Cód.

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Tema 4

Enzimas

ESPONTANEIDAD DE UNA REACCIÓN

Toda reacción química está § Adquirir el estado de enlace más

influida por dos fuerzas: estable, el de menor energía (menor
entalpía, H)
aA + bB cC + dD
§ Conseguir el mayor grado de desorden
(mayor entropía, S)

Una reacción será favorable o

espontánea si DG es negativa. Energía libre de Gibbs
o energía libre (G):
DG = DH –TDS
(energía de un sistema capaz
de transformarse en trabajo)

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Una reacción termodinámicamente

Espontaneidad favorable
no es sinónimo de no es
velocidad
necesariamente una reacción rápida.
O2 O2
Glucosa + 6O2 6CO2 + 6H2O
O2 O2 DG´0= - 2867 KJ/mol (686 Kcal/mol)
O2
O2
O2

vR = inapreciable
C6H12O6 CH O
6 12 6
Glucosa 6CO2Glucosa
+ 6H2O
no se modifica

¿Cuál es la diferencia?
Reacción catalizada
enzimaticamente

vR = muy rápido

C6H12O6 + 6O2 6CO2 + 6H2O

Glucosa

¿CÓMO FUNCIONAN LAS ENZIMAS?

Las enzimas son catalizadores muy eficaces; aceleran la
velocidad de la reacción, pero no afectan al equilibrio químico.
Estado de transición (‡) Reacción de
primer orden:
Energía libre, G

S P
K’eq = [P]/[S]

Estado DG’0= - RT ln K’eq

basal Estado
basal v= f / (DG‡)
Transcurso de la reacción

§ DG‡: Energía de activación: Barrera que se debe superar para

iniciar la reacción.
§ La velocidad de reacción (v) depende de la magnitud de DG‡.

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¿CÓMO FUNCIONAN LAS ENZIMAS?

Las enzimas disminuyen la energía de activación
y, por tanto, aumentan la velocidad de la reacción
Energía libre, DG

Estado de transición (‡) E

S P
S ES EP P

con menor
intermedios Complejo Complejo energía de
de reacción enzima-sustrato enzima-producto activación

Transcurso de la reacción

Características de las enzimas

1.- Enorme eficiencia catalítica:
Incrementan la velocidad de la reacción que catalizan
en más de un millón de veces (entre 105-1017).
2.- Especificidad:
Catalizan sólo un tipo específico de reacción y actúan
sólo sobre un sustrato determinado o un nº limitado
de ellos.
3.- Funcionan en condiciones de pH, temperatura y
medio acuoso fisiológicos.
4.- Capacidad de regulación: La actividad de los
enzimas se regula mediante diversos mecanismos
activadores e inhibidores para adecuarse a los
requerimientos celulares.

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Enzimas: Tipos de especificidad

1.- Esteroespecificidad:
Sólo actúan sobre uno de los isómeros posibles:
Ej: Maltasa hidroliza α-glúcidos y no β-glúcidos

2.- Especificidad de reacción:

Sólo actúan en una determinada reacción.
3.- Especificidad de grupo:
Sólo actúan sobre grupos funcionales determinados:
Ej: - Quimiotripsina: enlaces peptídicos adyacentes
a los aminoácidos aromáticos.
- Esterasas: enlaces éster
- Óxidorreductasas utilizan el NADPH en la
biosíntesis pero el NADH en la degradación.

NOMENCLATURA DE ENZIMAS
Enzyme Commission Grupo transferido
(NC-IUBMB) Sustrato
EC 2.X.Y.Z
Cofactor
Tipo de reacción catalizada (TRANSFERASAS)

Clasificación internacional de enzimas

Nº Clase Tipo de reacción catalizada
1 Óxidorreductasas Transferencia de electrones
2 Transferasas Transferencia de grupos: metilo, acilo, amino, fosfato…
3 Hidrolasas Reacciones de hidrólisis (interviene el agua)
4 Liasas Adición de grupos a dobles enlaces o formación
de dobles enlaces por eliminación de grupos.
5 Isomerasas Transferencia intramolecular de grupos
6 Ligasas Formación de enlaces C-C, C-S, C-O y C-N por
condensación acoplada a hidrólisis de ATP.

ATP + D-Glucosa ADP + D-Glucosa-6-fosfato ATP:glucosa fosfotransferasa

ATP ADP + P (Hexoquinasa, EC [Link].)
DG0 = –30,5 kJ/mol
[Link]

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Cofactores enzimáticos
§ Muchas enzimas requieren para su acción catalítica un
componente químico adicional que se denomina COFACTOR. Una
enzima sin su cofactor se denomina APOENZIMA; la enzima completa,
catalíticamente activa, se denomina HOLOENZIMA.
§ El COFACTOR:
- Actúa a modo de puente de unión entre la enzima y el sustrato.
- Estabiliza la conformación de la proteína: asegura una forma
adecuada para que la enzima sea activa catalíticamente.
Los cofactores se pueden clasificar según su naturaleza
química en:
1) Metales: Fe2+/Fe3+, Zn2+, Mg2+,Cu2+, Mn2+, K+, Ni2+, Mo, Se…
2) Coenzimas: moléculas orgánicas pequeñas derivadas
generalmente de las vitaminas.
- Si se une fuertemente a la enzima: Grupo prostético
- Si se une débilmente: Cosustrato
§ Enzimas que usan el mismo coenzima tienen mecanismos de
acción similares.

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Cofactores enzimáticos
Coenzima Fuente Función
COSUSTRATOS
Adenosina trifosfato Transferencia de grupos fosfato
S-adenosilmetionina Transferencia de grupos metilo
Ácido ascórbico Vitamina C Hidroxilación de prolina. Antioxidante
NAD+/NADP+ Niacina Transferencia de 2 electrones
Coenzima A Pantotenato (B3) Transferencia de grupos acilo
Tetrahidrofolato Ácido fólico Transferencia de grupos de 1 C (formilo, [Link].)
Ubiquinona Transferencia de electrones
GRUPOS PROSTÉTICOS
FAD/FMN Riboflavina (B2) Transferencia de 1 ó 2 electrones
Tiamina pirofosfato Tiamina (B1) Transferencia de unidades de 2 C con un carbonilo
Piridoxalfosfato Piridoxina (B6) Transferencia de grupos de aminoácidos
Biotina Biotina Transferencia de grupos carboxilo
Adenosilcobalamina Cobalamina (B12) Reorganización intramolecular
Metilcobalamina Cobalamina (B12) Transferencia de grupos metilo
Retinal Vitamina A Visión
Vitamina K Vitamina K Carboxilación de glutamina

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¿CÓMO FUNCIONAN LAS ENZIMAS?

Las reacciones enzimáticas transcurren en un espacio limitado dentro
de la estructura de la proteína: centro activo

Sustrato
2 etapas:
Ø Unión del sustrato
Ø Reacción: Acción catalítica

Centro activo

Quimotripsina

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Centro activo - Características

1.- Son cavidades tridimensionales.
2.- Suponen una pequeña parte del volumen total
del enzima: 1 Aa o un pequeño grupo de Aas.
3.- El sustrato se une al centro activo mediante
enlaces débiles (puentes de hidrógeno, interacciones
electrostáticas, van der Waals e hidrofóbicas).
Estas interacciones contribuyen no sólo a la
especificidad de la reacción sino que intervienen
también en la catálisis.
4.- La especificidad de un enzima depende de la
disposición de los átomos en el centro activo.

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Centro activo
Los aminoácidos que forman el centro activo pueden estar
muy alejados entre sí en la secuencia primaria de la proteína.

Residuos de
aminoácidos que forman
el centro activo de la
lisozima

posición de los residuos en la cadena peptídica

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SERÍN-PROTEASAS: ejemplo de relación de configuración

del centro activo y especificidad de sustrato.
Quimiotripsina, tripsina y elastasa son proteasas similares en estructura y
mecanismo catalítico pero que, sin embargo, difieren en su especificidad. Cortan el
enlace peptídico, respectivamente, después de un residuo:

Aromático Lisina/Arginina
(cargados +) Alanina/Serina
(apolar, (tamaño pequeño)
voluminoso)

Sus centros activos (llamados “bolsillos” por su forma de cavidad) presentan

diferencias muy pequeñas pero muy significativas que son las responsables de esa
especificidad.
bolsillo
bolsillo bolsillo estrecho
apolar cargado -
amplio

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Especificidad de la
unión enzima-sustrato
(ES)

1. Modelo llave-cerradura
Emil Fischer,1890

2. Modelo del ajuste inducido

Daniel Koshland Jr., 1958

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Efecto de la temperatura
y el pH sobre la actividad Tª óptima

enzimática.

V0 Papain
pH óptimo
Chemotrypsin

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Glucosa-6 Fosfato Glucosa-6 Fosfato

deshidrogenasa deshidrogenasa

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REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

La actividad de las enzimas en las células debe estar estrictamente
regulada y coordinada para responder en cada momento a las
necesidades globales del organismo en respuesta a un entorno
cambiante y con el menor gasto de energía y sustratos.

Mecanismos generales:
•Transcripción
Ø Regulación de la cantidad de enzima: •Traducción
• Degradación

Ø Localización intracelular de enzima y sustrato

(compartimentación).

Ø Isoformas enzimáticas (isoenzimas): actividad y localización

Ø Regulación de la actividad enzimática:

ü Excisión proteolítica: zimógenos
ü Unión reversible de moléculas reguladoras
ü Modificación covalente reversible

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La acción de las enzimas puede inhibirse

§ Los inhibidores enzimáticos son moléculas que se

unen al enzima frenando o deteniendo su actividad.
Muchos fármacos son inhibidores enzimáticos y
también muchos metabolitos intracelulares que
intervienen en la regulación del metabolismo.

§ Los mecanismos y los efectos sobre la cinética

enzimática pueden ser muy diversos y su estudio
constituye una excelente herramienta de estudio del
proceso catalítico.

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La inhibición puede ser:

Ø Irreversible: los inhibidores irreversibles se unen fuerte o

covalentemente a la enzima modificando o destruyendo un
grupo funcional esencial para su actividad.

Ej: la Aspirina acetila un residuo de Ser del centro activo de la

enzima Ciclooxigenasa, inactivándola.

Ø Reversible: desaparece al eliminarse el inhibidor.

Ej: la acción del Ibuprofeno sobre la enzima Ciclooxigenasa se

une al centro activo impidiendo que lo haga el sustrato natural.

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