METABOLISMO DE LOS NUCLEOTIDOS
A. BASES ISOALOXAZINICAS, PURINICAS Y PIRIMIDINICAS (NUCEOTIDOS)
Las purinas y pirimidinas son heterociclos que contienen nitrógeno, carbono,
otros (hetero) atomos, como nitrogeno. La molecula de pirimidina de menor
tamaño tiene el nombre más largo, y que la molecula de purina de mayor
tamano tiene el nombre más corto, y que sus anillos de seis atomos.
Las purinas o pirimidinas con un grupo —NH2 son bases debiles (valores de
pKb de 10 a 11). La naturaleza planar de las purinas y las pirimidinas facilita su
asociacion estrecha, o “apilamiento”, que estabiliza el DNA bicatenario. Los
grupos oxo y amino de purinas y pirimidinas muestran tautomerismo ceto-enol y
aminaimina aunque las condiciones fisiologicas favorecen fuertemente las
formas amino y oxo.
Los nucleósidos son N-glucósidos
Los nucleosidos son derivados de purinas y pirimidinas que tienen un azucar
enlazado a un nitrogeno de anillo de una purina o pirimidina. Los numeros con
una prima (p. ej., 2ʹ o 3ʹ) distinguen entre los atomos del azucar y los del
heterociclo. El azucar en los ribonucleosidos es la D-ribosa, y en los
desoxirribonucleosidos es la 2-desoxi-D-ribosa. Ambos azucares estan unidos al
heterociclo por medio de un enlace β-N-glucosidico, casi siempre al N-1 de una
pirimidina o al N-9 de una purina.
B. FUNCIONES DE LAS BASES NITROGENEDAS
Los tejidos humanos son capaces de sintetizar purinas y pirimidinas a partir de
intermediarios anfibólicos. Los ácidos nucleicos y nucleótidos ingeridos, que en
consecuencia son no esenciales en la dieta, se degradan en el tubo digestivo
hacia mononucleótidos, que se pueden absorber o convertir en bases purina y
pirimidina. A continuación, las bases purina se oxidan hacia ácido úrico, que se
puede absorber o excretar en la orina. Si bien poca o ninguna purina o pirimidina
de la dieta se incorpora hacia ácidos nucleicos de tejidos, los compuestos
inyectados sí lo hacen. De este modo, la incorporación de [3H]timidina inyectada
hacia DNA recién sintetizado, se usa para medir el índice de síntesis de DNA.
Ademas de servir como precursores de acidos nucleicos, los nucleótidos purina
y pirimidina participan en funciones metabolicas tan diversas como el
metabolismo de energia, la sintesis de proteina, la regulacion de la actividad
enzimatica y la transduccion de senal.
Cuando se enlazan a vitaminas o derivados de vitaminas, los nucleótidos forman
parte de muchas coenzimas. Como los principales donadores y receptores de
grupos fosforilo en el metabolismo, los nucleosidos trifosfatos y difosfatos, como
el ATP y ADP, son los principales elementos en las transducciones de energia
que acompañan a las interconversiones metabolicas y la fosforilacion oxidativa.
Enlazados a azucares o lipidos, los nucleosidos constituyen intermediarios
biosinteticos clave. Los derivados del azucar UDP-glucosa y UDP-galactosa
participan en interconversiones de azucar y en la biosintesis de almidon y
glucogeno. De modo similar, los derivados nucleosido-lipido, como el CDP-
acilglicerol, son intermediarios en la biosintesis de lipidos. Las funciones de los
nucleotidos en la regulación metabolica son fosforilacion (dependiente de ATP)
de
enzimas metabolicas clave, regulacion alosterica de enzimas por ATP, AMP y
CTP, y control por el ADP del indice de fosforilación oxidativa. Los nucleotidos
ciclicos cAMP y cGMP sirven como los segundos mensajeros en eventos
regulados por hormonas, y el GTP y GDP desempenan funciones clave en la
cascada de eventos que caracterizan a las vias de transducción de senal. Las
aplicaciones específicamente medicas son el uso de analogos de purina y
pirimidina sinteticos que contienen halogenos, tioles, o atomos de nitrógeno
adicionales, en la quimioterapia de cancer y SIDA, y como supresores de la
respuesta inmunitaria durante trasplante de organos.
BIOSÍNTESIS DE NUCLEÓTIDOS
PURINA
Con la excepción de protozoarios parásitos, todas las formas de vida sintetizan
nucleótidos purina y pirimidina. La síntesis a partir de intermediarios anfibólicos
procede a índices controlados apropiados para todas las funciones celulares.
Con el fin de lograr homeostasis, mecanismos intracelulares detectan y regulan
el tamaño del fondo común de nucleótido trifosfatos (NTP), que aumenta durante
el crecimiento, o la regeneración de tejido, cuando las células se están
dividiendo con rapidez. Los nucleótidos purina y pirimidina se sintetizan in vivo a
índices congruentes con la necesidad fisiológica.
En las investigaciones tempranas de biosíntesis de nucleótido se emplearon
primero aves, y más tarde Escherichia coli. Precursores isotópicos suministrados
como alimento a palomas establecieron la fuente de cada átomo de una purina e
iniciaron el estudio de los intermediarios de la biosíntesis de purina. Tejidos de
aves sirvieron como una fuente de genes clonados que codifican para enzimas
de la biosíntesis de purina y las proteínas reguladoras que controlan el índice de
biosíntesis de purina.
Los tres procesos que contribuyen a la biosíntesis de nucleótido
purina son, en orden de importancia decreciente:
1. Síntesis a partir de intermediarios anfibólicos (síntesis de
novo).
2. Fosforribosilación de purinas.
3. Fosforilación de nucleósidos purina.
LA INOSINA MONOFOSFATO (IMP) SE SINTETIZA A PARTIR DE
INTERMEDIARIOS ANFIBÓLICO.
Además de ser el primer intermediario formado en la vía de novo para la
biosíntesis de purina, el 5fosforribosil5pirofosfatoNes un intermediario en laNvía
de recuperación de purina, y en la biosíntesis de nucleótidos pirimidina, NAD+ y
NADP+.
C. SINTESIS DE LOS NUCLEOTIDOS
D. SINTESIS DE LOS ACIDOS NUCLEICOS, ADN Y ARN
Los nucleósidos son derivados de purinas y pirimidinas que tienen un azúcar
enlazado a un nitrógeno de anillo de una purina o pirimidina. Los números con
una prima (p. ej., 2ʹ o 3ʹ) distinguen entre los átomos del azúcar y los del
heterociclo. El azúcar en los ribonucleósidos es la D-ribosa, y en los
desoxirribonucleósidos es la 2-desoxi- D-ribosa. Ambos azúcares están unidos
al heterociclo por medio de un enlace β-N-glucosídico, casi siempre al N-1 de
una pirimidina o al N-9 de una purina.
Los nucleótidos son nucleósidos fosforilados
Los mononucleótidos son nucleósidos con un grupo fosforilo esterificado a un
grupo hidroxilo del azúcar. Los nucleótidos 3ʹ y 5ʹ son nucleósidos con un grupo
fosforilo en el grupo 3ʹ- o 5ʹ-hidroxilo del azúcar, respectivamente. Dado que
casi todos los nucleótidos son 5ʹ-, el prefijo “5ʹ-” por lo general se omite cuando
se les cita. Así, el UMP y el dAMP representan nucleótidos con un grupo fosforilo
en el C-5 de la pentosa. Los grupos fosforilo adicionales, ligados por enlaces
anhídrido de ácido al grupo fosforilo de un mononucleótido, forman nucleósido
difosfatos y trifosfatos. Se usan abreviaturas de una sola letra para identificar a
la adenina (A), guanina (G), citosina (C), timina (T) y uracilo (U), sean libres o
presentes en nucleósidos o nucleótidos.
El prefijo “d” (desoxi) indica que el azúcar es 2ʹ-desoxi-Dribosa (p. ej., en el
dATP)
La reducción del 2ʹhidroxilo de purina y pirimidina ribonucleótidos, catalizada por
el complejo de ribonucleotido reductasa forma desoxirribonucleósido difosfatos
(dNDP). El complejo enzimático sólo es funcional cuando las células están
sintetizando de modo activo DNA. La reducción necesita tiorredoxina,
tiorredoxina
reductasa y NADPH. El reductor inmediato, tiorredoxina reducida, se produce
por la NADPH: tiorredoxina reductasa.
La reducción de ribonucleósido difosfatos (NDP) hacia dNDP está sujeta a
controles reguladores complejos que logran producción equilibrada de
desoxirribonucleótidos para la síntesis de DNA.
BIOSÍNTESIS DE NUCLEÓTIDOS
PIRIMIDINA
El catalítico para la reacción inicial es la carbamoil fosfato sintasa II citosólica,
una enzima diferente de la carbamoil fosfato sintasa I mitocondrial de la síntesis
de la urea.
De esta manera, la compartamentalización proporciona dos fondos comunes
independientes de carbamoil fosfato. El PRPP, un participante temprano de la
síntesis de nucleótido purina es un participante mucho más tardío en la
biosíntesis de pirimidina. Proteínas multifuncionales catalizan las reacciones
tempranas de la biosíntesis de pirimidina
Mientras que las células de mamífero reutilizan pocas pirimidinas libres, las
“reacciones de recuperación” convierten los pirimidina ribonucleósidos uridina y
citidina, y los pirimidina desoxirribonucleósidos timidina y desoxicitidina hacia
sus nucleótidos respectivos.
Las fosforribosiltransferasas (cinasas) dependientes de ATP catalizan la
fosforilación de los difosfatos de la 2ʹdesoxicitidina, 2ʹdesoxiguanosina y
2ʹdesoxiadenosina hacia sus nucleósido trifosfatos correspondientes. Más aún,
la orotato fosforribosiltransferasa una enzima de la síntesis de nucleótido
pirimidina, recupera ácido orótico al convertirlo en orotidina monofosfato (OMP).
El metotrexato bloquea la reducción de dihidrofolato es la única reacción de la
biosíntesis de nucleótido pirimidina que requiere un derivado tetrahidrofolato. El
grupo metileno del N5,N10metilenotetrahidrofolato se reduce hacia el grupo
metilo que se transfiere, y el tetrahidrofolato se oxida hacia dihidrofolato. Para
que ocurra síntesis adicional de pirimidina, es necesario que el dihidrofolato se
reduzca de regreso hacia tetrahidrofolato, una reacción catalizada por la
dihidrofolato reductasa.
Así, las células en división, que deben generar TMP y dihidrofolato, son en
especial sensibles a inhibidores de la dihidrofolato reductasa, como el
medicamento anticáncer metotrexato. Los seres humanos convierten la
adenosina y guanosina en ácido úrico.
La adenosina desaminasa convierte primero la adenosina en inosina. En
mamíferos que no son los primates superiores, la uricasa convierte el ácido úrico
en el producto hidrosoluble alantoína, pero, dado que los seres humanos
carecen de uricasa, en ellos el producto terminal del catabolismo de la purina es
el ácido úrico.
E. PRINCIPALES ALTERACIONES DEL METOBOLISMO DE LOS
NUCLEOTIDOS.
Aun cuando los estados de deficiencia de purina son raros en seres humanos
hay muchos trastornos genéticos del catabolismo de purina.
Las hiperuricemias pueden diferenciarse con base en si los enfermos excretan
cantidades normales o excesivas de uratos totales. Algunas hiperuricemias
reflejan defectos enzimáticos específicos. Otras son consecutivas a
enfermedades como cáncer o psoriasis que aumentan el recambio de tejido.
Síndrome de Lesch-Nyhan
Es una hiperuricemia por producción excesiva, que se caracteriza por episodios
frecuentes de litiasis por ácido úrico, y un síndrome raro de automutilación, que
refleja un defecto de la hipoxantinaguanina fosforribosiltransferasa, una enzima
de la recuperación de purina.
El incremento acompañante del PRPP intracelular causa producción excesiva de
purina. Las mutaciones que aminoran o suprimen la actividad de la
hipoxantinaguanina fosforribosiltransferasa son deleciones, mutaciones por
cambio de marco (también conocida como mutación del marco de lectura),
sustituciones de bases y empalme aberrante de Mrna.
Enfermedad de von gierke
La producción excesiva de purina y la hiperuricemia en la enfermedad de von
Gierke (deficiencia de glucosa-6-fosfatasa) son una consecuencia de generación
aumentada del precursor de PRPP ribosa5fosfato.
Una acidosis láctica relacionada incrementa el umbral renal para urato, lo que
aumenta los uratos corporales totales.
Hipouricemia
La hipouricemia y la excreción incrementada de hipoxantina y xantina muestran
vínculo con deficiencia de xantina oxidasa debido a un defecto genético o a daño
hepático grave. Los individuos con una deficiencia enzimática grave pueden
tener xantinuria o litiasis por xantina.
Deficiencia de adenosina desaminasa y de nucleósido purina fosforilasa
La deficiencia de adenosina desaminasa se relacionan con una enfermedad por
inmunodeficiencia en la cual los linfocitos derivados tanto del timo (células T)
como de la médula ósea (células B) son escasos y disfuncionales. Los afectados
sufren inmunodeficiencia grave. En ausencia de remplazo de enzima o de
trasplante de médula ósea, los lactantes suelen sucumbir a infecciones mortales.
La deficiencia de nucleosido purina fosforilasa muestra vínculo con una
deficiencia grave de células T pero función de células B al parecer normal. Las
disfunciones inmunitarias parecen depender de acumulación de dGTP y dATP,
que inhiben la ribonucleótido reductasa y, de esta manera, agotan los
precursores de DNA en las células.
Al contrario de los productos terminales del catabolismo de la purina, los
productos terminales del catabolismo de la pirimidina son los productos muy
hidrosolubles CO2, NH3, βalanina y βaminoisobutirato. Los seres humanos
transaminan el βaminoisobutirato hacia metilmalonato semialdehído, que a
continuación forma succinilCoA
Catabolismo de las pirimidinas.
La β-ureidopropionasa hepatica cataliza la formacion tanto de β-alanina como de
β-aminoisobutirato a partir de sus precursores de pirimidina.
La excreción de βaminoisobutirato aumenta en la leucemia y en la exposició
grave a rayos X, debido al incremento de la destrucción de DNA. Aun así,
muchas personas de ascendencia china o japonesa excretan de modo
sistemático βaminoisobutirato.
Los trastornos del metabolismo de la βalanina y del βaminoisobutirato surgen
por defectos de las enzimas del catabolismo de pirimidina.
Éstos comprenden aciduria β-hidroxibutirica, un trastorno debido a deficiencia
total o parcial de la enzima dihidropirimidina deshidrogenasa. La enfermedad
genética refleja una falta de la enzima. Un trastorno del catabolismo de
pirimidina, también conocido como uraciluriatiminuria combinada, es asimismo
un trastorno
del metabolismo de βaminoacido, puesto que la formación de βalanina y de
βaminoisobutirato está alterada. Cuando se debe a un error congénito hay serias
complicaciones neurológicas. Una forma no genética se desencadena por la
administración del fármaco anticáncer 5fluorouracilo a pacientes que tienen
concentraciones bajas de dihidropirimidina deshidrogenasa. La seudouridina se
excreta sin cambios
Dado que en seres humanos ninguna encima cataliza la hidrólisis o la fosforólisis
de la seudouridina, este nucleósido poco común se excreta sin cambios en la
orina de individuos normales y, de hecho,se aisló primero a partir de la orina.
Dado que los productos terminales del catabolismo de la pirimidina son muy
hidrosolubles, la producción excesiva de pirimidina suscita pocos signos o
síntomas clínicos. En la hiperuricemia vinculada con producción excesiva grave
de PRPP, hay producción exagerada de nucleótidos pirimidina y excreción
aumentada de βalanina. Dado que se necesita N5,N10metilenotetrahidrofolato
para la síntesis del timidilato, los trastornos del metabolismo del folato y de la
vitamina B12 producen deficiencias de TMP.
Acidurias Oróticas
La aciduria orótica que acompaña al sindrome de Reye probablemente es una
consecuencia de la incapacidad de mitocondrias dañadas de manera grave para
usar carbamoil fosfato, que entonces queda disponible para la producción
citosólica excesiva de ácido orótico. La aciduria orotica tipo I refleja una
deficiencia tanto de orotato fosforribosiltransferasa como de orotidilato
descarboxilasa; la aciduria orotica tipo II, más rara, se debe a una deficiencia
sólo de orotidilato descarboxilasa.
La deficiencia de una enzima del ciclo de la urea ocasiona excreción de
precursores de pirimidina
La excreción incrementada de ácido orótico, uracilo y uridina acompaña a una
deficiencia de ornitina transcarbamoilasa en las mitocondrias del hígado.
El carbamoil fosfato excesivo sale hacia el citosol, donde estimula la biosíntesis
de nucleótido pirimidina. Los alimentos con alto contenido de nitrógeno
aumentan la aciduria orotica leve resultante. La aciduria orótica puede
precipitarse
por fármacos El alopurinol, un sustrato alternativo para la orotato
fosforribosiltransferasa, compite con el ácido orótico. El producto nucleótido
resultante también inhibe a la orotidilato descarboxilasa, lo que da por resultado
aciduria orotica y orotidinuria. La 6azauridina, después de conversión en
6azauridilato, también inhibe de manera competitiva a la orotidilato
descarboxilasa,lo que incrementa la excreción de ácido orótico y orotidina.
