Virus Generalidades e Introducción A La Patogénesis Viral
Virus Generalidades e Introducción A La Patogénesis Viral
E INMUNOLOGÍA
1º CÁTEDRA
MICROBIOLOGÍA I.
VIROLOGÍA: TEÓRICO 19
VIRUS
Generalidades
e Introducción a la
Patogénesis viral
José Raúl Oubiña
Objetivos generales de la Cursada
Se pretende que los alumnos logren
en el área Virología:
✓ Comprender en profundidad la Patogénesis de las
Virología
Epidemiología Inmunología
Importante
Como se mencionó al inicio de la Clase Teórica,
se exhiben en este PDF algunas imágenes no utilizadas
durante su dictado, al sólo efecto de facilitar
la correlación / sistematización temática por parte de cada alumno
como plataforma Introductoria a la Virología
y su ulterior revisión, una vez concluida la cursada.
Glóbulo rojo
(dam=7.500 nm)
Ribosomas
bacterianos
(25 nm) Virus viruela
(200 x 300 nm)
Virus polio
(30 nm) Bacteriófago T4
(200 x 300 nm)
Virus del mosaico del tabaco
(15 x 300 nm)
Megavirus chilensis: ¡700 nm!
…es descubrir su
presencia !
HSV-1 / 2 RSV HSV-1 / 2 Influenza Rotavirus
Así TLR2 TLR4 TLR9 TLR7/8 TLR3
empezamos
a
defendernos
(I)
Superficie
Intracelular:
celular endosoma
y RE
MaI/TRAP
MaI/TRAP
MyD88
MyD88 TRIF
MyD88 TBK1
IRAK 1 / 2
TRIF IKK ε
IKK α, β, γ
IRF 3, 5, 7
NFκB
Así
<CARDIF empezamos
a
defendernos
(II)
Vía de señalización
RLR – MAVS
(= VISA = IPS-1)
(RIG-1 Like Receptors
MAVS: mitochondrial antiviral signaling
protein)
IPS-1: Interferon promoter stimulator -1;
VISA: Virus inducing signaling adaptor)
TRIM25 (tripartite motif protein 25) y
RIPLET ubiquitino-ligasas.
14-3-3 epsilon: chaperona
Así
empezamos
a
defendernos
(III)
¿Son agentes infecciosos?
Infección: del latín infectio, “teñir”
Ver:
[Link]
past-issues/what-is-life/article/are-viruses-
[Link]
Parasitismo
genético
100 nm
Infectividad
Antigenicidad
Virus influenza
VIRUS
• AGENTES INFECCIOSOS
• PUEDEN CRISTALIZARSE
Vacuna
Vacuna
bivalente
trivalente
anti-polio
anti-polio
Partículas
Defectivas
Viriones
/
subvirales
Partículas
Partículas
virales
Viriones /
defectivas
subvirales
Proteínas estructurales y no estructurales. Virión vs. partícula viral vs. partícula defectiva
PICORNAVIRUS HERPESVIRUS
ADENOVIRUS
VIRUS HEPATITIS B
VIRUS INFLUENZA
VIRUS PAPILOMA
HUMANO
Simetría viral
Helicoidal Icosaédrica Mixta
(todos con envoltura)
Compleja
Bacteriofago T4
Viruela
Ebola
HIV
Adenovirus
Influenza
Relación estructura – función (I)
◆ Ácido nucleico: información genética
infectividad
◆ Tamaño: 1000 a 100.000 codones
(300 codones / gen)
◆ Disposición: continua (lineal, circular o
superenrollado) o segmentada
◆ Polaridad: + o -
Clasificación de virus
Desnudo o Envuelto
Desnudo Envuelto
Envuelto
Microscopia de fuerza atómica
El grupo de A.
Gamarnik
documenta la
circularización
de los extremos
del RNA del
virus dengue.
Progenie
Clasificación de virus
Envuelto Envuelto
Desnudo Envuelto Desnudo/Envuelto
(citoplasmático)
(citoplasmático)
Papiloma
HBV
genes solapados
200 nm
100 nm
100 nm 100 nm
HBc Ag
Virus hepatitis A (HAV):
VP1 desnudo y cuasi-envuelto
El HAV circula como población de partículas desnudas
¡y también envueltas en membranas exosomales del hospedador!
30 nm
Virus hepatitis E José Raúl Oubiña
Cátedra I de Microbiología, Parasitología e
Inmunología
Fac. de Medicina. UBA. 2016
HPV: diferentes epítopes en las VLPs
genotipo-específicas 6, 35,16 y 18
50 nm
Replicón de HCV
(construcción artificial)
Stanley B. Prusiner
Carleton Gadjusek
Premio Nobel de Medicina o
Premio Nobel de Medicina o Fisiología
Fisiología , 1997
1987
“Virus lentos” :
NO existen…
≠ Priones: ¡SÍ!
VLP: Viral like particles o partículas semejantes a virus artificiales. No infectan pues carecen del
genoma viral, aunque mantienen su capacidad inmunogénica. (Ej. vacuna para HPV o HEV)
Replicón: ácido nucleico (DNA o RNA) capaz de replicarse en forma autónoma (Ej. replicones
artificiales de HCV).
Priones
Agentes infecciosos de enfermedades definidas que se cree, consisten en un tipo simple de
proteína sin presencia de ácido nucleico. La proteína y el gen que la codifica se encuentran
en células sanas, no infectadas. Estos agentes están asociados con enfermedades humanas
tales como la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, scrapie en ovejas y la encefalopatía bovina
espongiforme (BSE) en ganado vacuno.
✓ Comentarios “virulentos”
✓ Un virus es…
✓ Los virus ayer, hoy… ¿y siempre?
• Constituyentes virales: relación entre estructura y función
✓ Viriones, partículas subvirales, VLPs, replicones…¿y esto?
• Viroma: ¿de dónde? ¿adónde? ¿Por qué?
• Virus en la célula: susceptibilidad, permisividad,
infecciones productivas y abortivas…
• ¿Son todos los virus iguales en su estrategia replicativa?
• Las Infecciones según la temporalidad,
la espacialidad y el hospedador
Genoma Proteoma Metaboloma
VIROMA
Y por si esto fuera poco……
[Link].[Link].000.000.000
1031 virus en el planeta
Retrovirus
endógenos Infecciones
persistentes
Bacteriófagos
comensales
Viroma Infecciones
agudas
humano
Bacteriófagos con
potencial patogénico
o con genes de
resistencia a
Antibióticos
Nuevos
Nuevos
Bacteriófagos
virus
Viroma humano…
(colección de todos los virus en
el cuerpo humano) ¿tenemos
virus como flora normal?
Crecimiento de la base
de datos de virus
Secuencias nucleotídicas
Otros
Componentes del viroma y su asociación
con la relación genotipo / fenotipo
Simbiosis mutualista
Variación fenotípica
Diversificacion viral interindividual
Y rápida evolución
Enfermedad viral
´típica
Viroma
procariótico
Disparadores
✓ Agentes vacunales
CONJUNTIVA
ARTRÓPODOS
SANGRE
TRACTO RESPIRATORIO
INJURIA
TRACTO GASTROINTESTINAL
TRACTO UROGENITAL
PIEL y MUCOSAS
ANAL
VERTICAL
Modificado de [Link]
Entrada, diseminación y eliminación
Sitios de
Vaso replicación
Músculo Hígado Bazo sanguíneo
Sangre HIV
Sangre HBV Viremia
secundaria
Sitios de replicación
Basolateral
INFECCIÓN DISEMINADA
se disemina más allá del sitio primario de
replicación. Cuando varios órganos son
afectados se hace referencia a una
infección sistémica.
Egreso del virus sarampión en células
epiteliales polarizadas
Polo apical: Polo basolateral: Polo apical: Polo basolateral:
48 hs p.i. 48 hs p.i. 7 días p.i. 7 días p.i.
Baja magnificaciòn
Alta magnificaciòn
Infecciones virales
✓ Comentarios “virulentos”
✓ Un virus es…
✓ Los virus ayer, hoy… ¿y siempre?
• Constituyentes virales: relación entre estructura y función
✓ Viriones, partículas subvirales, VLPs, replicones…¿y esto?
• Viroma: ¿de dónde? ¿adónde? ¿Por qué?
✓ Virus en la célula: susceptibilidad, permisividad,
infecciones productivas y abortivas…
• ¿Son todos los virus iguales en su estrategia replicativa?
• Las Infecciones según la temporalidad,
la espacialidad y el hospedador
Un virus no puede infectar cualquier tipo de célula...
Tropismo: Capacidad de un virus de infectar una población
determinada de células de un órgano o tejido. Está influenciada
por factores virales (por ej., puerta de entrada) y del huésped
(cofactores celulares, correceptores).
1) Adsorción
2) Penetración
3) Desnudamiento
4) Replicación del
genoma/Síntesis de
proteínas virales
5) Ensamblaje
6) Egreso
Replicación de genoma: - en el núcleo (virus con DNA, a excepción de poxvirus)
- en el citoplasma (virus con RNA, a excepción de influenza, hepatitis D
y retrovirus, que lo hacen en el núcleo)
Cultivo de células VERO
no infectado
Infección aguda productiva ¡Infección productiva!
asociada a lisis celular con
DICT50/ ml de
sobrenadante
destrucción de la monocapa
Virus detectable en extractos celulares
y en el sobrenadante.
El título se determina en forma semi-
cuantitativa en DICT50 / ml
////
1h 5 – 11 días
post-infección
Título de virus Junín
en sobrenadante
Título: UFP/ml
Dulbecco R, 1952.
Premio Nobel de Medicina o Fisiología, 1975. Clones de virus
Cuantificación del título viral
en estudios de patogénesis
Título: UFP/ml
M.Ósea
Hígado
Pulmón
2 objetivos
RNA
viral
VIRIÓN
¿La susceptibilidad celular implica su permisividad?
INFECCIÓN PRODUCTIVA
Ciclo de replicación completo con producción de progenie viral.
INFECCIÓN ABORTIVA
El virus infecta una célula susceptible pero irreversiblemente
no completa su ciclo de replicación (NO hay progenie viral)
(por carecer de algún gen viral esencial o celular no expresado
Por ej.: Influenza en ciertas células macrofágicas de pulmón
No necesariamente benigna para la célula:
• Daño en membranas, lisis de endosomas, activación de vías de apoptosis, de
piroptosis (por ej. con HIV), producción de interferones, etc..
¿Se puede crear un virus?
Receptores celulares
Clatrina
CD81 CLDN-1, 6 o 9
SR-BI
GAG
Fusión
Liberación
del RNA viral H+
Citoplasma
ENDOCITOSIS
Liberación del AN
Citoplasma
Endosoma
Liberación del AN
Lisis
ECHO 1
Entrada del virus a la célula Macropinocitosis
Virus en la célula:
“¿A dónde voy?”
DINEÍNA
ENDOSOMA
MIGRACIÓN INTRACELULAR
La disrupción de los microtúbulos en células tratadas con colchicina (D,E,F; tinción con fluoresceína),
impide el tráfico nuclear de una cepa de poliomavirus murino (VP1 viral teñida de rojo con rodamina
en células control NIH3T3 sin tratar; A,B y C)
Entrada al núcleo
Virus con genoma
a ADN, retrovirus,
influenza, HDV
Clasificación de Baltimore
Todos los
Todos los caminos
caminos conducen
conducen al
a ...
... mRNA
El genoma RNApol/
viral actúa RNAdep viral RNApol/
como RNAdep
mRNA viral
RNApol II
celular RNApol/
RNAdep viral RNApol II
celular
Transcriptasa
inversa viral
RNA
ambisentido Hepatitis D
Todos los
Todos los caminos
caminos conducen
conducen al
a ...
... mRNA
El genoma RNApol/
viral actúa RNAdep viral RNApol/
como RNAdep
mRNA viral
RNApol II
celular RNApol/
RNAdep viral RNApol II
celular
Transcriptasa
inversa viral
RNA
ambisentido Hepatitis D
Ribonucleoproteínas (RNP) de
Pichindé
200 nm
100 nm
100 nm 100 nm
Nucleo- a
c
proteína NP
t
presente en
o
las RNP del
virus RNP
Pichindé
para
RNP: ribonucleoproteína
investigar la
actividad de Pichinde:
RNA arenavirus no patógeno
para el humano
polimerasa
viral
asociada a
dicha
fracción
Auto-
radiografía Gel Northern blot
del Gel Northern blot
Actividad de RNA polimerasa
del virus Pichinde:
Actividad de RNA polimerasa
del virus Pichinde:
Síntesis de RNA
Potenciales blancos terapéuticos en la infección por HCV
(180) (204)
Variabilidad del HBV (II)
➢ Cambios menores:
Transcriptasa inversa
1 /103 – 104 nt/site/yr
Evolución de
cuasiespecies
➢Cambios mayores
Fuerte presión de selección de la
Rta. Inmune / Recombinación
¿Nos infectamos con un solo virus?
La presión de selección (ej: sistema
inmune, terapia) altera la composición
…algunos serán eliminados pero otros…
…perduran !
Cuasiespecies del HBV
Pacientes
Banda
1 2 3 4 5 en la
SSCP 1 2 3 4 5
1 X
2 X X
3 X X X X
4 X
5 X X X X
6 X X X X
7 X X X X X
8 X
9 X X X
10 X X X X X
11 X X X
12 X X X X X
Variantes y mutantes del HBV
Variantes
(≠ nt)
Mutantes
(≠ aa)
1. Presión de
selección De Franchis et
2. Fenotípicamente al, 2003;
definidas Wai et al, 2004
Mecanismos generadores de
VARIABILIDAD GENÉTICA
MUTACIONES
DELECIONES
INSERCIONES
RE-ASOCIACIONES
RECOMBINACIONES
¿El hospedador se infecta con UN virus
o …con una POBLACIÓN VIRAL?
CUASIESPECIES:
variantes genéticas cercanamente
relacionadas y viables sometidas
a proceso de evolución y
selección
SEROTIPO ≠ GENOTIPO
• ESPECIE
• SEROTIPO(s)
• Mutante(s) (eventuales)
• Genotipos
• Formas recombinantes (eventuales)
• Cuasiespecies (virus a RNA [con RNA polimerasa-RNA dependiente o
con transcriptasa inversa] y a DNA [con transcriptasa inversa])
Partículas de poliomavirus murino (50 nm) unidas a microtúbulos de células BMK. 96 h post-infección,
presumiblemente al egresar de la célula.
Sanjuan NA et al. Virology, 2003
Salida (egreso) de la progenie viral de la
Brotación
célula
Apoptosis
Endocitosis reversa
Doitsh et al, Nature 505 509, 2014
Eliminación
del DNA viral
Detección
LT CD4+ diana Sobrevida
por la Rta.
inmune
Acumulación
del DNA viral innata
LT CD4+ Piroptosis
productivamente
infectado
✓ Comentarios “virulentos”
✓ Un virus es…
✓ Los virus ayer, hoy… ¿y siempre?
• Constituyentes virales: relación entre estructura y función
✓ Viriones, partículas subvirales, VLPs, replicones…¿y esto?
• Viroma: ¿de dónde? ¿adónde? ¿Por qué?
✓ Virus en la célula: susceptibilidad, permisividad,
infecciones productivas y abortivas…
✓ ¿Son todos los virus iguales en su estrategia replicativa?
• Las Infecciones según la temporalidad,
la espacialidad y el hospedador
Patogénesis viral (I)
◼ Según espacialidad:
localizadas o sistémicas
◼ Según temporalidad:
Agudas o
Persistentes Crónicas
Latentes
Lentas
Transformantes
❑ Según hospedador:
Inmunocompetente
o inmunodeficiente
Una misma célula MDCK infectada por dos virus diferentes:
la población del virus SV5 egresa por el polo apical;
La población del virus de la estomatitis vesicular,
lo hace por el polo basolateral
Brotación de
Infección aguda localizada
virus influenza
por el polo
apical de
células
epiteliales
Patogénesis viral
Espectro de eventos
desencadenados por un
virus que conducen al
daño hístico y a la
enfermedad
(la “última” acometida)
Algunos términos de utilidad...
Ejemplos:
Sarampión → alta patogenicidad
Polio → baja patogenicidad,
puede tener elevada virulencia
“Máxima” virulencia”
Rabia
Algunos ejemplos de factores
virales asociados a la virulencia
•IRES (Internal ribosomal entry site) del
virus Coxsackie B y cardiovirulencia
• Mutación en el nucleótido (nt) 472 de la
región 5´ No codificante del RNA del virus
polio asociado a la neurovirulencia del
serotipo 3
•Mutaciones T/A en nt 1762/1764 del DNA
del virus hepatitis B (HBV) asociadas a
mayor gravedad del curso evolutivo
Algunos términos de utilidad...(II)
C Hepatitis aguda o
crónica por
B HBV o HCV
Tipos de infección según temporalidad
Manifestaciones clínicas
Aguda
rotavirus, HAV
rinovirus
Producción Viral
Persistente
crónica
hepatitis B
(portador crónico)
Muerte
Persistente
latente
herpes simplex
Persistente lenta
PEES (sarampión)
Tiempo Muerte
Mimms
Respuesta T Respuesta B
M Anticuerpos séricos
M
a
a
g Plasmocitos
g de vida larga
n
Inf. aguda n i LB de
I LT de memoria memoria
t
t polifuncionales
u Plasmocitos
u y autorrenovables de vida corta
d
d
Tiempo Tiempo
Respuesta T Respuesta B
M M Anticuerpos séricos
a a
g g Plasmocitos
n n Plasmocitos
i I de vida
Inf. crónica LB de larga?
t LT regulados (-) y/o t Memoria?
u con funcionalidad ± u Plasmocitos
d d de vida corta
Tiempo Tiempo
Virgin & Ahmed, Cell, 2009
¿Por qué un grupo significativo de mayores
de 60 años no padeció un curso grave
durante la gripe pandémica de influenza 2009?
¡Los Acs. anti-hemaglutinina del virus Influenza
causante de la pandemia de 1918 H!-SC1918)
reaccionan con la hemaglutinina del virus de 2009
(H1-CA04)!
Absorbancia (450 nm)
Virólisis
Inmune
Neutralización con HBIG del HBV salvaje
(pero no del mutado) en hepatocitos
FcRn
VIGOROSA
POLICLONAL
Francis V. Chisari MULTIESPECÍFICA
DÉBIL
PERSISTENCIA OLIGOCLONAL
100 nm
A B
PEES
Hepatitis B Herpes
Encefalopatía HPV
simplex por priones
CTL
Treg Efector
CTL
Efector
Treg
PERSISTENCIA VIRAL
PROTECCIÓN CONTRA EL DAÑO CELULAR
Panencefalitis esclerosante
subaguda: infección persistente
Lenta
1/106 casos
Sarampíón:
infección aguda
Varicela y zóster: dos enfermedades y
un único virus…
Célula
infectada
Escape viral
Agotamiento Permanente
LT CD4+ parcial mantenimiento y función
Infección crónica
Infección aguda
CURSO DE LA INFECCIÓN
Infección aguda
Control
viral
LT CD4+ LT CD8+
HIV