UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
“Año del Bicentenario, de la consolidación de nuestra Independencia, y
de la conmemoración de las heroicas batallas de Junín y Ayacucho”
INFORME DE:
USO DEL SOFTWARE MEGA DNA
ASIGNATURA: BIOTECNOLOGÍA
DC: SOTO GONZALES HERBERT HERNÁN
CICLO: VII
DESARROLLADO POR:
Sucari Pilco Eli Blanca
ILO – MOQUEGUA – PERÚ
1. INTRODUCCIÓN
La secuenciación masiva de ADN en muestras ambientales ha dado lugar al campo de
la metagenómica. Uno de los objetivos finales de esta secuenciación es transferir la
información extraída de los genomas de organismos a formas de vida sintéticas. Estas
podrían diseñarse de diversas maneras para beneficiar a la humanidad y abordar
problemas ecológicos, sirviendo como medicina, combustible o fertilizante, entre
otras aplicaciones.
Los avances tecnológicos en secuenciación hacen que sea atractivo utilizar un enfoque
basado en esta técnica para identificar y cuantificar el transcriptoma de una célula, en
lugar de utilizar matrices que limitan el análisis a transcritos específicos conocidos. La
bioinformática se encarga de crear herramientas informáticas para analizar y gestionar
datos relevantes, además de ayudar a entender cómo se utilizan y procesan estos datos
en contextos biológicos.
Se desarrollaron dos versiones (2.0 y 2.1), cada una de las cuales apoya los análisis de
secuencia molecular (secuencias de ADN y proteínas) y datos de distancia por pares.
Ambos podrían especificar dominios y genes para el análisis de secuencias
comparativas de múltiples genes y podría crear grupos de secuencias que facilitarían
la estimación de dentro y diversidades entre grupos e inferir las relaciones evolutivas
de nivel superior de los genes y especies. MEGA2 implementó muchos métodos para
la estimación de evolución distancias, el cálculo de la secuencia molecular y las
diversidades genéticas dentro y fuera de entre grupos, y la inferencia de árboles
filogenéticos bajo evolución mínima y Criterios de máxima parsimonia. Incluía el
Bootstrap y la probabilidad de confianza pruebas de confiabilidad de has filogenias
inferidas. (Tamura, 2011)
2. OBJETIVOS
2.1. Objetivo General
Realizar un alineamiento múltiple de secuencias utilizando el software MEGA.
Construir un árbol filogenético a partir del alineamiento obtenido en MEGA.
Descubrir y analizar secuencias de ADN para entender su diversidad y
relaciones evolutivas.
3. MARCO TEÓRICO
3.1. Alineamiento Múltiple de Secuencias
El alineamiento múltiple de secuencias es una técnica fundamental en bioinformática
que permite la comparación de varias secuencias biológicas (como ADN, ARN o
proteínas) para identificar regiones de similitud que pueden indicar relaciones
evolutivas, funcionales o estructurales. Existen varios algoritmos y programas que
facilitan esta tarea, siendo MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) uno de
los más utilizados. El alineamiento múltiple ayuda a revelar homología entre
secuencias y es un paso crucial para posteriores análisis filogenéticos.
3.2. Filogenia y Construcción de Árboles Filogenéticos
La filogenia es el estudio de las relaciones evolutivas entre diferentes especies o
grupos de organismos. La construcción de árboles filogenéticos es una herramienta
clave en este ámbito, ya que permite visualizar estas relaciones de forma gráfica.
Utilizando el alineamiento múltiple como base, el software MEGA implementa
diversas metodologías, como el método de máxima verosimilitud y el de vecino más
cercano, para inferir relaciones evolutivas y construir árboles que representen la
historia evolutiva de las secuencias analizadas.
3.3. Análisis de Secuencias de ADN
El análisis de secuencias de ADN es esencial para comprender la variabilidad
genética y las relaciones entre diferentes organismos. Este análisis puede incluir la
identificación de variantes genéticas, la comparación de secuencias para determinar la
similitud o divergencia, y la exploración de la función de genes específicos. Las
técnicas de alineamiento y la construcción de árboles filogenéticos permiten a los
investigadores interpretar datos genéticos en un contexto evolutivo, lo que contribuye
a campos como la biología evolutiva, la ecología y la medicina.
4. MATERIAL NECESARIO
MATERIALES
SOFTWARE MEGA LAPTOP
5. METODOLOGÍA
5.1. PROCEDIMIENTO
La metodóloga aplicada en la presente practica fue la siguiente:
Paso 1: Primeramente, se instaló el software "Mega" el cual se tiene que estar
instalada correctamente en el equipo para su optima ejecución.
Figura 1: El programa para trabajo
Paso 2. Luego pasamos abrir el programa MEGA y clicamos en "alignament > Query
Databanks".
Figura 2: Elaboración propia
Paso 3. Esto nos llevará a un buscador donde, para este trabajo, buscaremos el
microorganismo que contiene el gen Fös.
Figura 3: Elaboración propia de programa paso a paso
Paso 4. Escogemos un microorganismo y clicamos en buscar. De la lista de microorganismos
que encontraremos, seleccionamos uno y nos dará nuestra secuencia esto igual.
Figura 4: Elaboración propia
Paso 5. Luego clicamos en Add To Alignment, dando OK a todas ventanas que se
muestran.
Figura 6: Elaboración propia
Paso 6. En seguida podremos evidenciar el alineamiento de consecuencia que
realizamos.
Figura 7: Elaboración propia
Paso 7. Para este trabajo tomare 10 microorganismos y para cada una de ellos
Seleccionaremos tres tipos. Teniendo encuentra un total 20 alineamientos.
Figura 8: Elaboración propia
Paso 8. Ahora alinearemos nuestras secuencias haciendo clic en Alignament,
posteriormente en Align by MUSCLE dando OK a toda pantalla que se muestre.
De esta manera tendremos todo alineado, en seguida borramos todos los espacios en
blanco seleccionándolos y clicando en X o presionando la tecla suprimir
Figura 9: Elaboración propia
Paso 9. Posteriormente clicamos on PHYLOGENY y seguidamente en Construct/Test
UPGMA Tree Escogemos nuestra PRACTICA Al va guardada y damos OK a todas las
ventanas que se presenten
Figura 10: Elaboración propia
Paso 10. Finalmente, no sale el arbolito
6. RESULTADOS
CONSTRUCCION DEL ARBOLITO FILOGENETICO
Imagen: Resultado de construcción del árbol
Fuente: Elaboración propia
Un árbol filogenético es como un mapa que muestra cómo están relacionados los organismos
a lo largo de la evolución. A través de sus ramas, podemos ver cómo las especies, incluidos
los microorganismos, han surgido de ancestros comunes a lo largo del tiempo. Además, este
mapa nos ayuda a entender en qué momentos históricos se han desarrollado.
En este árbol, dos especies están más conectadas si comparten un ancestro común. La
información que usamos para construirlo proviene de diversas fuentes, como las
características físicas de las especies y las secuencias de ADN de sus genes. Esto nos permite
visualizar la historia de la vida de una manera clara y comprensible.
7. CONCLUSIONES
● Mediante la metodología aplicada se logró realizar el alineamiento de las
secuencias utilizando el programa Molecular Evolutionary Genetics Analysis
(MEGA), el cual resulto sencillo de manejar y es una herramienta muy útil para
cualquier bioinformático. Por otra parte, también se logró construir el árbol
filogenético con el programa MEGA y descubrir y analizar cada una de las
secuencias de ADN que presentaron cierta similitud entre ellas.
● Estos procesos no solo enriquecen nuestro conocimiento científico, sino que
también ofrecen perspectivas sobre la conservación y el manejo de la
biodiversidad en un mundo en constante cambio.
8. BIBLIOGRAFÍA
Felsenstein, J. (2004). Inferring Phylogenies. Sinauer Associates.
Kumar, S., Stecher, G., & Tamura, K. (2016). MEGA7: Molecular Evolutionary
Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets. Molecular Biology and Evolution,
33(7), 1870-1874.
LINKS DE VISUALIZACIÓN COMPARTIDA
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