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Precursores de macromoléculas
Nucleótidos.
Compuestos formados por una base nitrogenada, un azúcar y uno
o varios grupos fosfatos. La base nitrogenada está unida al azúcar
mediante un enlace ß-N-Glicosídico y el enlace que une a la
pentosa con el grupo fosfato es un éster fosfato. Si el nucleótido
posee más de un grupo fosfato estos se unen entre sí por enlaces
anhídrido de ácido.
Clasificación:
Según su base nitrogenada:
Purínicos (adenina, guanina, hipoxantina).
Pirimidínicos (citocina, timina, uracilo).
Según el tipo de azúcar:
Ribonucleótidos.
Desoxirribonucleótidos.
Según la cantidad de grupo fosfato
Monofosfatado (1).
Difosfatado (2).
Trifosfatado (3).
Características generales:
Solubles en soluciones acuosas por tener grupo amino, ceto,
hidroxilo y fosfato.
Tienen carga negativa por la presencia de grupo fosfato, por lo
que pueden interactuar con proteínas catiónicas.
Por la presencia de átomos de oxígeno y nitrógeno pueden
establecer puentes de hidrógeno.
Pueden formar enlaces éster por los OH del azúcar o por los
grupos fosfatos.
Función:
(Cumplen con el principio de multiplicidad de utilización)
Son precursores de los ácidos nucléicos.
Forman parte de algunos cofactores enzimáticos.
Participan en la transmisión de energía.
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Actúan como activadores o inhibidores en la acción
enzimática.
Monosacáridos.
Son polihidroxialdehídos y polihidroxicetonas. Tienen en común
un grupo carbonilo y una cadena polihidroxilada. El enlace
polimerizante de los monosacáridos es el enlace acetal(enlace
glucosídico) que se establece entre el OH anomérico de un
monosacárido y un OH de otro monosacárido.
Clasificación:
Según la posición del grupo carbonilo:
Aldosas(carbono primario).
Cetosas(carbono secundario).
Según el # de átomos de carbono:
Triosas(3).
Tetrosas(4).
Pentosas(5).
Hexosa(6).
Según la serie estérica:
Serie D(es la que predomina).
Serie L.
Según el tipo de anómero:
o ß.
Funciones:
(cumplen con el principio de multiplicidad de utilización)
Son precursores de los oligosacáridos y polisacáridos.
Se utilizan como fuente de energía.
Forman parte de otros compuestos como glicoproteínas y
glicolípidos.
Carácter reductor:
Cuando se interconvierten aldosas en cetosas o viceversa se forma
un compuesto intermedio denominado enodiol que es una
sustancia reductora y reduce los iones Cu2+ a Cu1+. Esta
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propiedad es la base de la prueba de Benedict que se utiliza para
conocer los niveles de glucosa en orina.
Monosacáridos derivados:
Son aquellos que sufren transformaciones en sus grupos
funcionales.
Ácidos(por oxidación)
Ej. Ácidos aldáricos, urónicos y aldánicos.
Polialcoholes(por reducción)
Ej. Glicerol.
Azúcares aminados(por sustitución del grupo OH por amino)
Ej. D- glucosamina.
Ésteres fosfóricos(por adicción de grupo fosfato)
Ej. Glucosa-6-fosfato.
Aminoácidos.
Son ácidos orgánicos en los cuales al menos un hidrógeno ha
sido sustituido por un grupo amino. En los -aminoácidos el
hidrógeno que se ha sustituido es un H.
Serina.
Con OH.
Treonina.
Cisteina.
Con azufre.
Metionina.
Aspártico.
Con COOH
Glutámico.
Lisina.
Con NH2 Arginina.
Histidina.
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Fenilalanina.
Con anillo aromático. Tirosina.
Triptófano.
Glicina, alanina.
Con cadena hidrocarbonada
Valina, leucina, isoleucina.
Clasificación:
Presencia de grupos ácidos o básicos en la cadena lateral.
Básicos(histidina, lisina, arginina).
Ácidos(aspártico, glutámico).
Neutros(el resto).
Presencia de grupos polares.
Polares.
1. Iónicos(aspártico, glutámico, arginina, lisina e histidina).
2. Poco iónicos (serina, treonina, tirosina, cisteína, triptófano,
asparagina y glutamina).
3. Apolares(glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina,
metionina, fenilalanina y prolina).
Propiedades físicas:
Sólidos cristalinos.
Generalmente solubles en solventes acuosos.
Tienen altos puntos de fusión y ebullición.
Propiedades ópticas:
Todos menos glicina presentan actividad óptica.
Serie estérica L.
Propiedades eléctricas:
Las propiedades eléctricas dependen del estado de disociación de
los grupos disociables que varía en dependencia del PH.
Si ph=pk entonces fd=fnd
Si phpk entonces fdfnd
Si phpk entonces fdfnd
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FND FD
COOH COO + H+
NH3+ NH+ + H+
Si aumenta la concentración de iones hidrógeno, disminuye el ph
favoreciéndose el sentido inverso de la reacción por lo que
predomina COOH y NH3+.
Si disminuye la concentración de iones hidrógeno o aumenta la
concentración de OH, disminuye elph favoreciéndose el sentido
inverso de la reacción por lo que predomina el COO y el NH2.
Punto isoeléctrico: es el ph al cual el aminoácido tiene carga neta
0 y no migra en un campo eléctrico. Es específico para cada
aminoácido.
Si ph=PI el aminoácido tiene carga neta 0 y no migra en el
campo eléctrico.
Si phPI el aminoácido tiene carga neta + y migra al polo –
(cátodo).
Si phPI el aminoácido tiene carga neta – y migra al polo +
(ánodo).
Funciones:
Son precursores de las proteínas y los péptidos.
Algunos son metabolitos intermediarios.
Algunos son neurotrasmisores.
Algunos son antibióticos.
Por descarboxilación se forman las amígenasbiógenas.
Enlace peptídico:
Es una amida sustituída que se forma al reaccionar el grupo
carboxilo de un a.a con el amino de otro a.a. Se pierde una
molécula de H2O.
Es un enlace covalente fuerte y estable.
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Tiene carácter parcial de doble enlace por el fenómeno de
resonancia, por lo tanto no presenta libertad de giro. Los
átomos del grupo peptídico están en un mismo plano.
La libertad de giro se produce a nivel de los enlaces del
carbono .
Interacciones entre los a.a:
Entre un a.a ácido y a.a básico - Puente salino.
Entre dos a.a con cadenas hidrocarbonadas - Interacción
hidrofóbica.
Entre un a.a básico y a.a con OH - Puente de H.
Entre un a.a ácido y a.a con OH - Puente de H.
Entre dos a.a con OH - Puente de H.
Entre dos a.a con azufre - Enlace disulfuro.
Entre dos a.a con anillo aromático - Fuerzas de Van Der
Waals(fuerzas de apilamiento).
Características generales de las macromoléculas.
1. Elevado peso molecular: Velocidad de difusión lenta, no
dializan y tienen alta velocidad de sedimentación.
2. Carácter polimérico: Un polímero es una sustancia que se
forma por la unión de varias moléculas más pequeñas llamadas
monómeras.
3. Carácter uniforme: Cada biomolécula se forma por la
polimerización de precursores de la misma clase por lo que el
enlace polimerizante es el mismo en cada macromolécula.
4. Carácter lineal: Está presente cuando hay ausencia de
ramificaciones.
5. Carácter tridimensional: Las macromoléculas existen en 3
dimensiones y para estudiar la estructura de las
macromoléculas se dividen en niveles de organización:
- Nivel primario: Orden o secuencia de los precursores en la
cadena polimérica. Se mantiene estable por el enlace
polimerizante. Es el más estable.
- Nivel secundario: Forma que adopta la cadena en pequeños
sectores de la misma. Se estabiliza por interacciones débiles.
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- Nivel terciario: Es la estructura tridimensional total de la
macromolécula. Está estabilizado por interacciones débiles
(puentes de H, puentes salinos y fuerzas de Van Der Waals).
- Nivel cuaternario: Solo existe en las proteínas oligoméricas
que son las que tienen más de una cadena polipeptídica. Está
estabilizado por interacciones débiles.
6. Carácter informacional: La información molecular está
relacionada con la variedad estructural y permite la realización
de interacciones específicas entre diferentes macromoléculas.
Existen 2 tipos de información, la secuencial y la
conformacional.
-La inf. Secuencial está contenida en la estructura primaria de las
macromoléculas con secuencias irregulares o variadas. Tiene
como función la de construir los niveles superiores, no permite
que se realicen interacciones específicas en el espacio ya que
aparece de forma lineal y determina la información
conformacional.
-La información conformacional está contenida en la estructura
tridimensional de las macromoléculas, es decir, en la
conformación general de la macromolécula. Permite establecer
interacciones específicas en el espacio y tiene carácter funcional.
Un fenómeno que está ligado a la información conformacional es
el de RECONOCIMIENTO MOLECULAR que se define como
la interacción específica entre una macromolécula y una
biomolécula que se le denomina ligando. El reconocimiento
molecular se lleva a cabo en un sitio específico que se conoce
como sitio de reconocimiento.
7. Tendencia a la agregación: las macromoléculas tienden a
agregarse unas con otras formando grandes estructuras
supramoleculares con una gran complejidad estructural y
funcional. Estas asociaciones pueden realizarse de forma
covalente o no y no contradice el carácter de uniformidad pues
las macromoléculas que se asocian no lo hacen con
interrupción del eje covalente principal, sino que emplean
grupos químicos laterales para el enlace.
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8. Relación estructura – función: se plantea que en las
macromoléculas la función está directamente relacionada con
la estructura.
Glucógeno.
Composición elemental: CHO.
Precursor: -D-glucosa.
Enlace polimerizante: 1-4 y1-6 en las ramificaciones.
Elevado peso molecular: si.
Carácter polimérico: si.
Carácter uniforme: si.
Carácter lineal: no está presente ya que existen ramificaciones
cada 8 a 12 residuos de glucosa.
Carácter tridimensional: si. Presenta una estructura globular.
Carácter informacional: no existe porque hay monotonía
estructural ya que solo hay -D-glucosa.
Relación estructura-función: por la presencia de ramificaciones
en un menor volumen se puede almacenar gran cantidad de
glucosa y además aportan un mayor número de sitios para la
acción de las enzimas. Es la forma de almacenar glucosa en los
animales.
Almidón.
Composición elemental: CHO.
Precursor: -D-glucosa.
Enlace polimerizante: 1-4 y1-6 en las ramificaciones.
Elevado peso molecular: si.
Carácter polimérico: si.
Carácter uniforme: si.
Carácter lineal: no está presente ya que existen ramificaciones
cada 24 a 30 residuos de glucosa.
Carácter tridimensional: si. Presenta una estructura globular.
Carácter informacional: no existe porque hay monotonía
estructural ya que solo hay -D-glucosa.
Relación estructura-función: por la presencia de ramificaciones
en un menor volumen se puede almacenar gran cantidad de
glucosa y además aportan un mayor número de sitios para la
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acción de las enzimas. Es la forma de almacenar glucosa en los
vegetales.
Celulosa.
Composición elemental: CHO.
Precursor: -D-glucosa.
Enlace polimerizante: 1-4.
Elevado peso molecular: si.
Carácter polimérico: si.
Carácter uniforme: si.
Carácter lineal: si hay porque no presenta ramificaciones.
Carácter tridimensional: si. Presenta una estructura fibrosa.
Carácter informacional: no existe porque hay monotonía
estructural ya que solo hay -D-glucosa.
Relación estructura-función: las cadenas de celulosa se
entrecruzan mediante puentes de hidrógeno formando fibras
resistentes a la tensión. Además el enlace 1-4 le brinda
rigidez a la molécula.
Proteínas.
Composición elemental: CHONS.
Precursor: L--aminoácidos.
Enlace polimerizante: peptídico.
Elevado peso molecular: si.
Carácter polimérico: si.
Carácter uniforme: si.
Carácter lineal: si hay porque no presenta ramificaciones.
Carácter tridimensional: el nivel primario es la secuencia de
los a.a en la cadena polipeptídica, el secundario es el
ordenamiento regular de determinados sectores de la cadena el
cual está estabilizado por puentes de hidrógeno y el nivel
terciario consiste en la disposición tridimensional de la cadena
polipeptídica y está estabilizado por interacciones débiles. El
nivel cuaternario solo está presente en proteínas con más de
una cadena polipeptídica y está estabilizado por interacciones
débiles, consiste en la asociación de las cadenas polipeptídicas.
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Carácter informacional: existe carácter informacional porque
hay diversidad estructural ya que las proteínas pueden estar
formadas hasta por 20 a.a que al combinarse dan lugar a
secuencias variadas que contienen la información secuencial.
En dependencia de las secuencias serán las interacciones que
se establezcan y la conformación tridimensional de la proteína.
Tipo de información que predomina: Conformacional.
Relación estructura-función: en la conformación tridimensional
aparecen hendiduras, hoyos y otras estructuras que permiten
que la proteína interactúe con otras biomoléculas mediante el
reconocimiento molecular, permitiendo que la proteína realice
una función específica.
ADN
Precursor: desoxirribonucleótidos de adenina, timina, guanina
y citosina.
Elevado peso molecular: si.
Carácter polimérico: si.
Carácter uniforme: si.
Carácter lineal: si.
Carácter tridimensional:
- nivel primario: orden o secuencia de los desoxirribonucleótidos
en la cadena polinucleotídica.
- Nivel secundario: (Modelo de Watson y Crick)
La molécula de ADN está formada por 2 cadenas poliméricas
de desoxirribonucleótidos que se enrollan alrededor de un eje
con giro a la derecha.
Las cadenas tienen posición antiparalela y una envuelve a la
otra y para separarlas hay que desenrollar la doble hélice.
Las bases nitrogenadas se disponen hacia el centro de la hélice
y el eje pentosa fosfato hacia la periferia.
Cada base nitrogenada se aparea mediante puente de hidrógeno
con la base nitrogenada correspondiente de la cadena opuesta
y forman un par de bases casi perpendicular al eje de la hélice.
Entre una base nitrogenada y otra se establecen fuerzas de
apilamientos.
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En la superficie de la molécula existen 2 surcos, el mayor de
180° y el menor de 180°. Las proteínas interactúan por el
surco mayor.
Carácter informacional: existe porque hay diversidad
estructural.
Tipo de información que predomina: Secuencial.
Relación estructura-función: la función de conservar la
información genética está dada por la disposición de las BN
hacia el centro y el echo de que una cadena envuelva a la otra
lo que contribuye al empaquetamiento de la molécula y a la
protección de las BN. La función de trasmitir la información
genética está dada por la complementariedad de bases.
ARN de transferencia.
Precursor: ribonucleótidos de adenina, uracilo, guanina y
citosina.
Elevado peso molecular: si.
Carácter polimérico: si.
Carácter uniforme: si.
Carácter lineal: si.
Carácter tridimensional:
- Nivel primario: orden o secuencia de los ribonucleótidos en la
cadena polinucleotídica.
- Nivel secundario: presenta una forma de hoja de trébol. El
extremo 5´ está apareado y el extremo 3´ no está apareado y
presenta la secuencia CCA.
- Nivel terciario: tiene forma de L invertida y está estabilizado
por puentes de hidrógeno.
Carácter informacional: existe carácter informacional ya que
están formados por ribonucleótidos que al combinarse forman
secuencias variadas que contienen la información
secuencial(anticodón).
Tipo de información que predomina: Conformacional que está
contenida en la estructura tridimensional que tiene forma de L
invertida cuando se pliega la molécula.
Relación estructura –función: uno de los extremos dela L
invertida contiene la secuencia CCA que le permite interactuar
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con a.a y el extremo que contiene al anticodón permite la
interacción con el codón del ARN mensajero.
ARN mensajero.
Precursor: ribonucleótidos de adenina, uracilo, guanina y
citosina.
Elevado peso molecular: si.
Carácter polimérico: si.
Carácter uniforme: si.
Carácter lineal: si.
Carácter tridimensional: en eucarionte tiene modificado el
extremo 5´ por la adición de un nucleótido de 7 metilguanina y
el extremo 3´ tiene una cola de poliadenina.
Carácter informacional: existe porque los ARN mensajeros
están formados por ribonucleótidos que al combinarse forman
secuencias variadas que contienen la información
secuencial(codón). La información conformacional está
contenida en la estructura tridimensional.
Tipo de información que predomina: Secuencial.
Relación estructura-función: el codón es la unidad informativa
porque en dependencia del codón será el a.a que se incorpore a
la cadena polipeptídica. Además existe codones de inicio y
terminación de la síntesis de proteínas.
ARN ribosomal.
Carácter informacional: está dado por la presencia de los
ribonucleótidos que forman secuencias variadas que contienen
la información secuencial. La información conformacional está
contenida en la estructura tridimensional.
Tipo de información que predomina: Conformacional.
Relación estructura-función: forman parte de los ribosomas.
Biocatalizadores.
Mecanismo básico de acción de las enzimas.
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1era etapa: el sustrato se une a la enzima y forma el complejo
enzima-sustrato. Esta etapa es reversible y se conoce como
ETAPA DE UNIÒN. Depende de la complementariedad espacial
(la estructura del CA y del sustrato deben ser complementarias) y
complementariedad química (en el CA deben existir grupos que
puedan interactuar con los grupos químicos del sustrato).
2da etapa: transformación del sustrato obteniéndose el producto
y la enzima libre que puede comenzar el proceso de catálisis. Es
un proceso irreversible y se le conoce como
ETAPA DE TRANSFORMACIÒN.
Características del centro activo.
Constituye una pequeña porción del volumen total de la
enzima.
Se encuentra en la superficie lo que facilita el acceso del
sustrato.
Es una entidad tridimensional que generalmente tiene forma de
cavidad y seque resulta del plegamiento de la cadena
polipeptídica cuando se forma la estructura terciaria.
Los a.a que forman el CA no necesariamente se encuentran
adyacentes. El acercamiento ocurre cuando se pliega la cadena
polipeptídica.
Hay presencia de grupos químicos que tienen una orientación
específica permitiendo que la unión E-S sea íntima.
Componentes del centro activo.
1. Eje peptídico.
2. Grupos de ambientación.1era etapa (Unión).
3. Grupos de fijación.
4. Grupos catalíticos.2da etapa (Transformación)
El eje peptídico está relacionado con la complementariedad
espacial. Está formado por la parte monótona de la cadena
polipeptídica que al plegarse contribuye a dar la forma
tridemensional del CA.
Los grupos de ambientación son los que están presentes en
las cadenas laterales de los a.a polares. Impiden la entrada de
agua al CA por lo que se refuerzan las interacciones que se
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establecen entre la enzima y el sustrato. (Cria un centro
hidrofobico)
Los grupos de fijación son los que están presentes en las
cadenas laterales de los a.a e interactúan de manera específica
con los grupos químicos del sustrato. Permiten la unión de la
enzima con el [Link] puentes de hidrógeno orienta al
sustrato a su entrada al CA.
Los grupos catalíticos son los responsables de la
transformación del sustrato. No están relacionados con el
reconocimiento molecular.
Existen 2 hipótesis que explican la unión del sustrato a la
enzima:
Llave y cerradura.
Plantea que la estructura del CA y del sustrato es complementaria
aún
cuando estos no se hayan unido.
Adaptación inducida.
Plantea que la estructura del CA es complementaria a la del
sustrato solo cuando este ya esté unido al CA. A medida que el
sustrato va penetrando al CA, la estructura de este sufre un
cambio conformacional y adopta la estructura complementaria del
sustrato.
Agentes modificadores del centro activo:
Los que modifican la estructura tridimensional del CA.
Provocan una distorsión del CA lo que afecta la actividad
enzimática. Ej. Agentes desnaturalizantes.
Los que alteran la distribución de las cargas eléctricas de la
enzima. Modifican la actividad enzimática. Ej. Ph(varía el
estado de disociación de los grupos disociables)
Los que son análogos del sustrato. Son sustancias
generalmente similar al sustrato y se unen al CA impidiendo la
unión del sustrato al CA, por lo tanto, hay pérdida de la
actividad enzimática.
Los que modifican los grupos químicos del CA. Ej. Sustratos
suicidas que se quedan unidos al CA lo que provoca una
pérdida de la actividad enzimática.
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Especificidad de la enzimas.
Especificidad de sustrato.(absoluta o relativa).
Al CA se puede unir un sustrato o un # pequeño de ellos con
estructura similar.
Especificidad de acción.
La enzima cataliza solo una de las posibles transformaciones del
sustrato.
Principio de máxima eficiencia: las reacciones catalizadas por
enzimas rinden el # máximo de moléculas del producto sin que
se obtengan productos secundarios.
CINÈTICA ENZIMÀTICA.
Factores que afectan la velocidad de la reacción:
1. Concentración de la enzima.
2. Concentración del sustrato.
3. Ph.
4. Temperatura.
5. Activadores.
6. Inhibidores.
7. Concentración de los cofactores.
Concentración de la enzima.
La relación entre la velocidad de la reacción y la concentración
de enzima es que son directamente proporcionales, es decir, a
medida que aumenta la concentración de enzima aumenta la
velocidad de la reacción.
Cuando aumenta la concentración de enzimas se favorece la
formación del complejo enzima – sustrato por lo que aumenta
la velocidad de la reacción.
Vo
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Concentración de la enzima.
Concentración del sustrato.
Al inicio al aumentar la concentración del sustrato aumenta en
la misma medida la velocidad de la reacción, luego al seguir
aumentando la concentración de sustrato aumenta la velocidad
de la reacción pero no en la misma medida hasta que la
velocidad de la reacción se hace prácticamente constante.
La Vm se alcanza cuando se saturan las enzimas, es decir,
cuando todos los centros activos han sido ocupados por el
sustrato. A este fenómeno se le conoce como efecto de
saturación.
Los parámetros cinéticos de la ecuación de Michaelis-Menten
son la Vm y la Km.
La Km es la constante de disociación del complejo enzima-
sustrato y es una medida de la afinidad de la enzima por el
sustrato, es por esto que se puede decir que a poca afinidad
mayor Km y a gran afinidad menor Km.
La Km se puede interpretar como la concentración de sustrato
a la cual se alcanza la mitad de la velocidad máxima(Vm).
Km = ESVo
ES
Vm
Vm/2
Km concentración
sustrato.
Ph.
En la zona central de la campana se encuentran los valores
máximos de la velocidad de la reacción.
El Ph óptimo es al cual se alcanza la mayor velocidad de la
reacción y al cual la enzima tiene su conformación más activa.
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A valores extremos de Ph como 0 y 14 la velocidad de la
reacción disminuye considerablemente ya que la enzima se
desnaturaliza.
El Ph afecta el estado de disociación de los grupos disociables.
Vo
Ph óptimo. Ph.
Temperatura.
El aumento de la temperatura refleja un aumento de la energía
cinética de las moléculas lo que provoca un aumento de los
choques entre las moléculas de la enzima y el sustrato.
A temperaturas muy elevadas disminuye la velocidad de la
reacción porque la enzima se desnaturaliza.
Activadores.
Estimulan la velocidad de la reacción y generalmente son iones
inorgánicos y no necesariamente están presentes.
Cofactores.
Son compuestos que requieren las enzimas para poder producir
la reacción.
Inhibidores.
Competitivo: es un análogo del sustrato y se une al centro
activo y lo mantiene ocupado impidiendo la unión del sustrato
al centro activo. La km aumenta. Cuando aumenta la
concentración del sustrato este desplaza al inhibidor
competitivo y se logra alcanzar la Vm. [Link], metrotrexate
y malonato.
No competitivo: no tienen una estructura similar a la del
sustrato, por lo tanto no impide la unión del sustrato al centro
activo. Se une a la enzima por un sitio diferente al centro
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activo provocando un cambio en la conformación del CA
impidiendo la transformación del sustrato. La Km no varía ya
que el sustrato se sigue uniendo a la enzima pero la Vm
disminuye porque se afecta la capacidad catalítica de la
enzima. Ej. Iodoacetato.
Regulación enzimática.
Regulación enzimática: posibilidad que tienen las enzimas de
variar la velocidad de la reacción que catalizan en respuesta a
cambios que se producen en el medio.
Regulación.
Variación de la Vr.
Cambios cuantitativos.
Cambios cualitativos.
Cantidad de enzima.
Actividad enzimática.
Inducción Represión
Enzimática. Enzimática.
Presencia de una sustancia en Presencia de una sustancia
en el medio que
el medio que aumenta la síntesis disminuye la síntesis de
enzimas.
de las enzimas.
Regulación alostérica.
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Gráfico de aspecto sigmoidal.
Menor gasto de energía.
Las enzimas tienen otro sitio de reconocimiento además del
centro activo llamado sitio alostérico.
Está presente el fenómeno de cooperatividad.
El efector se une a la enzima por fuerzas no covalentes.
Los estados conformacionales están en equilibrio.
No existe el fenómeno de amplificación.
Regulación por modificación covalente.
Gráfico en forma de hipérbola.
Mayor gasto de energía.
Se requiere de una pareja de enzimas para el paso de una
enzima a la otra.
El sitio de modificación covalente no es un sitio de
reconocimiento molecular.
El efector(grupo fosfato) se une al sitio de modificación
covalente por fuerzas covalentes.
La composición química de los estados conformacionales es
diferente.
Se dá el fenómeno de amplificación.
Semejanzas:
Existen 2 estados conformacionales interconvertibles con
diferente actividad y afinidad por el sustrato.
Las enzimas se ubican generalmente en el inicio de las vías
metabólicas y esto hace que las enzimas cumplan con el
principio de máxima economía que plantea que la célula utiliza
la cantidad indispensable de sustancia y energía para su
funcionamiento.
Son mecanismos de regulación enzimática por modificación de
la actividad de las enzimas.
Regulación alostérica:
Existe cooperatividad cuando la unión de un ligando a la
enzima influye sobre la unión posterior de otros ligandos. Es
positiva cuando al unirse el primer ligando aumenta la afinidad
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de la enzima por otros ligandos y es negativa cuando al unirse
el primer ligando disminuye la afinidad.
Efecto homotrópico: cuando la unión del primer ligando
influye sobre la unión posterior del mismo ligando.
Efecto heterotrópico: cuando la unión del primer ligando
influye sobre la unión posterior de otros ligandos.
Modelo que explica las enzimas alostéricas: Simétrico o
concertado.
- Plantea que las enzimas alostéricas existen en 2 estados
conformacionales interconvertibles que están en equilibrio: R y
T.
- Plantea que las enzimas alostéricas son proteínas oligoméricas.
- Es simétrico porque todas las subunidades están en el mismo
estado conformacional.
- Es concertado porque el paso de un estado conformacional a
otro en una subunidad es trasmitido al resto de las subunidades
de manera que todas adoptan el mismo estado.
- Este modelo no permite formas híbridas.
Las enzimas alostéricas tienen además del centro activo otros
sitios específicos con una conformación específica que
permite que los ligandos se unan a 1 de los 2 estados
conformacionales. Estos sitios alostéricos son sitios de
reconocimiento molecular en el que el ligando se une mediante
fuerzas no covalentes y de manera reversible. Cuando se une
el ligando no ocurre transformación.
Regulación por modificación covalente.
Para que la enzima pase de una forma a la otra requiere de la
formación o ruptura del enlace covalente.
Para que la enzima pase de una forma a otra se requiere de una
pareja de enzimas, una que anade el grupo químico y la otra
que lo elimine.
Los estados conformacionales se diferencian en su actividad de
manera que un estado es más activo que otro.
Existe amplificación cuando a partir de una senal metabólica la
intensidad de la respuesta que se obtiene es mucho mayor que
la del estímulo. Esto se debe a que los intermediarios son
enzimas.
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Cofactores enzimáticos.
Son moléculas de bajo peso requeridas por muchas enzimas en el
desarrollo de la reacción.
Inorgánicos:
- Cationes divalentes. Ej.Ca2+, Mg2+, Mn2+, Fe2+ y Zn2+.
- Cationes monovalentes. Ej. K+.
- Aniones. [Link]-.
Orgánicos(coenzimas):
- Atendiendo a la fortaleza con que se unen a la enzima se
clasifican en coenzimas que se unen débilmente y grupos
prostáticos que se unen fuertemente mediante enlace covalente.
- Moléculas inorgánicas con propiedades físico-químicas
específicas. No están unidos a la cadena polipeptídica y actúan
junto a las enzimas en la reacción.
Función de los cofactores inorgánicos:
Contribuyen a la unión del sustrato a la enzima. Ej. Mg2+ en
las quinasas.
Estabilizan la enzima en su conformación más activa. Ej. Ca2+
en las lipasas.
Constituyen en ocasiones el centro catalítico principal y al
unirse a la enzima favorecen la reacción y adquieren
especificidad. Ej. Fe2+ en las oxidoreductasas.
Función de los cofactores orgánicos:
Transportan parte del sustrato que puede ser electrones, átomos
o grupos funcionales.
Son interenzimáticos los que transportan parte del sustrato de
una enzima a otra y esta es la forma de actuar más común de
las enzimas orgánicas.
Son intraenzimáticos los que transportan parte del sustrato de
un sitio a otro dentro de la misma enzima. Son grupos
prostéticos.
Nucleótidos de piridina.
1. NAD+.
2. NADP+.
Tienen en su estructura nicotidamina que es la parte funcional y
vitamina del complejo B.
22
Están formados por un nucleótido de nicotidamina y otro de
adenina unido por un enlace anhidrido de ácido. El NADP+
tiene también un grupo fosfato.
Participan en las reacciones de oxidación - reducción que son
catalizadas por deshidrogenasas.
Actúan con enzimas que sustraen 2 átomos de hidrógeno
directa o indirectamente unidos al mismo átomo de carbono.
El NAD+ generalmente participa en la oxidación de sustratos
en vías catabólicas por lo que se considera una coenzima
eminentemente catabólica.
El NADP+ actúa generalmente en la reducción de sustratos en
vías anabólicas por lo que se considera una coenzima
eminentemente anabólica.
El NAD+ participa en la oxidación de alcoholes a aldehidos o
cetonas.
Nucleótidos de flavina.
1. FAD.
2. FMN.
La parte funcional es el anillo de isoaloxacina.
El FAD está formado por un nucleótido de flavina y otro de
adenina unidos por un enlace anhídrido de ácido.
El FMN está formado por un nucleótido de flavina.
Participan en las reacciones de oxidación reducción catalizadas
por deshidrogenasas y oxidasas.
Actúan con coenzimas que sustraen 2 átomos de hidrógeno
unidos a carbonos adyacentes.
El FAD participa en la oxidación de alcanos a alquenos.
Coenzima A.(CoASH)
Presenta en su estructura al ácido pantolénico que es una
vitamina del complejo B, AMP y mercaptoetilamina.
El grupo funcional es el sulfidrilo.
Participa en las reacciones de transferencia de grupo acilo.
ATP
Está formado por una adenina, azúcar tipo ribosa y 3 grupos
fosfatos.
23
No posee vitamina en su estructura.
Son fuente de energía por la presencia de enlaces anhidrido
fosfórico que cuando se rompen liberan energía.
Son fuente de elementos estructurales cuando aparece en el
producto un elemento de la estructura del ATP.
Componentes celulares: estructura de las membranas
biológicas.
Lípidos de membrana.
Los lípidos que se encuentran formando parte de las membranas
presentan la propiedad de ser anfipáticos debido a la presencia en
la estructura de una porción polar y otra apolar.
1. Esfingolípidos.
a) Fosfatados: la porción polar es la fosfocolina y la apolar la
ceramida. Ej. Esfingomielina.
b) No fosfatados: la porción polar es el glúcido y la apolar la
ceramida.
Ej. Glicoesfingolípidos(cerebrósidos, sulfátidos y
gangliósidos).
2. Fosfolípidos.
Son anfipáticos.
La porción polar es el grupo fosfato más un grupo polar y la
porción apolar es la cola hidrofóbica.
3. Colesterol.
Tienen carácter anfipáticos.
La porción apolar es el OH de la posición 3 y la porción apolar
el anillo de ciclopentanoperhidrofenantreno.
4. Triacilglicéridos.
No tienen cabeza polar.
Los ácidos grasos forman parte de los fosfolípidos, los
esfingolípidos y los triacilglicéridos. Los saturados son el ácido
palmático y esteárico y los insaturados tienen doble enlace.
Teniendo en cuenta el carácter anfipático de los lípidos estos se
disponen en forma de bicapa. La cabeza polar se dispone hacia la
superficie y la cola hidrofóbica hacia el interior.
24
Interactúa con el solvente mediante Interactúan
mediante fuerzas de
puentes de hidrógeno o interacciones Van
derWaalls e interacciones
ión-dipolo. Una cabeza interactúa con hidrofóbicas.
otra mediante unión salina o pte de H.
Características de la bicapa lipídica:
La bicapa lipídica es asimétrica porque la composición de la
capa externa e interna es diferente. En la capa interna
predominan la fosfatidilserina yfosfatidiletanolamina y en la
capa externa predominan la fosfatidil colina y la
esfingomielina.
La bicapa es una estructura fluida y la fluidez depende de la
longitud de los ácidos grasos y del grado de insaturación de
estos. Aumenta la fluidez cuando más cortos y más insaturados
sean los ácidos grasos.
La presencia de colesterol contribuye a la fluidez de la bicapa.
La bicapa se comporta como una barrera permeable para las
sustancias lipídicas e impermeable para los iones y compuestos
polares excepto el agua.
Forman compartimientos cerrados y si se producen
alteraciones en la bicapa estas pueden autorepararse.
Proteínas de membranas.
1. Integrales o intrínsecas.( 70% ).
Están incluidas total o parcialmente en la bicapa.
Cuando están incluidas totalmente se llaman proteínas
transmembranales.
La porción que queda fuera de la bicapa presenta un elevado
contenido de a.a polares y la porción contenida en la bicapa
presenta un elevado contenido de a.a apolares.
Función:
- Contribuyen a la organización estructural de la membrana.
- Manifiestan diversas actividades como enzimas y como
transportadoras o formadoras de canales.
25
- Tienen función de receptores de membrana, capaces de
interactuar con ligandosespecífícos por medio del
reconocimiento molecular.
2. Periféricas o extrínsecas.
Se disponen en la superficie interna o externa de la bicapa.
Presentan un elevado contenido de a.a polares.
Contribuyen a la organización estructural de la membrana y
pueden actuar como enzimas.
Glúcidos de membrana.
Constituyen del 2 al 10%.
Se presentan en forma de oligosacáridos que están unidos
covalentemente a lípidos y sobre todo a proteínas formándose
glicolípidos y glicoproteínas.
Se disponen hacia la cara citoplasmática de la membrana.
Función:
- Contribuyen a la organización estructural de la membrana.
- Intervienen en las interacciones entre las membranas celulares.
- Confieren propiedades antigénicas a las membranas.
Modelo del mosaico fluido.
Plantea que la bicapa lipídica es la estructura básica de la
membrana y que las proteínas se disponen en forma de
mosaico.
Plantea que las membranas son estructuras fluidas y el grado
de fluidez influye en las funciones de la membrana.
Plantea que las proteínas realizan movimientos de traslación en
la bicapa y que existe asimetría en la disposición de lípidos,
proteínas y sobre todo de los glúcidos.
Funciones de la membrana lipídica.
Delimita la célula y la interrelaciona con otras.
Presenta permeabilidad selectiva; permiten el paso libre de
algunas sustancias e impiden el de otras según el tamano y la
solubilidad.
Participan en los mecanismos mediante los cuales la célula
secreta y expulsa sustancias al exterior.
Trasmiten ondas exitatorias a células vecinas como respuesta
de algunas senales.
26
Reciben senales del medio a través de las proteínas receptoras
de membranas.
Participan en el transporte selectivo de sustancias entre la
célula y el medio.
Incorporan grandes moléculas mediante el mecanismo de
fagocitosis.
Confieren especificidad antigénica a la célula.
HASTA AQUÍ LLEGA EL RESUMEN
Transporte de sustancia a través de las membranas.
Difusión simple.
Se transportan sustancias apolares y algunas polares como al
glicerol y el urea.
Se mueven a favor del gradiente de concentración y no
requieren de transportador.
No se requiere de energía.
La difusión de produce hasta que se igualan las
concentraciones de la sustancia a ambos lados de la membrana.
El flujo neto se hace 0 porque la misma cantidad de sustancia
que entra es la cantidad de sustancia que sale.
velocidad
DS
Son directamente proporcionales.
Gradiente de concentración.
Ósmosis.
Lo que se mueve no es la sustancia sino el agua que se
desplaza del compartimiento menos concentrado al más
concentrado.
Cuando se igualan las concentraciones a los lados de la
membrana el flujo neto se hace 0.
La presión osmótica es la fuerza que se ejerce en el
compartimiento más concentrado para impedir el paso de agua
hacia él.
27
Existen sustancias que se mueven a través de los espacios que
delimitan poros y membranas mediante un mecanismo similar a la
difusión simple. Los poros delimitan espacios mayores con
respecto a los canales y son menos selectivos. La selectividad de
los canales depende del tamano y la carga de la sustancia que lo
atraviesa.
Los poros siempre están abiertos y la apertura y cierre de los
canales depende de la unión de ligandos específicos o de otras
senales.
Transporte pasivo.
Se transportan sustancias polares.
Se requiere de un transportador.
No se requiere de energía porque la sustancia se mueve a favor
del gradiente de concentración.
Los transportadores que intervienen en este transporte pasivo
se le llaman Permeasas:
- Son proteínas transmembranales.
- Tienen un sitio de reconocimiento molecular mediante el cual
interactúan con la sustancia que van a transportar.
- Está presente el efecto de saturación.
- Está presente el fenómeno de inhibición competitiva.
- No transforman a la sustancia que se une.
- Cuando transporta una sustancia se le llama al proceso uniporte
y cuando el paso de una sustancia depende del transporte
simultáneo de otra sustancia se le llama al proceso cotransporte
que es simporte cuando las 2 sustancias se transportan en el
mismo sentido y antiporte cuando se transportan en sentidos
contrarios.
La sustancia el liberada cuando se produce un cambio
conformacional en la permeasa.
velocidad
TP
28
Gradiente de concentración.
Transporte activo.
Se transportan iones y sustancias polares.
Se requiere de un transportador(bombas).
Ocurre en contra del gradiente de concentración por lo que se
requiere energía.
Debido a la diferencia de la concentración de iones a ambos
lados de la membrana se crea una diferencia de potencial
electroquímico.
Esta diferencia es mantenida por el transporte activo.
Un ejemplo típico lo constituye la ATPasa dependiente de
Na2+ y K+ cuya función es extraer 3 iones Na2+ e incorporar
2 iones K+. Tiene 2 cadenas y 2 cadenas en las que se
encuentran los sitios de unión del ATP.
Para que se produzca el transporte es necesario un cambio de la
conformación de la ATPasa que está dado por la fosforilación-
desfosforilación.
Potencial de membrana en reposo.
Diferencia de potencial electroquímico producido por la
diferencia de concentración de iones, donde el interior de la
célula es más negativo que el exterior. Esta diferencia se debe
en gran medida al funcionamiento de las bombas en particular
a la ATPasa dependiente de Na2+ y K+ ya que provoca en su
acción un desbalance instantáneo de cargas por la salida de 3
iones Na2+ y la entrada de 2 de potasio.
Factores que contribuyen al PMR:
ATPasa dependiente de sodio y potasio ya que extrae 3 iones
sodio y solo incorpora 2 iones potasio.
Canales de fuga de potasio ya que permiten la salida de potasio
al exterior.
Proteínas intracelulares que poseen carga negativa.
Condiciones en las que puede variar el PMR:
Entrada de sodio por sus canales lo que provoca la
despolarización de la membrana.
29
Entrada de Cl- lo que provoca que el interior se haga más
negativo y que ocurra una hiperpolarización de la membrana.
Salida de potasio lo que provoca una hiperpolarización de la
membrana y que el interior se haga más negativo.
Estos cambios están relacionados con la transmisión del impulso
nervioso.
Receptores de membrana.
Son proteínas transmembranales.
En su estructura presentan 3 dominios: dominio extracelular,
dominio transmembranal y dominio intracelular,
citoplasmático o citosólico.
Presentan un sitio de reconocimiento que permite la interacción
con un ligando.
Captan señales externas y permiten que la célula den respuesta
a los cambios que ocurren en el medio.
Tipos:
- Con actividad enzimática de: tirosina quinasa, serina/treonina
quinasa y tirosina fosfatasa.
- Que son canales iónicos.
- Que promueven la endocitosis del ligando.
- Que modifican la actividad de factores de transcripción.
- Acoplados a proteínas G.
Núcleo celular.
Envoltura nuclear.
Está formada por la envoltura nuclear interna y externa y por el
espacio que hay entre ellas llamado espacio perinuclear.
Está atravesada en determinadas regiones por los poros
nucleares los cuales comunican el núcleo con el citoplasma.
La membrana externa se continúa con el RER.
Unido a la membrana interna se encuentran proteínas y se le
conoce como lámina nuclear que está formada por proteínas,
laminina A y E, las cuales intervienen en los mecanismos de
agregación y desagregación de la envoltura nuclear mediante la
mitosis. Estas proteínas se regulan por modificación covalente.
La lámina nuclear se relaciona con la membrana interna y con
la cromatina.
30
El complejo del poro nuclear está formado por varias proteínas
llamadas nucleoporinas.
Por el poro nuclear pasan las histonas, las proteínas
ribosomales, enzimas y proteínas que se utilizan en la síntesis y
procesamiento del ADN y ARN; desde el citoplasma al
núcleo.
Del núcleo al citoplasma pasan ARN mensajero, de
transferencia y ribosomas.
Nucleolo.
En él se sintetizan los ARN ribosomales y se ensamblan los
ribosomas.
Se pueden sintetizar los ARN ribosomales porque se
encuentran los organizadores nucleares que contienen la
información que permite la síntesis de los ARN ribosomales.
Existen 2 zona, la central(fibrilar) donde ocurre la
transcripción y la periférica(granular) donde se asocian los
ARN ribosomales con las proteínas ribosomales formando las
subunidades ribosomales.
El nucleoplasma es la continuación del citoplasma y al
esqueleto se le conoce como carioesqueleto donde están
suspendidos el material genético y los componentes que se
requieren en la síntesis y procesamiento del ADN y ARN.
Organización del material genético en la célula eucariota.
Consiste en la asociación del ADN con proteínas, muchas de las
cuales son histonas. Las histonas son ricas en carga negativa y
reaccionan con los grupos fosfatos del ADN mediante un puente
salino.
Cromatina.
Se encuentra desenrollada.
Su grado de condensación y empaquetamiento es menor con
respecto al de los cromosomas.
Aparece en la interfase.
Uno de los niveles de organización de la cromatina es el
nucleosoma que está formado por ADN-histonas.(H1, H2A,
H2B, H3 y H4).
31
El nucleosoma está formado por un octámero de histonas(2
H2A,2 H2B,2 H3, 2 H4)
El ADN se enrolla alrededor del octámero de histonas para
formar el nucleosoma.
Los extremos que entran y salen del nucleosoma interactúan
con H1.
Las histonas son ricas en residuos de lisina y arginina por lo
que tienen abundante carga positiva.
Cromosomas.
Tienen mayor grado de condensación y empaquetamiento.
Aparecen durante la mitosis.
Estructura:
- Tienen 2 pares de brazos que se unen al centrómero que se
considera constricción primaria.
- En ocasiones en los brazos aparecen constricciones secundarias
y el fragmento que queda inmediatamente se le llama satélite.
- Tienen un brazo corto(p) y un brazo largo(q).
- Se pueden clasificar según el tamano de sus brazos en:
metacéntricos cuando los 2 pares tienen el mismo tamano,
submetacéntricos cuando 1 par de brazo es más corto que el
otro y acrocéntrico cuando 1 de los pares es muy corto.
Autosómicos 1 al 22.
Cromosomas
Sexuales. X y Y.
En los cromosomas se encuentran los genes que son uno o más
sectores del ADN que en su secuencia de bases nitrogenadas
contienen la información que permite la síntesis de moléculas
específicas.(ARNm a partir del cual se forman las proteínas, el
ARNt y el ARNr).
Cariotipo: distribución de los cromosomas en una especie
organizándolos de mayor a menor tamano.
Estructura del gen en eucariota.
AATAAA
5´ promotor. ATG
3´
32
Exon1 Intron1IntronExon Región de terminación.
Unidad de transcripción. Sitio de
poliadenilación.
Está formado por secuencias codificadoras(exón) y no
codificadoras(intrón).
Cuando se transcribe el ADN el exón sale del núcleo y el
intrón se queda y es eliminado. Después el último exón se
encuentra la secuencia AATAAA que indica que varios
nucleótidos, después está el sitio de poliadenilación donde se
anaden los nucleótidos de adenina.
Asociado al gen, hacia la izquierda se encuentra el promontor
que es una región del ADN que está relacionado con el inicio y
velocidad del proceso de transcripción. Al promotor se une la
ADN polimerasa que cataliza la transcripción.
El primer nucleótido que se transcribe se considera como la
posición +1 y todo lo que está a la derecha de denota con el
signo + y todo lo que está a la izquierda se denota con el
signo .
Al inicio del gen está la secuencia ATG que una vez que es
transcripta se obtiene el codón AUG que es un codón de
iniciación.
Genotipo: par de genes que determinan un carácter.
Fenotipo: manifestación externa del genotipo.
Genoma: conjunto de genes de una célula.
Alelos: formas alternativas de 1 gen cuyas secuencias no son =
pero codifican el mismo producto.
Ciclo celular.
Es la secuencia de eventos que experimenta una célula desde una
división celular hasta la siguiente.
Interfase. G1 , S y G2.
33
Mitosis. Profase, metafase, anafase y telofase.
G1.
Aumenta la síntesis de proteínas y la utilización de glucosa.
La célula se prepara para la replicación.
La célula es estimulada por factores de crecimiento.
Destino final de la célula
Desarrollo de organulos
S
Ocurre la replicació[Link] ADN
G2
Se repara el ADN.
Al final aparecen los cromosomas y da inicio a la mitosis.
Condensación de la cromatina
Rectificación
Trascripción y Traducción
Profase.
Se desintegra la envoltura nuclear y desaparece el nucleolo.
Se forma el huso mitótico.
Migran centriolos
Metafas
Los cromosomas se disponen al centro del huso mitótico
formando la placa ecuatorial.
Desaparece la envoltura
Anafase.
Se separan las cromátidas hacia el polo de la célula.
Migran hacia los polos
Anillo de constriccion
Telofase.
Se vuelve a formar la envoltura nuclear.
Se forma el nucleolo.
Desaparece el huso mitótico.
Se separan las células hijas.2
En la regulación del ciclo celular participan 3 elementos:
1) Ciclinas.
34
2) Quinasas dependientes de ciclinas.(CdK)
3) Inhibidores de los complejos ciclina-cdk.
En el paso de una fase a la otra del ciclo celular se produce un
aumento de la concentración de una y la disminución de la
concentración de otra ciclina.
Genética molecular.
Principio de la transferencia de información:
La información fluye de macromoléculas con predominio de
información secuencial a macromoléculas con predominio de
información conformacional. Se manifiesta mediante la
conservación, transmisión y expresión de la información genética.
Consiste en mantener la Garantiza el paso de la Se
relaciona con la dirección
información lo más variable información a los de
síntesis de moléculas espe-
posible. descendientes(replicación). cíficas
lo que permite la transi
ción a la inf. conformacional
y que se realicen funciones espe-
cíficas que permiten el desarrollo
de los organismos.(transcripción y
traducción).
Replicación en procariontes.
Requerimientos:
dATP, dGTP, dCTP y dTTP.
Mg2+.
Proteínas:
SSB. Es la proteína estabilizadora de la simple hebra del ADN.
Su función es mantener al ADN en forma de simple hebra
evitando que se enrolle.
Proteínas con actividad iniciadora.
Otras proteínas.
Enzimas:
35
ADN polimerasa III.
Es la enzima que cataliza este proceso. Lleva a cabo la reacción
de polimerización y requiere de un extremo 3` OH libre para
anadir losdesoxinucleótidos. Su función es
anadirdesoxinucleótidostrifosfatados a otro desoxinucleótidos.
Esto es posible gracias a la complementariedad de bases.
ADN polimerasa I.
Tiene actividad polimerizante, actividad exonucleasa 3`-5`y
actividad exonucleasa 5`-3´ con la cual elimina el ARN iniciador.
Topoisomerasa I y II.
Tienen la función de relajar las tensiones en la molécula de ADN
formando topoisómeros. Convierten topoisómeros positivos en
negativos. La topoisomerasa I corta ADN de simple hebra y la
topoisomerasa II corta ADN de doble hebra.
Helicasas.
Desenrollan la doble hélice del ADN y requieren de ATP.
ADN ligasa.
Une dos fragmentos contiguos de ADN y usa como cofactor al
NAD+.
Reacción de polimerización: el O de la posición 3` de un
nucléotido ataca al fosfato de la posición 5` de otro nucleótido.
Está acoplada a la hidrólisis del pirofosfato por lo que se libera
energía favoreciéndose el sentido directo de la reacción.
Características generales:
Es un proceso semiconservativo porque las moléculas hijas
conservan la mitad de la molécula original.
Ocurre por complementariedad de bases porque la base del
desoxinucleótido que se incorpora es complementaria a la base
que se encuentra en la cadena opuesta.
Es unidireccional ya que la dirección se síntesis es 5`-3` debido
al requerimiento de las ADN polimerasas.
Tiene carácter gradual ya que los nucleótidos se incorporan
uno a uno.
Tiene carácter repetitivo porque los nucleótidos se incorporan
por el mismo mecanismo.
36
Tiene carácter acoplado porque se acopla a la hidrólisis del
pirofosfato.
El proceso es antiparalelo porque se enfrentan los extremos de
la hebra molde y de la hebra hija que son diferentes.
La replicación ocurre una sola vez en el ciclo celular.
Se requiere de un iniciador que es el ARNi que aporta el
extremo 3`OH para que las ADN polimerasas puedan actuar.
Posee una elevada fidelidad.
Eventos:
Preiniciación.
Se separan las dos hebras del ADN y se forma el complejo de
preiniciación.
Iniciación:
Se forma el complejo de iniciación, se sintetiza el ARNi, se
incorpora la ADN polimerasa III y se forma el replisoma.
Elongación:
La actividad de la ADN polimerasa III incorpora uno a uno los
desoxinucleótidos en una hebra dirigida por la secuencia de la
hebra contraria, de esta forma el proceso transcurre rápidamente.
Este alargamiento se produce de forma diferente en cada una de
las 2 hebras, para la hebra conductora solo hace falta la
participación de la polimerasa III y la otra hebra se alarga
discontinuamente y requiere la participación del complejo de
iniciación, la polimerasa III, la I y la ADNligasa.
Terminación:
Culmina el proceso de replicación y da como resultado la
separación de las 2 moléculas de ADN hijas, cada una de las
cuales contiene una cadena de ADN paterno y una recien
formada. Se produce en un sitio fijo del ADN y requiere de
proteínas específicas.
Posterminación:
Ocurre la metilación de bases específicas del ADN lo que permite
diferenciar la hebra molde de la nueva, contribuye a la regulación
de la información genética y protege al AND de las enzimas de
restricción que rompen el enlace fosfodiester en secuencias
específicas del ADN.
37
Replicación en eucariontes
El proceso es más complejo porque el tamano del genoma es
mayor y la organización estructural del ADN es más compleja.
Existen múltiples orígenes de replicación.
El número de polimerasas es mucho mayor que en
procariontes.
El origen de replicación es más complejo.
Existen 5 tipos de ADN polimerasas.
El cromosoma eucarionte es lineal. Sus extremos no se replican
por el mecanismo habitual, en su replicación participa
latelomerasa que utiliza un ARN como cofactor que sirve de
molde.
Fidelidad de la replicación: que las moléculas hijas tengan la
misma secuencia de la molécula materna. Se incorpora una base
errónea por cada 1000 a 100000 millones de bases incorporadas.
Factores que contribuyen a la alta fidelidad de la replicación:
1) Alta especificidad del apareamiento de bases.
2) Alta especificidad de las polimerasas ya que solo incorporan
nucleótidos que puedan formar pares de bases Watson y Crick.
3) Presencia del ARNi ya que se elimina y si hubiese algún error
en esa zona se perdería.
4) Mecanismo de edición. Cuando se incorpora un nucleótido
incorrecto esa zona del ADN se debilita porque el
apareamiento es incorrecto. La ADN polimerasa III elimina
con su actividad exonucleasa 3`-5` el segmento donde está el
nucleótido incorrecto y con su actividad polimerizante
restituye el segmento.
Inhibidores de la replicación:
Los que actúan sobre el ADN molde intercalándose entre los
pares de bases impidiendo que se separen las 2 hebras del
ADN. Ej. Actinomicina D.
Los que actúan sobre las proteínas replicativas inhibiendo a la
ADNligasa que es la que une 2 segmentos contiguos de ADN.
Ej. Novobiocina y ac. Nalidísico.
Transcripción en procariontes.
38
Requerimientos:
ATP, GTP, CTP y UTP.
Mg2+.
ARN polimerasa cuya función es catalizar la reacción de
polimerización que es reversible y se favorece por la energía de
hidrólisis del pirofosfato. Además incorpora
ribonucleótidostrifosfatados al extremo 3` OH de un nucleótido
precedente.
Otras proteínas.
Características generales:
Ocurre por complementariedad de bases ya que las bases del
nucleótido que se incorpora son complementarias al del
nucleótido de la cadena opuesta.
Tiene carácter acoplado porque se acopla a la hidrólisis del
pirofosfato.
Es unidireccional. La dirección de síntesis es 5`-3`.
Tiene carácter gradual porque los nucleótidos de incorporan
uno a uno.
Tiene carácter repetitivo porque los nucleótidos de incorporan
por el mismo mecanismo.
Es antiparalelo porque el ARN se sintetiza de la cadena molde
con dirección 3`-5`.
No requiere iniciador.
En un gen la primera base que se transcribe se denomina con la
posición +1. El promotor tiene secuencias específicas a la que se
une la ARN polimerasa; tiene otras senales a las que se unen otras
proteínas que controlan la efectividad de la unión de la ARN
polimerasa al promotor y es el elemento central de la regulación
de la transcripción.
Una de las 2 hebras del ADN es la hebra molde a partir de la cual
se sintetiza el ARN y la otra es la hebra codificante cuya
secuencia es igual a la secuencia del ARN a diferencia que el
ARN tiene uracilo.
Eventos:
Preiniciación:
39
Los eventos de preiniciación comprenden el reconocimiento de
señales específicos, la unión ADN- enzima formando un
promotor cerrado y su transformación posterior en un promotor
abierto. La enzima se desliza hasta la posición +1 para dar
comienzo al proceso.
Iniciación:
La ARN polimerasa comienza a incorporar los
ribonucleósidostrifosfatado formando enlace fosfodiester entre
ellos. Generalmente el primer nucleósido que se incorpora tiene
como base una purina, sobre todo una adenina. Cuando la cadena
de ARN tiene de 6 a9 nucleótidos se detiene el crecimiento de la
cadena y se separa el factor 70 de la ARN polimerasa
concluyendo la iniciación.
Elongación:
Consiste en el aumento gradual de la cadena
polirribonucleotídica por acción fundamentalmente del núcleo de
la ARN polimerasa. El complejo de la ARN polimerasa,
moviéndose sobre el ADN, es estabilizado por proteínas
auxiliares que impiden la dislocación de la enzima.
Terminación:
Incluye el detenimiento de la elongación, la liberación del ARN y
la polimerasa. En ocasiones son necesarias secuencias específicas
del ADN y en otras se requieren proteínas específicas.
Posterminación:
ARNm
No tiene modificaciones postranscripcionales.
Son policistrónicos pues codifican varias cadenas polipeptídicas.
Hacia el extremo 5´ presentan la secuencia Shine- Dalgarmo que
permite la unión al ribosoma.
ARNr
Las modificaciones postranscripcionales son la eliminación de
bases extras de los extremos 5´ y 3´ y la modificación de bases
nitrogenadas.
Transcripción en eucariontes.
En eucariontes existen 3 ARN polimerasas, la I que sintetiza
los ARNr y se localiza en elnucleolo; la II que sintetiza los
40
ARNm y se ubica en el nucleoplasma y la III que sintetiza los
ARNt y ARNr y se encuentra en el nucleoplasma.
La estructura de estas enzimas es más compleja que en
procariontes y la reacción catalizada es similar a la que realiza
la ARN polimerasa de procarionte.
Al igual que en procarionte existen 5 etapas.
Inhibidores de la transcripción:
Poseen 2 formas de actuar:
Impiden la separación de las cadenas del ADN. Ej.
Actinomicina.
Actúan las ARN polimerasas. Ej. Rifanpicina.( antibiótico que
inhibe a la ARN polimerasa de procariontes).
Traducción en procariontes.
(síntesis de proteína que ocurre en los ribosomas y forma parte de
la expresión genética)
Requerimientos:
Aminoácidos.
ARNm(1 solo). Dirige la síntesis de proteínas.
ARNt. Transfieren los a.a al ribosoma.
Ribosoma.
Mg2+
ATP y GTP.
Aminoacil-ARNtsintetasa.
Actividad de peptidiltransferasa. Está localizada en la
subunidad 50S de procariontes y permite formar el enlace
peptídico.
Proteínas no ribosomales(factores de la traducción)FI factores
de iniciación, FE factores de elongación y FL factores de
liberación.
El GTP se une a determinados factores de la traducción y cuando
está unido estos factores presentan una configuración que les
permiten unirse al ribosoma. Cuando ocurre la hidrólisis del GTP
a ATP y fosfato inorgánico cambia la conformación del factor de
la traducción y se separa del ribosoma.
41
Características generales:
Ocurre en los ribosomas.
Es unidireccional. La proteína se sintetiza del extremo NH2 al
COOH terminal.
Se produce colinealmente a la lectura del ARNm.
Tiene carácter gradual porque losa.a. se van incorporando uno
a uno.
Tiene carácter repetitivo porque los a.a. se incorporan por el
mismo mecanismo.
Tiene carácter acoplado porque se acopla a la hidrólisis de
nucleósidostrifosfatados.
Tiene carácter dirigido porque el orden de los a.a en la cadena
polipeptídica está determinado por el orden de los codones en
el ARNm.
Eventos:
Preiniciación:
Ocurre la activación de los aminoácidos que consiste en la unión
del a.a a su ARNt.
Reacción general de la activación:
a.a + ARNt + ATP Aminoacil-ARNt + AMP + P-P.
El COOH del a.a reacciona con el OH de la posición 3 ó 2 del
nucleótido de adenina de la secuencia CCA del ARNt. Está
favorecido el sentido directo por la energía de hidrólisis del
pirofosfato. La enzima que cataliza esta reacción es la aminoacil-
ARNtsintetasa.
Cuando el ARN no tiene unido ningún a.a. se dice que está
descargado y cuando tiene unido algún a.a se dice que está
cargado.
AUG codón de iniciación y codifica la metionina.
Después que la metionina se une al ARNt i, se bloquea el grupo
amino de la metionina y consiste en la transferencia de un grupo
formilo al NH2 de la metionina. Después de este bloqueo se
obtiene el formilmetionil-ARNt iniciador de la metionina.
Iniciación:
El FI1 y FI3 se unen a la subunidad 30S y el equilibrio se
desplaza en el sentido de la
42
disociación lo que permite que más moléculas de FI1 y FI3 se
unan a la subunidad 30S.
Después el FI2 unido al GTP se une a la subunidad 30S.
Se incorpora el formilmetionil-ARNt iniciador de la metionina y
es el FI2 unido al GTP el que permite esta incorporación.
Se incorpora el ARNm que tiene hacia su extremo 5´ la secuencia
Shine-Dalgarmo que es la que le permite unirse al ribosoma. Esta
unión depende del FI3.
Por último la subunidad 50S se une a la subunidad 30S y el GTP
unido al FI2 se hidrolisa y se liberan los FI1, FI2 y FI3.
Una vez unida la subunidad 50S con 30S se forma el complejo de
iniciación 70S donde el codón AUG del ARNm queda situado
correctamente interactuando con el anticodón del ARNt i.
Elongación:
Al inicio el sitio P del ribosoma está ocupado por el
formilmetionil-ARNt iniciador de la metionina y el sitio A se
encuentra vacio.
Ocurre el alargamiento de la cadena polipeptídica.
Durante la elongación ocurren 3 eventos de forma cíclica:
1) Incorporación del aminoacilARNt al sitio A.
El factor de elongación Ts permite que el FE Tu se active. Esta
incorporación depende del FE Tu unido al GTP.
2) Formación del enlace peptídico.
Se produce por la transferencia del grupo unido al ARNt del sitio
P hacia el grupo amino del a.a unido al ARNt que está en el sitio
A. La formación del enlace peptídico es catalizada por una
actividad de peptidiltransferasa presente en la subunidad 50S del
ribosoma. Después que ocurre la formación del enlace peptídico
en el sitio P queda un ARNt descargado y en el sitio A queda un
peptidilARNt.
3) Translocación.
Consiste en el avance del ribosoma 3 nucleótidos a lo largo del
ARNm. El ARNt descargado que estaba en el sitio P sale del
ribosoma y el peptidilARNt del sitio A pasa al sitio P, quedando
al sitio A vacio y comienza otro ciclo. Participa el FE G unido al
ATP.
Este ciclo ocurre cuantas veces sea necesario. Generalmente
ocurre según la cantidad de a.a menos 1.
43
Terminación:
Al inicio en el sitio P hay un peptidilARNt y en el sitio A hay un
codón de terminación. Participan los FL1, FL2 yFL3. El 1
reconoce los codones de terminación UAA y UAG; el 2 reconoce
los codones de terminación UAA y UGA y el 3 estimula la acción
del FL1 y FL2.
Cuando en el sitio A aparece un codón de terminación, un FL
interactúa con este lo que provoca que se libere la cadena
polipeptídica, el ARNt y el ARNm. Se separan los FL y se
disocian las subunidades ribosomales.
Traducción en eucariontes.
Los ribosomas son más grandes y complejos.
Los ARNm generalmente son monocistrónicos.(que codifican
1 cadena polipeptídica).
Se requiere de un mayor número de proteínas no ribosomales.
Posterminación:
1) Separación del formilo de la formilmetionina.(en procariontes).
2) Separación de la metionina inicial que depende del a.a que está
en la 2da posición.
3) Modificación covalente. Ej. Fosforilación, glicosilación,
hidroxilación y adición de grupos prostéticos.
4) Formación del puente disulfuro.
5) Ruptura proteolítica.(la eliminación de segmentos peptídicos
mediante la hidrólisis de enlaces peptídicos).
6) Asociación de subunidades en proteínas oligoméricas.
Inhibidores de la traducción.
Cloranfenicol: inhibe la peptidiltransferasa.
Eritromicina: se une a la subunidad 50S e impide la unión con
la subunidad 30S.
Respiración celular.
44
Es el proceso mediante el cual los organismos obtienen energía
en forma de ATP cuando degradan sustancias más o menos
complejas hasta CO2 y agua. En este proceso se produce consumo
de O2.
La localización celular es en la mitocondria.
Procesos:
1) Ciclo de Krebs.
2) Transporte de electrones.
3) Fosforilación oxidativa.
El ciclo de Krebs ocurre en la matriz mitocondrial y la cadena
respiratoria en la membrana mitocondrial interna.
Metabolismo: conjunto de reacciones que ocurren en el
organismo y le permiten a este intercambiar sustancias y energía
con el medio.
Vía o ruta metabólica: secuencia de reacciones químicas
catalizadas por enzimas.
A B C D E
Sustrato Intermediarios. Producto
inicial. final.
Principio de los cambios graduales.
En una ruta metabólica los compuestos químicos van sufriendo
pequeñas transformaciones. El cambio del sustrato inicial al
producto final es grande.
Ciclo metabólico: secuencias cerradas de reacciones químicas
catalizadas por enzimas. Es cerrado porque uno de los sustratos
iniciales del ciclo es a la vez el producto final.
Tanto en las rutas como en los ciclos metabólicos las reacciones
están reguladas lo que provoca que la velocidad con que ocurren
varía según las condiciones celulares.
Vías anabólicas(vías de síntesis).
- Una molécula de estructura sencilla se transforma en una
molécula de estructura compleja.
45
- Se requiere de energía.
- Generalmente algunos de los intermediarios participan en
reacciones de reducción.
- Traducción, replicación y transcripción.
Vías catabólicas(vías de degradación).
- Una molécula de estructura compleja se transforma en una
molécula de estructura sencilla.
- Se produce energía.
- Generalmente algunos de sus intermediarios participan en
reacciones de oxidación.
Ciclo de Krebs.
Ciclo metabólico en el que se oxida el grupo acetilo del acetil
CoA a 2 moléculas de CO2 y en el que se obtienen además 3
NAD reducido, 1 FAD reducido y una molécula de GTP. Ocurre
en la matriz mitocondrial y el acetil CoA es el principal
alimentador del ciclo.
El acetil CoA se forma a partir de los glúcidos, ácidos grasos y
a.a. cuando los glúcidos se degradan se obtiene el piruvato y a
partir de este se obtiene el acetil CoA mediante la acción del
complejo piruvato deshidrogenasa.
El ciclo de Krebs consta de 8 reacciones:
1) El oxalacetato se condensa con el acetil CoA y se obtiene el
citrato. Requiere de agua para romper el enlace tioester del
acetil CoA y se libera la CoASH. Es una reacción exotérmica.
Enzima: CITRATO SINTASA.
2) Se convierte un alcohol terciario en un alcohol secundario
que se puede oxidar. Se obtiene isocitrato. Es una reacción de
isomerización. Enzima: ACONITASA.
3) Ocurre una descarboxilación oxidativa. Se obtiene
cetoglutarato. El cofactor es el NAD+ que se reduce a NAD
reducido por lo que se obtiene el primer cofactor reducido y
la primera molécula de CO2.
4) Ocurre una descarboxilación oxidativa. El producto es el
succinilCoA. Se obtiene la segunda molécula de CO2 y el
segundo cofactor reducido(NAD reducido). Se requiere de
46
la CoASH. Enzima: CETOGLUTARATO
DESHIDROGENASA.
5) Es una reacción reversible y se produce una fosforilación a
nivel de sustrato y se obtiene una molécula de
[Link] se transforma en succinatoy la energía
del enlace tioester de la succinilCoA se conserva en la
molécula de GTP. Enzima: SUCCINIL CoA SINTETASA.
6) Ocurre una oxidación. El succinato se transforma en
fumarato. El cofactor es el FAD y se obtiene el tercer
cofactor reducido(FAD reducido).Es una reacción reversible
y la enzima es la SUCCINATO DESHIDROGENASA.
7) Se anade una molécula de agua al doble enlace del fumarato
y se obtiene L-malato. Enzima:FUMARATO HIDRATASA.
8) El L-malato se transforma en oxalacetato. El cofactor es el
NAD y se obtiene el cuarto cofactor reducido(NAD
reducido).
La succinato deshidrogenasa es la única enzima del ciclo que se
encuentra en la membrana mitocondrial interna y el resto están en
la matriz mitocondrial.
4 reacciones de oxidación.(3 4 6 8).
Se obtienen 2 moléculas de CO2.(3 y 4).
Se obtiene una molécula de GTP.(5).
Se obtienen 4 cofactores reducidos.(3 4 6 8).
Por cada NAD reducido se obtienen 3 ATP.(9 ATP)
Por cada FAD reducido se obtienen 2 ATP.(2ATP).
El GTP se transforma en ADP por la acción de la nucleótido
difosfato quinasa.
Por cada vuelta del ciclo se obtienen 12 ATP.
Regulación del ciclo de Krebs.
1) Citrato sintasa.
2) Isocitrato deshidrogenasa. Enzimas reguladoras.
3) cetoglutarato deshidrogenasa.
La citrato sintasa se regula por disponibilidad de sustrato que son
el oxalacetato, el acetil CoA y el NADH, por lo que su actividad
varía en dependencia de los cambios de concentración de estos.
47
La disponibilidad de acetil CoA depende de la regulación del
complejo piruvato deshidrogenasa y los niveles deoxalacetato
dependen de la reacción catalizada por la L-malato
deshidrogenasa.
La isocitrato deshidrogenasa es la principal enzima reguladora del
ciclo de Krebs. Tiene un requerimiento absoluto de ADP que un
efector positivo. Si no hay ADP la enzima se encuentra
prácticamente inactiva. Su efector positivo es el calcio, NAD y el
ADP y el negativo el NADH y el ATP.
Carácter anfibólico del ciclo de Krebs.
Consiste en que el ciclo de Krebs tiene carácter anabólico y
catabólico.
El carácter catabólico está dado ya que el ciclo en sí es una vía
degradativa ya que se oxida el grupo acetilo del acetil CoA a 2
moléculas de CO2.
El ciclo es anabólico porque existen intermediarios que son
precursores de la síntesis de otros compuestos.
Ej. Acetil CoA: síntesis de ácidos grasos y colesterol.
Oxalacetato: síntesis de glucosa.
SuccinilCoA: síntesis del grupo hemo.
Oxalacetato: ácido aspártico.
cetoglutarato: ácido glutámico.
Reacciones anapleróticas.
Estas reacciones reponen los metabolitos del ciclo. La reacción
anaplerótica fundamental es la catalizada por la
piruvatocarboxilasa cuyo requerimiento es acetil CoA. En esta
reacción el piruvato se carboxila y se transforma en oxalacetato
que cuando se condensa con el acetil CoA se obtiene el citrato
que es el primer producto del ciclo de Krebs, de manera que se a
partir del oxalacetato se forman los demás metabolitos
intermediarios del ciclo.
Cadena transportadora de electrones.
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La cadena transportadora de electrones utiliza como sustrato a los
cofactores reducidos que se obtienen en el ciclo de Krebs y forma
los ATP.
El transporte de electrones se realiza por 4 complejos:
1) NADH - CoQreductasa.
2) Succinato – CoQreductasa.
3) CoQ – citocromo C reductasa.
4) Citocromo C oxidasa.
Centro redox: compuestos químicos que pueden ceder o captar
electrones.
1) Varias proteínas y el centro redox es el FMN y grupos Fe-S.
2) Varias proteínas y el centro redox son los grupos Fe-S y el
citocromo b 560.
3) Varias proteínas y el centro redox es el citocromo b 562, b 566
y C1 y grupos Fe-S.
4) Varias proteínas y el centro redox es el hemo A-CoA y hemo
B-CoB.
Tanto la CoQ como el citocromo son centros redox pero no
forman parte de ningún complejo y de todos los centros redox los
únicos que transportan protones y electrones son el FMN y la
CoQ; el resto solo transportan electrones.
Fosforilación oxidativa.
Es la síntesis de ATP a partir del gradiente protónico y ADP +
fosfato inorgánico.
Es catalizada por la ATPasatranslocadora de electrones.
Ocurre en la membrana mitocondrial interna.
A la ATPasatranslocadora de electrones se le conoce como
complejo V y su estructura es de la siguiente manera:
Porción Fo: Canal de protones que permite el paso de los
protones desde el espacio intermembranoso hacia la matriz
mitocondrial.
Porción F1: existen 3 subunidades catalíticas en las cuales
ocurre la síntesis de ATP y cada una presenta 3 estados
conformacionales, el L en el cual se une débilmente el ADP al
49
fosfato; el T en el cual se une fuertemente el ADP al fosfato y
se sintetiza el ATP y el estado O en el cual se libera el ATP.
Tallo que une estas 2 porciones.
Mecanismo de la fosforilación oxidativa.
El bombeo de protones ocurre hasta que se alcanza el ph límite
en el espacio intermembranoso. Cuando se alcanza este ph se abre
el canal de la porción Fo de la ATPasatranslocadora de electrones
regresando los protones hacia la matriz mitocondrial por lo que se
disipa el gradiente electroquímico y la energía almacenada en este
se utiliza en los cambios conformacionales de las subunidades
catalíticas de la porción F1 en la que se sintetiza el ATP, por lo
tanto la energía almacenada en el gradiente permite la síntesis de
ATP. Después que se disipa el gradiente se reanuda el transporte
de electrones.
- El ADP y el ATP atraviesan la MMI mediante el translocador
ADP-ATP. El ADP entra a la MMI y el ATP sale de la MMI.
- Los cofactores reducidos durante el ciclo de Krebs se reoxidan
en la cadena transportadora de electrones y vuelven a ser
utilizados en el ciclo de Krebs.
- En la cadena transportadora de electrones no solo se
transportan electrones, también se bombean protones desde la
matriz mitocondrial hacia el espacio intermembranoso mediante
un transporte activo cuya energía es proporcionada por el
transporte de electrones ya que es un proceso exotérmico que
libera energía.
- Existen solamente 3 sitios de bombeo de electrones: complejo
I, III y IV. El único complejo donde el transporte de electrones
no proporciona la energía necesaria para el bombeo de protones
y la síntesis de ATP es el complejo II.
- Durante el transporte de electrones se bombean protones y se
crea un gradiente electroquímico donde está almacenada la
energía del transporte de electrones.
Inhibidores del transporte de electrones.
1) Barbitúricos. Ej fenobarbital.
Inhiben el transporte desde el NADH alaCoQ.
50
2) Cianuro(CN) y monóxido de carbono(CO).
Inhiben el transporte del complejo IV al oxígeno.
Si el transporte está inhibido disminuye la oxidación de cofactores
reducidos por lo que no se pueden obtener los cofactores oxidados
que se utilizan durante el ciclo de Krebs, por lo que este también
está inhibido. Además si no se oxidan los cofactores reducidos ,
aumentan los niveles de estos y como el NAD reducido es un
efector negativo de la isocitrato deshidrogenasa y de la
cetoglutarato deshidrogenasa que son las principales enzimas
reguladoras del ciclo de Krebs , entonces este está inhibido.
Si el transporte está inhibido no se produce el bombeo de protones
y no se forma el gradiente electroquímico y como este es el
vínculo entre el transporte de electrones y la fosforilación
oxidativa esta última también está inhibida.
Inhibidores de la fosforilación oxidativa.
1) Oligomicina(antibiótico).
Se une al canal de protones de la porción Fo de la
ATPasatranslocadora de protones e impide el paso de los protones
hacia la matriz mitocondrial. Como los protones no pueden
regresar a la matriz no se disipa el gradiente electroquímico y por
lo tanto no se libera la energía suficiente para sintetizar el ATP y
no se reanuda el transporte de electrones por lo que disminuye la
oxidación de los cofactores reducidos. Al disminuir la oxidación
de los cofactores reducidos no se forman los cofactores oxidados
que se utilizan en el ciclo de Krebs, por lo tanto este también se
inhibe.
Desacopladores.
Son sustancias que aumentan la permeabilidad de la MMI a los
protones y disipan el gradiente electroquímico, por lo que
desacoplan el transporte de electrones de la fosforilación
oxidativa.
Como consecuencia de los desacopladores continúa el transporte
de electrones, la oxidación de sustrato y la formación de agua
pero se inhibe la fosforilaciónoxidativa y la producción de ATP.
La energía del transporte se libera en forma de calor.
51
Ej. 2,4 dinitroferol y el dicumarol.
Regulación de la cadena respiratoria.
Depende de la disponibilidad de los cofactores reducidos y de
los niveles de ADP(control por el aceptor).
Si los niveles de ADP son altos la velocidad con que funciona
la cadena respiratoria aumenta si son bajos la velocidad
disminuye.
Cuando aumenta la disponibilidad de cofactores reducidos
aumenta la velocidad de la cadena respiratoria.
Regulación de la respiración celular.
1) Niveles energéticos de la célula.
2) Disponibilidad de cofactores reducidos.
Hidrólisis del ATP es baja.
Niveles energéticos altos. La concentración de ATP es alta.
La concentración de ADP es baja.
Hidrólisis de ATP es alta.
Niveles energéticos bajos. La concentración de ATP es baja.
La concentración de ADP es alta.
Cuando los niveles energéticos son altos la concentración de ATP
es alta y como es un efector negativo de la isocitrato
deshidrogenasa, esta se encuentra inhibida y por lo tanto
disminuye la velocidad del ciclo de Krebs y la formación de
cofactores reducidos por lo que disminuye la velocidad de la
cadena respiratoria. Cuando los niveles de ADP son bajos
disminuye la velocidad de la cadena respiratoria.
Cuando los niveles energéticos son bajos la concentración de
ADP es alta y como es un efector positivo de la isocitrato
deshidrogenasa esta se encuentra activa aumentando la velocidad
del ciclo de Krebs y la formación de cofactores reducidos, por lo
que aumenta la velocidad de la cadena respiratoria. Si los niveles
de ADP son altos aumenta la velocidad de la cadena respiratoria.
52
Problemas actuales de la BCM.
Cáncer (neoplasia maligna): conglomerado de células que se
multiplican de manera incontrolada y que invaden tejidos vecinos
y lejanos, causando grandes danos al organismo donde se
encuentran.
Características de las células cancerosas:
Multiplicación incontrolada. Se dividen a una velocidad mucho
mayor que lo habitual.
Comportamiento invasivo. Invaden tejidos vecinos y
lejanos(responsable de la metástasis).
Alto consumo energético. Tienen un metabolismo acelerado,
utilizan la glucosa como fuente de energía.
Predominio del metabolismo anaerobio. Obtienen la energía
mediante vías anaeróbias.
Alteraciones morfológicas. Son variadas y afectan el tamaño y
forma de la célula.
Modificación de las propiedades inmunológicas. Se deben a
modificaciones del reconocimiento intercelular, o sea, en las
interacciones de una célula con otra; se deben a alteraciones en
los componentes de la membrana citoplasmática.
Transformación en células cancerosas.
En un tejido normal una célula puede experimentar un cambio
que provoca que se transforme en una célula cancerosa. Esta
célula puede mantenerse durante un tiempo en el mismo
tejido(crecimiento in situ) hasta que comienza la invasión a
tejidos cercanos y lejanos. Tiene carácter hereditario ya que al
multiplicarse las células que se obtienen son células cancerosas.
Experimento 1.
Transformación de células normales por ADN extraído de células
cancerosas.
Se extrajo el ADN de células cancerosas y se introdujo en el
cultivo de células normales.
Luego aparecieron células cancerosas en el cultivo de células
normales.
Con este experimento se comprueba que el ADN contiene la
información que induce a la transformación cancerosa.
53
Experimento2.
Transformación de células normales por un segmento específico
de ADN extraído de células cancerosas.
Se realiza teniendo en cuenta que el tamaño del genoma humano
es grande y que no todo el ADN es responsable de la
transformación cancerosa, sino un sector del ADN. Tiene como
objetivo identificar que segmento del ADN es el responsable de la
transformación cancerosa.
Se extrae el ADN de células cancerosas.
Se utilizan enzimas de sustracción para su fragmentación.
Se clona para obtener copias del fragmento.
Con este experimento se aisló el gen productor del cáncer
denominado ONCOGEN.
Las células normales contienen en su genoma secuencias de ADN
muy similares a la de algunos oncogenes. A este tipo de genes
presentes en células normales se le denominó proto-oncogen.
Inmunoglobulinas.
Antígeno: son sustancias extrañas al organismo de naturaleza
variada que interactúan con los anticuerpos.
El inmunógeno es un antígeno que desencadena respuesta
inmune.
Las Ig son Ac.
1) Ig A: presentes en cavidades, tractos, calostro y leche materna.
2) Ig D.
3) Ig E: está vinculada a procesos alérgicos y se produce vs los
parásitos.
4) Ig G: atraviesa la barrera placentaria y confiere inmunidad al
feto. Se les llaman ganmaglobulinas.
5) Ig M: es la primera que se produce en respuesta a un Ag.
Para estudiar la estructura de los anticuerpos se toma como
prototipo a la IgG. Contiene dos cadenas ligeras(L) que contienen
214 a.a y 2 cadenas pesadas (H) con 446 a.a. Cada cadena ligera
54
está unida a una cadena pesada por un puente disulfuro y las dos
cadenas pesadas están unidas por 2 puentes disulfuro.
La región de unión del anticuerpo al antígeno consiste en los
extremos NH2 terminales de las 4 cadenas. A esta región se le
llama región variable y al resto región constante. La interacción
Ag-Ac se realiza mediante el reconocimiento molecular por lo
que estos se unen por interacciones débiles.
Teóricamente el organismo puede producir millones de
anticuerpos que se diferencian en su región variable.
El gen de cadena ligera K está formada por segmentos V que
codifican 95 a.a de la región variable y por segmentos J que
codifican 13 a.a de la región variable. Además tiene un segmento
C que codifica la región constante.
Existen 300 segmentos V y 5 J. La explicación de cómo se
genera la diversidad de anticuerpo está dada por la organización
de los genes de Inmunoglobulina y por el fenómeno de
recombinación somática.
Ejemplo: Gen de cadena ligera K. Los segmentos V se unen a los
J por la recombinación somática y esto hace que puedan existir
1500 posibilidades de obtener regiones variables diferentes y por
lo tanto 1500 anticuerpos diferentes.
Morfogénesis.
Proceso mediante el cual un organismo vivo alcanza una
estructura tridimensional característica en cada nivel de
organización.
Reglas:
1. Está determinada genéticamente.
2. Las proteínas tienen una función sobresaliente.
3. Las interacciones débiles tienen gran importancia.
4. Es un proceso cooperativo.
5. Es un proceso espontáneo.
6. En las estructuras complejas se produce a partir de bloques o
unidades de construcción.
7. En las estructuras complejas existe un orden de ensamblaje.
8. Está vinculada a la función de cada nivel.
Experimento 1.
55
Desnaturalización reversible de una proteína sencilla.
Al someter la ribonucleasa a la acción de urea y agentes
reductores, ésta se desnaturaliza y pierde su actividad enzimática
y cuando se retira la urea y los agentes reductores la proteína se
vuelve a plegar y recupera la actividad enzimática.
No se cumple la 7ma y 8va regla porque esta proteína no es una
estructura compleja.
Tecnología del ADN recombinante.
Permite obtener proteínas en cantidades apreciables.
Pasos para obtener la proteína:
1. Clonación del gen que codifica la proteína(se obtienen
múltiples copias del gen).
1.1 Obtención del gen o ADN de interés
a partir de un organismo dado. El material genético de la
célula se someten a enzimas de restricción que fragmentan el
ADN. Estas enzimas son endonucleasas que reconocen
secuencias específicas en el ADN donde realzan cortes de la
doble hebra.
1.2 Unión del gen a una molécula de
ADN capaz de replicarse(vector de clonación). Ejemplo:
plásmidos, virus(bacteriófagos) y cromosomas artificiales de
levadura. Se usan en dependencia del gen que se va a clonar y
deben tener las siguientes características: que puedan ser
introducidos en una célula, que sean capaces de replicarse y
deben poseer alguna característica que permita identificarlo.
Generalmente se usan genes de resistencia a antibióticos. La
enzima de restricción que se usa para obtener el segmento del
gen de interés es la que usa para unir el gen al vector de
clonación. Para que se una el gen con el plásmido se utiliza la
ADNligasa. Cuando se une el ADN de interés o el gen que se
va a clonar con el vector de clonación se denomina
recombinación y el ADN que se obtiene se llama ADN
recombinante.
1.3 Introducir el vector recombinado en
una célula para que ocurra la replicación del vector de
clonación.
56
2. Expresión del gen clonado, es decir, que el gen sea transcrito y
traducido. Para que esto ocurra hay que incorporar un vector de
expresión donde se inserta el gen. El vector se introduce en una
célula para que ocurra la transcripción, traducción y se obtenga
la proteína.
3. Purificación de la proteína.
Enfermedad molecular.
Consiste en la alteración de una proteína específica y tiene
carácter hereditario. Se afecta la función de la proteína específica.
La causa de la enfermedad celular es una mutación en el gen que
codifica la proteína específica.
La mutación puede ser en la zona reguladora o en la zona
codificante
Se afecta la cantidad de proteínas. Se afecta la
actividad de la proteína.
Puede aumentar o disminuir la cantidad puede ser
mayor o menor la actividad.
de enzimas.
Lo más frecuente es que la mutación se produzca en la zona
codificante y por lo tanto la actividad de la proteína disminuye y
no se afecta la cantidad.
ECM.
Se produce cuando se afecta una enzima.
Acumulación del sustrato.
Disminución o ausencia del producto.
Debido a la acumulación del sustrato se estimulan vías
secundarias que en condiciones normales presentan una baja
velocidad.
Drepanositosis o sicklemia.
Proteína específica: Hb.
Función: transporte de gases(02 y CO2) en sangre e interviene en
la regulación del ph sanguíneo.
Se produce una mutación en el gen que codifica la cadena ß de la
Hb.
57
Cadena ß 6glu. ------ Hb A normal.
Mutación 6val ------Hb S.
Patrón de herencia: carácter autosómico recesivo.
Cuando los niveles de oxígeno son adecuados la HbS se comporta
igual a la HbA. Cuando los niveles de oxígeno disminuyen las
moléculas de HbS forman polímeros y al asociarse varios
polímeros se forman fibras que precipitan en el citoplasma del
glóbulo rojo y este adopta una forma de hoz y se forma el
drepanocito.
Los glóbulos rojos tienen una vida media de 120 días y los
drepanocitos tienen una vida media menor de manera porque son
reconocidos como extranos y son retirados de la circulación por el
sistema retículo endotelial, fundamentalmente el bazo y allí son
destruidos por lo que se produce una disminución execiva de
glóbulos rojos lo que lleva a la anemia e ictericia.
Cada cadena alfa y beta están unidas a un grupo hemo.
Cuando se degrada la Hb también se degrada el grupo hemo y uno
de los productos de la degradación es la bilurrubina. Al aumento
de la bilirrubina en sangre se denomina ictericia.
La elasticidad del drepanocito es mucho menor que la de los
glóbulos rojos normal, por lo que cuando el drepanocito atraviesa
vasos de pequenos calibre como los capilares se produce la
obstrucción de esos vasos y aparecen los infartos. En piel las
úlceras maleolares y en huesos deformidades óseas como el
cráneo en torre y tibias en sable.
Diagnóstico: electroforesis de Hb.