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Energía y Metabolismo Celular

Este documento trata sobre los principios de la energía y la termodinámica en relación con el metabolismo celular. Explica que las células son sistemas abiertos que obtienen energía del ambiente a través de procesos catabólicos y anabólicos. También describe las leyes de la termodinámica y cómo los seres vivos mantienen su organización a través del intercambio de energía con el medio.

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Energía y Metabolismo Celular

Este documento trata sobre los principios de la energía y la termodinámica en relación con el metabolismo celular. Explica que las células son sistemas abiertos que obtienen energía del ambiente a través de procesos catabólicos y anabólicos. También describe las leyes de la termodinámica y cómo los seres vivos mantienen su organización a través del intercambio de energía con el medio.

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Energía, termodinámica y Metabolismo

1.- Principios de Energía y Termodinámica:

Los seres vivos poseemos un alto grado de organización. Desde la bacteria más sencilla
hasta los homínidos, todos tenemos las mismas moléculas constituyentes. Poseemos iguales
elementos (átomos) que la materia inanimada (aunque no todos; sólo unos 20
aproximadamente, de los presentes en la Tabla Periódica), pero en otra proporción que la que
presentan en la corteza terrestre y con una complejidad estructural mucho mayor, que nos
caracteriza a todos los reinos, desde el más sencillo al más complejo. Cómo llegamos a los
diferentes grados de complejidad es tema de la Evolución y se trata más adelante en el curso.
Para mantener esa organización se requiere trabajo. Podríamos afirmar que sin trabajo no se
obtienen resultados. Y para realizar un trabajo necesitamos… energía.
La energía es habitualmente definida como aquello que permite realizar un trabajo. El trabajo
realizado puede ser mecánico, como trasladar un paquete unos metros.
Puede ser de síntesis: cuando en una empresa farmoquímica se sintetiza una molécula
nueva a partir de otra más sencilla.
Puede ser de organización: cuando ordenamos nuestro ambiente de estudio colocando los
apuntes y/o libros por materia en la mesa o biblioteca.
La célula necesita realizar tareas semejantes: trabajo mecánico de ciclosis, células con
movimiento ameboideo (glóbulos blancos en los tejidos) protistas con flagelos, animales con
movimientos musculares; síntesis de moléculas propias: proteínas, lípidos, polisacáridos,
ácidos nucleicos; generación de gradientes de concentración en la célula y en sus organelas
membranosas.

Primera Ley o Principio de la Termodinámica:

La primera Ley de la Termodinámica es sencilla: la energía no se crea ni se destruye. Puede


transformarse de una forma a otra, pero la energía total de un sistema y su ambiente,
permanece constante a pesar de los cambios de forma.

Toda la energía que se utiliza en nuestro planeta y permite mantener la vida proviene de las
reacciones de fusión nuclear que ocurren en el centro de nuestra estrella el Sol. Se convierte
en energía radiante, una parte de la cual es lumínica y llega hasta nuestra atmósfera. Parte es
reflejada y una pequeña parte es aprovechada por los organismos autótrofos fotosintéticos
para transformarla en energía química, una forma de energía potencial que reside en los
enlaces entre los elementos de las moléculas y la energía de los electrones que giran alrededor
de la molécula.

Existen muchos ejemplos de transformaciones energéticas en el mundo físico que nos rodea
y que percibimos todos los días: las centrales térmicas usan combustibles fósiles (gas, carbón
y derivados del petróleo) para producir electricidad que se envía a hogares e industrias donde
se transforma en luz, calor, trabajo mecánico, etc. La energía hidráulica acumulada en una
represa es función directa de la presión que ejerce la columna de agua (energía potencial) y es
mayor a medida que la represa se llena por las lluvias o deshielos; y se transforma energía
cinética cuando se abre la exclusa de la turbina hidroeléctrica y luego en energía eléctrica que
se transfiere a las ciudades.

Un litro de nafta puede mover un automóvil de 1.000 kg de peso a determinada velocidad


promedio durante una cantidad de kilómetros. Para realizar ese trabajo mecánico, usa la
energía libre del litro de nafta, que en el proceso se oxida completamente en presencia del
oxígeno del aire (combustión) a dióxido de carbono y agua y produce el movimiento.

Segunda Ley o Principio de la Termodinámica:

Se puede definir de muchas formas. Aquí van las más habituales:

Los cambios o reacciones que ocurren en el universo siempre van en un sentido tal que
siempre aumenta la entropía.

La entropía es una forma de medir el desorden de un sistema. En el ejemplo de arriba, las


moléculas de los gases dióxido de carbono y vapor de agua son muchas y están dispersas.
Mucho mayor desorden que las moléculas de nafta del combustible que estaban en estado
líquido.
Otra forma de definirla:

En un sistema en estudio aislado, la Energía Potencial del Estado Final, siempre es menor
que la Energía Potencial del Estado Inicial.
La clave de este concepto es el concepto de aislado. Los seres vivos no son aislados.
Intercambian materia y energía con el ambiente. Son abiertos. El único sistema aislado,
realmente, es el Universo. Lo que refiere a la primera forma de enunciación del principio.

Las reacciones termodinámicas en que los productos de la reacción tienen menor energía
potencial que los reactivos se denominan Exergónicas. Disipan parte de la energía libre de los
reactivos hacia el ambiente como calor y desorden.

Para que ocurra un proceso inverso (que el producto de la reacción posea mayor energía
libre o potencial), deberá agregarse energía al sistema, por lo que éste ya no estará aislado. Si
se le agregara energía (calórica o lumínica) el sistema sería semiabierto. Si se incorporara
materia, Sería abierto. Intercambiaría materia y energía con el ambiente. Y la energía a agregar
debería ser mayor que la necesaria para que ocurra al cambio, porque una parte siempre se
convierte en entropía y calor.

2.- Metabolismo:

Las células son entidades abiertas. Los individuos de los que forman parte están abiertos al
medio que los rodea, del cual toman energía libre en forma de alimentos (los heterótrofos de la
energía potencial en los enlaces entre los átomos de sus moléculas) y energía lumínica que
luego de una serie de pasos se convierte también en energía potencial en las biomoléculas de
plantas, algas y cianobacterias (los foto-autótrofos).

Las células realizan cambios que requieren energía: procesos mecánicos, de síntesis de
moléculas y de concentración de cationes que requieren energía libre. Los heterótrofos toman
esa energía en forma de moléculas biológicas en el alimento.
El alimento provee la energía química en los enlaces químicos de sus átomos, y también los
constituyentes (monómeros) con los cuales se van a sintetizar en cada célula del individuo, sus
propias proteínas, lípidos, glúcidos y ácidos nucleicos.
Al conjunto de reacciones y procesos químicos que ocurren en la célula se la denomina
metabolismo. Todas las reacciones y cambios químicos constituyen el metabolismo celular. Por
extensión, solemos referirnos al metabolismo de un animal cuando pensamos sobre sus
necesidades energéticas diarias imprescindibles para mantener la estructura, funcionamiento y
salud de ese organismo en conjunto.
Existen dos tipos de reacciones:
Catabolismo: en estos procesos una molécula cambia a una o más moléculas más sencillas.
En todo caso, disminuye la energía potencial en el proceso. Se disipa al medio el calor
producido y se incrementa el desorden.
Un ejemplo claro es la respiración celular. Una molécula de glucosa se combina con 6 de
oxígeno, produce 6 moléculas de dióxido de carbono y 6 de agua. Los productos son 12
moléculas desordenadas. Se disipa hacia el ambiente calor (que las células no pueden utilizar
para realizar trabajo) y se incrementa el desorden del medio en que ese individuo vive. Porque
en última instancia, agua y CO2 pasan al ambiente. El organismo consumió un alimento, del
cual obtuvo la glucosa. Devuelve al ambiente agua y dióxido de carbono, calor y desorden del
medio en que vive.
Las reacciones catabólicas son exergónicas y exotérmicas; implican una disminución de la
energía potencial de los productos respecto a los sustratos o reactivos. Pero una parte
importante de la energía se acumula en moléculas de Adenosina Trifosfato (ATP)

Anabolismo: a partir de moléculas precursoras sencillas, se sintetiza una molécula más


compleja, y con mayor estado de organización. Por ejemplo, la síntesis de proteínas a partir de
los aminoácidos.
Estas reacciones requieren el aporte de energía química al proceso. Son endergónicas,
requieren el aporte de energía libre. Pero entonces: ¿cumplen con el segundo principio?

Sabemos que la energía potencial de los productos debe ser menor que la de los sustratos
de la reacción. Pero si agregamos la energía proveniente de otra reacción química diferente
que ocurra inmediatamente antes, en forma secuencial o acoplada y que sea exergónica; que
por lo tanto libere más energía que la que se requiere para la reacción anabólica, entonces el
“sistema en estudio” no consta ya de una sola reacción, sino de dos acopladas, el conjunto de
las cuales dé una sumatoria de valor negativo.

Lógicamente, los seres vivos deben incorporar permanentemente nutrientes que provean un
exceso de energía química sobre sus necesidades anabólicas. Exceso porque en la sumatoria
completa de todas las reacciones que ocurren en un ser vivo (y en el interior de todas sus
células si es multicelular), o sea en su metabolismo; parte de la energía química se disipa como
calor y desorden. Y debe liberarse hacia el ambiente que lo rodea (entropía y calor).
El “combustible” que son los alimentos, libera paulatinamente en una serie de reacciones
encadenadas llamadas vías catabólicas, la energía química acoplable a las necesidades
anabólicas.
Los organismos toman la energía del medio (lumínica los que son fotoautótrofos, de los
alimentos los heterótrofos), realizan los cambios catabólicos y anabólicos con los que
conservan su estructura y función, y en el proceso liberan energía calórica y moléculas
desordenadas e inorgánicas. Conservan su estructura desordenando y disminuyendo la
energía libre disponible en el universo. La energía libre del Universo va disminuyendo
lentamente. La entropía se incrementa.

El mecanismo exacto en que se obtiene la energía de los alimentos se verá en el tema


Respiración celular. La forma en que los organismos fotosintéticos captan los fotones del sol se
verá en Fotosíntesis. Estas reacciones producen moléculas intermediarias metabólicas que
poseen una cantidad adecuada de energía química en las magnitudes que requiere el
metabolismo celular.

Las reacciones de síntesis de proteínas, lípidos y ácidos nucleicos a partir de los monómeros
constituyentes, y las funciones de reproducción que requieren energía; los mecanismos de
traslado de las células, la contracción muscular; la generación de gradientes de iones: todas
son altamente demandantes de energía química. Requieren de intermediarios metabólicos que
puedan ceder la energía química necesaria para producir este anabolismo.

En la siguiente imagen podemos ver una integración de los procesos anabólicos y catabólicos
y su relación con la energía:
Existen moléculas y procesos intermediarios entre las reacciones catabólicas y las
anabólicas. El más importante, porque se utiliza en la mayoría de las reacciones endergónicas,
es el trifosfato de Adenosina o ATP.
Esta molécula está formada por el glúcido de cinco carbonos ribosa, la base nitrogenada de
dos anillos adenina, y tres grupos fosfato.

Adenosina trifosfato (ATP)

La adenina con la ribosa constituye un ribonucleósido llamado adenosina. Al agregarse los


fosfatos, ya se denomina ribonucleótido. Puede ser monofosfato, difosfato o trifosfato de
adenosina.

En las reacciones catabólicas como la glucólisis o las que ocurren en la cadena respiratoria
en la mitocondria, la liberación de energía potencial permite la unión de un grupo fosfato a la
adenosina difosfato (ADP) para formar ATP. Esta unión covalente entre dos grupos fosfato
suele denominarse de alta energía. Lo importante es que es la unidad de cambio energético
a nivel celular. Es la moneda de cambio entre las reacciones exergónicas y catabólicas que
ceden energía al medio, pero parte la usan para acumularla en el enlace del tercer fosfato del
ATP y permiten la unión de este fosfato; y aquéllas reacciones que requieren energía
(anabólicas). Energía que aporta el ATP cuando se hidroliza a ADP + PO4H3-
En las reacciones metabólicas que requieren aporte de energía química (anabólicas), el ATP
se desdobla en ADP más un grupo fosfato inorgánico, y transfiere una cantidad de energía libre
que permite la formación de nuevos enlaces o configuraciones más complejas en la reacción
anabólica.
Sintetizando el rol del ATP en el metabolismo:
Función del ATP en el metabolismo intermedio

Por ello el ATP es la molécula estrella del metabolismo intermedio. La que relaciona los
pequeños requerimientos o excesos de energía a nivel molecular, y está disponible para
participar en ambos tipos de reacciones.

Función central del ATP en el metabolismo intermedio


Otra forma en que aporta energía el ATP es transfiriendo el grupo fosfato a otra molécula,
que de este modo está fosforilada. Esta molécula ahora esta activada para poder seguir una
vía metabólica determinada. Un ejemplo es la activación de la glucosa a glucosa 6-fosfato en el
inicio de la glucólisis.

El ATP también puede perder el grupo pirofosfato (dos fosfatos unidos) que luego son
hidrolizados entre sí generando dos grupos fosfato. Este proceso se da en las reacciones
altamente demandantes de energía de transcripción de los genes a proteínas y en la
duplicación del ácido desoxirribonucleico (si bien en este caso el nucleótido interviniente es el
desoxi-ATP). La hidrólisis del enlace entre los dos fosfatos por acción de un catalizador (una
enzima) determina que la liberación de energía sea relativamente alta y permita la síntesis de
una macromolécula como el ADN o el ARNm, de la cual el mononucleótido pasa a formar parte
como monómero (unidad estructural).

3.- Enzimas:

Vimos que las células cumplen con las leyes de la física y la química. Cumplen con el primer
y segundo principio de la termodinámica. En la célula más sencilla, como la de una bacteria,
ocurren cientos de reacciones distintas al mismo tiempo. En una célula eucarionte de un animal
superior, miles de reacciones a la vez. La elevación de la temperatura o el cambio del pH por
sobre los estrechos límites que permite la homeostasis, desnaturaliza las proteínas
citoplasmáticas y causa la muerte celular. Las concentraciones de sustratos (materias primas)
suelen ser bajas.
Y, sin embargo, dentro de esas limitaciones propias de las características de los seres vivos,
las células son sumamente eficientes para obtener energía del medio, producir biomoléculas,
realizar trabajo mecánico y osmótico, generar gradientes de concentración y reproducirse.
Si intentáramos imitar en el laboratorio las condiciones ambientales en que las células
operan, tardaríamos muchísimo en producir una (una sola) reacción específica.
La principal razón que explica el éxito bioquímico de las células es el desarrollo evolución de
unas moléculas que probablemente originaron y luego mantuvieron la vida: las enzimas.
Las enzimas son catalizadores biológicos. Son propios de los seres vivos. La gran mayoría
son proteínas. Pero hay algunas que son ácidos ribonucleicos (riboenzimas o ribozimas), que
probablemente fueron muy importantes en la historia de la evolución química prebiológica.
Características de las enzimas

 Las enzimas son proteínas de estructura terciaria o cuaternaria de alto peso molecular
y gran tamaño en relación a las moléculas de sustrato con las que interactúan.
Globulinas, con una conformación espacial muy definida.

 Presentan de muy diferentes tamaños y requerimientos; algunas necesitan para


desarrollar su actividad tan sólo su estructura peptídica, Otras requieren la presencia
de un cofactor. Este compuesto puede ser, sencillamente un ión inorgánico, Fe2+,
Mg2+, Mn2+ o Zn2+; o una molécula orgánica más o menos compleja, que si se
encuentra unida covalentemente se denomina grupo prostético, y si establece uniones
de naturaleza débil y reversible se denomina coenzima. Muchas vitaminas, o
derivados de las mismas, funcionan como coenzimas. La enzima completa junto a su
cofactor se denomina holoenzima y su parte exclusivamente proteica apoenzima.

Quimiotripsina en modelo de esferas blancas unida a una molécula de sustrato. En


colorado se observan algunos de los aminoácidos clave del sitio activo (Tomado de
Lehninger, AL: Principios de Bioquímica, 2da ed., Omega, Barcelona, 1995.

 La función catalítica de las enzimas reside en su capacidad para acelerar enormemente


la velocidad de las reacciones químicas. Cuando indicamos enormemente queremos
indicar que la velocidad a que aceleran la reacción es de un uno seguido por 6 a 14
ceros más rápido que la reacción sin catalizar.
 Aumentan la velocidad de la reacción porque disminuyen la energía de activación
necesaria para superar el estado inestable de máxima energía de la reacción.

 No modifican el curso de la reacción, La variación de Energía libre no cambia. No


cambian el equilibrio, sino que permiten llegar a él mucho más rápido

 Actúan en bajísimas concentraciones ya que no se modifican irreversiblemente en el


transcurso de la reacción, por lo que cada molécula de enzima vuelve a quedar
disponible luego de catalizar el proceso de una molécula de reactivo para reaccionar
con otra.

 Son específicas del sustrato y de la reacción que catalizan.

 Como son globulinas, su conformación es afectada por todas las razones que afectan el
microambiente donde actúan: fundamentalmente el pH, la concentración iónica, la
molaridad de las soluciones, y la temperatura van a afectar seriamente el
funcionamiento catalítico de la enzima.

 Las enzimas pueden ser inhibidas por distintas moléculas que interactúan con ellas.

 La actividad catalítica de las enzimas es regulada por una serie de moduladores que
responden a su vez a la concentración de determinadas señales en la célula. Estas
señales pueden responder a mecanismos de control metabólico que veremos después
o a control extracelular por señales provenientes del sistema inmunoneuroendócrino.

¿Cómo catalizan las enzimas los procesos de cambio?

A diferencia de lo que ocurre en el laboratorio o en una industria, las reacciones biológicas


ocurren a baja temperatura, sin cambios drásticos de presiones, en condiciones de baja
concentración de las moléculas participantes, en un medio (citoplasma, sangre, lisosoma) en
que hay muchas moléculas diferentes que no participan en la reacción, pero interfieren,
especialmente con las moléculas de agua del medio.

En esta situación, las enzimas presentan un, pliegue o bolsillo en su conformación llamado
sitio activo donde se aloja al sustrato específico mediante fuerzas de unión débiles,
fundamentalmente interacciones salinas, puentes de Hidrógeno e interacciones hidrofóbicas y
de van der Walls, aunque también existen uniones covalentes fugaces. Las moléculas de
sustrato se encontraban en su máximo estado de entropía (desorden) y con la mínima energía
que los mantiene estables. Los grupos funcionales de los aminoácidos del sitio activo de la
enzima; pero también de regiones de la proteína lejanas del sitio activo, interactúan sobre el
sustrato.

En el siguiente video, si bien está en inglés, se puede ver claramente la relación entre el sitio
activo y el sustrato y como al final de la reacción la enzima se recupera completamente
inalterada:
[Link]

La interacción supone en este modelo, dos instancias:


1) se requiere una Energía de Fijación que une al sustrato en determinado sentido en el sitio
activo. Esta energía de fijación ha de ser mayor que la energía de repulsión de las moléculas
de sustratos entre sí, y permite una complementariedad espacial muy exacta entre enzima y
sustrato.
2) la proteína interactúa sobre el sustrato mediante la liberación de la Energía de catálisis, que
determina el cambio de las nubes de electrones moleculares que se reordenan, y se produce la
modificación de la molécula de sustrato. Es el momento de máxima energía, denominado
estado de transición o estado inestable; a partir del cual el complejo de Enzima-Sustrato (ES)
puede “caer” hacia la disociación Enzima + Producto (E + P) o volver hacia el lado izquierdo de
la reacción: (Enzima + Sustrato).
Como la concentración de Sustrato en el medio celular, es mayor que la de producto, y muy
diferente a las concentraciones altas que suelen utilizarse en el laboratorio, el equilibrio se
desplaza hacia la formación de Enzima + Producto.
Variación de Energía libre en una reacción sin catalizador (línea roja) y con la acción de
una enzima (línea azul)

En la figura siguiente se muestra el proceso por el cual la enzima se une al sustrato y libera el
producto.

Esquema simplificado del proceso de catálisis

Se han descrito dos modelos para explicar el proceso de complementaridad y catálisis:

Modelo Llave y cerradura:


Fue el primer modelo, desarrollado desde 1890 por Emil Fisher: el centro activo y el sustrato
presentan morfología complementaria.
La enzima interactúa con moléculas de sustrato. En el momento inicial, la concentración de
sustratos es baja, pero la de producto es mucho menor. Se forma luego el complejo Enzima-
Sustrato. Las moléculas en este estado presentan la máxima energía. Es el Estado de
Transición que describimos antes. El complejo Enzima-Sustrato no puede aislarse
químicamente. Sólo podemos dilucidar teóricamente cómo son los desplazamientos de
electrones y las nuevas uniones débiles que se han formado.

Cuando la reacción termina, se han forman los productos, cuya concentración irá aumentando.
La Enzima ya liberada vuelve a estar disponible para catalizar el proceso para otra molécula,
sin modificarse, lo que fundamenta que, en muy pequeñas concentraciones, sean tan eficientes
en acelerar el proceso.

Éste fue el modelo más antiguo desarrollado. Explica bien por qué la enzima se relaciona
íntimamente con el sustrato: por una absoluta complementaridad espacial por uniones débiles.
No explica bien la razón por la cual un sustrato perfectamente asociado a la enzima sería
reconfigurado para originar otra o molécula.

Modelo de Encaje Inducido.


Actualmente se ha dilucidado que, al unirse sustrato y centro activo, las interacciones entre
ambos producen cambios en la conformación tanto del sustrato como de la enzima. Este
modelo de Koshland y Neet fue denominado de ajuste inducido o del guante y la mano. Los
enlaces débiles no sólo permiten la unión enzima-sustrato, sino que van violentando la
conformación de la enzima aún en residuos lejanos del sitio activo, y del sustrato, para generar
una tensión que lo modifique a producto.
El modelo de encaje inducido implica que la enzima no debería ser absolutamente
complementaria, sino que induce un cambio en el sustrato por acción justamente, de la no
complementaridad perfecta. La energía de fijación y la energía de catálisis actuarían en
sucesión a fin de lograr una complementación no tan perfecta Enzima-Sustrato; pero sí un
rápido salto a través del estado de transición.

Modelos de llave-cerradura y ajuste inducido


Factores que afectan la actividad enzimática:

1.- Cinética enzimática y concentración de sustrato en enzimas clásicas o michelianas:


L. Michaelis y M. Menten en 1913, diseñaron un modelo o teoría general de la acción
enzimática. Estudiaron los factores que afectan la velocidad con que catalizan la reacción las
enzimas. El factor Concentración de sustrato fue el que más conclusiones les permitió emitir
para entender la forma en que las enzimas actúan sobre el proceso de catálisis.

Las moléculas de enzima cuya concentración es constante, se relacionan mediante fuerzas


débiles con el sustrato, conformando un complejo Enzima-Sustrato, que no puede aislarse;
pero puede dilucidarse. La concentración del complejo [ES] en relación a la concentración del
producto va a determinar el equilibrio de la reacción, y depende de la concentración del
sustrato, que es la variable en estudio.
El otro factor importante es la afinidad de la enzima por el sustrato.

Los círculos verdes representan moléculas de enzima. Los amarillos grandes


representan Complejo Enzima/Sustrato. Los amarillos pequeños, representan moléculas
de sustrato. La curva de la función representa la velocidad con que ocurre la reacción a
diferentes concentraciones de sustrato. El producto no se representa.

La velocidad con que ocurre una reacción química en relación a la variable independiente
Concentración de sustrato puede determinarse verificando la cantidad de producto que se
forma por unidad de tiempo (por ej.: moles de producto formado/milisegundo) con cada
concentración creciente de concentración de sustrato (la variable independiente que se cambia
en el laboratorio). O se puede medir la cantidad o concentración de sustrato que desaparece
por unidad de tiempo.
Es importante notar que estos ensayos se realizan con concentración constante de enzima.
A concentraciones bajas de sustrato, hay un exceso de moléculas libres de Enzima. La
reacción presenta una pendiente muy acusada de la curva. Hay baja concentración de sustrato:
las moléculas de enzima catalizan la reacción con una velocidad inicial constante.
A medida que se incrementa la concentración del sustrato, quedan pocas moléculas de
enzima libres; por lo tanto, los aumentos de velocidad son cada vez más pequeños con los
aumentos puntuales de sustrato.
En el extremo derecho, la curva se horizontaliza. Se llega a la Velocidad Máxima (Vmáx). Ya
no hay enzima no unida disponible. Toda está en estado Enzima/Sustrato. No hay moléculas
de enzima libre. Cuando catalizan una molécula de sustrato a producto, inmediatamente se
asocian a una molécula de sustrato.
Con el dato de la Vmáx obtenemos la mitad de la Vmáx (1/2Vmáx) y se interpola hasta la
concentración de sustrato. Esa concentración de sustrato constituye la Constante de Michelis,
(Km) que, en las condiciones de la experiencia, constituye una medida de la afinidad de la
Enzima por el sustrato: cuando mayor es el km menor es la afinidad de la enzima por el
sustrato, y viceversa. Con este valor y unas aplicaciones de las matemáticas que exceden
nuestro curso, se pueden determinar hipótesis acerca de la actividad enzimática.

Observación: Las enzimas denominadas reguladoras, de regulación o alostéricas, no


responden con el mismo comportamiento cinético. Serán descriptas más adelante dentro del
tema de Regulación Enzimática.

2.- Inhibición enzimática:

Los inhibidores son sustancias que al unirse a las enzimas impiden la formación de producto.
De acuerdo al tipo de interacción que tenga el inhibidor con la enzima, podemos encontrar
inhibidores reversibles, cuya unión al sustrato es transitoria, e inhibidores irreversibles que se
unen a la enzima en forma permanente.
Dentro de los inhibidores reversibles, están los competitivos y los no competitivos:

a.- Inhibición Competitiva: cuando una molécula interfiere con la catálisis de las enzimas con
su sustrato, compitiendo con él sobre el sitio activo de la enzima; el proceso se denomina
Inhibición competitiva. Es habitual en las células que haya moléculas que interfieran en forma
reversible con el sustrato en el sitio activo. Son moléculas muy similares al sustrato. En la
inhibición competitiva se verifica que la velocidad máxima puede alcanzarse con mayor
concentración de sustrato, pero el Km con inhibidor es mayor, y se denomina Km Aparente.

Cinética enzimática modificada por un inhibidor competitivo

Se puede revertir si se incrementa la concentración de sustrato, o si disminuye la


concentración de inhibidor. Algunos insecticidas del tipo de los órgano-fosforados son
inhibidores irreversibles de la importante enzima Acetilcolinesterasa que participa en el
mecanismo de transmisión nerviosa. Matan a los insectos y pueden intoxicar a los animales.

Pasos de la reacción con un inhibidor competitivo

b. Inhibición No Competitiva:
En este caso el inhibidor no es similar al sustrato e interactúa con la molécula de la enzima en
otra región, no en el sitio activo. Esto produce tensiones en la enzima cuya conformación
tridimensional cambia mientras esté unido el inhibidor, y el sitio activo deja de ser
complementario del sustrato. El Km Aparente es muy similar al Km; pero la Vmax aparente es
menor.

Cinética enzimática modificada por un inhibidor no competitivo

Pasos de la reacción con un inhibidor no competitivo

En este video se muestran las diferencias que podemos encontrar cuando una enzima no
está inhibida y cuando está bajo una inhibición competitiva y la no competitiva (hasta el minuto
2:00)
[Link]
MMXsU&list=PLy9QO_k9Fw3QzEwxOL24ZX10a_6CEA1P6&index=15
3.- Concentración de enzimas:
Existe un comportamiento lineal directo entre la concentración de la enzima y la velocidad
de la reacción: a mayor concentración de enzimas, mayor será la velocidad, o se la formación
de producto por unidad de tiempo.

La función es lineal con la concentración de enzimas. La pendiente es diferente para


cada reacción. En verde se representan las moléculas de sustrato y en rojo las enzimas.

4.- Efecto de la modificación de la temperatura:


Las enzimas presentan un rango de temperatura estrecho dentro del cual la actividad es
máxima: es su temperatura óptima. En los mamíferos y aves, esa temperatura está cercana a
la habitual en estos organismos.
Efecto de la variación de temperatura

En el ejemplo, se observa que por debajo de la temperatura óptima la actividad catalítica es


muy baja. A medida que se incremente, vemos que existe una temperatura de actividad óptima
donde la capacidad catalítica de esa enzima es cercana al 100 % de eficacia.
A mayor temperatura las fuerzas débiles se deforman y la proteína se desnaturaliza. Cambia
la estructura cuaternaria (si la tuviera), la terciaria y la secundaria y pierde totalmente la
capacidad catalítica. El proceso se denomina desnaturalización y es reversible dentro de
temperaturas cercanas a la óptima. Si se sigue calentando la desnaturalización es irreversible.
La estructura primaria (uniones peptídicas) se conserva.

5.- Efecto de la modificación del pH: En forma similar a la anterior, el cambio de pH


modifica las interacciones de la enzima con el agua. El proceso es reversible si el cambio es
leve. El pH de nuestro plasma es 7,4
Hay muchas enzimas que actúan a un pH óptimo alejado del normal de nuestro medio
interno. Es porque su presencia se expresa en ubicaciones especiales. Ej.: la pepsina
estomacal actúa con un pH óptimo de 2, en la cavidad estomacal. En cambio, la tripsina lo
hace a pH 8 en el duodeno.

Eficacia porcentual de la catálisis para tres enzimas con diferente pH óptimo.


6.- Concentración salina: El cambio en la concentración de iones en general y, por tanto, de
la competencia de éstos por las moléculas de agua, pueden desnaturalizar las proteínas, que
pierden su conformación natural o nativa y su funcionalidad catalítica.

Regulación de la actividad enzimática en la célula

Las células de un individuo multicelular o la de una bacteria, han evolucionado priorizando el


ahorro de energía. Los mecanismos que menos energía potencial demandaron para mantener
la organización y funciones de esa célula u organismo, otorgaron ventajas a esas células. Esos
mecanismos persistieron y se generalizaron por selección natural. Por eso es que existen las
vías metabólicas idénticas en casi todos los organismos.
El control de la energía utilizada en el mantenimiento de las células vivas ha generado
mecanismos precisos de regulación, a fin de preservar la energía.

La regulación enzimática puede dividirse en dos tipos:


1) Control de la concentración o cantidad de las enzimas.
a.- Control de su síntesis, o sea, que haya o no una determinada enzima. Esta es la
regulación genética, que implica que los genes que poseen la información para la producción
de una enzima determinada se activen (enciendan) o anulen (apaguen) en un determinado
momento del ciclo de vida celular, o ante estímulos ambientales.
b.- Persistencia de las moléculas de la enzima: regulación de su vida media, hasta que son
degradadas a sus constituyentes péptidos.

2) Regulación de la capacidad catalítica de un número relativamente constante de


enzimas. Esto está relacionado con los fenómenos que hemos visto respecto a cómo se
realiza, se modifica o se inactiva el proceso de catálisis.

Los temas a ver son los siguientes:


a. Enzimas alostéricas, reguladoras o de regulación
b. Sistemas multienzimáticos (vías catalíticas comunes)
c. Modificaciones por enlace covalente.
d. Compartimentalización.
e. Isoenzimas

a.-Enzimas alostéricas, de regulación o reguladoras.


La actividad catalítica de las enzimas es regulada por alteraciones de conformación y
estructura cuaternaria. En el análisis de las enzimas clásicas (fig. nº 10) vimos que la velocidad
inicial de una reacción catalizada varía con la concentración de sustrato, y con la afinidad de la
enzima por su sustrato.
Estos conceptos son válidos en general también para las enzimas alostéricas, con ciertas
importantes diferencias que surgen desde su estructura y fundamentalmente, su actividad
catalítica más compleja y modulable.
La afinidad de la enzima por el sustrato puede modularse mediante la acción de pequeñas
moléculas muy importantes por concentrarse como respuesta a los requerimientos metabólicos
de la célula.

✔ Estructura: Las enzimas alostéricas son oligoméricas, Poseen dos o más subunidades
polipeptídicas que se relacionan entre sí con fuerzas débiles. Por lo tanto, poseen varios sitios
activos.
✔ Presentan curvas de cinética sigmoidea, eso se debe a que hay un efecto cooperativo
entre las subunidades: la unión de una molécula de sustrato a un sitio activo, facilita el ingreso
del sustrato a los sitios activos de otras subunidades.
✔ Son modulables. Su actividad catalítica es operada por moduladores positiva o
negativamente.
✔ La regulación puede ser homotrópica (el modulador es el propio sustrato) o
heterotrópica (otra molécula).
✔ Cada subunidad posee dos dominios diferentes (a veces más): el dominio llamado sitio
activo para ubicar y catalizar la reacción, y el o los dominios llamados sitios alostéricos, donde
se ubican los moduladores o efectores alostéricos.
✔ Cada subunidad se presenta en una de dos conformaciones: Tensa o Relajada. La
conformación T no es afín por el sustrato, que no puede ubicarse en el sitio activo. La
configuración R sí es afín por el sustrato.
✔ El pasaje de una conformación a otra implica una gran diferencia en la capacidad
catalítica inmediata.

En este video se puede apreciar las diferencias que presentan las enzimas alostéricas con
respecto a las enzimas michaelianas:
[Link]
b.- efecto o acción alostérica: los moduladores o efectores se unen al sitio alostérico, y alteran
la conformación de una subunidad; la que a su vez altera la de su vecina, etc.
Los moduladores alostéricos puede ser positivo, permite que la enzima aumente su afinidad
por el sustrato, son activadores de la catálisis. O negativos (los sitios activos pierden afinidad
por las moléculas de sustrato)

Efecto de moduladores alostéricos positivos y negativos (adaptado de Khan Academy)

b.- Sistemas multienzimáticos (vías catalíticas comunes)

El esquema siguiente muestra una vía metabólica: una secuencia de reacciones donde el
sustrato A se transforma en el producto B mediante la enzima E1. El producto B luego es
sustrato de la siguiente enzima E2, y así sucesivamente, hasta llegar a un producto final F.

Esquema simplificado de una vía metabólica (adaptado de Khan Academy)


Regulación negativa por producto final (F)

Las vías metabólicas pueden ser reguladas por enzimas alostéricas. Un caso muy común es
la inhibición por el producto final, o mecanismo de feed-back negativo.
El producto final de una ruta metabólica inhibe alostéricamente (temporariamente) al enzima
que cataliza la primera reacción de dicha ruta. Se interrumpe la producción del producto de la
primera reacción, por lo tanto, de toda la cadena, ahorrando energía cuando no lo requiere la
célula. Se trata de un control heterotrópico mediante un modulador negativo.

Cuando la concentración del producto final disminuye (porque el metabolismo celular lo


requiere), F deja de ingresar al sitio alostérico de la enzima 1; ésta cambia su conformación y
recupera su capacidad catalítica.

Debe tenerse en cuenta que en la modificación alostérica de una enzima, la diferencia de


conformación se debe a las tensiones sobre su estructura espacial que determina una
modulador. Y la unión del modulador es siempre por uniones débiles.

Inhibición por producto final o feedback negativo (adaptado de Khan Academy)

Este proceso, en forma dinámica, pueden verlo en este video que, si bien está en inglés, se
comprende fácilmente una vez que leyeron el texto anterior:
[Link]

c.1- Modificación por enlace covalente reversible


En este caso, también muy extendido, la modificación de la enzima es por la formación o
ruptura de un enlace covalente reversible.
El mejor ejemplo es la activación de la capacidad catalítica de una enzima por el aporte de un
grupo fosfato.
La enzima inactiva es activada por el traspaso de un grupo fosfato del ATP; y cambia a forma
relajada (activa). El proceso es reversible. Este mecanismo es muy rápido para ajustar las
reacciones enzimáticas a los requerimientos metabólicas celulares.

c.2: Modificación covalente irreversible:

En este caso, la ruptura de un enlace covalente, permite que ésta se active. El proceso es
irreversible. Suele ocurrir con las enzimas hidrolíticas de los lisosomas. La enzima inactiva se
denomina zimógeno.

d.- Compartimentalización:

En una célula eucarionte existen distintas organelas membranosas (REG, REA, Golgi,
mitocondrias, cloroplastos, lisosomas) en que ocurren diferentes procesos metabólicos. A
medida que se sintetizan, las enzimas se ubican en su compartimento correspondiente.
Entonces están presentes en donde ocurren los procesos por ellas catalizados. Lo que implica
economía en la célula.

e.- Isoenzimas:
El prefijo iso significa igual. Las isoenzimas poseen el mismo sustrato, catalizan la misma
reacción. Se obtiene igual producto. Pero, poseen uno, dos o pocos aminoácidos diferentes. Se
sintetizan en distintos tejidos del individuo. Y poseen una cinética diferente entre sí: implica que
cambia la constante de Michaelis (Km); cambia la afinidad por el sustrato.
Tienen importancia clínica porque, como son enzimas citoplasmáticas, su presencia en
sangre implica una patología (muerte o infarto de tejidos). Un ejemplo es la Láctico-
deshidrogenasa (LDH)
Puede determinarse si es de origen cardíaco, o hepático, de acuerdo a su cinética.

Conclusiones:

La vida puede caracterizarse como una lucha contra la entropía (contra el desorden).
Las células y organismos deben mantener su alto estado de organización adquiriendo
materia y energía del ambiente.
Todos los seres vivos toman energía libre, útil del ambiente (fotoautótrofos, la lumínica; los
heterótrofos, energía potencial química en los alimentos).
Con la energía lumínica y moléculas inorgánicas del suelo y aire, los fotosintetizadores
producen sus propias moléculas biológicas (son productores). Los heterótrofos toman la
energía de las moléculas orgánicas producidas por los fotosintetizadores.
Tanto fotosintetizadores como heterótrofos utilizan la energía química potencial y los
monómeros para construir sus propias macromoléculas, realizar trabajo mecánico, acumular
iones, producir moléculas hereditarias y reproducirse.
En cada uno de estos procesos parte de la energía potencial química de las moléculas se
traduce en trabajo, pero una parte importante se libera hacia el ambiente como calor o
desorden (porque todos cumplen con el segundo principio de la termodinámica).
Los seres vivos están permanentemente en un estado dinámico estacionario: ingresa materia
y energía y sale materia y energía. Pero las biomoléculas en el proceso se producen y se
gastan. Hay que reemplazarlas. La estructura y función permanece, pero las moléculas se
recambian permanentemente. Por lo cual se requiere trabajo. Y por tanto el aporte permanente
de Energía.
Y como todos cumplen con la segunda Ley, para conservar la estructura y función, alteran el
orden del ambiente, aumentan la entropía.

Una forma de “economizar” energía debió de ser muy útil para competir con las otras células
para obtener beneficios (mayor productividad con la misma energía). Por ello, las células que
desarrollaron vías metabólicas de degradación y de anabolismo, con enzimas eficientes para
catalizar las reacciones rápido, debieron tener ventajas. Es por ello que todos los seres vivos
presentan iguales vías. Hemos evolucionado con ellas desde las células primordiales.
Y aquéllas células que “encontraron” aleatoriamente mejores sistemas de regulación y control
del metabolismo, resultaron ganadoras en la competencia; y hoy exhiben su progenie.

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