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Taller 1 Enlaces, Macromoléculas, Replicación

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Bio141c_secciones 23 y 24_2020

Ayudantía Nº1

I. Enlaces, propiedades químicas del agua


1. Indique los distintos tipos de enlace que existen, y ordénelos de menor a mayor de acuerdo con la
fuerza de éstos.
De menor a mayor fuerza:
o Interacciones/fuerzas de Van der Waals
o Puentes de Hidrógeno
o Enlace iónico
o Enlace covalente

2. ¿Qué tipo de enlace se genera entre moléculas de agua y qué relevancia biológica puede tener esto?
Las moléculas de agua se unen mediante puentes de hidrógeno y cada molécula puede formar dos de
estos enlaces
Estos enlaces mantienen al agua en equilibrio líquido a temperatura ambiente
Permiten que moléculas hidrófilas se disuelvan en agua (al ser polares forman ptes. de H con el
agua)
Los enlaces permiten estabilidad entre macromoléculas

3. Mencione los tipos de enlaces que se


esquematizan entre moléculas A y B.
1 -> Enlace Iónico o interacción entre
dipolos
2 -> Puente de Hidrógeno
3 y 4 -> Interacción de Van der Waals,
hidrofóbicas (porque ambas moléculas son
iguales, interactúan entre sí) o fuerzas de
London (las 3 mencionadas son fuerzas
débiles)

4. ¿Por qué la interacción entre Molécula A y


B, es más fuerte que la interacción entre A y C?
Porque entre A y B hay mayor cantidad de enlaces y que las mantienen “unidas”, las mantienen
estables, en cambio entre A y C hay fuerzas repulsivas (++ y - -)
A y B “encajan” de mejor manera que A y C, como sustrato y enzima.
II. Macromoléculas en la vida
1. Completa la siguiente tabla respecto a la jerarquía de la organización molecular en las células.

Nivel 1 Nivel 2 Nivel 3 Nivel 4

Monómero Macromoléculas Estructura Ubicación


donde lo
encuentro
Nucleótido Ácido nucleico (ADN y Cromosoma Núcleo
ARN)

Aminoácido Proteína Complejo Membrana o


proteico Citoplasma o
espacio
Intercelular
Ácido graso Lípidos Micela Membrana

Monosacáridos Pared Celular Célula vegetal


polisacárido/Carbohidrato

2. Sabemos que el ADN es de suma importancia para la vida, ya que es la molécula que porta la
información genética. Además, y por lo mismo, es la macromolécula de mayor tamaño presente en los
seres vivos. ¿Cómo explicarías entonces, que forme solo un 1% de la masa de una célula, mientras las
proteínas forman el 15%?

Porque el ADN es el que se encarga de entregar las instrucciones al resto de las macromoléculas, no se
necesitan tantos “ADN” (ejemplo de recetas, para hacer 3000 queques (moléculas) no necesito 3000
recetas (ADN) sino que solo una). Otra razón es que las proteínas no están compactadas y el ADN sí,
por lo que independiente del tamaño, hay menos ADN.

III. Ácidos nucleicos

1. En las cadenas de ácidos nucleicos de la figura:


a) Identifique los extremos 5’ y 3’.
Tanto en la cadena A como B, el extremo 5’ es el
superior y el 3’ el inferior (en el C 5’ hay un grupo
fosfato y en el C 3’ hay un OH)
b) Nombre los azúcares y las bases.
Azúcares (Pentosa):
o Ribosa (Si en el C-2’ tienen OH)
o Corresponde a la cadena A (ARN)
o Desoxirribosa (Si en el C-2’ tiene H y no
OH)
o Corresponde a la cadena B (ADN)

Bases nitrogenadas:
o Pirimidinas:
- Timina (T)
- Citosina (C)
o Purinas:
- Guanina (G)
- Adenina (A)

c) ¿En qué se diferencian las purinas de las pirimidinas?

Se diferencian en la cantidad de anillos que las conforman. Las pirimidinas tienen 1 anillo y las
purinas tienen 2.

d) Indique qué oligonucleótido es DNA y cual RNA. Explique cómo los diferencia.

La cadena A es ARN porque la pentosa es ribosa y la b es ADN porque la pentosa es


desoxirribosa

2. ¿Qué diferencias existen entre un nucleótido y un nucleósido? ¿Podrían estos últimos formar parte de
macromoléculas como el DNA?
Un nucleótido está constituido por un grupo fosfato, un azúcar de tipo pentosa y una base nitrogenada,
en cambio, un nucleósido solo presenta un azúcar y una base, por lo que no puede formar
macromoléculas de ADN o ARN al no tener un grupo fosfato que se una a otra azúcar de otro
nucleósido.

3. ¿Qué otra función cumplen las bases nitrogenadas en la célula?

Formar ATP, por lo que ayuda entregando energía (tienen función energética)

4. Describa qué tipo de enlace ocurre entre dos nucleótidos y cómo se forma éste.
Entre dos nucleótidos se forma un enlace fosfodiéster de tipo covalente. Se forma el enlace entre el
grupo OH del carbono 3’ de la desoxirribosa de uno y el grupo fosfato del carbono 5’ de la desoxirribosa
del otro. Al generarse la unión, se liberan grupos fosfatos y una molécula de agua.

5. ¿Cómo se estructura el apareamiento de bases en el DNA? Mencione los tipos de interacciones y las
consecuencias que ello tiene en la organización de la molécula.
Las bases se unen a través de puentes de hidrógeno de forma complementaria, es decir, la Guanina
interactúa con la Citosina a través de 3 puentes y la Timina con la Adenina a través de 2. Esto además
produce que las hebras de ADN tengan esa forma de hélice.

6. La secuencia de nucleótidos de una doble hélice de DNA es:


5’ -CTGACCTATTGAAGGATAATCGACACACCTGAGCCTTGGATTT - 3’

¿Cuál es la secuencia de la cadena complementaria?


3’ -GACTGGATAACTTCCTATTAGCTGTGTGGACTCGGAACCTAAA - 5’

7. En el DNA de ciertas células bacterianas, el 21 % de los nucleótidos corresponde a citosina ¿Cuáles son
los porcentajes de los otros nucleótidos?
21% de Guanina, 29% de Timina y 29% Adenina

IV. Replicación del DNA. Recombinación y reparación.

1. ¿A qué se refiere el término “replicación semiconservativa”? Explique cuál fue el experimento que
determinó que la replicación era semiconservativa.
Se refiere al hecho de que la hebra de ADN parental se divide en dos hebras moldes, de donde salen hebras
replicadas nuevas.
Experimento Meselson y Stahl: se cultivaron bacterias E. coli durante varias generaciones en un medio que
contenía al isótopo de Nitrógeno (N-15), por ende, el ADN de las bacterias
tenia N-15. Se transfirieron a otro medio con N-14 (más ligero) y dejaron
que se reprodujeran, como la siguiente generación era un intermedio entre
las bacterias iniciales, se dedujo que era mitad y mitad (molde y nueva)

2. Dibuje una horquilla de replicación y explique por qué es asimétrica.

Aquel lugar o punto donde las hebras anteriormente estaban juntas y ahora hay un espacio entre ellas, es
de forma Y. Es asimétrica porque una hebra es continua y la otra discontinua.

3. Durante la síntesis del DNA, ¿Cómo corrige la DNA polimerasa su propio trabajo?
La polimerasa al poseer actividad exonucleasa (puede cortar nucleótidos al romper enlaces fosfodiéster a
través de hidrólisis), en su proceso de “revisión” si detecta que ha agregado un nucleótido de forma
incorrecta, elimina el último nucleótido y agrega el correcto.

4. Nombre y defina la función de los principales componentes de la maquinaria de replicación.


o Helicasa: separa la doble hebra, “cortando” los puentes de hidrógeno
o SSB: mantiene las hebras separadas
o Topoisomerasa: relaja la molécula de ADN para que se libere tensión y la helicasa haga su trabajo
sin mayor problema
o Primasa: sintetiza el primer lo que le indica a la polimerasa donde partir la replicación
o ADN Polimerasa: copia la nueva hebra de ADN, añadiendo nucleótidos en dirección 5’ a 3’
5. ¿Qué enzimas intervienen en el desenrollamiento de la doble hélice durante la replicación del DNA? ¿Esta
reacción requiere energía?
Es una acción que requiere energía puesto que se va formando tensión a lo largo de la hebra y se debe
liberar. La primera enzima en actuar es la helicasa que separa las hebras y al mismo tiempo la SSB mantiene
las hebras separadas, sin embargo, la helicasa a lo largo de la hebra va “topándose” con mas tensión y esta
es relajada por la enzima topoisomerasa

6. Describa los daños más comunes que puede sufrir el DNA y las enzimas encargadas de repararlo.

El ADN puede sufrir daños por alquilación, corte en una hebra o ambas por rayos x, daños de pirimidina por
radiación UV, entrecruzamiento entre ADN-proteína o ADN-ADN, intercalación en el ADN (un ligando
encaja y se une entre pares de bases de ADN), daño de las bases.

Las enzimas encargadas son la Alquiltransferasa, ligasa, complejo de excisión nucleótido-reparación


(exonucleasa, endonucleasa, topoisomerasa, polimerasa, ligasa, helicasa) y complejos excisión base-
reparación (glicosidasa, endonucleasa AP, polimerasa-Ligasa)

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