ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEL ADN

EL ADN

Ácido Desoxirribonucleico (ADN), material genético de todos los organismos

celulares y casi todos los virus. Es el tipo de molécula más compleja que se
conoce. Su secuencia de nucleótidos contiene la información necesaria para
poder controlar el metabolismo un ser vivo.

El ADN lleva la información necesaria para dirigir la síntesis de proteínas y la

replicación. En casi todos los organismos celulares el ADN está organizado en
forma de cromosomas, situados en el núcleo de la célula.

Está formado por la unión de muchos desoxirribonucleótidos. La mayoría de las

moléculas de ADN poseen dos cadenas antiparalelas (una 5´-3´ y la otra 3´-5´)
unidas entre sí mediante las bases nitrogenadas, por medio de puentes de
hidrógeno.

La adenina enlaza con la timina, mediante dos puentes de hidrógeno, mientras

que la citosina enlaza con la guanina, mediante tres puentes de hidrógeno.

El estudio de su estructura se puede hacer a varios niveles, apareciendo

estructuras, primaria, secundaria, terciaria, cuaternaria y niveles de
empaquetamiento superiores.

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 ESTRUCTURA PRIMARIA
Se trata de la secuencia de desoxirribonucleótidos de una de las cadenas. La
información genética está contenida en el orden exacto de los nucleótidos.

Las bases nitrogenadas que se hallan formando los nucleótidos de ADN son
Adenina, Guanina, Citosina y Timina. Los nucleótidos se unen entre sí mediante
el grupo fosfato del segundo nucleótido, que sirve de puente de unión entre el
carbono 5' del primer nucleótido y el carbono 3' de siguiente nucleótido.

Como el primer nucleótido tiene libre el carbono 5' y el siguiente nucleótido tiene
libre el carbono 3', se dice que la secuencia de nucleótidos se ordena desde 5' a
3' (5' → 3')

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ESTRUCTURA SECUNDARIA

Es una estructura en doble hélice. Permite explicar el almacenamiento de la

información genética y el mecanismo de duplicación del ADN. Fue postulada
por James Watson y Francis Crick.

Es una cadena doble, dextrógira o levógira, según el tipo de ADN. Ambas

cadenas son complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la
otra, y la guanina de una a la citosina de la otra. Estas bases enfrentadas son
las que constituyen los Puentes de Hidrógeno.

Adenina forma dos puentes de hidrógeno con Timina. Guanina forma tres
puentes de hidrógeno con Citosina.

Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3´ de una se enfrenta al

extremo 5´ de la otra.

Las dos hebras están enrolladas en torno a un eje imaginario, que gira en
contra del sentido de las agujas de un reloj. Las vueltas de estas hélices se
estabilizan mediante puentes de hidrógeno.

Esta estructura permite que las hebras que se formen por duplicación de ADN
sean copia complementaria de cada una de las hebras existentes.

Existen tres modelos de ADN:

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  ADN-B: ADN en disolución, 92% de humedad relativa, se encuentra en
soluciones con baja fuerza iónica se corresponde con el modelo de la
Doble Hélice. Es el más abundante y es el descubierto por Watson y
Crick.
 ADN-A: ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como
contraiones, presenta 11 pares de bases por giro completo y 23 Å de
diámetro. Es interesante por presentar una estructura parecida a la de
los híbridos ADN-ARN y a las regiones de autoapareamiento ARN-ARN.
 ADN-Z: doble hélice sinistrorsa (enrollamiento a izquierdas), 12 pares de
bases por giro completo, 18 Å de diámetro, se observa en segmentos de
ADN con secuencia alternante de bases púricas y pirimidínicas
(GCGCGC), debido a la conformación alternante de los residuos
azúcar-fosfato sigue un curso en zig-zag.

ESTRUCTURA TERCIARIA

El ADN presenta una estructura terciaria, que consiste en que la fibra de 20 Å

se halla retorcida sobre sí misma, formando una especie de super-hélice. Esta
disposición se denomina ADN Superenrollado, y se debe a la acción de
enzimas denominadas Topoisomerasas-II. Este enrollamiento da estabilidad a
la molécula y reduce su longitud.

Varía según se trate de organismos procariontes o eucariontes:

a) En procariontes se pliega como una super-hélice en forma,

generalmente, circular y asociada a una pequeña cantidad de proteínas.
Lo mismo ocurre en la mitocondrias y en los plastos.

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 b) En eucariontes el empaquetamiento ha de ser más complejo y compacto
y para esto necesita la presencia de proteínas, como son las histonas y
otras de naturaleza no histona (en los espermatozoides las proteínas
son las protamínas). A esta unión de ADN y proteínas se conoce como
Cromatina, en la cual se distinguen diferentes niveles de organización:

- Nucleosoma
- Collar de perlas
- Fibra cromatínica
- Bucles radiales
- Cromosoma.

El ADN es una molécula muy larga en algunas especies y, sin embargo, en las
células eucariotas se encuentra alojado dentro del minúsculo núcleo. Cuando el
ADN se une a proteínas básicas, la estructura se compacta mucho.

Las proteínas básicas son Histonas o Protamínas.

La unión con Histonas genera la estructura denominada Nucleosoma. Cada

nucleosoma está compuesto por una estructura voluminosa, denominada Core,
seguida por un eslabón o "Linker". El core está compuesto por un octámero de
proteínas, Histonas, denominadas H2A, H2B, H3 y H4. Cada tipo de histona se
presenta en número par. Esta estructura está rodeada por un tramo de ADN que
da una vuelta y 3/4 en torno al octámero.
El Linker está formado por un tramo de ADN que une un nucleosoma con otro y
una histona H1.

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 El conjunto de la estructura se denomina Fibra de Cromatina de 100Å. Tiene un
aspecto repetitivo en forma de collar de perlas, donde las perlas serían los
nucleosomas, unidos por los linker.

ESTRUCTURA CUATERNARIA

La cromatina en el núcleo tiene un grosor de 300Å. La fibra de cromatina de

100Å se empaqueta formando una fibra de cromatina de 300Å. El enrollamiento
que sufre el conjunto de nucleosomas recibe el nombre de Solenoide.

Los solenoides se enrollan formando la cromatina del núcleo interfásico de la

célula eucariota. Cuando la célula entra en división, el ADN se compacta más,
formando los cromosomas.

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ESTRUCTURA DEL A RN

EL ARN

El Ácido Ribonucleico se forma por la polimerización de ribonucleótidos, los

cuales se unen entre ellos mediante enlaces fosfodiéster en sentido 5´-3´ (igual
que en el ADN). Estos a su vez se forman por la unión de un grupo fosfato, una
ribosa (una aldopentosa cíclica) y una base nitrogenada unida al carbono 1’ de
la ribosa, que puede ser citosina, guanina, adenina y uracilo. Esta última es una
base similar a la timina.

En general los ribonucleótidos se unen entre sí, formando una cadena simple,
excepto en algunos virus, donde se encuentran formando cadenas dobles.

Un gen está compuesto, como hemos visto, por una secuencia lineal de
nucleótidos en el ADN, dicha secuencia determina el orden de los aminoácidos
en las proteínas. Sin embargo el ADN no proporciona directamente de
inmediato la información para el ordenamiento de los aminoácidos y su
polimerización, sino que lo hace a través de otras moléculas, los ARN.

Se conocen tres tipos principales de ARN y todos ellos participan de una u otra
manera en la síntesis de las proteínas. Ellos son: El ARN mensajero (ARNm),
el ARN ribosomal (ARNr) y el ARN de transferencia (ARNt).

ARN mensajero (ARNm)

Consiste en una molécula lineal de nucleótidos (monocatenaria), cuya

secuencia de bases es complementaria a una porción de la secuencia de
bases del ADN. El ARNm dicta con exactitud la secuencia de aminoácidos en
una cadena polipeptídica en particular. Las instrucciones residen en tripletes
de bases a las que llamamos Codones.

ARN ribosomal (ARNr)

Este tipo de ARN una vez trascrito, pasa al nucleolo donde se une a proteínas.
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 De esta manera se forman las subunidades de los ribosomas.

ARN de transferencia (ARNt)

Este es el más pequeño de todos, tiene aproximadamente 75 nucleótidos en su

cadena, además se pliega adquiriendo lo que se conoce con forma de hoja de
trébol plegada. El ARNt se encarga de transportar los aminoácidos libres del
citoplasma al lugar de síntesis proteica. En su estructura presenta un triplete de
bases complementario de un codón determinado, lo que permitirá al ARNt
reconocerlo con exactitud y dejar el aminoácido en el sitio correcto. A este
triplete lo llamamos Anticodón.

ESTRUCTURA PRIMARIA

ESTRUCTURA SECUNDARIA

Al igual que el ADN, se refiere a la secuencia de las bases nitrogenadas que

constituyen sus nucleótidos. La estructura primaria del ARN es similar a la del
ADN, excepto por la sustitución de desoxirribosa por ribosa y de timina por
uracilo. La molécula de ARN está formada, además por una sola cadena.

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La cadena simple de ARN puede plegarse y presentar regiones con bases
apareadas, de este modo se forman estructuras secundarias del ARN, que tienen
muchas veces importancia funcional, como por ejemplo en los ARNt (ARN de
transferencia). Aunque existan zonas apareadas, los extremos 5’ y 3’ que marcan
el inicio y el final de la molécula permanecerán libres.

ESTRUCTURA TERCIARIA

Es un plegamiento complicado sobre la estructura secundaria adquiriendo una

forma tridimensional.

Los virus cuyo material genético está codificado en forma de ADN se

denominan virus de ADN. Por lo general, este tipo de virus se replica en el interior
del núcleo celular, utilizando las proteínas de la célula hospedadora. De este tipo
de virus, podemos distinguir tres subtipos, los virus de ADN bicatenario (Grupo I),
los virus de ADN monocatenario (Grupo II) y los virus de ADN bicatenario
retrotranscrito (Grupo VII).
Los virus que organizan su material genético en ADN de doble cadena, similar al
que encontramos en las células eucariotas, son llamados “virus de ADN

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bicatenario”. En la clasificación de Baltimore se conocen como virus del Grupo I.
Forman parte de este grupo el virus de la varicela, el virus del papiloma
humano (VPH) y el virus del herpes simple. Los virus de ADN bicatenario, por lo
general, necesitan que la célula infectada entre en la fase de replicación celular,
ya que son dependientes de las polimerasas celulares. En ocasiones, estos virus
pueden inducir la división celular en las células hospedadoras, de ahí que algunos
tengan relación directa con ciertos tipos de cánceres.
Los virus de ADN monocatenario son aquellos que organizan su material genético
en moléculas de ADN de cadena sencilla. Para que estos virus consigan
replicarse en la célula hospedadora, es necesario que, en su infección, el ADN de
cadena simple se transforme en ADN de doble cadena. Son virus de ADN
monocatenario (Grupo II), por ejemplo, el Parvovirus V19 humano y
los bacteriófagos de las familias Inoviridae y Microviridae.
El Grupo VII de la clasificación de Baltimore lo protagonizan los virus de ADN
bicatenario retrotranscrito. El gran conocido de este grupo es el virus de
la hepatitis B. Los virus del Grupo VII están caracterizados por la utilización de la
transcriptasa reversa durante su ciclo reproductivo. La transcriptasa reversa o
retrotranscriptasa es una ADN-polimerasa que funciona “al revés”. Esto significa
que, al contrario que otras ADN-polimerasas, puede obtener una molécula de
ADN bicatenario a partir de una molécula de ARN monocatenario. ¡Impresionante!
Os explicaré más sobre la infección de este tipo de virus en nuestro próximo post
sobre ellos.
Virus de ARN

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Al igual que existen virus cuyo material genético está organizado en forma de
ADN, algunos virus utilizan el ARN para ello. Entre los virus de ARN se incluyen
los virus de ARN bicatenario (Grupo III), los virus de ARN monocatenario
positivo (Grupo IV). los virus de ARN monocatenario negativo (Grupo V) y
los virus de ARN monocatenario retrotranscrito (Grupo VI).
El primer puesto entre los virus de ARN lo ocupan los virus de ARN bicatenario
(Grupo III). Este tipo de virus organiza su material genético en ARN de doble
cadena y se replica en el citoplasma celular. Gracias a esto, no son dependientes
de la maquinaria de replicación del ADN de la célula hospedadora. Forman parte
de este grupo los virus del Género Rotavirus, que causan diarreas en
vertebrados, entre otros.
El Grupo IV de la clasificación de Baltimore lo ocupan los virus de ARN
monocatenario positivo. Este tipo de virus organiza su material genético
en moléculas de ARN monocatenario en sentido positivo. En este tipo de virus es
muy importante la polaridad del ARN. ¿Por qué? Muy sencillo. Porque los virus de
ARN monocatenario positivo tienen la misma polaridad que el ARNm celular, así
que llegan con ventaja a la célula y pueden ser traducidos directamente. Forman
parte de este tipo de virus el virus de la hepatitis A, de la fiebre amarilla,
el resfriado común, el coronavirus recientemente descubierto SARS-CoV-2 o el
conocido virus del mosaico del tabaco.
El Grupo V de la clasificación de Baltimore corresponde a los virus de ARN
monocatenario negativo y, al contrario que el Grupo IV, organiza su material
genético en ARN de sentido negativo. Este tipo de virus ha de convertir su ARN

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de sentido negativo en ARN de sentido positivo mediante una ARN-polimerasa
para poder replicarse en la célula. Por ello, los virus del Grupo V suelen aportar
en la infección junto a su material genético una ARN-polimerasa o transcriptasa.
Forman parte de este grupo el virus del ébola, el virus de la gripe, el virus
del sarampión o el virus de la rabia.
Por último, el grupo VI de la clasificación de Baltimore corresponde a virus
de ARN de cadena sencilla que utilizan la acción de una retrotranscriptasa. El
gran conocido de este grupo es el VIH, causante del SIDA. Veremos en el
siguiente post cómo este tipo de virus es capaz de replicarse en las células
hospedadoras.

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