Instituto de Ciencias Naturales
Bioquímica
Clase 3: Estructura de
Proteínas
Síntesis de Contenido
Niveles estructurales:
Las proteínas son heteropolímeros de aminoácidos que tienen una estructura
tridimensional característica. El primer nivel en la arquitectura de las proteínas es la
estructura primaria, que corresponde a la secuencia de aminoácidos en la cadena
proteica, es decir, el número de aminoácidos presentes y el orden en que están
enlazados. La estructura primaria es determinada por la información genética y
establecerá las características de los siguientes nivelesde plegamiento y la función de
la proteína. Este nivel estructural está estabilizado porel enlace peptídico que es un
enlace covalente (fuerte).
La conformación espacial de una proteína se analiza en términos de su estructura
secundaria, la que consiste en el plegamiento local de partes de la cadena de
aminoácidos para adquirir diferentes formas (helicoidal, plegamiento beta, estructura al
azar). Este nivel se estabiliza por puentes de hidrógeno entre el grupo carbonilo y el N-
H de los enlacespeptídicos del esqueleto polipéptidico. Dentro de estas estructuras
se puede destacar las α-hélice, β-plegadas y giros β. Las estructuras
supersecundarias o motivos son combinaciones de varias estructuras secundarias
definidas con una disposición geométrica característica.
Después de que la cadena polipeptídica adopta la conformación secundaria, ésta se
pliega sobre sí misma adoptando una estructura espacial tridimensional que
involucra a la cadena polipeptídica completa, llamada estructura terciaria. Este
nivel se estabiliza por interacciones débiles entre cadenas laterales de los
aminoácidos de la cadena y por enlaces covalentes fuertes de tipo puente disulfuro,
formado entre cisteínas. Al adquirir la estructura terciaria muchas proteínas alcanzan
su funcionalidad.
Para algunas proteínas es necesaria la asociación de varias cadenas polipeptídicas,
iguales o no. Esto origina un nivel superior de organización, la llamada estructura
cuaternaria. Este nivel se estabiliza por interacciones débiles y en algunos casos por
puentes disulfuro entre aminoácidos de distintas cadenas.
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El plegamiento correcto, rápido y eficaz de los polipéptidos recién sintetizados a su
estructura nativa es de vital importancia. Existe una relación directa entre la estructura
primaria de una proteína y su conformación tridimensional final. Una proteína, sin su
estructura nativa:
- No es funcional.
- Tiende a agregarse con otras cadenas polipeptídicas, generando placas insolubles
- Suele ser degradada
- Consume recursos celulares (materia y energía).
¿Cuáles son los efectos del plegamiento incorrecto de proteínas sobre la salud
humana? Una proteína mal plegada no podrá ejercer su función por lo que se pueden
generar un sin número de enfermedades. Estas proteínas mal plegadas tienden a
acumularse en forma de placas insolubles, lo cual es una característica importante de
varias enfermedades neurodegenerativas del ser humano.
En la siguiente tabla se muestran algunos ejemplos de enfermedades asociadas a mal
plegamiento de proteínas
Enfermedad Proteína Afectada Mecanismo
Acumulación de péptido amiloide mal plegado en
Péptido amiloide
(derivado de la
tejido nervioso humano, formando depósitos
Alzheimer conocidos como placas neuríticas.
proteína precursora
amiloide)
Agregación de las proteínas no plegadas. Los
Polineuropatía
nervios y otros órganos son daños por depósitos de
amiloidótica Transtiretina
estos productos proteicos insolubles.
familiar
p53 impide que las células con daños en el ADN se
dividan. Un tipo de mutación en la proteína p53
Cáncer p53 genera un plegamiento incorrecto de la proteína que
es inestable y por lo tanto se destruye.
Las proteína priónica con una conformación alterada
Creutzfeldt-Jacob
(PrPSC) puede generar transiciones
(equivalente a la
Prion conformacionales en proteínas normales PrP (PrPC)
enfermedad de las
vacas locas)
El plegamiento incompleto de las formas mutantes
CFTR (proteína de CFTR, no se disocian libremente de las
reguladora de la
Fibrosisquística chaperonas, impidiendo que los CFTR lleguen a su
conductancia
transmembranal)
destino en la membrana
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Pérdida de la estructura proteica:
La estructura proteica es muy sensible a los factores de entorno. Muchos agentes
físicos y químicos pueden perturbar la conformación nativa una proteína. El proceso
de desorganización de la estructura se le denomina desnaturalización. Dependiendo
del grado de desnaturalización, la molécula puede perder de forma parcial o total su
función biológica. La desnaturalización, con frecuencia da lugar a cambios observables de
las propiedades físicas de las proteínas. Por ejemplo, la albúmina de huevo (la clara)
soluble y transparente se hace insoluble y opaca tras calentarla. Como la gran mayoría de
las desnaturalizaciones, cocinar huevos es un proceso irreversible.
Entre las condiciones desnaturalizantes se encuentran las siguientes:
• Ácidos y bases fuertes: Los cambios de pH dan lugar a la protonación o
desprotonación de algunos grupos de las cadenas laterales de una proteína, lo que
altera las interacciones débiles como puentes de hidrógeno e interacciones iónicas.
• Cambios de temperatura: Al aumentar la temperatura aumenta la velocidad de
vibración moléculas. Con ello se rompen las interacciones débiles como los puentes
de hidrógeno y la proteína se despliega.
• Detergentes: Los detergentes son moléculas anfipáticas que interrumpen las
interacciones hidrofóbicas, haciendo que las proteínas se desplieguen en cadenas
polipeptídicas extendidas.
• Agentes reductores: En presencia de reactivos como la urea, los agentes
reductores (como el β-mercaptoetanol) convierte los puentes disulfuros en grupos
sulfidrilos. La urea rompe los puentes de hidrógeno y las interacciones hidrofóbicas.
• Solventes orgánicos: Los solventes orgánicos hidrosolubles, como el etanol,
interfieren con las interacciones hidrofóbicas, debido a que interactúan con los
grupos de las cadenas laterales no polares y forman puentes de hidrógeno con
elagua y con los otros grupos polares de las proteínas.
• Concentración salina: Cuando la concentración de sal aumenta en una solución
acuosa de proteína, algún de las moléculas de agua que interactúan con los grupos
con carga son atraídos por los iones de la sal. A medida que disminuye el número
de moléculas de solvente disponible. A consecuencia de esto las moléculas
proteicas se agregan y luego precipitan. Debido a que este procedimiento es
reversible, suelo emplearse como un primer paso en la purificación de proteínas
• Iones metálicos pesados: Los metales pesados, como el mercurio (Hg 2+) y el
plomo (Pb2+ ) afectan de varias maneras a la estructura proteica. Pueden romper las
interacciones iónicas e interactuar con los grupos funcionales con carga negativa.
Los metales pesados también pueden formar enlaces con los grupos sulfhidrilos.
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• Agitación vigorosa: La agitación o la trituración rompen las interacciones que
mantienen la estructura de las proteínas.
Conclusiones
✓ Las proteínas son un grupo muy diverso y complejo de macromoléculas que
realizan miles de tareas que sustentan la vida.
✓ Cada proteína tiene una estructura tridimensional característica indispensable
para realizar su función.
✓ Las interacciones débiles (interacciones iónicas, hidrofóbicas y puentes de
hidrogeno) e interacciones fuertes (puente disulfuro) son las fuerzas principales
que mantienen la estructura tridimensional de las proteínas.
✓ Las proteínas poseen una amplia gama de funciones en los seres vivos, cuya
función está estrechamente relacionada con su estructura nativa. Una proteína
que pierde su estructura nativa puede perder leve o totalmente su función.
✓ Las proteínas pueden perder su estructura nativa producto de mutaciones,
envejecimiento molecular o por desnaturalización
Bibliografía
❖ Feduchi, Elena., Blasco, Isabel., Romero, Carlos., Yañez, Ester. Bioquímica:
conceptos esenciales. 1ª Edición. Editorial Médica Panamericana. (2010)
❖ Nelson, David L., Cox, Michael M. Lehninger: Principios de Bioquímica. 5a
Edición, Omega Ediciones S.A (2009).
❖ McKee, Trudy., McKee, James R. Bioquímica: Las bases moleculares de la vida.
5a Edición. Editorial McGraw-Hill Interamericana (2014)
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