3.

Aminoácidos
 Figure 1.1 Flow chart of human biochemistry. Throughout this book we will be discussing interrelationships between nutrients, energy metabolism and structure of cells
and organs. We will highlight the role of catalytic and regulatory molecules and the control of cell cycle and metabolism by the information encrypted in the nucleic acids.
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Figure 1.2 Biochemistry: all in one. Interrelationships between biochemical pathways. This figure has been designed to give you a bird's-eye view of the field. It may help
to structure your study, or revision. Downloaded from: StudentConsult©(on
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 Grupo carboxilo
Aminoácidos (disociado)

Grupo amino
(protonado)
-
1 COO
+ 2
H 3N C H
R
Carbono a
Cadena
lateral
 Aminoácidos: estereoisomería

1
1
2 2
1 COO- 3 1 COO
-

+ 2 3 2
H 3N C H H C NH3+
3 CH 3
3 CH3
L-Alanina D-Alanina

ENANTIÓMEROS
 Aminoácidos: estereoisomería

COOH CHO
H 2N C H HO C H
R CH2OH

L-Alanina L-Gliceraldehido
No polares
Aminoácidos
alifáticos
VIL

STT

LysHA
NOMENCLATURA DE AMINOÁCIDOS
AMINOÁCIDOS ESCENCIALES

FHILLM TV T
 COO - COO-
+
+
H3N C H H 3N C H

H C OH H C CH3
CH2
CH3
CH3

L-Treonina L-Isoleucina
 Aminoácidos alifáticos o neutros, 1

COO- COO-
H 3N + C H H 3N + C H
H CH3

Glicina
Alanina
Gly, G
Ala, A
NE
NE
Aminoácidos alifáticos o neutros, 2
COO-
H 3N +
Valina
C H
Val, V
CH E
H 3C CH3

COO-
H 3N + C H
Leucina
CH2
Leu, L
CH E
H 3C CH3

COO-
H 3N + C H Isoleucina
CH Ile, I
H 3C CH2
E
CH3
Aminoácidos alifáticos

Su característica fundamental es la hidrofobicidad de

la cadena lateral (con excepción de G)

Suelen ocupar el interior de las proteínas globulares,

donde contribuyen a la estructura global de la proteína
debido al efecto hidrofóbico (“micela proteica”)

Reactividad química muy escasa

Glicina tiene un destacado papel estructural: suele ser

invariante en series filogenéticas
 Aminoácidos alifáticos

• Glicina actúa como

NEUROTRANSMISOR inhibidor en el
tronco encefálico y la médula espinal.
• Sus acciones son antagonizadas por la
estricnina raticida, lo que origina
fasciculaciones y espasmo muscular.
 COO- COO-
COO- H 3N + C H
H 3N + C H
+
H 3N C H CH2
CH2
CH2
Tirosina
Fenilalanina Tyr, Y
Phe, F NE NH
E OH
Triptófano
Trp, W
E

AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS
Aminoácidos aromáticos

La presencia de sistemas aromáticos hace que absorban

luz UV en torno a 280 nm; la absorción UV de las proteínas
se debe a su contenido en estos aminoácidos

F y W son hidrofóbicos
 COO-
+ Serina
H 3N C H
Ser, S
CH2OH NE

COO-
H3N+ C H Treonina
Thr, T
H C OH E
CH3

Hidroxiaminoácidos
P O LA R E S
Hidroxiaminoácidos

El grupo -OH de la serina es fundamental en el centro

activo de muchas enzimas (serin proteinasas, p.e.)

Forma enlaces glicosídicos con oligosacáridos en ciertas

glicoproteínas

El grupo -OH tanto de S como de T es susceptible de

fosforilación: importante modificación postraduccional
que regula la actividad de muchas proteínas
 Tioaminoácidos contienen azufre, S
COO-
H 3N + C H Cisteína
Cys, C
CH2 NE
SH

COO-
H 3N + C H
CH2 Metionina
Met, M
CH2 E
S
CH3
Tioaminoácidos

Importante papel estructural de la cisteína por la

posibilidad de formar enlaces disulfuro con otro
residuo de cisteína

La cisteína participa en el centro activo de muchas

enzimas

La metionina es el aminoácido iniciador de la síntesis

de proteínas (codón AUG)
Aminas secundarias (“Iminoácidos”)

-
COO
+
NH2

Prolina
Pro, P
NE
alifático
Prolina

Importante papel estructural: su presencia dificulta

la formación de estructura secundaria

Por esa misma razón suele ser invariante en series

filogenéticas

Como tal o modificado por hidroxilación (4-hidroxi-

prolina) es muy abundante en el colágeno
Aminoácidos dicarboxílicos y amidas con carga y sin carga
COO- COO-
COO- COO- H 3N + C H H 3N + C H
H 3N + C H H 3N + C H CH2 CH2
CH2 CH2 CH2 CH2
COO- CONH2
COO- CONH2
Ác.Aspártico Asparragina Ác.Glutámico Glutamina
aspartato Asn, N glutamato Gln, Q
Asp, P NE Glu, E NE
NE NE
Aminoácidos dicarboxílicos y sus amidas

Todos ellos son importantísimos intermediarios en el

metabolismo nitrogenado, sobre todo E y Q

Forman parte del centro activo de las glicosidasas y de

las serin enzimas (tríada SHD)

Proveen a la proteína de superficies aniónicas que

sirven para fijar cationes (p.e., Ca+ +)
 Glutamato
• Mayor concentración el cerebro, actúa
como neurotransmisor en cerebro y médula
espinal
 COO- COO-
COO-
H 3N + C H H 3N + C H
H3N+ C H
CH2 CH2
Lisina Arginina CH2
CH2 CH2
Lys, K Arg, R
CH2 CH2
E E(?) NH+
CH2 NH
+ HN
NH3+ H 2N C
NH2 Histidina
His, H
E

Aminoácidos dibásicos con carga

Aminoácidos dibásicos
Lisina sirve para formar intermediarios covalentes en
catálisis enzimática (bases de Schiff)

Lisina es el aminoácido que une determinadas coenzimas

a la estructura de la proteína

Arginina es un importante intermediario en el ciclo de

la urea

Histidina forma parte del centro activo de muchas enzimas,

debido al carácter nucleófilo del imidazol

Histidina contribuye al tamponamiento de los medios

biológicos por tener un pKa cercano al pH intracelular
Clasificación de aminoácidos según polaridad

Aminoácidos apolares o hidrofóbicos:

- A, V, L, I, F, W, M, P

Aminoácidos polares sin carga eléctrica:

- G, Y, S, T, C, N, Q

Aminoácidos polares con carga eléctrica:

Aniónicos (-): D, E
Catiónicos (+): K, R, H
Cadenas laterales con carga eléctrica

Arginina 12.48 +
Aspártico (ác.) 3.86 -
Cisteína 10.78 -
Glutámico (ác.) 4.25 -
Histidina 6.00 +
Lisina 10.53 +
Tirosina 10.57 -
 H O H O
N C N C
N HC HC C
CH2 CH2
SH SH

O C N H
C CH2 S S CH2 C
H N C O

N C
Figure 2.6 Structure of glutathione.

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 COO-
+
H 3N C H
CH2
Cisteína
SH

COO- COO-
+ +
H3N CH H3N CH
CH2 S S CH2

Cistina
 Aminoácidos no proteicos: intermediarios metabólicos

COO- COO- COO- COO-

+ + +
H 3N C H H 3N C H H3N C H +
H 3N C H
CH2 CH2 CH2 CH2
CH2 CH2 CH2 CH2OH
CH2 CH2 SH
NH3+ NH
O C Homocisteína Homoserina
NH2

Ornitina Citrulina
Aminoácidos no proteicos: DOPA

COO-
+
H 3N C H Catecolaminas
CH2

Hormonas
tiroideas
HO
OH

L-DOPA Melanina
(dihidroxifenilalanina)
 w-Aminoácidos

COO-
COO-
CH2
CH2
CH2
β CH2
ɤ CH
2
NH3+
NH3+
b-Alanina GABA
g-Aminobutirato
 Modificaciones postraduccionales, 1

COO-
+
H H3N C H
COO-
HO C CH2 CH2 +
H3N C H
CH2
H2C HC COO- CH2
H C OH
NH2+ HC COO-
CH2
COO-
NH3+
4-hidroxiprolina
4-carboxiglutámico
5-hidroxilisina
 COO-
Modificaciones postraduccionales, 2
+
H3N C H
CH2
CH2
H CH2 H
-
OOC C CH2 CH2 CH2 CH2 C COO-
NH3+ NH3+
N+
CH2
CH2 Desmosina
CH2
CH2
H C NH3+
COO-
 ACIDEZ Y BASICIDAD DE LOS
AMINOACIDOS

[H+] [A-]
Ka= _____________
[HA]

Cuanto mayor sea el valor de Ka, más fuerte es el

ácido, porque mayor parte de HA está disociado en
[H+] [A-].
Cuanto menor sea el valor de Ka, más débil es el
ácido, porque menor es la cantidad de ácido
disociado.
 ACIDEZ Y BASICIDAD DE LOS
AMINOACIDOS
• pH= log 1/[H+]

• pH = -log [H+]

• pKa= -log Ka

• pH= pKa + log [A-]/ [HA] Ec. Henderson-Hasselbalch

 Figure 2.4 Titration of amino acid. The curve shows the number of equivalents of NaOH consumed by alanine while titrating the solution from pH 0 to pH 12. Alanine
contains two ionizable groups: an α-carboxyl group and an α-amino group. As NaOH is added, these two groups are titrated. The pKa of the α-COOH
group is 2.4, whereas that of the α-NH3+ group is 9.8. At very low pH, the predominant ion species of alanine is the fully protonated form:

At the mid-point in the first stage of the titration (pH 2.4), equimolar concentrations of proton-donor and proton-acceptor species are present, providing good buffering
power.

The second stage of the titration corresponds to the removal of a proton from the -NH3+ group of alanine. The pH at the mid-point of this stage is 9.8, equal to the pKa
for the -NH3+ group. The titration is complete at a pH of about 12, at which point the predominant form of alanine is:

The pH at which a molecule has no net charge is known as its isoelectric point, pI. For alanine, it is calculated as:
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 ACIDEZ Y BASICIDAD DE LOS
AMINOACIDOS

• Los aminoácidos pueden actuar como una

base o como un ácido y se denominan
anfóteros, anfolitos.
 PUNTO ISOELÉCTRICO

• pI es el pH al cual el aminoácido es
eléctricamente neutro, es decir, la suma de
las cargas positivas es igual a la suma de
las cargas negativas
 Titulación de aminoácido neutro
14

12
III
10

8
pH

6
II
4

I
0
0 1 2

Base añadida (uu. arbitrarias)

 I II III
COOH COO- COO-
H3N+ C H H 3N + C H H 2N C H
CH3 CH3 CH3

pH < pKC pH > pKC pH > pKC

pH < pKN pH < pKN pH > pKN
 Titulación de aminoácido dicarboxílico
14

12
IV
10

8
pH

III
6

4
II
2

I
0
0 1 2 3

Base añadida (uu. arbitrarias)

 I II III IV
COOH COO- COO- COO-
H3N+ C H H3N+ C H H 3N + C H H 2N C H
CH2 CH2 CH2 CH2
COOH COOH COO- COO-

pH < pKC pH > pKC pH > pKC pH > pKC

pH < pKL pH < pKL pH > pKL pH > pKL

pH < pKN pH < pKN pH < pKN pH > pKN

 Titulación de aminoácido dibásico
14
IV
12

10
III

8
pH

6
II
4

0
I
0 1 2 3

Base añadida (uu. arbitrarias)

 I II III IV

COOH COO- COO- COO-

H3N+ C H H 3N + C H H2N C H H2N C H
(CH2)4 (CH2)4 (CH2)4 (CH2)4
NH3+ NH3+ NH3+ NH2

pH < pKC pH > pKC pH > pKC pH > pKC

pH < pKN pH < pKN pH > pKN pH > pKN
pH < pKL pH < pKL pH < pKL pH > pKL
 SOLUCIONES AMORTIGUADORAS

• TAMPÓN, BUFFER
Es una disolución que resiste el cambio de pH después de
la adición de un ácido o una base.

La capacidad de amortiguamiento máximo se produce a

un pH = pKa, pero un par ácido/base conjugado puede
actuar como un tampón eficaz cuando el pH de una
disolución esta dentro de un intervalo de + 1unidad del
pH del pKa.
 SYSMEHFRWGKPV
a-MSH (hormona estimulante de los melanocitos)

SYSMEHFRWGKPVGKKRRPVKVYPDAGEDQSAEAFPLEF
ACTH (Hormona corticotropa)

CYIQNCPLG Oxitocina

CYFQNCPRG Arginin-Vasopresina
Hormonas
CYFQNCPKG Lisin-Vasopresina peptídicas
TRH (Hormona liberadora de tirotropina)

NH2
O CO
O NH
NH N
O CH2

N
NH

Piroglutamil-histidil-prolinamida
 ECA
DRVYHPFHL DRVYHPF

Angiotensina I HL Angiotensina II

RPPGFSPFR Bradiquinina

KRPPGFSPFR Kalidina

Péptidos vasoactivos
Neurotransmisores peptídicos

YGGFL (Leucin-encefalina)

YGGFM (Metionin-encefalina)
 AMINOACIDOS

• COMPUESTOS POR:
GRUPO AC. CARBOXILICO –COOH pH fisiológico –COO -
GRUPO a-AMINO -–NH3+ –NH3+
CADENAS LATERALES DE 20 TIPOS DIFERENTES
NO POLARES POLARES NEUTRAS ÁCIDOS BÁSICOS
Ala Asp Ac. Asp Arg
Gly C Ac. Glu His
I Glu Lis
Leu S
M Tre
F Tir
P
W
V
NO POLARES POLARES NEUTRAS ÁCIDOS BÁSICOS
Se encuentran se encuentran en el exterior de proteinas que funcio-
en el interior nan en un ambiente acuoso y en el interior de las
de proteinas proteinas asociadas a membrana.
en ambientes
acuosos y en
las superficies
de las proteinas
que interaccionan
con lipidos.

• Los aminoácidos están unidos por enlaces

peptídicos -COOH + -H N -CO-NH-
» H2
 PROTEINAS

• Niveles de organización:
• ESTRUCTURA PRIMARIA
• ESTRUCTURA SECUNSDARIA
• ESTRUCTURA TERCIARIA
• ESTRUCTURA CUATERNARIA
BIBLIOGRAFÍA