Informe trabajo práctico: Cálculo de índices de diversidad genética, índice de fijación FST y
construcción de red de haplotipos a partir de secuencias de ADN mitocondrial.
Nombres: Marcelo Felipe Merino Suazo
Tabla 1 Índices de diversidad genética de secuencias parciales del gen Citocromo c Oxidasa I (COI)
del ave del trópico de cola roja, Phaethon rubricauda. n: número de individuos, S: número de sitios
polimórficos, h: número de haplotipos, Hd: diversidad haplotípica, π : diversidad nucleotídica.
Colonias Código n S h Hd π
Kauia, Hawaii Kau 24 12 5 0,540 0,00588
Oahu, Hawaii Oah 13 11 4 0,603 0,00641
Meyer, Nueva Zelanda Mey 11 5 3 0,582 0,00273
Phillip, Australia Phi 25 6 4 0,545 0.00369
Rapa Nui, Chile RN 44 13 8 0.854 0.00609
Salas y Gómez, Chile SG 32 7 5 0.712 0.00260
Total Tt 149 18 13 0,822 0,00735
Tabla 2 Valores de ST (FST) de secuencias parciales del gen COI del ave del trópico de cola roja,
Phaethon rubricauda entre colonias (bajo la diagonal) y valores de probabilidad (P, sobre la
diagonal). Códigos según se indica en la tabla 1. Los valores de significativos P < _____ se muestran
en negrita. La significancia se evaluó utilizando 10.000 permutaciones.
Kau Oha SG RN Mey Phi
Kau -----
Oha 0.89555+-
-----
0.0029
SG 0 0 -----
RN 0 0 0.00634+-
-----
0.0009
Mey 0 0.00040+- 0 0.00010+-
-----
0.0002 0.0001
Phi 0 0 0.00010+- 0 0.26661+-
-----
0.0001 0.0042
Figura 1 Escribir la leyenda correspondiente. Indicar en la leyenda a que corresponden los círculos y
los colores. Copiar la imagen del network obtenido en PopART a continuación y responder las
siguientes preguntas:
1) ¿Cuantos haplotipos muestra la red de haplotipos?
13
2) ¿Cuantos haplotipos están presentes en más de una colonia?
3) ¿Cuantos haplotipos están presentes en sólo una colonia?
4) ¿Cuantos haplotipos están presentes en las seis colonias?
5) ¿Cual colonia presenta el mayor número de haplotipos?
Rapa Nui con 8 de haplotipos
6) El haplotipo de mayor frecuencia esta presente en mayor proporción en la colonia de:
El haplotipo de mayor frecuencia se encuentra en la isla Phillip
