TEMA 7. Genética bacteriana.

Las bacterias son organismos muy variados genéticamente ya que pueden presentar 1 o
varios cromosomas, que pueden ser circulares o lineales.
La genética bacteriana se desarrolló analizando marcadores morfológicos,
características metabólicas y resistencias fácilmente estudiables (auxotrofías,
resistencias a antibióticos, resistencias a fagos, capacidad de metabolizar ciertos
compuestos, colores y morfología de colonias…)

La OBTENCIÓN DE MUTANTES CON RESISTENCIAS (a antibióticos, fagos…) es

sencilla ya que sembrando bacterias en medios con diferentes antibióticos o fagos se
pueden seleccionar las colonias resistentes que se forman.
Para el AISLAMIENTO DE MUTANTES AUXÓTROFOS ha sido decisiva una técnica
que permite hacer réplicas exactas de colonias en distintos medios de cultivo: Partimos
de una placa Petri con medio completo en la que se han desarrollado colonias
bacterianas. Se pueden transferir células de cada colonia a un terciopelo estéril
(situando la placa sobre el terciopelo). Se van poniendo nuevas placas con medios de
cultivo con la composición deseada sobre dicho terciopelo manteniendo la adecuada
orientación de las placas. Así, las posibles colonias que puedan crecer aparecerán en
las mismas posiciones que en la placa original permitiendo localizar mutantes
auxótrofos y determinar qué tipo de auxotrofía presentan.

MECANISMOS DE TRANSFERENCIA DE GENES EN BACTERIAS

La transferencia siempre es unidireccional: hay una cepa donadora y una receptora. No
es un fenómeno recíproco.
Existen 3 mecanismos de transferencia de genes:
-Transformación: la transferencia se produce por el paso de DNA libre de una
célula a otra.
-Conjugación: la transferencia se realiza al establecerse una conexión física
entre 2 células.
-Transducción: la transferencia la median virus que portan DNA bacteriano.

Nunca se va a transferir todo el genoma, se van a transferir fragmentos. El fragmento (a

veces llamado exogenote) es capaz de recombinar con el cromosoma bacteriano (a
veces llamado endogenote) y si los alelos que porta el fragmento son diferentes de los
alelos que porta el cromosoma, se puede cambiar el genotipo de la bacteria receptora.
La célula receptora del DNA pasa por un estado en el que además de su propio
cromosoma tiene un fragmento de DNA procedente de la célula donadora. Por tanto,
para algunos genes la célula receptora será diploide (un diploide parcial o merodiploide
o merocigoto).
En la recombinación el nº de sobrecruzamientos tiene que ser par obligatoriamente, ya
que si se diera un número impar el cromosoma bacteriano se volvería lineal y no viable.
Una vez se ha producido la recombinación, el fragmento de DNA que queda libre se
destruye. Por eso el estado de diploide parcial es transitorio. (de los 2 productos que se
producen en la recombinación sólo se podrá estudiar uno)

TRANSFORMACIÓN
Se trata del cambio de genotipo mediado por DNA desnudo.
Para que una bacteria sea capaz de adquirir DNA desnudo del medio externo tiene que
estar en estado competente. Las bacterias pueden ser competentes de manera natural o
se puede inducir.
En la naturaleza el DNA externo puede tener diferentes orígenes:
-Liberación pasiva a partir de bacterias muertas.
-Liberación activa mediante un sistema de secreción.
-Captura de DNA mediante un mecanismo fraticida (las células competentes
matan y lisan a las células no competentes cercanas)

- ¿Por qué se transforman las bacterias?

Puede ser porque el DNA les proporciona nutrientes; es posible que sea porque tienen
daños en el DNA propio y quieran repararlos; lo más probable es que sea para provocar
variación genética cuando hay situaciones de estrés para así sobrevivir. Todas estas
teorías son finalistas.

- ¿Cómo entra el DNA en la bacteria competente?

De manera natural entra en el interior mediante un mecanismo de transporte activo
que varía de unas especies a otras. En el proceso de entrada se degrada una de las
cadenas.
La cadena sencilla si no se destruye inmediatamente puede invadir la molécula de DNA
gracias a proteínas que participan en los procesos de recombinación homóloga como
recA. La zona de la cadena original que es desplazada se elimina y la cadena invasora
(o única) se une covalentemente al DNA.
La cadena invasora no debe tener una secuencia perfectamente complementaria a la
cadena del DNA cromosómico (puede tener variaciones en la secuencia de bases). Las
pequeñas zonas desapareadas que se creen se corregirán por procesos de reparación del
DNA, lo que puede hacer que la bacteria cambie de alelo en este gen (transforma su
genotipo).

- Mapas genéticos mediante transformación.

Se utiliza una cepa donadora de la que se extrae el DNA. El DNA se fragmenta y si 2 loci
están próximos podrán ir en el mismo fragmento. El DNA extraído se usa para
transformar una cepa receptora que presentará 2 alelos.
 -Si 2 loci están cercanos en el cromosoma los 2 genes podrán ir en el
mismo fragmento: La cepa donadora es a+b+ y la receptora es a-b- y después de la
recombinación pueden surgir 3 tipos de células transformadas:
a) Dobles transformadas: Cambian su genotipo para los 2 genes simultáneamente. Los
sobrecruzamientos se tienen que producir en la zona I y en la zona III.
b) Simple transformada para a: Cambian su genotipo sólo para el gen a. Los
sobrecruzamientos se han tenido que producir en la zona I y II.
c) Simple transformada para b: Cambian su genotipo sólo para el gen b. Los
sobrecruzamientos se han tenido que producir en la zona II y III.
Los 3 casos necesitan el mismo nº de sobrecruzamientos (2). Cuanto + cerca estén a y
b, menor probabilidad de que se dé un sobrecruzamiento en la zona II por lo que
aumenta la frecuencia de la clase doble transformada.

-Si 2 loci están alejados en el cromosoma no van a poder ir en el mismo

fragmento: Para obtener la clase doble transformada se necesita que se introduzcan
los 2 fragmentos en la célula receptora y que se produzcan 4 sobrecruzamientos.
Para obtener las simples transformadas basta con que se introduzca uno de los
fragmentos y que se den 2 sobrecruzamientos.
Esto da lugar a que la clase doble transformada sea mucho menos frecuente que las
clases simples transformadas.

-Estimación de la distancia.
Para estimar la distancia entre los 2 genes se utiliza el parámetro q. Varía entre 0 y 1.
q=simples transformadas/total transformadas
Si q=0 es porque sólo aparecen dobles transformantes (los 2 loci están muy
cerca)
Si q=1 es porque sólo aparecen simples transformantes (los 2 loci están muy
lejos)

-Concepto de ligamiento en bacterias.

Dos loci están ligados si la frecuencia de bacterias dobles transformadas es superior a la
frecuencia de las simples transformadas. Como las bacterias tienen un único
cromosoma, todos los genes están ligados.
Sin embargo, en los procesos de recombinación bacterianos interviene un fragmento de
DNA de tamaño limitado que procede de una célula donadora y el cromosoma de una
célula receptora.
-En bacterias se considera que 2 loci están ligados cuando están lo suficientemente
cerca en el cromosoma para que, si este se fragmenta, puedan aparecer juntos en el
mismo segmento de DNA con una frecuencia más alta que la de aparecer en segmentos
separados.
-2 loci se consideran independientes si están tan separados que prácticamente nunca
pueden aparecer juntos en el mismo fragmento.
La transformación también permite analizar 3 loci simultáneamente de manera
sencilla. Si se producen 4 sobrecruzamientos la cepa receptora --- cambia su genotipo
en los 2 genes externos (+-+). Esto permite establecer el orden sin necesidad de
calcular distancias ya que la clase doble transformada de menor frecuencia indicará
cuál es el locus central. Una vez establecido el orden, calculamos las distancias entre los
loci por parejas mediante el parámetro q.

CONJUGACIÓN
Se trata de la transferencia de DNA al establecerse una conexión física entre 2 células.
***estudiar el experimento de Lederberg y Tatum

-Plásmido F.
Es una molécula circular de DNA de doble cadena con un tamaño de unas 100 kb. Está
presente en las células en una cantidad de 1 copia/célula.
Cuando el cromosoma bacteriano se replica a partir del origen de replicación situado en
la zona repF y cuando la célula se divide, un sistema genético asegura que cada copia
vaya a cada una de las células hijas (transferencia vertical: pasa de una célula a sus 2
células hijas).

La región tra contiene los genes implicados en el proceso de transferencia del plásmido
a una célula F- (transferencia horizontal: pasa de una célula a otra diferente). En el
extremo de esta zona está la secuencia oriT que es el origen de transferencia (lugar por
donde comienza a transferirse el DNA).
En la región tra residen los genes responsables de la formación de los pili en la
superficie de las células F+. Otros genes de esta región codifican las proteínas de
exclusión de superficie que impiden la interacción entre 2 células F+. Por eso no se
produce interacción entre 2 células F+.

La región situada entre oriT y la zona rep se llama región leading por ser la primera que
se transmite a las células F-.

En la secuencia del plásmido aparecen transposones tanto simples (ej: secuencias de

inserción IS) como compuestos (ej: Tn1000).
Cuando una bacteria F+ se sitúa cerca de una F- se produce un contacto entre ellas a
través del extremo de uno de los pili. Esta unión se estabiliza al mismo tiempo que se
produce una retracción del pilus hasta que las 2 bacterias quedan en un contacto
estrecho, con una estructura que las conecta llamada puente de conjugación.
Cuando se ha formado el puente de conjugación, un complejo proteico (relaxosoma)
hace un corte en una de las cadenas de la secuencia oriT y se une al extremo 5’.
Va desenrollando la cadena y mediante un factor de acoplamiento esta cadena se
transfiere a la bacteria receptora.
Una vez transferida la cadena completa (2-3 minutos) esta se circulariza y las cadenas
sencillas se replican tanto en la célula donadora como en la receptora.
Una vez finalizado, se separan las 2 células.
Así, la célula que originalmente era F- se convierte en F+. En este proceso se transfiere
el plásmido F exclusivamente pero no se transfiere ninguna zona del cromosoma
bacteriano.

- ¿Cómo pueden aparecer los recombinantes para genes del cromosoma,

aunque sea en frecuencias muy bajas?
Explicado por Cavalli-Sforza al aislar una cepa de tipo F+ pero con características
diferentes.
Después de las conjugaciones con esta cepa, en las células F- aparecen recombinantes
para genes del cromosoma con una frecuencia al menos 1000 veces mayor que la que se
encuentra al utilizar una cepa F+ normal. Por eso estas cepas F+ se llaman cepas Hfr
(derivan de cepas F+).
Después de la conjugación, las células F- continúan siendo F-.
Una cepa Hfr es aquella que presenta el plásmido F integrado en el cromosoma
bacteriano, mientras que una F+ presenta el plásmido F individualizado.

La integración del plásmido F en el cromosoma bacteriano se produce por un proceso

de recombinación entre las secuencias de inserción IS que contienen tanto el plásmido
como el cromosoma. Este proceso ocurre con una frecuencia aprox. de 10^-4, por lo
que en toda cepa F+ aparecen algunas células Hfr y es por ello que después de la
conjugación F+ x F- aparezcan unos pocos recombinantes.

En el cromosoma bacteriano aparecen muchos elementos IS esparcidos por la

molécula. Esto significa que a partir de una cepa F+ se pueden obtener muchas cepas
Hfr diferentes, ya que cada una puede tener insertado el plásmido F en un lugar
diferente.
Las células Hfr se comportan en la conjugación del mismo modo que una célula F+.
Cuando una bacteria Hfr se sitúa cerca de una F- se produce un contacto entre ellas a
través del extremo de uno de los pilus. Esta unión, débil al comienzo, se estabiliza al
mismo tiempo que se produce una retracción del pilus hasta que las dos bacterias
quedan en un contacto estrecho, con una estructura que las conecta, denominada
puente de conjugación.
Cuando se ha formado el puente de conjugación, el relaxosoma realiza un corte en una
de las cadenas de la secuencia oriT y se une al extremo 5’. A continuación, va
desenrollando la cadena y mediante un factor de acoplamiento esta cadena va
transfiriendo a la bacteria receptora.
Como ahora el plásmido está unido al cromosoma, lo que se transfiere es una parte del
plásmido y a continuación el DNA del cromosoma bacteriano.
El cromosoma es de gran tamaño, por lo que no se transfiere todo él, sino sólo una
parte cuyo tamaño depende del tiempo en que permanezcan unidas las 2 células.
Una vez transferida una parte del cromosoma, las cadenas sencillas se replican tanto en
la célula donadora, que volverá a tener todo su cromosoma en forma de DNA de doble
cadena.
Finalizado el proceso se separan las 2 células (exconjugantes) y en la célula F- puede
haber recombinación entre el fragmento que ha entrado y el cromosoma de la bacteria,
originando la aparición de recombinantes.
Como se puede observar en este proceso de conjugación se transfiere la zona del
plásmido que dirige la entrada del DNA, pero hay otra zona del plásmido que no se
transfiere porque primero sería necesario que lo hiciera todo el cromosoma.
De este modo la célula F- nunca obtiene un plásmido F completo, así que la célula que
originalmente era F- continúa siendo F-.
Se puede deducir que el proceso de transferencia de genes cromosómicos es ordenado,
pasando primero los más cercanos a la zona transferida del plásmido, y
secuencialmente los más alejados.

-Mapas de tiempo: La transferencia ordenada de los genes permitió un nuevo

método de mapeado genético utilizando la conjugación entre una cepa Hfr y una F- que
difieran en los alelos para una serie de genes.
El método consiste en mezclar una cepa Hfr sensible a un antibiótico con una cepa F-
resistente a dicho antibiótico, que además difieran en sus alelos para otros genes.
Se permite la conjugación de las 2 cepas durante un tiempo y se interrumpe la
transferencia de DNA en un momento controlado mediante una agitación potente.
Luego se siembran las células en distintos medios con el antibiótico para que sólo
formen colonias las bacterias exconjugantes de la cepa F-.
La composición de los medios permitirá conocer si algunas células F- han cambiado de
genotipo.
Ejemplo: Vemos que, si se interrumpe la conjugación después de 5 minutos de contacto
entre las 2 cepas, todas las bacterias F- han cambiado su genotipo a thr+ y leu+. Esto
indica que estos 2 genes han tenido que ser transferidos desde la cepa Hfr y se ha
producido la recombinación antes de los 5 minutos transcurridos. Cuando se
interrumpe la conjugación a los 10 minutos, hay un 12% de bacterias F- que son aziR.
Como a los 5 minutos no había ninguna, la transferencia de este gen habrá ocurrido
entre los 5 y 10 minutos. De este modo se puede determinar el intervalo de tiempo en el
que los genes se transfieren de la cepa Hfr a la F-.
Este tiempo refleja la distancia física que existe entre el extremo de DNA que dirige la
transferencia (oriT) y la posición del gen correspondiente. De este modo se construyen
los mapas de tiempo cuyas unidades son los minutos. Estos mapas son mapas físicos y
reflejan distancias físicas en pares de bases. Las distancias en los mapas de tiempo son
completamente aditivas, de modo que la distancia entre 2 genes dados es la diferencia
que existe en los tiempos de entradas de dichos genes. Así, si azi entra a los 9 minutos y
gal a los 25, la distancia entre los genes es 25-9=16 minutos.

En los cruzamientos Hfr x F- sólo se transfiere una parte del cromosoma, de modo que
el mapa que obtendremos será parcial. Sin embargo, las diferentes cepas Hfr
transfieren zonas diferentes puesto que dependen del lugar de cromosomas donde se
haya integrado el plásmido F.
Si los mapas obtenidos tienen al menos 2 genes comunes, se pueden ir relacionando e ir
aumentando la longitud del mapa.
Una vez integrados los distintos mapas, se pudo deducir que el cromosoma de [Link]
tiene un tamaño de 100 minutos. Ahora sabemos que el genoma de [Link] tiene unos
4,6 millones de pares de bases, una distancia de 1 minuto se corresponde con una
distancia de unos 46000 pb.

-Factores F’.
En una cepa F+ el plásmido se puede integrar por recombinación entre los elementos
IS que contienen el plásmido y el cromosoma bacteriano, lo que origina las cepas Hfr.
Con baja frecuencia el plásmido se puede escindir por recombinación entre los
elementos IS que flanquean el plásmido integrado. Así en una cepa Hfr siempre
aparecen unas pocas bacterias que son F+.
Con una frecuencia más baja aún, en el proceso de escisión pueden recombinar 2
elementos IS que no sean los inmediatamente contiguos al plásmido integrado.
A estos plásmidos F especiales se los denomina elementos F’, y si se conoce el gen o
genes que lleva, se especifican.
La célula en la que se forma el factor F’ no presenta ninguna anomalía ya que sigue
teniendo todos los genes, aunque alguno esté situado en el plásmido. Esta célula se
comporta igual que una célula F+ y puede participar en la conjugación sin ningún tipo
de problema.
Cuando una célula F- recibe el plásmido F’ se forma un diploide parcial para aquellos
genes que estén situados simultáneamente en el cromosoma y en el plásmido F’. Estos
diploides parciales son estables y se mantienen en el tiempo.

La conjugación no se limita al plásmido F. Existen otros plásmidos que también

presentan este proceso.
La transferencia de plásmidos por conjugación no se limita a bacterias que pertenecen a
lo que se considera una misma especie, sino que también se puede producir entre
especies diferentes. Esto ha permitido que haya transferencia de genes de unas especies
a otras mediada por plásmidos similares a F’.
TRANSDUCCIÓN
Transferencia de genes entre bacterias realizado mediante virus.
Realizando el experimento en tubo en U observaron la aparición de recombinantes
silvestres en una de las ramas del tubo. Esto suponía que había una cepa receptora del
DNA y una cepa donadora.
Para comprobar si el proceso pudiese ser debido a la transferencia de DNA desnudo
entre las ramas y por tanto ser un caso de transformación, en el medio de cultivo del
tubo en U añadieron DNAsas. Pero seguían apareciendo recombinantes por lo que el
DNA que pasaba de una rama a la otra estaba protegido de la degradación y no era un
caso de transformación.
Experimentos con distintos tipos de filtros y análisis más detallados identificaron que el
DNA bacteriano se transfería de una rama a la otra protegido en el interior de una
cápside viral.

-Transducción generalizada.
Cuando un fago virulento entra en el ciclo lítico en el interior de una bacteria, replica su
genoma cientos de veces, se sintetizan las proteínas del virus que se autoorganizan
formando las cápsides de los descendientes, el cromosoma bacteriano se degrada y los
genomas virales se introducen en las cápsides.
La introducción del DNA en las cápsides es un proceso muy controlado de modo que
sólo se adquiere el DNA del fago. En algunas cápsides se puede introducir un fragmento
del genoma bacteriano.
Estos virus, cuando salen al exterior después de la lisis, son capaces de inyectar el DNA
en una bacteria porque este proceso depende de las proteínas de la cubierta del virus y
no del material genético que porte en su interior.
Una vez inyectado el fragmento bacteriano tendremos un diploide parcial como en los
casos de transformación o conjugación, y se produce el proceso de recombinación entre
zonas con secuencias homólogas.

-Mapeo mediante transducción.

Si 2 genes están muy cerca en el cromosoma bacteriano, podrán ir juntos en el mismo
fragmento y por tanto ser transportados en el mismo virus.
De esta manera, la transducción simultánea para los 2 genes (cotransducción) tendrá
una frecuencia alta si están juntos. Si 2 genes están muy lejanos en el cromosoma
bacteriano, la cotransducción de ambos tendrá una frecuencia muy baja.
El método para mapear por cotransducción consiste en seleccionar el cambio en uno de
los genes y después comprobar el genotipo para los otros genes estudiados.
***mirar experimento
Al hacer varios experimentos, tenemos varios datos de frecuencias de cotransducción y
utilizaremos la media de los valores.
-Transducción especializada.
Sólo participan unos genes concretos. Para ello necesitamos unos fagos que entren en
su ciclo lisogénico. No podemos mapear todo el genoma bacteriano, ya que nos
centramos sólo en unos genes específicos del mismo.
Un ejemplo de fago con ciclo lisogénico es el fago lambda:
-El DNA del fago se circulariza al entrar en la bacteria. La zona attlambda es un
elemento de unión del fago lambda con el cromosoma bacteriano y la zona attB es un
elemento de unión del cromosoma bacteriano donde se integrará el DNA vírico. Son
secuencias similares, pero no idénticas.
Entre estas zonas ocurre una recombinación con el resultado del DNA vírico entre 2
secuencias BOP’-POB’
-El fago actúa como parte del cromosoma bacteriano hasta que la bacteria sufre
estrés por lo que el fago se escindirá.
-El fago comenzará a replicarse hasta que la bacteria se lise. A veces hay errores
en el proceso de escisión. Esto va a hacer que el fago lleve en su cromosoma genes
bacterianos, pasando a ser un fago transductante pero defectivo.
-El fago lambda pasa a ser defectivo ya que le falta una parte del cromosoma
vírico además de llevar un gen bacteriano; en este caso pasa a ser lambdagal. El fago se
replica sin problema e infecta a otra bacteria, aunque en su zona de attachtment (att) es
incorrecta por lo que no se puede incluir en el cromosoma bacteriano, pero la bacteria
pasa a ser un diploide parcial y se puede producir una recombinación.
El diploide parcial es transitorio ya que el fago, al ser defectivo, es degradado por la
bacteria.
TEMA 8. Genética cuantitativa.
Los caracteres cualitativos poseen unos fenotipos discretos, los individuos pueden
clasificarse fácilmente según su fenotipo, poseen un control genético sencillo (nº
reducido de loci controlan el caracter) y los efectos ambientales son pequeños y no
dificultan la clasificación en el fenotipo adecuado.
Pero la gran mayoría de las características de un individuo no son de tipo cualitativo.

Los caracteres cuantitativos son caracteres continuos, discretos o umbral, poseen

un control genético complejo y los efectos ambientales tienen una gran influencia en
ellos.
-Carácter continuo: El fenotipo puede tomar cualquier valor dentro de un rango. Se
suelen hacer agrupaciones para poder representarlo.
-Carácter merístico o numérico: El fenotipo toma valores numéricos discretos dentro
de un rango en el que existen muchas clases. Tiene clases discretas, pero son muy
numerosas. Son discretos por la naturaleza del carácter, pero reflejan la existencia de
un carácter continuo subyacente.
-Carácter umbral: El fenotipo tiene 2 clases, pero se debe a un rasgo cuantitativo
subyacente. Por debajo de dicho valor umbral aparece un fenotipo y por encima el
fenotipo alternativo
La gran mayoría de los caracteres de los individuos son de tipo cuantitativo y el estudio
de su control genético es complejo porque van a estar bajo el control de varios genes, y
el ambiente en el que se desarrolla el individuo va a tener un efecto importante sobre el
fenotipo resultante.

HERENCIA DE LOS CARACTERES CUANTITATIVOS.

Utilizaremos como ejemplo caracteres continuos o merísticos. En un carácter
cuantitativo no se observan proporciones mendelianas al hacer los cruzamientos
controlados, si no distribuciones continuas.
Se realizaron 2 experimentos fundamentales para determinar que poseen una
distribución normal y que son caracteres continuos:

-Experimento de Johannsen: Analizó un carácter continuo (peso de las judías).

Tomó una variedad antigua y analizó su peso, observando que tenía una distribución
muy similar a la normal.
Intentó obtener líneas puras cruzando un tipo de judía y la autofecundó. Con la
descendencia realizó el mismo procedimiento de autofecundación hasta obtener la
línea pura 1. Con este mecanismo obtuvo hasta 19 líneas puras diferentes.
Al analizar una línea pura y analizar su peso observó que no todas poseían el mismo
peso, existiendo una media de pesos de la línea pura. En la diferencia de sus pesos
interviene el ambiente. Estas variaciones ambientales no se pueden controlar.
Al juntar una alubia de menor peso de la línea pura 10 con una alubia de mayor peso de
la misma línea obtenemos una curva normal en la que la distribución y la media se
mantiene. Esta distribución y media podemos afirmar que estén determinadas por
el genotipo de cada alubia. El fenotipo que vemos en este carácter está determinado
por el genotipo y ambiente, que es quien hace que haya variación.
Este es un caso de herencia compleja ya que no todos poseen el mismo fenotipo,
aunque su genotipo sí sea el mismo. Esta variedad posee una variación de genotipos
que es quien proporciona la variación poblacional, pero la variación final viene dada
por la suma de genotipos y ambiente.
Este experimento dio como origen la teoría de las líneas puras, donde se afirma que la
variación tiene causas genéticas y ambientales. Actualmente los distintos fenotipos
generados por el mismo genotipo en condiciones ambientales distintas se llaman
norma de reacción.
CONCLUSIONES: Cada línea presenta un único genotipo homocigoto, Cada línea
presenta un peso medio característico que depende del genotipo, Dentro de cada línea
hay variación en el peso de las semillas, La variación dentro de cada línea sólo puede
achacarse a causas ambientales, La variación en la población original se debe a la
presencia de varios genotipos diferentes y a las variaciones ambientales que afectan a
cada genotipo.
Por tanto, en una población la variación cuantitativa que veamos va a deberse a los
diferentes genotipos que tiene la población y a las variaciones ambientales que haya.

-Teoría de los factores polímeros.

Para explicar el modo en que el efecto de genes mendelianos puede dar lugar a una
distribución continua de fenotipos, Yule propuso su teoría. Sus principales puntos son:
a) Los caracteres cuantitativos están controlados por muchos genes independientes
llamados factores polímeros o poligenes; b) El efecto de cada locus sobre el carácter es
pequeño; c) Los efectos de los distintos loci son equivalentes y aditivos; d) Todos los
loci presentan 2 alelos (M y m) y son equivalentes; e) Los alelos M aportan mayor
cantidad al carácter que los m; f) El fenotipo final resulta de la suma de todos los
efectos de los alelos M y m presentes en los poligenes.
-Experimento de Nilsson-Ehle: Se basa en la teoría matemática de Yule. La
distribución normal es parecida a la distribución binominal. Yule propuso que la
variación continua se debe a que poseemos muchos genes asociados a esa
característica.
Todos los genes poseen 2 alternativas: 1ª alternativa: mayor incremento; 2ª alternativa:
menor incremento. Nilsson estudió el color del grano de trigo.
En el trigo existen variedades en las que los granos tienen colores diferentes, como
blancos y rojos. Al cruzar una línea pura blanca (B) con 3 líneas puras diferentes de
granos rojos, obtuvo F2 que presentaban segregaciones mendelianas con los resultados
que se muestran en la diapositiva.

¿Cómo es posible que el mismo carácter aparezca controlado por un nº diferente de

genes en cada caso? Sólo se detectan los genes que segregan (los que muestran
diferencias entre los individuos que se cruzan). Por ello es necesario hacer muchos
cruzamientos diferentes y muchas pruebas de alelismo hasta determinar cuántos genes
controlan realmente un carácter.
Los cruzamientos de Nilsson demostraban que el color del grano estaba determinado
por genes con segregaciones mendelianas. Si además de analizar el color se mide cómo
de intenso es el color, aparecen distintas tonalidades en diferentes proporciones.
Si todos los alelos representados por letras mayúsculas tienen efectos equivalentes y los
representados por minúsculas lo mismo y son sumables, todos los genotipos con el
mismo nº de alelos mayúsculas y minúsculas tendrán el mismo fenotipo; serían iguales
en tono de color los individuos AAbb, aaBB o AaBb.
Si observamos las distribuciones con 1, 2 o 3 loci segregando, podemos comprobar que
cuantos + nº de genes segreguen, + clases fenotípicas y la distribución se asemeja cada
vez más a una curva normal. Si segregan + loci, la distribución se convierte en continua.

MODELO DE LOS POLIGENES

En el caso general de que crucemos 2 líneas puras que difieran para n genes, se
obtendría una F1 heterocigota para los n genes. La F1 puede producir 2 tipos de
gametos distintos por gen, por lo que el nº de gametos diferentes es de 2^n.
La teoría de los poligenes asume que todos los genes son independientes, por lo que
todos los gametos tendrían la misma frecuencia ½^n.
En la F2 lo que ocurre en un gen concreto se puede representar como (½*A + ½*a)^2
***mirar página 158 para ver las fórmulas.
-Segregación transgresiva: La tª de los poligenes explica que en las descendencias
de algunos cruzamientos puedan aparecer fenotipos + extremos que los que presentan
sus antecesores. Cuando se tienen estos fenotipos que son superiores o inferiores a los
de los parentales y la F1 se dice que existe segregación transgresiva.
Esta se produce si las líneas parentales que se cruzan no son las que tienen los
genotipos que dan lugar a los fenotipos extremos.
Las frecuencias con las que aparecen los fenotipos extremos en una F2 nos permiten
conocer el nº de genes que están segregando en un cruzamiento.
El nº de genes que se obtiene es el de genes segregantes (los que están en heterocigosis
en la F1) en el cruzamiento.
Esto no significa que sea el nº de genes que realmente controlan el carácter ya que
pudiera haber más que no segreguen en este experimento. Por ello la necesidad de
realizar muchos cruzamientos. Pero por este modo sabemos que como mínimo hay X
genes determinando el carácter.
Con el modelo de los poligenes, las clases fenotípicas serían muchas y con una
distribución semejante a una normal, pero siguen siendo clases discretas. Esto es así
porque no hemos considerado hasta ahora ningún tipo de variación ambiental. Si tal y
como demostró Johanssen un genotipo concreto puede dar un rango de valores debido
a la variación ambiental, las clases se mezclan y observamos una distribución continua
y normal.
HEREDABILIDAD DE UN CARÁCTER CUANTITATIVO
Al analizar una población para un carácter cuantitativo se obtiene una distribución de
valores, que por lo general es similar a una distribución normal.
Esta variación del carácter en la población se debe tanto a la variación genética que
presenta la población como a la variación ambiental en la que se desarrollan sus
individuos. La variación la podemos cuantificar mediante la varianza.

-Heredabilidad en sentido amplio (H2)

Proporción de la variación fenotípica que se debe a la variación genética existente en la
población en un ambiente concreto.
La varianza es un parámetro aditivo de modo que si el fenotipo lo consideramos como
un resultado del genotipo + el ambiente, la variación fenotípica (VP) es el resultado de
la variación genotípica + la variación ambiental (VG+VE).
-H2=0  No hay variación genética en la población para el carácter; toda la
variación fenotípica es ambiental.
-H2=1  Toda la variación fenotípica observada para el carácter se debe a la
variación genética que hay en la población.

Para estimar H2 se puede hacer de varias maneras. Si se pueden conseguir líneas puras
y cruzarlas para obtener una F1 y después una F2, podemos analizar un carácter
cuantitativo en todas ellas en las mismas condiciones ambientales. Esto no significa que
no exista variación ambiental, sino que esta es similar en todos los casos.
En las líneas puras no hay variación genética porque todos los individuos presentan el
mismo genotipo homocigoto. En la F1 tampoco ya que es uniforme, aunque presente
genes en heterocigosis. En parentales y F1 toda la variación que detectemos será
ambiental.
Si tenemos los datos de las 2 líneas puras y de la F1, hacemos la media de los 3 valores y
será la mejor estimación de la variación ambiental.
En la F2 la variación observada es la suma de la variación genética + la variación
ambiental. La VE será igual que la que han presentado las otras generaciones por lo que
se puede conocer la variación genética en la F2.

***Mirar correlaciones entre individuos emparentados

La utilización directa de la proporción entre correlaciones es correcta si los individuos
emparentados que utilizamos se desarrollan en ambientes no relacionados. Si los
parientes viven en ambientes similares, la correlación fenotípica puede estar
aumentada. En estos casos es mejor estimar el valor de H2 restando los valores entre
individuos con distinto grado de parentesco, pero con características ambientales
relativamente similares.
-Heredabilidad en sentido estricto (h2)
Proporción de la variación fenotípica que se debe exclusivamente a la variación aditiva
(debida a los alelos) existente en la población en un ambiente concreto.
Permite predecir el resultado de los programas de selección que se realizan en los
proyectos de mejora genética. La variación genética se puede descomponer en varias
partes:
Una parte se debe al efecto de los alelos que portan los individuos, lo que
correspondería con el efecto aditivo.
Otra parte puede deberse a las relaciones de dominancia que tienen los alelos de un
locus. En el modelo de los poligenes se supone que no hay dominancia, si no que todos
los efectos son aditivos, pero esto es una simplificación.
Otra parte de la variación genética puede deberse a las interacciones entre alelos de
distintos genes (epistasias). El modelo de los poligenes vuelve a ignorar estos efectos
por simplificar el análisis.
Lo que se transmite de generación en generación son sólo los alelos, porque las
relaciones de dominancia y epistasias entre ellos no se transmiten a los descendientes.
Por ello nos interesa saber la variación debida a los alelos.
Para estimar h2 usamos el valor medio del carácter en ambos parentales y el valor
medio de los hijos y calculamos el coeficiente de regresión de la recta que relaciona los
valores de parentales y descendientes.

-Respuesta a la selección: Depende de h2, y esta varía a medida que se realizan

generaciones de selección. Al seleccionar unos individuos para usarlos como
parentales, estamos quedándonos sólo con una parte de los genotipos que presenta la
población y estamos por tanto disminuyendo la variación genética.
Si seleccionamos durante muchas generaciones llegará un momento en el que nos
quedemos con el mejor genotipo y perderemos la variación genética. En ese momento,
h2 será 0 y ya no habrá respuesta a la selección. Esto hace que en los programas de
selección se observen 2 fases, una con respuesta lineal en la que h2 parece mantenerse
constante y después se llegará al límite.

CONSIDERACIONES SOBRE LA HEREDABILIDAD

-No se puede aplicar a un individuo, sino que indica si las diferencias entre individuos
de una población son debidas a los genes o al ambiente.
-No indica el grado de determinación genética de un carácter ya que depende de la
población en que se estime.
-No se refiere a una población concreta en un ambiente concreto, no presenta un valor
fijo y constante para un carácter.
-No indica nada sobre la naturaleza de las diferencias de un carácter en dos poblaciones
-Que un carácter presente una heredabilidad de -1 no significa que el valor del carácter
no se pueda modificar cuando cambian las condiciones ambientales.
TEMA 9. QTLs.
Un QTL es un locus que afecta a un carácter cuantitativo.
El modelo de los poligenes asume que: 1) Todos los loci son equivalentes; 2) No existe
ligamiento entre los loci; 3) Todos los loci presentan 2 alelos con efectos idénticos
sobre el carácter; 4) Los efectos de los alelos de todos los loci son aditivos; 5) Los
efectos individuales de cada locus sobre el carácter son pequeños.
En la realidad los loci que afectan a un carácter cuantitativo pueden adaptarse de las
premisas anteriores.
Para un carácter interesa saber: 1) Cuántos QTL están implicados; 2) El efecto de los
distintos QTL sobre el carácter; 3) El efecto de los diferentes alelos de un QTL sobre el
carácter; 4) Posibles interacciones entre distintos QTL.

Las premisas del modelo de los poligenes representan una simplificación de la realidad.
Los diferentes loci que afecten a un carácter cuantitativo tendrán sus características
particulares, y en este caso hablamos de QTLs.

- ¿Cuántos QTL están implicados en un carácter cuantitativo?: Supongamos que

podemos detectar directamente el efecto de unos de los QTLs que tiene 2 alelos, uno
que aporta más al carácter cuantitativo (Q) y otro que aporte menos (q). En un
cruzamiento entre 2 líneas homocigotas para ese gen, veríamos una F1 heterocigota en
la que el carácter mostrará una distribución normal debido a los efectos ambientales, y
en la F2 seríamos capaces de diferenciar las distribuciones que presentan los 3
genotipos posibles.

-Metodología del análisis de QTLs.

Se cruzan 2 líneas parentales que difieran para el carácter y para muchos marcadores
moleculares. Cuando se obtiene la F2 se analiza cada individuo para el fenotipo del
carácter y para el genotipo del marcador molecular.
Una vez analizada la F2 se hacen 3 grupos en función del genotipo que presentan para
el marcador molecular: los homocigotos para el alelo a, los heterocigotos y los
homocigotos para el alelo b.
En cada uno de los grupos se analiza cómo es el fenotipo del carácter cuantitativo. Si los
3 grupos tienen la misma distribución es porque el marcador está muy lejos o es
independiente de cualquier QTL que afecte a ese carácter. Si existen diferencias en las
distribuciones es porque el marcador está muy cerca de uno de los QTLs que afectan al
carácter.
-Análisis de punto sencillo.
***mirar las fórmulas en la página 176
VENTAJAS: No necesita un mapa genético desarrollado, simplicidad y se puede
realizar con programas estadísticos habituales.
INCONVENIENTES: No se conoce con exactitud la posición del QTL, los efectos
calculados (a y d) asumen que no hay recombinación entre el marcador y el QTL(si
hubiera recombinación los efectos reales serían mayores), sólo detecta QTL con efectos
importantes, subestima el nº de QTLs.

-Mapeo de QTLs por intervalos simples.

Localizamos los QTLs cuando disponemos de un mapa genético con muchos
marcadores. Si para cada marcador vemos las distribuciones de los 3 genotipos,
detectaremos si el marcador está lejos (las distribuciones de los 3 grupos serán iguales)
o cerca (las distribuciones de los 3 grupos serán diferentes) de un QTL.
El punto exacto donde se localizaría el QTL sería aquel en el que las distribuciones de
los 3 grupos presenten la máxima diferencia. Para conocer este dato es necesario usar
programas de ordenador específicos para esta tarea. Estos programas calculan en cada
punto la probabilidad de que em dicho lugar haya un QTL, frente a la probabilidad de
que en dicho punto no haya ningún QTL, y con estas probabilidades realizan una
gráfica de tipo LOD a lo largo de todo el grupo de ligamiento.
Aquellas zonas que presenten valores de LOD altos serán las zonas en las que hay una
alta probabilidad de que haya un QTL. Si detectamos varios picos en varios
cromosomas es que hay varios QTLs repartidos por el genoma.

IDENTIFICACIÓN DE QTLS EN POBLACIONES. ANÁLISIS GWAS.

Un caso especial lo constituye la identificación de aquellos genes y alelos que están
relacionados con caracteres umbral (estudio de los polimorfismos), como ocurre con
muchas enfermedades. Entre las diferentes metodologías posibles nos limitaremos a los
estudios de tipo caso-control.
Partimos de poblaciones naturales y elegimos una muestra de individuos que presentan
el fenotipo considerado normal. Esta será la que denominaremos grupo control.
También reunimos una muestra de individuos que presentan el fenotipo alternativo
(por ejemplo, que manifiestan una enfermedad) y este grupo será el denominado caso.
En ambos grupos extraemos DNA de todos los individuos y los analizamos para todos
los marcadores genéticos que podamos y que estén distribuidos por todo el genoma a
ser posible.
Comparando el grupo caso con el grupo control podemos encontrar varios resultados:
-Habrá marcadores que sean monomórficos (aparece el mismo alelo) tanto en los
individuos del grupo caso como en los del grupo control. Esto indica que dicho alelo no
está asociado a la aparición o no de la enfermedad.
-Habrá marcadores que presenten polimorfismo tanto en los casos como en los control,
de modo que la presencia de 1 u otro alelo tampoco está relacionada con la aparición o
no de la enfermedad.
-Habrá marcadores que presenten un genotipo concreto en todos los individuos caso y
un genotipo alternativo en todos los individuos control. Esto indica que dicho marcador
está muy estrechamente ligado al gen responsable de la enfermedad.
Normalmente no se encuentran resultados tan claros como los esperados en este último
caso. Lo que suele ocurrir es que un alelo concreto suele presentar cierta asociación con
la enfermedad, pero no al 100%. Por otra parte, en la aparición de una enfermedad
pueden intervenir varios genes de modo que no siempre un genotipo concreto en un
gen provoca su aparición, sino que depende del genotipo de varios genes
simultáneamente.
Una limitación de este tipo de estudios GWAS es que suelen necesitar del análisis de
decenas de miles de marcadores y de un gran número de individuos para ser fiable.
TEMA 10. Genética de poblaciones.
La genética de poblaciones estudia la herencia en grupos de individuos, en poblaciones.
Los cambios genéticos a través de las generaciones son la base del proceso evolutivo. Se
transmiten los genes, no los genotipos.
En genética de poblaciones se analiza la herencia estudiando descendencias
procedentes de grupos de individuos que se cruzan entre ellos sin que se ejerza un
control sobre las parejas que se forman.
A medida que se obtienen nuevas generaciones, aparecerán cambios en la composición
genética de las poblaciones. Esto es la evolución.

-Población mendeliana: Grupo de individuos que real o potencialmente pueden

cruzarse entre sí compartiendo un acervo genético común (pool) en el tiempo y en el
espacio. Va a contener una riqueza genética que está formada por todos los alelos
de todos los genes presentes en la población y que constituyen su acervo genético.
-Acervo genético: Conjunto de alelos presentes en todos los loci de la población.
-Polimorfismo genético: Presencia en locus y en una población de 2 o más formas
alélicas en frecuencias apreciables.

Cuando en un gen todos los individuos son homocigotos para el mismo alelo, se dice
que ese alelo está fijado en la población. Si para un gen los individuos presentan
diferentes alelos y ninguno de ellos tiene una frecuencia mayor de 0,95, se dice que ese
locus es polimórfico.

ESTRUCTURA GENÉTICA DE UNA POBLACIÓN.

Al estudiar un locus en una población, lo primero que hay que hacer es determinar los
genotipos que presentan los individuos y cuántos hay de cada genotipo. Si analizamos
un gen con 2 alelos (A, a) tendremos 3 genotipos (AA, Aa y aa), y de cada genotipo un
nº de individuos n1, n2 y n3.
A partir de estos valores calculamos las frecuencias genotípicas que llamamos D, H y R.
A partir de las frecuencias genotípicas calculamos las frecuencias de los alelos
(frecuencias génicas o alélicas). En N individuos tenemos 2N alelos (trabajamos con
organismos diploides). Si tenemos n1 individuos AA, n2 Aa y n3 aa, tendremos 2n1+n2
alelos A, ya que cada homocigoto porta 2 alelos y cada heterocigoto sólo 1. También
tendremos 2n3+n2 alelos a.
Dos o más poblaciones pueden tener diferentes frecuencias genotípicas e iguales
frecuencias alélicas (si nos dan las frecuencias génicas no podemos conocer sus
frecuencias genotípicas si no tenemos más datos). Cuando hay dominancia entre alelos
sólo podremos calcular la R (frecuencia de aa), pero no podremos calcular ni D ni H ya
que no distinguimos AA de Aa.
ALELISMO MÚLTIPLE (más de 2 alelos en el locus)
Si en el gen tenemos varios alelos, también aparecerán más de 3 genotipos. Suponiendo
que podamos distinguir todos los genotipos, las frecuencias de un alelo se calculan
como frecuencia de homocigotos para ese alelo+ ½ frecuencia de heterocigotos que
contienen dicho alelo.

Las frecuencias alélicas y genotípicas no cambiarán si la población cumple los

supuestos del equilibrio Hardy-Weinberg.
Cuando una población cumple una serie de características, se puede demostrar que se
mantienen las frecuencias génicas y genotípicas a lo largo de las generaciones. Si se
mantienen las frecuencias en las generaciones sucesivas, se dice que la oblación ha
alcanzado un equilibrio.
Las características que debe cumplir la población son las siguientes:
-Especie diploide.
-Población muy grande (infinita)
-Apareamiento al azar (panmixia)
-No hay solapamiento de generaciones
-Las frecuencias son iguales en los 2 sexos
-No hay mutación
-No hay migración
-No hay selección
***mirar página 190

Algunas peculiaridades del equilibrio H-W:

-Las frecuencias H-W (p^2, 2pq, q^2) se alcanzan en una única generación en
las que se den las condiciones de la población ideal y se mantienen inalteradas
generación tras generación mientras se den esas condiciones.
-Que un locus esté en equilibrio H-W no implica que lo estén todos.
-Si en una población en un momento dado observamos frecuencias H-W no
implica necesariamente que esté en equilibrio H-W (hay que demostrar que las
frecuencias no cambian).
-Si hay H-W, a partir de las frecuencias génicas podemos conocer las
genotípicas.
-Los alelos poco frecuentes están presentes principalmente en los heterocigotos.
-La frecuencia de los heterocigotos (heterocigosidad) máxima se alcanza cuando
los alelos presentan la misma frecuencia. La mayor heterocigosidad aparece cuando las
frecuencias de los alelos son iguales y a frecuencias bajas de un alelo es mayor la
frecuencia del alelo en los heterocigotos que de los homocigotos para dicho alelo.
Además, en una población el alelo dominante no tiene que ser siempre el más frecuente
y el recesivo el menos frecuente, sino que dependerá de la composición genotípica de la
población.

AGENTES DE CAMBIO EVOLUTIVO CAMBIAN LAS FRECUENCIAS GÉNICAS EN

LAS POBLACIONES.
Si todos los genes de las poblaciones estuviesen en equilibrio H-W, la composición
genética se mantendría generación tras generación y no habría posibilidad de que los
organismos evolucionaran. Los cambios se producen cuando no se cumplen las
premisas necesarias para el equilibrio. No se cumple que:
-La población sea muy grande, por lo que aparece la deriva genética que cambia
las frecuencias de modo aleatorio.
-La población presente apareamientos panmícticos (al azar), generalmente
aparece el fenómeno de consanguinidad, aunque también pueden aparecer otros
fenómenos.
-No hay solapamiento de generaciones. Si hubiese solapamiento generacional
sería necesario desarrollar modelos poblacionales más complejos que el presentado.
-Las frecuencias son iguales en los 2 sexos. Si no es así, se necesita mayor
número de generaciones para poder alcanzar el equilibrio, y en algunos casos, las
frecuencias de equilibrio dependerán del sexo.
-No hay mutación. Cuando hay mutaciones van apareciendo nuevos alelos que
van a ser la base de toda la variación genética.
-No hay migración. Si hay migración, las poblaciones van a intercambiar genes y
van a parecerse unas a otras.
-No hay selección. Cuando hay selección natural, las poblaciones van a cambiar
su composición genética y este proceso evolutivo es el único capaz de explicar el
fenómeno de la adaptación de los organismo a sus ambientes.