis.
○ Km: concentración de sustrato necesaria para que la enzima alcance
la mitad de su velocidad máxima.
○ Vmax: velocidad máxima de la enzima en condiciones de saturación
por el sustrato.
○ Kcat: número de recambio. Cantidad de ciclos catalíticos en un sitio
activo por segundo.
● La representación gráfica del cambio de la velocidad de reacción con
respecto de la concentración de sustrato para enzimas con cinética
Micheliana (hiperbólica) puede ser linealizada con la graficación de dobles
inversos.
● Inhibición. Se puede identificar el tipo de inhibidor a través del cambio en los
valores de Km y Vmax.
○ Inhibición competitiva: inhibidor se une a enzima libre. Interfiere con
formación de complejo E-S.
○ Inhibición incompetitiva: inhibidor se une al complejo E-S. Interfiere
con la formación del producto.
○ Inhibición mixta: el inhibidor se une a la enzima en sus dos formas.
Interfiere con ambos pasos.
○ Inhibición no competitiva: subclase de inhibidor mixto, con la misma
afinidad por la enzima en sus dos formas. No afecta la formación E-S.
○ Interpretación de la gráfica de dobles inversos:
■ Competitiva: Aumenta el valor de Km porque el inhibidor impide
la unión de la enzima al sustrato. Vmax se mantiene constante
 porque en condiciones saturantes, la misma cantidad de
moléculas de sustrato se unirán a la enzima.
■ Incompetitiva. Vmax y Km disminuyen en la misma proporción
debido a que el inhibidor se une al complejo E - S, lo que
disminuye la cantidad de enzimas útiles para la catálisis, y al
mismo tiempo estabiliza al complejo, lo que aumenta su afinidad
aparente.
■ No competitiva: Vmax disminuye, pero Km se mantiene igual
porque el inhibidor se une a un sitio alostérico, diferente del sitio
activo.
● Ejemplo de catálisis enzimática: proteasas de serina.
○ Son enzimas (proteínas) que rompen los enlaces peptídicos de otras
proteínas. Tienen una serina en el sitio catalítico, además de
asparagina e histidina (triada catalítica), que actúan en el rompimiento.
Los mecanismos específicos varían en función de la enzima; por
ejemplo, la tripsina rompe el enlace peptídico contiguo a una Arginina
o Lisina, la quimotripsina el contiguo a un grupo R hidrofóbico, y la
Subtilisina el contiguo a un grupo no polar pequeño.
● Regulación enzimática. Sobre la enzima existente o de la cantidad de la
misma.
○ a) sobre la enzima existente: modificación química o alosterismo.
■ Alosterismo: mecanismo por el cuál la unión de un efector a un
sitio diferente al activo de una enzima (sitio alostérico), modifica
su actividad.
● Homotrópico: la molécula efectora es la misma que el
sustrato (O2 con la hemoglobina, activación).
● Heterotrópico: la molécula es diferente (ATP y AMP con
la PFK, inhibición y activación respectivamente).
● Retroinhibición: Un producto final de una ruta inhibe una
enzima de una reacción anterior, comúnmente es un
proceso heterotrópico.
● Retroactivación: Puede ser tanto homotrópico como
heterotrópico.
● Activación hacia adelante: un intermediario de la ruta
activa la enzima de una reacción posterior. Generalmente
heterotrópico.
● Activación o inhibición por compuestos no pertenecientes
a la ruta.Generalmente heterotrópico.
■ Regulación química: adición covalente de un grupo
(fosforilación o proteólisis), zimógenos (irreversible).
● Adición covalente: Formación de un enlace covalente
entre la cadena lateral de un residuo de aminoácido
específico y no catalítico con otra molécula (molécula
 donadora), que produce un cambio conformacional o
cambio en la polaridad de la enzima.
● Es reversible, se necesita una molécula donadora, un
agente nucleofílico, que es la cadena lateral se un
aminoácido que se puede desprotonar, una enzima
modificadora y una desmodificadora.
○ Fosforilación: protein cinasas (ATP dona fosfato) y
proteín fosfatasas (rompen el enlace y liberan
fosfato). La fosforilación se da sobre residuos de
serina, treonina o tirosina.
○ Oxido/reducción de cisteína: formación transitoria
de puentes disulfuro entre residuos de cisteína
vecinos.
○ b) Regulación sobre la cantidad de enzima: regulación transcripcional,
postranscripcional, traduccional y postraduccional.
■ Síntesis: de mRNA (transcripcional) o de la proteína en el
ribosoma (traduccional)
■ Degradación: de mRNA o de la proteína. (post).
○ Isoenzimas: enzimas catalizadoras de la misma reacción en un
organismo pero codificadas por genes diferentes o resultado de
variación postranscripcional del mismo gen.

Membranas biológicas.

Función.

● Responsables de la distribución de procesos fisiológicos, como el ciclo de

krebs o la fosforilación oxidativa (en mitocondría).
● Comunicación inter e intracelular.
● Organizadoras de secuencias específicas de reacciones.
● Alojadoras de sistemas proteicos importantes para la producción de energía.

Composición y estructura.

● Bicapa lipídica con carbohidratos unidos covalentemente a la parte polar y

proteínas (integrales o periféricas) unidas por interacciones no covalentes.
● Glicerofosfolípidos, esfingolípidos y esteroles. Todos tienen en común la
presencia de una cabeza polar y una cola apolar en su estructura.
○ El colesterol se inserta perpendicularmente al plano de la membrana,
genera un puente de hidrógeno entre su hidroxilo y el carbonilo de un
fosfolípido, confiriendo rigidez a la membrana.
○ Los glicerofosfolípidos son DAGs con un alcohol (serina, colina,
etanolamina, inositol, glicerol) fosforilado unido al tercer carbono del
glicerol. Su parte polar puede tener carga.
 ○ Los esfingolípidos tienen un ácido graso unido mediante enlace amida
a una esfingosina, misma que tiene unida en su primer carbono la
cabeza polar (carbohidrato).

Modelo del mosaico fluido.

● La bicapa es asimétrica porque tanto los lípidos que conforman una

monocapa y otra, como las proteínas y carbohidratos asociados a cada una,
son diferentes.
● Las proteínas se integran a la bicapa dependiendo de sus propiedades de
hidrofobicidad o hidrofilicidad. Los carbohidratos se unen a la parte polar de
la bicapa o a las proteínas (glucoproteínas).
● Las proteínas que penetran la membrana se llaman integrales. si penetran
ambas monocapas, son transmembranales. Ambas tienen cadenas laterales
hidrofóbicas en su mayoría.
● Las que se asocian a estas proteínas, o a la parte polar de los lípidos
(superficie membranal) mediante interacciones electrostáticas o puentes de
hidrógeno se denominan periféricas.
● Al arreglo que se genera se le llama modelo del mosaico fluido.
● Fluidez membranal. Los ácidos grasos insaturados con configuración cis
producen espaciós vacíos en la bicapa, lo que favorece la fluidez de la
misma. Caso contrario con los ácidos grasos saturados y el colesterol.
○ Los ácidos grasos pueden desplazarse lateral o transversalmente (flip
- flop), rotar o flexionarse. Las proteínas únicamente lo pueden hacer
de forma lateral.
○ Depende de las interacciones hidrofóbicas. Un aumento en la
temperatura la vuelve más fluida.
● Asimetría membranal. La distribución de los ácidos grasos en una capa de
la membrana puede ser diferente de la otra, así como la concentración de
lípidos en una zona de una misma capa y en otra. Las proteínas siempre se
distribuyen de manera asimétrica.
○ Entre ambas capas puede ser absoluta (glicolípidos situados en la
membrana exterior) o relativa (desbalance de cargas por fosfolípidos
con carga negativa al interior).
○ En una misma capa es provocada por balsas lipídicas.

Transporte transmembranal. Proteínas transmembranales.

● Si es de moléculas no polares y a favor del gradiente de concentración, y no

es mediado por una proteína transportadora, es llamado difusión simple
(transporte pasivo). Si se requiere energía para llevarlo a cabo se denomina
transporte activo.
● El transporte de moléculas sin carga depende únicamente de su gradiente de
concentración y su velocidad es proporcional a la diferencia de ese gradiente.
 El de moléculas con carga depende de su gradiente electroquímico
(concentración y carga).
● Las principales características del transporte activo que lo diferencian del
pasivo son: especificidad, alta velocidad y regulación alostérica, por adición
covalente e inhibición competitiva.
● Las proteínas transportadoras de sustratos a través de la membrana, se
clasifican en bombas, canales y transportadores.
○ Canales: se encargan del transporte mediado pasivo, es decir, a favor
del gradiente iónico, y sólo transportan una molécula a la vez
(uniporte). Son más rápidos y menos específicos que los
transportadores, tienen un estado abierto y otro cerrado. Generan
corriente iónica, pueden cambiar el potencial de membrana.
○ Transportadores primarios o bombas: son proteínas transmembranales
que hidrolizan ATP a la vez que transportan una molécula (ión u
orgánica) en contra del gradiente de concentración. Son los
transportadores más lentos y más específicos.
○ Acarreadores o transportadores: transporte activo secundario o pasivo.
Utilizan los gradientes de concentración y eléctricos generados por las
bombas para mover una molécula en contra del gradiente de
concentración, a la vez que transportan otra en la misma dirección o
en la opuesta, utilizando la energía (carga) generada por la segunda
molécula para costear el de la primera. Asimismo pueden realizar
uniporte a favor del gradiente, la unión del sustrato a la proteína
genera un cambio conformacional en ella. Velocidad intermedia, alta
especificidad.
● El transporte es clasificado por su balance energético como electroneutro o
electrogénico (diferente de cero).

Transducción de señales. Proteínas transmembranales.

● Los receptores en la transducción de señales son proteínas

transmembranales.
● Los sistemas de transducción de señales son reacciones organizadas,
ordenadas y rápidas que se encargan de recibir una señal (cambio) y
producir una respuesta.
● Primeros mensajeros: hormonas y neurotransmisores que se unen al receptor
(proteína blanco) con alta afinidad y especificidad por la hormona.
○ Receptores: proteínas transmembranales (membrana plasmática). Los
de las hormonas son del tipo tirosin cinasas o receptores que se unen
a proteínas G. Las hormonas esteroideas, por ser liposolubles,
atraviesan la membrana y se unen a sus receptores en el citoplasma o
en el núcleo. Los neurotransmisores se unen a canales iónicos.
● Segundos mensajeros: moléculas orgánicas e inorgánicas que aumentan de
forma rápida y controlada su concentración, encargadas de activar enzimas
 (tirosin cinasas, fosfatasas) que fosforilan a las proteínas blanco para regular
su actividad.
○ Tanto los segundos mensajeros como las protein cinasas, amplifican la
señal original para producir una fase de respuesta, a través de la
inducción de cambios metabólicos dados por la regulación de la
actividad de proteínas blanco por fosforilación / desfosforilación y la
activación de genes en el núcleo que codifican proteínas que
contienen el estímulo.

Metabolismo.

● Suma de transformaciones químicas, catalizadas enzimáticamente, que

forman las rutas metabólicas, que tienen como objetivo la obtención de
energía mediante degradación de moléculas obtenidas del ambiente,
polimerización de precursores en metabolitos, y de metabolitos en
macromoléculas, síntesis y degradación de moléculas necesarias para
funciones de la célula, y transformación de moléculas nutrientes en otras
características de la célula
● Rutas metabólicas: serie de reacciones catalizadas enzimáticamente, que
globalmente son termodinámicamente favorables e irreversibles. Tiene
reacciones reversibles e irreversibles, que aportan o requieren energía, no
regulables o regulables. La reacción que es el paso determinante de la ruta
siempre es regulable e irreversible. Las rutas son regulables mediante la
cantidad o disponibilidad de sustrato, mediante regulación enzimática o por
hormonas. Pueden estar compartimentalizadas sub-celularmente o asignadas
a tejidos específicos.
● Catabolismo: reacciones productoras de energía, procesos oxidantes
degradativos. Utilizan moléculas como ADP, NAD+, NADP+, FAD, que se
reducen, mientras oxidan a los sustratos como glúcidos, grasas y proteínas
para formar moléculas con poder reductor, y otras sin energía, como agua,
amoniaco y dióxido de carbono.
● Anabolismo: reacciones que necesitan energía para formar macromoléculas,
procesos biosintéticos y de reducción. Utilizan moléculas con poder reductor,
que se oxidan a la vez que reducen a las moléculas sustrato, convirtiéndolas
en macromoléculas.
● Los diferentes tipos de reacciones que ocurren en el metabolismo están
reguladas por enzimas específicas a ese tipo de reacción.
○ Reductasas / Oxidasas: el sustrato se oxida o reduce, mientras que un
cofactor del tipo acarreador de electrones hace lo contrario.
○ Transferasas: transfieren un grupo funcional de una molácula a otra.
○ Isomerasas: catalizan isomerización.
○ Liasas: adicionan o eliminan un grupo de una molécula.
○ Hidrolasas: catalizan hidrólisis
 ● Cofactores o coenzimas: moléculas que transportan grupos funcionales o
moléculas o electrones, existen cuatro tipos y pueden ser iones o moléculas
orgánicas provenientes de vitaminas.
○ Transferidoras de electrones: NAD+ (dinucleótido adenin de
nicotinamida), FAD (dinucleótido adenin de flavina) en su forma
oxidada, son aceptores de electrones que actúan durante la oxidación
de combustibles. Por ejemplo, la degradación de ATP.
○ Para biosíntesis reductora: el NADPH actúa como donador de
electrones en procesos de biosíntesis.
○ Transferidoras de grupos con dos o más carbonos: la coenzima A es
una transferidora de grupos acilo, los cuáles se unen a la CoA
mediante un enlace tioéster.
○ Transferidoras de grupo fosfato: ATP, GTP, etc.

Termodinámica.

● El deltaG de una ruta es la suma de las reacciones individuales. A su vez, la

diferencia de energía libre está dada por G= H- T S. La entalpía es la energía
calórica del sistema, si la energía de los productos es mayor que la de los
productos, se dice que el sistema es endotérmico, y si la de los reactivos es
mayor, entonces el sistema libera energía, y es exotérmico. La entropía
describe el ordenamiento del sistema, si los productos son menos complejos
y más desordenados que los sustratos, se dice que hay una ganancia de
entropía. El valor final de deltaG determina si la reacción es
termodinámicamente favorable (exergónica, espontánea) o no (endergónica),
o si el sistema está en equilibrio, cercano o lejano a él.
○ Reacciones cercanas al equilibrio: reversibles, reguladas sólo por la
relación de concentraciones sustrato - producto.
○ Reacciones muy exergónicas: Reguladas por enzimas alostéricas y
poco sensibles a los cambios de concentración de reactivos y
productos, reguladoras de la vía metabólica.
● El ATP es un compuesto fosforilado de energía de hidrólisis media, moneda
de cambio biológica. Puede ser sintetizado por la concomitante hidrólisis de
un grupo fosfato con valor de deltaG de hidrólisis más negativo.
● Compuestos fosforilados de alta energía: su hidrólisis está favorecida porque
los productos son más estables (resonancia), el más energético es el
fosfoenolpiruvato.

Glucólisis

● Los carbohidratos forman la mayor parte de materia orgánica en los

organismos vivos. Su oxidación produce energía, que es usada o
almacenada. La glucólisis es la oxidación parcial de glucosa para producir
piruvato, energía y poder reductor.
 ● Condiciones aerobias: la glucosa se reduce completamente hasta CO2
(respiración celular), mediante la glucólisis, el ciclo de Krebs y la fosforilación
oxidativa.
● Condiciones anaerobias: el piruvato es reducido a lactato o etanol.
● En la oxidación de glucosa a piruvato se tiene la ganancia de 2 ATP. Se lleva
a cabo en el citosol y consta de dos reacciones divididas en 2 etapas.
○ Primera etapa: Activación de la glucosa e hidrólisis de fructosa. La
glucosa se fosforila, se isomeriza a fructosa y se vuelve a fosforilar
(Fructosa-1,6-bifosfato), que se hidroliza en dos moléculas de
gliceraldehido-3-fosfato, que puede isomerizar a dihidroxiacetona
fosfato.
○ Segunda etapa: Síntesis de moléculas con alto contenido energético.
Se produce 1,3-bifosfoglicerato y fosfoenolpiruvato que, por tener una
mayor energía de hidrólisis de grupo fosfato, la transferencia de este
está favorecida hacia el ADP, y se produce ATP.
● Pasos de la glucólisis. Sustrato, enzima y tipo de reacción, producto.
Número de reacción Sustrato Enzima/reacción Producto

1 (irreversible) Glucosa Hexocinasa/fosforilación G6P

2 G6P Fosfohexosa isomerasa/ isomerización. F6P

3 (irreversible) F6P PFK-1 / fosforilación FBP

4 Fructosa-1,6-bifosfato Aldolasa (liasa) / descomposición G3P

5 G3P Triosa fosfato isomerasa (reversible) Dihidroxiacetona

fosfato

6 G3P Deshidrogenasa /oxidación y fosforilación 1,3 -

bifosfoglicerato

7 1,3-BPG Fosfoglicerato cinasa / fosforilación a nivel 3-fosfoglicerato

de sustrato

8 3-fosfoglicerato Mutasa / isomerización 2 - fosfoglicerato

9 2- fosfoglicerato Enolasa / deshidratación Fosfoenolpiruvato

10 (irreversible, PEP Piruvato cinasa (PK) / fosforilación a nivel Piruvato

paso comprometido) de sustrato
*x2

● La estrategia de la ruta es ir abstrayendo electrones de la glucosa, que es

muy rica en hidrógenos. Los electrones los acepta la coenzima NAD+, al
mismo tiempo. En las reacciones 1 y 3 se da la inversión de energía, para
recuperarse en la 7 y 10, que son repetidas en dos ocaciones para obtener la
ganancia de energía.
 ● El NADH debe reconvertirse en NAD+ para reciclarse en la misma u otras
rutas. Este reciclaje puede darse en condiciones aerobias o anaerobias.
○ Anaerobias: fermentación láctica o alcohólica.
■ láctica: El piruvato pasa a lactato por acción de la enzima
deshidrogenasa láctica, que oxida las dos moléculas de NADH
a NAD+
● Regulación. La glucólisis es regulada por tres enzimas de la ruta (HK, PFK-1
y PK) y una no perteneciente a ella, la fosfofructocinasa 2/fosfofructosa
bisfosfatasa 2 (PFK2/FBPasa2), que sintetiza Fructosa - 2,6 - bifosfato a
partir de F6P, es un regulador alostérico.

● Todas las reacciones se llevan a cabo en el citosol.

+
● 𝐺𝑙𝑢𝑐𝑜𝑠𝑎 + 2𝑁𝐴𝐷 + 2𝐴𝐷𝑃 + 2𝑃𝑖 ↔ 2 𝑃𝑖𝑟𝑢𝑣𝑎𝑡𝑜 + 4 𝑁𝐴𝐷𝐻 + 2𝐴𝑇𝑃

Gluconeogénesis.

● 11 reacciones. 7 enzimas iguales que en la glucólisis y 4 diferentes.

● Las enzimas de los pasos 1, 3 y 10 son sustituidas por la fructosa - 1,6 -
bifosfatasa y glucosa - 6 - fosfatasa, fosfoenolpiruvato carboxicinasa y la
piruvato carboxilasa.
● Los pasos reguladores de la vía (1 y 13) son realizados en la mitocondria y
retículo endoplásmico.
● Se regula de manera recíproca con la glucólisis, además, hay metabolitos
que regulan las reacciones clave de la ruta, como el citrato y la acetil-CoA,
que la activan, o el ADP y AMP, que la inhiben.
 ● Algunas de las moléculas que favorecen a la gluconeogénesis, desfavorecen
a la glucólisis y viceversa.
● Activadoras de gluconeogénesis: Citrato, acetil-CoA. El citrato inhibe la
glucólisis.
● Inhibidores: FBP, AMP,ADP. Los tres activan la glucólisis, ATP la inhibe.
● Durante el ejercicio extremo, el músculo cubre las necesidades de energía
mediante la oxidación de glucosa hasta lactato y alanina, que también es
producida por degradación de proteínas. Este sale del músculo, al torrente
sanguíneo, y al hígado, donde vuelve a transformarse G6P, también por
degradación de glucógeno, después en glucosa para recuperar la energía
almacenada en él y una vez desfosforilada, sale del hígado. Este proceso se
llama Ciclo de Cori.

● Ambas rutas están reguladas mediante transducción de señales por la

insulina y el glucagón.

Número de reacción Sustrato Enzima/reacción Producto

1 Piruvato (a partir de lactato Piruvato carboxilasa Oxalacetato

y aminoácidos)

2 Oxalacetato PEP carboxicinasa PEP

3 PEP Enolasa 2 - fosfoglicerato

4 2 - fosfoglicerato PG mutasa 3- fosfoglicerato

5 3 - fosfoglicerato fosfoglicerato cinasa 1,3 -bifosfoglicerato

6 BPG G3P deshidrogenasa G3P

7 G3P triosa fosfato isomerasa Dihidroxiacetona fosfato

 (reversible)

8 G3P Aldolasa FBP

9 FBP FBPasa F6P

10 F6P Fosfoglucosa isomerasa G6P

11 G6P G6Pasa Glucosa

● 2 piruvato + 4 ATP + 2 GTP + 2 NADH + 2 H+ + 4 H2O ↔glucosa + 4 ADP +

2 GDP + 6 Pi + 2 NAD+
Ruta de las pentosas fosfato.

● Provee al sistema de moléculas biosintéticas, como lo son la ribosa y NADPH

(nicotinamida adenina dinucleótido fosfato).
● Siete reacciones, dos fases: oxidativa y no oxidativa.
○ Primera fase: oxidación de la glucosa a una pentosa
(ribulosa-5-fosfato), produciendo CO2 y dos NADPH.
○ Segunda fase: se obtiene G3P, F6P (intermediarios de la glucólisis) y
ribosa-5-fosfato.
○ La fase oxidativa es la no reversible. Y la etapa dos se divide en dos
partes: isomerización y adición / eliminación.

Número de reacción Sustrato Enzima / reacción Producto

1 (prod. NADPH). Rx G6P G6P deshidrogenasa 6-fosfoglucono-gama-lacto

comprometida na

2 6PGL Lactonasa / oxidación 6 - fosfogluconato

3 (prod. NADPH) 6 - fosfogluconato 6-fosfogluconato Ribulosa - 5 - fosfato

deshidrogenasa

4 Rib5P Fosfopentosa Ribosa-5-Fosfato/Xilulosa-

isomerasa/epimerasa 5-Fosfato

5 R5P + X5P Transcetolasa Sedoheptulosa-7-P + G3P

6 Sedoheptulosa-7-P + G3P Transaldolasa Hexosa + eritrosa-4-P

7 E4P + X5P Transcetolasa F6P + G3P

● 1-3 fase oxidativa. 4 isomerización. 5-7 fase adición eliminación.
● G6P ↔ CO2 + NADPH
● La regulación de la vía se da por regulación de la enzima de la primera
reacción, por la coenzima NADPH oxidada y reducida, favoreciendo la vía
una alta concentración de la oxidada.
 Ciclo de Krebs

● Ruta metabólica común para oxidación final de la glucosa, lípidos y proteínas.

Dos carbonos del piruvato entran al ciclo como acetil CoA, y se oxidan hasta
CO2 y genera ATP a partir de GTP, NADH y FADH2. En mitocondria en
organismos eucariontes.
● El Acetil-CoA es un compuesto de alta energía proveniente del piruvato
producido en la degradación de carbohidratos, pero también puede venir de
la oxidación de lípidos o aminoácidos.
○ Se sintetiza a partir de piruvato por una oxidación y una
descarboxilación, catalizada por el complejo enzimático PDH (piruvato
deshidrogenasa). Este complejo, en eucariotas, se inhibe por sus
productos (Acetil-CoA y NADH).

Número de reacción Sustrato Enzima / Reacción Producto

1 Acetil-CoA + Oxalacetato Citrato sintasa / condensación Citrato

2 Citrato Aconitasa / isomerización Isocitrato

3 (prod. de NADH) Isocitrato Isocitrato deshidrogenasa / alfa cetoglutarato + CO2

oxidación (descarboxilación)

4 (prod. de NADH) alfa cetoglutarato Cetoglutarato deshidrogenasa Succinil CoA + CO2

(complejo multienzimático)/
oxidación (descarboxilación)

5 Succinil CoA + GDP Succinil CoA sintetasa / hidrólisis + Succinato + CoA + GTP
fosf. a nivel de sustrato

6 (prod. de FADH2) Succinato + FAD (cofactor) Succinato deshidrogenasa / Fumarato + FADH2

oxidación

7 Fumarato Fumarasa / hidratación L - Malato

8 (prod. de NADH) Malato Malato deshidrogenasa / Oxalacetato

oxidación

● Acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2 H2O ↔ 2 CO2 + 3 NADH +

3 H+ + FADH2 + GTP + CoA
● Oxidación total, ganancia de poder reductor (NADH y FADH2) y ATP.
● Anfibólico: catabólico por reacciones de oxidación, anabólico por generación
de intermediarios de biosíntesis.
○ Citrato y acetil CoA: Sale de la mitocondria al citosol y contribuye a la
síntesis de ácidos grasos y colesterol.
○ alfa-cetoglutarato y oxalacetato: Precursores biosintéticos de
aminoácidos (glutamato y aspartato).
 ○ Malato: sale de la mitocondria al citosol y se convierte en oxalacetato
para alimentar la ruta gluconeogénica.
● Regeneración de Acetil-CoA mediante reacciones anapleróticas.
● Regulación:
○ Citrato sintasa: se regula por disponibilidad de sustrato (Acetil-CoA y
oxalacetato)
○ Citrato sintasa y alfa-cetoglutarato deshidrogenasa: se inhiben por sus
productos (citrato, succinil-CoA y NADH).}
○ Citrato sintasa: se regula por retroinhibición competitiva (succinil - CoA
y Acetil-CoA).
○ Isocitrato deshidrogenasa: se activa alostéricamente por ADP.

Fosforilación oxidativa.

● En mitocondria para eucariotas, participación específica de la membrana

mitocondrial interna y la matriz mitocondrial.
● La gran cantidad de moléculas con poder reductor (NADH y FADH2)
producidas en el ciclo se Krebs propician la fosforilación oxidativa.
● Está constituida por dos etapas: la primera de oxidación, en la que la cadena
respiratoria (serie de reacciones redox) transfieren electrones hasta un
aceptor final, el O2, que se reduce a agua. La segunda, la etapa fosforilante,
en la que una molécula de fosfato se esterifica al ADP, y se forma ATP.
● Cadena respiratoria (respiración celular): Las coenzimas reducidas
generadas por todo el metabolismo (NADH y FADH2) son aceptadas y
transferidas (sus electrones) por la cadena respiratoria, que son una serie de
complejos proteicos insertos en la membrana mitocondrial interna hasta
formar ATP.
○ Está formada por complejos enzimáticos (varios polipéptidos) que son
los aceptores de electrones, y moléculas orgánicas (cofactores, grupos
prostéticos) que actúan como transportadores, se oxidan y reducen
reversiblemente.
○ A) complejos enzimáticos 1,2,3 y 4. Proteínas integrales de
membrana.
○ B) Transportadores móviles: Coenzima Q (ubiquinona), es una
molécula orgánica hidrofóbica, y el citocromo C, una proteína periférica
que se encuentra del lado intermembranal.
○ C) Complejo enzimático V: ATP sintetasa, fosforila al ADP, se
encuentra inserta en la membrana mitocondrial interna.
● NADH entra al complejo I y FADH2 al II.
● Los electrones son aceptados por el complejo I o II, que los dona a la
ubiquinona (CoQ), luego al complejo III, luego al citocromo C y luego al
complejo IV, al final los electrones son aceptados por el O2, se reduce a H2O.
 ● Los H son disociados en e´ y H+, los protones son bombeados hacia el
espacio intermembranal por bombas (complejos respiratorios), generando un
gradiente quimiosmótico.
● La membrana interna es impermeable a los protones, por lo tanto estos
deben ser devueltos a la matriz mitocondrial por medio de la ATP sintasa.
NADH genera 3 ATP, FADH2 genera 2.

Teoría quimiosmótica.

● Se basa en la translocación de protones y la semipermeabilidad de la

membrana interna mitocondrial.

Balance total de energía.

● 1 glucosa + 38 ADP + 38Pi ↔ 6 CO2 + 38 ATP

* 2 NADH deben ser transportados activamente del citoplasma a la matriz
mitocondrial (1 ATP c/u), el balance final da 36 ATP.

Transporte de electrones fotosintético / fotofosforilación.

● Proceso muy eficiente en la formación de ATP. Los electrones son

donados por clorofilas excitadas.
● Fotosíntesis se da en algas y plantas con cloroplastos. Producción de
O2, ATP, carbohidratos y NADPH.
● Dos fases: la luminosa, que produce ATP, O2, NADPH. Y la oscura
(ciclo de kalvin), que produce carbohidratos y NADP+ (oxidante) y
consume NADPH y ATP.
○ Fase luminosa: Se absorbe luz por pigmentos, excitación de
clorofila, transporte de electrones, generación de NADPH y O2,
generación de un gradiente de protones, fosforilación del ADP
para generar ATP.
■ Transducción de energía: se convierte energía luminosa
en química.
■ Estas reacciones se llevan a cabo en los fotosistemas I y
II. Cada uno cuenta con clorofilas tipo A y B, pigmentos
antena como carotenoides, proteínas integrales y
periféricas y grupos prostéticos.
■ Los centros reactivos se conforman de una “trampa de
luz”, que son clorofilas y los pigmentos, esto y dos
clorofilas excitables se encuentran embebidas en una
proteína transmembranal (membrana tilacoidal).
■ El electrón donado por el PSII debe ser finalmente
devuelto a la clorofila, se hace por medio de un complejo
 proteico con Mn2+, que toma el electrón del agua,
produciendo O2.
■ Síntesis de ATP/fotofosforilación: Los pasos anteriores
generan un gradiente de protones, la ATP sintasa
fosforila al ADP para generar ATP.
○ Fase oscura (Ciclo de Calvin): En el estroma del cloroplasto. Se
usa para fijar CO2, sintetizar esqueletos carbonados y grandes
cantidades de NADP+.
● La vía es anabólica y reductora.

Metabolismo del glucógeno.

● Polímero de glucosa con enlaces glucosídicos alfa-1-4 y ramificaciones 1-6,

se almacena en hígado y músculo. Forma gránulos y a ellos se asocian las
enzimas encargadas de su síntesis y degradación.
● Glucogenolisis: el glucógeno sufre fosforólisis por la glucógeno fosforilasa, se
produce G1P que es convertida a G6P por la fosfoglucomutasa. La glucosa 6
fosfato puede integrarse a la glucólisis en músculo directamente, o puede ser
hidrolizada por la glucosa fosfatasa para salir como glucosa al torrente
sanguíneo desde el hígado. La enzima desramificadora se encarga de
romper un enlace 1-6 y transponer una trisacárido hacia otro extremo no
reductor con enlaces 1-4.
○ La enzima reguladora es la glucógeno fosforilasa (forma activa
fosforilada), por alosterismo (activada por AMP e inhibida por ATP y
G6P), por fosforilación catalizada por la fosforilasa b cinasa. E
indirectamente por el glucagón y la epinefrina.
● Glucogenogénesis: La glucosa, si está en el torrente sanguíneo y entra al
hígado, es fosforilada por la enzima hexocinasa, produciendo G6P, después
la fosfomutoglucasa la convierte en G1P, después, la enzima UDP-glucosa
pirofosforilasa, con ayuda de UTP, activa a la glucosa y la convierte en
glucosa UDP. Finalmente, la glucógeno sintasa transfiere el grupo glucosilo a
un extremo no reductor del glucógeno.
○ Regulación: la glucógeno sintasa es regulada alostéricamente por ATP,
ADP y Pi, que inhiben la forma inactiva de la enzima (fosforilada).

Metabolismo de lípidos.

● Llamada beta-oxidación, se lleva a cabo en la mitocondria de organismos

eucariontes. Los lípidos se encuentran en el citosol, donde se activan
mediante una acilación para formar Acil-CoA y entrar a la mitocondria.
● Activación: la Acil-Coa sintetasa adiciona un AMP al ácido graso, luego la
CoA reemplaza al AMP, formando Acil-Coa, que entra a la mitocondria por
acción de la carnitina.
Beta-oxidación (4 reacciones)

● Acil-CoA deshidrogenasa cataliza la deshidrogenación para formar un doble

enlace trans entre los carbonos alfa y beta del acil-CoA, utilizando FAD como
cofactor y produciendo FADH2. La enzima enoil-CoA hidratasa cataliza la
hidratación del doble enlace, y forma 3-L-hidroxiacilCoA. La
deshidrogenación de esta última por la 3-L-hidroxiacil-CoA deshidrogenasa
forma la beta-cetoacil-CoA y NADH. Por último, una tiolisis del enlace entre
los carbonos alfa y beta catalizada por la beta-cetoacil tiolasa genera
Acetil-CoA + Acil-CoA.
○ Regulación: por la cantidad de ácidos grasos en sangre, que a su vez
está regulada por la lipasa de triacilglicerol, se regula por fosforilación /
desfosforilación dependiente de AMPc (estado activo fosforilado).
Activada por glucagón y epinefrina (activan la degradación). La
insulina inhibe la degradación y activa la síntesis.

Síntesis de ácidos grasos.

● Se lleva a cabo en el citosol, requiere poder reductor (NADPH). El precursor

es el acetil-CoA y el donador de grupos acilo es el malonil-CoA.
● Reacciones: El acetil-CoA se carboxila para formar al malonil-Coa por acción
de la acetil-CoA carboxilasa y una desfosforilación de ATP (reacción
reguladora). Las siguientes siete reacciones son catalizadas por la misma
enzima: la ácido graso sintasa. Se condensa un grupo acetil-ACP con uno
malonil-ACP, se libera CO2 proveniente del malonil y se produce
beta-cetoacil-ACP , que se reduce por la beta-cetoacil reductasa y NADPH
como cofactor. se genera 3-D-hidroxiacil-ACP que se deshidrata por la
beta-hidroxiacil-ACP dehidrasa y NADPH para generar un doble enlace entre
el carbono alfa y beta, formando enoil-ACP, que es reducido por la enoil-ACP
reductasa y forma acil-ACP (Cn+2), que se condensa con otro acetil-ATP
hasta llegar a palmitoil-ACP (16 C). Llegado a ese punto, la palmitoil esterasa
hidroliza el enlace y libera al palmitato. 8 acetil-CoA producen un palmitato.
● El palmitato es el precursor de ácidos grasos de cadenas más largas e
insaturados.
● Regulación: la acetil-CoA carboxilasa se activa mediante polimerización, el
citrato estimula la polimerización, y por tanto la síntesis y la palmitoil-CoA
hace lo contrario. El glucagón y la epinefrina fosforilan la enzima, por lo que
se inhibe la polimerización, y la insulina hace lo opuesto.

Cetogénesis / síntesis de cuerpos cetónicos.

● Se da a partir de Acetil-CoA y es una forma de almacenamiento de la misma.

Estos compuestos suministran energía al corazón, músculo y cerebro.
Metabolismo de compuestos nitrogenados

Degradación de aminoácidos.

● Primera etapa: desaminación. se divide en dos pasos; transaminación a un

alfa-cetoácido y producción de glutamato. y desaminación oxidativa, que
desamina al glutamato y libera amoniaco.
● Segunda etapa: El nitrógeno liberado como amoniaco puede ser excretado
como urea en ureotélicos ( vertebrados terrestres) o metabolizado.
○ La síntesis de urea se da en el hígado a través de las enzimas del
ciclo de la urea, presentes en citosol y matriz mitocondrial. Después,
es secretada a la sangre y captada por los riñones, finalmente,
excretada en la orina.
● Tercera etapa: los esqueletos desaminados de aa pueden ser glucogénicos o
cetogénicos dependiendo del aminoácido al que pertenezcan, y son
convertidos a intermediarios precursores de la síntesis de glucosa o ácidos
grasos y cuerpos cetónicos respectivamente.

Integración metabólica.
● Encrucijadas metabólicas: G6P, piruvato, Acetil-CoA.