UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
“ELECTROFORESIS IN - SILICO CON EL SOFTWARE SNAPGENE V”
REALIZADO POR:
• Yáñez Cabiedes Jorge Andrés
CURSO
Biotecnología
CICLO:
VII
DOCENTE
Blgo. Soto Gonzales, Hebert Hernan
ILO – PERÚ
2024
I. INTRODUCCIÓN:
En el presente trabajo se realiza una simulación del gel de agarosa para cepas
bacterianes encontradas en suelo y aguas contaminadas por derrame de petróleos. La
electroforesis en gel de agarosa se utiliza comúnmente para separar moléculas en
función de su carga, tamaño y forma. Se trata de un medio de separación eficaz para las
biomoléculas cargadas como el ADN, el ARN y las proteínas. El software SnapGene
nos proporciona la manera de realizar esa simulación utilizando las secuencias de ADN
de las cepas bacterianas. SnapGene proporciona herramientas que le permiten planificar,
visualizar y documentar todos sus procedimientos de biología molecular.
II. OBJETIVOS:
• Objetivo General
➢ Realizar la simulación de electroforesis en gel de agarosa utilizando el software
SnapGene con los datos identificados de cepas bacterianas aisladas de aguas y
suelos contaminados del Articulo Científico “Aislamiento de bacterias con
potencial biorremediador y análisis de comunidades bacterianas de zona
impactada por derrame de petróleo en Condorcanqui – Amazonas – Perú”.
• . Objetivos Específicos
➢ Conocer el funcionamiento e importancia del Gel de Agarosa en cepas
bacterianas.
➢ Utilizar datos del NCBI.
➢ Manejar el software SnapGene para realizar la práctica.
III. METODOLOGIA
A. Utilizamos las cepas bacterianas que se han identificado en el siguiente articulo
científico
B. Se buscan las cepas en la National Library of Medicine(NIH) y se exportan los
archivos en formato FASTA para poder exportarlos al programa.
C. Abrimos los archivos FASTA que contienen las cepas bacterianas
D. A continuacion, hacemos click en “Tools” y seleccionamos la opción que dice
“Simulate agarose gel”
E. Seleccionamos todos los archivos FASTA que hemos abierto para realizar el proceso de
electroforesis de agarosa en gel.
IV. RESULTADOS
Al final de todo el procedimiento, el resultado de la electroforesis será este.
V. CONCLUSIÓN
➢ Se pudo aprender el proceso de simulación de agarosa en gel para la
electroforesis utilizando el software de SNAPGENE V.
➢ Se logro recolectar datos de las cepas bacterianas utilizadas en el artículo
científico seleccionado para realizar la simulación y realizar una
comparación entre el ADN de diferentes cepas bacterianas.
CUSESTIONARIO:
• ¿QUE ES ELECTROFORESIS?
La electroforesis es una técnica de laboratorio que se usa para separar moléculas de
ADN, ARN o proteínas en función de su tamaño y carga eléctrica. Se usa una corriente
eléctrica para mover las moléculas a través de un gel o de otra matriz.
• ¿CUALES SON SUS APLICACIONES?
Es una de las técnicas más utilizadas en los laboratorios y se realiza con el objetivo de
separar moléculas de acuerdo con su tamaño y carga eléctrica con el fin de realizar un
diagnóstico de enfermedades, verificar la expresión de proteínas o identificar
microorganismos.
¿QUE ES EL GEN 16S Y CUALES SON SUS APLICACIONES?
El ARNr 16S es un polirribonucleótido de aproximadamente 1500 nucleótidos codificado por el
gen rrs, también denominado ADN ribosomal 16S. Como cualquier secuencia nucleotídica de
cadena sencilla, el ARNr 16S se pliega y adquiere una estructura secundaria que se caracteriza
por tener segmentos de doble cadena que permiten la formación de asas y hélices. Esta molécula
ha sido reconocida como un poderoso marcador universal debido a que se encuentra en todos
los organismos conocidos.
¿APLICACIÓN DE EL GEN 16S EN INGENIERIA AMBIENTAL?
Se puede identificar la presencia y estructura de diferentes microorganismos presentes al
realizar estudios de biorremediación y muestreo. También puede ayudarnos a determinar cuales
son los grupos bacterianos más predominantes y sus interacciones con los parámetros
fisicoquímicos del medio en el que se encuentran.
REALIZAR UN GEL DE AGAROSA DE LA TABLA 3 DEL ARTICULO CIENTIFICO
“Caracterización molecular de bacterias cultivables y no cultivables procedentes de pozas de
lixiviación con cianuro”
