TALLER DE ÁCIDOS NUCLEICOS
¿Qué estructuras forman un nucleósido?
Los nucleósidos están formados por ribosa o desoxirribosa y una base heterocíclica.
En cada nucleósido, un enlace b-N-glicosídico conecta el C1 del azúcar al N1 de la pirimidina o al N9 de la
purina.
Son derivados N-ribosilo o N-desoxirribosilo de las purinas o pirimidinas.
Los nombres de los nucleósidos derivan de los de sus bases.
Por ejemplo, el nucleósido que contiene adenina se llama adenosina si es un ribonucleósido o desoxiadenosina
si es un desoxirribonucleósido. Dependiendo de R, que puede ser una ribosa o una desoxirribosa,
respectivamente.
Los desoxirribonucleósidos se abrevian dA, dG, dC y dT.
¿A un nucleótido monofosfato?
Son derivados fosforilados de los nucleósidos.
Los grupos fosforilo suelen estar unidos al átomo de oxígeno del grupo 5’- hidroxilo. Un nucleótido es un ester
de 5’-fosfato. Resultan de la unión mediante un enlace éster de la pentosa de un nucleósido con una molécula de
ácido fosfórico. Está unión en la que se libera una molécula de agua se puede producir en cualquiera de los
hidroxilos libres de la pentosa pero como regla general tiene lugar en el que ocupa la posición 5’. Por eso los
nucleótidos son los 5’ fosfatos de los nucleósidos.
Contienen un azúcar con cinco carbonos, una base nitrogenada y un grupo fosfato.
Los nucleótidos monofosfato, que son derivados del ácido fosfórico, son aniónicos a pH fisiológico. Son ácidos
dibásicos con valores de pKa aproximados entre 1 y 6. La posición de un grupo fosfato que a pH 7 se encuentra
ionizado, confiere un carácter marcadamente acido a los nucleótidos.
Los nucleósidos monofosfato se pueden seguir fosforilando y formar nucleótidos difosfato y trifosfato.
¿Las secuencias dTMP-dGMP-dAMP-dCMP (TGAC) y dCMP -dAMP-dGMPdTMP (CAGT) transmiten la
misma información genética?
No. En la secuencia de nucleótidos del ADN se encuentran específicas las secuencias de aminoácidos de todas
las proteínas y las secuencias de nucleótidos de todas las moléculas de ARN de la célula (entre ellos, el ARNm
que transporta la información genética de un gen hasta el ribosoma para la síntesis proteíca).
Cada segmento de ADN contiene la información necesaria para la síntesis de un producto biológico distinto, ya
sea una proteína o un ARN.
Los genes codifican proteínas, que se definen como una cadena de aminoácidos.
Los genes son los encargados de trasmitir los caracteres de padres a hijos, las proteínas son las que manifiestan
esos caracteres.
Pero ¿cómo un gen se transforma en proteína? El ADN está escrito en la secuencia de nucleótidos y las
proteínas de aminoácidos. De modo que nuestra célula ha desarrollado un mecanismo para equiparar ambos
lenguajes.
El ADN está formado por cuatro bases nitrogenadas: A, T, C y G. Por eso cada gen estará constituido por una
secuencia de estas cuatro letras, que se dispondrán en diferente orden y cantidad según cada gen.
Cada secuencia de un gen tiene una combinación específica de estas cuatro bases.
No puede haber una relación 1:1 entre nucleótidos y aminoácidos porque de esa forma habría solo 4
aminoácidos, cuando existen 20.
El código genético se basa en un código de codones en el
que la combinación de tres nucleótidos determina un
aminoácido. LA COMBINACIÓN MÍNIMA DE
NUCLEÓTIDOS PARA FORMAR UN AMINOÁCIDO
ES 3.
Teniendo en cuenta que los codones están formados por
la combinación de tres nucleótidos, el número total de
codones posibles es 64. (43=64) Pero solo existen 20
aminoácidos, ¿Qué ocurre con los 44 codones restantes?
Distintos codones pueden codificar un aminoácido.
TRANSCRIPCIÓN
El ADN de las eucariotas se encuentra situado en el núcleo celular, mientras que la síntesis de proteínas tiene
lugar en el citoplasma. Por ello cada vez que es necesaria la producción de cierto polipéptido, el gen que guarda
la información sobre su secuencia de aminoácidos es transcripto a ARN mensajero.
INICIACIÓN: Cuando el ADN debe trasladar el mensaje necesario para que en el citoplasma se forme una
proteína, las 2 cadenas de ADN se separan en la zona que codifica el tipo y orden de los aminoácidos de esa
proteína. DONDE ESTE EL GEN QUE LE CORRESPONDA.
La ARN polimerasa se asocia a una zona denominada promotor, que es una secuencia rica en nucleótidos de
timina y adenina situada justo antes de la secuencia de nucleótidos que va a ser transcrita.
ELONGACIÓN: Ese mensaje está codificado en una de las dos cadenas, y se va a transcribir a ARNm, que lo
va a llevar hasta el citoplasma para que se forme la proteína que codifica ese gen.
La cadena que lleva el sentido de los aminoácidos de la proteína NO es la que se copia sino su complementaria,
para mantener el orden adecuado de los aminoácidos en el ARNm. Una vez abierta la
molécula de ADN comienza la transcripción que avanza mediante la adición
de nucleótidos a la cadena de ARN en crecimiento. Este
proceso sigue las reglas de la complementariedad con la
salvedad de que en vez de añadir un nucleótido de timina cuando
en la hebra molde aparece uno de adenina, se añade uno de uracilo en la
cadena de ARN en crecimiento, ya que LOS ARN NO TIENEN
NUCLEÓTIDOS DE TIMINA SINO DE URACILO.
Por ejemplo, en la imagen el código del segundo triplete de la cadena codificante es ATC (que corresponde a un
aminoácido), sin embargo, el ARNm copiará el segundo triplete de la cadena molde que es TAG, para llevar el
código complementario ATC que codifica el aminoácido que el
segundo aminoácido que debe tener en segundo lugar la
proteína que codifica ese gen.
La ARN polimerasa produce una cadena de ARN en dirección
de 5’ a 3’ al agregar cada nuevo nucleótido al extremo 3’ de la
cadena.
FIN: cuando la ARN encuentra una señal de parada en la hebra
de ADN molde la ARN polimerasa se separa del ADN
pudiendo volver a unirse a otro promotor para iniciar una
nueva transcripción.
El codón TAC que corresponde a la metionina
es el que marca el sitio de lectura para el ARN
mensajero. Hay también tres tripletes TAA,
TGA y TAG que son codones de parada.
TRADUCCIÓN
El proceso en el que una célula lee
información contenida en el ARNm y la usa
para construir una proteína.
Aunque un ARNm no siempre codifica las
instrucciones para una proteína completa, sino
que podemos decir que siempre codifica para
un POLIPÉPTIDO. Lo que es diferente
porque una proteína es una macromolécula
completamente ensamblada y funcional,
mientras que algunas proteínas se conforman
de solo una cadena de aminoácidos, otras
incluyen varias de estas y poseen estructura cuaternaria. Por
otro lado un polipéptido puede formar una proteína funcional
por sí mismo, o puede que tenga que unirse con otros
polipéptidos para formar una proteína funcional.
En un ARNm, las instrucciones para construir un polipéptido
son los nucleótidos de ARN: A, U, C y G, que se leen en
grupos de tres llamados CODONES.
Un codón AUG especifica el aminoácido metionina y también
actúa como un codón de inicio para señalar el comienzo de la
construcción de la proteína.
Los codones de terminación UAA, UAG y UGA, le informan a
la célula cuando un polipéptido está completo.
Esta relación codón-aminoácidos permite que la célula decodifique un ARNm en una cadena de aminoácidos.
En la traducción los codones de un ARNm se leen del extremo 5’ (del que sobresale el grupo fosfato) al extremo
3’ (donde está expuesto el hidroxilo del último nucleótido que se agregó a la cadena) mediante moléculas
llamadas ARNt.
ARNt
Los ARNt de transferencia unen los codones del ARNm con los aminoácidos para los que codifican. En el
extremo de cada ARNt hay una secuencia de tres nucleótidos llamada anticodón que se une al codón específico
del ARNm a través del apareamiento de bases. El otro extremo lleva el aminoácido que especifica el codón.
RIBOSOMA
En ellos se construyen los polipéptidos. Están compuestos de proteínas y ARNr.
Proporciona un conjunto de espacios
huecos donde los ARNt pueden encontrar
sus codones correspondientes en la
plantilla del ARNm y entregar sus
aminoácidos.
A medida que los ARNt entran al ribosoma
y se unen a los codones sus aminoácidos se
unen a la cadena de polipéptidos creciente
en una reacción química. El resultado final
es un polipéptido cuya secuencia de aminoácidos refleja la secuencia de codones en el ARNm.
- INICIACIÓN: El ribosoma se reúne con el ARNm y el primer ARNt para que comience la traducción.
Formando el COMPLEJO DE INICIACIÓN.
Depende de proteínas auxiliares especializadas llamadas factores de iniciación. Ayudan a que los tres
componentes se unan. Moverlos requiere de GTP, trifosfato de guanosina.
Primero el ARNt que lleva la metionina se une a la subunidad ribosomal pequeña. Se une al extremo 5’
del ARNm y luego se mueve sobre el ARNm para detenerse frente al codón de inicio AUG.
Todos los ARNm inician con el codón AUG, que corresponde al aminoácido de metionina, sin embargo
la cadena polipeptídica final carece de este aminoácido en su extremo N porque ese codón solo sirve de
señal de inicio para la traducción en los ARNm y luego es desprendido de la cadena.
- ELONGACIÓN: Los ARNt traen los aminoácidos al ribosoma y se unen para formar una cadena
polipeptídica.
El primer ARNt que lleva metionina comienza el sitio llamado P.
Luego la metionina forma un enlace peptídico con el aminoácido del segundo ARNt que se sitúa en el
sitio A. Se forma un dipéptido que se une al ARNt del sitio A.
La metionina forma el extremo N y el otro aminoácido el extremo C. Los aminoácidos nuevos se
agregan en el extremo C.
Una vez formado el enlace peptídico el ARNm avanza a través del ribosoma exactamente un codón. Lo
que permite que el ARNt vacío salga a través del sitio E. A la vez pone un nuevo codón en el sitio A para
que el ciclo se repita.
- TERMINACIÓN: Cuando un codón de alto en el ARNm entra en el sitio A.
A medida que el codón de inicio del ARNm queda libre se puede formar otro complejo de iniciación con un
nuevo ribosoma comenzándose de nuevo la traducción del ARNm. Esto le permite hacer múltiples copias de un
polipéptido a partir de una sola molécula de ARNm.
REPLICACIÓN
Es semiconservativa, a partir de una molécula de ADN se obtienen 2, cada una de las cuales porta una hebra del
ADN que se ha duplicado.
Para comenzar el proceso las dos hebras se deben separar mediante la rotura de los puentes de hidrógeno que las
une. En ese punto se inicia la replicación simultánea de las dos hebras.
La elongación de la nueva hebra es catalizada por una enzima ADN polimerasa. Usa como molde una de las
hebras de ADN originales y construye la hebra nueva incorporando los nucleótidos según la regla de la
complementariedad de las bases. Si en la hebra antigua hay un nucleótido de adenina, pone uno de timina en la
nueva.
Tras el proceso, las dos moléculas de ADN se separan, portando ambas una hebra antigua y una nueva. Son
idénticas.
5- a. Prácticamente todas las células del organismo de una persona tienen el mismo ácido desoxirribonucleico
(ADN).
