UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERIA AMBIENTAL
BIOTECNOLOGIA
Facultad de ingenierías:
Escuela Profesional
De Ingeniería Ambiental
INFORME DE:
‘‘Uso y aplicaciones del programa bioinformática snap gene y su uso en ingeniería
ambiental”
PRESENTADO POR:
Nelva Rodríguez Mejía – 2018205048
CATEDRATICO:
Blgo. Hebert Hernan Soto Gonzales
CURSO:
Biotecnología
CICLO: 7°mo
FECHA DE ENTREGA:
16 de Noviembre del 2024
Ilo, Moquegua, Perú
ÍNDICE
1 INTRODUCCIÓN 1
2 OBJETIVOS 1
2.1 Objetivos general 1
2.2 Objetivos específicos 1
3 METODOLOGIA 2
3.1 Definiciones 3
3.2 LAS 15 Secuencias 6
3.2.1 Paso N° 01 6
3.2.2 Paso N° 02 7
3.2.3 Paso N° 03 7
3.2.4 Paso N° 04 8
3.3 LAS 8 SECUENCIAS 9
4 RESULTADOS 11
5 RESULTADOS 12
6 CONCLUSIONES 13
7 BIBLIOGRAFIA 13
ÍNDICE DE FIGURAS
1 INTRODUCCIÓN
El avance de la bioinformática ha permitido el desarrollo de herramientas
innovadoras como SnapGene, un programa diseñado para la visualización, simulación y
análisis de secuencias genéticas. Este software es ampliamente utilizado en biología
molecular, pero su potencial se extiende a diversas áreas, incluyendo la ingeniería
ambiental. SnapGene permite realizar análisis detallados de ADN, lo que puede aplicarse
en la caracterización de microorganismos para remediación ambiental, control de
contaminación y manejo sostenible de recursos naturales.
Este informe explora las capacidades de SnapGene y cómo su uso contribuye al
desarrollo de soluciones innovadoras en ingeniería ambiental.
2 OBJETIVOS
2.1 Objetivos general
- Identificar las aplicaciones del software SnapGene en proyectos de ingeniería
ambiental, especialmente en la identificación y manipulación genética de
microorganismos.
2.2 Objetivos específicos
Analizar secuencias genéticas relacionadas con microorganismos utilizados
en biorremediación.
Identificar enzimas de restricción y fragmentos genéticos clave mediante
SnapGene.
1
Proponer métodos para integrar herramientas bioinformáticas en proyectos
ambientales.
3 METODOLOGIA
1. Selección de secuencias genéticas: Se descargaron secuencias relacionadas con
microorganismos de bases de datos como NCBI, siguiendo el protocolo
establecido en herramientas bioinformáticas.
2. Uso de SnapGene:
- Importación de secuencias genéticas.
- Identificación de sitios de corte con enzimas como EcoRI y ApoI.
- Simulación de mapas genéticos.
3. Análisis aplicado: Las secuencias fueron analizadas para evaluar su potencial en
procesos de remediación ambiental, como la degradación de hidrocarburos o el
tratamiento de aguas residuales.
2
3.1 Definiciones
1. Apai
Es una enzima de restricción del tipo II que corta ADN en la secuencia
específica GGGCCC. Es usada en biología molecular para fragmentar y
manipular ADN en estudios de clonación, ingeniería genética y análisis de
secuencias.
2. Ecori.
Es una enzima de restricción tipo II ampliamente utilizada en biología
molecular. Aislada de la bacteria Escherichia coli, esta enzima reconoce y
corta la secuencia palindrómica específica GAATTC, realizando el corte entre
las bases G↓AATTC. Esto produce extremos cohesivos o "pegajosos", que son
útiles para unir fragmentos de ADN en técnicas como la clonación de genes y la
construcción de plásmidos recombinantes. EcoRI es una de las primeras y más
comunes enzimas de restricción empleadas en la manipulación genética debido
a su especificidad y facilidad de uso.
3. AccI
Es una enzima de restricción tipo II que reconoce y corta específicamente la
secuencia de ADN GT↓AC en el punto indicado por la flecha. Es utilizada en
biología molecular para manipular fragmentos de ADN en técnicas como la
clonación y el análisis de genomas.
3
4. BmgBI
Es una enzima de restricción tipo II que reconoce y corta la secuencia
específica CAC↓GTG en el punto indicado. Es útil en biología molecular para
el análisis y manipulación de ADN, especialmente en clonación y construcción
de plásmidos.
5. Esp3I
Es una enzima de restricción tipo IIS que reconoce la secuencia específica
CGTCTC y corta fuera del sitio de reconocimiento, generando extremos
cohesivos. Es ampliamente utilizada en biología molecular para ensamblajes de
ADN como el método Golden Gate.
6. HgaI.
Es una enzima de restricción tipo IIS que reconoce la secuencia específica
GACGC↓NNNNN y corta en una posición distante al sitio de reconocimiento.
Es utilizada en ensamblajes genéticos como Golden Gate, permitiendo unir
fragmentos de ADN de forma precisa.
7. PciI
Es una enzima de restricción tipo II que reconoce la secuencia específica
ACAT↓GT y realiza el corte en el punto indicado. Es utilizada en biología
molecular para la clonación de genes y análisis de fragmentos de ADN.
8. SfoI
Es una enzima de restricción tipo II que reconoce la secuencia específica
GGCG↓CC y corta en el punto indicado. Genera extremos romos, lo que la
hace útil en técnicas de clonación y ensamblaje de ADN.
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9. TspRI
Es una enzima de restricción tipo II que reconoce la secuencia específica
CASTG↓N (donde S representa G o C, y N cualquier base) y corta en el punto
indicado. Se utiliza en biología molecular para análisis y manipulación de
ADN.
10. AciI
Es una enzima de restricción tipo II que reconoce la secuencia específica
CCGC↓GG y corta en el punto indicado. Genera extremos cohesivos y se
utiliza en biología molecular para estudios de metilación y análisis de ADN.
11. XmaI
Es una enzima de restricción tipo II que reconoce la secuencia específica
C↓CCGGG y corta en el punto indicado. Genera extremos cohesivos
("pegajosos") y es ampliamente utilizada en clonación y manipulación de ADN.
5
3.2 LAS 15 Secuencias
3.2.1 Paso N° 01
Buscar [Link] que contenga a partir 1500 bp
para descargar 15 secuencias.
6
3.2.2 Paso N° 02
Guardar en una carpeta nueva de tu ordenador.
3.2.3 Paso N° 03
Abrir las 15 secuencias en el [Link]
7
3.2.4 Paso N° 04
8
A cada secuencia aplicar EcoRI se dividen en dos partes
3.3 LAS 8 SECUENCIAS
Revista proporcionada por el docente.
9
De la tabla 2 descargar en el [Link]
cada uno de las secuencias.
10
Abrir snapegene nuevo file ingresar las 8 secuencias guardar.
4 RESULTADOS
11
De las 16 secuencias todas tienen EcoRI.
De las 8 secuencias tienen ApoI
5 RESULTADOS
Se identificaron sitios de restricción comunes en secuencias de
microorganismos utilizados en biorremediación.
SnapGene permitió simular la inserción de genes en plásmidos,
facilitando el diseño de microorganismos genéticamente modificados.
Los análisis mostraron cómo estos microorganismos podrían mejorar
procesos ambientales como la degradación de fenoles y el tratamiento
de aguas contaminadas.
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6 CONCLUSIONES
SnapGene es una herramienta poderosa para la ingeniería genética en
aplicaciones ambientales.
Su facilidad de uso y precisión en la simulación de procesos genéticos lo
convierten en una opción ideal para investigadores y profesionales en
ingeniería ambiental.
El uso de herramientas bioinformáticas es clave para enfrentar desafíos
como la contaminación y el manejo sostenible de recursos.
7 BIBLIOGRAFIA
SnapGene. (2024). Guía de usuario. Recuperado de
[Link]
National Center for Biotechnology Information. (2024). Base de datos de
secuencias genéticas. Recuperado de [Link]
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