Scribd
Cargar
19 vistas5 páginas

Construcción de un Árbol Filogenético

El documento describe los pasos para construir un árbol filogenético a partir de secuencias de ADN usando el programa MEGA, incluyendo alinear las secuencias, cortar los extremos, construir el árbol usando el método de vecino más cercano y guardar el resultado.

Cargado por

Denis R
Derechos de autor
© © All Rights Reserved
Nos tomamos en serio los derechos de los contenidos. Si sospechas que se trata de tu contenido, reclámalo aquí.
Formatos disponibles
Descarga como PDF, TXT o lee en línea desde Scribd
19 vistas5 páginas

Construcción de un Árbol Filogenético

El documento describe los pasos para construir un árbol filogenético a partir de secuencias de ADN usando el programa MEGA, incluyendo alinear las secuencias, cortar los extremos, construir el árbol usando el método de vecino más cercano y guardar el resultado.

Cargado por

Denis R
Derechos de autor
© © All Rights Reserved
Nos tomamos en serio los derechos de los contenidos. Si sospechas que se trata de tu contenido, reclámalo aquí.
Formatos disponibles
Descarga como PDF, TXT o lee en línea desde Scribd

ARBOL FILOGENETICO

1. EL ARCHIVO EN EL QUE TENEMOS NUESTRA SECUENCIA CONSENSUS, 5 SECUENCIAS


TIPO Y EL GRUPO EXTERNO AL TENERLO EN TXT SE PASA A FASTA.

2. ESTE NUEVO DOCUMENTO EN FASTA SE ABRE CON EL PROGRAMA DE MEGA EN


DONDE SE VA A DAR CLIC EN ALIGNMENT Y LUEGO EN ALIGN BY CLUSTA IW PARA QUE
LAS SECUENCIAS SE PUEDAN ALIENAR.
3. UNA VEZ QUE NOS DA LAS SECUENCIAS ALIENADAS, SE PROCEDE A CORTAR POR
AMBOS EXTREMOS
-CORTE DEL EXTREMO IZQUIERDO

-CORTE DEL EXTREMO DERECHO

4. SE PROCEDE A GUARDAR LA INFORMACION

5. SE PROCEDE A ABRIR EL ARCHIVO GUARDADO Y SE SELECCIONA PHYLOGENY Y LUEGO


CONSTRUCT/ TEST NEIGHBOR-JOINING TREE
6. A CONTINUACION UBICAMOS EL ARCHIVO Y SELECCIONAMOS LA OPCION ALL FILES Y
LE DAMOS ABRIR.

7. UNA VEZ CONSTRUIDO EL ARBOL FILOGENETICO SE VA CONFIGURAR LA PARTE


ESTADISTICA ELIGIENDO SITE COVERAGE Y TAMBIEN SE DARA CLIC EN DISPLAY
CAPTION
8. PARA GUARDAR EL PROCESO VAMOS A LA OPCION DE IMAGEN / SAVE AS PDF FILE, LA
CUAL UNA VEZ GUARDADA EN PDF SE VA A CONVERTIR EN PDF.

}
ARBOL FILOGENETICO
[Link] (X83408.1)

100%

[Link] (X80741.1)

100%
Arthrobacter ginsengisoliT (KF212463.1)

JCFP

99%

99%

Arthrobacter glacialisT (JX949500.2)

Arthrobacter spT (CAQI01000001.1)

Streptococcus pneumoniae (AF003930.1)

0.02

También podría gustarte