Ácidos nucleicos: ADN y ARN
• Historia del ADN:
o George Mendel → descubrió el ADN
▪ Descubre que se debe transmitir información para asimilar las características
físicas entre los organismos
o Friedrich Miescher y Levene → descubren los ácidos nucleicos en el siglo XX
▪ Se sabía su función bioquímica
▪ Discusión por investigar si las proteínas o los ácidos nucleicos transmitían la
información genética
▪ Debate de si el ADN es mayormente proteico o compuesto por ácidos nucleicos
o Los ácidos nucleicos son las la molécula de la vida
• ADN → ácido desoxirribosa
o Para que una molécula sirva como el material genético, debe de exhibir 4
características: (las cumplen los ácidos nucleicos)
▪ Replicarse / duplicarse
• Capaz de hacer una nueva copia de sí misma para que sea transmitida
• Proteínas no pueden duplicarse y generar una proteína igual
▪ Almacenar la información genética
• Y transferirla a generaciones futuras → mantener el fenotipo
▪ Expresar la información genética → fenotipo
• Son los genes
▪ Debe contener variación → mutación
• Características diferentes para cada individuo
• Adaptación al medio ambiente
• Transmisión de la información genética:
o Por duplicación y transferir la información a células hijas
o Por expresión de los genes → transcripción y síntesis de ARN
▪ Cuando el gen transmite la información para producir una molécula funcional
• Descubrimiento del material genético:
o Entre 1944 y 1953 se trabajó en discernir no solo la estructura del ADN, pero
también la relación entre la estructura y su función
o Con el descubrimiento de la estructura tridimensional del ADN (1953), se demostró
como es que el ADN funciona como la base genética para el proceso de vida
• Estructura molecular del ADN:
o J. Watson y F. Crick → acreedores del premio Nobel en 1962, por establecer el
modelo de la estructura del ADN
▪ Usaron investigaciones de otros científicos
o Entre 1940 y 1953 muchos investigadores se interesaron en resolver la estructura
del ADN, entre ellos: Erwin Chargaff, Maurice Wilkins, Rosalind Franklin, Linus
Pauling, Francis Crick y James Watson
o Watson y Crick contaron con dos líneas de evidencia:
▪ Estudios de Chargaff: aplicó técnicas de cromatografía sobre papel en la
separación y cuantificación de los componentes de los ácidos nucleicos
▪ Estudios de R. Franklin y M. Wilkins: análisis de difracción de
▪ rayos X
• Estructura del ADN: estudios de Chargaff 1949:
o Permitieron comprobar que las 4 bases no se encuentran en proporciones
exactamente iguales y difieren según la muestra
o La cantidad de A es proporcional a la de T
o La cantidad de G es proporcional a la de C
o La suma de purinas (A+G) es igual a la suma de pirimidinas (C+T)
o El porcentaje de C+G no es necesariamente igual al de A+T
• Estructura del ADN: estudios de Franklin / Wilkins:
o Análisis de difracción de rayos X determinan la estructura 3D
o Los datos sugerían un tipo de estructura helicoidal de dos o más cadenas, con 10
bases por cada vuelta y una periodicidad de bases de 3.4Å (0.34nm)
• Composición química del ADN:
o Macromolécula formada por unidades estructurales llamadas nucleótidos
o Cada nucleótido está formado por:
▪ Un azúcar pentosa → 2-desoxirribosa
• 5 carbonos
• Da el nombre a los ácidos nucleicos
▪ Un grupo fosfato → se une al carbono 5 de la desoxirribosa
• Son 3 fosfatos cuando el nucleótido está libre en la célula
• En el ADN aparecen como monofosfatos
• El fosfato es el que le da el carácter ácido a la molécula
▪ Una base nitrogenada → se une al carbono 1 del azúcar
• Purinas → adenina (A) y guanina (G)
• Pirimidinas → citosina (C), uracilo (U), timina (T)
o Subunidades pueden estar libres en la célula
o Nucleósido → azúcar + base
o Nucleótido → azúcar + base + fosfato
▪ Nucleósido monofosfato (1 fosfato)
▪ Nucleósido difosfato (2 fosfatos)
▪ Nucleósido trifosfato (3 fosfatos)
• ADN no está compuesto por adenina, está compuesto por desoxiadenilato
(desoxiadenosina 5-monosfato → error común, pero se usa el nombre de la base para
mayor facilidad
• El ADN es un polímero lineal
• ADN gira hacia la derecha → dextrógira → puede haber regiones que
giren a la izquierda (levógiras)
• Enlace covalente une los nucleótidos → enlace de tipo fosfodiéster → C5
– fosfato – OH de C3
• Orientación de 5’ a 3’ → todo se hace en esta dirección
• Cada molécula de ADN está formada por dos largas cadenas de
polinucleótidos que corren en direcciones opuestas (antiparalelas)
formando una hélice doble alrededor de un eje imaginario central
• Esqueleto formado por azúcares y fosfatos
• Bases nitrogenadas están en la parte interna del ADN
o Dan el grosor de la molécula
o Están en un ángulo de 90º con un eje imaginario
o Bases tienen diferentes grosores
▪ Se une una más gruesa (2 anillos) con una más
delgada (1 anillo) para mantener el grosor del
ADN
• 10 bases nitrogenadas conforman un giro completo
• Hay surcos mayores y menores → son sitios de
reconocimiento de proteínas
• Doble cadena antiparalela en estructura de alfa hélice
o Una cadena es dextrógira → gira hacia la derecha
o Una cadena es levógira → gira hacia la izquierda
o Una va de 5’ a 3’ de arriba abajo y otra de 5’ a 3’ de
abajo hacia arriba
• Adenina con timina → cantidades iguales de ambas
o Unidas por 2 puentes de H
• Guanina con citosina → cantidades iguales de ambas
o Unidas por 3 puentes de H
• Pares de bases → se refiere al sitio donde se unen las bases
en el centro del ADN
• Complementariedad de bases se determina gracias a
estudios de cromatografía y rayos X realizados por J.
Watson y F. Crick, ya que se sabía que el diámetro de
la molécula de ADN es de 20 Å.
• Puentes de H permiten la formación del alfa hélice → le
dan estabilidad
• Estructura del ADN: base de la herencia:
o El descubrimiento de la doble hélice sugirió como
se lleva a cabo la transferencia de información →
ambas hebras portan la misma información
genética → si sabe la secuencia de un lado, se sabe
automáticamente la del otro lado
o Una hebra de A hace un A’ y A’ sirve como molde para
sintetizar A
o Pares de bases son la base de la herencia
o Para transmitir la información de una célula a otra el ADN
debe de duplicarse → no hay problema por la
complementariedad de bases
o Cada hebra actúa como una plantilla para la formación de
la nueva hebra de ADN
• Estructura del ADN: niveles:
o Nucleótidos
o Estructura primaria → secuencia de solo 1 cadena
o Estructura secundaria → estructura de alfa hélice
o Estructura terciaria → cómo se almacena el ADN es un espacio reducido →
cromatina → cuando el ADN ya está unido a proteínas
▪ Procariotas → superhélice en forma circular
▪ Eucariotas → unión de proteínas y ADN = cromatina
• Estructura del ADN: formas alternativas:
o El ADN existe en muchas conformaciones (condiciones de aislamiento)
o Conformación que adopta depende de:
▪ La secuencia
▪ La cantidad y dirección de superenrollamiento
▪ La presencia de modificaciones químicas en las bases
▪ Las condiciones de la solución (concentración de iones de metales y
poliaminas)
o En el laboratorio se han descrito otras formas alternativas, variando el pH, la
cantidad de algunos nutrientes y la temperatura
o Lo que varía es el ángulo sobre el cual están las bases, si la molécula esta más
achatada o estirada, o si el giro es hacia la derecha o hacia la izquierda.
o ADN-B → presente en condiciones acuosas de baja concentración salina, es la
conformación con importancia biológica, la más común (descrita por Franklin,
Watson y Crick) y gira hacia la derecha
o ADN-C → no se ha visto in-vivo, solo a nivel de experimentación
o ADN-A → no se ha visto in-vivo, solo a nivel de experimentación
o ADN-Z → si se ha visto in-vivo y en experimentación, similar a la forma B pero el
giro es hacia la izquierda
o Tener formas alternativas le brinda diferentes funciones al ADN
o Estas estructuras alternativas son transitorias
o Cada región puede ser un sitio de unión para ciertas proteínas
▪ Para la transcripción y duplicación del ADN
▪ Puede que una cierta proteína solo se una cuando el esté en forma C o B, etc
▪ La forma puede definir la expresión de un gen
• Estructuras secundarias inusuales del ADN: → son estructuras transitorias
o Secuencia palindrómica: son secuencias del ADN que se leen igual de derecha a
izquierda y de izquierda a derecha.
▪ Hay complementariedad dentro de la misma hebra → la hebra se dobla
▪ El doblamiento tiene una función → sitios de unión a proteínas para activar
algún proceso por ejemplo
▪ Horquilla → tiene 1 doblez
▪ Cruciforme → tiene 2 dobleces → 2 horquillas (una en cada hebra)
• Función del ADN → almacenar la información genética
• ARN: composición y estructura:
o Ácido ribonucleico
o Descodifica la información contenida en el ADN
o Molécula formada por unidades estructurales llamadas
nucleótidos (ribonucleótidos)
o “Almacena información genética” → solo durante un periodo
corto de tiempo → desde que se sintetiza hasta que se genera
la molécula que codifica
o ADN transmite la información por medio de la síntesis del ARN
▪ ARN decodifica la información en el ARN
o Componentes de los ribonucleótidos’:
▪ Azúcar pentosa → 5 carbonos y da el nombre a los
ácidos nucleicos → ribosa
▪ Grupo fosfato
• En el ADN solo uno y cuando está libre por la
célula tiene 3 fosfatos
• Da carácter ácido
▪ Bases nitrogenadas:
• Pirimidinas → citosina y uracilo
• Purinas → adenina y guanina
• Estructura molecular del ARN:
o 1 única cadena (monocatenarios)
▪ Algunos ARNs se pliegan sobre sí mismos
o Ribonucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster en sentido 5’-3’
• Nucleótidos menores:
o Los nucleótidos en la cadena de ARN pueden ser modificados
o Los nucleótidos modificados pueden estar tanto en el ARN como en el ADN
• Estructura secundaria del ARN:
o Al ser una cadena simple, tiene la capacidad para plegarse y formar una variedad
de estructuras secundarias
o ARN es un contorsionista molecular → es más versátil que el ADN
o Al tener más posibles estructuras, se pueden unir una mayor cantidad de proteínas
a las estructuras secundarias del ARN y tener una mayor funcionalidad
o La estructura secundaria depende de la secuencia y de los alineamientos que pueda
realizar (puentes de H entre bases complementarias de la misma cadena)
o ARN adopta la estructura o conformación más estable → la de menor energía
• Tipos de ARN:
• Los que participan en la síntesis de proteínas:
o Mensajero (ARNm):
▪ Descodifica la información del ADN para la síntesis de una proteína
▪ Moléculas de ARN mensajero portan la información genética del ADN al
ribosoma → son codificantes
▪ Varían de tamaño → según el gen y el tamaño de la proteína
o Ribosomal (ARNr):
▪ Es un componente estructural del ribosoma
• Ribosoma → ARN + proteínas
• Ambas unidades del ribosoma consisten de una o más moléculas de
ARNr (además de proteínas ribosomales)
▪ Las formas de ARNr en eucariotas y procariotas difieren en tamaño
▪ Transferencia (ARNt):
▪ Mejor caracterizados
▪ Compuestos por 75-90 nucleótidos → estructuras casi idénticas en bacterias
y eucariotas
▪ Sigue el modelo de hoja de trébol
▪ El anticodón se compone de las tres bases que se van a unir a la molécula de
ARN y que van a indicar cual es el aminoácido que va a estar codificando
• Los que regulan la expresión génica o tienen actividad catalítica (no codificantes) →
regulan también la síntesis de las moléculas de ARN y no se traducen en proteínas
o ARN pequeños nucleares (ARNpn ó snRNA)
o ARN pequeños nucleolares (ARNpno ó snoRNA)
o ARN heterogéneos nucleares (ARNhn ó nhRNA)
o ARN de interferencia (ARNi: siARN, miARN)
• Diferencias entre el ADN y el ARN:
o Composición → bases: timina (ADN) y uracilo (ARN) / azúcar: ribosa y
desoxirribosa, en común las otras bases
o Estructura → ADN en hélice y ARN una hebra simple, en común: mismo tipo de
enlace, misma dirección y ambas pueden formar estructuras secundarias inusuales
o Función → ADN almacena y ARN descodifica (mensajero), regula, estructural (en
ribosomas) y transporte; en común el almacenamiento
• Ácidos nucleicos y luz ultravioleta:
o Absorben la luz → 260 nm
o La luz UV puede ser usada en la localización, aislación y caracterización de
moléculas que contengan bases nitrogenadas (ej nucleósidos, nucleótidos y
polinucleótidos)
• Desnaturalización y renaturalización de los ácidos nucleicos → se rompen los puentes
de hidrógeno que unen las bases nitrogenadas (se pierde la estructura)
o Desnaturalización del ADN: calor y pH
o Ruptura de los puentes de hidrógeno entre las bases
o En el laboratorio la desnaturalización puede ser causada intencionalmente por calor
o tratamiento químico (alcalino)
o Par de bases GC vs AT y calor
▪ Menos energía para romper AT → son
solo 2 puentes de hidrógeno
▪ Si se requiere más energía para
desnaturalizar una sección del ADN
quiere decir que esta región es rica en
GC → desnaturalización sirve para
caracterizas regiones
o Tm → temperatura a la cual la mitad del ADN
está desnaturalizada
o Análisis del perfil de desnaturalización provee una
caracterización del ADN y un método alternativo para
estimar su composición de bases
o Alkali y ADN = desnaturaliza y no rompe el enlace
fosfodiester
o Alkali y ARN = rompe el enlace fosfodiester
o La desnaturalización es reversible
▪ Puede ser parcial o completa la desnaturalización
o Si el ADN que ha sido desnaturalizado térmicamente es
enfriado lentamente, colisiones azarosas entre las hebras
complementarias resultarán en su reasociación
o A la temperatura adecuada los enlaces de hidrógeno se
volverán a formar, asegurando el apareamiento de las
hebras y en la formación de la doble hélice
o La desnaturalización y renaturalización de los ácidos nucleicos son la base de una
de las técnicas más poderosas y más usadas en la genética molecular →
Hibridación molecular
• Modificaciones de los nucleótidos:
o Deaminación → se cambia una amina por una cetona
▪ Ocurre 100 al día
▪ La desaminación ocurre con menos frecuencia y cuando ocurre este evento
debe de ser reparado.
▪ Este evento es la razón del porque en el ADN no hay uracilo.
▪ Algunas de las citosinas que están en el ADN de forma natural se van a
convertir en uracilo por deaminación y se sabe que hay mecanismos de
reparación que corrigen esto, pero si hubiera uracilo en el ADN ¿Cuál uracilo
se corregiría? ¿El uracilo que se forma como producto del proceso
espontaneo de deaminación o el uracilo que esta correctamente en un lugar
específico del ADN, si lo tuviera? Por esta razón en el ADN hay timina y en el
ARN uracilo, para que exista tal diferenciación.
o Depurinación → eliminación de la base nitrogenada (purina)
▪ Solo queda el azúcar unido al fosfato
▪ Se elimina por hidrólisis
▪ 105 eventos al día
o Dímeros de primidina (T-T) → formación de enlaces entre timinas adyacentes →
cambia la estructura del ADN
▪ Ocurre gracias a eventos exógenos o eventos inducidos principalmente por la
luz ultravioleta.
▪ La luz ultravioleta provoca que haya enlaces entre las dos timinas.
▪ Estos enlaces entre dos timinas adyacentes impiden que haya enlaces entre
la timina y la adenina de la cadena complementaria. Esto conlleva una
alteración en la estructura de la molécula de ADN que debe ser corregida.
• Otras funciones de los nucleótidos:
o Portadores de energía, componentes de enzimas cofactoras y mensajeros químicos
o Los nucleósidos trifosfatos (ATP) son una fuente de energía química usada por las
células para llevar a cabo una gran variedad de reacciones químicas
o ATP es el más usado, pero también son usados UTP, GTP y CTP en reacciones
específicas
o Los nucleósidos trifosfatos también sirven como los precursores activados de la
síntesis de ADN y ARN
o Una variedad de enzimas cofactoras que sirven en un amplio ámbito de funciones
químicas incluyen la adenosina como parte de su estructura
▪ Reacciones de transferencia de grupos acilo
▪ Transferencia de electrones → FAD
▪ Transferencia de hidruros → NAD+
o Nucleótidos como segundos mensajeros o cascadas de señalización → sintetizar
una molécula por recibir una señal extracelular
▪ Uno de los segundos mensajeros más comunes es el nucleótido adenosin
3',5'- monofosfato cíclico (AMP cíclico, or cAMP), formado del ATP en una
reacción catalizada por la adenilato ciclasa
o Regulan muchas funciones al interior de la célula